Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7795
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7795, 461 aa
1>>>pF1KB7795 461 - 461 aa - 461 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7631+/-0.000873; mu= -1.1936+/- 0.052
mean_var=242.5353+/-52.395, 0's: 0 Z-trim(116.7): 111 B-trim: 1688 in 2/50
Lambda= 0.082354
statistics sampled from 17199 (17313) to 17199 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.823), E-opt: 0.2 (0.532), width: 16
Scan time: 3.190
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42156.1 TGFB1I1 gene_id:7041|Hs108|chr16 ( 461) 3330 408.1 9.7e-114
CCDS10713.1 TGFB1I1 gene_id:7041|Hs108|chr16 ( 444) 3227 395.9 4.5e-110
CCDS58281.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 ( 605) 1380 176.5 6.7e-44
CCDS44998.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 ( 424) 1374 175.7 8.2e-44
CCDS44996.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 ( 557) 1374 175.8 1e-43
CCDS44997.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 ( 591) 1363 174.5 2.7e-43
CCDS76407.1 LPXN gene_id:9404|Hs108|chr11 ( 366) 1266 162.8 5.3e-40
CCDS7969.1 LPXN gene_id:9404|Hs108|chr11 ( 386) 1266 162.8 5.6e-40
CCDS53635.1 LPXN gene_id:9404|Hs108|chr11 ( 391) 1266 162.8 5.6e-40
CCDS47102.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 487) 621 86.3 7.9e-17
CCDS3641.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 596) 621 86.3 9.2e-17
CCDS58916.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 625) 621 86.3 9.6e-17
CCDS7377.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10 ( 727) 621 86.4 1.1e-16
CCDS75166.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 271) 609 84.7 1.3e-16
CCDS41544.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10 ( 617) 612 85.3 2e-16
CCDS53550.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10 ( 732) 612 85.3 2.3e-16
CCDS58917.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 483) 589 82.5 1.1e-15
CCDS4423.1 PDLIM7 gene_id:9260|Hs108|chr5 ( 423) 574 80.6 3.4e-15
CCDS4422.1 PDLIM7 gene_id:9260|Hs108|chr5 ( 457) 574 80.7 3.6e-15
CCDS5883.1 ZYX gene_id:7791|Hs108|chr7 ( 572) 457 66.8 6.6e-11
>>CCDS42156.1 TGFB1I1 gene_id:7041|Hs108|chr16 (461 aa)
initn: 3330 init1: 3330 opt: 3330 Z-score: 2155.5 bits: 408.1 E(32554): 9.7e-114
Smith-Waterman score: 3330; 100.0% identity (100.0% similar) in 461 aa overlap (1-461:1-461)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MEDLDALLSDLETTTSHMPRSGAPKERPAEPLTPPPSYGHQPQTGSGESSGASGDKDHLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MEDLDALLSDLETTTSHMPRSGAPKERPAEPLTPPPSYGHQPQTGSGESSGASGDKDHLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 STVCKPRSPKPAAPAAPPFSSSSGVLGTGLCELDRLLQELNATQFNITDEIMSQFPSSKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 STVCKPRSPKPAAPAAPPFSSSSGVLGTGLCELDRLLQELNATQFNITDEIMSQFPSSKV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 ASGEQKEDQSEDKKRPSLPSSPSPGLPKASATSATLELDRLMASLSDFRVQNHLPASGPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ASGEQKEDQSEDKKRPSLPSSPSPGLPKASATSATLELDRLMASLSDFRVQNHLPASGPT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QPPVVSSTNEGSPSPPEPTGKGSLDTMLGLLQSDLSRRGVPTQAKGLCGSCNKPIAGQVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QPPVVSSTNEGSPSPPEPTGKGSLDTMLGLLQSDLSRRGVPTQAKGLCGSCNKPIAGQVV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 TALGRAWHPEHFVCGGCSTALGGSSFFEKDGAPFCPECYFERFSPRCGFCNQPIRHKMVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TALGRAWHPEHFVCGGCSTALGGSSFFEKDGAPFCPECYFERFSPRCGFCNQPIRHKMVT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ALGTHWHPEHFCCVSCGEPFGDEGFHEREGRPYCRRDFLQLFAPRCQGCQGPILDNYISA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ALGTHWHPEHFCCVSCGEPFGDEGFHEREGRPYCRRDFLQLFAPRCQGCQGPILDNYISA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 LSALWHPDCFVCRECFAPFSGGSFFEHEGRPLCENHFHARRGSLCATCGLPVTGRCVSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSALWHPDCFVCRECFAPFSGGSFFEHEGRPLCENHFHARRGSLCATCGLPVTGRCVSAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KB7 GRRFHPDHFTCTFCLRPLTKGSFQERAGKPYCQPCFLKLFG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GRRFHPDHFTCTFCLRPLTKGSFQERAGKPYCQPCFLKLFG
430 440 450 460
>>CCDS10713.1 TGFB1I1 gene_id:7041|Hs108|chr16 (444 aa)
initn: 3227 init1: 3227 opt: 3227 Z-score: 2089.6 bits: 395.9 E(32554): 4.5e-110
Smith-Waterman score: 3227; 100.0% identity (100.0% similar) in 444 aa overlap (18-461:1-444)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MEDLDALLSDLETTTSHMPRSGAPKERPAEPLTPPPSYGHQPQTGSGESSGASGDKDHLY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MPRSGAPKERPAEPLTPPPSYGHQPQTGSGESSGASGDKDHLY
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 STVCKPRSPKPAAPAAPPFSSSSGVLGTGLCELDRLLQELNATQFNITDEIMSQFPSSKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 STVCKPRSPKPAAPAAPPFSSSSGVLGTGLCELDRLLQELNATQFNITDEIMSQFPSSKV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 ASGEQKEDQSEDKKRPSLPSSPSPGLPKASATSATLELDRLMASLSDFRVQNHLPASGPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ASGEQKEDQSEDKKRPSLPSSPSPGLPKASATSATLELDRLMASLSDFRVQNHLPASGPT
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QPPVVSSTNEGSPSPPEPTGKGSLDTMLGLLQSDLSRRGVPTQAKGLCGSCNKPIAGQVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QPPVVSSTNEGSPSPPEPTGKGSLDTMLGLLQSDLSRRGVPTQAKGLCGSCNKPIAGQVV
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 TALGRAWHPEHFVCGGCSTALGGSSFFEKDGAPFCPECYFERFSPRCGFCNQPIRHKMVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TALGRAWHPEHFVCGGCSTALGGSSFFEKDGAPFCPECYFERFSPRCGFCNQPIRHKMVT
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ALGTHWHPEHFCCVSCGEPFGDEGFHEREGRPYCRRDFLQLFAPRCQGCQGPILDNYISA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ALGTHWHPEHFCCVSCGEPFGDEGFHEREGRPYCRRDFLQLFAPRCQGCQGPILDNYISA
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 LSALWHPDCFVCRECFAPFSGGSFFEHEGRPLCENHFHARRGSLCATCGLPVTGRCVSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LSALWHPDCFVCRECFAPFSGGSFFEHEGRPLCENHFHARRGSLCATCGLPVTGRCVSAL
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460
pF1KB7 GRRFHPDHFTCTFCLRPLTKGSFQERAGKPYCQPCFLKLFG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GRRFHPDHFTCTFCLRPLTKGSFQERAGKPYCQPCFLKLFG
410 420 430 440
>>CCDS58281.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 (605 aa)
initn: 1588 init1: 1350 opt: 1380 Z-score: 901.7 bits: 176.5 E(32554): 6.7e-44
Smith-Waterman score: 1443; 46.4% identity (63.9% similar) in 498 aa overlap (55-460:113-604)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 KERPAEPLTPPPSYGHQPQTGSGESSGASGDKDHLYSTVCKPRSPKPAAPAAPPFSSSSG
...:.:: : .: .:. : :.:
CCDS58 SSSPVYGSSAKTSSVSNPQDSVGSPCSRVGEEEHVYSFPNKQKSAEPS----PTVMSTS-
90 100 110 120 130
90 100 110 120
pF1KB7 VLGTGLCELDRLLQELNATQFNI----TDEIMSQ------------FPSSKVASGEQKED
::..: :::::: ::::.: : .:: :. : .. : .
CCDS58 -LGSNLSELDRLLLELNAVQHNPPGFPADEANSSPPLPGALSPLYGVPETNSPLGGKAGP
140 150 160 170 180 190
130 140
pF1KB7 QSEDKK-----------RPSLPS----------SPSPGL---------P----------K
...: :::. : :: :.. : .
CCDS58 LTKEKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDELESSVPSPVPAITVNQGEMSSPQRVTSTQQQTR
200 210 220 230 240 250
150 160 170
pF1KB7 ASATSATLELDRLMASLSDFR-----------------VQN-----------HLPAS--G
::.::: :::.::::::::. ::. : : .
CCDS58 ISASSATRELDELMASLSDFKGSWPLEEVVLLVSISSSVQEGEKYPHPCAARHRTPSLRS
260 270 280 290 300 310
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 PTQPP----VVSSTNEGSPSPPE-PTGKGS-LDTMLGLLQSDLSRRGVPTQAKGLCGSCN
: ::: ... . :: ::: : :: ::.::: :::::.. :: : :::.::.:.
CCDS58 PDQPPPCPQFMAQGKTGSSSPPGGPPKPGSQLDSMLGSLQSDLNKLGVATVAKGVCGACK
320 330 340 350 360 370
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 KPIAGQVVTALGRAWHPEHFVCGGCSTALGGSSFFEKDGAPFCPECYFERFSPRCGFCNQ
::::::::::.:..:::::::: :. .:. .:::.:: :.: . : . ::::: .::
CCDS58 KPIAGQVVTAMGKTWHPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCEKDYHNLFSPRCYYCNG
380 390 400 410 420 430
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 PIRHKMVTALGTHWHPEHFCCVSCGEPFGDEGFHEREGRPYCRRDFLQLFAPRCQGCQGP
:: :.:::: :::::: :..:: :: :::::..:. :::.:....:::.: ::
CCDS58 PILDKVVTALDRTWHPEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCARA
440 450 460 470 480 490
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 ILDNYISALSALWHPDCFVCRECFAPFSGGSFFEHEGRPLCENHFHARRGSLCATCGLPV
::.::::::..::::.::::::::.:: .::::::.:.: :: :.: ::::::. : :.
CCDS58 ILENYISALNTLWHPECFVCRECFTPFVNGSFFEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQKPI
500 510 520 530 540 550
420 430 440 450 460
pF1KB7 TGRCVSALGRRFHPDHFTCTFCLRPLTKGSFQERAGKPYCQPCFLKLFG
::::..:....:::.::.:.:::. :.::.:.:. ::::: ::::::
CCDS58 TGRCITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLKLFC
560 570 580 590 600
>>CCDS44998.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 (424 aa)
initn: 1506 init1: 1350 opt: 1374 Z-score: 900.0 bits: 175.7 E(32554): 8.2e-44
Smith-Waterman score: 1467; 48.4% identity (71.8% similar) in 426 aa overlap (35-460:26-423)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 DALLSDLETTTSHMPRSGAPKERPAEPLTPPPSYGHQPQTGSGESSGASGDKDHLYSTVC
::.. : .. : : . ::..
CCDS44 MSTSLGSNLSELDRLLLELNAVQHNPPGF---PADEANSSPPLPGALSPLYGV--
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KPRSPKPAAPAAPPFSSSSGVLGTGLCELDRLLQELNATQFNITDEIMSQFPSSKVASGE
:.. .: . : :... . . : : :... . .. ::. :. :: :
CCDS44 -PETNSPLGGKAGPLTKEKPKRNGG-----RGLEDVRPSVESLLDELESSVPSPVPAITV
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 QKEDQSEDKKRPSLPSSPSPGLPKASATSATLELDRLMASLSDFRVQNHLPASGPTQPPV
.. ..: .. : .. . ::.::: :::.::::::::. . . .: ..::
CCDS44 NQGEMSSPQRVTSTQQQ-----TRISASSATRELDELMASLSDFKFMAQ-GKTGSSSPP-
110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VSSTNEGSPSPPEPTGKGSLDTMLGLLQSDLSRRGVPTQAKGLCGSCNKPIAGQVVTALG
:.: :.: .. ::.::: :::::.. :: : :::.::.:.::::::::::.:
CCDS44 ------GGP--PKPGSQ--LDSMLGSLQSDLNKLGVATVAKGVCGACKKPIAGQVVTAMG
160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RAWHPEHFVCGGCSTALGGSSFFEKDGAPFCPECYFERFSPRCGFCNQPIRHKMVTALGT
..:::::::: :. .:. .:::.:: :.: . : . ::::: .:: :: :.::::
CCDS44 KTWHPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCEKDYHNLFSPRCYYCNGPILDKVVTALDR
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 HWHPEHFCCVSCGEPFGDEGFHEREGRPYCRRDFLQLFAPRCQGCQGPILDNYISALSAL
:::::: :..:: :: :::::..:. :::.:....:::.: :: ::.::::::..:
CCDS44 TWHPEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCARAILENYISALNTL
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 WHPDCFVCRECFAPFSGGSFFEHEGRPLCENHFHARRGSLCATCGLPVTGRCVSALGRRF
:::.::::::::.:: .::::::.:.: :: :.: ::::::. : :.::::..:....:
CCDS44 WHPECFVCRECFTPFVNGSFFEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKF
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460
pF1KB7 HPDHFTCTFCLRPLTKGSFQERAGKPYCQPCFLKLFG
::.::.:.:::. :.::.:.:. ::::: ::::::
CCDS44 HPEHFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLKLFC
390 400 410 420
>>CCDS44996.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 (557 aa)
initn: 1588 init1: 1350 opt: 1374 Z-score: 898.3 bits: 175.8 E(32554): 1e-43
Smith-Waterman score: 1498; 46.5% identity (65.7% similar) in 495 aa overlap (30-460:80-556)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MEDLDALLSDLETTTSHMPRSGAPKERPAEPLTPPPSYGHQ--------PQTGSGESSG
.: . : :: . :: . : .
CCDS44 PPPPSSEALNGTILDPLDQWQPSSSRFIHQQPQSSSPVYGSSAKTSSVSNPQDSVGSPCS
50 60 70 80 90 100
60 70 80 90 100
pF1KB7 ASGDKDHLYSTVCKPRSPKPAAPAAPPFSSSSGVLGTGLCELDRLLQELNATQFNI----
:...:.:: : .: .: .: :.: ::..: :::::: ::::.: :
CCDS44 RVGEEEHVYSFPNKQKSAEP----SPTVMSTS--LGSNLSELDRLLLELNAVQHNPPGFP
110 120 130 140 150 160
110 120 130 140
pF1KB7 TDEIMSQ------------FPSSKVASGEQKEDQSEDKK-----------RPSLPS----
.:: :. : .. : . ...: :::. :
CCDS44 ADEANSSPPLPGALSPLYGVPETNSPLGGKAGPLTKEKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDE
170 180 190 200 210 220
150 160 170
pF1KB7 ------SPSPGL---------P----------KASATSATLELDRLMASLSDFRVQNHLP
:: :.. : . ::.::: :::.::::::::. . .
CCDS44 LESSVPSPVPAITVNQGEMSSPQRVTSTQQQTRISASSATRELDELMASLSDFKFMAQ-G
230 240 250 260 270 280
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 ASGPTQPPVVSSTNEGSPSPPEPTGKGSLDTMLGLLQSDLSRRGVPTQAKGLCGSCNKPI
.: ..:: :.: :.: .. ::.::: :::::.. :: : :::.::.:.:::
CCDS44 KTGSSSPP-------GGP--PKPGSQ--LDSMLGSLQSDLNKLGVATVAKGVCGACKKPI
290 300 310 320 330
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 AGQVVTALGRAWHPEHFVCGGCSTALGGSSFFEKDGAPFCPECYFERFSPRCGFCNQPIR
:::::::.:..:::::::: :. .:. .:::.:: :.: . : . ::::: .:: ::
CCDS44 AGQVVTAMGKTWHPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCEKDYHNLFSPRCYYCNGPIL
340 350 360 370 380 390
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 HKMVTALGTHWHPEHFCCVSCGEPFGDEGFHEREGRPYCRRDFLQLFAPRCQGCQGPILD
:.:::: :::::: :..:: :: :::::..:. :::.:....:::.: :: ::.
CCDS44 DKVVTALDRTWHPEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCARAILE
400 410 420 430 440 450
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 NYISALSALWHPDCFVCRECFAPFSGGSFFEHEGRPLCENHFHARRGSLCATCGLPVTGR
::::::..::::.::::::::.:: .::::::.:.: :: :.: ::::::. : :.:::
CCDS44 NYISALNTLWHPECFVCRECFTPFVNGSFFEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQKPITGR
460 470 480 490 500 510
420 430 440 450 460
pF1KB7 CVSALGRRFHPDHFTCTFCLRPLTKGSFQERAGKPYCQPCFLKLFG
:..:....:::.::.:.:::. :.::.:.:. ::::: ::::::
CCDS44 CITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLKLFC
520 530 540 550
>>CCDS44997.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 (591 aa)
initn: 1599 init1: 1350 opt: 1363 Z-score: 890.9 bits: 174.5 E(32554): 2.7e-43
Smith-Waterman score: 1485; 46.5% identity (64.8% similar) in 497 aa overlap (42-460:100-590)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 ETTTSHMPRSGAPKERPAEPLTPPPSYGHQPQTGSGESSGASGDKDHLYSTVCKPRSPKP
:: . : . :...:.:: : .: .:
CCDS44 QPSSSRFIHQQPQSSSPVYGSSAKTSSVSNPQDSVGSPCSRVGEEEHVYSFPNKQKSAEP
70 80 90 100 110 120
80 90 100 110
pF1KB7 AAPAAPPFSSSSGVLGTGLCELDRLLQELNATQFNI----TDEIMSQ------------F
. : :.: ::..: :::::: ::::.: : .:: :.
CCDS44 S----PTVMSTS--LGSNLSELDRLLLELNAVQHNPPGFPADEANSSPPLPGALSPLYGV
130 140 150 160 170 180
120 130 140
pF1KB7 PSSKVASGEQKEDQSEDKK-----------RPSLPS----------SPSPGL--------
: .. : . ...: :::. : :: :..
CCDS44 PETNSPLGGKAGPLTKEKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDELESSVPSPVPAITVNQGEMS
190 200 210 220 230 240
150 160 170 180
pF1KB7 -P----------KASATSATLELDRLMASLSDFRVQN-------------HLPASGPTQP
: . ::.::: :::.::::::::..:. : .: .
CCDS44 SPQRVTSTQQQTRISASSATRELDELMASLSDFKIQGLEQRADGERCWAAGWPRDGGRSS
250 260 270 280 290 300
190 200 210 220 230
pF1KB7 P-------VVSSTNEGSPSPPE-PTGKGS-LDTMLGLLQSDLSRRGVPTQAKGLCGSCNK
: ... . :: ::: : :: ::.::: :::::.. :: : :::.::.:.:
CCDS44 PGGQDEGGFMAQGKTGSSSPPGGPPKPGSQLDSMLGSLQSDLNKLGVATVAKGVCGACKK
310 320 330 340 350 360
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 PIAGQVVTALGRAWHPEHFVCGGCSTALGGSSFFEKDGAPFCPECYFERFSPRCGFCNQP
:::::::::.:..:::::::: :. .:. .:::.:: :.: . : . ::::: .:: :
CCDS44 PIAGQVVTAMGKTWHPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCEKDYHNLFSPRCYYCNGP
370 380 390 400 410 420
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 IRHKMVTALGTHWHPEHFCCVSCGEPFGDEGFHEREGRPYCRRDFLQLFAPRCQGCQGPI
: :.:::: :::::: :..:: :: :::::..:. :::.:....:::.: :: :
CCDS44 ILDKVVTALDRTWHPEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCARAI
430 440 450 460 470 480
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 LDNYISALSALWHPDCFVCRECFAPFSGGSFFEHEGRPLCENHFHARRGSLCATCGLPVT
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CCDS44 LENYISALNTLWHPECFVCRECFTPFVNGSFFEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQKPIT
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:::..:....:::.::.:.:::. :.::.:.:. ::::: ::::::
CCDS44 GRCITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLKLFC
550 560 570 580 590
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::.::....:::.:::: .::. :: ::::: .:::.:: :.: :::.:: :: :.:::
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CCDS79 HSRKETNLDETSEILSIQDNTSPLPAQLVYTTNIQELNVYSEAQEPKESPPPSKTSAAAQ
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CCDS79 LDELMAHLTEM------------QAKVAVRADAGKKHLPDKQDHKASLDSMLGGLEQELQ
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:. : :: :.::.:::::.:. :::..:::::::: :. .:.: :::..: .::
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pF1KB7 ECYFERFSPRCGFCNQPIRHKMVTALGTHWHPEHFCCVSCGEPFGDEGFHEREGRPYCRR
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CCDS79 NDYHQLFSPRCAYCAAPILDKVLTAMNQTWHPEHFFCSHCGEVFGAEGFHEKDKKPYCRK
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pF1KB7 DFLQLFAPRCQGCQGPILDNYISALSALWHPDCFVCRECFAPFSGGSFFEHEGRPLCENH
::: .:.:.: ::. :.:.::.::....:::.:::: .::. :: ::::: .:::.:: :
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:::
CCDS79 NKLFPL
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CCDS53 ----QAKVAVRADAGKKHLPDKQDHKASLDSMLGGLEQELQDLGIATVPKGHCASCQKPI
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pF1KB7 AGQVVTALGRAWHPEHFVCGGCSTALGGSSFFEKDGAPFCPECYFERFSPRCGFCNQPIR
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CCDS53 AGKVIHALGQSWHPEHFVCTHCKEEIGSSPFFERSGLAYCPNDYHQLFSPRCAYCAAPIL
170 180 190 200 210 220
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pF1KB7 HKMVTALGTHWHPEHFCCVSCGEPFGDEGFHEREGRPYCRRDFLQLFAPRCQGCQGPILD
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CCDS53 DKVLTAMNQTWHPEHFFCSHCGEVFGAEGFHEKDKKPYCRKDFLAMFSPKCGGCNRPVLE
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CCDS53 NYLSAMDTVWHPECFVCGDCFTSFSTGSFFELDGRPFCELHYHHRRGTLCHGCGQPITGR
290 300 310 320 330 340
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CCDS53 CISAMGYKFHPEHFVCAFCLTQLSKGIFREQNDKTYCQPCFNKLFPL
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10 20 30 40
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CCDS47 GINAQGMTHLEAQNKIKGCTGSLNMTLQRASAAPKPEPV-PVQKPTVTSVCSETSQELAE
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pF1KB7 GESSGASGDKDHLYSTVCKPRSPKPAAPAAPPFSSSSGVLGTGLCELDRLLQELNATQFN
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CCDS47 GQRRGSQGDSKQQNGPPRKHIVERYTEFYHVPTHSDAS--KKRLIEDTEDWRPRTGTTQS
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CCDS47 RSFRILAQITGTE----HLKESEADNTKKANNSQEPSPQLASSVASTRSMPESLDSPTSG
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..::. . . . ..: . : . :.: :: . : .::. .. ::
CCDS47 RPGVTSLTAAAAFKPVGSTGVIKSPSWQRPNQGVPSTGRISNSATYSGSVAPANSALGQT
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pF1KB7 Q-SD---LSRRG--VPTQAKG-LCGSCNKPIAGQVVTALGRAWHPEHFVCGGCSTALGGS
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CCDS47 QPSDQDTLVQRAEHIPAGKRTPMCAHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYI
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pF1KB7 SFFEKDGAPFCPECYFERFSPRCGFCNQPIRHKMVTALGTHWHPEHFCCVSCGEPFGDEG
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CCDS47 GFVEEKGALYCELCYEKFFAPECGRCQRKILGEVISALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNV
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CCDS47 FHLEDGEPYCETDYYALFGTICHGCEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]