FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7787, 458 aa
1>>>pF1KB7787 458 - 458 aa - 458 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8104+/-0.00167; mu= 6.0350+/- 0.099
mean_var=255.1456+/-48.242, 0's: 0 Z-trim(106.2): 980 B-trim: 44 in 1/50
Lambda= 0.080293
statistics sampled from 7781 (8859) to 7781 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.611), E-opt: 0.2 (0.272), width: 16
Scan time: 2.900
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 1376 173.6 4.1e-43
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1342 169.6 6.3e-42
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CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 1315 166.5 5.3e-41
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CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1309 166.0 1.1e-40
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CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1280 162.6 1.1e-39
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1280 162.6 1.1e-39
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CCDS33095.1 ZNF320 gene_id:162967|Hs108|chr19 ( 509) 1245 158.4 1.5e-38
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CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1242 158.3 2.5e-38
CCDS74437.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 458) 1238 157.6 2.5e-38
CCDS77346.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 492) 1238 157.6 2.7e-38
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1240 158.0 2.7e-38
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1240 158.0 2.7e-38
CCDS12850.2 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 535) 1238 157.6 2.8e-38
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1240 158.0 2.8e-38
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 1237 157.5 3e-38
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 1237 157.6 3.2e-38
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 1238 157.8 3.3e-38
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CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 560) 1235 157.3 3.7e-38
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1236 157.5 3.8e-38
CCDS42559.1 ZNF527 gene_id:84503|Hs108|chr19 ( 609) 1235 157.4 3.9e-38
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1234 157.3 4.5e-38
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1232 157.2 6e-38
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1232 157.2 6e-38
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 1227 156.6 8.8e-38
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1224 156.0 9e-38
CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 1227 156.6 9e-38
>>CCDS10901.1 ZNF19 gene_id:7567|Hs108|chr16 (458 aa)
initn: 3233 init1: 3233 opt: 3233 Z-score: 2050.4 bits: 388.7 E(32554): 6.9e-108
Smith-Waterman score: 3233; 99.8% identity (100.0% similar) in 458 aa overlap (1-458:1-458)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAMPLKAQYQEMVTFEDVAVHFTKTEWTGLSPAQRALYRSVMLENFGNLTALGYPVPKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MAAMPLKAQYQEMVTFEDVAVHFTKTEWTGLSPAQRALYRSVMLENFGNLTALGYPVPKP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 ALISLLERGDMAWGLEAQDDPPAERTKNVCKDVETNIDSESTLIQGISEERDGMMSHGQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ALISLLERGDMAWGLEAQDDPPAERTKNVCKDVETNIDSESTLIQGISEERDGMMSHGQL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KSVPQRTDFPETRNVEKHQDIPTVKNIQGKVPRIPCARKPFICEECGKSFSYFSYYARHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KSVPQRTDFPETRNVEKHQDIPTVKNIQGKVPRIPCARKPFICEECGKSFSYFSYYARHQ
130 140 150 160 170 180
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pF1KB7 RIHTGEKPFECSECGKAFNGNSSLIRHQRIHTGERPYHCEECGRAFNDNANLIRHQRIHS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS10 RIHTGEKPFECSECGKAFNGNSSLIRHQRIHTGERPYQCEECGRAFNDNANLIRHQRIHS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 GDRPYYCTECGNSFTSSSEFVIHQRIHTGEKPYECNECGKAFVGNSPLLRHQKIHTGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GDRPYYCTECGNSFTSSSEFVIHQRIHTGEKPYECNECGKAFVGNSPLLRHQKIHTGEKP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 YECNECGKSFGRTSHLSQHQRIHTGEKPYSCKVCGQAFNFHTKLTRHQRIHSEEKPFDCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YECNECGKSFGRTSHLSQHQRIHTGEKPYSCKVCGQAFNFHTKLTRHQRIHSEEKPFDCV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 DCGKAFSAQEQLKRHLRIHTQESSYVCDECGKALTSKRNLHQHQRIHTGEKPYECSKYEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DCGKAFSAQEQLKRHLRIHTQESSYVCDECGKALTSKRNLHQHQRIHTGEKPYECSKYEK
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KB7 AFGTSSQLGHLEHVYSGEKPVLDICRFGLPEFFTPFYW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AFGTSSQLGHLEHVYSGEKPVLDICRFGLPEFFTPFYW
430 440 450
>>CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 (474 aa)
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Smith-Waterman score: 1376; 46.1% identity (69.4% similar) in 451 aa overlap (1-440:1-448)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAMPLKAQYQEMVTFEDVAVHFTKTEWTGLSPAQRALYRSVMLENFGNLTALGYPVPKP
::: : : . . : .:.: :.. .: : . : .. . . .:. :: :: .:
CCDS69 MAAGLLTAGPRGSTFFSSVTVAFAQERWRCLVSTPRDRFKEGIPGKSRSLVLLGLPVSQP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB7 ALISLLERGDMAWGLEAQD-DPPAERTKNVCKDVETNIDSESTLIQGISEERDGMMSHG-
.. : ::. . :: ::..: :. : . . . ::... . : : .::
CCDS69 GMNSQLEQREGAWMLEGEDLRSPSPGWKIISGSPPEQALSEASFQDPCVEMPPGDSDHGT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KB7 -------QLKSV--PQRTDFPETRNVEKHQDIPTVKNIQGKVPRIPCARKPFICEECGKS
.:. : ::. :.: . . . :: ... . : ::. :.::::.
CCDS69 SDLEKSFNLRPVLSPQQRVPVEARPRKCETHTESFKN--SEILK-PHRAKPYACNECGKA
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 FSYFSYYARHQRIHTGEKPFECSECGKAFNGNSSLIRHQRIHTGERPYHCEECGRAFNDN
::: : ..::. ::::::.:::::::::. .::::.::::::::.::.: ::::::..:
CCDS69 FSYCSSLSQHQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQN
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 ANLIRHQRIHSGDRPYYCTECGNSFTSSSEFVIHQRIHTGEKPYECNECGKAFVGNSPLL
::: .::: :.:..:: :.:: ..:.. : .: :::::::::::::..::::: .. :
CCDS69 ANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLT
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 RHQKIHTGEKPYECNECGKSFGRTSHLSQHQRIHTGEKPYSCKVCGQAFNFHTKLTRHQR
::. :::::::.:.::::.:. . . :::::::::::: : .::.::. ..:: :::
CCDS69 NHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQRIHTGEKPYRCAACGKAFSQSANLTNHQR
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 IHSEEKPFDCVDCGKAFSAQEQLKRHLRIHTQESSYVCDECGKALTSKRNLHQHQRIHTG
:. :::. : .:::::: . .: : . :: :. : :.:::: .. . : .:. ::::
CCDS69 THTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTG
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KB7 EKPYECSKYEKAFGTSSQLGHLEHVYSGEKPVLDICRFGLPEFFTPFYW
::::::.. :::. ::.:.. .....: ::
CCDS69 EKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKPYECSECGKAFRCSSAFVRHQRLHAGE
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>>CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 (498 aa)
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Smith-Waterman score: 1376; 46.1% identity (69.4% similar) in 451 aa overlap (1-440:25-472)
10 20 30
pF1KB7 MAAMPLKAQYQEMVTFEDVAVHFTKTEWTGLSPAQR
::: : : . . : .:.: :.. .: : . :
CCDS68 MLEEGVLPSPGPALPQEENTGEEGMAAGLLTAGPRGSTFFSSVTVAFAQERWRCLVSTPR
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 ALYRSVMLENFGNLTALGYPVPKPALISLLERGDMAWGLEAQD-DPPAERTKNVCKDVET
.. . . .:. :: :: .:.. : ::. . :: ::..: :. : . .
CCDS68 DRFKEGIPGKSRSLVLLGLPVSQPGMNSQLEQREGAWMLEGEDLRSPSPGWKIISGSPPE
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140
pF1KB7 NIDSESTLIQGISEERDGMMSHG--------QLKSV--PQRTDFPETRNVEKHQDIPTVK
. ::... . : : .:: .:. : ::. :.: . . . :
CCDS68 QALSEASFQDPCVEMPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVLSPQQRVPVEARPRKCETHTESFK
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 NIQGKVPRIPCARKPFICEECGKSFSYFSYYARHQRIHTGEKPFECSECGKAFNGNSSLI
: ... . : ::. :.::::.::: : ..::. ::::::.:::::::::. .::::
CCDS68 N--SEILK-PHRAKPYACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLI
190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 RHQRIHTGERPYHCEECGRAFNDNANLIRHQRIHSGDRPYYCTECGNSFTSSSEFVIHQR
.::::::::.::.: ::::::..:::: .::: :.:..:: :.:: ..:.. : .: :::
CCDS68 QHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSALVQHQR
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 IHTGEKPYECNECGKAFVGNSPLLRHQKIHTGEKPYECNECGKSFGRTSHLSQHQRIHTG
::::::::::..::::: .. : ::. :::::::.:.::::.:. . . ::::::::
CCDS68 IHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQRIHTG
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 EKPYSCKVCGQAFNFHTKLTRHQRIHSEEKPFDCVDCGKAFSAQEQLKRHLRIHTQESSY
:::: : .::.::. ..:: ::: :. :::. : .:::::: . .: : . :: :. :
CCDS68 EKPYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPY
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 VCDECGKALTSKRNLHQHQRIHTGEKPYECSKYEKAFGTSSQLGHLEHVYSGEKPVLDIC
:.:::: .. . : .:. ::::::::::.. :::. ::.:.. .....: ::
CCDS68 KCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKPYECSE
420 430 440 450 460 470
450
pF1KB7 RFGLPEFFTPFYW
CCDS68 CGKAFRCSSAFVRHQRLHAGE
480 490
>>CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 (488 aa)
initn: 1328 init1: 1328 opt: 1342 Z-score: 866.3 bits: 169.6 E(32554): 6.3e-42
Smith-Waterman score: 1342; 57.8% identity (80.6% similar) in 320 aa overlap (121-440:27-341)
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 KDVETNIDSESTLIQGISEERDGMMSHGQLKSVPQRTDFPETRNVEKHQDIPTVKNIQGK
:. :. : : . .:.:: .:: .
CCDS12 MENLTKHSIECSSFRGDWECKNQFERKQGSQEGHFSEM--IFTPEDMPTF-SIQHQ
10 20 30 40 50
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 VPRIPCARKPFICEECGKSFSYFSYYARHQRIHTGEKPFECSECGKAFNGNSSLIRHQRI
:: .: . :.::::.::. : .:::::::::::.::.::::::.....: ::::
CCDS12 --RIHTDEKLLECKECGKDFSFVSVLVRHQRIHTGEKPYECKECGKAFGSGANLAYHQRI
60 70 80 90 100 110
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 HTGERPYHCEECGRAFNDNANLIRHQRIHSGDRPYYCTECGNSFTSSSEFVIHQRIHTGE
::::.:..:.:::.::....:: .:::::.:..:: : :::..:. .: .. :: ::.::
CCDS12 HTGEKPFECKECGKAFGSGSNLTHHQRIHTGEKPYECKECGKAFSFGSGLIRHQIIHSGE
120 130 140 150 160 170
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 KPYECNECGKAFVGNSPLLRHQKIHTGEKPYECNECGKSFGRTSHLSQHQRIHTGEKPYS
:::::.::::.: .: :.::..:::::::::: .:::.:: :.:.::.:::::::::
CCDS12 KPYECKECGKSFSFESALIRHHRIHTGEKPYECIDCGKAFGSGSNLTQHRRIHTGEKPYE
180 190 200 210 220 230
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 CKVCGQAFNFHTKLTRHQRIHSEEKPFDCVDCGKAFSAQEQLKRHLRIHTQESSYVCDEC
::.::.::. . ::::::::. :::. : .:::::: : :: :::: :. ::: ::
CCDS12 CKACGMAFSSGSALTRHQRIHTGEKPYICNECGKAFSFGSALTRHQRIHTGEKPYVCKEC
240 250 260 270 280 290
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 GKALTSKRNLHQHQRIHTGEKPYECSKYEKAFGTSSQLGHLEHVYSGEKPVLDICRFGLP
:::..: .: ::::::::::::::.. :::: ..:.: . .....::::
CCDS12 GKAFNSGSDLTQHQRIHTGEKPYECKECEKAFRSGSKLIQHQRMHTGEKPYECKECGKTF
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 EFFTPFYW
CCDS12 SSGSDLTQHHRIHTGEKPYECKECGKAFGSGSKLIQHQLIHTGERPYECKECGKSFSSGS
360 370 380 390 400 410
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CCDS72 CGKAFPRSSALKQHKKIHNKERAMKCS
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CCDS42 ECGKSFSHNSSLIKHQRIHSR
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CCDS10 RFSFQLSQHQSVHSEGKS
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CCDS12 HQKIHNGEKPYECKECGRAFIRGSLLMQHQRIHTGEKPYKCEECGKAFIRGSQLTQHQRI
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