Result of FASTA (omim) for
pF1KB7705
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7705, 419 aa
1>>>pF1KB7705 419 - 419 aa - 419 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.7495+/-0.000456; mu= -14.8713+/- 0.028
mean_var=668.1627+/-162.654, 0's: 0 Z-trim(122.4): 385 B-trim: 2111 in 1/58
Lambda= 0.049617
statistics sampled from 39466 (40437) to 39466 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.788), E-opt: 0.2 (0.474), width: 16
Scan time: 10.310
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016872039 (OMIM: 606238) PREDICTED: zinc finger ( 419) 2951 226.1 1.3e-58
XP_016872041 (OMIM: 606238) PREDICTED: zinc finger ( 419) 2951 226.1 1.3e-58
XP_016872040 (OMIM: 606238) PREDICTED: zinc finger ( 419) 2951 226.1 1.3e-58
NP_001258769 (OMIM: 606238) zinc finger protein Pe ( 419) 2951 226.1 1.3e-58
XP_006718010 (OMIM: 606238) PREDICTED: zinc finger ( 419) 2951 226.1 1.3e-58
XP_016872042 (OMIM: 606238) PREDICTED: zinc finger ( 351) 2496 193.5 7.3e-49
XP_016872043 (OMIM: 606238) PREDICTED: zinc finger ( 351) 2496 193.5 7.3e-49
XP_016872044 (OMIM: 606238) PREDICTED: zinc finger ( 351) 2496 193.5 7.3e-49
XP_011509121 (OMIM: 606234) PREDICTED: zinc finger ( 458) 450 47.1 0.00011
XP_016859081 (OMIM: 606234) PREDICTED: zinc finger ( 459) 450 47.1 0.00011
NP_001278768 (OMIM: 603023,616873) DNA-binding pro ( 390) 387 42.5 0.0022
XP_011513379 (OMIM: 603023,616873) PREDICTED: DNA- ( 414) 387 42.6 0.0022
NP_899051 (OMIM: 606221) zinc finger protein Aiolo ( 453) 363 40.9 0.0078
>>XP_016872039 (OMIM: 606238) PREDICTED: zinc finger pro (419 aa)
initn: 2951 init1: 2951 opt: 2951 Z-score: 1173.4 bits: 226.1 E(85289): 1.3e-58
Smith-Waterman score: 2951; 100.0% identity (100.0% similar) in 419 aa overlap (1-419:1-419)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGEKKPEPLDFVKDFQEYLTQQTHHVNMISGSVSGDKEAEALQGAGTDGDQNGLDHPSVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MGEKKPEPLDFVKDFQEYLTQQTHHVNMISGSVSGDKEAEALQGAGTDGDQNGLDHPSVE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 VSLDENSGMLVDGFERTFDGKLKCRYCNYASKGTARLIEHIRIHTGEKPHRCHLCPFASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VSLDENSGMLVDGFERTFDGKLKCRYCNYASKGTARLIEHIRIHTGEKPHRCHLCPFASA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YERHLEAHMRSHTGEKPYKCELCSFRCSDRSNLSHHRRRKHKMVPIKGTRSSLSSKKMWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YERHLEAHMRSHTGEKPYKCELCSFRCSDRSNLSHHRRRKHKMVPIKGTRSSLSSKKMWG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VLQKKTSNLGYSRRALINLSPPSMVVQKPDYLNDFTHEIPNIQTDSYESMAKTTPTGGLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VLQKKTSNLGYSRRALINLSPPSMVVQKPDYLNDFTHEIPNIQTDSYESMAKTTPTGGLP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RDPQELMVDNPLNQLSTLAGQLSSLPPENQNPASPDVVPCPDEKPFMIQQPSTQAVVSAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RDPQELMVDNPLNQLSTLAGQLSSLPPENQNPASPDVVPCPDEKPFMIQQPSTQAVVSAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SASIPQSSSPTSPEPRPSHSQRNYSPVAGPSSEPSAHTSTPSIGNSQPSTPAPALPVQDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SASIPQSSSPTSPEPRPSHSQRNYSPVAGPSSEPSAHTSTPSIGNSQPSTPAPALPVQDP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB7 QLLHHCQHCDMYFADNILYTIHMGCHGYENPFQCNICGCKCKNKYDFACHFARGQHNQH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QLLHHCQHCDMYFADNILYTIHMGCHGYENPFQCNICGCKCKNKYDFACHFARGQHNQH
370 380 390 400 410
>>XP_016872041 (OMIM: 606238) PREDICTED: zinc finger pro (419 aa)
initn: 2951 init1: 2951 opt: 2951 Z-score: 1173.4 bits: 226.1 E(85289): 1.3e-58
Smith-Waterman score: 2951; 100.0% identity (100.0% similar) in 419 aa overlap (1-419:1-419)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGEKKPEPLDFVKDFQEYLTQQTHHVNMISGSVSGDKEAEALQGAGTDGDQNGLDHPSVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MGEKKPEPLDFVKDFQEYLTQQTHHVNMISGSVSGDKEAEALQGAGTDGDQNGLDHPSVE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 VSLDENSGMLVDGFERTFDGKLKCRYCNYASKGTARLIEHIRIHTGEKPHRCHLCPFASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VSLDENSGMLVDGFERTFDGKLKCRYCNYASKGTARLIEHIRIHTGEKPHRCHLCPFASA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YERHLEAHMRSHTGEKPYKCELCSFRCSDRSNLSHHRRRKHKMVPIKGTRSSLSSKKMWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YERHLEAHMRSHTGEKPYKCELCSFRCSDRSNLSHHRRRKHKMVPIKGTRSSLSSKKMWG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VLQKKTSNLGYSRRALINLSPPSMVVQKPDYLNDFTHEIPNIQTDSYESMAKTTPTGGLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VLQKKTSNLGYSRRALINLSPPSMVVQKPDYLNDFTHEIPNIQTDSYESMAKTTPTGGLP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RDPQELMVDNPLNQLSTLAGQLSSLPPENQNPASPDVVPCPDEKPFMIQQPSTQAVVSAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RDPQELMVDNPLNQLSTLAGQLSSLPPENQNPASPDVVPCPDEKPFMIQQPSTQAVVSAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SASIPQSSSPTSPEPRPSHSQRNYSPVAGPSSEPSAHTSTPSIGNSQPSTPAPALPVQDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SASIPQSSSPTSPEPRPSHSQRNYSPVAGPSSEPSAHTSTPSIGNSQPSTPAPALPVQDP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB7 QLLHHCQHCDMYFADNILYTIHMGCHGYENPFQCNICGCKCKNKYDFACHFARGQHNQH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QLLHHCQHCDMYFADNILYTIHMGCHGYENPFQCNICGCKCKNKYDFACHFARGQHNQH
370 380 390 400 410
>>XP_016872040 (OMIM: 606238) PREDICTED: zinc finger pro (419 aa)
initn: 2951 init1: 2951 opt: 2951 Z-score: 1173.4 bits: 226.1 E(85289): 1.3e-58
Smith-Waterman score: 2951; 100.0% identity (100.0% similar) in 419 aa overlap (1-419:1-419)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGEKKPEPLDFVKDFQEYLTQQTHHVNMISGSVSGDKEAEALQGAGTDGDQNGLDHPSVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MGEKKPEPLDFVKDFQEYLTQQTHHVNMISGSVSGDKEAEALQGAGTDGDQNGLDHPSVE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 VSLDENSGMLVDGFERTFDGKLKCRYCNYASKGTARLIEHIRIHTGEKPHRCHLCPFASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VSLDENSGMLVDGFERTFDGKLKCRYCNYASKGTARLIEHIRIHTGEKPHRCHLCPFASA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YERHLEAHMRSHTGEKPYKCELCSFRCSDRSNLSHHRRRKHKMVPIKGTRSSLSSKKMWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YERHLEAHMRSHTGEKPYKCELCSFRCSDRSNLSHHRRRKHKMVPIKGTRSSLSSKKMWG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VLQKKTSNLGYSRRALINLSPPSMVVQKPDYLNDFTHEIPNIQTDSYESMAKTTPTGGLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VLQKKTSNLGYSRRALINLSPPSMVVQKPDYLNDFTHEIPNIQTDSYESMAKTTPTGGLP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RDPQELMVDNPLNQLSTLAGQLSSLPPENQNPASPDVVPCPDEKPFMIQQPSTQAVVSAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RDPQELMVDNPLNQLSTLAGQLSSLPPENQNPASPDVVPCPDEKPFMIQQPSTQAVVSAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SASIPQSSSPTSPEPRPSHSQRNYSPVAGPSSEPSAHTSTPSIGNSQPSTPAPALPVQDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SASIPQSSSPTSPEPRPSHSQRNYSPVAGPSSEPSAHTSTPSIGNSQPSTPAPALPVQDP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB7 QLLHHCQHCDMYFADNILYTIHMGCHGYENPFQCNICGCKCKNKYDFACHFARGQHNQH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QLLHHCQHCDMYFADNILYTIHMGCHGYENPFQCNICGCKCKNKYDFACHFARGQHNQH
370 380 390 400 410
>>NP_001258769 (OMIM: 606238) zinc finger protein Pegasu (419 aa)
initn: 2951 init1: 2951 opt: 2951 Z-score: 1173.4 bits: 226.1 E(85289): 1.3e-58
Smith-Waterman score: 2951; 100.0% identity (100.0% similar) in 419 aa overlap (1-419:1-419)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGEKKPEPLDFVKDFQEYLTQQTHHVNMISGSVSGDKEAEALQGAGTDGDQNGLDHPSVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGEKKPEPLDFVKDFQEYLTQQTHHVNMISGSVSGDKEAEALQGAGTDGDQNGLDHPSVE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 VSLDENSGMLVDGFERTFDGKLKCRYCNYASKGTARLIEHIRIHTGEKPHRCHLCPFASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSLDENSGMLVDGFERTFDGKLKCRYCNYASKGTARLIEHIRIHTGEKPHRCHLCPFASA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YERHLEAHMRSHTGEKPYKCELCSFRCSDRSNLSHHRRRKHKMVPIKGTRSSLSSKKMWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YERHLEAHMRSHTGEKPYKCELCSFRCSDRSNLSHHRRRKHKMVPIKGTRSSLSSKKMWG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VLQKKTSNLGYSRRALINLSPPSMVVQKPDYLNDFTHEIPNIQTDSYESMAKTTPTGGLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLQKKTSNLGYSRRALINLSPPSMVVQKPDYLNDFTHEIPNIQTDSYESMAKTTPTGGLP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RDPQELMVDNPLNQLSTLAGQLSSLPPENQNPASPDVVPCPDEKPFMIQQPSTQAVVSAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDPQELMVDNPLNQLSTLAGQLSSLPPENQNPASPDVVPCPDEKPFMIQQPSTQAVVSAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SASIPQSSSPTSPEPRPSHSQRNYSPVAGPSSEPSAHTSTPSIGNSQPSTPAPALPVQDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SASIPQSSSPTSPEPRPSHSQRNYSPVAGPSSEPSAHTSTPSIGNSQPSTPAPALPVQDP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB7 QLLHHCQHCDMYFADNILYTIHMGCHGYENPFQCNICGCKCKNKYDFACHFARGQHNQH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QLLHHCQHCDMYFADNILYTIHMGCHGYENPFQCNICGCKCKNKYDFACHFARGQHNQH
370 380 390 400 410
>>XP_006718010 (OMIM: 606238) PREDICTED: zinc finger pro (419 aa)
initn: 2951 init1: 2951 opt: 2951 Z-score: 1173.4 bits: 226.1 E(85289): 1.3e-58
Smith-Waterman score: 2951; 100.0% identity (100.0% similar) in 419 aa overlap (1-419:1-419)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGEKKPEPLDFVKDFQEYLTQQTHHVNMISGSVSGDKEAEALQGAGTDGDQNGLDHPSVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MGEKKPEPLDFVKDFQEYLTQQTHHVNMISGSVSGDKEAEALQGAGTDGDQNGLDHPSVE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 VSLDENSGMLVDGFERTFDGKLKCRYCNYASKGTARLIEHIRIHTGEKPHRCHLCPFASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VSLDENSGMLVDGFERTFDGKLKCRYCNYASKGTARLIEHIRIHTGEKPHRCHLCPFASA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YERHLEAHMRSHTGEKPYKCELCSFRCSDRSNLSHHRRRKHKMVPIKGTRSSLSSKKMWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YERHLEAHMRSHTGEKPYKCELCSFRCSDRSNLSHHRRRKHKMVPIKGTRSSLSSKKMWG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VLQKKTSNLGYSRRALINLSPPSMVVQKPDYLNDFTHEIPNIQTDSYESMAKTTPTGGLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VLQKKTSNLGYSRRALINLSPPSMVVQKPDYLNDFTHEIPNIQTDSYESMAKTTPTGGLP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RDPQELMVDNPLNQLSTLAGQLSSLPPENQNPASPDVVPCPDEKPFMIQQPSTQAVVSAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RDPQELMVDNPLNQLSTLAGQLSSLPPENQNPASPDVVPCPDEKPFMIQQPSTQAVVSAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SASIPQSSSPTSPEPRPSHSQRNYSPVAGPSSEPSAHTSTPSIGNSQPSTPAPALPVQDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SASIPQSSSPTSPEPRPSHSQRNYSPVAGPSSEPSAHTSTPSIGNSQPSTPAPALPVQDP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB7 QLLHHCQHCDMYFADNILYTIHMGCHGYENPFQCNICGCKCKNKYDFACHFARGQHNQH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QLLHHCQHCDMYFADNILYTIHMGCHGYENPFQCNICGCKCKNKYDFACHFARGQHNQH
370 380 390 400 410
>>XP_016872042 (OMIM: 606238) PREDICTED: zinc finger pro (351 aa)
initn: 2496 init1: 2496 opt: 2496 Z-score: 998.3 bits: 193.5 E(85289): 7.3e-49
Smith-Waterman score: 2496; 100.0% identity (100.0% similar) in 351 aa overlap (69-419:1-351)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 AEALQGAGTDGDQNGLDHPSVEVSLDENSGMLVDGFERTFDGKLKCRYCNYASKGTARLI
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MLVDGFERTFDGKLKCRYCNYASKGTARLI
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 EHIRIHTGEKPHRCHLCPFASAYERHLEAHMRSHTGEKPYKCELCSFRCSDRSNLSHHRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EHIRIHTGEKPHRCHLCPFASAYERHLEAHMRSHTGEKPYKCELCSFRCSDRSNLSHHRR
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 RKHKMVPIKGTRSSLSSKKMWGVLQKKTSNLGYSRRALINLSPPSMVVQKPDYLNDFTHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RKHKMVPIKGTRSSLSSKKMWGVLQKKTSNLGYSRRALINLSPPSMVVQKPDYLNDFTHE
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 IPNIQTDSYESMAKTTPTGGLPRDPQELMVDNPLNQLSTLAGQLSSLPPENQNPASPDVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IPNIQTDSYESMAKTTPTGGLPRDPQELMVDNPLNQLSTLAGQLSSLPPENQNPASPDVV
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 PCPDEKPFMIQQPSTQAVVSAVSASIPQSSSPTSPEPRPSHSQRNYSPVAGPSSEPSAHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PCPDEKPFMIQQPSTQAVVSAVSASIPQSSSPTSPEPRPSHSQRNYSPVAGPSSEPSAHT
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 STPSIGNSQPSTPAPALPVQDPQLLHHCQHCDMYFADNILYTIHMGCHGYENPFQCNICG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 STPSIGNSQPSTPAPALPVQDPQLLHHCQHCDMYFADNILYTIHMGCHGYENPFQCNICG
280 290 300 310 320 330
400 410
pF1KB7 CKCKNKYDFACHFARGQHNQH
:::::::::::::::::::::
XP_016 CKCKNKYDFACHFARGQHNQH
340 350
>>XP_016872043 (OMIM: 606238) PREDICTED: zinc finger pro (351 aa)
initn: 2496 init1: 2496 opt: 2496 Z-score: 998.3 bits: 193.5 E(85289): 7.3e-49
Smith-Waterman score: 2496; 100.0% identity (100.0% similar) in 351 aa overlap (69-419:1-351)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 AEALQGAGTDGDQNGLDHPSVEVSLDENSGMLVDGFERTFDGKLKCRYCNYASKGTARLI
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MLVDGFERTFDGKLKCRYCNYASKGTARLI
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 EHIRIHTGEKPHRCHLCPFASAYERHLEAHMRSHTGEKPYKCELCSFRCSDRSNLSHHRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EHIRIHTGEKPHRCHLCPFASAYERHLEAHMRSHTGEKPYKCELCSFRCSDRSNLSHHRR
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 RKHKMVPIKGTRSSLSSKKMWGVLQKKTSNLGYSRRALINLSPPSMVVQKPDYLNDFTHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RKHKMVPIKGTRSSLSSKKMWGVLQKKTSNLGYSRRALINLSPPSMVVQKPDYLNDFTHE
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 IPNIQTDSYESMAKTTPTGGLPRDPQELMVDNPLNQLSTLAGQLSSLPPENQNPASPDVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IPNIQTDSYESMAKTTPTGGLPRDPQELMVDNPLNQLSTLAGQLSSLPPENQNPASPDVV
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 PCPDEKPFMIQQPSTQAVVSAVSASIPQSSSPTSPEPRPSHSQRNYSPVAGPSSEPSAHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PCPDEKPFMIQQPSTQAVVSAVSASIPQSSSPTSPEPRPSHSQRNYSPVAGPSSEPSAHT
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 STPSIGNSQPSTPAPALPVQDPQLLHHCQHCDMYFADNILYTIHMGCHGYENPFQCNICG
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XP_016 STPSIGNSQPSTPAPALPVQDPQLLHHCQHCDMYFADNILYTIHMGCHGYENPFQCNICG
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400 410
pF1KB7 CKCKNKYDFACHFARGQHNQH
:::::::::::::::::::::
XP_016 CKCKNKYDFACHFARGQHNQH
340 350
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PCPDEKPFMIQQPSTQAVVSAVSASIPQSSSPTSPEPRPSHSQRNYSPVAGPSSEPSAHT
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 STPSIGNSQPSTPAPALPVQDPQLLHHCQHCDMYFADNILYTIHMGCHGYENPFQCNICG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 STPSIGNSQPSTPAPALPVQDPQLLHHCQHCDMYFADNILYTIHMGCHGYENPFQCNICG
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:::::::::::::::::::::
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. : :. .:. .... . :. .:.
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:. ..:. . . :: : .: :. . . :..::..:.:::: .: .: .: .
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pF1KB7 RHLEAHMRSHTGEKPYKCELCSFRCSDRSNLSHHRRRKHKMVPIKGTRSSLSSKKMWGVL
: .:.:.:. ::.::. :. ..::.: .:..: :... ...: . :.
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190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QKKTSNLGYSRRALINLSPPSMVVQKPDYLNDFTHEIPNIQTDSYESMAKTTPTGGLPRD
:. : . :. .: :.. . :. . .: .:. ... ... : : .
XP_011 ----SHHG---EKLMRFSYPDI---HFDMNLTYEKEAELMQSHMMDQAINNAITY-LGAE
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250 260 270 280 290
pF1KB7 PQELMVDNPLNQLSTLAGQLSSL------PPENQNPASPDVVPCPDEK---PFMIQQPST
. ....: . .. .: .:: : . . : : ... ... :. . .:..
XP_011 ALHPLMQHPPSTIAEVAPVISSAYSQVYHPNRIERPISRETADSHENNMDGPISLIRPKS
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pF1KB7 QAVVSAVSASIPQSSSPTSPEPRPSHSQRNYSPVAGPSSEPSAHTSTPSIGNSQPSTPAP
. .: : .: : . .:.. . :. .:. . : .. .. .: ::
XP_011 RPQEREASPSNSCLDSTDSESSHDDHQSYQGHPALNPKRKQSPAYMKEDV-KALDTTKAP
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360 370 380 390 400
pF1KB7 ALPVQD---------PQL-LHHCQHCDMYFADNILYTIHMGCHGYENPFQCNICGCKCKN
..: :. .:.:: . : :...::::::::::..:..::::: . ..
XP_011 KGSLKDIYKVFNGEGEQIRAFKCEHCRVLFLDHVMYTIHMGCHGYRDPLECNICGYRSQD
390 400 410 420 430 440
410
pF1KB7 KYDFACHFARGQHNQH
.:.:. :..::.:. :
XP_011 RYEFSSHIVRGEHTFH
450
>>XP_016859081 (OMIM: 606234) PREDICTED: zinc finger pro (459 aa)
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Smith-Waterman score: 478; 24.6% identity (57.6% similar) in 406 aa overlap (33-419:78-459)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 EKKPEPLDFVKDFQEYLTQQTHHVNMISGSVSGDKEAEALQGAGTDGDQNGLDHPSVEVS
. : :. .:. .... . :. .:.
XP_016 PSHMTSTNSVKLEMQSDEECDRKPLSREDEIRGHDEGSSLEEPLIESSEVA-DNRKVQ-E
50 60 70 80 90 100
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LDENSGMLVDGFERTFDGKLKCRYCNYASKGTARLIEHIRIHTGEKPHRCHLCPFASAYE
:. ..:. . . :: : .: :. . . :..::..:.:::: .: .: .: .
XP_016 LQGEGGIRLPNGERPF----HCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCPFCSYACRRR
110 120 130 140 150 160
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RHLEAHMRSHTGEKPYKCELCSFRCSDRSNLSHHRRRKHKMVPIKGTRSSLSSKKMWGVL
: .:.:.:. ::.::. :. ..::.: .:..: :... ...: . :.
XP_016 DALTGHLRTHSVGKPHKCNYCGRSYKQRSSLEEHKERCHNYL------QNVSMEAAGQVM
170 180 190 200 210
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QKKTSNLGYSRRALINLSPPSMVVQKPDYLNDFTHEIPNIQTDSYESMAKTTPTGGLPRD
:. : . :. .: :.. . :. . .: .:. ... ... : : .
XP_016 ----SHHG---EKLMRFSYPDI---HFDMNLTYEKEAELMQSHMMDQAINNAITY-LGAE
220 230 240 250 260
250 260 270 280 290
pF1KB7 PQELMVDNPLNQLSTLAGQLSSL------PPENQNPASPDVVPCPDEK---PFMIQQPST
. ....: . .. .: .:: : . . : : ... ... :. . .:..
XP_016 ALHPLMQHPPSTIAEVAPVISSAYSQVYHPNRIERPISRETADSHENNMDGPISLIRPKS
270 280 290 300 310 320
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 QAVVSAVSASIPQSSSPTSPEPRPSHSQRNYSPVAGPSSEPSAHTSTPSIGNSQPSTPAP
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XP_016 RPQEREASPSNSCLDSTDSESSHDDHQSYQGHPALNPKRKQSPAYMKEDV-KALDTTKAP
330 340 350 360 370 380
360 370 380 390 400
pF1KB7 ALPVQD---------PQL-LHHCQHCDMYFADNILYTIHMGCHGYENPFQCNICGCKCKN
..: :. .:.:: . : :...::::::::::..:..::::: . ..
XP_016 KGSLKDIYKVFNGEGEQIRAFKCEHCRVLFLDHVMYTIHMGCHGYRDPLECNICGYRSQD
390 400 410 420 430 440
410
pF1KB7 KYDFACHFARGQHNQH
.:.:. :..::.:. :
XP_016 RYEFSSHIVRGEHTFH
450
419 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 09:11:44 2016 done: Fri Nov 4 09:11:45 2016
Total Scan time: 10.310 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]