FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7260, 312 aa
1>>>pF1KB7260 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6166+/-0.00127; mu= 13.8013+/- 0.076
mean_var=174.6162+/-61.204, 0's: 0 Z-trim(102.4): 431 B-trim: 405 in 1/48
Lambda= 0.097058
statistics sampled from 6437 (6956) to 6437 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.557), E-opt: 0.2 (0.214), width: 16
Scan time: 2.410
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 1449 216.1 2.9e-56
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 1377 206.0 3.1e-53
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 1369 204.9 6.8e-53
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 1363 204.1 1.2e-52
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 1360 203.6 1.6e-52
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 1359 203.5 1.8e-52
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CCDS32897.1 OR7G2 gene_id:390882|Hs108|chr19 ( 345) 1295 194.6 9.3e-50
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CCDS32898.2 OR7G1 gene_id:125962|Hs108|chr19 ( 311) 1189 179.7 2.6e-45
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 1167 176.6 2.2e-44
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 1147 173.8 1.5e-43
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 1130 171.4 8e-43
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 1119 169.9 2.4e-42
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 1107 168.2 7.4e-42
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 1100 167.2 1.5e-41
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CCDS32937.1 OR1I1 gene_id:126370|Hs108|chr19 ( 355) 1027 157.1 1.9e-38
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CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 935 144.1 1.3e-34
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CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 927 143.0 2.9e-34
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 926 142.9 3.2e-34
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 921 142.2 5.2e-34
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 920 142.0 5.7e-34
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 920 142.0 5.7e-34
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 918 141.7 6.8e-34
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 918 141.8 7.3e-34
CCDS35125.1 OR1Q1 gene_id:158131|Hs108|chr9 ( 314) 914 141.2 1e-33
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 913 141.0 1.1e-33
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 906 140.0 2.2e-33
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 903 139.6 3e-33
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 902 139.5 3.2e-33
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 898 138.9 4.8e-33
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 894 138.4 7.1e-33
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 893 138.3 8e-33
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 892 138.1 8.6e-33
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 891 137.9 9.5e-33
>>CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 (312 aa)
initn: 2049 init1: 2049 opt: 2049 Z-score: 1577.8 bits: 300.1 E(32554): 1.5e-81
Smith-Waterman score: 2049; 100.0% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MEAGNQTGFLEFILLGLSEDPELQPFIFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAISSDSHLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MEAGNQTGFLEFILLGLSEDPELQPFIFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAISSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLSNLSWVDICFSTCIVPKMLVNIQTENKAISYMDCLTQVYFSMFFPILDTLLLTVMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FFLSNLSWVDICFSTCIVPKMLVNIQTENKAISYMDCLTQVYFSMFFPILDTLLLTVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRFVAVCHPLHYMIIMNPHLCGLLVFVTWLIGVMTSLLHISLMMHLIFCKDFEIPHFFCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DRFVAVCHPLHYMIIMNPHLCGLLVFVTWLIGVMTSLLHISLMMHLIFCKDFEIPHFFCE
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190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LTYILQLACSDTFLNSTLIYFMTGVLGVFPLLGIIFSYSRIASSIRKMSSSGGKQKALST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LTYILQLACSDTFLNSTLIYFMTGVLGVFPLLGIIFSYSRIASSIRKMSSSGGKQKALST
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250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CGSHLSVVSLFYGTGIGVHFTSAVTHSSQKISVASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 LGSLLSRAASCL
::::::::::::
CCDS32 LGSLLSRAASCL
310
>>CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 (312 aa)
initn: 1449 init1: 1449 opt: 1449 Z-score: 1123.7 bits: 216.1 E(32554): 2.9e-56
Smith-Waterman score: 1449; 70.7% identity (86.8% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MEAGNQTGFLEFILLGLSEDPELQPFIFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAISSDSHLHTPMY
::: : : . .:.:::::.:::::: .:::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS32 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLSNLSWVDICFSTCIVPKMLVNIQTENKAISYMDCLTQVYFSMFFPILDTLLLTVMAY
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CCDS32 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
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pF1KB7 DRFVAVCHPLHYMIIMNPHLCGLLVFVTWLIGVMTSLLHISLMMHLIFCKDFEIPHFFCE
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CCDS32 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE
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190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LTYILQLACSDTFLNSTLIYFMTGVLGVFPLLGIIFSYSRIASSIRKMSSSGGKQKALST
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CCDS32 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST
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250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CGSHLSVVSLFYGTGIGVHFTSAVTHSSQKISVASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
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CCDS32 CGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 LGSLLSRAASCL
: ::::: ::
CCDS32 LERLLSRADSCP
310
>>CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 (309 aa)
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Smith-Waterman score: 1377; 66.2% identity (88.9% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MEAGNQTGFLEFILLGLSEDPELQPFIFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAISSDSHLHTPMY
:.. :.: .:::.:::.::.:::: :.::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS32 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
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pF1KB7 FFLSNLSWVDICFSTCIVPKMLVNIQTENKAISYMDCLTQVYFSMFFPILDTLLLTVMAY
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CCDS32 FFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNKVITYAGCITQMCFFLLFVGLDNFLLTVMAY
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pF1KB7 DRFVAVCHPLHYMIIMNPHLCGLLVFVTWLIGVMTSLLHISLMMHLIFCKDFEIPHFFCE
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CCDS32 DRFVAICHPLHYMVIMNPQLCGLLVLASWIMSVLNSMLQSLMVLPLPFCTHMEIPHFFCE
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pF1KB7 LTYILQLACSDTFLNSTLIYFMTGVLGVFPLLGIIFSYSRIASSIRKMSSSGGKQKALST
.. ...:::::::::. ..:: ...:: :: ::..:::.:.:::: .::. :: ::.::
CCDS32 INQVVHLACSDTFLNDIVMYFAVALLGGGPLTGILYSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
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pF1KB7 CGSHLSVVSLFYGTGIGVHFTSAVTHSSQKISVASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
:.:::::::::::: .::...::.::.:. ..:::::::::::::::::::::: .:::
CCDS32 CASHLSVVSLFYGTCLGVYLSSAATHNSHTGAAASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKHIKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 LGSLLSRAASCL
. ...
CCDS32 MKTFFRGKQ
>>CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 (319 aa)
initn: 1369 init1: 1369 opt: 1369 Z-score: 1063.1 bits: 204.9 E(32554): 6.8e-53
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pF1KB7 MEAGNQTGFLEFILLGLSEDPELQPFIFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAISSDSHLHTPMY
:: ::.: . ::.:::.:..: ::::.::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS12 MEPGNDTQISEFLLLGFSQEPGLQPFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
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CCDS12 FFLSNLSFADICVTSTTIPKMLMNIQTQNKVITYIACLMQMYFFILFAGFENFLLSVMAY
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CCDS12 DRFVAICHPLHYMVIMNPHLCGLLVLASWTMSALYSLLQILMVVRLSFCTALEIPHFFCE
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:.:::::::::::. .::...::.:..:.. ..:::::::::::::::::::::::.: :
CCDS12 CASHLSVVSLFYGAILGVYLSSAATRNSHSSATASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDIKRA
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310
pF1KB7 LGSLLSRAASCL
::
CCDS12 LGIHLLWGTMKGQFFKKCP
310
>>CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 (320 aa)
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pF1KB7 MEAGNQTGFLEFILLGLSEDPELQPFIFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAISSDSHLHTPMY
::.:::: ::.:::.: :.: ..::::::::::: ::::::::: ::::::::::
CCDS12 METGNQTHAQEFLLLGFSATSEIQFILFGLFLSMYLVTFTGNLLIILAICSDSHLHTPMY
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pF1KB7 FFLSNLSWVDICFSTCIVPKMLVNIQTENKAISYMDCLTQVYFSMFFPILDTLLLTVMAY
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CCDS12 FFLSNLSFADLCFTSTTVPKMLLNILTQNKFITYAGCLSQIFFFTSFGCLDNLLLTVMAY
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pF1KB7 DRFVAVCHPLHYMIIMNPHLCGLLVFVTWLIGVMTSLLHISLMMHLIFCKDFEIPHFFCE
:::::::::::: .::::.::::::. .: :.:: :::. ...: :: ..:::::::.
CCDS12 DRFVAVCHPLHYTVIMNPQLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTVLRLSFCTEMEIPHFFCD
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pF1KB7 LTYILQLACSDTFLNSTLIYFMTGVLGVFPLLGIIFSYSRIASSIRKMSSSGGKQKALST
: .:.:::::::.:...::: ::::::. . ::.::: .:. :: ..::.: :.::.::
CCDS12 LLEVLKLACSDTFINNVVIYFATGVLGVISFTGIFFSYYKIVFSILRISSAGRKHKAFST
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pF1KB7 CGSHLSVVSLFYGTGIGVHFTSAVTHSSQKISVASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
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CCDS12 CGSHLSVVTLFYGTGFGVYLSSAATPSSRTSLVASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNTDMKRA
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310
pF1KB7 LGSLLSRAASCL
:: :::::
CCDS12 LGRLLSRATFFNGDITAGLS
310 320
>>CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 (319 aa)
initn: 1355 init1: 1012 opt: 1360 Z-score: 1056.3 bits: 203.6 E(32554): 1.6e-52
Smith-Waterman score: 1360; 65.5% identity (86.5% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MEAGNQTGFLEFILLGLSEDPELQPFIFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAISSDSHLHTPMY
:: :::: .:.:::..:: ..: .. ::::::::::..:::::::.::::::::::::
CCDS12 MERGNQTEVGNFLLLGFAEDSDMQLLLHGLFLSMYLVTIIGNLLIILTISSDSHLHTPMY
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pF1KB7 FFLSNLSWVDICFSTCIVPKMLVNIQTENKAISYMDCLTQVYFSMFFPILDTLLLTVMAY
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CCDS12 FFLSNLSFADICFTSTTVPKMLVNIQTQSKMITFAGCLTQIFFFIAFGCLDNLLLTMTAY
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CCDS12 PSEVLKLACSDTFINNIVMYFVTIVLGVFPLCGILFSYSQIFSSVLRVSARG-QHKAFST
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310
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CCDS12 LGRLLLRATSLKEGTIAKLS
300 310
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CCDS12 FFLSNLSFADICFISTTIPKMLINIQTQSRVITYAGCITQMCFFVLFGGLDSLLLAVMAY
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CCDS12 CASHLSVVSLFCCTGLGVYLTSAATHNSHTSATASVMYTVATPMLNPFIYSLRNKDIKRA
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CCDS12 LKMSFRGKQ
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CCDS32 FLLSILSLVDICFTSTTMPKMLVNIQAQAQSINYTGCLTQICFVLVFVGLENGILVMMAY
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CCDS32 LAHILKLACSDVLINNILVYLVTSLLGVVPLSGIIFSYTRIVSSVMKIPSAGGKYKAFSI
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310
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CCDS32 QICFVLFFAGLENCLLAAMAYDRYVAICHPLRYTVIMNPRLCGLLILLSLLTSVVNALL-
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CCDS32 LSLMVLRLSFCTDLEIPLFFCELAQVIQLTCSDTLINNILIYFAACIFGGVPLSGIILSY
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CCDS32 SVFPQMVNPFIYSLRNKDMKGTLRKFIGRIPSLLWCAICFGFRFLE
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CCDS45 MSYFPILFFFFLKRCPSYTEPQNLTGVSEFLLLGLSEDPELQPVLAGLFLSMYLVTVLGN
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CCDS45 MLQLTCFKDVDISNFFCDPSQLLHLRCSDTFINEMVIYFMGAIFGCLPISGILFSYYKIV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]