Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7726
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7726, 480 aa
1>>>pF1KB7726 480 - 480 aa - 480 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9834+/-0.00099; mu= -4.4515+/- 0.060
mean_var=397.1349+/-83.473, 0's: 0 Z-trim(117.4): 886 B-trim: 903 in 1/53
Lambda= 0.064358
statistics sampled from 17165 (18149) to 17165 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.817), E-opt: 0.2 (0.558), width: 16
Scan time: 4.260
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42248.1 BCL6B gene_id:255877|Hs108|chr17 ( 479) 3329 322.7 5.4e-88
CCDS3289.1 BCL6 gene_id:604|Hs108|chr3 ( 706) 1022 108.7 2.1e-23
CCDS46975.1 BCL6 gene_id:604|Hs108|chr3 ( 650) 833 91.1 3.9e-18
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 579 67.4 3.9e-11
CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 748) 582 67.8 4.4e-11
CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 799) 582 67.9 4.7e-11
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 584 68.1 4.7e-11
CCDS31418.1 ZNF214 gene_id:7761|Hs108|chr11 ( 606) 578 67.4 5e-11
CCDS32981.1 ZNF675 gene_id:171392|Hs108|chr19 ( 568) 577 67.3 5.1e-11
CCDS33047.1 ZNF233 gene_id:353355|Hs108|chr19 ( 670) 577 67.3 5.7e-11
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 576 67.2 6.2e-11
CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19 ( 738) 575 67.2 6.9e-11
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 572 66.8 7.2e-11
>>CCDS42248.1 BCL6B gene_id:255877|Hs108|chr17 (479 aa)
initn: 2607 init1: 1746 opt: 3329 Z-score: 1693.3 bits: 322.7 E(32554): 5.4e-88
Smith-Waterman score: 3329; 99.8% identity (99.8% similar) in 480 aa overlap (1-480:1-479)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGSPAAPEGALGYVREFTRHSSDVLGNLNELRLRGILTDVTLLVGGQPLRAHKAVLIACS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MGSPAAPEGALGYVREFTRHSSDVLGNLNELRLRGILTDVTLLVGGQPLRAHKAVLIACS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 GFFYSIFRGRAGVGVDVLSLPGGPEARGFAPLLDFMYTSRLRLSPATAPAVLAAATYLQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GFFYSIFRGRAGVGVDVLSLPGGPEARGFAPLLDFMYTSRLRLSPATAPAVLAAATYLQM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 EHVVQACHRFIQASYEPLGISLRPLEAEPPTPPTAPPPGSPRRSEGHPDPPTESRSCSQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EHVVQACHRFIQASYEPLGISLRPLEAEPPTPPTAPPPGSPRRSEGHPDPPTESRSCSQG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PPSPASPDPKACNWKKYKYIVLNSQASQAGSLVGERSSGQPCPQARLPSGDEASSSSSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PPSPASPDPKACNWKKYKYIVLNSQASQAGSLVGERSSGQPCPQARLPSGDEASSSSSSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SSSSSEEGPIPGPQSRLSPTAATVQFKCGAPASTPYLLTSQAQDTSGSPSERARPLPGSE
:::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SSSS-EEGPIPGPQSRLSPTAATVQFKCGAPASTPYLLTSQAQDTSGSPSERARPLPGSE
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 FFSCQNCEAVAGCSSGLDSLVPGDEDKPYKCQLCRSSFRYKGNLASHRTVHTGEKPYHCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FFSCQNCEAVAGCSSGLDSLVPGDEDKPYKCQLCRSSFRYKGNLASHRTVHTGEKPYHCS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 ICGARFNRPANLKTHSRIHSGEKPYKCETCGSRFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCPTCGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ICGARFNRPANLKTHSRIHSGEKPYKCETCGSRFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCPTCGT
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 RFRHLQTLKSHVRIHTGEKPYHCDPCGLHFRHKSQLRLHLRQKHGAATNTKVHYHILGGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RFRHLQTLKSHVRIHTGEKPYHCDPCGLHFRHKSQLRLHLRQKHGAATNTKVHYHILGGP
420 430 440 450 460 470
>>CCDS3289.1 BCL6 gene_id:604|Hs108|chr3 (706 aa)
initn: 2239 init1: 978 opt: 1022 Z-score: 533.5 bits: 108.7 E(32554): 2.1e-23
Smith-Waterman score: 1163; 48.2% identity (63.8% similar) in 434 aa overlap (94-476:272-693)
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YSIFRGRAGVGVDVLSLPGGPEARGFAPLLDFMYTSRLRLSPATAPAVLAAATYLQMEHV
:. :. :.:: ::.. : .
CCDS32 YSRPTLEVSPNVCHSNIYSPKETIPEEARSDMHYSVAEGLKPA-APSARNAPYF------
250 260 270 280 290
130 140 150 160 170
pF1KB7 VQACHRFIQASYEPLGISLRPLEAEPPTPPTAPP----PGSPRRSEGHPDPPTESRS---
: . . .: . . :. :::. : : ::..:. .:. :::: :
CCDS32 --PCDKASKEEERPSSEDEIALHFEPPNAPLNRKGLVSPQSPQKSDCQPNSPTESCSSKN
300 310 320 330 340 350
180 190 200 210 220
pF1KB7 -C----SQGPPSPASPDPKACNWKKYKYIVLNS---QASQAGSLVGERSSGQP----CPQ
: : .::. . :::::::::::.::::: .:. : .: . .: :
CCDS32 ACILQASGSPPAKSPTDPKACNWKKYKFIVLNSLNQNAKPEGPEQAELGRLSPRAYTAPP
360 370 380 390 400 410
230 240 250 260 270
pF1KB7 ARLPSGDEASSSSSSSS--SSSSEEGPIPGPQSRLSPTAATVQFKCGAPAST-----PYL
: : . . . .: . :.:.:.. :: :::. . . :.: :. :
CCDS32 ACQPPMEPENLDLQSPTKLSASGEDSTIP-QASRLNNIVNRSM--TGSPRSSSESHSPLY
420 430 440 450 460
280 290 300 310
pF1KB7 LTSQAQDTSGSPSER--------ARP-LP---G---SEF---------FSCQNCEAVAGC
. . :: : . : : .: : ::. : :..:. .
CCDS32 MHPPKCTSCGSQSPQHAEMCLHTAGPTFPEEMGETQSEYSDSSCENGAFFCNECDCRFSE
470 480 490 500 510 520
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 SSGLDS-LVPGDEDKPYKCQLCRSSFRYKGNLASHRTVHTGEKPYHCSICGARFNRPANL
..: . ::::::. :..:::::::::::.:::::::::.:.::::.:::::::
CCDS32 EASLKRHTLQTHSDKPYKCDRCQASFRYKGNLASHKTVHTGEKPYRCNICGAQFNRPANL
530 540 550 560 570 580
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 KTHSRIHSGEKPYKCETCGSRFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCPTCGTRFRHLQTLKSHV
:::.:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::.
CCDS32 KTHTRIHSGEKPYKCETCGARFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCEICGTRFRHLQTLKSHL
590 600 610 620 630 640
440 450 460 470 480
pF1KB7 RIHTGEKPYHCDPCGLHFRHKSQLRLHLRQKHGAATNTKVHYHILGGP
:::::::::::. :.::::::::::::::::::: :::::.:..
CCDS32 RIHTGEKPYHCEKCNLHFRHKSQLRLHLRQKHGAITNTKVQYRVSATDLPPELPKAC
650 660 670 680 690 700
>>CCDS46975.1 BCL6 gene_id:604|Hs108|chr3 (650 aa)
initn: 2110 init1: 813 opt: 833 Z-score: 439.1 bits: 91.1 E(32554): 3.9e-18
Smith-Waterman score: 985; 45.4% identity (61.2% similar) in 410 aa overlap (94-476:272-637)
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YSIFRGRAGVGVDVLSLPGGPEARGFAPLLDFMYTSRLRLSPATAPAVLAAATYLQMEHV
:. :. :.:: ::.. : .
CCDS46 YSRPTLEVSPNVCHSNIYSPKETIPEEARSDMHYSVAEGLKPA-APSARNAPYF------
250 260 270 280 290
130 140 150 160 170
pF1KB7 VQACHRFIQASYEPLGISLRPLEAEPPTPPTAPP----PGSPRRSEGHPDPPTESRS---
: . . .: . . :. :::. : : ::..:. .:. :::: :
CCDS46 --PCDKASKEEERPSSEDEIALHFEPPNAPLNRKGLVSPQSPQKSDCQPNSPTESCSSKN
300 310 320 330 340 350
180 190 200 210 220
pF1KB7 -C----SQGPPSPASPDPKACNWKKYKYIVLNS---QASQAGSLVGERSSGQP----CPQ
: : .::. . :::::::::::.::::: .:. : .: . .: :
CCDS46 ACILQASGSPPAKSPTDPKACNWKKYKFIVLNSLNQNAKPEGPEQAELGRLSPRAYTAPP
360 370 380 390 400 410
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 ARLPSGDEASSSSSSSS--SSSSEEGPIPGPQSRLSPTAATVQFKCGAPASTPYLLTSQA
: : . . . .: . :.:.:.. :: :::. . . :.: :.
CCDS46 ACQPPMEPENLDLQSPTKLSASGEDSTIP-QASRLNNIVNRSM--TGSPRSS--------
420 430 440 450 460
290 300 310 320 330
pF1KB7 QDTSGSPSERARPLPGSEFFSCQNCEAVAGCSSGLDSLVPGDEDKPYKCQLCRSS----F
. : :: : .: .: : .: : . ..: . :
CCDS46 -SESHSPLYMHPP-------KCTSC----GSQS------------PQHAEMCLHTAGPTF
470 480 490
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 RYK-GNLASHRTVHT-GEKPYHCSICGARFNRPANLKTHSRIHSGEKPYKCETCGSRFVQ
. :. :. . . :::::.:.::::.::::::::::.:::::::::::::::.::::
CCDS46 PEEMGETQSEYSDSSCGEKPYRCNICGAQFNRPANLKTHTRIHSGEKPYKCETCGARFVQ
500 510 520 530 540 550
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 VAHLRAHVLIHTGEKPYPCPTCGTRFRHLQTLKSHVRIHTGEKPYHCDPCGLHFRHKSQL
::::::::::::::::::: ::::::::::::::.:::::::::::. :.:::::::::
CCDS46 VAHLRAHVLIHTGEKPYPCEICGTRFRHLQTLKSHLRIHTGEKPYHCEKCNLHFRHKSQL
560 570 580 590 600 610
460 470 480
pF1KB7 RLHLRQKHGAATNTKVHYHILGGP
:::::::::: :::::.:..
CCDS46 RLHLRQKHGAITNTKVQYRVSATDLPPELPKAC
620 630 640 650
>>CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 (475 aa)
initn: 1007 init1: 545 opt: 579 Z-score: 313.4 bits: 67.4 E(32554): 3.9e-11
Smith-Waterman score: 579; 47.4% identity (69.0% similar) in 171 aa overlap (298-465:222-390)
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 CGAPASTPYLLTSQAQDTSGSPSERARPLPGSEFFSCQNCEAVAGCSSGLDS---LVPGD
: . : :..: . .::: :.. . :
CCDS12 HIGEKSYECKECGKFFSCGSHVTRHLKIHTGEKPFECKECGKAFSCSSYLSQHQRIHTG-
200 210 220 230 240 250
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 EDKPYKCQLCRSSFRYKGNLASHRTVHTGEKPYHCSICGARFNRPANLKTHSRIHSGEKP
:::.:. : ..: : .:: .:. .:::::::.:..:: :.. ..: :.:::.::::
CCDS12 -KKPYECKECGKAFSYCSNLIDHQRIHTGEKPYECKVCGKAFTKSSQLFQHARIHTGEKP
260 270 280 290 300
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 YKCETCGSRFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCPTCGTRFRHLQTLKSHVRIHTGEKPYHCD
:.:. ::. :.: ..: : :::::::: : :: : ..: .: ::::::::: :
CCDS12 YECKECGKAFTQSSKLVQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSALTNHQRIHTGEKPYDCK
310 320 330 340 350 360
450 460 470 480
pF1KB7 PCGLHFRHKSQLRLHLRQKHGAATNTKVHYHILGGP
:: : ..:::: : : . :
CCDS12 ECGKAFTQSSQLRQHQRIHAGEKPFECLECGKAFTQNSQLFQHQRIHTDEKPYECNECGK
370 380 390 400 410 420
>>CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 (748 aa)
initn: 2048 init1: 549 opt: 582 Z-score: 312.4 bits: 67.8 E(32554): 4.4e-11
Smith-Waterman score: 582; 48.2% identity (71.2% similar) in 170 aa overlap (298-465:465-633)
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 CGAPASTPYLLTSQAQDTSGSPSERARPLPGSEFFSCQNCEAVAGCSSGLDSL--VPGDE
: . :.:..: . :: :.. : :
CCDS74 HTGEKPYKCKECGKGFSQASNLQVHQNVHTGEKRFKCETCGKGFSQSSKLQTHQRVHTGE
440 450 460 470 480 490
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 DKPYKCQLCRSSFRYKGNLASHRTVHTGEKPYHCSICGARFNRPANLKTHSRIHSGEKPY
:::.:..: ..: :..:: :...:::::::.: :: :. .::..:.:.:::::::
CCDS74 -KPYRCDVCGKDFSYSSNLKLHQVIHTGEKPYKCEECGKGFSWRSNLHAHQRVHSGEKPY
500 510 520 530 540 550
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 KCETCGSRFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCPTCGTRFRHLQTLKSHVRIHTGEKPYHCDP
::: : . : :. .:.: .::::::: : .:: : . . :.:: :.:::::::.::
CCDS74 KCEQCDKSFSQAIDFRVHQRVHTGEKPYKCGVCGKGFSQSSGLQSHQRVHTGEKPYKCDV
560 570 580 590 600 610
450 460 470 480
pF1KB7 CGLHFRHKSQLRLHLRQKHGAATNTKVHYHILGGP
:: ::..::. : : . :
CCDS74 CGKGFRYSSQFIYHQRGHTGEKPYKCEECGKGFGRSLNLRHHQRVHTGEKPHICEECGKA
620 630 640 650 660 670
>>CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 (799 aa)
initn: 2048 init1: 549 opt: 582 Z-score: 312.0 bits: 67.9 E(32554): 4.7e-11
Smith-Waterman score: 582; 48.2% identity (71.2% similar) in 170 aa overlap (298-465:516-684)
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 CGAPASTPYLLTSQAQDTSGSPSERARPLPGSEFFSCQNCEAVAGCSSGLDSL--VPGDE
: . :.:..: . :: :.. : :
CCDS12 HTGEKPYKCKECGKGFSQASNLQVHQNVHTGEKRFKCETCGKGFSQSSKLQTHQRVHTGE
490 500 510 520 530 540
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 DKPYKCQLCRSSFRYKGNLASHRTVHTGEKPYHCSICGARFNRPANLKTHSRIHSGEKPY
:::.:..: ..: :..:: :...:::::::.: :: :. .::..:.:.:::::::
CCDS12 -KPYRCDVCGKDFSYSSNLKLHQVIHTGEKPYKCEECGKGFSWRSNLHAHQRVHSGEKPY
550 560 570 580 590 600
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 KCETCGSRFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCPTCGTRFRHLQTLKSHVRIHTGEKPYHCDP
::: : . : :. .:.: .::::::: : .:: : . . :.:: :.:::::::.::
CCDS12 KCEQCDKSFSQAIDFRVHQRVHTGEKPYKCGVCGKGFSQSSGLQSHQRVHTGEKPYKCDV
610 620 630 640 650 660
450 460 470 480
pF1KB7 CGLHFRHKSQLRLHLRQKHGAATNTKVHYHILGGP
:: ::..::. : : . :
CCDS12 CGKGFRYSSQFIYHQRGHTGEKPYKCEECGKGFGRSLNLRHHQRVHTGEKPHICEECGKA
670 680 690 700 710 720
>>CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 (970 aa)
initn: 2527 init1: 547 opt: 584 Z-score: 311.9 bits: 68.1 E(32554): 4.7e-11
Smith-Waterman score: 584; 47.5% identity (68.5% similar) in 181 aa overlap (290-464:791-970)
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 TAATVQFKCGAPASTPYLLTSQAQDTSGSPSERARPLPGSEFFSCQNCEAVAGCSSGL--
....: : . ..:..: .:.:
CCDS46 SLEKHRRIHTGEKPYKCKVCDKAFGRDSHLAQHTRIHTGEKPYKCNECGKNFRHNSALVI
770 780 790 800 810 820
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 DSLVPGDEDKPYKCQLCRSSFRYKGNLASHRTVHTGEKPYHCSICGARFNRPANLKTHSR
. . . : :::::. : ..::... : :...:::::::.:: :: ::: :::. : :
CCDS46 HKAIHSGE-KPYKCNECGKTFRHNSALEIHKAIHTGEKPYKCSECGKVFNRKANLSRHHR
830 840 850 860 870
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 IHSGEKPYKCETCGSRFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCPTCGTRFRHLQTLKSHVRIHTG
.:.:::::::. ::. : : ::: : :::::::: : :: ::: ..: : ::::
CCDS46 LHTGEKPYKCNKCGKVFNQQAHLACHHRIHTGEKPYKCNECGKTFRHNSVLVIHKTIHTG
880 890 900 910 920 930
440 450 460 470 480
pF1KB7 EKPYHCDPCGLHFRHKSQL----RLHLRQKHGAATNTKVHYHILGGP
::::.:. :: : .:..: :.: .::
CCDS46 EKPYKCNECGKVFNRKAKLARHHRIHTGKKH
940 950 960 970
>>CCDS31418.1 ZNF214 gene_id:7761|Hs108|chr11 (606 aa)
initn: 1296 init1: 559 opt: 578 Z-score: 311.5 bits: 67.4 E(32554): 5e-11
Smith-Waterman score: 578; 44.6% identity (64.6% similar) in 195 aa overlap (275-465:385-578)
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SEEGPIPGPQSRLSPTAATVQFKCGAPASTPYLLTSQAQDTSGSPSERARPL--PGSEFF
:: .. : : . : . : : . .
CCDS31 EKPFKCNQCGKSFNRSSVLHVHQRVHTGEKPYKCDECGKGFSQSSNLRIHQLVHTGEKSY
360 370 380 390 400 410
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SCQNCEAVAGCSSGLD--SLVPGDEDKPYKCQLCRSSFRYKGNLASHRTVHTGEKPYHCS
.:..: :.:. . : : :::::. : ..: ....: :. :::::::: :
CCDS31 KCEDCGKGFTQRSNLQIHQRVHTGE-KPYKCDDCGKDFSHSSDLRIHQRVHTGEKPYTCP
420 430 440 450 460 470
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 ICGARFNRPANLKTHSRIHSGEKPYKCETCGSRFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCPTCGT
:: :.. ..:.::.:.:.:::::::: ::. : : .:: : .::::::: : ::
CCDS31 ECGKGFSKSSKLHTHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSQRSHLLIHQRVHTGEKPYKCHDCGK
480 490 500 510 520 530
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 RFRHLQTLKSHVRIHTGEKPYHCDPCGLHFRHKSQLRLHLRQKHGAATNTKVHYHILGGP
: : ..:. : :.:::::::.: :: : :.: ::.: : . :
CCDS31 GFSHSSNLHIHQRVHTGEKPYQCAKCGKGFSHSSALRIHQRVHAGEKPYKCREYYKGFDH
540 550 560 570 580 590
CCDS31 NSHLHNNHRRGNL
600
>>CCDS32981.1 ZNF675 gene_id:171392|Hs108|chr19 (568 aa)
initn: 535 init1: 535 opt: 577 Z-score: 311.4 bits: 67.3 E(32554): 5.1e-11
Smith-Waterman score: 577; 42.8% identity (70.0% similar) in 180 aa overlap (281-459:347-526)
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 PGPQSRLSPTAATVQFKCGAPASTPYLLTSQAQDTSGSPSERARPLPGSEFFSCQNCEAV
.: . :.. .:. : . ..:..: .
CCDS32 CGKAFTQSSTLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSKLTEHKNIHTGEQPYKCEECGKA
320 330 340 350 360 370
320 330 340 350 360
pF1KB7 AGCSSGL-DSLVPGDEDKPYKCQLCRSSFRYKGNLASHRTVHTGEKPYHCSICGARFNRP
. ::.: . :.:::::. : ..:.... :..:. .:::::::.: :: :::
CCDS32 FNRSSNLTEHRKIHTEEKPYKCKECGKAFKHSSALTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNRS
380 390 400 410 420 430
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 ANLKTHSRIHSGEKPYKCETCGSRFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCPTCGTRFRHLQTLK
..: :...:.:.:::::: ::. :.: ..: : ::.:: :: : :: :.: ..:
CCDS32 SKLTEHKKLHTGKKPYKCEECGKAFIQSSKLTEHKKIHSGEIPYKCEECGKAFKHSSSLT
440 450 460 470 480 490
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 SHVRIHTGEKPYHCDPCGLHFRHKSQLRLHLRQKHGAATNTKVHYHILGGP
.: :::::::::.:. :: : ..:.: :
CCDS32 THKRIHTGEKPYKCEECGKAFSRSSKLTEHKIIHTGEKPYKCERCDKAFNQSANLTKHKK
500 510 520 530 540 550
>>CCDS33047.1 ZNF233 gene_id:353355|Hs108|chr19 (670 aa)
initn: 1025 init1: 543 opt: 577 Z-score: 310.5 bits: 67.3 E(32554): 5.7e-11
Smith-Waterman score: 577; 49.3% identity (75.0% similar) in 152 aa overlap (314-465:438-588)
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 DTSGSPSERARPLPGSEFFSCQNCEAVAGCSSGLDSLVPGDEDKPYKCQLCRSSFRYKGN
.::: . : : :::::..: ..: .:
CCDS33 SQTSQLQAHQRGHSRDKTYKWEVSDRIFNRNSGLHQRVHTGE-KPYKCEVCDKGFSKASN
410 420 430 440 450 460
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 LASHRTVHTGEKPYHCSICGARFNRPANLKTHSRIHSGEKPYKCETCGSRFVQVAHLRAH
: .:. .:::::::.:..: :.: ..:..:.:.:.:::::::.:::. : :..::.::
CCDS33 LQAHQRIHTGEKPYKCDVCDKNFSRNSHLQAHQRVHTGEKPYKCDTCGKDFSQISHLQAH
470 480 490 500 510 520
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 VLIHTGEKPYPCPTCGTRFRHLQTLKSHVRIHTGEKPYHCDPCGLHFRHKSQLRLHLRQK
.: ::::: : ::: : . . :..: ..::::.::.:: :: : .:.:. : : .
CCDS33 QRVHKGEKPYKCETCGKGFSQSSHLQDHQQVHTGENPYKCDVCGKGFSWSSHLQAHQRVH
530 540 550 560 570 580
470 480
pF1KB7 HGAATNTKVHYHILGGP
:
CCDS33 TGEKPYKCEECRKGFIWNSYLHVHQRIHTGEKPYKCGMCGKSFSQTSHLQAHQRVHTGEK
590 600 610 620 630 640
480 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 09:16:36 2016 done: Fri Nov 4 09:16:36 2016
Total Scan time: 4.260 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]