Result of FASTA (omim) for
pF1KB7758
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7758, 498 aa
1>>>pF1KB7758 498 - 498 aa - 498 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3305+/-0.000551; mu= 5.0125+/- 0.034
mean_var=235.5531+/-50.862, 0's: 0 Z-trim(114.5): 257 B-trim: 1144 in 1/50
Lambda= 0.083566
statistics sampled from 24069 (24403) to 24069 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.286), width: 16
Scan time: 8.890
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006065 (OMIM: 606559) E3 ubiquitin-protein liga ( 498) 3385 421.8 2.2e-117
NP_001186502 (OMIM: 606559) E3 ubiquitin-protein l ( 494) 3340 416.4 9.5e-116
XP_005253240 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 493) 1768 226.9 1.1e-58
NP_149023 (OMIM: 608487) tripartite motif-containi ( 493) 1768 226.9 1.1e-58
NP_477514 (OMIM: 607564) tripartite motif-containi ( 488) 1583 204.6 5.5e-52
NP_001003818 (OMIM: 607564) tripartite motif-conta ( 516) 1583 204.6 5.7e-52
NP_067629 (OMIM: 605684) tripartite motif-containi ( 488) 1484 192.6 2.2e-48
NP_001003827 (OMIM: 605684) tripartite motif-conta ( 488) 1484 192.6 2.2e-48
XP_016873951 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 300) 1198 157.9 3.7e-38
XP_005253241 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 326) 1193 157.4 5.9e-38
NP_149084 (OMIM: 608487) tripartite motif-containi ( 326) 1193 157.4 5.9e-38
NP_149083 (OMIM: 608487) tripartite motif-containi ( 347) 1193 157.4 6.2e-38
NP_569074 (OMIM: 605684) tripartite motif-containi ( 270) 1068 142.2 1.8e-33
XP_006718421 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 265) 1025 137.0 6.4e-32
XP_016873952 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 265) 1025 137.0 6.4e-32
XP_011518729 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 271) 1024 136.9 7.1e-32
XP_011518728 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 310) 1025 137.1 7.1e-32
XP_016873950 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 310) 1025 137.1 7.1e-32
XP_016873949 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 314) 1003 134.4 4.5e-31
NP_003132 (OMIM: 109092) E3 ubiquitin-protein liga ( 475) 914 123.9 1e-27
NP_001185574 (OMIM: 607564) tripartite motif-conta ( 313) 770 106.3 1.3e-22
NP_001185573 (OMIM: 607564) tripartite motif-conta ( 313) 770 106.3 1.3e-22
NP_060543 (OMIM: 613184) E3 ubiquitin-protein liga ( 485) 724 101.0 8.2e-21
NP_006501 (OMIM: 602165) zinc finger protein RFP [ ( 513) 697 97.8 8.1e-20
NP_742013 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein liga ( 488) 690 96.9 1.4e-19
NP_660215 (OMIM: 607868) E3 ubiquitin-protein liga ( 468) 675 95.1 4.8e-19
XP_016857901 (OMIM: 607868) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 467) 663 93.6 1.3e-18
NP_067076 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein liga ( 518) 599 85.9 2.9e-16
NP_291027 (OMIM: 610530) E3 ubiquitin-protein liga ( 630) 582 84.0 1.4e-15
NP_003440 (OMIM: 600830) tripartite motif-containi ( 539) 574 83.0 2.4e-15
XP_006715243 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 539) 574 83.0 2.4e-15
XP_005249435 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 539) 574 83.0 2.4e-15
XP_005249431 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 539) 574 83.0 2.4e-15
XP_005249434 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 539) 574 83.0 2.4e-15
NP_001229712 (OMIM: 600830) tripartite motif-conta ( 539) 574 83.0 2.4e-15
XP_005249433 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 539) 574 83.0 2.4e-15
XP_005249432 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 539) 574 83.0 2.4e-15
XP_006711842 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 558 81.0 8.6e-15
NP_001020111 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein l ( 477) 558 81.0 8.6e-15
NP_057186 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein liga ( 477) 558 81.0 8.6e-15
XP_011542512 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 558 81.0 8.6e-15
XP_011542511 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 558 81.0 8.6e-15
NP_006769 (OMIM: 605701) tripartite motif-containi ( 481) 541 78.9 3.6e-14
NP_439893 (OMIM: 605701) tripartite motif-containi ( 395) 525 76.9 1.2e-13
NP_001128327 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein l ( 343) 497 73.5 1.1e-12
XP_011512525 (OMIM: 605701) PREDICTED: tripartite ( 499) 500 74.0 1.1e-12
XP_011512523 (OMIM: 605701) PREDICTED: tripartite ( 499) 500 74.0 1.1e-12
XP_011512524 (OMIM: 605701) PREDICTED: tripartite ( 499) 500 74.0 1.1e-12
XP_011512527 (OMIM: 605701) PREDICTED: tripartite ( 413) 494 73.2 1.6e-12
XP_011512567 (OMIM: 609316) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 421) 493 73.1 1.8e-12
>>NP_006065 (OMIM: 606559) E3 ubiquitin-protein ligase T (498 aa)
initn: 3385 init1: 3385 opt: 3385 Z-score: 2228.3 bits: 421.8 E(85289): 2.2e-117
Smith-Waterman score: 3385; 100.0% identity (100.0% similar) in 498 aa overlap (1-498:1-498)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDFSVKVDIEKEVTCPICLELLTEPLSLDCGHSFCQACITAKIKESVIISRGESSCPVCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MDFSVKVDIEKEVTCPICLELLTEPLSLDCGHSFCQACITAKIKESVIISRGESSCPVCQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 TRFQPGNLRPNRHLANIVERVKEVKMSPQEGQKRDVCEHHGKKLQIFCKEDGKVICWVCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TRFQPGNLRPNRHLANIVERVKEVKMSPQEGQKRDVCEHHGKKLQIFCKEDGKVICWVCE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 LSQEHQGHQTFRINEVVKECQEKLQVALQRLIKEDQEAEKLEDDIRQERTAWKNYIQIER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LSQEHQGHQTFRINEVVKECQEKLQVALQRLIKEDQEAEKLEDDIRQERTAWKNYIQIER
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QKILKGFNEMRVILDNEEQRELQKLEEGEVNVLDNLAAATDQLVQQRQDASTLISDLQRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QKILKGFNEMRVILDNEEQRELQKLEEGEVNVLDNLAAATDQLVQQRQDASTLISDLQRR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LRGSSVEMLQDVIDVMKRSESWTLKKPKSVSKKLKSVFRVPDLSGMLQVLKELTDVQYYW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LRGSSVEMLQDVIDVMKRSESWTLKKPKSVSKKLKSVFRVPDLSGMLQVLKELTDVQYYW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 VDVMLNPGSATSNVAISVDQRQVKTVRTCTFKNSNPCDFSAFGVFGCQYFSSGKYYWEVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VDVMLNPGSATSNVAISVDQRQVKTVRTCTFKNSNPCDFSAFGVFGCQYFSSGKYYWEVD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 VSGKIAWILGVHSKISSLNKRKSSGFAFDPSVNYSKVYSRYRPQYGYWVIGLQNTCEYNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VSGKIAWILGVHSKISSLNKRKSSGFAFDPSVNYSKVYSRYRPQYGYWVIGLQNTCEYNA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 FEDSSSSDPKVLTLFMAVPPCRIGVFLDYEAGIVSFFNVTNHGALIYKFSGCRFSRPAYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 FEDSSSSDPKVLTLFMAVPPCRIGVFLDYEAGIVSFFNVTNHGALIYKFSGCRFSRPAYP
430 440 450 460 470 480
490
pF1KB7 YFNPWNCLVPMTVCPPSS
::::::::::::::::::
NP_006 YFNPWNCLVPMTVCPPSS
490
>>NP_001186502 (OMIM: 606559) E3 ubiquitin-protein ligas (494 aa)
initn: 2162 init1: 2162 opt: 3340 Z-score: 2199.0 bits: 416.4 E(85289): 9.5e-116
Smith-Waterman score: 3340; 99.2% identity (99.2% similar) in 498 aa overlap (1-498:1-494)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDFSVKVDIEKEVTCPICLELLTEPLSLDCGHSFCQACITAKIKESVIISRGESSCPVCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MDFSVKVDIEKEVTCPICLELLTEPLSLDCGHSFCQACITAKIKESVIISRGESSCPVCQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 TRFQPGNLRPNRHLANIVERVKEVKMSPQEGQKRDVCEHHGKKLQIFCKEDGKVICWVCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TRFQPGNLRPNRHLANIVERVKEVKMSPQEGQKRDVCEHHGKKLQIFCKEDGKVICWVCE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 LSQEHQGHQTFRINEVVKECQEKLQVALQRLIKEDQEAEKLEDDIRQERTAWKNYIQIER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
NP_001 LSQEHQGHQTFRINEVVKECQEKLQVALQRLIKEDQEAEKLEDDIRQERTAWK----IER
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QKILKGFNEMRVILDNEEQRELQKLEEGEVNVLDNLAAATDQLVQQRQDASTLISDLQRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QKILKGFNEMRVILDNEEQRELQKLEEGEVNVLDNLAAATDQLVQQRQDASTLISDLQRR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LRGSSVEMLQDVIDVMKRSESWTLKKPKSVSKKLKSVFRVPDLSGMLQVLKELTDVQYYW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRGSSVEMLQDVIDVMKRSESWTLKKPKSVSKKLKSVFRVPDLSGMLQVLKELTDVQYYW
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 VDVMLNPGSATSNVAISVDQRQVKTVRTCTFKNSNPCDFSAFGVFGCQYFSSGKYYWEVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VDVMLNPGSATSNVAISVDQRQVKTVRTCTFKNSNPCDFSAFGVFGCQYFSSGKYYWEVD
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 VSGKIAWILGVHSKISSLNKRKSSGFAFDPSVNYSKVYSRYRPQYGYWVIGLQNTCEYNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSGKIAWILGVHSKISSLNKRKSSGFAFDPSVNYSKVYSRYRPQYGYWVIGLQNTCEYNA
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 FEDSSSSDPKVLTLFMAVPPCRIGVFLDYEAGIVSFFNVTNHGALIYKFSGCRFSRPAYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FEDSSSSDPKVLTLFMAVPPCRIGVFLDYEAGIVSFFNVTNHGALIYKFSGCRFSRPAYP
420 430 440 450 460 470
490
pF1KB7 YFNPWNCLVPMTVCPPSS
::::::::::::::::::
NP_001 YFNPWNCLVPMTVCPPSS
480 490
>>XP_005253240 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite moti (493 aa)
initn: 1465 init1: 803 opt: 1768 Z-score: 1174.8 bits: 226.9 E(85289): 1.1e-58
Smith-Waterman score: 1774; 53.5% identity (75.4% similar) in 512 aa overlap (1-498:1-493)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDFSVKVDIEKEVTCPICLELLTEPLSLDCGHSFCQACITAKIKESVIISRGESSCPVCQ
: .. :....::::::::::::.::::::::::::::.::. :.: ....::::::::.
XP_005 MASGILVNVKEEVTCPICLELLTQPLSLDCGHSFCQACLTANHKKS-MLDKGESSCPVCR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 TRFQPGNLRPNRHLANIVERVKEVKMSPQEGQKRDVCEHHGKKLQIFCKEDGKVICWVCE
.:: :.:::::.:::::...:::.:: :::: : : .::.:: .::.::::::::.::
XP_005 ISYQPENIRPNRHVANIVEKLREVKLSP-EGQKVDHCARHGEKLLLFCQEDGKVICWLCE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 LSQEHQGHQTFRINEVVKECQEKLQVALQRLIKEDQEAEKLEDDIRQERTAWKNYIQIER
::::.::.:: .::..: : :::.::. : ...::::.:: :::.:...::. :: ..
XP_005 RSQEHRGHHTFLTEEVAREYQVKLQAALEMLRQKQQEAEELEADIREEKASWKTQIQYDK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QKILKGFNEMRVILDNEEQRELQKLEEGEVNVLDNLAAATDQLVQQRQDASTLISDLQRR
..: :...: ::: ::. :::.::. : ..: .:. . ..::: :. :::::..:
XP_005 TNVLADFEQLRDILDWEESNELQNLEKEEEDILKSLTNSETEMVQQTQSLRELISDLEHR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LRGSSVEMLQDVIDVMKRSESWTLKKPKSVSKKLKSVFRVPDLSGMLQVLKELTDVQYYW
:.:: .:.:: : :.::.:. :::::.. :. . :::.:::.:::.:..:::::. ::
XP_005 LQGSVMELLQGVDGVIKRTENVTLKKPETFPKNQRRVFRAPDLKGMLEVFRELTDVRRYW
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340
pF1KB7 VDVMLNPGSATSNVAISVDQRQVKT-----------VRTCTFKNSNPCDFSAFGVFGCQY
::: . :.. . : :: :.:::.. .: :: : : : :..: :
XP_005 VDVTVAPNNISCAV-ISEDKRQVSSPKPQIIYGARGTRYQTFVNFNYCT----GILGSQS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 FSSGKYYWEVDVSGKIAWILGVHSKISSLNKRKSSGFAFDPSVNYSKVYSRYRPQYGYWV
..:::.::::::: : :::::: .:: : : : :.:.:::::
XP_005 ITSGKHYWEVDVSKKTAWILGV-----------CAGFQPDAMCNIEK-NENYQPKYGYWV
360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 IGLQNTCEYNAFEDSSSSDPKV---LTLFMAVPPCRIGVFLDYEAGIVSFFNVTNHGALI
:::.. . .::.::: :.: . : . . : :.:::::::: :::::.:::: ::
XP_005 IGLEEGVKCSAFQDSSFHTPSVPFIVPLSVIICPDRVGVFLDYEACTVSFFNITNHGFLI
410 420 430 440 450 460
470 480 490
pF1KB7 YKFSGCRFSRPAYPYFNPWNCLVPMTVCPPSS
:::: : ::.:..::.:: .: ::::.: :::
XP_005 YKFSHCSFSQPVFPYLNPRKCGVPMTLCSPSS
470 480 490
>>NP_149023 (OMIM: 608487) tripartite motif-containing p (493 aa)
initn: 1465 init1: 803 opt: 1768 Z-score: 1174.8 bits: 226.9 E(85289): 1.1e-58
Smith-Waterman score: 1774; 53.5% identity (75.4% similar) in 512 aa overlap (1-498:1-493)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDFSVKVDIEKEVTCPICLELLTEPLSLDCGHSFCQACITAKIKESVIISRGESSCPVCQ
: .. :....::::::::::::.::::::::::::::.::. :.: ....::::::::.
NP_149 MASGILVNVKEEVTCPICLELLTQPLSLDCGHSFCQACLTANHKKS-MLDKGESSCPVCR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 TRFQPGNLRPNRHLANIVERVKEVKMSPQEGQKRDVCEHHGKKLQIFCKEDGKVICWVCE
.:: :.:::::.:::::...:::.:: :::: : : .::.:: .::.::::::::.::
NP_149 ISYQPENIRPNRHVANIVEKLREVKLSP-EGQKVDHCARHGEKLLLFCQEDGKVICWLCE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 LSQEHQGHQTFRINEVVKECQEKLQVALQRLIKEDQEAEKLEDDIRQERTAWKNYIQIER
::::.::.:: .::..: : :::.::. : ...::::.:: :::.:...::. :: ..
NP_149 RSQEHRGHHTFLTEEVAREYQVKLQAALEMLRQKQQEAEELEADIREEKASWKTQIQYDK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QKILKGFNEMRVILDNEEQRELQKLEEGEVNVLDNLAAATDQLVQQRQDASTLISDLQRR
..: :...: ::: ::. :::.::. : ..: .:. . ..::: :. :::::..:
NP_149 TNVLADFEQLRDILDWEESNELQNLEKEEEDILKSLTNSETEMVQQTQSLRELISDLEHR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LRGSSVEMLQDVIDVMKRSESWTLKKPKSVSKKLKSVFRVPDLSGMLQVLKELTDVQYYW
:.:: .:.:: : :.::.:. :::::.. :. . :::.:::.:::.:..:::::. ::
NP_149 LQGSVMELLQGVDGVIKRTENVTLKKPETFPKNQRRVFRAPDLKGMLEVFRELTDVRRYW
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340
pF1KB7 VDVMLNPGSATSNVAISVDQRQVKT-----------VRTCTFKNSNPCDFSAFGVFGCQY
::: . :.. . : :: :.:::.. .: :: : : : :..: :
NP_149 VDVTVAPNNISCAV-ISEDKRQVSSPKPQIIYGARGTRYQTFVNFNYCT----GILGSQS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 FSSGKYYWEVDVSGKIAWILGVHSKISSLNKRKSSGFAFDPSVNYSKVYSRYRPQYGYWV
..:::.::::::: : :::::: .:: : : : :.:.:::::
NP_149 ITSGKHYWEVDVSKKTAWILGV-----------CAGFQPDAMCNIEK-NENYQPKYGYWV
360 370 380 390 400
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pF1KB7 IGLQNTCEYNAFEDSSSSDPKV---LTLFMAVPPCRIGVFLDYEAGIVSFFNVTNHGALI
:::.. . .::.::: :.: . : . . : :.:::::::: :::::.:::: ::
NP_149 IGLEEGVKCSAFQDSSFHTPSVPFIVPLSVIICPDRVGVFLDYEACTVSFFNITNHGFLI
410 420 430 440 450 460
470 480 490
pF1KB7 YKFSGCRFSRPAYPYFNPWNCLVPMTVCPPSS
:::: : ::.:..::.:: .: ::::.: :::
NP_149 YKFSHCSFSQPVFPYLNPRKCGVPMTLCSPSS
470 480 490
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10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDFSVKVDIEKEVTCPICLELLTEPLSLDCGHSFCQACITAKIKESVIISRGESSCPVCQ
: : :::..::::::::::::::::.:::::::::::: . .:::: ..:: ::::::
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: .:::::::::::::::.:..:: ..: . : .: ::.:::.::.::::::::.::
NP_477 TSYQPGNLRPNRHLANIVRRLREVVLGPGKQLKAVLCADHGEKLQLFCQEDGKVICWLCE
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 LSQEHQGHQTFRINEVVKECQEKLQVALQRLIKEDQEAEKLEDDIRQERTAWKNYIQIER
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NP_477 RSQEHRGHHTFLVEEVAQEYQEKFQESLKKLKNEEQEAEKLTAFIREKKTSWKNQMEPER
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QKILKGFNEMRVILDNEEQRELQKLEEGEVNVLDNLAAATDQLVQQRQDASTLISDLQRR
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NP_477 CRIQTEFNQLRNILDRVEQRELKKLEQEEKKGLRIIEEAENDLVHQTQSLRELISDLERR
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pF1KB7 LRGSSVEMLQDVIDVMKRSESWTLKKPKSVSKKLKSVFRVPDLSGMLQVLKELTDVQYYW
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::: ::: .:. :.... ..:::. : . : :.: : . . .:.: :.:::::.::
NP_477 VDVTLNPHTANLNLVLAKNRRQVRFVGA---KVSGPSCLEKHYDCSVLGSQHFSSGKHYW
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pF1KB7 EVDVSGKIAWILGVHSKISSLNKRKSSGFAFDPSVNYSKVYSRYRPQYGYWVIGLQNTCE
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pF1KB7 YNAFEDSSSSDPKVLTLFMAVPPCRIGVFLDYEAGIVSFFNVTNHGALIYKFSGCRFSRP
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NP_477 YRAYEDSSPS----LLLSMTVPPRRVGVFLDYEAGTVSFYNVTNHGFPIYTFSKYYFPTT
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pF1KB7 AYPYFNPWNCLVPMTVCPPSS
::::: ::..:::. :::
NP_477 LCPYFNPCNCVIPMTLRRPSS
470 480
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10 20 30
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40 50 60 70 80 90
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NP_001 SFCQACITPNGRESVIGQEGERSCPVCQTSYQPGNLRPNRHLANIVRRLREVVLGPGKQL
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pF1KB7 KRDVCEHHGKKLQIFCKEDGKVICWVCELSQEHQGHQTFRINEVVKECQEKLQVALQRLI
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pF1KB7 KEDQEAEKLEDDIRQERTAWKNYIQIERQKILKGFNEMRVILDNEEQRELQKLEEGEVNV
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NP_001 NEEQEAEKLTAFIREKKTSWKNQMEPERCRIQTEFNQLRNILDRVEQRELKKLEQEEKKG
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pF1KB7 LDNLAAATDQLVQQRQDASTLISDLQRRLRGSSVEMLQDVIDVMKRSESWTLKKPKSVSK
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NP_001 LRIIEEAENDLVHQTQSLRELISDLERRCQGSTMELLQDVSDVTERSEFWTLRKPEALPT
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280 290 300 310 320 330
pF1KB7 KLKSVFRVPDLSGMLQVLKELTDVQYYWVDVMLNPGSATSNVAISVDQRQVKTVRTCTFK
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NP_001 KLRSMFRAPDLKRMLRVCRELTDVQSYWVDVTLNPHTANLNLVLAKNRRQVRFVGA---K
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pF1KB7 NSNP-CDFSAF--GVFGCQYFSSGKYYWEVDVSGKIAWILGVHSKISSLNKRKSSGFAFD
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NP_001 VSGPSCLEKHYDCSVLGSQHFSSGKHYWEVDVAKKTAWILGVCS--NSLGPT----FSFN
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pF1KB7 PSVNYSKVYSRYRPQYGYWVIGLQNTCEYNAFEDSSSSDPKVLTLFMAVPPCRIGVFLDY
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NP_001 HFAQNHSAYSRYQPQSGYWVIGLQHNHEYRAYEDSSPS----LLLSMTVPPRRVGVFLDY
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450 460 470 480 490
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NP_001 EAGTVSFYNVTNHGFPIYTFSKYYFPTTLCPYFNPCNCVIPMTLRRPSS
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10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDFSVKVDIEKEVTCPICLELLTEPLSLDCGHSFCQACITAKIKESVIISRGESSCPVCQ
: .. .....::::::::::::::::::::::.:.::::.. ::.: :.::::::
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pF1KB7 LSQEHQGHQTFRINEVVKECQEKLQVALQRLIKEDQEAEKLEDDIRQERTAWKNYIQIER
::::.::.: .:: ::::::::..:.:: ::..:::::: :::.:.:.:: .: ::
NP_067 RSQEHRGHHTVLTEEVFKECQEKLQAVLKRLKKEEEEAEKLEADIREEKTSWKYQVQTER
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pF1KB7 QKILKGFNEMRVILDNEEQRELQKLEEGEVNVLDNLAAATDQLVQQRQDASTLISDLQRR
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NP_067 QRIQTEFDQLRSILNNEEQRELQRLEEEEKKTLDKFAEAEDELVQQKQLVRELISDVECR
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pF1KB7 LRGSSVEMLQDVIDVMKRSESWTLKKPKSVSKKLKSVFRVPDLSGMLQVLKELTDVQYYW
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NP_067 SQWSTMELLQDMSGIMKWSEIWRLKKPKMVSKKLKTVFHAPDLSRMLQMFRELTAVRCYW
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NP_067 VDVTLNSVNLNLNLVLSEDQRQVISVPIWPFQCYN------YGVLGSQYFSSGKHYWEVD
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pF1KB7 VSGKIAWILGVHSKISSLNKRKSSGFAFDPSVNYSKVYSRYRPQYGYWVIGLQNTCEYNA
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NP_067 VSKKTAWILGVYCRTYSRHMK----YVVRRCANRQNLYTKYRPLFGYWVIGLQNKCKYGV
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pF1KB7 FEDSSSSDPKVLTLFMAVPPCRIGVFLDYEAGIVSFFNVTNHGALIYKFSGCRFSRPAYP
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490
pF1KB7 YFNPWNCLVPMTVCPPSS
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NP_067 YFNPWNCPAPMTLCPPSS
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10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDFSVKVDIEKEVTCPICLELLTEPLSLDCGHSFCQACITAKIKESVIISRGESSCPVCQ
: .. .....::::::::::::::::::::::.:.::::.. ::.: :.::::::
NP_001 MASKILLNVQEEVTCPICLELLTEPLSLDCGHSLCRACITVSNKEAVTSMGGKSSCPVCG
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pF1KB7 TRFQPGNLRPNRHLANIVERVKEVKMSPQEGQKRDVCEHHGKKLQIFCKEDGKVICWVCE
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NP_001 ISYSFEHLQANQHLANIVERLKEVKLSPDNGKKRDLCDHHGEKLLLFCKEDRKVICWLCE
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 LSQEHQGHQTFRINEVVKECQEKLQVALQRLIKEDQEAEKLEDDIRQERTAWKNYIQIER
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NP_001 RSQEHRGHHTVLTEEVFKECQEKLQAVLKRLKKEEEEAEKLEADIREEKTSWKYQVQTER
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pF1KB7 QKILKGFNEMRVILDNEEQRELQKLEEGEVNVLDNLAAATDQLVQQRQDASTLISDLQRR
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NP_001 QRIQTEFDQLRSILNNEEQRELQRLEEEEKKTLDKFAEAEDELVQQKQLVRELISDVECR
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pF1KB7 LRGSSVEMLQDVIDVMKRSESWTLKKPKSVSKKLKSVFRVPDLSGMLQVLKELTDVQYYW
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NP_001 SQWSTMELLQDMSGIMKWSEIWRLKKPKMVSKKLKTVFHAPDLSRMLQMFRELTAVRCYW
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pF1KB7 VDVMLNPGSATSNVAISVDQRQVKTVRTCTFKNSNPCDFSAFGVFGCQYFSSGKYYWEVD
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NP_001 VDVTLNSVNLNLNLVLSEDQRQVISVPIWPFQCYN------YGVLGSQYFSSGKHYWEVD
310 320 330 340 350
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pF1KB7 VSGKIAWILGVHSKISSLNKRKSSGFAFDPSVNYSKVYSRYRPQYGYWVIGLQNTCEYNA
:: : ::::::. . : . . .. .: ...:..::: .::::::::: :.:..
NP_001 VSKKTAWILGVYCRTYSRHMK----YVVRRCANRQNLYTKYRPLFGYWVIGLQNKCKYGV
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pF1KB7 FEDSSSSDPKVLTLFMAVPPCRIGVFLDYEAGIVSFFNVTNHGALIYKFSGCRFSRPAYP
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pF1KB7 YFNPWNCLVPMTVCPPSS
::::::: .:::.:::::
NP_001 YFNPWNCPAPMTLCPPSS
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pF1KB7 TRFQPGNLRPNRHLANIVERVKEVKMSPQEGQKRDVCEHHGKKLQIFCKEDGKVICWVCE
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XP_016 ISYQPENIRPNRHVANIVEKLREVKLSP-EGQKVDHCARHGEKLLLFCQEDGKVICWLCE
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XP_016 RSQEHRGHHTFLTEEVAREYQVKLQAALEMLRQKQQEAEELEADIREEKASWKTQIQYDK
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pF1KB7 QKILKGFNEMRVILDNEEQRELQKLEEGEVNVLDNLAAATDQLVQQRQDASTLISDLQRR
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XP_016 TNVLADFEQLRDILDWEESNELQNLEKEEEDILKSLTNSETEMVQQTQSLRELISDLEHR
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:.:: .:.:: : :.::.:. :::::.. :. . :::.:::.:::.:..:::::. ::
XP_016 LQGSVMELLQGVDGVIKRTENVTLKKPETFPKNQRRVFRAPDLKGMLEVFRELTDVRRYW
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:
XP_016 ED
300
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pF1KB7 MDFSVKVDIEKEVTCPICLELLTEPLSLDCGHSFCQACITAKIKESVIISRGESSCPVCQ
: .. :....::::::::::::.::::::::::::::.::. :.: ....::::::::.
XP_005 MASGILVNVKEEVTCPICLELLTQPLSLDCGHSFCQACLTANHKKS-MLDKGESSCPVCR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 TRFQPGNLRPNRHLANIVERVKEVKMSPQEGQKRDVCEHHGKKLQIFCKEDGKVICWVCE
.:: :.:::::.:::::...:::.:: :::: : : .::.:: .::.::::::::.::
XP_005 ISYQPENIRPNRHVANIVEKLREVKLSP-EGQKVDHCARHGEKLLLFCQEDGKVICWLCE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 LSQEHQGHQTFRINEVVKECQEKLQVALQRLIKEDQEAEKLEDDIRQERTAWKNYIQIER
::::.::.:: .::..: : :::.::. : ...::::.:: :::.:...::. :: ..
XP_005 RSQEHRGHHTFLTEEVAREYQVKLQAALEMLRQKQQEAEELEADIREEKASWKTQIQYDK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QKILKGFNEMRVILDNEEQRELQKLEEGEVNVLDNLAAATDQLVQQRQDASTLISDLQRR
..: :...: ::: ::. :::.::. : ..: .:. . ..::: :. :::::..:
XP_005 TNVLADFEQLRDILDWEESNELQNLEKEEEDILKSLTNSETEMVQQTQSLRELISDLEHR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LRGSSVEMLQDVIDVMKRSESWTLKKPKSVSKKLKSVFRVPDLSGMLQVLKELTDVQYYW
:.:: .:.:: : :.::.:. :::::.. :. . :::.:::.:::.:..:::::. ::
XP_005 LQGSVMELLQGVDGVIKRTENVTLKKPETFPKNQRRVFRAPDLKGMLEVFRELTDVRRYW
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 VDVMLNPGSATSNVAISVDQRQVKTVRTCTFKNSNPCDFSAFGVFGCQYFSSGKYYWEVD
XP_005 GWSAMARSRFTATSTSQIQAILLPQPPK
300 310 320
498 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 09:24:53 2016 done: Fri Nov 4 09:24:54 2016
Total Scan time: 8.890 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]