Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7450
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7450, 312 aa
1>>>pF1KB7450 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0015+/-0.00123; mu= 11.5154+/- 0.072
mean_var=116.7533+/-34.926, 0's: 0 Z-trim(102.3): 368 B-trim: 774 in 2/46
Lambda= 0.118697
statistics sampled from 6436 (6874) to 6436 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.545), E-opt: 0.2 (0.211), width: 16
Scan time: 2.310
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 2091 369.8 1.5e-102
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 1484 265.9 2.9e-71
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 1404 252.2 3.8e-67
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 1116 202.9 2.7e-52
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 1112 202.2 4.3e-52
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 1029 188.0 8.2e-48
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 1013 185.3 5.6e-47
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 1005 183.9 1.4e-46
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 985 180.5 1.5e-45
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 980 179.6 2.7e-45
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 979 179.4 3.1e-45
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 976 178.9 4.5e-45
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 966 177.2 1.5e-44
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 964 176.9 2e-44
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 963 176.7 2.1e-44
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 954 175.1 6e-44
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 946 173.8 1.6e-43
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 941 172.9 2.8e-43
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 896 165.3 6.4e-41
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 892 164.5 9.7e-41
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 891 164.4 1.1e-40
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 888 163.9 1.6e-40
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 880 162.5 4.1e-40
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 875 161.6 7.2e-40
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 875 161.6 7.2e-40
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 873 161.3 9.2e-40
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 869 160.6 1.4e-39
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 862 159.4 3.4e-39
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 862 159.4 3.4e-39
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 853 157.9 9.8e-39
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 851 157.5 1.2e-38
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 846 156.7 2.3e-38
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 845 156.5 2.5e-38
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 845 156.5 2.5e-38
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 823 152.7 3.4e-37
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 822 152.6 3.9e-37
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 817 151.7 7.3e-37
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 782 145.7 4.5e-35
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 737 138.0 9.2e-33
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 734 137.5 1.3e-32
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 710 133.4 2.5e-31
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 709 133.2 2.6e-31
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 707 132.9 3.3e-31
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 702 132.0 6e-31
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 678 127.9 1e-29
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 658 124.5 1.1e-28
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 658 124.5 1.2e-28
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 597 114.0 1.5e-25
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 577 110.6 1.7e-24
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 568 109.1 4.9e-24
>>CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 2091 init1: 2091 opt: 2091 Z-score: 1954.7 bits: 369.8 E(32554): 1.5e-102
Smith-Waterman score: 2091; 100.0% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGLNKSASTFQLTGFPGMEKAHHWIFIPLLAAYISILLGNGTLLFLIRNDHNLHEPMYYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MGLNKSASTFQLTGFPGMEKAHHWIFIPLLAAYISILLGNGTLLFLIRNDHNLHEPMYYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LAMLAATDLGVTLTTMPTVLGVLWLDHREIGHGACFSQAYFIHTLSVMESGVLLAMAYDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LAMLAATDLGVTLTTMPTVLGVLWLDHREIGHGACFSQAYFIHTLSVMESGVLLAMAYDC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FITIRSPLRYTSILTNTQVMKIGVRVLTRAGLSIMPIVVRLHWFPYCRSHVLSHAFCLHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FITIRSPLRYTSILTNTQVMKIGVRVLTRAGLSIMPIVVRLHWFPYCRSHVLSHAFCLHQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 DVIKLACADITFNRLYPVVVLFAMVLLDFLIIFFSYILILKTVMGIGSGGERAKALNTCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DVIKLACADITFNRLYPVVVLFAMVLLDFLIIFFSYILILKTVMGIGSGGERAKALNTCV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SHICCILVFYVTVVCLTFIHRFGKHVPHVVHITMSYIHFLFPPFMNPFIYSIKTKQIQSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SHICCILVFYVTVVCLTFIHRFGKHVPHVVHITMSYIHFLFPPFMNPFIYSIKTKQIQSG
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 ILRLFSLPHSRA
::::::::::::
CCDS31 ILRLFSLPHSRA
310
>>CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1471 init1: 1471 opt: 1484 Z-score: 1393.0 bits: 265.9 E(32554): 2.9e-71
Smith-Waterman score: 1484; 70.9% identity (89.9% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGLNKSASTFQLTGFPGMEKAHHWIFIPLLAAYISILLGNGTLLFLIRNDHNLHEPMYYF
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CCDS31 MSSSGSSHPFLLTGFPGLEEAHHWISVFFLFMYISILFGNGTLLLLIKEDHNLHEPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LAMLAATDLGVTLTTMPTVLGVLWLDHREIGHGACFSQAYFIHTLSVMESGVLLAMAYDC
::::::::::..::::::::::::::::::: .::::::::::.:: .:::.:::::::
CCDS31 LAMLAATDLGLALTTMPTVLGVLWLDHREIGSAACFSQAYFIHSLSFLESGILLAMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FITIRSPLRYTSILTNTQVMKIGVRVLTRAGLSIMPIVVRLHWFPYCRSHVLSHAFCLHQ
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CCDS31 FIAICNPLRYTSVLTNTRVVKIGLGVLMRGFVSVVPPIRPLYFFLYCHSHVLSHAFCLHQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 DVIKLACADITFNRLYPVVVLFAMVLLDFLIIFFSYILILKTVMGIGSGGERAKALNTCV
::::::::: :::::::.:.. . .::.::::.::.::::::..:.: :::::: :::
CCDS31 DVIKLACADTTFNRLYPAVLVVFIFVLDYLIIFISYVLILKTVLSIASREERAKALITCV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SHICCILVFYVTVVCLTFIHRFGKHVPHVVHITMSYIHFLFPPFMNPFIYSIKTKQIQSG
:::::.:::::::. :..::::::.:::.::. ::: .:::::.:::. ::.::::::..
CCDS31 SHICCVLVFYVTVIGLSLIHRFGKQVPHIVHLIMSYAYFLFPPLMNPITYSVKTKQIQNA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 ILRLFSLPHSRA
::.::.
CCDS31 ILHLFTTHRIGT
310
>>CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 992 init1: 992 opt: 1404 Z-score: 1319.0 bits: 252.2 E(32554): 3.8e-67
Smith-Waterman score: 1404; 67.6% identity (88.1% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGLNKSASTFQLTGFPGMEKAHHWIFIPLLAAYISILLGNGTLLFLIRNDHNLHEPMYYF
: :.::. : :::: : : .:. : . ... :.:.:.:::::: :: :::.::::::::
CCDS77 MWYNNSAGPFLLTGFLGSEAVHYRISMSFFVIYFSVLFGNGTLLVLIWNDHSLHEPMYYF
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 LAMLAATDLGVTLTTMPTVLGVLWLDHREIGHGACFSQAYFIHTLSVMESGVLLAMAYDC
::::: ::::.:.:::::::::: ::.:::.:.:::.:. :::.:...:::.::..::::
CCDS77 LAMLADTDLGMTFTTMPTVLGVLLLDQREIAHAACFTQS-FIHSLAIVESGILLVLAYDC
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FITIRSPLRYTSILTNTQVMKIGVRVLTRAGLSIMPIVVRLHWFPYCRSHVLSHAFCLHQ
::.::.::::. ::::..::.::. :: :. .::.::.. :. .::: :..: :.:::::
CCDS77 FIAIRTPLRYNCILTNSRVMNIGLGVLMRGFMSILPIILSLYCYPYCGSRALLHTFCLHQ
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 DVIKLACADITFNRLYPVVVLFAMVLLDFLIIFFSYILILKTVMGIGSGGERAKALNTCV
:::::::::::::..::.. :.:: :::.:::::::::::::.:: :.::.:::::
CCDS77 DVIKLACADITFNHIYPIIQTSLTVFLDALIIIFSYILILKTVMGIASGQEEAKSLNTCV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SHICCILVFYVTVVCLTFIHRFGKHVPHVVHITMSYIHFLFPPFMNPFIYSIKTKQIQSG
::: :.:::..::. :.::::::::.:::: :::::.:::::::.::.:::::::::: .
CCDS77 SHISCVLVFHITVMGLSFIHRFGKHAPHVVPITMSYVHFLFPPFVNPIIYSIKTKQIQRS
240 250 260 270 280 290
310
pF1KB7 ILRLFSLPHSRA
:.:::: .:::
CCDS77 IIRLFS-GQSRA
300 310
>>CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 (321 aa)
initn: 1116 init1: 1116 opt: 1116 Z-score: 1052.2 bits: 202.9 E(32554): 2.7e-52
Smith-Waterman score: 1116; 52.0% identity (81.8% similar) in 302 aa overlap (6-307:17-318)
10 20 30 40
pF1KB7 MGLNKSASTFQLTGFPGMEKAHHWIFIPLLAAYISILLGNGTLLFLIRN
. :.: :::: :::. . :. ::. . : .:::: .: .: .
CCDS31 MFLSSRMITSVSPSTSTNSSFLLTGFSGMEQQYPWLSIPFSSIYAMVLLGNCMVLHVIWT
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 DHNLHEPMYYFLAMLAATDLGVTLTTMPTVLGVLWLDHREIGHGACFSQAYFIHTLSVME
. .::.::.:::.::: ::: . :.:. ::::.:: :::. .:..:.:::: :: ::
CCDS31 EPSLHQPMFYFLSMLALTDLCMGLSTVYTVLGILWGIIREISLDSCIAQSYFIHGLSFME
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 SGVLLAMAYDCFITIRSPLRYTSILTNTQVMKIGVRVLTRAGLSIMPIVVRLHWFPYCRS
:.:::.::.: .:.: .::::.:::::....:::. .. :. . : : .. :..: ::.
CCDS31 SSVLLTMAFDRYIAICNPLRYSSILTNSRIIKIGLTIIGRSFFFITPPIICLKFFNYCHF
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 HVLSHAFCLHQDVIKLACADITFNRLYPVVVLFAMVLLDFLIIFFSYILILKTVMGIGSG
:.:::.::::::...:::.:: :: : ..... ..::: ..:.::::::::.:....:
CCDS31 HILSHSFCLHQDLLRLACSDIRFNSYYALMLVICILLLDAILILFSYILILKSVLAVASQ
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 GERAKALNTCVSHICCILVFYVTVVCLTFIHRFGKHVPHVVHITMSYIHFLFPPFMNPFI
:: : ..::.:::: .::::. .. ::..::::::. :.:. .. :..::::.:::.:
CCDS31 EERHKLFQTCISHICAVLVFYIPIISLTMVHRFGKHLSPVAHVLIGNIYILFPPLMNPII
250 260 270 280 290 300
290 300 310
pF1KB7 YSIKTKQIQSGILRLFSLPHSRA
::.::.::.. .::::::
CCDS31 YSVKTQQIHTRMLRLFSLKRY
310 320
>>CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1110 init1: 1110 opt: 1112 Z-score: 1048.7 bits: 202.2 E(32554): 4.3e-52
Smith-Waterman score: 1112; 53.2% identity (80.6% similar) in 299 aa overlap (7-305:14-312)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MGLNKSASTFQLTGFPGMEKAHHWIFIPLLAAYISILLGNGTLLFLIRNDHNL
..:: :.:.::.:. : :: ::: :. . :: :.::.:.....:
CCDS31 MTLGSLGNSSSSVSATFLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILFIIKTERSL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 HEPMYYFLAMLAATDLGVTLTTMPTVLGVLWLDHREIGHGACFSQAYFIHTLSVMESGVL
::::: ::.::: :::..: :.:::::..:. :::.: :::.: .::: .: .::.::
CCDS31 HEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDACFAQLFFIHCFSFLESSVL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LAMAYDCFITIRSPLRYTSILTNTQVMKIGVRVLTRAGLSIMPIVVRLHWFPYCRSHVLS
:.::.: :..: ::.:.:::::: . .::. : :. :.:. :. :::: : :::
CCDS31 LSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRFPYCGSPVLS
130 140 150 160 170 180
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pF1KB7 HAFCLHQDVIKLACADITFNRLYPVVVLFAMVLLDFLIIFFSYILILKTVMGIGSGGERA
:..::::.:.::::::. : .: . :. . : .: :.:.::: :::.::..:.: .::
CCDS31 HSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVLSIASRAERF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 KALNTCVSHICCILVFYVTVVCLTFIHRFGKHVPHVVHITMSYIHFLFPPFMNPFIYSIK
::::::::::: .:.::. .. :. ::::::..::.:...:.....:::: :::..::.:
CCDS31 KALNTCVSHICAVLLFYTPMIGLSVIHRFGKQAPHLVQVVMGFMYLLFPPVMNPIVYSVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 TKQIQSGILRLFSLPHSRA
::::.. . . :
CCDS31 TKQIRDRVTHAFCY
310
>>CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1051 init1: 1020 opt: 1029 Z-score: 971.8 bits: 188.0 E(32554): 8.2e-48
Smith-Waterman score: 1029; 49.3% identity (79.2% similar) in 298 aa overlap (10-307:14-311)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MGLNKSASTFQLTGFPGMEKAHHWIFIPLLAAYISILLGNGTLLFLIRNDHNLHEP
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