Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7258
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7258, 311 aa
1>>>pF1KB7258 311 - 311 aa - 311 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4630+/-0.00119; mu= 14.6800+/- 0.069
mean_var=203.2198+/-70.623, 0's: 0 Z-trim(101.5): 403 B-trim: 372 in 1/47
Lambda= 0.089969
statistics sampled from 6042 (6545) to 6042 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.539), E-opt: 0.2 (0.201), width: 16
Scan time: 2.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 2064 281.6 5.2e-76
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1329 186.2 2.7e-47
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 1292 181.4 7.6e-46
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 1279 179.7 2.4e-45
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1264 177.9 1e-44
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1251 176.1 3e-44
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1243 175.1 6.6e-44
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1228 173.1 2.4e-43
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 1210 170.8 1.2e-42
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1203 169.9 2.3e-42
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 1197 169.1 3.9e-42
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 1192 168.4 6.1e-42
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 1191 168.3 6.7e-42
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 1191 168.3 6.7e-42
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 1184 167.5 1.3e-41
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 1181 167.0 1.7e-41
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 1145 162.4 4.2e-40
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 1137 161.3 8.8e-40
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1128 160.1 2e-39
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 1121 159.2 3.7e-39
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1094 155.8 4.4e-38
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 1093 155.6 4.6e-38
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 1091 155.3 5.5e-38
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1091 155.4 5.7e-38
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 1089 155.1 6.5e-38
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 1087 154.8 7.8e-38
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 1083 154.3 1.1e-37
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1080 153.9 1.5e-37
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 1078 153.7 1.8e-37
CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 ( 328) 1067 152.3 4.8e-37
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 1063 151.7 6.8e-37
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1061 151.4 8e-37
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 1055 150.7 1.4e-36
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 1055 150.7 1.4e-36
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 1051 150.2 2e-36
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 1040 148.7 5.3e-36
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 1037 148.3 7e-36
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 1035 148.1 8.4e-36
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 1024 146.6 2.3e-35
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 1023 146.5 2.4e-35
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 1019 146.0 3.6e-35
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 1004 144.1 1.4e-34
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 973 140.0 2.2e-33
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 968 139.4 3.5e-33
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 966 139.1 4.2e-33
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 955 137.7 1.1e-32
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 953 137.4 1.4e-32
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 952 137.3 1.5e-32
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 952 137.3 1.5e-32
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 951 137.2 1.6e-32
>>CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 2064 init1: 2064 opt: 2064 Z-score: 1478.1 bits: 281.6 E(32554): 5.2e-76
Smith-Waterman score: 2064; 100.0% identity (100.0% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MEKINNVTEFIFWGLSQSPEIEKVCFVVFSFFYIIILLGNLLIMLTVCLSNLFKSPMYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MEKINNVTEFIFWGLSQSPEIEKVCFVVFSFFYIIILLGNLLIMLTVCLSNLFKSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LSFLSFVDICYSSVTAPKMIVDLLAKDKTISYVGCMLQLFGVHFFGCTEIFILTVMAYDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LSFLSFVDICYSSVTAPKMIVDLLAKDKTISYVGCMLQLFGVHFFGCTEIFILTVMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YVAICKPLHYMTIMNRETCNKMLLGTWVGGFLHSIIQVALVVQLPFCGPNEIDHYFCDVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YVAICKPLHYMTIMNRETCNKMLLGTWVGGFLHSIIQVALVVQLPFCGPNEIDHYFCDVH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PVLKLACTETYIVGVVVTANSGTIALGSFVILLISYSIILVSLRKQSAEGRRKALSTCGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PVLKLACTETYIVGVVVTANSGTIALGSFVILLISYSIILVSLRKQSAEGRRKALSTCGS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 HIAMVVIFFGPCTFMYMRPDTTFSEDKMVAVFYTIITPMLNPLIYTLRNAEVKNAMKKLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HIAMVVIFFGPCTFMYMRPDTTFSEDKMVAVFYTIITPMLNPLIYTLRNAEVKNAMKKLW
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 GRNVFLEAKGK
:::::::::::
CCDS31 GRNVFLEAKGK
310
>>CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1323 init1: 1323 opt: 1329 Z-score: 962.5 bits: 186.2 E(32554): 2.7e-47
Smith-Waterman score: 1329; 62.3% identity (86.8% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MEKINNVTEFIFWGLSQSPEIEKVCFVVFSFFYIIILLGNLLIMLTVCLSNLFKSPMYFF
: . .::::.:: :: :.: ...:::::: :. ..:: ::.::: .:. . ::::::
CCDS31 MASTSNVTELIFTGLFQDPAVQSVCFVVFLPVYLATVVGNGLIVLTVSISKSLDSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LSFLSFVDICYSSVTAPKMIVDLLAKDKTISYVGCMLQLFGVHFFGCTEIFILTVMAYDR
:: ::.:.: :::. :::.:.::::: :::: ::. :.: :::: .::....:::::
CCDS31 LSCLSLVEISYSSTIAPKFIIDLLAKIKTISLEGCLTQIFFFHFFGVAEILLIVVMAYDC
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130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YVAICKPLHYMTIMNRETCNKMLLGTWVGGFLHSIIQVALVVQLPFCGPNEIDHYFCDVH
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CCDS31 YVAICKPLHYMNIISRQLCHLLVAGSWLGGFCHSIIQILVIIQLPFCGPNVIDHYFCDLQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PVLKLACTETYIVGVVVTANSGTIALGSFVILLISYSIILVSLRKQSAEGRRKALSTCGS
:..:::::.:.. ::.: :::: ... ::.::. :: .:::.::..:::::.::::::.:
CCDS31 PLFKLACTDTFMEGVIVLANSGLFSVFSFLILVSSYIVILVNLRNHSAEGRHKALSTCAS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 HIAMVVIFFGPCTFMYMRPDTTFSEDKMVAVFYTIITPMLNPLIYTLRNAEVKNAMKKLW
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CCDS31 HITVVILFFGPAIFLYMRPSSTFTEDKLVAVFYTVITPMLNPIIYTLRNAEVKIAIRRLW
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 GRNVFLEAKGK
..
CCDS31 SKKENPGRE
>>CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1315 init1: 1288 opt: 1292 Z-score: 936.5 bits: 181.4 E(32554): 7.6e-46
Smith-Waterman score: 1292; 60.3% identity (84.4% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MEKINNVTEFIFWGLSQSPEIEKVCFVVFSFFYIIILLGNLLIMLTVCLSNLFKSPMYFF
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CCDS31 MEKSNNSTLFILLGFSQNKNIEVLCFVLFLFCYIAIWMGNLLIMISITCTQLIHQPMYFF
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pF1KB7 LSFLSFVDICYSSVTAPKMIVDLLAKDKTISYVGCMLQLFGVHFFGCTEIFILTVMAYDR
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CCDS31 LNYLSLSDLCYTSTVTPKLMVDLLAERKTISYNNCMIQLFTTHFFGGIEIFILTGMAYDR
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pF1KB7 YVAICKPLHYMTIMNRETCNKMLLGTWVGGFLHSIIQVALVVQLPFCGPNEIDHYFCDVH
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CCDS31 YVAICKPLHYTIIMSRQKCNTIIIVCCTGGFIHSASQFLLTIFVPFCGPNEIDHYFCDVY
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pF1KB7 PVLKLACTETYIVGVVVTANSGTIALGSFVILLISYSIILVSLRKQSAEGRRKALSTCGS
:.:::::.. ...:..: :::: ::: .::.::.:: .:: ..: ::: : :::.::.:
CCDS31 PLLKLACSNIHMIGLLVIANSGLIALVTFVVLLLSYVFILYTIRAYSAERRSKALATCSS
190 200 210 220 230 240
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pF1KB7 HIAMVVIFFGPCTFMYMRPDTTFSEDKMVAVFYTIITPMLNPLIYTLRNAEVKNAMKKLW
:. .::.::.: :.:.:: :::::::. :.:::::.::.:::::::::.:.::::.:.:
CCDS31 HVIVVVLFFAPALFIYIRPVTTFSEDKVFALFYTIIAPMFNPLIYTLRNTEMKNAMRKVW
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 GRNVFLEAKGK
...:.
CCDS31 CCQILLKRNQLF
310
>>CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1279 init1: 1279 opt: 1279 Z-score: 927.4 bits: 179.7 E(32554): 2.4e-45
Smith-Waterman score: 1279; 60.5% identity (86.5% similar) in 296 aa overlap (5-300:5-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MEKINNVTEFIFWGLSQSPEIEKVCFVVFSFFYIIILLGNLLIMLTVCLSNLFKSPMYFF
::::::...:: .: :....::::: .:... .:::::...:. . .:::::::
CCDS31 MGAKNNVTEFVLFGLFESREMQHTCFVVFFLFHVLTVLGNLLVIITINARKTLKSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LSFLSFVDICYSSVTAPKMIVDLLAKDKTISYVGCMLQLFGVHFFGCTEIFILTVMAYDR
:: :::.:::: :.: ::::.: ... : ::. ::: :::..:::: ::::.::.:::::
CCDS31 LSQLSFADICYPSTTIPKMIADTFVEHKIISFNGCMTQLFSAHFFGGTEIFLLTAMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YVAICKPLHYMTIMNRETCNKMLLGTWVGGFLHSIIQVALVVQLPFCGPNEIDHYFCDVH
:::::.:::: .::. . :. . ..:..::::::.:. :.::::::::::::..:::::
CCDS31 YVAICRPLHYTAIMDCRKCGLLAGASWLAGFLHSILQTLLTVQLPFCGPNEIDNFFCDVH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PVLKLACTETYIVGVVVTANSGTIALGSFVILLISYSIILVSLRKQSAEGRRKALSTCGS
:.:::::..::.::..:.:::: :.:.:: ::.::: :::..::.::.: ::::.:::::
CCDS31 PLLKLACADTYMVGLIVVANSGMISLASFFILIISYVIILLNLRSQSSEDRRKAVSTCGS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 HIAMVVIFFGPCTFMYMRPDTTFSEDKMVAVFYTIITPMLNPLIYTLRNAEVKNAMKKLW
:. :.. . : :::.::.::.. ::.. .: .. :.:::::::::: .:::::.::.
CCDS31 HVITVLLVLMPPMFMYIRPSTTLAADKLIILFNIVMPPLLNPLIYTLRNNDVKNAMRKLF
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 GRNVFLEAKGK
CCDS31 RVKRSLGEK
>>CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 (370 aa)
initn: 1278 init1: 1121 opt: 1264 Z-score: 916.2 bits: 177.9 E(32554): 1e-44
Smith-Waterman score: 1264; 58.4% identity (84.8% similar) in 303 aa overlap (1-302:55-357)
10 20 30
pF1KB7 MEKINNVTEFIFWGLSQSPEIEKVCFVVFS
:.. . ::::.. ::::.:..... ::::
CCDS31 PQIDLKQIFLCPNCRLYMIPVGAFIFSLGNMQNQSFVTEFVLLGLSQNPNVQEIVFVVFL
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80
pF1KB7 FFYIIILLGNLLIMLTVCLS-NLFKSPMYFFLSFLSFVDICYSSVTAPKMIVDLLAKDKT
: :: . ::.::..:. : :. :::::::.::::.: :.::: .:::::: : ::
CCDS31 FVYIATVGGNMLIVVTILSSPALLVSPMYFFLGFLSFLDACFSSVITPKMIVDSLYVTKT
90 100 110 120 130 140
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 ISYVGCMLQLFGVHFFGCTEIFILTVMAYDRYVAICKPLHYMTIMNRETCNKMLLGTWVG
::. :::.:::. :::. .:...::.::::::::::::::: .::::. :. .. .:.:
CCDS31 ISFEGCMMQLFAEHFFAGVEVIVLTAMAYDRYVAICKPLHYSSIMNRRLCGILMGVAWTG
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 GFLHSIIQVALVVQLPFCGPNEIDHYFCDVHPVLKLACTETYIVGVVVTANSGTIALGSF
:.:::.::. .. :::::::: :.:..::..:.:.::::.:.: :..:. ::: : . .:
CCDS31 GLLHSMIQILFTFQLPFCGPNVINHFMCDLYPLLELACTDTHIFGLMVVINSGFICIINF
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 VILLISYSIILVSLRKQSAEGRRKALSTCGSHIAMVVIFFGPCTFMYMRPDTTFSEDKMV
.::.::..::.::: .:.::: :::::::::::.:..:: :: :.: :: ..:: :::.
CCDS31 SLLLVSYAVILLSLRTHSSEGRWKALSTCGSHIAVVILFFVPCIFVYTRPPSAFSLDKMA
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310
pF1KB7 AVFYTIITPMLNPLIYTLRNAEVKNAMKKLWGRNVFLEAKGK
:.:: :..:.:::::::.:: :::.::...:.:
CCDS31 AIFYIILNPLLNPLIYTFRNKEVKQAMRRIWNRLMVVSDEKENIKL
330 340 350 360 370
>>CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 1251 init1: 1251 opt: 1251 Z-score: 907.8 bits: 176.1 E(32554): 3e-44
Smith-Waterman score: 1251; 56.5% identity (82.9% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MEKINNVTEFIFWGLSQSPEIEKVCFVVFSFFYIIILLGNLLIMLTVCLSNLFKSPMYFF
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CCDS31 MQQNNSVPEFILLGLTQDPLRQKIVFVIFLIFYMGTVVGNMLIIVTIKSSRTLGSPMYFF
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310
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... : ::
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310
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CCDS31 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMYFF
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CCDS31 LAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHIFGGSEVFLLLVMAYDC
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CCDS31 PLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFLLLLISYGVILHSLKNLSQKGRQKALSTCSS
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CCDS31 HMTVVVFFFVPCIFMYARPARTFPIDKSVSVFYTVITPMLNPLIYTLRNSEMTSAMKKLW
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CCDS31 RRDLISSST
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CCDS32 KLRIKPCGIPLPC
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]