Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7342
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7342, 894 aa
1>>>pF1KB7342 894 - 894 aa - 894 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4581+/-0.000962; mu= 20.2243+/- 0.058
mean_var=74.5915+/-14.691, 0's: 0 Z-trim(104.8): 190 B-trim: 2 in 1/49
Lambda= 0.148501
statistics sampled from 7906 (8099) to 7906 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.617), E-opt: 0.2 (0.249), width: 16
Scan time: 4.250
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11894.1 DSC1 gene_id:1823|Hs108|chr18 ( 894) 6012 1298.2 0
CCDS11895.1 DSC1 gene_id:1823|Hs108|chr18 ( 840) 5546 1198.3 0
CCDS11892.1 DSC2 gene_id:1824|Hs108|chr18 ( 901) 3204 696.6 5.3e-200
CCDS32810.1 DSC3 gene_id:1825|Hs108|chr18 ( 896) 3039 661.3 2.3e-189
CCDS11893.1 DSC2 gene_id:1824|Hs108|chr18 ( 847) 2830 616.5 6.6e-176
CCDS77172.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18 ( 875) 1300 288.7 3.2e-77
CCDS11891.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18 ( 906) 1300 288.7 3.3e-77
CCDS10869.1 CDH1 gene_id:999|Hs108|chr16 ( 882) 1266 281.4 5e-75
CCDS58784.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20 ( 842) 1178 262.5 2.3e-69
CCDS13488.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20 ( 916) 1178 262.6 2.5e-69
CCDS82004.1 CDH3 gene_id:1001|Hs108|chr16 ( 784) 1176 262.1 2.9e-69
CCDS10868.1 CDH3 gene_id:1001|Hs108|chr16 ( 829) 1176 262.1 3e-69
CCDS10976.1 CDH15 gene_id:1013|Hs108|chr16 ( 814) 1055 236.2 1.9e-61
CCDS11897.1 DSG4 gene_id:147409|Hs108|chr18 (1040) 1042 233.4 1.6e-60
CCDS45845.1 DSG4 gene_id:147409|Hs108|chr18 (1059) 1042 233.5 1.6e-60
CCDS58486.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 ( 713) 1039 232.7 1.8e-60
CCDS42423.1 DSG2 gene_id:1829|Hs108|chr18 (1118) 1041 233.3 2e-60
CCDS58485.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 ( 760) 1033 231.4 4.7e-60
CCDS58487.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 ( 674) 954 214.5 5.3e-55
CCDS3889.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5 ( 790) 950 213.7 1.1e-54
CCDS11898.1 DSG3 gene_id:1830|Hs108|chr18 ( 999) 941 211.8 5.1e-54
CCDS13485.1 CDH26 gene_id:60437|Hs108|chr20 ( 832) 936 210.7 9.2e-54
CCDS3892.1 CDH10 gene_id:1008|Hs108|chr5 ( 788) 904 203.8 1e-51
CCDS11993.1 CDH7 gene_id:1005|Hs108|chr18 ( 785) 896 202.1 3.3e-51
CCDS82259.1 CDH7 gene_id:1005|Hs108|chr18 ( 630) 884 199.5 1.7e-50
CCDS54835.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5 ( 574) 859 194.1 6.3e-49
CCDS75229.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5 ( 575) 859 194.1 6.3e-49
CCDS11977.1 CDH20 gene_id:28316|Hs108|chr18 ( 801) 845 191.2 6.6e-48
CCDS3890.1 CDH12 gene_id:1010|Hs108|chr5 ( 794) 844 191.0 7.6e-48
CCDS10802.1 CDH8 gene_id:1006|Hs108|chr16 ( 799) 818 185.4 3.6e-46
CCDS81993.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16 ( 693) 816 184.9 4.3e-46
CCDS10803.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16 ( 796) 816 185.0 4.9e-46
CCDS9586.1 CDH24 gene_id:64403|Hs108|chr14 ( 781) 803 182.2 3.3e-45
CCDS3894.1 CDH6 gene_id:1004|Hs108|chr5 ( 790) 803 182.2 3.3e-45
CCDS3893.1 CDH9 gene_id:1007|Hs108|chr5 ( 789) 777 176.6 1.6e-43
CCDS11896.1 DSG1 gene_id:1828|Hs108|chr18 (1049) 752 171.3 8.2e-42
CCDS13395.1 CDH22 gene_id:64405|Hs108|chr20 ( 828) 726 165.7 3.2e-40
CCDS6260.1 CDH17 gene_id:1015|Hs108|chr8 ( 832) 722 164.8 5.8e-40
CCDS81992.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16 ( 670) 673 154.3 7.1e-37
CCDS11994.1 CDH19 gene_id:28513|Hs108|chr18 ( 772) 661 151.7 4.7e-36
CCDS9585.1 CDH24 gene_id:64403|Hs108|chr14 ( 819) 644 148.1 6.2e-35
CCDS82005.1 CDH1 gene_id:999|Hs108|chr16 ( 821) 579 134.2 9.6e-31
CCDS59325.1 CDH19 gene_id:28513|Hs108|chr18 ( 490) 542 126.1 1.5e-28
CCDS82991.1 CDH12 gene_id:1010|Hs108|chr5 ( 754) 543 126.5 1.9e-28
CCDS58472.1 CDH16 gene_id:1014|Hs108|chr16 ( 732) 460 108.7 4.1e-23
CCDS14076.1 CELSR1 gene_id:9620|Hs108|chr22 (3014) 453 107.6 3.7e-22
CCDS796.1 CELSR2 gene_id:1952|Hs108|chr1 (2923) 409 98.1 2.5e-19
CCDS2775.1 CELSR3 gene_id:1951|Hs108|chr3 (3312) 390 94.1 4.6e-18
CCDS3732.3 FAT4 gene_id:79633|Hs108|chr4 (4981) 376 91.2 5.1e-17
CCDS58471.1 CDH16 gene_id:1014|Hs108|chr16 ( 790) 330 80.8 1.1e-14
>>CCDS11894.1 DSC1 gene_id:1823|Hs108|chr18 (894 aa)
initn: 6012 init1: 6012 opt: 6012 Z-score: 6955.5 bits: 1298.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6012; 100.0% identity (100.0% similar) in 894 aa overlap (1-894:1-894)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MALASAAPGSIFCKQLLFSLLVLTLLCDACQKVYLRVPSHLQAETLVGKVNLEECLKSAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MALASAAPGSIFCKQLLFSLLVLTLLCDACQKVYLRVPSHLQAETLVGKVNLEECLKSAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LIRSSDPAFRILEDGSIYTTHDLILSSERKSFSIFLSDGQRREQQEIKVVLSARENKSPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LIRSSDPAFRILEDGSIYTTHDLILSSERKSFSIFLSDGQRREQQEIKVVLSARENKSPK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KRHTKDTALKRSKRRWAPIPASLMENSLGPFPQHVQQIQSDAAQNYTIFYSISGPGVDKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KRHTKDTALKRSKRRWAPIPASLMENSLGPFPQHVQQIQSDAAQNYTIFYSISGPGVDKE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PFNLFYIEKDTGDIFCTRSIDREKYEQFALYGYATTADGYAPEYPLPLIIKIEDDNDNAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PFNLFYIEKDTGDIFCTRSIDREKYEQFALYGYATTADGYAPEYPLPLIIKIEDDNDNAP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 YFEHRVTIFTVPENCRSGTSVGKVTATDLDEPDTLHTRLKYKILQQIPDHPKHFSIHPDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YFEHRVTIFTVPENCRSGTSVGKVTATDLDEPDTLHTRLKYKILQQIPDHPKHFSIHPDT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 GVITTTTPFLDREKCDTYQLIMEVRDMGGQPFGLFNTGTITISLEDENDNPPSFTETSYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GVITTTTPFLDREKCDTYQLIMEVRDMGGQPFGLFNTGTITISLEDENDNPPSFTETSYV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 TEVEENRIDVEILRMKVQDQDLPNTPHSKAVYKILQGNENGNFIISTDPNTNEGVLCVVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TEVEENRIDVEILRMKVQDQDLPNTPHSKAVYKILQGNENGNFIISTDPNTNEGVLCVVK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 PLNYEVNRQVILQVGVINEAQFSKAASSQTPTMCTTTVTVKIIDSDEGPECHPPVKVIQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PLNYEVNRQVILQVGVINEAQFSKAASSQTPTMCTTTVTVKIIDSDEGPECHPPVKVIQS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 QDGFPAGQELLGYKALDPEISSGEGLRYQKLGDEDNWFEINQHTGDLRTLKVLDRESKFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QDGFPAGQELLGYKALDPEISSGEGLRYQKLGDEDNWFEINQHTGDLRTLKVLDRESKFV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 KNNQYNISVVAVDAVGRSCTGTLVVHLDDYNDHAPQIDKEVTICQNNEDFAVLKPVDPDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KNNQYNISVVAVDAVGRSCTGTLVVHLDDYNDHAPQIDKEVTICQNNEDFAVLKPVDPDG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 PENGPPFQFFLDNSASKNWNIEEKDGKTAILRQRQNLDYNYYSVPIQIKDRHGLVATHML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PENGPPFQFFLDNSASKNWNIEEKDGKTAILRQRQNLDYNYYSVPIQIKDRHGLVATHML
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 TVRVCDCSTPSECRMKDKSTRDVRPNVILGRWAILAMVLGSVLLLCILFTCFCVTAKRTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TVRVCDCSTPSECRMKDKSTRDVRPNVILGRWAILAMVLGSVLLLCILFTCFCVTAKRTV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 KKCFPEDIAQQNLIVSNTEGPGEEVTEANIRLPMQTSNICDTSMSVGTVGGQGIKTQQSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KKCFPEDIAQQNLIVSNTEGPGEEVTEANIRLPMQTSNICDTSMSVGTVGGQGIKTQQSF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 EMVKGGYTLDSNKGGGHQTLESVKGVGQGDTGRYAYTDWQSFTQPRLGEKVYLCGQDEEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EMVKGGYTLDSNKGGGHQTLESVKGVGQGDTGRYAYTDWQSFTQPRLGEKVYLCGQDEEH
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KB7 KHCEDYVCSYNYEGKGSLAGSVGCCSDRQEEEGLEFLDHLEPKFRTLAKTCIKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KHCEDYVCSYNYEGKGSLAGSVGCCSDRQEEEGLEFLDHLEPKFRTLAKTCIKK
850 860 870 880 890
>>CCDS11895.1 DSC1 gene_id:1823|Hs108|chr18 (840 aa)
initn: 5655 init1: 5546 opt: 5546 Z-score: 6416.4 bits: 1198.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5546; 99.9% identity (100.0% similar) in 830 aa overlap (1-830:1-830)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MALASAAPGSIFCKQLLFSLLVLTLLCDACQKVYLRVPSHLQAETLVGKVNLEECLKSAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MALASAAPGSIFCKQLLFSLLVLTLLCDACQKVYLRVPSHLQAETLVGKVNLEECLKSAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LIRSSDPAFRILEDGSIYTTHDLILSSERKSFSIFLSDGQRREQQEIKVVLSARENKSPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LIRSSDPAFRILEDGSIYTTHDLILSSERKSFSIFLSDGQRREQQEIKVVLSARENKSPK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KRHTKDTALKRSKRRWAPIPASLMENSLGPFPQHVQQIQSDAAQNYTIFYSISGPGVDKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KRHTKDTALKRSKRRWAPIPASLMENSLGPFPQHVQQIQSDAAQNYTIFYSISGPGVDKE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PFNLFYIEKDTGDIFCTRSIDREKYEQFALYGYATTADGYAPEYPLPLIIKIEDDNDNAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PFNLFYIEKDTGDIFCTRSIDREKYEQFALYGYATTADGYAPEYPLPLIIKIEDDNDNAP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 YFEHRVTIFTVPENCRSGTSVGKVTATDLDEPDTLHTRLKYKILQQIPDHPKHFSIHPDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YFEHRVTIFTVPENCRSGTSVGKVTATDLDEPDTLHTRLKYKILQQIPDHPKHFSIHPDT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 GVITTTTPFLDREKCDTYQLIMEVRDMGGQPFGLFNTGTITISLEDENDNPPSFTETSYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GVITTTTPFLDREKCDTYQLIMEVRDMGGQPFGLFNTGTITISLEDENDNPPSFTETSYV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 TEVEENRIDVEILRMKVQDQDLPNTPHSKAVYKILQGNENGNFIISTDPNTNEGVLCVVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TEVEENRIDVEILRMKVQDQDLPNTPHSKAVYKILQGNENGNFIISTDPNTNEGVLCVVK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 PLNYEVNRQVILQVGVINEAQFSKAASSQTPTMCTTTVTVKIIDSDEGPECHPPVKVIQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PLNYEVNRQVILQVGVINEAQFSKAASSQTPTMCTTTVTVKIIDSDEGPECHPPVKVIQS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 QDGFPAGQELLGYKALDPEISSGEGLRYQKLGDEDNWFEINQHTGDLRTLKVLDRESKFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QDGFPAGQELLGYKALDPEISSGEGLRYQKLGDEDNWFEINQHTGDLRTLKVLDRESKFV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 KNNQYNISVVAVDAVGRSCTGTLVVHLDDYNDHAPQIDKEVTICQNNEDFAVLKPVDPDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KNNQYNISVVAVDAVGRSCTGTLVVHLDDYNDHAPQIDKEVTICQNNEDFAVLKPVDPDG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 PENGPPFQFFLDNSASKNWNIEEKDGKTAILRQRQNLDYNYYSVPIQIKDRHGLVATHML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PENGPPFQFFLDNSASKNWNIEEKDGKTAILRQRQNLDYNYYSVPIQIKDRHGLVATHML
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 TVRVCDCSTPSECRMKDKSTRDVRPNVILGRWAILAMVLGSVLLLCILFTCFCVTAKRTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TVRVCDCSTPSECRMKDKSTRDVRPNVILGRWAILAMVLGSVLLLCILFTCFCVTAKRTV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 KKCFPEDIAQQNLIVSNTEGPGEEVTEANIRLPMQTSNICDTSMSVGTVGGQGIKTQQSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KKCFPEDIAQQNLIVSNTEGPGEEVTEANIRLPMQTSNICDTSMSVGTVGGQGIKTQQSF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 EMVKGGYTLDSNKGGGHQTLESVKGVGQGDTGRYAYTDWQSFTQPRLGEKVYLCGQDEEH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS11 EMVKGGYTLDSNKGGGHQTLESVKGVGQGDTGRYAYTDWQSFTQPRLGEESIRGHTLIKN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KB7 KHCEDYVCSYNYEGKGSLAGSVGCCSDRQEEEGLEFLDHLEPKFRTLAKTCIKK
>>CCDS11892.1 DSC2 gene_id:1824|Hs108|chr18 (901 aa)
initn: 2691 init1: 1469 opt: 3204 Z-score: 3704.2 bits: 696.6 E(32554): 5.3e-200
Smith-Waterman score: 3204; 54.7% identity (79.3% similar) in 907 aa overlap (2-894:4-901)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MALASAAPGSIFCKQLLFSLLVLTLLCDACQKVYLRVPSHLQAETLVGKVNLEECLKS
: :.. .. .:. ::..: .: . :::..: :.:::.:.:: :::.:::.::. .
CCDS11 MEAARPSGSWNGALCRLLLLTLAILIFASDACKNVTLHVPSKLDAEKLVGRVNLKECFTA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 ASLIRSSDPAFRILEDGSIYTTHDLILSSERKSFSIFLSDGQRREQQEIKVVLSARENKS
:.::.:::: :.::::::.:::. ..::::..::.:.::. . .:...: : : ...:
CCDS11 ANLIHSSDPDFQILEDGSVYTTNTILLSSEKRSFTILLSNTENQEKKKIFVFLE-HQTKV
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 PKKRHTKDTALKRSKRRWAPIPASLMENSLGPFPQHVQQIQSDAAQNYTIFYSISGPGVD
::::::. .:.:.:::::::: :..:::::::: .::.:::.::::::.::: :::::
CCDS11 LKKRHTKEKVLRRAKRRWAPIPCSMLENSLGPFPLFLQQVQSDTAQNYTIYYSIRGPGVD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 KEPFNLFYIEKDTGDIFCTRSIDREKYEQFALYGYATTADGYAPEYPLPLIIKIEDDNDN
.:: ::::.:.:::...::: .:::.::.: . ..::: :::.:: ::::::::::.:::
CCDS11 QEPRNLFYVERDTGNLYCTRPVDREQYESFEIIAFATTPDGYTPELPLPLIIKIEDENDN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 APYFEHRVTIFTVPENCRSGTSVGKVTATDLDEPDTLHTRLKYKILQQIPDHPKHFSIHP
: : ... ::. :::: ::.::.: ::: :::::.::::::.:. :.: : ::.::
CCDS11 YPIFTEETYTFTIFENCRVGTTVGQVCATDKDEPDTMHTRLKYSIIGQVPPSPTLFSMHP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 DTGVITTTTPFLDREKCDTYQLIMEVRDMGGQPFGLFNTGTITISLEDENDNPPSFTETS
:::::::. :::: : ::: ..:.:: :: ::: .:.: :...: ::. :.::.::
CCDS11 TTGVITTTSSQLDRELIDKYQLKIKVQDMDGQYFGLQTTSTCIINIDDVNDHLPTFTRTS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 YVTEVEENRIDVEILRMKVQDQDLPNTPHSKAVYKILQGNENGNFIISTDPNTNEGVLCV
::: :::: .::::::. :.:.:: :: . .: : ::.::::::: : :: .::::::::
CCDS11 YVTSVEENTVDVEILRVTVEDKDLVNTANWRANYTILKGNENGNFKIVTDAKTNEGVLCV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 VKPLNYEVNRQVILQVGVINEAQFSKAASSQTPTMCTTTVTVKIIDSDEGPECHPPVKVI
::::::: ..:.:::.::.::: ::. :: .. .: :.::::.. :.::::::.::....
CCDS11 VKPLNYEEKQQMILQIGVVNEAPFSREASPRS-AMSTATVTVNVEDQDEGPECNPPIQTV
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 QSQDGFPAGQELLGYKALDPEISSGEGLRYQKLGDEDNWFEINQHTGDLRTLKVLDRESK
. ... .: :::: ::: :. :.::.:: : .: :...::...... ::::..
CCDS11 RMKENAEVGTTSNGYKAYDPETRSSSGIRYKKLTDPTGWVTIDENTGSIKVFRSLDREAE
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 FVKNNQYNISVVAVDAVGRSCTGTLVVHLDDYNDHAPQIDKE-VTICQNNEDFAVLKPVD
.::. :::.:.: : ::.::::: . :.: ::..: : :. : ::. . . : . ::
CCDS11 TIKNGIYNITVLASDQGGRTCTGTLGIILQDVNDNSPFIPKKTVIICKPTMSSAEIVAVD
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB7 PDGPENGPPFQFFLDNSAS---KNWNIEEKDGKTAILRQRQNLDYNYYSVPIQIKDRHGL
:: : .::::.: :..:.: . : .. . .: : ... .. : ::: ..:: :.
CCDS11 PDEPIHGPPFDFSLESSTSEVQRMWRLKAINDTAARLSYQNDPPFGSYVVPITVRDRLGM
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB7 VATHMLTVRVCDCSTPSECRMKDKSTRDVRPNVILGRWAILAMVLGSVLLLCILFTCFCV
.. : : .::: : ..: . . : .: ::.:::::..:: .::.::::: :
CCDS11 SSVTSLDVTLCDCITENDCTHR-VDPRIGGGGVQLGKWAILAILLGIALLFCILFTLVC-
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB7 TAKRTVK--KCFPEDIAQQNLIVSNTEGPGEE-VTEANIRLPMQTSNICDTSMSV-GTVG
:. : : : .:.:.:::::::::::.::.. : :: . :... ....: ::::
CCDS11 GASGTSKQPKVIPDDLAQQNLIVSNTEAPGDDKVYSAN---GFTTQTVGASAQGVCGTVG
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820
pF1KB7 GQGIKT--QQSFEMVKGGY-TLDSNKGGGHQ-TLESVKGVGQG--DTGRYAYTDWQSFTQ
. :::. :...::::::. : .: .:.::. ::.: .: :. :. ::.:..:.::::
CCDS11 S-GIKNGGQETIEMVKGGHQTSESCRGAGHHHTLDSCRG-GHTEVDNCRYTYSEWHSFTQ
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KB7 PRLGEKVYLCGQDEEHKHCEDYVCSYNYEGKGSLAGSVGCCSDRQEEEGLEFLDHLEPKF
::::::::::.:::.::: .::: .:::::.::.::::::::.::::.::::::.:::::
CCDS11 PRLGEKVYLCNQDENHKHAQDYVLTYNYEGRGSVAGSVGCCSERQEEDGLEFLDNLEPKF
840 850 860 870 880 890
890
pF1KB7 RTLAKTCIKK
::::..:.:.
CCDS11 RTLAEACMKR
900
>>CCDS32810.1 DSC3 gene_id:1825|Hs108|chr18 (896 aa)
initn: 2619 init1: 1377 opt: 3039 Z-score: 3513.2 bits: 661.3 E(32554): 2.3e-189
Smith-Waterman score: 3039; 51.3% identity (77.8% similar) in 908 aa overlap (3-894:1-896)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MALASAAP-----GSIFCKQLLFSLLVLTLLCDACQKVYLRVPSHLQAETLVGKVNLEEC
.:.:.: :.. : .::..:.... .::.:: : :::.:.:. ..:.::::::
CCDS32 MAAAGPRRSVRGAV-CLHLLLTLVIFSRAGEACKKVILNVPSKLEADKIIGRVNLEEC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LKSASLIRSSDPAFRILEDGSIYTTHDLILSSERKSFSIFLSDGQRREQQEIKVVLSARE
..::.::::::: ::.:.:::.::.. . ::....::.:.::: ... :.:. :.: ..
CCDS32 FRSADLIRSSDPDFRVLNDGSVYTARAVALSDKKRSFTIWLSDKRKQTQKEVTVLLE-HQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 NKSPKKRHTKDTALKRSKRRWAPIPASLMENSLGPFPQHVQQIQSDAAQNYTIFYSISGP
.: : :::..:.:.:.:::::::: :..:::::::: .::..::::::::.::::::
CCDS32 KKVSKTRHTRETVLRRAKRRWAPIPCSMQENSLGPFPLFLQQVESDAAQNYTVFYSISGR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 GVDKEPFNLFYIEKDTGDIFCTRSIDREKYEQFALYGYATTADGYAPEYPLPLIIKIEDD
::::::.::::::.:::..:::: .:::.:. : : .::.:::::. . :::: :..::.
CCDS32 GVDKEPLNLFYIERDTGNLFCTRPVDREEYDVFDLIAYASTADGYSADLPLPLPIRVEDE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 NDNAPYFEHRVTIFTVPENCRSGTSVGKVTATDLDEPDTLHTRLKYKILQQIPDHPKHFS
::: : : . . : : :. : ::.:: : ::: :::::.::::::.:::: : : ::
CCDS32 NDNHPVFTEAIYNFEVLESSRPGTTVGVVCATDRDEPDTMHTRLKYSILQQTPRSPGLFS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 IHPDTGVITTTTPFLDREKCDTYQLIMEVRDMGGQPFGLFNTGTITISLEDENDNPPSFT
.::.::::::.. .:::: : :.:::.:.:: :: :::..:.: :.. : ::: :.:
CCDS32 VHPSTGVITTVSHYLDREVVDKYSLIMKVQDMDGQFFGLIGTSTCIITVTDSNDNAPTFR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 ETSYVTEVEENRIDVEILRMKVQDQDLPNTPHSKAVYKILQGNENGNFIISTDPNTNEGV
...: . :::: ..:::::. ..:.:: :: . .. . ::.:::::.: :::: .:::::
CCDS32 QNAYEAFVEENAFNVEILRIPIEDKDLINTANWRVNFTILKGNENGHFKISTDKETNEGV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 LCVVKPLNYEVNRQVILQVGVINEAQFSKAASSQTPTMCTTTVTVKIIDSDEGPECHPPV
: :::::::: :::: :..:: ::: :.. : .. . :::.. : :::::: : .
CCDS32 LSVVKPLNYEENRQVNLEIGVNNEAPFARDIPRVT-ALNRALVTVHVRDLDEGPECTPAA
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 KVIQSQDGFPAGQELLGYKALDPEISSGEGLRYQKLGDEDNWFEINQHTGDLRTLKVLDR
. .. .... .:... :::: ::: .:.::::.:: : .:. :.. .:.. : :.:::
CCDS32 QYVRIKENLAVGSKINGYKAYDPENRNGNGLRYKKLHDPKGWITIDEISGSIITSKILDR
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 ESKFVKNNQYNISVVAVDAVGRSCTGTLVVHLDDYNDHAPQIDKE-VTICQNNEDFAVLK
: . ::. :::.:.:.: :::::::.:...: ::. :.: .: :.::. . .. .
CCDS32 EVETPKNELYNITVLAIDKDDRSCTGTLAVNIEDVNDNPPEILQEYVVICKPKMGYTDIL
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB7 PVDPDGPENGPPFQFFLDNSA---SKNWNIEEKDGKTAILRQRQNLDYNYYSVPIQIKDR
:::: : .: :: : : :.. :. :.. . . .: : ..: .. :..:: .:::
CCDS32 AVDPDEPVHGAPFYFSLPNTSPEISRLWSLTKVNDTAARLSYQKNAGFQEYTIPITVKDR
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB7 HGLVATHMLTVRVCDCSTPSECRMKDKSTRDVRPNVILGRWAILAMVLGSVLLLCILFTC
: .::..: : .:.:. :..:: ..:: .::::.:::::..:: .::. .:.:
CCDS32 AGQAATKLLRVNLCECTHPTQCRATSRST-----GVILGKWAILAILLGIALLFSVLLTL
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB7 FCVTAKRTVKKCFPEDIAQQNLIVSNTEGPGEE-VTEANIRLPMQTSNICDTSMSVGTVG
: . : : ::::.::::::.::::.::.. : :: . ::.: ..:.. .
CCDS32 VCGVFGATKGKRFPEDLAQQNLIISNTEAPGDDRVCSANGFMT-QTTN--NSSQGFCGTM
720 730 740 750 760
780 790 800 810 820
pF1KB7 GQGIKT--QQSFEMVKGG-YTLDSNKGGGHQ-TLESVKGVGQG--DTGRYAYTDWQSFTQ
:.:.:. :...::.::: ::.: .:.::. ::.: .: :. :. ::.:..:.::::
CCDS32 GSGMKNGGQETIEMMKGGNQTLESCRGAGHHHTLDSCRG-GHTEVDNCRYTYSEWHSFTQ
770 780 790 800 810 820
830 840 850 860 870 880
pF1KB7 PRLGEKVYLCGQDEEHKHCEDYVCSYNYEGKGSLAGSVGCCSDRQEEEGLEFLDHLEPKF
::::::.. :.:.:.. .::: .:::::.:: ::::::::..:::.::.::..:::::
CCDS32 PRLGEKLHRCNQNEDRMPSQDYVLTYNYEGRGSPAGSVGCCSEKQEEDGLDFLNNLEPKF
830 840 850 860 870 880
890
pF1KB7 RTLAKTCIKK
:::..: :.
CCDS32 ITLAEACTKR
890
>>CCDS11893.1 DSC2 gene_id:1824|Hs108|chr18 (847 aa)
initn: 2317 init1: 1469 opt: 2830 Z-score: 3271.6 bits: 616.5 E(32554): 6.6e-176
Smith-Waterman score: 2830; 52.9% identity (77.9% similar) in 843 aa overlap (2-830:4-837)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MALASAAPGSIFCKQLLFSLLVLTLLCDACQKVYLRVPSHLQAETLVGKVNLEECLKS
: :.. .. .:. ::..: .: . :::..: :.:::.:.:: :::.:::.::. .
CCDS11 MEAARPSGSWNGALCRLLLLTLAILIFASDACKNVTLHVPSKLDAEKLVGRVNLKECFTA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 ASLIRSSDPAFRILEDGSIYTTHDLILSSERKSFSIFLSDGQRREQQEIKVVLSARENKS
:.::.:::: :.::::::.:::. ..::::..::.:.::. . .:...: : : ...:
CCDS11 ANLIHSSDPDFQILEDGSVYTTNTILLSSEKRSFTILLSNTENQEKKKIFVFLE-HQTKV
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 PKKRHTKDTALKRSKRRWAPIPASLMENSLGPFPQHVQQIQSDAAQNYTIFYSISGPGVD
::::::. .:.:.:::::::: :..:::::::: .::.:::.::::::.::: :::::
CCDS11 LKKRHTKEKVLRRAKRRWAPIPCSMLENSLGPFPLFLQQVQSDTAQNYTIYYSIRGPGVD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 KEPFNLFYIEKDTGDIFCTRSIDREKYEQFALYGYATTADGYAPEYPLPLIIKIEDDNDN
.:: ::::.:.:::...::: .:::.::.: . ..::: :::.:: ::::::::::.:::
CCDS11 QEPRNLFYVERDTGNLYCTRPVDREQYESFEIIAFATTPDGYTPELPLPLIIKIEDENDN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 APYFEHRVTIFTVPENCRSGTSVGKVTATDLDEPDTLHTRLKYKILQQIPDHPKHFSIHP
: : ... ::. :::: ::.::.: ::: :::::.::::::.:. :.: : ::.::
CCDS11 YPIFTEETYTFTIFENCRVGTTVGQVCATDKDEPDTMHTRLKYSIIGQVPPSPTLFSMHP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 DTGVITTTTPFLDREKCDTYQLIMEVRDMGGQPFGLFNTGTITISLEDENDNPPSFTETS
:::::::. :::: : ::: ..:.:: :: ::: .:.: :...: ::. :.::.::
CCDS11 TTGVITTTSSQLDRELIDKYQLKIKVQDMDGQYFGLQTTSTCIINIDDVNDHLPTFTRTS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 YVTEVEENRIDVEILRMKVQDQDLPNTPHSKAVYKILQGNENGNFIISTDPNTNEGVLCV
::: :::: .::::::. :.:.:: :: . .: : ::.::::::: : :: .::::::::
CCDS11 YVTSVEENTVDVEILRVTVEDKDLVNTANWRANYTILKGNENGNFKIVTDAKTNEGVLCV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 VKPLNYEVNRQVILQVGVINEAQFSKAASSQTPTMCTTTVTVKIIDSDEGPECHPPVKVI
::::::: ..:.:::.::.::: ::. :: .. .: :.::::.. :.::::::.::....
CCDS11 VKPLNYEEKQQMILQIGVVNEAPFSREASPRS-AMSTATVTVNVEDQDEGPECNPPIQTV
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 QSQDGFPAGQELLGYKALDPEISSGEGLRYQKLGDEDNWFEINQHTGDLRTLKVLDRESK
. ... .: :::: ::: :. :.::.:: : .: :...::...... ::::..
CCDS11 RMKENAEVGTTSNGYKAYDPETRSSSGIRYKKLTDPTGWVTIDENTGSIKVFRSLDREAE
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 FVKNNQYNISVVAVDAVGRSCTGTLVVHLDDYNDHAPQIDKE-VTICQNNEDFAVLKPVD
.::. :::.:.: : ::.::::: . :.: ::..: : :. : ::. . . : . ::
CCDS11 TIKNGIYNITVLASDQGGRTCTGTLGIILQDVNDNSPFIPKKTVIICKPTMSSAEIVAVD
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB7 PDGPENGPPFQFFLDNSAS---KNWNIEEKDGKTAILRQRQNLDYNYYSVPIQIKDRHGL
:: : .::::.: :..:.: . : .. . .: : ... .. : ::: ..:: :.
CCDS11 PDEPIHGPPFDFSLESSTSEVQRMWRLKAINDTAARLSYQNDPPFGSYVVPITVRDRLGM
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB7 VATHMLTVRVCDCSTPSECRMKDKSTRDVRPNVILGRWAILAMVLGSVLLLCILFTCFCV
.. : : .::: : ..: . . : .: ::.:::::..:: .::.::::: :
CCDS11 SSVTSLDVTLCDCITENDCTHR-VDPRIGGGGVQLGKWAILAILLGIALLFCILFTLVC-
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB7 TAKRTVK--KCFPEDIAQQNLIVSNTEGPGEE-VTEANIRLPMQTSNICDTSMSV-GTVG
:. : : : .:.:.:::::::::::.::.. : :: . :... ....: ::::
CCDS11 GASGTSKQPKVIPDDLAQQNLIVSNTEAPGDDKVYSAN---GFTTQTVGASAQGVCGTVG
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820
pF1KB7 GQGIKT--QQSFEMVKGGY-TLDSNKGGGHQ-TLESVKGVGQG--DTGRYAYTDWQSFTQ
. :::. :...::::::. : .: .:.::. ::.: .: :. :. ::.:..:.::::
CCDS11 S-GIKNGGQETIEMVKGGHQTSESCRGAGHHHTLDSCRG-GHTEVDNCRYTYSEWHSFTQ
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KB7 PRLGEKVYLCGQDEEHKHCEDYVCSYNYEGKGSLAGSVGCCSDRQEEEGLEFLDHLEPKF
:::::.
CCDS11 PRLGEESIRGHTLIKN
840
>>CCDS77172.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18 (875 aa)
initn: 992 init1: 457 opt: 1300 Z-score: 1499.8 bits: 288.7 E(32554): 3.2e-77
Smith-Waterman score: 1511; 33.9% identity (60.6% similar) in 888 aa overlap (42-888:18-867)
20 30 40 50 60
pF1KB7 FCKQLLFSLLVLTLLCDACQKVYLRVPSHLQAETLVG-KVNLEECL-KSASLIRSSDPA-
::: : .:.. .: : .::.::
CCDS77 MFLLRRYVCIFTEKLKNQAELYVFLSVKFSNCNGKRKVQYESSEPAD
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB7 FRILEDGSIYTTHDLILSSERKSFSIFLSDGQRREQQEIKVVLSARENKS----------
:.. ::: .:..... ::::. .: :. .: . .:. .. : :: . . .
CCDS77 FKVDEDGMVYAVRSFPLSSEHAKFLIYAQDKETQEKWQVAVKLSLKPTLTEESVKESAEV
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 -----PKKRHTKDTALKRSKRRWAPIPASLMENSLGPFPQHVQQIQSDAAQNYTIFYSIS
:.. .. :.:.:: :. : .: ::: :::::.. .:.:: .: .. ::..
CCDS77 EEIVFPRQFSKHSGHLQRQKRDWVIPPINLPENSRGPFPQELVRIRSDRDKNLSLRYSVT
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 GPGVDKEPFNLFYIEKDTGDIFCTRSIDREKYEQFALYGYATTADGYAPEYPLPLIIKIE
:::.:. : ..: :. .:.. :. .:::. .: : ..:. .: : :. ..:..
CCDS77 GPGADQPPTGIFIINPISGQLSVTKPLDREQIARFHLRAHAVDINGNQVENPIDIVINVI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 DDNDNAPYFEHRVTIFTVPENCRSGTSVGKVTATDLDEPDTLHTRLKYKILQQIPD--HP
: ::: : : :.: ::::. . :: : ::: : :.:..:. :.:.:..: :. :
CCDS77 DMNDNRPEFLHQVWNGTVPEGSKPGTYVMTVTAIDADDPNALNGMLRYRIVSQAPSTPSP
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 KHFSIHPDTGVITTTTPFLDREKCDTYQLIMEVRDMGGQP-FGLFNTGTITISLEDENDN
. :.:. .:: : :.. ::::: . : ::... :: :.: .:: ::.: .:.. : :::
CCDS77 NMFTINNETGDIITVAAGLDREKVQQYTLIIQATDMEGNPTYGLSNTATAVITVTDVNDN
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 PPSFTETSYVTEVEENRIDVEILRMKVQDQDLPNTPHSKAVYKILQGNENGNFIISTDPN
:: :: .. :: :::.:. . . : :.: :.:: .:::.: :. .: : :.::::
CCDS77 PPEFTAMTFYGEVPENRVDIIVANLTVTDKDQPHTPAWNAVYRISGGDPTGRFAIQTDPN
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 TNEGVLCVVKPLNYEVNRQVILQVGVINEAQFSKAASSQTPTMCTTTVTVKIIDSDEGPE
.:.:.. ::::...:.::. .: :.. :.. ..:. : : . :.::.: .:: .:.:
CCDS77 SNDGLVTVVKPIDFETNRMFVLTVAAENQVPLAKGI--QHPPQSTATVSVTVIDVNENPY
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 CHPPVKVIQSQDGFPAGQELLGYKALDPEISSGEGLRYQKLGDEDNWFEINQHTGDLRTL
: :.:....:. :: : . : ::. ...:: ::.: ::..:. .:.. :.
CCDS77 FAPNPKIIRQEEGLHAGTMLTTFTAQDPDRYMQQNIRYTKLSDPANWLKIDPVNGQITTI
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580
pF1KB7 KVLDRESKFVKNNQYNISVVAVDA--VGRSCTGTLVVHLDDYNDHAPQI-DKEVTICQNN
:::::: :::: :: . .: : : :::: ..: : ::.:::. .:. :..
CCDS77 AVLDRESPNVKNNIYNATFLASDNGIPPMSGTGTLQIYLLDINDNAPQVLPQEAETCETP
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KB7 EDFAV-LKPVDPDGPENGPPFQFFLDNSA---SKNWNIEEKDGKTAILRQR-QNLDYNYY
. .. . .: : :. :: : : : ..::.: . .: : : . . :. . :
CCDS77 DPNSINITALDYDIDPNAGPFAFDLPLSPVTIKRNWTITRLNGDFAQLNLKIKFLEAGIY
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KB7 SVPIQIKDRHGLVATHM--LTVRVCDCSTPSECRMKDKSTRDVRPNVILGRWAILAMVLG
::: : : . ... : :.::.:.. ..: :. . .. :: ::.:..:
CCDS77 EVPIIITDSGNPPKSNISILRVKVCQCDSNGDCTDVDRIV-----GAGLGTGAIIAILL-
650 660 670 680 690
710 720 730 740 750
pF1KB7 SVLLLCILFTCFCVTAKRT-----VKKCF--PEDIAQQNLIVSNTEGPGEEVTEANIRLP
...: :: : : :: .:. . ::: ...:.. . :: ::: . ..
CCDS77 CIIILLILVLMFVVWMKRRDKERQAKQLLIDPEDDVRDNILKYDEEGGGEEDQDYDLSQL
700 710 720 730 740 750
760 770 780 790 800 810
pF1KB7 MQTSNICDTSMSVGTVGGQGIKTQQSFEM-VKGGYTLDSNKGGGHQTLESVKGVGQGDTG
.: ... . . ::. .. . .. : . : .. : :: :
CCDS77 QQPDTVEPDA-----IKPVGIRRMDERPIHAEPQYPVRS--AAPHP----------GDIG
760 770 780 790 800
820 830 840 850 860 870
pF1KB7 RYAYTDWQSFTQPRLGEKVYLCGQDEEHKHCEDYVCSYNYEGKGSLAGSVGC--CSDRQE
. ..: . .: : . ..:::.:: :::.. :.
CCDS77 DF------------INEGLKAADNDPTAPP-YDSLLVFDYEGSGSTAGSLSSLNSSSSGG
810 820 830 840
880 890
pF1KB7 EEGLEFLDHLEPKFRTLAKTCIKK
:. ..:. :.:. ::
CCDS77 EQDYDYLNDWGPRFKKLADMYGGGDD
850 860 870
>>CCDS11891.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18 (906 aa)
initn: 992 init1: 457 opt: 1300 Z-score: 1499.6 bits: 288.7 E(32554): 3.3e-77
Smith-Waterman score: 1506; 33.8% identity (60.6% similar) in 879 aa overlap (50-888:58-898)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 LLVLTLLCDACQKVYLRVPSHLQAETLVGKVNLEECL-KSASLIRSSDPA-FRILEDGSI
:.. .: : .::.:: :.. ::: .
CCDS11 EIALCKTGFPEDVYSAVLSKDVHEGQPLLNVKFSNCNGKRKVQYESSEPADFKVDEDGMV
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120
pF1KB7 YTTHDLILSSERKSFSIFLSDGQRREQQEIKVVLSARENKS---------------PKKR
:..... ::::. .: :. .: . .:. .. : :: . . . :..
CCDS11 YAVRSFPLSSEHAKFLIYAQDKETQEKWQVAVKLSLKPTLTEESVKESAEVEEIVFPRQF
90 100 110 120 130 140
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 HTKDTALKRSKRRWAPIPASLMENSLGPFPQHVQQIQSDAAQNYTIFYSISGPGVDKEPF
.. :.:.:: :. : .: ::: :::::.. .:.:: .: .. ::..:::.:. :
CCDS11 SKHSGHLQRQKRDWVIPPINLPENSRGPFPQELVRIRSDRDKNLSLRYSVTGPGADQPPT
150 160 170 180 190 200
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 NLFYIEKDTGDIFCTRSIDREKYEQFALYGYATTADGYAPEYPLPLIIKIEDDNDNAPYF
..: :. .:.. :. .:::. .: : ..:. .: : :. ..:.. : ::: : :
CCDS11 GIFIINPISGQLSVTKPLDREQIARFHLRAHAVDINGNQVENPIDIVINVIDMNDNRPEF
210 220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 EHRVTIFTVPENCRSGTSVGKVTATDLDEPDTLHTRLKYKILQQIPD--HPKHFSIHPDT
:.: ::::. . :: : ::: : :.:..:. :.:.:..: :. :. :.:. .:
CCDS11 LHQVWNGTVPEGSKPGTYVMTVTAIDADDPNALNGMLRYRIVSQAPSTPSPNMFTINNET
270 280 290 300 310 320
310 320 330 340 350
pF1KB7 GVITTTTPFLDREKCDTYQLIMEVRDMGGQP-FGLFNTGTITISLEDENDNPPSFTETSY
: : :.. ::::: . : ::... :: :.: .:: ::.: .:.. : ::::: :: ..
CCDS11 GDIITVAAGLDREKVQQYTLIIQATDMEGNPTYGLSNTATAVITVTDVNDNPPEFTAMTF
330 340 350 360 370 380
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 VTEVEENRIDVEILRMKVQDQDLPNTPHSKAVYKILQGNENGNFIISTDPNTNEGVLCVV
:: :::.:. . . : :.: :.:: .:::.: :. .: : :.::::.:.:.. ::
CCDS11 YGEVPENRVDIIVANLTVTDKDQPHTPAWNAVYRISGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVV
390 400 410 420 430 440
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 KPLNYEVNRQVILQVGVINEAQFSKAASSQTPTMCTTTVTVKIIDSDEGPECHPPVKVIQ
::...:.::. .: :.. :.. ..:. : : . :.::.: .:: .:.: : :.:.
CCDS11 KPIDFETNRMFVLTVAAENQVPLAKGI--QHPPQSTATVSVTVIDVNENPYFAPNPKIIR
450 460 470 480 490 500
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 SQDGFPAGQELLGYKALDPEISSGEGLRYQKLGDEDNWFEINQHTGDLRTLKVLDRESKF
...:. :: : . : ::. ...:: ::.: ::..:. .:.. :. ::::::
CCDS11 QEEGLHAGTMLTTFTAQDPDRYMQQNIRYTKLSDPANWLKIDPVNGQITTIAVLDRESPN
510 520 530 540 550 560
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 VKNNQYNISVVAVDA--VGRSCTGTLVVHLDDYNDHAPQI-DKEVTICQNNEDFAV-LKP
:::: :: . .: : : :::: ..: : ::.:::. .:. :.. . .. .
CCDS11 VKNNIYNATFLASDNGIPPMSGTGTLQIYLLDINDNAPQVLPQEAETCETPDPNSINITA
570 580 590 600 610 620
600 610 620 630 640 650
pF1KB7 VDPDGPENGPPFQFFLDNSA---SKNWNIEEKDGKTAILRQR-QNLDYNYYSVPIQIKDR
.: : :. :: : : : ..::.: . .: : : . . :. . : ::: : :
CCDS11 LDYDIDPNAGPFAFDLPLSPVTIKRNWTITRLNGDFAQLNLKIKFLEAGIYEVPIIITDS
630 640 650 660 670 680
660 670 680 690 700
pF1KB7 HGLVATHM--LTVRVCDCSTPSECRMKDKSTRDVRPNVILGRWAILAMVLGSVLLLCILF
. ... : :.::.:.. ..: :. . .. :: ::.:..: ...: ::
CCDS11 GNPPKSNISILRVKVCQCDSNGDCTDVDRIV-----GAGLGTGAIIAILL-CIIILLILV
690 700 710 720 730
710 720 730 740 750 760
pF1KB7 TCFCVTAKRT-----VKKCF--PEDIAQQNLIVSNTEGPGEEVTEANIRLPMQTSNICDT
: : :: .:. . ::: ...:.. . :: ::: . .. .: ...
CCDS11 LMFVVWMKRRDKERQAKQLLIDPEDDVRDNILKYDEEGGGEEDQDYDLSQLQQPDTVEPD
740 750 760 770 780 790
770 780 790 800 810 820
pF1KB7 SMSVGTVGGQGIKTQQSFEM-VKGGYTLDSNKGGGHQTLESVKGVGQGDTGRYAYTDWQS
. . ::. .. . .. : . : .. : :: : .
CCDS11 A-----IKPVGIRRMDERPIHAEPQYPVRS--AAPHP----------GDIGDF-------
800 810 820 830
830 840 850 860 870
pF1KB7 FTQPRLGEKVYLCGQDEEHKHCEDYVCSYNYEGKGSLAGSVGC--CSDRQEEEGLEFLDH
..: . .: : . ..:::.:: :::.. :. :. ..:.
CCDS11 -----INEGLKAADNDPTAPP-YDSLLVFDYEGSGSTAGSLSSLNSSSSGGEQDYDYLND
840 850 860 870 880
880 890
pF1KB7 LEPKFRTLAKTCIKK
:.:. ::
CCDS11 WGPRFKKLADMYGGGDD
890 900
>>CCDS10869.1 CDH1 gene_id:999|Hs108|chr16 (882 aa)
initn: 574 init1: 412 opt: 1266 Z-score: 1460.4 bits: 281.4 E(32554): 5e-75
Smith-Waterman score: 1332; 33.6% identity (62.0% similar) in 777 aa overlap (8-744:3-763)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MALASAAPGSIFCKQLLFSLLVLTLLC---DACQKVY------LRVPS-HLQAETLVGKV
: : . ::. : : . :: . :. . . :: ::. ..:.:
CCDS10 MGPWSRSLSALLLLLQVSSWLCQEPEPCHPGFDAESYTFTVPRRHLERGRVLGRV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KB7 NLEECL-KSASLIRSSDPAFRILEDGSIYTTHDLILSSERKSFSIFLSDGQRREQQEIKV
:.:.: .. . : : :.. :: : . . : . . . : .. :. : . ::
CCDS10 NFEDCTGRQRTAYFSLDTRFKVGTDGVITVKRPLRFHNPQIHFLVYAWDSTYR-KFSTKV
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KB7 VLSA--RENKSPKKRHT-------------KDTALKRSKRRWAPIPASLMENSLGPFPQH
.:.. .... : .. . .. .:.:.:: :. : : :: ::::..
CCDS10 TLNTVGHHHRPPPHQASVSGIQAELLTFPNSSPGLRRQKRDWVIPPISCPENEKGPFPKN
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 VQQIQSDAAQNYTIFYSISGPGVDKEPFNLFYIEKDTGDIFCTRSIDREKYEQFALYGYA
. ::.:. .. .::::.: :.: : ..: ::..:: . :. .:::. ..:...:
CCDS10 LVQIKSNKDKEGKVFYSITGQGADTPPVGVFIIERETGWLKVTEPLDRERIATYTLFSHA
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 TTADGYAPEYPLPLIIKIEDDNDNAPYFEHRVTIFTVPENCRSGTSVGKVTATDLDEP-D
....: : : :. ..: . :.::: : : ..: .: :. :::: .::::: :. .
CCDS10 VSSNGNAVEDPMEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGTSVMEVTATDADDDVN
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 TLHTRLKYKILQQIPDHPKH--FSIHPDTGVITTTTPFLDREKCDTYQLIMEVRDMGGQP
: .. . : ::.: :. : . :.:. .::::...: ::::. :: :.... :. :.
CCDS10 TYNAAIAYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDRESFPTYTLVVQAADLQGE-
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 FGLFNTGTITISLEDENDNPPSFTETSYVTEVEENRIDVEILRMKVQDQDLPNTPHSKAV
:: .:.: .:.. : ::::: :. :.: .: ::. .: : .:: : : :::: .::
CCDS10 -GLSTTATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITTLKVTDADAPNTPAWEAV
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 YKILQGNENGNFIISTDPNTNEGVLCVVKPLNYEVNRQVILQVGVINEAQFSKAASSQTP
: ::. ...:.:...:.: .:.:.: ..: :..:...: ::.:.: : . : . ...:
CCDS10 YTILN-DDGGQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHVAVTNVVPFEVSLTTST-
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 TMCTTTVTVKIIDSDEGPECHPPVKVIQSQDGFPAGQELLGYKALDPEISSGEGLRYQKL
.:::: ..: .:.: :: : .. .. : .:::. .: : .:. . . :.
CCDS10 ----ATVTVDVLDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPDTFMEQKITYRIW
480 490 500 510 520
520 530 540 550 560
pF1KB7 GDEDNWFEINQHTGDLRTLKVLDRES-KFVKNNQYNISVVAVDAVG--RSCTGTLVVHLD
: ::.::: :: . : ::::. . :::. :. ..:.: . . ::::.. :.
CCDS10 RDTANWLEINPDTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLLLILS
530 540 550 560 570 580
570 580 590 600 610 620
pF1KB7 DYNDHAPQID-KEVTICQNNEDFAVLKPVDPDGPENGPPFQFFLDNSASKNWNIEEKDG-
: ::.:: . . . .:. : :.. .: : : : :: : ..:: ::.:. .:
CCDS10 DVNDNAPIPEPRTIFFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGASANWTIQYNDPT
590 600 610 620 630 640
630 640 650 660 670 680
pF1KB7 -KTAILRQRQNLDYNYYSVPIQIKDRHGLVATHMLTVRVCDC-STPSECRMKDKSTRDVR
.. ::. .. :. . :.. ... : .. . : : :::: .. . :: . ..
CCDS10 QESIILKPKMALEVGDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVCRKAQPVEAGLQ
650 660 670 680 690 700
690 700 710 720 730 740
pF1KB7 PNVILGRWAILAMVLGSVLLLCILFTCFCVTAKR--TVKKCF--PEDIAQQNLIVSNTEG
.::: .::..: : ::. . . .: .::. . ::: ...:. . ::
CCDS10 IPAILG-------ILGGILALLILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYYYDEEG
710 720 730 740 750
750 760 770 780 790 800
pF1KB7 PGEEVTEANIRLPMQTSNICDTSMSVGTVGGQGIKTQQSFEMVKGGYTLDSNKGGGHQTL
:::
CCDS10 GGEEDQDFDLSQLHRGLDARPEVTRNDVAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDENLKAAD
760 770 780 790 800 810
>>CCDS58784.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20 (842 aa)
initn: 1109 init1: 414 opt: 1178 Z-score: 1358.8 bits: 262.5 E(32554): 2.3e-69
Smith-Waterman score: 1351; 32.3% identity (58.7% similar) in 869 aa overlap (69-888:3-833)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 SHLQAETLVGKVNLEECLKSASLIRSSDPAFRILEDGSIYTTHDLILSSERKSFSIFLSD
:.. ::....:..: . ::. .:.. :
CCDS58 MDFKVGADGTVFATRELQVPSEQVAFTVTAWD
10 20 30
100 110 120 130
pF1KB7 GQRREQQEIKVVLSARENKSPKKRHT----------------KDT-----------ALKR
.: :. . : : . ...::.. : ::: .:.:
CCDS58 SQTAEKWDAVVRLLVAQTSSPHSGHKPQKGKKVVALDPSPPPKDTLLPWPQHQNANGLRR
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 SKRRWAPIPASLMENSLGPFPQHVQQIQSDAAQNYTIFYSISGPGVDKEPFNLFYIEKDT
:: :. : .. ::: :::::.. .:.:: .. : :::.: :.:. :...: :.. .
CCDS58 RKRDWVIPPINVPENSRGPFPQQLVRIRSDKDNDIPIRYSITGVGADQPPMEVFSIDSMS
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 GDIFCTRSIDREKYEQFALYGYATTADGYAPEYPLPLIIKIEDDNDNAPYFEHRVTIFTV
: .. :: .:::.. .. : ..:. .: : :. : : . : ::: : : ..: .:
CCDS58 GRMYVTRPMDREEHASYHLRAHAVDMNGNKVENPIDLYIYVIDMNDNRPEFINQVYNGSV
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300
pF1KB7 PENCRSGTSVGKVTATDLDEPDTLHTRLKYKILQQIPDHPKH--FSIHPDTGVITTTTPF
:. . :: : :::.: :. : . ..:.:. : :. :.. :.:. .:: :.:..
CCDS58 DEGSKPGTYVMTVTANDADDSTTANGMVRYRIVTQTPQSPSQNMFTINSETGDIVTVAAG
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LDREKCDTYQLIMEVRDM-GGQPFGLFNTGTITISLEDENDNPPSFTETSYVTEVEENRI
::::: . : .:... :: :. .:: ::.: :.. : ::::: :: .... :: :::.
CCDS58 LDREKVQQYTVIVQATDMEGNLNYGLSNTATAIITVTDVNDNPPEFTASTFAGEVPENRV
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 DVEILRMKVQDQDLPNTPHSKAVYKILQGNENGNFIISTDPNTNEGVLCVVKPLNYEVNR
.. . . :.:.: :..:. .:::.:..:. .:.: . ::: ::::.. ::: ..::.::
CCDS58 ETVVANLTVMDRDQPHSPNWNAVYRIISGDPSGHFSVRTDPVTNEGMVTVVKAVDYELNR
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 QVILQVGVINEAQFSKAASSQTPTMCTTTVTVKIIDSDEGPECHPPVKVIQSQDGFPAGQ
.: : : :.: . :.. : . :. ::..:.: .:.: :.:. ..: : :
CCDS58 AFMLTVMVSNQAPL--ASGIQMSFQSTAGVTISIMDINEAPYFPSNHKLIRLEEGVPPGT
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 ELLGYKALDPEISSGEGLRYQKLGDEDNWFEINQHTGDLRTLKVLDRESKFVKNNQYNIS
: ..:.::. ...::.::.: .:..:: .:.. : :::::: ..::: :. .
CCDS58 VLTTFSAVDPDRFMQQAVRYSKLSDPASWLHINATNGQITTAAVLDRESLYTKNNVYEAT
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 VVAVDA--VGRSCTGTLVVHLDDYNDHAPQI-DKEVTICQNNEDFAV-LKPVDPDGPENG
.:.: : :::: ..: : ::.::.. ::. ::.. . :. . .: : :
CCDS58 FLAADNGIPPASGTGTLQIYLIDINDNAPELLPKEAQICEKPNLNAINITAADADVDPNI
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650
pF1KB7 PPFQF---FLDNSASKNWNIEEKDGKTAILRQR-QNLDYNYYSVPIQIKDRHG--LVATH
:. : :. .. :::.: . .: : : : :. ..:.::: . : . : :
CCDS58 GPYVFELPFVPAAVRKNWTITRLNGDYAQLSLRILYLEAGMYDVPIIVTDSGNPPLSNTS
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KB7 MLTVRVCDCSTPSECRMKDKSTRDVRPNVILGRWAILAMVLGSVLLLCILFTCFCVTAKR
.. :.:: :. ..: .: . . :: ::.: .: .:.: . : . ::
CCDS58 IIKVKVCPCDDNGDC-----TTIGAVAAAGLGTGAIVA-ILICILILLTMVLLFVMWMKR
640 650 660 670 680
720 730 740 750 760 770
pF1KB7 TVKKCF-------PEDIAQQNLIVSNTEGPGEEVTEANIRLPMQTSNICDTSMSVGTVGG
:. ::: ...:.. . :: ::: . .. .: ..: : .
CCDS58 REKERHTKQLLIDPEDDVRDNILKYDEEGGGEEDQDYDLSQLQQPE-------AMGHVPS
690 700 710 720 730
780 790 800 810 820 830
pF1KB7 QGIKTQQSFEMVKGGYTLDSNKGGGHQTLESVKGVGQ-GDTGRYAYTDWQSFTQPRLGEK
.. : .: :.. : . :: : . ..:
CCDS58 KA----------PGVRRVDERPVGAEPQYPIRPMVPHPGDIGDF------------INEG
740 750 760 770
840 850 860 870 880
pF1KB7 VYLCGQDEEHKHCEDYVCSYNYEGKGSLAGSVGCC-SDRQEEEGLEFLDHLEPKFRTLAK
. .: : . ..:::.:: ::::. :. . .. ..:. :.:. ::
CCDS58 LRAADNDPTAPP-YDSLLVFDYEGSGSTAGSVSSLNSSSSGDQDYDYLNDWGPRFKKLAD
780 790 800 810 820 830
890
pF1KB7 TCIKK
CCDS58 MYGGGEED
840
>>CCDS13488.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20 (916 aa)
initn: 1109 init1: 414 opt: 1178 Z-score: 1358.3 bits: 262.6 E(32554): 2.5e-69
Smith-Waterman score: 1362; 31.7% identity (59.0% similar) in 898 aa overlap (41-888:49-907)
20 30 40 50 60
pF1KB7 IFCKQLLFSLLVLTLLCDACQKVYLRVPSHLQAETLVGKVNLEECLKS-ASLIRSSDPAF
:..: :. .:.. :. . .. .... :
CCDS13 RAHNEDLTTRETCKAGFSEDDYTALISQNILEGEKLL-QVKFSSCVGTKGTQYETNSMDF
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 RILEDGSIYTTHDLILSSERKSFSIFLSDGQRREQQEIKVVLSARENKSPKKRHT-----
.. ::....:..: . ::. .:.. :.: :. . : : . ...::.. :
CCDS13 KVGADGTVFATRELQVPSEQVAFTVTAWDSQTAEKWDAVVRLLVAQTSSPHSGHKPQKGK
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160
pF1KB7 -----------KDT-----------ALKRSKRRWAPIPASLMENSLGPFPQHVQQIQSDA
::: .:.: :: :. : .. ::: :::::.. .:.::
CCDS13 KVVALDPSPPPKDTLLPWPQHQNANGLRRRKRDWVIPPINVPENSRGPFPQQLVRIRSDK
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 AQNYTIFYSISGPGVDKEPFNLFYIEKDTGDIFCTRSIDREKYEQFALYGYATTADGYAP
.. : :::.: :.:. :...: :.. .: .. :: .:::.. .. : ..:. .:
CCDS13 DNDIPIRYSITGVGADQPPMEVFSIDSMSGRMYVTRPMDREEHASYHLRAHAVDMNGNKV
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 EYPLPLIIKIEDDNDNAPYFEHRVTIFTVPENCRSGTSVGKVTATDLDEPDTLHTRLKYK
: :. : : . : ::: : : ..: .: :. . :: : :::.: :. : . ..:.
CCDS13 ENPIDLYIYVIDMNDNRPEFINQVYNGSVDEGSKPGTYVMTVTANDADDSTTANGMVRYR
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330
pF1KB7 ILQQIPDHPKH--FSIHPDTGVITTTTPFLDREKCDTYQLIMEVRDM-GGQPFGLFNTGT
:. : :. :.. :.:. .:: :.:.. ::::: . : .:... :: :. .:: ::.:
CCDS13 IVTQTPQSPSQNMFTINSETGDIVTVAAGLDREKVQQYTVIVQATDMEGNLNYGLSNTAT
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 ITISLEDENDNPPSFTETSYVTEVEENRIDVEILRMKVQDQDLPNTPHSKAVYKILQGNE
:.. : ::::: :: .... :: :::... . . :.:.: :..:. .:::.:..:.
CCDS13 AIITVTDVNDNPPEFTASTFAGEVPENRVETVVANLTVMDRDQPHSPNWNAVYRIISGDP
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 NGNFIISTDPNTNEGVLCVVKPLNYEVNRQVILQVGVINEAQFSKAASSQTPTMCTTTVT
.:.: . ::: ::::.. ::: ..::.:: .: : : :.: . :.. : . :. ::
CCDS13 SGHFSVRTDPVTNEGMVTVVKAVDYELNRAFMLTVMVSNQAPL--ASGIQMSFQSTAGVT
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 VKIIDSDEGPECHPPVKVIQSQDGFPAGQELLGYKALDPEISSGEGLRYQKLGDEDNWFE
..:.: .:.: :.:. ..: : : : ..:.::. ...::.::.: .:..
CCDS13 ISIMDINEAPYFPSNHKLIRLEEGVPPGTVLTTFSAVDPDRFMQQAVRYSKLSDPASWLH
500 510 520 530 540 550
520 530 540 550 560 570
pF1KB7 INQHTGDLRTLKVLDRESKFVKNNQYNISVVAVDA--VGRSCTGTLVVHLDDYNDHAPQI
:: .:.. : :::::: ..::: :. . .:.: : :::: ..: : ::.::..
CCDS13 INATNGQITTAAVLDRESLYTKNNVYEATFLAADNGIPPASGTGTLQIYLIDINDNAPEL
560 570 580 590 600 610
580 590 600 610 620 630
pF1KB7 -DKEVTICQNNEDFAV-LKPVDPDGPENGPPFQF---FLDNSASKNWNIEEKDGKTAILR
::. ::.. . :. . .: : : :. : :. .. :::.: . .: : :
CCDS13 LPKEAQICEKPNLNAINITAADADVDPNIGPYVFELPFVPAAVRKNWTITRLNGDYAQLS
620 630 640 650 660 670
640 650 660 670 680
pF1KB7 QR-QNLDYNYYSVPIQIKDRHG--LVATHMLTVRVCDCSTPSECRMKDKSTRDVRPNVIL
: :. ..:.::: . : . : : .. :.:: :. ..: .: . . :
CCDS13 LRILYLEAGMYDVPIIVTDSGNPPLSNTSIIKVKVCPCDDNGDC-----TTIGAVAAAGL
680 690 700 710 720 730
690 700 710 720 730 740
pF1KB7 GRWAILAMVLGSVLLLCILFTCFCVTAKRTVKKCF-------PEDIAQQNLIVSNTEGPG
: ::.:... .:.: . : . :: :. ::: ...:.. . :: :
CCDS13 GTGAIVAILI-CILILLTMVLLFVMWMKRREKERHTKQLLIDPEDDVRDNILKYDEEGGG
740 750 760 770 780
750 760 770 780 790 800
pF1KB7 EEVTEANIRLPMQTSNICDTSMSVGTVGGQGIKTQQSFEMVKGGYTLDSNKGGGHQTLES
:: . .. .: ..: : .. . : .: :..
CCDS13 EEDQDYDLSQLQQPE-------AMGHVPSK----------APGVRRVDERPVGAEPQYPI
790 800 810 820 830
810 820 830 840 850 860
pF1KB7 VKGVGQ-GDTGRYAYTDWQSFTQPRLGEKVYLCGQDEEHKHCEDYVCSYNYEGKGSLAGS
: . :: : . ..: . .: : . ..:::.:: :::
CCDS13 RPMVPHPGDIGDF------------INEGLRAADNDPTAPP-YDSLLVFDYEGSGSTAGS
840 850 860 870
870 880 890
pF1KB7 VGCC-SDRQEEEGLEFLDHLEPKFRTLAKTCIKK
:. :. . .. ..:. :.:. ::
CCDS13 VSSLNSSSSGDQDYDYLNDWGPRFKKLADMYGGGEED
880 890 900 910
894 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 08:51:43 2016 done: Sat Nov 5 08:51:44 2016
Total Scan time: 4.250 Total Display time: 0.380
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]