Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7723
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7723, 430 aa
1>>>pF1KB7723 430 - 430 aa - 430 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9831+/-0.000869; mu= 14.2114+/- 0.054
mean_var=250.7359+/-51.652, 0's: 0 Z-trim(115.3): 38 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.080996
statistics sampled from 15842 (15878) to 15842 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.787), E-opt: 0.2 (0.488), width: 16
Scan time: 3.580
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4748.1 PBX2 gene_id:5089|Hs108|chr6 ( 430) 2886 350.0 2.6e-96
CCDS55653.1 PBX1 gene_id:5087|Hs108|chr1 ( 420) 1864 230.6 2.3e-60
CCDS1246.1 PBX1 gene_id:5087|Hs108|chr1 ( 430) 1864 230.6 2.3e-60
CCDS6865.1 PBX3 gene_id:5090|Hs108|chr9 ( 434) 1836 227.3 2.3e-59
CCDS55654.1 PBX1 gene_id:5087|Hs108|chr1 ( 347) 1742 216.2 4.1e-56
CCDS83416.1 PBX3 gene_id:5090|Hs108|chr9 ( 351) 1708 212.2 6.4e-55
CCDS48021.1 PBX3 gene_id:5090|Hs108|chr9 ( 359) 1594 198.9 6.7e-51
CCDS12406.1 PBX4 gene_id:80714|Hs108|chr19 ( 374) 1497 187.6 1.8e-47
>>CCDS4748.1 PBX2 gene_id:5089|Hs108|chr6 (430 aa)
initn: 2886 init1: 2886 opt: 2886 Z-score: 1842.5 bits: 350.0 E(32554): 2.6e-96
Smith-Waterman score: 2886; 100.0% identity (100.0% similar) in 430 aa overlap (1-430:1-430)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDERLLGPPPPGGGRGGLGLVSGEPGGPGEPPGGGDPGGGSGGVPGGRGKQDIGDILQQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MDERLLGPPPPGGGRGGLGLVSGEPGGPGEPPGGGDPGGGSGGVPGGRGKQDIGDILQQI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MTITDQSLDEAQAKKHALNCHRMKPALFSVLCEIKEKTGLSIRSSQEEEPVDPQLMRLDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MTITDQSLDEAQAKKHALNCHRMKPALFSVLCEIKEKTGLSIRSSQEEEPVDPQLMRLDN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 MLLAEGVAGPEKGGGSAAAAAAAAASGGGVSPDNSIEHSDYRSKLAQIRHIYHSELEKYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MLLAEGVAGPEKGGGSAAAAAAAAASGGGVSPDNSIEHSDYRSKLAQIRHIYHSELEKYE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QACNEFTTHVMNLLREQSRTRPVAPKEMERMVSIIHRKFSAIQMQLKQSTCEAVMILRSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QACNEFTTHVMNLLREQSRTRPVAPKEMERMVSIIHRKFSAIQMQLKQSTCEAVMILRSR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FLDARRKRRNFSKQATEVLNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FLDARRKRRNFSKQATEVLNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 RYKKNIGKFQEEANIYAVKTAVSVTQGGHSRTSSPTPPSSAGSGGSFNLSGSGDMFLGMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RYKKNIGKFQEEANIYAVKTAVSVTQGGHSRTSSPTPPSSAGSGGSFNLSGSGDMFLGMP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 GLNGDSYSASQVESLRHSMGPGGYGDNLGGGQMYSPREMRANGSWQEAVTPSSVTSPTEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GLNGDSYSASQVESLRHSMGPGGYGDNLGGGQMYSPREMRANGSWQEAVTPSSVTSPTEG
370 380 390 400 410 420
430
pF1KB7 PGSVHSDTSN
::::::::::
CCDS47 PGSVHSDTSN
430
>>CCDS55653.1 PBX1 gene_id:5087|Hs108|chr1 (420 aa)
initn: 1997 init1: 1142 opt: 1864 Z-score: 1197.2 bits: 230.6 E(32554): 2.3e-60
Smith-Waterman score: 1930; 78.5% identity (91.7% similar) in 386 aa overlap (23-397:15-397)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDERLLGPPPPGGGRGGLGLVSGEPGGPGEPPGGGDPGGGSGGVPGGRGKQDIGDILQQI
: : :: : .::. : ::: :::::::::::
CCDS55 MDEQPRLMHSHAGVGMAGHPGLSQHLQDGAGGTEG-EGGR-KQDIGDILQQI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MTITDQSLDEAQAKKHALNCHRMKPALFSVLCEIKEKTGLSIRSSQEEEPVDPQLMRLDN
:::::::::::::.::::::::::::::.::::::::: ::::..:::::.:::::::::
CCDS55 MTITDQSLDEAQARKHALNCHRMKPALFNVLCEIKEKTVLSIRGAQEEEPTDPQLMRLDN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 MLLAEGVAGPEKGGGSAAAAAAAAASGGGVSPDNSIEHSDYRSKLAQIRHIYHSELEKYE
::::::::::::::::::::::::::::. : :::.::::::.::.:::.:::.::::::
CCDS55 MLLAEGVAGPEKGGGSAAAAAAAAASGGAGS-DNSVEHSDYRAKLSQIRQIYHTELEKYE
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QACNEFTTHVMNLLREQSRTRPVAPKEMERMVSIIHRKFSAIQMQLKQSTCEAVMILRSR
::::::::::::::::::::::..:::.::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS55 QACNEFTTHVMNLLREQSRTRPISPKEIERMVSIIHRKFSSIQMQLKQSTCEAVMILRSR
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FLDARRKRRNFSKQATEVLNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRI
:::::::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FLDARRKRRNFNKQATEILNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRI
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KB7 RYKKNIGKFQEEANIYAVKTAVSVTQ-GGH-SRTSSPTPPSSAGSGGSFNLSGSGDMFLG
:::::::::::::::::.::::..:. ..: :...::. :.::::..:::.:.:::.:..
CCDS55 RYKKNIGKFQEEANIYAAKTAVTATNVSAHGSQANSPSTPNSAGSSSSFNMSNSGDLFMS
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KB7 MPGLNGDSYSA--------SQVESLRHSMGP-GGYGDNLGGGQMYSPREMRANGSWQEAV
. .::::::.. :::..::: .. :::.:.:...:::::.
CCDS55 VQSLNGDSYQGAQVGANVQSQVDTLRHVISQTGGYSDGLAASQMYSPQGISHLPRHPRQA
350 360 370 380 390 400
410 420 430
pF1KB7 TPSSVTSPTEGPGSVHSDTSN
CCDS55 HYHFRLPTWHP
410 420
>>CCDS1246.1 PBX1 gene_id:5087|Hs108|chr1 (430 aa)
initn: 2181 init1: 1142 opt: 1864 Z-score: 1197.0 bits: 230.6 E(32554): 2.3e-60
Smith-Waterman score: 2114; 78.8% identity (91.9% similar) in 419 aa overlap (23-430:15-430)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDERLLGPPPPGGGRGGLGLVSGEPGGPGEPPGGGDPGGGSGGVPGGRGKQDIGDILQQI
: : :: : .::. : ::: :::::::::::
CCDS12 MDEQPRLMHSHAGVGMAGHPGLSQHLQDGAGGTEG-EGGR-KQDIGDILQQI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MTITDQSLDEAQAKKHALNCHRMKPALFSVLCEIKEKTGLSIRSSQEEEPVDPQLMRLDN
:::::::::::::.::::::::::::::.::::::::: ::::..:::::.:::::::::
CCDS12 MTITDQSLDEAQARKHALNCHRMKPALFNVLCEIKEKTVLSIRGAQEEEPTDPQLMRLDN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 MLLAEGVAGPEKGGGSAAAAAAAAASGGGVSPDNSIEHSDYRSKLAQIRHIYHSELEKYE
::::::::::::::::::::::::::::. : :::.::::::.::.:::.:::.::::::
CCDS12 MLLAEGVAGPEKGGGSAAAAAAAAASGGAGS-DNSVEHSDYRAKLSQIRQIYHTELEKYE
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QACNEFTTHVMNLLREQSRTRPVAPKEMERMVSIIHRKFSAIQMQLKQSTCEAVMILRSR
::::::::::::::::::::::..:::.::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS12 QACNEFTTHVMNLLREQSRTRPISPKEIERMVSIIHRKFSSIQMQLKQSTCEAVMILRSR
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FLDARRKRRNFSKQATEVLNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRI
:::::::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FLDARRKRRNFNKQATEILNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRI
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KB7 RYKKNIGKFQEEANIYAVKTAVSVTQ-GGH-SRTSSPTPPSSAGSGGSFNLSGSGDMFLG
:::::::::::::::::.::::..:. ..: :...::. :.::::..:::.:.:::.:..
CCDS12 RYKKNIGKFQEEANIYAAKTAVTATNVSAHGSQANSPSTPNSAGSSSSFNMSNSGDLFMS
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KB7 MPGLNGDSYSA--------SQVESLRHSMGP-GGYGDNLGGGQMYSPREMRANGSWQEAV
. .::::::.. :::..::: .. :::.:.:...:::::. . :::.::.:.
CCDS12 VQSLNGDSYQGAQVGANVQSQVDTLRHVISQTGGYSDGLAASQMYSPQGISANGGWQDAT
350 360 370 380 390 400
410 420 430
pF1KB7 TPSSVTSPTEGPGSVHSDTSN
:::::::::::::::::::::
CCDS12 TPSSVTSPTEGPGSVHSDTSN
410 420 430
>>CCDS6865.1 PBX3 gene_id:5090|Hs108|chr9 (434 aa)
initn: 1537 init1: 1106 opt: 1836 Z-score: 1179.3 bits: 227.3 E(32554): 2.3e-59
Smith-Waterman score: 2090; 78.0% identity (90.5% similar) in 419 aa overlap (26-430:23-434)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDERLLGPPPPGGGRGGLGLVSGEPGGPGEPPGGGDPGGGSGGVPGGRGKQDIGDILQQI
:: . :: : : :. : ::::::::.::
CCDS68 MDDQSRMLQTLAGVNLAGHSVQGGMALPP----PPHGHEGADGDGRKQDIGDILHQI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MTITDQSLDEAQAKKHALNCHRMKPALFSVLCEIKEKTGLSIRSSQEEEPVDPQLMRLDN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::.: :::::::::
CCDS68 MTITDQSLDEAQAKKHALNCHRMKPALFSVLCEIKEKTGLSIRGAQEEDPPDPQLMRLDN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 MLLAEGVAGPEKGGGSAAAAAAAAASGGGVSPDNSIEHSDYRSKLAQIRHIYHSELEKYE
:::::::.:::::::::::::::::::: : ::::::::::.::.:::.:::.::::::
CCDS68 MLLAEGVSGPEKGGGSAAAAAAAAASGG--SSDNSIEHSDYRAKLTQIRQIYHTELEKYE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QACNEFTTHVMNLLREQSRTRPVAPKEMERMVSIIHRKFSAIQMQLKQSTCEAVMILRSR
::::::::::::::::::::::..:::.::::.:::::::.:::::::::::::::::::
CCDS68 QACNEFTTHVMNLLREQSRTRPISPKEIERMVGIIHRKFSSIQMQLKQSTCEAVMILRSR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FLDARRKRRNFSKQATEVLNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRI
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS68 FLDARRKRRNFSKQATEILNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCSITVSQVSNWFGNKRI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB7 RYKKNIGKFQEEANIYAVKTAVSVTQG-----GHSRTSSPTPPSSAGSGGSFNLSGSGDM
::::::::::::::.::.::::..... ...:.::: :.: ::.::::: .::::
CCDS68 RYKKNIGKFQEEANLYAAKTAVTAAHAVAAAVQNNQTNSPTTPNS-GSSGSFNLPNSGDM
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KB7 FLGMPGLNGDSYSASQV--------ESLRHSMGP-GGYGDNLGGGQMYSPREMRANGSWQ
:..: .::::::..::: ..::: .. :::.:.:::...:::... :::.::
CCDS68 FMNMQSLNGDSYQGSQVGANVQSQVDTLRHVINQTGGYSDGLGGNSLYSPHNLNANGGWQ
360 370 380 390 400 410
410 420 430
pF1KB7 EAVTPSSVTSPTEGPGSVHSDTSN
.:.:::::::::::::::::::::
CCDS68 DATTPSSVTSPTEGPGSVHSDTSN
420 430
>>CCDS55654.1 PBX1 gene_id:5087|Hs108|chr1 (347 aa)
initn: 1161 init1: 1161 opt: 1742 Z-score: 1120.9 bits: 216.2 E(32554): 4.1e-56
Smith-Waterman score: 1742; 84.5% identity (93.8% similar) in 322 aa overlap (23-342:15-333)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDERLLGPPPPGGGRGGLGLVSGEPGGPGEPPGGGDPGGGSGGVPGGRGKQDIGDILQQI
: : :: : .::. : ::: :::::::::::
CCDS55 MDEQPRLMHSHAGVGMAGHPGLSQHLQDGAGGTEG-EGGR-KQDIGDILQQI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MTITDQSLDEAQAKKHALNCHRMKPALFSVLCEIKEKTGLSIRSSQEEEPVDPQLMRLDN
:::::::::::::.::::::::::::::.::::::::: ::::..:::::.:::::::::
CCDS55 MTITDQSLDEAQARKHALNCHRMKPALFNVLCEIKEKTVLSIRGAQEEEPTDPQLMRLDN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 MLLAEGVAGPEKGGGSAAAAAAAAASGGGVSPDNSIEHSDYRSKLAQIRHIYHSELEKYE
::::::::::::::::::::::::::::. : :::.::::::.::.:::.:::.::::::
CCDS55 MLLAEGVAGPEKGGGSAAAAAAAAASGGAGS-DNSVEHSDYRAKLSQIRQIYHTELEKYE
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QACNEFTTHVMNLLREQSRTRPVAPKEMERMVSIIHRKFSAIQMQLKQSTCEAVMILRSR
::::::::::::::::::::::..:::.::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS55 QACNEFTTHVMNLLREQSRTRPISPKEIERMVSIIHRKFSSIQMQLKQSTCEAVMILRSR
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FLDARRKRRNFSKQATEVLNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRI
:::::::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FLDARRKRRNFNKQATEILNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRI
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KB7 RYKKNIGKFQEEANIYAVKTAVSVTQ-GGH-SRTSSPTPPSSAGSGGSFNLSGSGDMFLG
:::::::::::::::::.::::..:. ..: :...::. :.:::
CCDS55 RYKKNIGKFQEEANIYAAKTAVTATNVSAHGSQANSPSTPNSAGGYPSPCYQPDRRIQ
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 MPGLNGDSYSASQVESLRHSMGPGGYGDNLGGGQMYSPREMRANGSWQEAVTPSSVTSPT
>>CCDS83416.1 PBX3 gene_id:5090|Hs108|chr9 (351 aa)
initn: 1823 init1: 1097 opt: 1708 Z-score: 1099.4 bits: 212.2 E(32554): 6.4e-55
Smith-Waterman score: 1708; 82.6% identity (92.2% similar) in 322 aa overlap (26-342:23-338)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDERLLGPPPPGGGRGGLGLVSGEPGGPGEPPGGGDPGGGSGGVPGGRGKQDIGDILQQI
:: . :: : : :. : ::::::::.::
CCDS83 MDDQSRMLQTLAGVNLAGHSVQGGMALPP----PPHGHEGADGDGRKQDIGDILHQI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MTITDQSLDEAQAKKHALNCHRMKPALFSVLCEIKEKTGLSIRSSQEEEPVDPQLMRLDN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::.: :::::::::
CCDS83 MTITDQSLDEAQAKKHALNCHRMKPALFSVLCEIKEKTGLSIRGAQEEDPPDPQLMRLDN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 MLLAEGVAGPEKGGGSAAAAAAAAASGGGVSPDNSIEHSDYRSKLAQIRHIYHSELEKYE
:::::::.:::::::::::::::::::: : ::::::::::.::.:::.:::.::::::
CCDS83 MLLAEGVSGPEKGGGSAAAAAAAAASGG--SSDNSIEHSDYRAKLTQIRQIYHTELEKYE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QACNEFTTHVMNLLREQSRTRPVAPKEMERMVSIIHRKFSAIQMQLKQSTCEAVMILRSR
::::::::::::::::::::::..:::.::::.:::::::.:::::::::::::::::::
CCDS83 QACNEFTTHVMNLLREQSRTRPISPKEIERMVGIIHRKFSSIQMQLKQSTCEAVMILRSR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FLDARRKRRNFSKQATEVLNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRI
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS83 FLDARRKRRNFSKQATEILNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCSITVSQVSNWFGNKRI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB7 RYKKNIGKFQEEANIYAVKTAVSVTQG-----GHSRTSSPTPPSSAGSGGSFNLSGSGDM
::::::::::::::.::.::::..... ...:.::: :.:.:
CCDS83 RYKKNIGKFQEEANLYAAKTAVTAAHAVAAAVQNNQTNSPTTPNSGGYPPSCYQSDGRLQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 FLGMPGLNGDSYSASQVESLRHSMGPGGYGDNLGGGQMYSPREMRANGSWQEAVTPSSVT
>>CCDS48021.1 PBX3 gene_id:5090|Hs108|chr9 (359 aa)
initn: 1495 init1: 1106 opt: 1594 Z-score: 1027.3 bits: 198.9 E(32554): 6.7e-51
Smith-Waterman score: 1848; 79.3% identity (92.8% similar) in 362 aa overlap (83-430:1-359)
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 IGDILQQIMTITDQSLDEAQAKKHALNCHRMKPALFSVLCEIKEKTGLSIRSSQEEEPVD
:::::::::::::::::::::..:::.: :
CCDS48 MKPALFSVLCEIKEKTGLSIRGAQEEDPPD
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 PQLMRLDNMLLAEGVAGPEKGGGSAAAAAAAAASGGGVSPDNSIEHSDYRSKLAQIRHIY
:::::::::::::::.:::::::::::::::::::: : ::::::::::.::.:::.::
CCDS48 PQLMRLDNMLLAEGVSGPEKGGGSAAAAAAAAASGG--SSDNSIEHSDYRAKLTQIRQIY
40 50 60 70 80
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 HSELEKYEQACNEFTTHVMNLLREQSRTRPVAPKEMERMVSIIHRKFSAIQMQLKQSTCE
:.::::::::::::::::::::::::::::..:::.::::.:::::::.:::::::::::
CCDS48 HTELEKYEQACNEFTTHVMNLLREQSRTRPISPKEIERMVGIIHRKFSSIQMQLKQSTCE
90 100 110 120 130 140
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 AVMILRSRFLDARRKRRNFSKQATEVLNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVS
:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS48 AVMILRSRFLDARRKRRNFSKQATEILNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCSITVSQVS
150 160 170 180 190 200
300 310 320 330 340
pF1KB7 NWFGNKRIRYKKNIGKFQEEANIYAVKTAVSVTQG-----GHSRTSSPTPPSSAGSGGSF
::::::::::::::::::::::.::.::::..... ...:.::: :.: ::.:::
CCDS48 NWFGNKRIRYKKNIGKFQEEANLYAAKTAVTAAHAVAAAVQNNQTNSPTTPNS-GSSGSF
210 220 230 240 250 260
350 360 370 380 390
pF1KB7 NLSGSGDMFLGMPGLNGDSYSASQV--------ESLRHSMGP-GGYGDNLGGGQMYSPRE
:: .:::::..: .::::::..::: ..::: .. :::.:.:::...:::..
CCDS48 NLPNSGDMFMNMQSLNGDSYQGSQVGANVQSQVDTLRHVINQTGGYSDGLGGNSLYSPHN
270 280 290 300 310 320
400 410 420 430
pF1KB7 MRANGSWQEAVTPSSVTSPTEGPGSVHSDTSN
. :::.::.:.:::::::::::::::::::::
CCDS48 LNANGGWQDATTPSSVTSPTEGPGSVHSDTSN
330 340 350
>>CCDS12406.1 PBX4 gene_id:80714|Hs108|chr19 (374 aa)
initn: 1577 init1: 1420 opt: 1497 Z-score: 965.9 bits: 187.6 E(32554): 1.8e-47
Smith-Waterman score: 1562; 66.5% identity (80.7% similar) in 388 aa overlap (45-430:12-374)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 RGGLGLVSGEPGGPGEPPGGGDPGGGSGGVPGGRGKQDIGDILQQIMTITDQSLDEAQAK
:. : . : .:.:::::.:::::::::::.
CCDS12 MAAPPRPAPSPPAPR-RLDTSDVLQQIMAITDQSLDEAQAR
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 KHALNCHRMKPALFSVLCEIKEKTGLSIRSSQEEEPVDPQLMRLDNMLLAEGVAGPEKGG
:::::::::::::::::::::::: .:::. :.:.: : ::.::::::::::: ::: :
CCDS12 KHALNCHRMKPALFSVLCEIKEKTVVSIRGIQDEDPPDAQLLRLDNMLLAEGVCRPEKRG
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 GSAAAAAAAAASGGGVSPDNSIEHSDYRSKLAQIRHIYHSELEKYEQACNEFTTHVMNLL
..:.: :..:. :: ::::::::::.::.:::.::::::::::::: :::::: :::
CCDS12 RGGAVARAGTATPGGCPNDNSIEHSDYRAKLSQIRQIYHSELEKYEQACREFTTHVTNLL
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 REQSRTRPVAPKEMERMVSIIHRKFSAIQMQLKQSTCEAVMILRSRFLDARRKRRNFSKQ
.:::: :::.:::.::::. :: :::::::::::::::::: ::::.:::::::::::::
CCDS12 QEQSRMRPVSPKEIERMVGAIHGKFSAIQMQLKQSTCEAVMTLRSRLLDARRKRRNFSKQ
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 ATEVLNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRIRYKKNIGKFQEEAN
:::::::::::::.:::::::::::::.: :.:.:::::::::::::::::.:::::::.
CCDS12 ATEVLNEYFYSHLNNPYPSEEAKEELARKGGLTISQVSNWFGNKRIRYKKNMGKFQEEAT
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 IYAVKTAVSVTQGG--HSRTSSPTPPSSAGSGGSFNLSGSGDMFLGMPGLNGDSYSASQV
::. ::::..:. : ...: . ::: ::.: : : ..:: :: . :
CCDS12 IYTGKTAVDTTEVGVPGNHASCLSTPSS-GSSGPFPLPSAGDAFLTLRTLA---------
290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 ESLRHSMGPGGYGDNLGGGQMYSPREMRANGSWQEAVTPSSVTSPTEGPGSVHSDTSN
:. : ::: . : .:.:::: :. ...::. :::..:.:::
CCDS12 -----SLQPPP-----GGGCLQS----QAQGSWQGATPQPATASPAGDPGSINSSTSN
340 350 360 370
430 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 22:07:32 2016 done: Fri Nov 4 22:07:33 2016
Total Scan time: 3.580 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]