FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7339, 833 aa
1>>>pF1KB7339 833 - 833 aa - 833 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.7567+/-0.00115; mu= -12.7066+/- 0.069
mean_var=474.9348+/-100.279, 0's: 0 Z-trim(115.1): 559 B-trim: 244 in 1/51
Lambda= 0.058851
statistics sampled from 14993 (15632) to 14993 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.777), E-opt: 0.2 (0.48), width: 16
Scan time: 4.720
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS59385.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19 ( 833) 5690 498.2 2.4e-140
CCDS42564.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19 ( 821) 5465 479.1 1.3e-134
CCDS8082.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11 ( 820) 1765 164.9 5e-40
CCDS1803.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 ( 894) 1427 136.3 2.3e-31
CCDS58707.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 ( 873) 1423 135.9 2.9e-31
CCDS81582.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11 ( 812) 1333 128.3 5.4e-29
CCDS13341.1 STK4 gene_id:6789|Hs108|chr20 ( 487) 861 88.0 4.3e-17
CCDS14631.1 STK26 gene_id:51765|Hs108|chrX ( 416) 836 85.8 1.7e-16
CCDS2549.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2 ( 426) 836 85.8 1.7e-16
CCDS47900.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 491) 828 85.2 3e-16
CCDS32001.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 431) 826 85.0 3.1e-16
CCDS9488.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 443) 826 85.0 3.1e-16
CCDS59108.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 519) 828 85.2 3.1e-16
CCDS54673.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1268) 838 86.4 3.4e-16
CCDS54674.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1276) 838 86.4 3.4e-16
CCDS54677.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1297) 838 86.4 3.4e-16
CCDS54678.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1305) 838 86.4 3.5e-16
CCDS54675.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1323) 838 86.4 3.5e-16
CCDS54676.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1331) 838 86.4 3.5e-16
CCDS54679.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1352) 838 86.4 3.6e-16
CCDS46956.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1360) 838 86.4 3.6e-16
CCDS45589.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17 (1303) 837 86.3 3.7e-16
CCDS45590.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17 (1312) 837 86.3 3.7e-16
CCDS45588.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17 (1332) 837 86.3 3.7e-16
CCDS34290.1 STK10 gene_id:6793|Hs108|chr5 ( 968) 829 85.5 4.7e-16
CCDS82487.1 MAP4K4 gene_id:9448|Hs108|chr2 (1165) 805 83.6 2.2e-15
CCDS56130.1 MAP4K4 gene_id:9448|Hs108|chr2 (1239) 805 83.6 2.3e-15
CCDS74546.1 MAP4K4 gene_id:9448|Hs108|chr2 (1273) 805 83.6 2.4e-15
CCDS76334.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10 (1204) 746 78.6 7.3e-14
CCDS7553.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10 (1235) 746 78.6 7.5e-14
CCDS8250.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11 ( 545) 688 73.4 1.2e-12
CCDS10662.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1049) 694 74.1 1.4e-12
CCDS58448.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1122) 694 74.1 1.5e-12
CCDS10663.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1235) 694 74.2 1.6e-12
CCDS10054.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15 ( 681) 677 72.5 2.8e-12
CCDS56024.1 TAOK1 gene_id:57551|Hs108|chr17 ( 853) 679 72.7 2.9e-12
CCDS65305.1 NRK gene_id:203447|Hs108|chrX (1582) 685 73.5 3.3e-12
CCDS32601.1 TAOK1 gene_id:57551|Hs108|chr17 (1001) 679 72.8 3.3e-12
CCDS14554.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 544) 671 71.9 3.3e-12
CCDS48153.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 559) 671 71.9 3.4e-12
CCDS48152.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 565) 671 71.9 3.4e-12
CCDS48151.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 580) 671 71.9 3.5e-12
CCDS44687.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11 ( 553) 667 71.6 4.3e-12
CCDS33019.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19 ( 438) 658 70.7 6.1e-12
CCDS63200.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2 ( 349) 655 70.4 6.1e-12
CCDS3321.1 PAK2 gene_id:5062|Hs108|chr3 ( 524) 657 70.7 7.4e-12
CCDS12528.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19 ( 591) 658 70.8 7.6e-12
CCDS48168.1 STK26 gene_id:51765|Hs108|chrX ( 339) 645 69.5 1.1e-11
CCDS9188.1 TAOK3 gene_id:51347|Hs108|chr12 ( 898) 657 70.9 1.1e-11
CCDS63199.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2 ( 332) 626 67.9 3.2e-11
>>CCDS59385.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19 (833 aa)
initn: 5690 init1: 5690 opt: 5690 Z-score: 2633.1 bits: 498.2 E(32554): 2.4e-140
Smith-Waterman score: 5690; 100.0% identity (100.0% similar) in 833 aa overlap (1-833:1-833)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDVVDPDIFNRDPRDHYDLLQRLGGGTYGEVFKARDKVSGDLVALKMVKMEPDDDVSTLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MDVVDPDIFNRDPRDHYDLLQRLGGGTYGEVFKARDKVSGDLVALKMVKMEPDDDVSTLQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KEILILKTCRHANIVAYHGSYLWLQKLWICMEFCGAGSLQDIYQVTGSLSELQISYVCRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KEILILKTCRHANIVAYHGSYLWLQKLWICMEFCGAGSLQDIYQVTGSLSELQISYVCRE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 VLQGLAYLHSQKKIHRDIKGANILINDAGEVRLADFGISAQIGATLARRLSFIGTPYWMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VLQGLAYLHSQKKIHRDIKGANILINDAGEVRLADFGISAQIGATLARRLSFIGTPYWMA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PEVAAVALKGGYNELCDIWSLGITAIELAELQPPLFDVHPLRVLFLMTKSGYQPPRLKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PEVAAVALKGGYNELCDIWSLGITAIELAELQPPLFDVHPLRVLFLMTKSGYQPPRLKEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 GKWSAAFHNFIKVTLTKSPKKRPSATKMLSHQLVSQPGLNRGLILDLLDKLKNPGKGPSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GKWSAAFHNFIKVTLTKSPKKRPSATKMLSHQLVSQPGLNRGLILDLLDKLKNPGKGPSI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 GDIEDEEPELPPAIPRRIRSTHRSSSLGIPDADCCRRHMEFRKLRGMETRPPANTARLQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GDIEDEEPELPPAIPRRIRSTHRSSSLGIPDADCCRRHMEFRKLRGMETRPPANTARLQP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 PRDLRSSSPRKQLSESSDDDYDDVDIPTPAEDTPPPLPPKPKFRSPSDEGPGSMGDDGQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PRDLRSSSPRKQLSESSDDDYDDVDIPTPAEDTPPPLPPKPKFRSPSDEGPGSMGDDGQL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 SPGVLVRCASGPPPNSPRPGPPPSTSSPHLTAHSEPSLWNPPSRELDKPPLLPPKKEKMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SPGVLVRCASGPPPNSPRPGPPPSTSSPHLTAHSEPSLWNPPSRELDKPPLLPPKKEKMK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 RKGCALLVKLFNGCPLRIHSTAAWTHPSTKDQHLLLGAEEGIFILNRNDQEATLEMLFPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RKGCALLVKLFNGCPLRIHSTAAWTHPSTKDQHLLLGAEEGIFILNRNDQEATLEMLFPS
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550 560 570 580 590 600
pF1KB7 RTTWVYSINNVLMSLSGKTPHLYSHSILGLLERKETRAGNPIAHISPHRLLARKNMVSTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RTTWVYSINNVLMSLSGKTPHLYSHSILGLLERKETRAGNPIAHISPHRLLARKNMVSTK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 IQDTKGCRACCVAEGASSGGPFLCGALETSVVLLQWYQPMNKFLLVRQVLFPLPTPLSVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 IQDTKGCRACCVAEGASSGGPFLCGALETSVVLLQWYQPMNKFLLVRQVLFPLPTPLSVF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 ALLTGPGSELPAVCIGVSPGRPGKSVLFHTVRFGALSCWLGEMSTEHRGPVQVTQVEEDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ALLTGPGSELPAVCIGVSPGRPGKSVLFHTVRFGALSCWLGEMSTEHRGPVQVTQVEEDM
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730 740 750 760 770 780
pF1KB7 VMVLMDGSVKLVTPEGSPVRGLRTPEIPMTEAVEAVAMVGGQLQAFWKHGVQVWALGSDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VMVLMDGSVKLVTPEGSPVRGLRTPEIPMTEAVEAVAMVGGQLQAFWKHGVQVWALGSDQ
730 740 750 760 770 780
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pF1KB7 LLQELRDPTLTFRLLGSPRLECSGTISPHCNLLLPGSSNSPASASRVAGITGL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LLQELRDPTLTFRLLGSPRLECSGTISPHCNLLLPGSSNSPASASRVAGITGL
790 800 810 820 830
>>CCDS42564.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19 (821 aa)
initn: 5465 init1: 5465 opt: 5465 Z-score: 2530.0 bits: 479.1 E(32554): 1.3e-134
Smith-Waterman score: 5465; 100.0% identity (100.0% similar) in 799 aa overlap (1-799:1-799)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDVVDPDIFNRDPRDHYDLLQRLGGGTYGEVFKARDKVSGDLVALKMVKMEPDDDVSTLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB7 KEILILKTCRHANIVAYHGSYLWLQKLWICMEFCGAGSLQDIYQVTGSLSELQISYVCRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KEILILKTCRHANIVAYHGSYLWLQKLWICMEFCGAGSLQDIYQVTGSLSELQISYVCRE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 VLQGLAYLHSQKKIHRDIKGANILINDAGEVRLADFGISAQIGATLARRLSFIGTPYWMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VLQGLAYLHSQKKIHRDIKGANILINDAGEVRLADFGISAQIGATLARRLSFIGTPYWMA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PEVAAVALKGGYNELCDIWSLGITAIELAELQPPLFDVHPLRVLFLMTKSGYQPPRLKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PEVAAVALKGGYNELCDIWSLGITAIELAELQPPLFDVHPLRVLFLMTKSGYQPPRLKEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 GKWSAAFHNFIKVTLTKSPKKRPSATKMLSHQLVSQPGLNRGLILDLLDKLKNPGKGPSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GKWSAAFHNFIKVTLTKSPKKRPSATKMLSHQLVSQPGLNRGLILDLLDKLKNPGKGPSI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 GDIEDEEPELPPAIPRRIRSTHRSSSLGIPDADCCRRHMEFRKLRGMETRPPANTARLQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GDIEDEEPELPPAIPRRIRSTHRSSSLGIPDADCCRRHMEFRKLRGMETRPPANTARLQP
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pF1KB7 PRDLRSSSPRKQLSESSDDDYDDVDIPTPAEDTPPPLPPKPKFRSPSDEGPGSMGDDGQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PRDLRSSSPRKQLSESSDDDYDDVDIPTPAEDTPPPLPPKPKFRSPSDEGPGSMGDDGQL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 SPGVLVRCASGPPPNSPRPGPPPSTSSPHLTAHSEPSLWNPPSRELDKPPLLPPKKEKMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SPGVLVRCASGPPPNSPRPGPPPSTSSPHLTAHSEPSLWNPPSRELDKPPLLPPKKEKMK
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pF1KB7 RKGCALLVKLFNGCPLRIHSTAAWTHPSTKDQHLLLGAEEGIFILNRNDQEATLEMLFPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RKGCALLVKLFNGCPLRIHSTAAWTHPSTKDQHLLLGAEEGIFILNRNDQEATLEMLFPS
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pF1KB7 RTTWVYSINNVLMSLSGKTPHLYSHSILGLLERKETRAGNPIAHISPHRLLARKNMVSTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RTTWVYSINNVLMSLSGKTPHLYSHSILGLLERKETRAGNPIAHISPHRLLARKNMVSTK
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pF1KB7 IQDTKGCRACCVAEGASSGGPFLCGALETSVVLLQWYQPMNKFLLVRQVLFPLPTPLSVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IQDTKGCRACCVAEGASSGGPFLCGALETSVVLLQWYQPMNKFLLVRQVLFPLPTPLSVF
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670 680 690 700 710 720
pF1KB7 ALLTGPGSELPAVCIGVSPGRPGKSVLFHTVRFGALSCWLGEMSTEHRGPVQVTQVEEDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ALLTGPGSELPAVCIGVSPGRPGKSVLFHTVRFGALSCWLGEMSTEHRGPVQVTQVEEDM
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 VMVLMDGSVKLVTPEGSPVRGLRTPEIPMTEAVEAVAMVGGQLQAFWKHGVQVWALGSDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VMVLMDGSVKLVTPEGSPVRGLRTPEIPMTEAVEAVAMVGGQLQAFWKHGVQVWALGSDQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KB7 LLQELRDPTLTFRLLGSPRLECSGTISPHCNLLLPGSSNSPASASRVAGITGL
:::::::::::::::::::
CCDS42 LLQELRDPTLTFRLLGSPRPVVVETRPVDDPTAPSNLYIQE
790 800 810 820
>>CCDS8082.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11 (820 aa)
initn: 2019 init1: 1270 opt: 1765 Z-score: 832.2 bits: 164.9 E(32554): 5e-40
Smith-Waterman score: 2172; 44.4% identity (68.9% similar) in 850 aa overlap (7-820:6-819)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDVVDPDIFNRDPRDHYDLLQRLGGGTYGEVFKARDKVSGDLVALKMVKMEPDDDVSTLQ
:. .::::...::::.:.::::.:.:::: :...:.:.:.::..: ::.:.::
CCDS80 MALLRDVSLQDPRDRFELLQRVGAGTYGDVYKARDTVTSELAAVKIVKLDPGDDISSLQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KEILILKTCRHANIVAYHGSYLWLQKLWICMEFCGAGSLQDIYQVTGSLSELQISYVCRE
.:: ::. ::: :.::: :::: ..:::::::::.::::.::..:: : : ::.:::::
CCDS80 QEITILRECRHPNVVAYIGSYLRNDRLWICMEFCGGGSLQEIYHATGPLEERQIAYVCRE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 VLQGLAYLHSQKKIHRDIKGANILINDAGEVRLADFGISAQIGATLARRLSFIGTPYWMA
.:.:: .:::: ::::::::::.:.. :.:.:::::.:... :..:.: ::::::::::
CCDS80 ALKGLHHLHSQGKIHRDIKGANLLLTLQGDVKLADFGVSGELTASVAKRRSFIGTPYWMA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PEVAAVALKGGYNELCDIWSLGITAIELAELQPPLFDVHPLRVLFLMTKSGYQPPRLKEK
:::::: :::::::::.:.::::::::.::::::: .::.:.:.::.::..:::.:..:
CCDS80 PEVAAVERKGGYNELCDVWALGITAIELGELQPPLFHLHPMRALMLMSKSSFQPPKLRDK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KB7 GKWSAAFHNFIKVTLTKSPKKRPSATKMLSHQLVSQPGLNRGLILDLLDKLKNPGKG-PS
.:. ::.:.:..:::.:::::.: :.:.: ...: : :.:. .:::: ..: : ::
CCDS80 TRWTQNFHHFLKLALTKNPKKRPTAEKLLQHPFTTQQ-LPRALLTQLLDKASDPHLGTPS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 IGDIEDEEPELPPAIPRRIRSTHRSSSLGIPDADCCRRHMEFRKLRGMETRP---PANTA
:: : : .: :.: . . .. ....: : :: : : .
CCDS80 P---EDCELETYDMFPDTIHSRGQHGPAERTPSEIQFHQVKFGAPRRKETDPLNEPWEEE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KB7 -RLQPPRDLRSS---SPRKQLSESS-----DDDYDDVDIPTPAEDT---PPPLPPKPKFR
: ..: .: : .. : : : ......: : . : : : : :
CCDS80 WTLLGKEELSGSLLQSVQEALEERSLTIRSASEFQELDSPDDTMGTIKRAPFLGPLP--T
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CCDS81 EDTLEKLISHRCSWLYCVNNVLLSLSGKSTHIWAHDLPGLFEQRRLQQQVPLSIPTNRLT
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CCDS81 QRIIPRRFALSTKIPDTKGCLQCRVVRNPYTGATFLLAALPTSLLLLQWYEPLQKFLLLK
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CCDS81 NFSSPLPSPAGMLEPLVLDGKELPQVCVGAEGPEGPGCRVLFHVLPLEA--GLTPDILIP
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pF1KB7 HRG-P---VQVTQVEEDMVMVLMDGSVKLVTPEGSPVRGLRTPEIPMTEAVEAVAMVGGQ
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CCDS81 PEGIPGSAQQVIQVDRDTILVSFERCVRIVNMQGEPTATL-APELTFDFPIETVVCLQDS
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CCDS81 HQSTY
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CCDS25 EGHGEESSSEDSDIDGEAEDGEQGPIWTFPPTIRPSPHSKLHKGTALHSSQKPAEPVKRQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]