Result of FASTA (omim) for
pF1KB7726
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7726, 480 aa
1>>>pF1KB7726 480 - 480 aa - 480 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.1818+/-0.000398; mu= -11.3445+/- 0.025
mean_var=477.2785+/-98.782, 0's: 0 Z-trim(125.2): 1762 B-trim: 0 in 0/61
Lambda= 0.058707
statistics sampled from 46299 (48402) to 46299 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.82), E-opt: 0.2 (0.568), width: 16
Scan time: 12.330
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_862827 (OMIM: 608992) B-cell CLL/lymphoma 6 mem ( 480) 3346 297.4 5.7e-80
NP_001124317 (OMIM: 109565) B-cell lymphoma 6 prot ( 706) 1022 100.8 1.3e-20
NP_001697 (OMIM: 109565) B-cell lymphoma 6 protein ( 706) 1022 100.8 1.3e-20
XP_005247751 (OMIM: 109565) PREDICTED: B-cell lymp ( 706) 1022 100.8 1.3e-20
NP_001128210 (OMIM: 109565) B-cell lymphoma 6 prot ( 650) 833 84.7 8.3e-16
XP_011511364 (OMIM: 109565) PREDICTED: B-cell lymp ( 650) 833 84.7 8.3e-16
XP_006718372 (OMIM: 605015) PREDICTED: zinc finger ( 592) 578 63.1 2.5e-09
XP_011518659 (OMIM: 605015) PREDICTED: zinc finger ( 592) 578 63.1 2.5e-09
XP_016873758 (OMIM: 605015) PREDICTED: zinc finger ( 592) 578 63.1 2.5e-09
XP_005253186 (OMIM: 605015) PREDICTED: zinc finger ( 592) 578 63.1 2.5e-09
NP_037381 (OMIM: 605015) zinc finger protein 214 [ ( 606) 578 63.1 2.5e-09
XP_005253185 (OMIM: 605015) PREDICTED: zinc finger ( 606) 578 63.1 2.5e-09
XP_006718371 (OMIM: 605015) PREDICTED: zinc finger ( 606) 578 63.1 2.5e-09
XP_011518657 (OMIM: 605015) PREDICTED: zinc finger ( 617) 578 63.1 2.5e-09
XP_016882723 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 518) 572 62.5 3.2e-09
NP_001243102 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 531) 572 62.5 3.2e-09
XP_011526566 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 536) 572 62.5 3.3e-09
XP_005259469 (OMIM: 604749) PREDICTED: zinc finger ( 734) 575 62.9 3.4e-09
NP_004225 (OMIM: 604749) zinc finger protein 235 [ ( 738) 575 62.9 3.4e-09
NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595) 572 62.6 3.5e-09
NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 625) 572 62.6 3.6e-09
XP_011526565 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 640) 572 62.6 3.7e-09
XP_016881641 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 502) 566 62.0 4.4e-09
XP_016881642 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 502) 566 62.0 4.4e-09
XP_011532947 (OMIM: 602444) PREDICTED: zinc finger ( 563) 564 61.9 5.4e-09
NP_001311268 (OMIM: 602444) zinc finger protein 35 ( 563) 564 61.9 5.4e-09
XP_016881640 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 669) 566 62.1 5.4e-09
XP_016868071 (OMIM: 194510) PREDICTED: zinc finger ( 410) 560 61.4 5.4e-09
NP_001265220 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 ( 410) 560 61.4 5.4e-09
NP_001265221 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 ( 410) 560 61.4 5.4e-09
XP_006716174 (OMIM: 194510) PREDICTED: zinc finger ( 410) 560 61.4 5.4e-09
XP_016868072 (OMIM: 194510) PREDICTED: zinc finger ( 410) 560 61.4 5.4e-09
XP_016881639 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 688) 566 62.1 5.5e-09
NP_001318063 (OMIM: 606954) zinc finger protein 25 ( 423) 560 61.4 5.6e-09
XP_016881638 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 700) 566 62.1 5.6e-09
XP_006723037 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 700) 566 62.1 5.6e-09
NP_006621 (OMIM: 604750) zinc finger protein 234 [ ( 700) 566 62.1 5.6e-09
NP_001138296 (OMIM: 604750) zinc finger protein 23 ( 700) 566 62.1 5.6e-09
NP_001318062 (OMIM: 606954) zinc finger protein 25 ( 435) 560 61.4 5.7e-09
XP_016865280 (OMIM: 602444) PREDICTED: zinc finger ( 605) 564 61.9 5.7e-09
NP_005640 (OMIM: 602444) zinc finger protein 354A ( 605) 564 61.9 5.7e-09
NP_001265216 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 ( 446) 560 61.5 5.8e-09
NP_001265213 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 ( 446) 560 61.5 5.8e-09
NP_116313 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 iso ( 446) 560 61.5 5.8e-09
NP_001265219 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 ( 446) 560 61.5 5.8e-09
NP_001305064 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 ( 446) 560 61.5 5.8e-09
NP_001305065 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 ( 453) 560 61.5 5.8e-09
NP_066385 (OMIM: 606954) zinc finger protein 253 i ( 499) 560 61.5 6.3e-09
NP_001264877 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 560 61.5 6.4e-09
NP_001264878 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 560 61.5 6.4e-09
>>NP_862827 (OMIM: 608992) B-cell CLL/lymphoma 6 member (480 aa)
initn: 3346 init1: 3346 opt: 3346 Z-score: 1556.8 bits: 297.4 E(85289): 5.7e-80
Smith-Waterman score: 3346; 100.0% identity (100.0% similar) in 480 aa overlap (1-480:1-480)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGSPAAPEGALGYVREFTRHSSDVLGNLNELRLRGILTDVTLLVGGQPLRAHKAVLIACS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_862 MGSPAAPEGALGYVREFTRHSSDVLGNLNELRLRGILTDVTLLVGGQPLRAHKAVLIACS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 GFFYSIFRGRAGVGVDVLSLPGGPEARGFAPLLDFMYTSRLRLSPATAPAVLAAATYLQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_862 GFFYSIFRGRAGVGVDVLSLPGGPEARGFAPLLDFMYTSRLRLSPATAPAVLAAATYLQM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 EHVVQACHRFIQASYEPLGISLRPLEAEPPTPPTAPPPGSPRRSEGHPDPPTESRSCSQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_862 EHVVQACHRFIQASYEPLGISLRPLEAEPPTPPTAPPPGSPRRSEGHPDPPTESRSCSQG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PPSPASPDPKACNWKKYKYIVLNSQASQAGSLVGERSSGQPCPQARLPSGDEASSSSSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_862 PPSPASPDPKACNWKKYKYIVLNSQASQAGSLVGERSSGQPCPQARLPSGDEASSSSSSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SSSSSEEGPIPGPQSRLSPTAATVQFKCGAPASTPYLLTSQAQDTSGSPSERARPLPGSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_862 SSSSSEEGPIPGPQSRLSPTAATVQFKCGAPASTPYLLTSQAQDTSGSPSERARPLPGSE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 FFSCQNCEAVAGCSSGLDSLVPGDEDKPYKCQLCRSSFRYKGNLASHRTVHTGEKPYHCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_862 FFSCQNCEAVAGCSSGLDSLVPGDEDKPYKCQLCRSSFRYKGNLASHRTVHTGEKPYHCS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 ICGARFNRPANLKTHSRIHSGEKPYKCETCGSRFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCPTCGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_862 ICGARFNRPANLKTHSRIHSGEKPYKCETCGSRFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCPTCGT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 RFRHLQTLKSHVRIHTGEKPYHCDPCGLHFRHKSQLRLHLRQKHGAATNTKVHYHILGGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_862 RFRHLQTLKSHVRIHTGEKPYHCDPCGLHFRHKSQLRLHLRQKHGAATNTKVHYHILGGP
430 440 450 460 470 480
>>NP_001124317 (OMIM: 109565) B-cell lymphoma 6 protein (706 aa)
initn: 2239 init1: 978 opt: 1022 Z-score: 490.8 bits: 100.8 E(85289): 1.3e-20
Smith-Waterman score: 1163; 48.2% identity (63.8% similar) in 434 aa overlap (94-476:272-693)
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YSIFRGRAGVGVDVLSLPGGPEARGFAPLLDFMYTSRLRLSPATAPAVLAAATYLQMEHV
:. :. :.:: ::.. : .
NP_001 YSRPTLEVSPNVCHSNIYSPKETIPEEARSDMHYSVAEGLKPA-APSARNAPYF------
250 260 270 280 290
130 140 150 160 170
pF1KB7 VQACHRFIQASYEPLGISLRPLEAEPPTPPTAPP----PGSPRRSEGHPDPPTESRS---
: . . .: . . :. :::. : : ::..:. .:. :::: :
NP_001 --PCDKASKEEERPSSEDEIALHFEPPNAPLNRKGLVSPQSPQKSDCQPNSPTESCSSKN
300 310 320 330 340 350
180 190 200 210 220
pF1KB7 -C----SQGPPSPASPDPKACNWKKYKYIVLNS---QASQAGSLVGERSSGQP----CPQ
: : .::. . :::::::::::.::::: .:. : .: . .: :
NP_001 ACILQASGSPPAKSPTDPKACNWKKYKFIVLNSLNQNAKPEGPEQAELGRLSPRAYTAPP
360 370 380 390 400 410
230 240 250 260 270
pF1KB7 ARLPSGDEASSSSSSSS--SSSSEEGPIPGPQSRLSPTAATVQFKCGAPAST-----PYL
: : . . . .: . :.:.:.. :: :::. . . :.: :. :
NP_001 ACQPPMEPENLDLQSPTKLSASGEDSTIP-QASRLNNIVNRSM--TGSPRSSSESHSPLY
420 430 440 450 460
280 290 300 310
pF1KB7 LTSQAQDTSGSPSER--------ARP-LP---G---SEF---------FSCQNCEAVAGC
. . :: : . : : .: : ::. : :..:. .
NP_001 MHPPKCTSCGSQSPQHAEMCLHTAGPTFPEEMGETQSEYSDSSCENGAFFCNECDCRFSE
470 480 490 500 510 520
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 SSGLDS-LVPGDEDKPYKCQLCRSSFRYKGNLASHRTVHTGEKPYHCSICGARFNRPANL
..: . ::::::. :..:::::::::::.:::::::::.:.::::.:::::::
NP_001 EASLKRHTLQTHSDKPYKCDRCQASFRYKGNLASHKTVHTGEKPYRCNICGAQFNRPANL
530 540 550 560 570 580
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 KTHSRIHSGEKPYKCETCGSRFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCPTCGTRFRHLQTLKSHV
:::.:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::.
NP_001 KTHTRIHSGEKPYKCETCGARFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCEICGTRFRHLQTLKSHL
590 600 610 620 630 640
440 450 460 470 480
pF1KB7 RIHTGEKPYHCDPCGLHFRHKSQLRLHLRQKHGAATNTKVHYHILGGP
:::::::::::. :.::::::::::::::::::: :::::.:..
NP_001 RIHTGEKPYHCEKCNLHFRHKSQLRLHLRQKHGAITNTKVQYRVSATDLPPELPKAC
650 660 670 680 690 700
>--
initn: 483 init1: 423 opt: 424 Z-score: 217.1 bits: 50.1 E(85289): 2.4e-05
Smith-Waterman score: 424; 36.2% identity (57.2% similar) in 271 aa overlap (16-275:10-261)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGSPAAPEGALGYVREFTRHSSDVLGNLNELRLRGILTDVTLLVGGQPLRAHKAVLIACS
.::::.:::: :::.:: : :::::...:. . .::::.::.:::
NP_001 MASPADSCIQFTRHASDVLLNLNRLRSRDILTDVVIVVSREQFRAHKTVLMACS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 GFFYSIFRGRAGVGVDVLSLPGGPEARGFAPLLDFMYTSRLRLSPATAPAVLAAATYLQM
:.::::: . ...:..: . .:: :::::::::: : .. ::.:.: ::::
NP_001 GLFYSIFTDQLKCNLSVINLDPEINPEGFCILLDFMYTSRLNLREGNIMAVMATAMYLQM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB7 EHVVQACHRFIQASYEPLGISLRPLEAEPPTPPTAPPP------GSPRRSEGHP---DPP
::::..:..::.:: . ...: . : . : : .. : :
NP_001 EHVVDTCRKFIKASEAEMVSAIKPPREEFLNSRMLMPQDIMAYRGREVVENNLPLRSAPG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB7 TESRSCSQGPPSPASPDPKACNWKKYKYIVLNSQASQAGSLVGERSS-GQPCPQAR-LPS
:::. . . : : : . .. :... ..: . . : ..: :. : ::
NP_001 CESRAFAPSLYSGLSTPPAS--YSMYSHLPVSSLLFSDEEFRDVRMPVANPFPKERALPC
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 GDEASSSSSSSSSSSSEEGPIPGPQSRLSPTAATVQFKCGAPASTPYLLTSQAQDTSGSP
: : :.:: :: :: . : . .:
NP_001 -DSAR--------------PVPGEYSR--PTLEVSPNVCHSNIYSPKETIPEEARSDMHY
240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 SERARPLPGSEFFSCQNCEAVAGCSSGLDSLVPGDEDKPYKCQLCRSSFRYKGNLASHRT
NP_001 SVAEGLKPAAPSARNAPYFPCDKASKEEERPSSEDEIALHFEPPNAPLNRKGLVSPQSPQ
280 290 300 310 320 330
>>NP_001697 (OMIM: 109565) B-cell lymphoma 6 protein iso (706 aa)
initn: 2239 init1: 978 opt: 1022 Z-score: 490.8 bits: 100.8 E(85289): 1.3e-20
Smith-Waterman score: 1163; 48.2% identity (63.8% similar) in 434 aa overlap (94-476:272-693)
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YSIFRGRAGVGVDVLSLPGGPEARGFAPLLDFMYTSRLRLSPATAPAVLAAATYLQMEHV
:. :. :.:: ::.. : .
NP_001 YSRPTLEVSPNVCHSNIYSPKETIPEEARSDMHYSVAEGLKPA-APSARNAPYF------
250 260 270 280 290
130 140 150 160 170
pF1KB7 VQACHRFIQASYEPLGISLRPLEAEPPTPPTAPP----PGSPRRSEGHPDPPTESRS---
: . . .: . . :. :::. : : ::..:. .:. :::: :
NP_001 --PCDKASKEEERPSSEDEIALHFEPPNAPLNRKGLVSPQSPQKSDCQPNSPTESCSSKN
300 310 320 330 340 350
180 190 200 210 220
pF1KB7 -C----SQGPPSPASPDPKACNWKKYKYIVLNS---QASQAGSLVGERSSGQP----CPQ
: : .::. . :::::::::::.::::: .:. : .: . .: :
NP_001 ACILQASGSPPAKSPTDPKACNWKKYKFIVLNSLNQNAKPEGPEQAELGRLSPRAYTAPP
360 370 380 390 400 410
230 240 250 260 270
pF1KB7 ARLPSGDEASSSSSSSS--SSSSEEGPIPGPQSRLSPTAATVQFKCGAPAST-----PYL
: : . . . .: . :.:.:.. :: :::. . . :.: :. :
NP_001 ACQPPMEPENLDLQSPTKLSASGEDSTIP-QASRLNNIVNRSM--TGSPRSSSESHSPLY
420 430 440 450 460
280 290 300 310
pF1KB7 LTSQAQDTSGSPSER--------ARP-LP---G---SEF---------FSCQNCEAVAGC
. . :: : . : : .: : ::. : :..:. .
NP_001 MHPPKCTSCGSQSPQHAEMCLHTAGPTFPEEMGETQSEYSDSSCENGAFFCNECDCRFSE
470 480 490 500 510 520
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 SSGLDS-LVPGDEDKPYKCQLCRSSFRYKGNLASHRTVHTGEKPYHCSICGARFNRPANL
..: . ::::::. :..:::::::::::.:::::::::.:.::::.:::::::
NP_001 EASLKRHTLQTHSDKPYKCDRCQASFRYKGNLASHKTVHTGEKPYRCNICGAQFNRPANL
530 540 550 560 570 580
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 KTHSRIHSGEKPYKCETCGSRFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCPTCGTRFRHLQTLKSHV
:::.:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::.
NP_001 KTHTRIHSGEKPYKCETCGARFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCEICGTRFRHLQTLKSHL
590 600 610 620 630 640
440 450 460 470 480
pF1KB7 RIHTGEKPYHCDPCGLHFRHKSQLRLHLRQKHGAATNTKVHYHILGGP
:::::::::::. :.::::::::::::::::::: :::::.:..
NP_001 RIHTGEKPYHCEKCNLHFRHKSQLRLHLRQKHGAITNTKVQYRVSATDLPPELPKAC
650 660 670 680 690 700
>--
initn: 483 init1: 423 opt: 424 Z-score: 217.1 bits: 50.1 E(85289): 2.4e-05
Smith-Waterman score: 424; 36.2% identity (57.2% similar) in 271 aa overlap (16-275:10-261)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGSPAAPEGALGYVREFTRHSSDVLGNLNELRLRGILTDVTLLVGGQPLRAHKAVLIACS
.::::.:::: :::.:: : :::::...:. . .::::.::.:::
NP_001 MASPADSCIQFTRHASDVLLNLNRLRSRDILTDVVIVVSREQFRAHKTVLMACS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 GFFYSIFRGRAGVGVDVLSLPGGPEARGFAPLLDFMYTSRLRLSPATAPAVLAAATYLQM
:.::::: . ...:..: . .:: :::::::::: : .. ::.:.: ::::
NP_001 GLFYSIFTDQLKCNLSVINLDPEINPEGFCILLDFMYTSRLNLREGNIMAVMATAMYLQM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB7 EHVVQACHRFIQASYEPLGISLRPLEAEPPTPPTAPPP------GSPRRSEGHP---DPP
::::..:..::.:: . ...: . : . : : .. : :
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:::. . . : : : . .. :... ..: . . : ..: :. : ::
NP_001 CESRAFAPSLYSGLSTPPAS--YSMYSHLPVSSLLFSDEEFRDVRMPVANPFPKERALPC
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: : :.:: :: :: . : . .:
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: . . .: . . :. :::. : : ::..:. .:. :::: :
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: : .::. . :::::::::::.::::: .:. : .: . .: :
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: : . . . .: . :.:.:.. :: :::. . . :.: :. :
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. . :: : . : : .: : ::. : :..:. .
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..: . ::::::. :..:::::::::::.:::::::::.:.::::.:::::::
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:::.:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::.
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:::::::::::. :.::::::::::::::::::: :::::.:..
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:::. . . : : : . .. :... ..: . . : ..: :. : ::
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: : :.:: :: :: . : . .:
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. : :: : .: .: : .: : . ..: . :
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pF1KB7 MGSPAAPEGALGYVREFTRHSSDVLGNLNELRLRGILTDVTLLVGGQPLRAHKAVLIACS
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pF1KB7 EHVVQACHRFIQASYEPLGISLRPLEAEPPTPPTAPPP------GSPRRSEGHP---DPP
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NP_001 EHVVDTCRKFIKASEAEMVSAIKPPREEFLNSRMLMPQDIMAYRGREVVENNLPLRSAPG
120 130 140 150 160 170
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pF1KB7 TESRSCSQGPPSPASPDPKACNWKKYKYIVLNSQASQAGSLVGERSS-GQPCPQAR-LPS
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NP_001 CESRAFAPSLYSGLSTPPAS--YSMYSHLPVSSLLFSDEEFRDVRMPVANPFPKERALPC
180 190 200 210 220 230
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pF1KB7 GDEASSSSSSSSSSSSEEGPIPGPQSRLSPTAATVQFKCGAPASTPYLLTSQAQDTSGSP
: : :.:: :: :: . : . .:
NP_001 -DSAR--------------PVPGEYSR--PTLEVSPNVCHSNIYSPKETIPEEARSDMHY
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NP_001 SVAEGLKPAAPSARNAPYFPCDKASKEEERPSSEDEIALHFEPPNAPLNRKGLVSPQSPQ
280 290 300 310 320 330
>>XP_011511364 (OMIM: 109565) PREDICTED: B-cell lymphoma (650 aa)
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pF1KB7 VQACHRFIQASYEPLGISLRPLEAEPPTPPTAPP----PGSPRRSEGHPDPPTESRS---
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pF1KB7 -C----SQGPPSPASPDPKACNWKKYKYIVLNS---QASQAGSLVGERSSGQP----CPQ
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pF1KB7 ARLPSGDEASSSSSSSS--SSSSEEGPIPGPQSRLSPTAATVQFKCGAPASTPYLLTSQA
: : . . . .: . :.:.:.. :: :::. . . :.: :.
XP_011 ACQPPMEPENLDLQSPTKLSASGEDSTIP-QASRLNNIVNRSM--TGSPRSS--------
420 430 440 450 460
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pF1KB7 QDTSGSPSERARPLPGSEFFSCQNCEAVAGCSSGLDSLVPGDEDKPYKCQLCRSS----F
. : :: : .: .: : .: : . ..: . :
XP_011 -SESHSPLYMHPP-------KCTSC----GSQS------------PQHAEMCLHTAGPTF
470 480 490
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pF1KB7 RYK-GNLASHRTVHT-GEKPYHCSICGARFNRPANLKTHSRIHSGEKPYKCETCGSRFVQ
. :. :. . . :::::.:.::::.::::::::::.:::::::::::::::.::::
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::::::::::::::::::: ::::::::::::::.:::::::::::. :.:::::::::
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pF1KB7 RLHLRQKHGAATNTKVHYHILGGP
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XP_011 RLHLRQKHGAITNTKVQYRVSATDLPPELPKAC
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>--
initn: 483 init1: 423 opt: 424 Z-score: 217.6 bits: 50.1 E(85289): 2.2e-05
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pF1KB7 MGSPAAPEGALGYVREFTRHSSDVLGNLNELRLRGILTDVTLLVGGQPLRAHKAVLIACS
.::::.:::: :::.:: : :::::...:. . .::::.::.:::
XP_011 MASPADSCIQFTRHASDVLLNLNRLRSRDILTDVVIVVSREQFRAHKTVLMACS
10 20 30 40 50
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pF1KB7 GFFYSIFRGRAGVGVDVLSLPGGPEARGFAPLLDFMYTSRLRLSPATAPAVLAAATYLQM
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XP_011 GLFYSIFTDQLKCNLSVINLDPEINPEGFCILLDFMYTSRLNLREGNIMAVMATAMYLQM
60 70 80 90 100 110
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pF1KB7 EHVVQACHRFIQASYEPLGISLRPLEAEPPTPPTAPPP------GSPRRSEGHP---DPP
::::..:..::.:: . ...: . : . : : .. : :
XP_011 EHVVDTCRKFIKASEAEMVSAIKPPREEFLNSRMLMPQDIMAYRGREVVENNLPLRSAPG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB7 TESRSCSQGPPSPASPDPKACNWKKYKYIVLNSQASQAGSLVGERSS-GQPCPQAR-LPS
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XP_011 CESRAFAPSLYSGLSTPPAS--YSMYSHLPVSSLLFSDEEFRDVRMPVANPFPKERALPC
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 GDEASSSSSSSSSSSSEEGPIPGPQSRLSPTAATVQFKCGAPASTPYLLTSQAQDTSGSP
: : :.:: :: :: . : . .:
XP_011 -DSAR--------------PVPGEYSR--PTLEVSPNVCHSNIYSPKETIPEEARSDMHY
240 250 260 270
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pF1KB7 SERARPLPGSEFFSCQNCEAVAGCSSGLDSLVPGDEDKPYKCQLCRSSFRYKGNLASHRT
XP_011 SVAEGLKPAAPSARNAPYFPCDKASKEEERPSSEDEIALHFEPPNAPLNRKGLVSPQSPQ
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:: :.. ..:.::.:.:.:::::::: ::. : : .:: : .::::::: : ::
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XP_006 GFSHSSNLHIHQRVHTGEKPYQCAKCGKGFSHSSALRIHQRVHAGEKPYKCREYYKGFDH
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>>XP_011518659 (OMIM: 605015) PREDICTED: zinc finger pro (592 aa)
initn: 1296 init1: 559 opt: 578 Z-score: 288.6 bits: 63.1 E(85289): 2.5e-09
Smith-Waterman score: 578; 44.6% identity (64.6% similar) in 195 aa overlap (275-465:371-564)
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SEEGPIPGPQSRLSPTAATVQFKCGAPASTPYLLTSQAQDTSGSPSERARPL--PGSEFF
:: .. : : . : . : : . .
XP_011 EKPFKCNQCGKSFNRSSVLHVHQRVHTGEKPYKCDECGKGFSQSSNLRIHQLVHTGEKSY
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410 420 430 440 450
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]