Result of FASTA (omim) for
pF1KB7331
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7331, 994 aa
1>>>pF1KB7331 994 - 994 aa - 994 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8056+/-0.000453; mu= 2.5181+/- 0.028
mean_var=380.5605+/-78.712, 0's: 0 Z-trim(120.2): 138 B-trim: 249 in 1/57
Lambda= 0.065745
statistics sampled from 35050 (35218) to 35050 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.744), E-opt: 0.2 (0.413), width: 16
Scan time: 14.820
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_849191 (OMIM: 616666) seizure protein 6 homolog ( 994) 6902 670.0 1.7e-191
NP_001092105 (OMIM: 616666) seizure protein 6 homo ( 993) 6840 664.1 1e-189
XP_011522617 (OMIM: 616666) PREDICTED: seizure pro (1073) 6608 642.2 4.4e-183
XP_011522619 (OMIM: 616666) PREDICTED: seizure pro ( 964) 6605 641.8 5e-183
NP_001277131 (OMIM: 616666) seizure protein 6 homo ( 869) 6060 590.1 1.7e-167
NP_066938 (OMIM: 607021) seizure 6-like protein is (1024) 2893 289.8 5.1e-77
NP_001171702 (OMIM: 607021) seizure 6-like protein (1023) 2876 288.2 1.6e-76
XP_006724258 (OMIM: 607021) PREDICTED: seizure 6-l (1022) 2875 288.1 1.7e-76
NP_001230262 (OMIM: 616667) seizure 6-like protein ( 879) 2734 274.6 1.6e-72
NP_001230261 (OMIM: 616667) seizure 6-like protein ( 923) 2733 274.6 1.8e-72
NP_036542 (OMIM: 616667) seizure 6-like protein 2 ( 853) 2696 271.0 1.9e-71
NP_001171704 (OMIM: 607021) seizure 6-like protein (1011) 2677 269.3 7.4e-71
XP_005261496 (OMIM: 607021) PREDICTED: seizure 6-l (1012) 2676 269.2 7.9e-71
NP_001171703 (OMIM: 607021) seizure 6-like protein (1013) 2676 269.2 7.9e-71
NP_963869 (OMIM: 616667) seizure 6-like protein 2 ( 910) 2553 257.5 2.4e-67
NP_001107571 (OMIM: 616667) seizure 6-like protein ( 840) 2516 253.9 2.6e-66
XP_011528339 (OMIM: 607021) PREDICTED: seizure 6-l ( 959) 2504 252.9 6.2e-66
XP_011528340 (OMIM: 607021) PREDICTED: seizure 6-l ( 958) 2500 252.5 8.1e-66
XP_011528341 (OMIM: 607021) PREDICTED: seizure 6-l ( 957) 2494 251.9 1.2e-65
NP_001171706 (OMIM: 607021) seizure 6-like protein ( 948) 2488 251.3 1.8e-65
XP_005255309 (OMIM: 616667) PREDICTED: seizure 6-l ( 859) 2343 237.5 2.3e-61
XP_016878624 (OMIM: 616667) PREDICTED: seizure 6-l ( 739) 2335 236.7 3.5e-61
NP_001107572 (OMIM: 616667) seizure 6-like protein ( 809) 2335 236.7 3.7e-61
XP_005261497 (OMIM: 607021) PREDICTED: seizure 6-l ( 960) 2317 235.1 1.4e-60
XP_016884188 (OMIM: 607021) PREDICTED: seizure 6-l ( 959) 2313 234.7 1.8e-60
XP_016884189 (OMIM: 607021) PREDICTED: seizure 6-l ( 958) 2307 234.2 2.6e-60
NP_001171705 (OMIM: 607021) seizure 6-like protein ( 949) 2298 233.3 4.7e-60
XP_016855682 (OMIM: 608398) PREDICTED: CUB and sus (2294) 876 98.9 3.3e-19
XP_016855681 (OMIM: 608398) PREDICTED: CUB and sus (2315) 876 98.9 3.3e-19
XP_016855680 (OMIM: 608398) PREDICTED: CUB and sus (2973) 876 99.0 3.9e-19
XP_016855679 (OMIM: 608398) PREDICTED: CUB and sus (3362) 876 99.1 4.3e-19
NP_443128 (OMIM: 608398) CUB and sushi domain-cont (3487) 876 99.1 4.4e-19
XP_016855678 (OMIM: 608398) PREDICTED: CUB and sus (3506) 876 99.1 4.4e-19
XP_016855683 (OMIM: 608398) PREDICTED: CUB and sus (3566) 876 99.1 4.4e-19
XP_016855677 (OMIM: 608398) PREDICTED: CUB and sus (3567) 876 99.1 4.4e-19
XP_016855676 (OMIM: 608398) PREDICTED: CUB and sus (3606) 876 99.1 4.5e-19
XP_016855675 (OMIM: 608398) PREDICTED: CUB and sus (3607) 876 99.1 4.5e-19
XP_016855674 (OMIM: 608398) PREDICTED: CUB and sus (3607) 876 99.1 4.5e-19
NP_001268885 (OMIM: 608398) CUB and sushi domain-c (3631) 876 99.1 4.5e-19
XP_011533055 (OMIM: 608397) PREDICTED: CUB and sus (2595) 852 96.7 1.7e-18
XP_016869220 (OMIM: 608397) PREDICTED: CUB and sus (3327) 852 96.8 2e-18
XP_011533054 (OMIM: 608397) PREDICTED: CUB and sus (3549) 852 96.8 2.1e-18
NP_150094 (OMIM: 608397) CUB and sushi domain-cont (3564) 852 96.8 2.1e-18
XP_016868501 (OMIM: 608399) PREDICTED: CUB and sus (3463) 800 91.9 6.4e-17
NP_443132 (OMIM: 608399) CUB and sushi domain-cont (3538) 800 91.9 6.5e-17
XP_016868499 (OMIM: 608399) PREDICTED: CUB and sus (3577) 800 91.9 6.6e-17
XP_011515118 (OMIM: 608399) PREDICTED: CUB and sus (3603) 800 91.9 6.6e-17
NP_937757 (OMIM: 608399) CUB and sushi domain-cont (3667) 800 91.9 6.7e-17
XP_016868497 (OMIM: 608399) PREDICTED: CUB and sus (3681) 800 91.9 6.7e-17
NP_937756 (OMIM: 608399) CUB and sushi domain-cont (3707) 800 91.9 6.7e-17
>>NP_849191 (OMIM: 616666) seizure protein 6 homolog iso (994 aa)
initn: 6902 init1: 6902 opt: 6902 Z-score: 3559.0 bits: 670.0 E(85289): 1.7e-191
Smith-Waterman score: 6902; 99.7% identity (99.8% similar) in 994 aa overlap (1-994:1-994)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRPVALLLLPSLLALLAHGLSLEAPTVGKGQAPGIEETDGELTAAPTPEQPERGVHFVTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_849 MRPVALLLLPSLLALLAHGLSLEAPTVGKGQAPGIEETDGELTAAPTPEQPERGVHFVTT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 APTLKLLNHHPLLEEFLQEGLEKGDEELRPALPFQPDPPAPFTPSPLPRLANQDSRPVFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_849 APTLKLLNHHPLLEEFLQEGLEKGDEELRPALPFQPDPPAPFTPSPLPRLANQDSRPVFT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 SPTPAMAAVPTQPQSKEGPWSPESESPMLRITAPLPPGPSMAVPTLGPGEIASTTPPSRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_849 SPTPAMAAVPTQPQSKEGPWSPESESPMLRITAPLPPGPSMAVPTLGPGEIASTTPPSRA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 WTPTQEGPGDMGRPWVAEVVSQGAGIGIQGTITSSTASGDDEETTTTTTIITTTITTVQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_849 WTPTQEGPGDMGRPWVAEVVSQGAGIGIQGTITSSTASGDDEETTTTTTIITTTITTVQT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 PGPCSWNFSGPEGSLDSPTDLSSPTDVGLDCFFYISVYPGYGVEIKVQNISLREGETVTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_849 PGPCSWNFSGPEGSLDSPTDLSSPTDVGLDCFFYISVYPGYGVEIKVQNISLREGETVTV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 EGLGGPDPLPLANQSFLLRGQVIRSPTHQAALRFQSLPPPAGPGTFHFHYQAYLLSCHFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_849 EGLGGPDPLPLANQSFLLRGQVIRSPTHQAALRFQSLPPPAGPGTFHFHYQAYLLSCHFP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 RRPAYGDVTVTSLHPGGSARFHCATGYQLKGARHLTCLNATQPFWDSKEPVCIGECPGVI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. : :::
NP_849 RRPAYGDVTVTSLHPGGSARFHCATGYQLKGARHLTCLNATQPFWDSKEPVCIAACGGVI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 RNATTGRIVSPGFPGNYSNNLTCHWLLEAPEGQRLHLHFEKVSLAEDDDRLIIRNGDNVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_849 RNATTGRIVSPGFPGNYSNNLTCHWLLEAPEGQRLHLHFEKVSLAEDDDRLIIRNGDNVE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 APPVYDSYEVEYLPIEGLLSSGKHFFVELSTDSSGAAAGMALRYEAFQQGHCYEPFVKYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_849 APPVYDSYEVEYLPIEGLLSSGKHFFVELSTDSSGAAAGMALRYEAFQQGHCYEPFVKYG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 NFSSSTPTYPVGTTVEFSCDPGYTLEQGSIIIECVDPHDPQWNETEPACRAVCSGEITDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_849 NFSSSTPTYPVGTTVEFSCDPGYTLEQGSIIIECVDPHDPQWNETEPACRAVCSGEITDS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 AGVVLSPNWPEPYGRGQDCIWGVHVEEDKRIMLDIRVLRIGPGDVLTFYDGDDLTARVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_849 AGVVLSPNWPEPYGRGQDCIWGVHVEEDKRIMLDIRVLRIGPGDVLTFYDGDDLTARVLG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 QYSGPRSHFKLFTSMADVTIQFQSDPGTSVLGYQQGFVIHFFEVPRNDTCPELPEIPNGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_849 QYSGPRSHFKLFTSMADVTIQFQSDPGTSVLGYQQGFVIHFFEVPRNDTCPELPEIPNGW
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 KSPSQPELVHGTVVTYQCYPGYQVVGSSVLMCQWDLTWSEDLPSCQRVTSCHDPGDVEHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_849 KSPSQPELVHGTVVTYQCYPGYQVVGSSVLMCQWDLTWSEDLPSCQRVTSCHDPGDVEHS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 RRLISSPKFPVGATVQYICDQGFVLMGSSILTCHDRQAGSPKWSDRAPKCLLEQLKPCHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_849 RRLISSPKFPVGATVQYICDQGFVLMGSSILTCHDRQAGSPKWSDRAPKCLLEQLKPCHG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 LSAPENGARSPEKQLHPAGATIHFSCAPGYVLKGQASIKCVPGHPSHWSDPPPICRAASL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_849 LSAPENGARSPEKQLHPAGATIHFSCAPGYVLKGQASIKCVPGHPSHWSDPPPICRAASL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 DGFYNSRSLDVAKAPAASSTLDAAHIAAAIFLPLVAMVLLVGGVYFYFSRLQGKSSLQLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_849 DGFYNSRSLDVAKAPAASSTLDAAHIAAAIFLPLVAMVLLVGGVYFYFSRLQGKSSLQLP
910 920 930 940 950 960
970 980 990
pF1KB7 RPRPRPYNRITIESAFDNPTYETGSLSFAGDERI
::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_849 RPRPRPYNRITIESAFDNPTYETGSLSFAGDERI
970 980 990
>>NP_001092105 (OMIM: 616666) seizure protein 6 homolog (993 aa)
initn: 6840 init1: 6840 opt: 6840 Z-score: 3527.2 bits: 664.1 E(85289): 1e-189
Smith-Waterman score: 6840; 99.7% identity (99.8% similar) in 984 aa overlap (1-984:1-984)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRPVALLLLPSLLALLAHGLSLEAPTVGKGQAPGIEETDGELTAAPTPEQPERGVHFVTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MRPVALLLLPSLLALLAHGLSLEAPTVGKGQAPGIEETDGELTAAPTPEQPERGVHFVTT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 APTLKLLNHHPLLEEFLQEGLEKGDEELRPALPFQPDPPAPFTPSPLPRLANQDSRPVFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APTLKLLNHHPLLEEFLQEGLEKGDEELRPALPFQPDPPAPFTPSPLPRLANQDSRPVFT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 SPTPAMAAVPTQPQSKEGPWSPESESPMLRITAPLPPGPSMAVPTLGPGEIASTTPPSRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPTPAMAAVPTQPQSKEGPWSPESESPMLRITAPLPPGPSMAVPTLGPGEIASTTPPSRA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 WTPTQEGPGDMGRPWVAEVVSQGAGIGIQGTITSSTASGDDEETTTTTTIITTTITTVQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WTPTQEGPGDMGRPWVAEVVSQGAGIGIQGTITSSTASGDDEETTTTTTIITTTITTVQT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 PGPCSWNFSGPEGSLDSPTDLSSPTDVGLDCFFYISVYPGYGVEIKVQNISLREGETVTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PGPCSWNFSGPEGSLDSPTDLSSPTDVGLDCFFYISVYPGYGVEIKVQNISLREGETVTV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 EGLGGPDPLPLANQSFLLRGQVIRSPTHQAALRFQSLPPPAGPGTFHFHYQAYLLSCHFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EGLGGPDPLPLANQSFLLRGQVIRSPTHQAALRFQSLPPPAGPGTFHFHYQAYLLSCHFP
310 320 330 340 350 360
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pF1KB7 RRPAYGDVTVTSLHPGGSARFHCATGYQLKGARHLTCLNATQPFWDSKEPVCIGECPGVI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. : :::
NP_001 RRPAYGDVTVTSLHPGGSARFHCATGYQLKGARHLTCLNATQPFWDSKEPVCIAACGGVI
370 380 390 400 410 420
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pF1KB7 RNATTGRIVSPGFPGNYSNNLTCHWLLEAPEGQRLHLHFEKVSLAEDDDRLIIRNGDNVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RNATTGRIVSPGFPGNYSNNLTCHWLLEAPEGQRLHLHFEKVSLAEDDDRLIIRNGDNVE
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490 500 510 520 530 540
pF1KB7 APPVYDSYEVEYLPIEGLLSSGKHFFVELSTDSSGAAAGMALRYEAFQQGHCYEPFVKYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APPVYDSYEVEYLPIEGLLSSGKHFFVELSTDSSGAAAGMALRYEAFQQGHCYEPFVKYG
490 500 510 520 530 540
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pF1KB7 NFSSSTPTYPVGTTVEFSCDPGYTLEQGSIIIECVDPHDPQWNETEPACRAVCSGEITDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NFSSSTPTYPVGTTVEFSCDPGYTLEQGSIIIECVDPHDPQWNETEPACRAVCSGEITDS
550 560 570 580 590 600
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pF1KB7 AGVVLSPNWPEPYGRGQDCIWGVHVEEDKRIMLDIRVLRIGPGDVLTFYDGDDLTARVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AGVVLSPNWPEPYGRGQDCIWGVHVEEDKRIMLDIRVLRIGPGDVLTFYDGDDLTARVLG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 QYSGPRSHFKLFTSMADVTIQFQSDPGTSVLGYQQGFVIHFFEVPRNDTCPELPEIPNGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QYSGPRSHFKLFTSMADVTIQFQSDPGTSVLGYQQGFVIHFFEVPRNDTCPELPEIPNGW
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 KSPSQPELVHGTVVTYQCYPGYQVVGSSVLMCQWDLTWSEDLPSCQRVTSCHDPGDVEHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KSPSQPELVHGTVVTYQCYPGYQVVGSSVLMCQWDLTWSEDLPSCQRVTSCHDPGDVEHS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 RRLISSPKFPVGATVQYICDQGFVLMGSSILTCHDRQAGSPKWSDRAPKCLLEQLKPCHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RRLISSPKFPVGATVQYICDQGFVLMGSSILTCHDRQAGSPKWSDRAPKCLLEQLKPCHG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 LSAPENGARSPEKQLHPAGATIHFSCAPGYVLKGQASIKCVPGHPSHWSDPPPICRAASL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSAPENGARSPEKQLHPAGATIHFSCAPGYVLKGQASIKCVPGHPSHWSDPPPICRAASL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 DGFYNSRSLDVAKAPAASSTLDAAHIAAAIFLPLVAMVLLVGGVYFYFSRLQGKSSLQLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DGFYNSRSLDVAKAPAASSTLDAAHIAAAIFLPLVAMVLLVGGVYFYFSRLQGKSSLQLP
910 920 930 940 950 960
970 980 990
pF1KB7 RPRPRPYNRITIESAFDNPTYETGSLSFAGDERI
::::::::::::::::::::::::
NP_001 RPRPRPYNRITIESAFDNPTYETGETREYEVSI
970 980 990
>>XP_011522617 (OMIM: 616666) PREDICTED: seizure protein (1073 aa)
initn: 6608 init1: 6608 opt: 6608 Z-score: 3407.9 bits: 642.2 E(85289): 4.4e-183
Smith-Waterman score: 6608; 99.7% identity (99.8% similar) in 950 aa overlap (1-950:1-950)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRPVALLLLPSLLALLAHGLSLEAPTVGKGQAPGIEETDGELTAAPTPEQPERGVHFVTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MRPVALLLLPSLLALLAHGLSLEAPTVGKGQAPGIEETDGELTAAPTPEQPERGVHFVTT
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70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 APTLKLLNHHPLLEEFLQEGLEKGDEELRPALPFQPDPPAPFTPSPLPRLANQDSRPVFT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SPTPAMAAVPTQPQSKEGPWSPESESPMLRITAPLPPGPSMAVPTLGPGEIASTTPPSRA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WTPTQEGPGDMGRPWVAEVVSQGAGIGIQGTITSSTASGDDEETTTTTTIITTTITTVQT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PGPCSWNFSGPEGSLDSPTDLSSPTDVGLDCFFYISVYPGYGVEIKVQNISLREGETVTV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EGLGGPDPLPLANQSFLLRGQVIRSPTHQAALRFQSLPPPAGPGTFHFHYQAYLLSCHFP
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. : :::
XP_011 RRPAYGDVTVTSLHPGGSARFHCATGYQLKGARHLTCLNATQPFWDSKEPVCIAACGGVI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RNATTGRIVSPGFPGNYSNNLTCHWLLEAPEGQRLHLHFEKVSLAEDDDRLIIRNGDNVE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 APPVYDSYEVEYLPIEGLLSSGKHFFVELSTDSSGAAAGMALRYEAFQQGHCYEPFVKYG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NFSSSTPTYPVGTTVEFSCDPGYTLEQGSIIIECVDPHDPQWNETEPACRAVCSGEITDS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AGVVLSPNWPEPYGRGQDCIWGVHVEEDKRIMLDIRVLRIGPGDVLTFYDGDDLTARVLG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KSPSQPELVHGTVVTYQCYPGYQVVGSSVLMCQWDLTWSEDLPSCQRVTSCHDPGDVEHS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RRLISSPKFPVGATVQYICDQGFVLMGSSILTCHDRQAGSPKWSDRAPKCLLEQLKPCHG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSAPENGARSPEKQLHPAGATIHFSCAPGYVLKGQASIKCVPGHPSHWSDPPPICRAASL
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XP_011 DGFYNSRSLDVAKAPAASSTLDAAHIAAAIFLPLVAMVLLVGGVYFYFSRRRENMKSPSR
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XP_011 WGQSREVNSDLHHSPAARLLASCCPSTSCIYHLGGDATKPSRSCALPRLRCPPWPIFLVS
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>>XP_011522619 (OMIM: 616666) PREDICTED: seizure protein (964 aa)
initn: 6706 init1: 6605 opt: 6605 Z-score: 3406.9 bits: 641.8 E(85289): 5e-183
Smith-Waterman score: 6605; 99.6% identity (99.7% similar) in 951 aa overlap (1-951:1-951)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRPVALLLLPSLLALLAHGLSLEAPTVGKGQAPGIEETDGELTAAPTPEQPERGVHFVTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MRPVALLLLPSLLALLAHGLSLEAPTVGKGQAPGIEETDGELTAAPTPEQPERGVHFVTT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 APTLKLLNHHPLLEEFLQEGLEKGDEELRPALPFQPDPPAPFTPSPLPRLANQDSRPVFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 APTLKLLNHHPLLEEFLQEGLEKGDEELRPALPFQPDPPAPFTPSPLPRLANQDSRPVFT
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pF1KB7 SPTPAMAAVPTQPQSKEGPWSPESESPMLRITAPLPPGPSMAVPTLGPGEIASTTPPSRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SPTPAMAAVPTQPQSKEGPWSPESESPMLRITAPLPPGPSMAVPTLGPGEIASTTPPSRA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 WTPTQEGPGDMGRPWVAEVVSQGAGIGIQGTITSSTASGDDEETTTTTTIITTTITTVQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WTPTQEGPGDMGRPWVAEVVSQGAGIGIQGTITSSTASGDDEETTTTTTIITTTITTVQT
190 200 210 220 230 240
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pF1KB7 PGPCSWNFSGPEGSLDSPTDLSSPTDVGLDCFFYISVYPGYGVEIKVQNISLREGETVTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PGPCSWNFSGPEGSLDSPTDLSSPTDVGLDCFFYISVYPGYGVEIKVQNISLREGETVTV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EGLGGPDPLPLANQSFLLRGQVIRSPTHQAALRFQSLPPPAGPGTFHFHYQAYLLSCHFP
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pF1KB7 RRPAYGDVTVTSLHPGGSARFHCATGYQLKGARHLTCLNATQPFWDSKEPVCIGECPGVI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. : :::
XP_011 RRPAYGDVTVTSLHPGGSARFHCATGYQLKGARHLTCLNATQPFWDSKEPVCIAACGGVI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RNATTGRIVSPGFPGNYSNNLTCHWLLEAPEGQRLHLHFEKVSLAEDDDRLIIRNGDNVE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 APPVYDSYEVEYLPIEGLLSSGKHFFVELSTDSSGAAAGMALRYEAFQQGHCYEPFVKYG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NFSSSTPTYPVGTTVEFSCDPGYTLEQGSIIIECVDPHDPQWNETEPACRAVCSGEITDS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AGVVLSPNWPEPYGRGQDCIWGVHVEEDKRIMLDIRVLRIGPGDVLTFYDGDDLTARVLG
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pF1KB7 QYSGPRSHFKLFTSMADVTIQFQSDPGTSVLGYQQGFVIHFFEVPRNDTCPELPEIPNGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QYSGPRSHFKLFTSMADVTIQFQSDPGTSVLGYQQGFVIHFFEVPRNDTCPELPEIPNGW
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pF1KB7 KSPSQPELVHGTVVTYQCYPGYQVVGSSVLMCQWDLTWSEDLPSCQRVTSCHDPGDVEHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KSPSQPELVHGTVVTYQCYPGYQVVGSSVLMCQWDLTWSEDLPSCQRVTSCHDPGDVEHS
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pF1KB7 RRLISSPKFPVGATVQYICDQGFVLMGSSILTCHDRQAGSPKWSDRAPKCLLEQLKPCHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RRLISSPKFPVGATVQYICDQGFVLMGSSILTCHDRQAGSPKWSDRAPKCLLEQLKPCHG
790 800 810 820 830 840
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pF1KB7 LSAPENGARSPEKQLHPAGATIHFSCAPGYVLKGQASIKCVPGHPSHWSDPPPICRAASL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSAPENGARSPEKQLHPAGATIHFSCAPGYVLKGQASIKCVPGHPSHWSDPPPICRAASL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 DGFYNSRSLDVAKAPAASSTLDAAHIAAAIFLPLVAMVLLVGGVYFYFSRLQGKSSLQLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
XP_011 DGFYNSRSLDVAKAPAASSTLDAAHIAAAIFLPLVAMVLLVGGVYFYFSSLFPLQETREY
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pF1KB7 RPRPRPYNRITIESAFDNPTYETGSLSFAGDERI
XP_011 EVSI
>>NP_001277131 (OMIM: 616666) seizure protein 6 homolog (869 aa)
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Smith-Waterman score: 6060; 99.7% identity (99.8% similar) in 869 aa overlap (126-994:1-869)
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pF1KB7 PDPPAPFTPSPLPRLANQDSRPVFTSPTPAMAAVPTQPQSKEGPWSPESESPMLRITAPL
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAAVPTQPQSKEGPWSPESESPMLRITAPL
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pF1KB7 PPGPSMAVPTLGPGEIASTTPPSRAWTPTQEGPGDMGRPWVAEVVSQGAGIGIQGTITSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PPGPSMAVPTLGPGEIASTTPPSRAWTPTQEGPGDMGRPWVAEVVSQGAGIGIQGTITSS
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pF1KB7 TASGDDEETTTTTTIITTTITTVQTPGPCSWNFSGPEGSLDSPTDLSSPTDVGLDCFFYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TASGDDEETTTTTTIITTTITTVQTPGPCSWNFSGPEGSLDSPTDLSSPTDVGLDCFFYI
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pF1KB7 SVYPGYGVEIKVQNISLREGETVTVEGLGGPDPLPLANQSFLLRGQVIRSPTHQAALRFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVYPGYGVEIKVQNISLREGETVTVEGLGGPDPLPLANQSFLLRGQVIRSPTHQAALRFQ
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pF1KB7 SLPPPAGPGTFHFHYQAYLLSCHFPRRPAYGDVTVTSLHPGGSARFHCATGYQLKGARHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLPPPAGPGTFHFHYQAYLLSCHFPRRPAYGDVTVTSLHPGGSARFHCATGYQLKGARHL
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pF1KB7 TCLNATQPFWDSKEPVCIGECPGVIRNATTGRIVSPGFPGNYSNNLTCHWLLEAPEGQRL
::::::::::::::::::. : ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TCLNATQPFWDSKEPVCIAACGGVIRNATTGRIVSPGFPGNYSNNLTCHWLLEAPEGQRL
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pF1KB7 HLHFEKVSLAEDDDRLIIRNGDNVEAPPVYDSYEVEYLPIEGLLSSGKHFFVELSTDSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HLHFEKVSLAEDDDRLIIRNGDNVEAPPVYDSYEVEYLPIEGLLSSGKHFFVELSTDSSG
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pF1KB7 AAAGMALRYEAFQQGHCYEPFVKYGNFSSSTPTYPVGTTVEFSCDPGYTLEQGSIIIECV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AAAGMALRYEAFQQGHCYEPFVKYGNFSSSTPTYPVGTTVEFSCDPGYTLEQGSIIIECV
400 410 420 430 440 450
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pF1KB7 DPHDPQWNETEPACRAVCSGEITDSAGVVLSPNWPEPYGRGQDCIWGVHVEEDKRIMLDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DPHDPQWNETEPACRAVCSGEITDSAGVVLSPNWPEPYGRGQDCIWGVHVEEDKRIMLDI
460 470 480 490 500 510
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pF1KB7 RVLRIGPGDVLTFYDGDDLTARVLGQYSGPRSHFKLFTSMADVTIQFQSDPGTSVLGYQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RVLRIGPGDVLTFYDGDDLTARVLGQYSGPRSHFKLFTSMADVTIQFQSDPGTSVLGYQQ
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pF1KB7 GFVIHFFEVPRNDTCPELPEIPNGWKSPSQPELVHGTVVTYQCYPGYQVVGSSVLMCQWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GFVIHFFEVPRNDTCPELPEIPNGWKSPSQPELVHGTVVTYQCYPGYQVVGSSVLMCQWD
580 590 600 610 620 630
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pF1KB7 LTWSEDLPSCQRVTSCHDPGDVEHSRRLISSPKFPVGATVQYICDQGFVLMGSSILTCHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTWSEDLPSCQRVTSCHDPGDVEHSRRLISSPKFPVGATVQYICDQGFVLMGSSILTCHD
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pF1KB7 RQAGSPKWSDRAPKCLLEQLKPCHGLSAPENGARSPEKQLHPAGATIHFSCAPGYVLKGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RQAGSPKWSDRAPKCLLEQLKPCHGLSAPENGARSPEKQLHPAGATIHFSCAPGYVLKGQ
700 710 720 730 740 750
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pF1KB7 ASIKCVPGHPSHWSDPPPICRAASLDGFYNSRSLDVAKAPAASSTLDAAHIAAAIFLPLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASIKCVPGHPSHWSDPPPICRAASLDGFYNSRSLDVAKAPAASSTLDAAHIAAAIFLPLV
760 770 780 790 800 810
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pF1KB7 AMVLLVGGVYFYFSRLQGKSSLQLPRPRPRPYNRITIESAFDNPTYETGSLSFAGDERI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AMVLLVGGVYFYFSRLQGKSSLQLPRPRPRPYNRITIESAFDNPTYETGSLSFAGDERI
820 830 840 850 860
>>NP_066938 (OMIM: 607021) seizure 6-like protein isofor (1024 aa)
initn: 2967 init1: 1716 opt: 2893 Z-score: 1503.7 bits: 289.8 E(85289): 5.1e-77
Smith-Waterman score: 2941; 43.4% identity (70.8% similar) in 1021 aa overlap (1-984:11-1015)
10 20 30 40
pF1KB7 MRPVALLLLPSLLALLAHGLSLEAPTVGKGQA----PGIEETDGELTAAP
.: ..:.: : : . . .:: .. .:.: : . . . ..:
NP_066 MPAARPPAAGLRGISLFL---ALLLGSPAAALERDALPEGDASPLGPYLLPSGAPERGSP
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 TPEQPERGVHFVTTAPTLKLLNHHPLLEEFLQEGLEKGDEELRPAL-PFQPDPPAPFTPS
:.::. : ::. :. . . .: :.. .: . .. ::: :. :. :
NP_066 GKEHPEERV--VTAPPSSS--QSAEVLGELVLDGTAPSAHHDIPALSPLLPEEARPKHAL
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140
pF1KB7 P----LPRLANQDS-----RPVFTSPT--------PAMAAVPTQPQSKEGPWSPESESPM
: :: : . .: :: :: . :: .. .: : : : . .:.
NP_066 PPKKKLPSLKQVNSARKQLRPKATSAATVQRAGSQPASQGLDLLSSSTEKPGPPGDPDPI
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190
pF1KB7 L---------------RITAPLPPGPSMAVPTLGPGEIASTTPPSRAWTPTQEGPGDMGR
. . ..: :.: . : . .: : : .: : . :: ::..
NP_066 VASEEASEVPLWLDRKESAVPTTPAPLQISPFTSQPYVAHTLP-QRP-EPGEPGP-DMAQ
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 PWVAEVVSQGAGIGIQGTITSSTASGDDEETTTTTTIITTTITTVQTPGPCSWNFSGPEG
: .: : . . ...:: ...::::.: : ::.::: :.:. :: .::.:::
NP_066 EAPQEDTSPMALMDKGENELTGSASEESQETTTSTIITTTVITTEQAPALCSVSFSNPEG
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 SLDSPTDLSSPTDVGLDCFFYISVYPGYGVEIKVQNISLREGETVTVEGLGGPDPLPLAN
.:: : . :.: . ..:: :::::..:....: .:: ....:. :: :::
NP_066 YIDSSDYPLLPLNNFLECTYNVTVYTGYGVELQVKSVNLSDGELLSIRGVDGPTLTVLAN
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 QSFLLRGQVIRSPTHQAALRFQSLPPPAGPGTFHFHYQAYLLSCHFPRRPAYGDVTVTSL
:..:..::::::::. .. :... : :::..::::..:::.::::: ::::: .:
NP_066 QTLLVEGQVIRSPTNTISVYFRTFQDD-GLGTFQLHYQAFMLSCNFPRRPDSGDVTVMDL
360 370 380 390 400
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 HPGGSARFHCATGYQLKGARHLTCLNATQPFWDSKEPVCIGECPGVIRNATTGRIVSPGF
: :: :.::: ::.:.::. :::.::..: :.:.::.: . : :...::: ::..::..
NP_066 HSGGVAHFHCHLGYELQGAKMLTCINASKPHWSSQEPICSAPCGGAVHNATIGRVLSPSY
410 420 430 440 450 460
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 PGNYSNNLTCHWLLEAPEGQRLHLHFEKVSLAEDDDRLIIRNGDNVEAPPVYDSYEVEYL
: : ... : : .::::::.::::::.. : .: ::. ...:.. .. .::: ..: .
NP_066 PENTNGSQFCIWTIEAPEGQKLHLHFERL-LLHDKDRMTVHSGQTNKSALLYDSLQTESV
470 480 490 500 510 520
500 510 520 530 540 550
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:.::::: :. . .:...:.. ::. . .:.:::..::::::... :::..: ::: .::
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XP_006 TEFDNPIYETGETREYEVSI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]