Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7263
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7263, 315 aa
1>>>pF1KB7263 315 - 315 aa - 315 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4021+/-0.00124; mu= 8.8844+/- 0.072
mean_var=164.6329+/-56.649, 0's: 0 Z-trim(102.6): 376 B-trim: 821 in 2/45
Lambda= 0.099958
statistics sampled from 6548 (7040) to 6548 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.567), E-opt: 0.2 (0.216), width: 16
Scan time: 2.440
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 2088 314.2 8.7e-86
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 1292 199.4 3.1e-51
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 1173 182.2 4.6e-46
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 1160 180.3 1.7e-45
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 1143 177.9 9.1e-45
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 1141 177.6 1.1e-44
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 1141 177.6 1.1e-44
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 1140 177.5 1.3e-44
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 1136 176.9 1.8e-44
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 1128 175.7 4.1e-44
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 1114 173.7 1.7e-43
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1091 170.4 1.7e-42
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 1089 170.1 2e-42
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 1074 167.9 9.1e-42
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 1073 167.8 1e-41
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 1071 167.5 1.2e-41
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 1042 163.3 2.3e-40
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 1031 161.7 6.7e-40
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 1029 161.4 8.1e-40
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 1027 161.2 1e-39
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 992 156.1 3.4e-38
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 990 155.8 4.1e-38
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 984 154.9 7.3e-38
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 982 154.7 8.9e-38
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 982 154.7 9.1e-38
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 978 154.1 1.4e-37
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 968 152.7 3.7e-37
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 967 152.5 4e-37
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 966 152.4 4.6e-37
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 964 152.1 5.5e-37
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 954 150.6 1.5e-36
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 948 149.8 2.7e-36
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 941 148.8 5.4e-36
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 937 148.2 8.1e-36
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 936 148.0 9e-36
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 916 145.1 6.5e-35
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 908 144.0 1.5e-34
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 899 142.7 3.6e-34
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 865 137.8 1.1e-32
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 822 131.6 8e-31
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 820 131.3 9.8e-31
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 815 130.6 1.7e-30
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 775 124.9 9.5e-29
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 765 123.4 2.4e-28
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 759 122.5 4.3e-28
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 752 121.5 8.7e-28
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 734 118.9 5.2e-27
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 701 114.1 1.4e-25
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 676 110.5 1.7e-24
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 643 105.8 4.7e-23
>>CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 2088 init1: 2088 opt: 2088 Z-score: 1653.6 bits: 314.2 E(32554): 8.7e-86
Smith-Waterman score: 2088; 100.0% identity (100.0% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGDWNNSDAVEPIFILRGFPGLEYVHSWLSILFCLAYLVAFMGNVTILSVIWIESSLHQP
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CCDS31 MGDWNNSDAVEPIFILRGFPGLEYVHSWLSILFCLAYLVAFMGNVTILSVIWIESSLHQP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MYYFISILAVNDLGMSLSTLPTMLAVLWLDAPEIQASACYAQLFFIHTFTFLESSVLLAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MYYFISILAVNDLGMSLSTLPTMLAVLWLDAPEIQASACYAQLFFIHTFTFLESSVLLAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AFDRFVAICHPLHYPTILTNSVIGKIGLACLLRSLGVVLPTPLLLRHYHYCHGNALSHAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AFDRFVAICHPLHYPTILTNSVIGKIGLACLLRSLGVVLPTPLLLRHYHYCHGNALSHAF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 CLHQDVLRLSCTDARTNSIYGLCVVIATLGVDSIFILLSYVLILNTVLDIASREEQLKAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CLHQDVLRLSCTDARTNSIYGLCVVIATLGVDSIFILLSYVLILNTVLDIASREEQLKAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 NTCVSHICVVLIFFVPVIGVSMVHRFGKHLSPIVHILMADIYLLLPPVLNPIVYSVRTKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NTCVSHICVVLIFFVPVIGVSMVHRFGKHLSPIVHILMADIYLLLPPVLNPIVYSVRTKQ
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 IRLGILHKFVLRRRF
:::::::::::::::
CCDS31 IRLGILHKFVLRRRF
310
>>CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1279 init1: 1279 opt: 1292 Z-score: 1033.3 bits: 199.4 E(32554): 3.1e-51
Smith-Waterman score: 1292; 59.3% identity (86.9% similar) in 305 aa overlap (5-309:8-312)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MGDWNNSDAVEPIFILRGFPGLEYVHSWLSILFCLAYLVAFMGNVTILSVIWIESSL
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CCDS31 MTLGSLGNSSSSVSATFLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILFIIKTERSL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 HQPMYYFISILAVNDLGMSLSTLPTMLAVLWLDAPEIQASACYAQLFFIHTFTFLESSVL
:.::: :.:.::. :::.:: ::::.:...:. : ::. .::.::::::: :.:::::::
CCDS31 HEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDACFAQLFFIHCFSFLESSVL
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pF1KB7 LAMAFDRFVAICHPLHYPTILTNSVIGKIGLACLLRSLGVVLPTPLLLRHYHYCHGNALS
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CCDS31 LSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRFPYCGSPVLS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 HAFCLHQDVLRLSCTDARTNSIYGLCVVIATLGVDSIFILLSYVLILNTVLDIASREEQL
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CCDS31 HSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVLSIASRAERF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 KALNTCVSHICVVLIFFVPVIGVSMVHRFGKHLSPIVHILMADIYLLLPPVLNPIVYSVR
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CCDS31 KALNTCVSHICAVLLFYTPMIGLSVIHRFGKQAPHLVQVVMGFMYLLFPPVMNPIVYSVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 TKQIRLGILHKFVLRRRF
::::: . : :
CCDS31 TKQIRDRVTHAFCY
310
>>CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1176 init1: 731 opt: 1173 Z-score: 940.5 bits: 182.2 E(32554): 4.6e-46
Smith-Waterman score: 1173; 55.0% identity (84.1% similar) in 309 aa overlap (6-313:5-312)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MGDWNNSDAVE-PIFILRGFPGLEYVHSWLSILFCLAYLVAFMGNVTILSVIWIESSLHQ
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CCDS31 MSIINTSYVEITTFFLVGMPGLEYAHIWISIPICSMYLIAILGNGTILFIIKTEPSLHE
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pF1KB7 PMYYFISILAVNDLGMSLSTLPTMLAVLWLDAPEIQASACYAQLFFIHTFTFLESSVLLA
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CCDS31 PMYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPEISSNACFAQEFFIHGFSVLESSVLLI
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pF1KB7 MAFDRFVAICHPLHYPTILTNSVIGKIGLACLLRSLGVVLPTPLLLRHYHYCHGNALSHA
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CCDS31 MSFDRFLAIHNPLRYTSILTTVRVAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLRNLRYCKKNQLSHS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 FCLHQDVLRLSCTDARTNSIYGLCVVIATLGVDSIFILLSYVLILNTVLDIASREEQLKA
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CCDS31 YCLHQDVMKLACSDNRIDVIYGFFGALC-LMVDFILIAVSYTLILKTVLGIASKKEQLKA
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pF1KB7 LNTCVSHICVVLIFFVPVIGVSMVHRFGKHLSPIVHILMADIYLLLPPVLNPIVYSVRTK
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CCDS31 LNTCVSHICAVIIFYLPIINLAVVHRFARHVSPLINVLMANVLLLVPPLTNPIVYCVKTK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KB7 QIRLGILHKFVLRRRF
:::. .. :. :.
CCDS31 QIRVRVVAKLCQRKI
300 310
>>CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 (321 aa)
initn: 1182 init1: 1145 opt: 1160 Z-score: 930.3 bits: 180.3 E(32554): 1.7e-45
Smith-Waterman score: 1160; 53.4% identity (81.8% similar) in 307 aa overlap (7-313:14-320)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MGDWNNSDAVEPIFILRGFPGLEYVHSWLSILFCLAYLVAFMGNVTILSVIWI
: ... :.: :: :.: . :::: : : ....:: .: :::
CCDS31 MFLSSRMITSVSPSTSTNSSFLLTGFSGMEQQYPWLSIPFSSIYAMVLLGNCMVLHVIWT
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 ESSLHQPMYYFISILAVNDLGMSLSTLPTMLAVLWLDAPEIQASACYAQLFFIHTFTFLE
: ::::::.::.:.::..:: :.:::. :.:..:: ::. ..: :: .::: ..:.:
CCDS31 EPSLHQPMFYFLSMLALTDLCMGLSTVYTVLGILWGIIREISLDSCIAQSYFIHGLSFME
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 SSVLLAMAFDRFVAICHPLHYPTILTNSVIGKIGLACLLRSLGVVLPTPLLLRHYHYCHG
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CCDS31 SSVLLTMAFDRYIAICNPLRYSSILTNSRIIKIGLTIIGRSFFFITPPIICLKFFNYCHF
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180 190 200 210 220 230
pF1KB7 NALSHAFCLHQDVLRLSCTDARTNSIYGLCVVIATLGVDSIFILLSYVLILNTVLDIASR
. :::.::::::.:::.:.: : :: :.: .:: : .:.:.::.::.:::..:: .::.
CCDS31 HILSHSFCLHQDLLRLACSDIRFNSYYALMLVICILLLDAILILFSYILILKSVLAVASQ
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 EEQLKALNTCVSHICVVLIFFVPVIGVSMVHRFGKHLSPIVHILMADIYLLLPPVLNPIV
::. : ..::.::::.::.:..:.:...:::::::::::..:.:...::.:.::..:::.
CCDS31 EERHKLFQTCISHICAVLVFYIPIISLTMVHRFGKHLSPVAHVLIGNIYILFPPLMNPII
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 YSVRTKQIRLGILHKFVLRRRF
:::.:.::. .:. : :.:
CCDS31 YSVKTQQIHTRMLRLFSLKRY
310 320
>>CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1126 init1: 1126 opt: 1143 Z-score: 917.2 bits: 177.9 E(32554): 9.1e-45
Smith-Waterman score: 1143; 52.4% identity (82.8% similar) in 309 aa overlap (5-313:2-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGDWNNSDAVEPIFILRGFPGLEYVHSWLSILFCLAYLVAFMGNVTILSVIWIESSLHQP
..: . .: :.: :::::: .: :.:..: . :. ..:: :.: .: . .::.:
CCDS31 MSSSGSSHP-FLLTGFPGLEEAHHWISVFFLFMYISILFGNGTLLLLIKEDHNLHEP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MYYFISILAVNDLGMSLSTLPTMLAVLWLDAPEIQASACYAQLFFIHTFTFLESSVLLAM
::.:...::..:::..:.:.::.:.::::: :: ..::..: .:::...::::..::::
CCDS31 MYFFLAMLAATDLGLALTTMPTVLGVLWLDHREIGSAACFSQAYFIHSLSFLESGILLAM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AFDRFVAICHPLHYPTILTNSVIGKIGLACLLRSLGVVLPTPLLLRHYHYCHGNALSHAF
:.:::.:::.::.: ..:::. . ::::. :.:.. :.: : . :::...:::::
CCDS31 AYDRFIAICNPLRYTSVLTNTRVVKIGLGVLMRGFVSVVPPIRPLYFFLYCHSHVLSHAF
120 130 140 150 160 170
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pF1KB7 CLHQDVLRLSCTDARTNSIYGLCVVIATLGVDSIFILLSYVLILNTVLDIASREEQLKAL
::::::..:.:.:. : .: .:. . .: ..:..::::::.:::.::::::. :::
CCDS31 CLHQDVIKLACADTTFNRLYPAVLVVFIFVLDYLIIFISYVLILKTVLSIASREERAKAL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 NTCVSHICVVLIFFVPVIGVSMVHRFGKHLSPIVHILMADIYLLLPPVLNPIVYSVRTKQ
::::::: ::.:.: :::.:..:::::.. :::..:. :.:.::..:::.:::.:::
CCDS31 ITCVSHICCVLVFYVTVIGLSLIHRFGKQVPHIVHLIMSYAYFLFPPLMNPITYSVKTKQ
240 250 260 270 280 290
310
pF1KB7 IRLGILHKFVLRRRF
:. .::: :. .:
CCDS31 IQNAILHLFTTHRIGT
300 310
>>CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1099 init1: 729 opt: 1141 Z-score: 915.6 bits: 177.6 E(32554): 1.1e-44
Smith-Waterman score: 1141; 54.8% identity (82.6% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGDWNNSDAVEPIFILRGFPGLEYVHSWLSILFCLAYLVAFMGNVTILSVIWIESSLHQP
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CCDS31 EIRKGILKFFHKSQA
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