Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7784
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7784, 510 aa
1>>>pF1KB7784 510 - 510 aa - 510 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0917+/-0.00177; mu= 16.6637+/- 0.106
mean_var=281.1997+/-50.850, 0's: 0 Z-trim(107.8): 934 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.076483
statistics sampled from 8742 (9786) to 8742 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.665), E-opt: 0.2 (0.301), width: 16
Scan time: 3.280
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14648.1 ZNF75D gene_id:7626|Hs108|chrX ( 510) 3554 406.7 3.2e-113
CCDS55503.1 ZNF75D gene_id:7626|Hs108|chrX ( 415) 1969 231.6 1.3e-60
CCDS10501.1 ZNF75A gene_id:7627|Hs108|chr16 ( 296) 1229 149.7 4.2e-36
CCDS42427.1 ZSCAN30 gene_id:100101467|Hs108|chr18 ( 494) 927 116.8 5.7e-26
CCDS46160.1 ZNF577 gene_id:84765|Hs108|chr19 ( 426) 725 94.4 2.7e-19
CCDS46203.1 ZSCAN5B gene_id:342933|Hs108|chr19 ( 495) 708 92.6 1.1e-18
CCDS73057.1 ZNF124 gene_id:7678|Hs108|chr1 ( 351) 705 92.0 1.2e-18
CCDS42640.1 ZNF586 gene_id:54807|Hs108|chr19 ( 402) 688 90.3 4.5e-18
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 675 88.9 1.3e-17
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 673 89.2 2e-17
CCDS35106.1 ZNF483 gene_id:158399|Hs108|chr9 ( 744) 671 88.9 2.2e-17
CCDS12273.1 ZNF791 gene_id:163049|Hs108|chr19 ( 576) 668 88.3 2.5e-17
CCDS74346.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 314) 664 87.4 2.5e-17
CCDS12494.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 418) 664 87.6 2.9e-17
CCDS46061.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 419) 664 87.6 2.9e-17
CCDS43429.1 ZNF391 gene_id:346157|Hs108|chr6 ( 358) 660 87.1 3.6e-17
CCDS6354.1 ZNF572 gene_id:137209|Hs108|chr8 ( 529) 661 87.5 4e-17
CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 687) 660 87.6 4.9e-17
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 715) 660 87.6 5e-17
CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19 ( 738) 658 87.4 5.9e-17
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 653 86.3 6.3e-17
CCDS58523.1 ZNF286B gene_id:729288|Hs108|chr17 ( 522) 655 86.8 6.4e-17
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 653 86.5 7.1e-17
CCDS6755.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 584) 654 86.8 7.2e-17
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 653 86.6 7.2e-17
CCDS64999.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 590) 654 86.8 7.3e-17
CCDS65096.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 612) 654 86.8 7.4e-17
CCDS6754.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 626) 654 86.8 7.5e-17
CCDS6435.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 686) 654 86.9 7.8e-17
CCDS64996.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 697) 654 86.9 7.8e-17
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 651 86.3 8.1e-17
CCDS82403.1 ZSCAN5A gene_id:79149|Hs108|chr19 ( 495) 650 86.2 9.1e-17
CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 511) 650 86.3 9.2e-17
CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 521) 650 86.3 9.3e-17
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 651 86.5 9.3e-17
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 651 86.5 9.3e-17
CCDS12941.1 ZSCAN5A gene_id:79149|Hs108|chr19 ( 496) 648 86.0 1.1e-16
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 647 85.8 1.1e-16
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 649 86.3 1.1e-16
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 649 86.5 1.2e-16
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 648 86.3 1.2e-16
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 649 86.5 1.2e-16
CCDS4439.1 ZNF354B gene_id:117608|Hs108|chr5 ( 612) 647 86.1 1.3e-16
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 646 85.9 1.3e-16
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 645 85.8 1.4e-16
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 646 86.0 1.4e-16
CCDS45945.1 ZNF557 gene_id:79230|Hs108|chr19 ( 423) 643 85.3 1.4e-16
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 591) 645 85.8 1.4e-16
CCDS42485.1 ZNF557 gene_id:79230|Hs108|chr19 ( 430) 643 85.3 1.5e-16
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 645 85.8 1.5e-16
>>CCDS14648.1 ZNF75D gene_id:7626|Hs108|chrX (510 aa)
initn: 3554 init1: 3554 opt: 3554 Z-score: 2146.2 bits: 406.7 E(32554): 3.2e-113
Smith-Waterman score: 3554; 100.0% identity (100.0% similar) in 510 aa overlap (1-510:1-510)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAMRELNADSCSSPQMGAMWETSGSVKENSSQSKKYSTKIENLGPESACRHFWSFRYHEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MAMRELNADSCSSPQMGAMWETSGSVKENSSQSKKYSTKIENLGPESACRHFWSFRYHEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 TGPLETISQLQKLCHQWLRPEIHSKEQILEMLVLEQFLSILPKETQNWVQKHHPQNVKQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TGPLETISQLQKLCHQWLRPEIHSKEQILEMLVLEQFLSILPKETQNWVQKHHPQNVKQA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 LVLVEFLQREPDGTKNEVTAHELGKEAVLLGGTAVAPGFKWKPAEPQPMGVFQKEYWNTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LVLVEFLQREPDGTKNEVTAHELGKEAVLLGGTAVAPGFKWKPAEPQPMGVFQKEYWNTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 RVLQEQLGWNTHKETQPVYERAVHDQQMLALSEQKRIKHWKMASKLILPESLSLLTFEDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RVLQEQLGWNTHKETQPVYERAVHDQQMLALSEQKRIKHWKMASKLILPESLSLLTFEDV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 AVYFSEEEWQLLNPLEKTLYNDVMQDIYETVISLGLKLKNDTGNDHPISVSTSEIQTSGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AVYFSEEEWQLLNPLEKTLYNDVMQDIYETVISLGLKLKNDTGNDHPISVSTSEIQTSGC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 EVSKKTRMKIAQKTMGRENPGDTHSVQKWHRAFPRKKRKKPATCKQELPKLMDLHGKGPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EVSKKTRMKIAQKTMGRENPGDTHSVQKWHRAFPRKKRKKPATCKQELPKLMDLHGKGPT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 GEKPFKCQECGKSFRVSSDLIKHHRIHTGEKPYKCQQCDRRFRWSSDLNKHFMTHQGIKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GEKPFKCQECGKSFRVSSDLIKHHRIHTGEKPYKCQQCDRRFRWSSDLNKHFMTHQGIKP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 YRCSWCGKSFSHNTNLHTHQRIHTGEKPFKCDECGKRFIQNSHLIKHQRTHTGEQPYTCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YRCSWCGKSFSHNTNLHTHQRIHTGEKPFKCDECGKRFIQNSHLIKHQRTHTGEQPYTCS
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KB7 LCKRNFSRRSSLLRHQKLHRRREACLVSPN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LCKRNFSRRSSLLRHQKLHRRREACLVSPN
490 500 510
>>CCDS55503.1 ZNF75D gene_id:7626|Hs108|chrX (415 aa)
initn: 2889 init1: 1969 opt: 1969 Z-score: 1201.7 bits: 231.6 E(32554): 1.3e-60
Smith-Waterman score: 2703; 81.4% identity (81.4% similar) in 510 aa overlap (1-510:1-415)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAMRELNADSCSSPQMGAMWETSGSVKENSSQSKKYSTKIENLGPESACRHFWSFRYHEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MAMRELNADSCSSPQMGAMWETSGSVKENSSQSKKYSTKIENLGPESACRHFWSFRYHEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 TGPLETISQLQKLCHQWLRPEIHSKEQILEMLVLEQFLSILPKETQNWVQKHHPQNVKQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TGPLETISQLQKLCHQWLRPEIHSKEQILEMLVLEQFLSILPKETQNWVQKHHPQNVKQA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 LVLVEFLQREPDGTKNEVTAHELGKEAVLLGGTAVAPGFKWKPAEPQPMGVFQKEYWNTY
:::::::::::::::::
CCDS55 LVLVEFLQREPDGTKNE-------------------------------------------
130
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 RVLQEQLGWNTHKETQPVYERAVHDQQMLALSEQKRIKHWKMASKLILPESLSLLTFEDV
::::::::
CCDS55 ----------------------------------------------------SLLTFEDV
140
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 AVYFSEEEWQLLNPLEKTLYNDVMQDIYETVISLGLKLKNDTGNDHPISVSTSEIQTSGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AVYFSEEEWQLLNPLEKTLYNDVMQDIYETVISLGLKLKNDTGNDHPISVSTSEIQTSGC
150 160 170 180 190 200
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 EVSKKTRMKIAQKTMGRENPGDTHSVQKWHRAFPRKKRKKPATCKQELPKLMDLHGKGPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EVSKKTRMKIAQKTMGRENPGDTHSVQKWHRAFPRKKRKKPATCKQELPKLMDLHGKGPT
210 220 230 240 250 260
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 GEKPFKCQECGKSFRVSSDLIKHHRIHTGEKPYKCQQCDRRFRWSSDLNKHFMTHQGIKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GEKPFKCQECGKSFRVSSDLIKHHRIHTGEKPYKCQQCDRRFRWSSDLNKHFMTHQGIKP
270 280 290 300 310 320
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 YRCSWCGKSFSHNTNLHTHQRIHTGEKPFKCDECGKRFIQNSHLIKHQRTHTGEQPYTCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YRCSWCGKSFSHNTNLHTHQRIHTGEKPFKCDECGKRFIQNSHLIKHQRTHTGEQPYTCS
330 340 350 360 370 380
490 500 510
pF1KB7 LCKRNFSRRSSLLRHQKLHRRREACLVSPN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LCKRNFSRRSSLLRHQKLHRRREACLVSPN
390 400 410
>>CCDS10501.1 ZNF75A gene_id:7627|Hs108|chr16 (296 aa)
initn: 1229 init1: 1229 opt: 1229 Z-score: 761.7 bits: 149.7 E(32554): 4.2e-36
Smith-Waterman score: 1312; 66.4% identity (76.9% similar) in 295 aa overlap (242-499:1-295)
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 SEQKRIKHWKMASKLILPESLSLLTFEDVAVYFSEEEWQLLNPLEKTLYNDVMQDIYETV
.:::.:::.::.: .:.:::::::. ::::
CCDS10 MYFSQEEWELLDPTQKALYNDVMQENYETV
10 20 30
280 290
pF1KB7 ISL-------------------------------------GLKLKNDTGNDHPISVSTSE
::: :::::::: : .:.:.: :
CCDS10 ISLALFVLPKPKVISCLEQGEEPWVQVSPEFKDSAGKSPTGLKLKNDTENHQPVSLSDLE
40 50 60 70 80 90
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 IQTSGCEVSKKTRMKIAQKTMGRENPGDTHSVQKWHRAFPRKKRKKPATCKQELPKLMDL
::.:. .:::...:. ::: :.:: : : : :::. :: ::::: .: :::: ::::
CCDS10 IQASAGVISKKAKVKVPQKTAGKENHFDMHRVGKWHQDFPVKKRKKLSTWKQELLKLMDR
100 110 120 130 140 150
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 HGKGPTGEKPFKCQECGKSFRVSSDLIKHHRIHTGEKPYKCQQCDRRFRWSSDLNKHFMT
: : . :::::::::::.::::::::::.:::: ::::::::::.:::::::::::. :
CCDS10 HKKDCAREKPFKCQECGKTFRVSSDLIKHQRIHTEEKPYKCQQCDKRFRWSSDLNKHLTT
160 170 180 190 200 210
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 HQGIKPYRCSWCGKSFSHNTNLHTHQRIHTGEKPFKCDECGKRFIQNSHLIKHQRTHTGE
:::::::.:::::::::.::::::::: ::::::: : ::::.: ::::::::.::::::
CCDS10 HQGIKPYKCSWCGKSFSQNTNLHTHQRTHTGEKPFTCHECGKKFSQNSHLIKHRRTHTGE
220 230 240 250 260 270
480 490 500 510
pF1KB7 QPYTCSLCKRNFSRRSSLLRHQKLHRRREACLVSPN
::::::.:.::::::::::::::::
CCDS10 QPYTCSICRRNFSRRSSLLRHQKLHL
280 290
>>CCDS42427.1 ZSCAN30 gene_id:100101467|Hs108|chr18 (494 aa)
initn: 3087 init1: 621 opt: 927 Z-score: 579.7 bits: 116.8 E(32554): 5.7e-26
Smith-Waterman score: 932; 34.8% identity (62.3% similar) in 488 aa overlap (27-501:26-493)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAMRELNADSCSSPQMGAMWETSGSVKENSSQSKKYSTKIENLGPESACRHFWSFRYHEA
.:: .. .. . . . : ..: .: : ..
CCDS42 MSGEATVLAYHAPEEQEGLLVVKVEEENYVLDQDFGLQENPWSQEVFRQKFRQFSYSDS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 TGPLETISQLQKLCHQWLRPEIHSKEQILEMLVLEQFLSILPKETQNWVQKHHPQNVKQA
::: :..:.:..:: ::::::.::::::::.:.:::::.:::.: : :...:.:.: ..:
CCDS42 TGPREALSRLRELCCQWLRPEVHSKEQILELLMLEQFLAILPEELQAWLREHRPENGEEA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB7 LVLVEFLQREPDGTKNEVTAHELGKEAVLLGGTAVAPGFKWKPAEPQPMGVFQKEYWNT-
....: :..: . ... :.: :.: :. : :.... :.
CCDS42 VTMLEELEKELEEPRQQDTTH--GQEMF------------WQ--EMTSTGALKSLSLNSP
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 YRVLQEQLGWNTHKETQPVYERAVHDQQMLA----LSEQKRIK---HWKMASKLILP-ES
. :..: .: .:.: :: : .:.: ...:. .. : : :: :.
CCDS42 VQPLENQCKTET-QESQAFQER---DGRMVAGKVLMAKQEIVECVASAAMISPGKLPGET
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280
pF1KB7 LSLLTFEDVAVYFSEEEWQLLNPLEKTLYNDVMQDIYETVISLGLKLKNDTG--NDHPIS
: :.. ... . : : . . . :: . .. ... .. .. . ..:
CCDS42 HSQRIAEEALGGLDNSKKQKGNAAGNKISQLPSQDRHFSLATFNRRIPTEHSVLESHESE
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 VSTSEIQTSGCEVSKKTRMKIAQKTMGRENPGDTHSVQKWHRAFPRKKRKKPATCKQELP
: : ... . : :: :. . . .. .. . .: .. : . .
CCDS42 GSFSMNSNDITQQSVDTREKLYECFDCGKAFCQSSKLIRHQRIHTGERPYACKECGKAFS
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 KLMDL--HGKGPTGEKPFKCQECGKSFRVSSDLIKHHRIHTGEKPYKCQQCDRRFRWSSD
:: : . .::::..: ::::.:: ::.::.:.:::::::::.: .: . : ::
CCDS42 LSSDLVRHQRIHSGEKPYECCECGKAFRGSSELIRHRRIHTGEKPYECGECGKAFSRSSA
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 LNKHFMTHQGIKPYRCSWCGKSFSHNTNLHTHQRIHTGEKPFKCDECGKRFIQNSHLIKH
: .: : : : :.: :::.:.... : ::::::::::..:.:::: : :.: : .:
CCDS42 LIQHKKIHTGDKSYECIACGKAFGRSSILIEHQRIHTGEKPYECNECGKSFNQSSALTQH
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510
pF1KB7 QRTHTGEQPYTCSLCKRNFSRRSSLLRHQKLHRRREACLVSPN
:: ::::.:: :: :...: .::.:..::. : :
CCDS42 QRIHTGEKPYECSECRKTFRHRSGLMQHQRTHTRV
460 470 480 490
>>CCDS46160.1 ZNF577 gene_id:84765|Hs108|chr19 (426 aa)
initn: 2953 init1: 578 opt: 725 Z-score: 459.8 bits: 94.4 E(32554): 2.7e-19
Smith-Waterman score: 725; 38.9% identity (68.6% similar) in 280 aa overlap (235-505:23-297)
210 220 230 240 250 260
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. : ...:.: . : :. . .: ... . ... : .: . .. ....:.
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: :. .:. .: . . : . . . ..: : . ::::: .:.::::.: .
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:.:. :.: :::::::.:..: . : . ::.: .: : : : :: :::.::... :
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.:::.:::.::.::..::. : .: : .::: ::::.:: :: :.. : .:.:..::.
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: .: .:
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CCDS73 FRYASSLQKHEKTHIAQKPYVCNNCGKGFRCSSSLRDHERTHTGEKPYECQKCGKAFSRA
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. . ... :. .. :. . ..: :.. . : : .: . ::.: .
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CCDS42 FRRSSSLLQHQRVHTRERPYECSECGKSFSLRSNLIHHQRVHTGERHECGQCGKSFSRKS
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::::::.:: :. : :.::.::.:..: ..:
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pF1KB7 N
CCDS23 CEKSFSRSSALIKHKRVHTD
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CCDS45 KCPECGKSFSVSSNLINHQRIHRGERPYICADCGKSFIMSSTLIRHQRIHTGEKPYKCSD
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CCDS45 CGKSFIRSSHLIQHRRTHTGEKPYKCPECGKSFSQSSNLITHVRTHMDENLFVCSDCGKA
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CCDS45 FLEAHELEQHRVIHERGKTPARRAQGDSLLGLGDPSLLTPPPGAKPHKCLVCGKGFNDEG
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510 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]