FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7264, 249 aa
  1>>>pF1KB7264 249 - 249 aa - 249 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6504+/-0.00123; mu= -9.3968+/- 0.075
 mean_var=344.5560+/-69.621, 0's: 0 Z-trim(111.7): 50  B-trim: 471 in 1/51
 Lambda= 0.069095
 statistics sampled from 12554 (12582) to 12554 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.711), E-opt: 0.2 (0.386), width:  16
 Scan time:  2.360

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS45292.1 ANP32A gene_id:8125|Hs108|chr15        ( 249) 1620 174.7 5.2e-44
CCDS6732.1 ANP32B gene_id:10541|Hs108|chr9         ( 251) 1116 124.5   7e-29
CCDS946.1 ANP32E gene_id:81611|Hs108|chr1          ( 268)  906 103.5 1.5e-22
CCDS31788.1 ANP32D gene_id:23519|Hs108|chr12       ( 131)  739 86.6 8.9e-18
CCDS44215.1 ANP32E gene_id:81611|Hs108|chr1        ( 220)  715 84.4 6.8e-17


>>CCDS45292.1 ANP32A gene_id:8125|Hs108|chr15             (249 aa)
 initn: 1620 init1: 1620 opt: 1620  Z-score: 903.6  bits: 174.7 E(32554): 5.2e-44
Smith-Waterman score: 1620; 100.0% identity (100.0% similar) in 249 aa overlap (1-249:1-249)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MEMGRRIHLELRNRTPSDVKELVLDNSRSNEGKLEGLTDEFEELEFLSTINVGLTSIANL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MEMGRRIHLELRNRTPSDVKELVLDNSRSNEGKLEGLTDEFEELEFLSTINVGLTSIANL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 PKLNKLKKLELSDNRVSGGLEVLAEKCPNLTHLNLSGNKIKDLSTIEPLKKLENLKSLDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PKLNKLKKLELSDNRVSGGLEVLAEKCPNLTHLNLSGNKIKDLSTIEPLKKLENLKSLDL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 FNCEVTNLNDYRENVFKLLPQLTYLDGYDRDDKEAPDSDAEGYVEGLDDEEEDEDEEEYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FNCEVTNLNDYRENVFKLLPQLTYLDGYDRDDKEAPDSDAEGYVEGLDDEEEDEDEEEYD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 EDAQVVEDEEDEDEEEEGEEEDVSGEEEEDEEGYNDGEVDDEEDEEELGEEERGQKRKRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EDAQVVEDEEDEDEEEEGEEEDVSGEEEEDEEGYNDGEVDDEEDEEELGEEERGQKRKRE
              190       200       210       220       230       240

                
pF1KB7 PEDEGEDDD
       :::::::::
CCDS45 PEDEGEDDD
                

>>CCDS6732.1 ANP32B gene_id:10541|Hs108|chr9              (251 aa)
 initn: 1382 init1: 966 opt: 1116  Z-score: 632.0  bits: 124.5 E(32554): 7e-29
Smith-Waterman score: 1116; 70.5% identity (85.4% similar) in 254 aa overlap (1-248:1-251)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MEMGRRIHLELRNRTPSDVKELVLDNSRSNEGKLEGLTDEFEELEFLSTINVGLTSIANL
       :.: ::::::::::::. :.:::::: .::.::.:::: :: .::::: ::::: :..::
CCDS67 MDMKRRIHLELRNRTPAAVRELVLDNCKSNDGKIEGLTAEFVNLEFLSLINVGLISVSNL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 PKLNKLKKLELSDNRVSGGLEVLAEKCPNLTHLNLSGNKIKDLSTIEPLKKLENLKSLDL
       ::: ::::::::.::. :::..:::: ::::::::::::.::.::.::::::: ::::::
CCDS67 PKLPKLKKLELSENRIFGGLDMLAEKLPNLTHLNLSGNKLKDISTLEPLKKLECLKSLDL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170          
pF1KB7 FNCEVTNLNDYRENVFKLLPQLTYLDGYDRDDKEAPDSDAEGYVEGLDDEEEDED-EEEY
       :::::::::::::.::::::::::::::::.:.::::::::  :.:.:.:::::. :.: 
CCDS67 FNCEVTNLNDYRESVFKLLPQLTYLDGYDREDQEAPDSDAE--VDGVDEEEEDEEGEDEE
              130       140       150       160         170        

     180       190            200       210       220       230    
pF1KB7 DEDAQVVEDEE-----DEDEEEEGEEEDVSGEEEEDEEGYNDGEVDDEEDEEELGEEERG
       ::: .  :.::     ::::. ::.:.:    :::.: : .. . :..:::::  :  .:
CCDS67 DEDDEDGEEEEFDEEDDEDEDVEGDEDDDEVSEEEEEFGLDEEDEDEDEDEEEE-EGGKG
      180       190       200       210       220       230        

          240         
pF1KB7 QKRKREPEDEGEDDD
       .::::: .:::::: 
CCDS67 EKRKRETDDEGEDD 
       240       250  

>>CCDS946.1 ANP32E gene_id:81611|Hs108|chr1               (268 aa)
 initn: 1132 init1: 839 opt: 906  Z-score: 518.5  bits: 103.5 E(32554): 1.5e-22
Smith-Waterman score: 958; 59.2% identity (79.0% similar) in 267 aa overlap (1-249:1-267)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MEMGRRIHLELRNRTPSDVKELVLDNSRSNEGKLEGLTDEFEELEFLSTINVGLTSIANL
       ::: ..:.::::::.: .: ::::::    .:..:::.: :.::::::  :: :.:.: :
CCDS94 MEMKKKINLELRNRSPEEVTELVLDNCLCVNGEIEGLNDTFKELEFLSMANVELSSLARL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 PKLNKLKKLELSDNRVSGGLEVLAEKCPNLTHLNLSGNKIKDLSTIEPLKKLENLKSLDL
       :.::::.::::::: .:::::::::::::::.:::::::::::::.: :..:.:::::::
CCDS94 PSLNKLRKLELSDNIISGGLEVLAEKCPNLTYLNLSGNKIKDLSTVEALQNLKNLKSLDL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160        170         
pF1KB7 FNCEVTNLNDYRENVFKLLPQLTYLDGYDRDDKEAPDSDAEGYVEG-LDDEEEDEDEEEY
       ::::.:::.::::..:.:: :.:::::.:..:.:::::. :   .:  :::::.:.:   
CCDS94 FNCEITNLEDYRESIFELLQQITYLDGFDQEDNEAPDSEEEDDEDGDEDDEEEEENEAGP
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200          210          220          230
pF1KB7 DEDAQVVEDEEDEDEEEEGEEEDVSGEEE---EDEEGYN---DGEVDDEEDEE---ELGE
        :  .  :.::.:..:.: :.:: .: :    :.: : .     :..::::..   : ::
CCDS94 PEGYEEEEEEEEEEDEDEDEDEDEAGSELGEGEEEVGLSYLMKEEIQDEEDDDDYVEEGE
              190       200       210       220       230       240

                      240          
pF1KB7 EE--------RGQKRKREPEDEGEDDD 
       ::        ::.::::. ::.::..: 
CCDS94 EEEEEEEGGLRGEKRKRDAEDDGEEEDD
              250       260        

>>CCDS31788.1 ANP32D gene_id:23519|Hs108|chr12            (131 aa)
 initn: 739 init1: 739 opt: 739  Z-score: 432.6  bits: 86.6 E(32554): 8.9e-18
Smith-Waterman score: 739; 89.3% identity (96.9% similar) in 131 aa overlap (1-131:1-131)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MEMGRRIHLELRNRTPSDVKELVLDNSRSNEGKLEGLTDEFEELEFLSTINVGLTSIANL
       ::::. :::::::::::::::: ::::.:::::::::::::::::.:.:::.::::::::
CCDS31 MEMGKWIHLELRNRTPSDVKELFLDNSQSNEGKLEGLTDEFEELELLNTINIGLTSIANL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 PKLNKLKKLELSDNRVSGGLEVLAEKCPNLTHLNLSGNKIKDLSTIEPLKKLENLKSLDL
       ::::::::::::.::.: :::::::::::: ::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS31 PKLNKLKKLELSSNRASVGLEVLAEKCPNLIHLNLSGNKIKDLSTIEPLKKLENLESLDL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 FNCEVTNLNDYRENVFKLLPQLTYLDGYDRDDKEAPDSDAEGYVEGLDDEEEDEDEEEYD
       :.:::::::.:                                                 
CCDS31 FTCEVTNLNNY                                                 
              130                                                  

>>CCDS44215.1 ANP32E gene_id:81611|Hs108|chr1             (220 aa)
 initn: 941 init1: 648 opt: 715  Z-score: 416.7  bits: 84.4 E(32554): 6.8e-17
Smith-Waterman score: 767; 59.0% identity (78.8% similar) in 217 aa overlap (51-249:3-219)

               30        40        50        60        70        80
pF1KB7 ELVLDNSRSNEGKLEGLTDEFEELEFLSTINVGLTSIANLPKLNKLKKLELSDNRVSGGL
                                     :: :.:.: ::.::::.::::::: .::::
CCDS44                             MANVELSSLARLPSLNKLRKLELSDNIISGGL
                                           10        20        30  

               90       100       110       120       130       140
pF1KB7 EVLAEKCPNLTHLNLSGNKIKDLSTIEPLKKLENLKSLDLFNCEVTNLNDYRENVFKLLP
       :::::::::::.:::::::::::::.: :..:.:::::::::::.:::.::::..:.:: 
CCDS44 EVLAEKCPNLTYLNLSGNKIKDLSTVEALQNLKNLKSLDLFNCEITNLEDYRESIFELLQ
             40        50        60        70        80        90  

              150       160        170       180       190         
pF1KB7 QLTYLDGYDRDDKEAPDSDAEGYVEG-LDDEEEDEDEEEYDEDAQVVEDEEDEDEEEEGE
       :.:::::.:..:.:::::. :   .:  :::::.:.:    :  .  :.::.:..:.: :
CCDS44 QITYLDGFDQEDNEAPDSEEEDDEDGDEDDEEEEENEAGPPEGYEEEEEEEEEEDEDEDE
            100       110       120       130       140       150  

     200          210          220          230               240  
pF1KB7 EEDVSGEEE---EDEEGYN---DGEVDDEEDEE---ELGEEE--------RGQKRKREPE
       .:: .: :    :.: : .     :..::::..   : ::::        ::.::::. :
CCDS44 DEDEAGSELGEGEEEVGLSYLMKEEIQDEEDDDDYVEEGEEEEEEEEGGLRGEKRKRDAE
            160       170       180       190       200       210  

               
pF1KB7 DEGEDDD 
       :.::..: 
CCDS44 DDGEEEDD
            220




249 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]