Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7255
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7255, 311 aa
1>>>pF1KB7255 311 - 311 aa - 311 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6101+/-0.00151; mu= 14.5199+/- 0.087
mean_var=162.3042+/-51.898, 0's: 0 Z-trim(101.2): 388 B-trim: 779 in 2/45
Lambda= 0.100672
statistics sampled from 5933 (6417) to 5933 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.531), E-opt: 0.2 (0.197), width: 16
Scan time: 2.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 2041 309.4 2.3e-84
CCDS7782.1 OR5P2 gene_id:120065|Hs108|chr11 ( 322) 1232 191.9 5.5e-49
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1056 166.3 2.7e-41
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1053 165.9 3.7e-41
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1035 163.3 2.2e-40
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 1021 161.3 9.6e-40
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1020 161.1 1e-39
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1008 159.4 3.4e-39
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1008 159.4 3.4e-39
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1007 159.2 3.7e-39
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1005 158.9 4.7e-39
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1002 158.5 6.6e-39
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1001 158.4 7.4e-39
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 999 158.0 8.4e-39
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 999 158.1 8.6e-39
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 995 157.5 1.3e-38
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 995 157.5 1.3e-38
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 994 157.3 1.4e-38
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 994 157.3 1.4e-38
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 991 156.9 1.9e-38
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 989 156.6 2.3e-38
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 989 156.6 2.3e-38
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 986 156.2 3.1e-38
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 984 155.9 3.8e-38
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 983 155.7 4.2e-38
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 979 155.1 6.3e-38
CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 974 154.4 1e-37
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 970 153.8 1.6e-37
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 969 153.8 1.9e-37
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 968 153.5 1.9e-37
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 967 153.4 2.1e-37
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 966 153.3 2.4e-37
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 965 153.1 2.6e-37
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 959 152.2 4.7e-37
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 958 152.1 5.2e-37
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 957 151.9 5.7e-37
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 947 150.5 1.6e-36
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 942 149.8 2.6e-36
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 941 149.6 2.8e-36
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 941 149.6 2.9e-36
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 940 149.5 3.2e-36
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 940 149.5 3.2e-36
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 939 149.3 3.5e-36
CCDS31536.1 OR9G1 gene_id:390174|Hs108|chr11 ( 305) 934 148.6 5.7e-36
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 934 148.6 5.8e-36
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 932 148.3 7.2e-36
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 929 147.9 9.6e-36
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 927 147.6 1.2e-35
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 926 147.4 1.3e-35
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 925 147.3 1.4e-35
>>CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 2041 init1: 2041 opt: 2041 Z-score: 1628.0 bits: 309.4 E(32554): 2.3e-84
Smith-Waterman score: 2041; 100.0% identity (100.0% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGTGNDTTVVEFTLLGLSEDTTVCAILFLVFLGIYVVTLMGNISIIVLIRRSHHLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MGTGNDTTVVEFTLLGLSEDTTVCAILFLVFLGIYVVTLMGNISIIVLIRRSHHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 IFLCHLAFVDIGYSSSVTPVMLMSFLRKETSLPVAGCVAQLCSVVTFGTAECFLLAAMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 IFLCHLAFVDIGYSSSVTPVMLMSFLRKETSLPVAGCVAQLCSVVTFGTAECFLLAAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYVAICSPLLYSTCMSPGVCIILVGMSYLGGCVNAWTFIGCLLRLSFCGPNKVNHFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DRYVAICSPLLYSTCMSPGVCIILVGMSYLGGCVNAWTFIGCLLRLSFCGPNKVNHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 YSPLLKLACSHDFTFEIIPAISSGSIIVATVCVIAISYIYILITILKMHSTKGRHKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 YSPLLKLACSHDFTFEIIPAISSGSIIVATVCVIAISYIYILITILKMHSTKGRHKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CTSHLTAVTLFYGTITFIYVMPKSSYSTDQNKVVSVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 CTSHLTAVTLFYGTITFIYVMPKSSYSTDQNKVVSVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 LKRELRIKIFS
:::::::::::
CCDS77 LKRELRIKIFS
310
>>CCDS7782.1 OR5P2 gene_id:120065|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 1264 init1: 1172 opt: 1232 Z-score: 992.9 bits: 191.9 E(32554): 5.5e-49
Smith-Waterman score: 1232; 64.0% identity (83.1% similar) in 308 aa overlap (4-311:7-307)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MGTGNDTTVVEFTLLGLSEDTTVCAILFLVFLGIYVVTLMGNISIIVLIRRSHHLHT
:: :... : ::::..: . .:::...:. ::.:::.::: : .::
CCDS77 MNSLKDGNHTALTGFILLGLTDDPILRVILFMIILS-------GNLSIIILIRISSQLHH
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 PMYIFLCHLAFVDIGYSSSVTPVMLMSFLRKETSLPVAGCVAQLCSVVTFGTAECFLLAA
:::.:: ::::.:..::::::: ::..:: ..... ::. :: :.. :.:.:: ::::
CCDS77 PMYFFLSHLAFADMAYSSSVTPNMLVNFLVERNTVSYLGCAIQLGSAAFFATVECVLLAA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 MAYDRYVAICSPLLYSTCMSPGVCIILVGMSYLGGCVNAWTFIGCLLRLSFCGPNKVNHF
:::::.::::::::::: :: : . :. . :..: . : .. . : :::::.::::
CCDS77 MAYDRFVAICSPLLYSTKMSTQVSVQLLLVVYIAGFLIAVSYTTSFYFLLFCGPNQVNHF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 FCDYSPLLKLACSHDFTFEIIPAISSGSIIVATVCVIAISYIYILITILKMHSTKGRHKA
:::..:::.:.:: . .. ..:::::::.::::::. :::::::::::.::.:.:::
CCDS77 FCDFAPLLELSCSDISVSTVVLSFSSGSIIVVTVCVIAVCYIYILITILKMRSTEGHHKA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 FSTCTSHLTAVTLFYGTITFIYVMPKSSYSTDQNKVVSVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEI
:::::::::.:::::::::::::::. ::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS77 FSTCTSHLTVVTLFYGTITFIYVMPNFSYSTDQNKVVSVLYTVVIPMLNPLIYSLRNKEI
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KB7 KGALKRELRIKIFS
:::::::: ::.:
CCDS77 KGALKRELVRKILSHDACYFSRTSNNDIT
300 310 320
>>CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 1086 init1: 1039 opt: 1056 Z-score: 854.8 bits: 166.3 E(32554): 2.7e-41
Smith-Waterman score: 1056; 54.1% identity (79.2% similar) in 303 aa overlap (5-305:11-311)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MGTGNDTTVVEFTLLGLSEDTTVCAILFLVFLGIYVVTLMGNISIIVLIRRSHH
:.: :.:: :::::.. . ..:: .:: ::.....::...::::. .
CCDS31 MRLMKEVRGRNQTEVTEFLLLGLSDNPDLQGVLFALFLLIYMANMVGNLGMIVLIKIDLC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LHTPMYIFLCHLAFVDIGYSSSVTPVMLMSFLRKETSLPVAGCVAQLCSVVTFGTAECFL
::::::.:: :.::: .::::::: ::.... .. .. ::.::. .: .::::
CCDS31 LHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAENKAISFHGCAAQFYFFGSFLGTECFL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LAAMAYDRYVAICSPLLYSTCMSPGVCIILVGMSYLGGCVNAWTFIGCLLRLSFCGPNKV
:: ::::::.:: .:::: . .: .:..:.. :.:.:: :: : .:::::: :..
CCDS31 LAMMAYDRYAAIWNPLLYPVLVSGRICFLLIATSFLAGCGNAAIHTGMTFRLSFCGSNRI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 NHFFCDYSPLLKLACSHDFTFE--IIPAISSGSIIVATVCVIAISYIYILITILKMHSTK
:::.:: :::::.:: : :. .: :.:: :... : .. :::. :.:..::: : .
CCDS31 NHFYCDTPPLLKLSCS-DTHFNGIVIMAFSS-FIVISCVMIVLISYLCIFIAVLKMPSLE
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 GRHKAFSTCTSHLTAVTLFYGTITFIYVMPKSSYSTDQNKVVSVFYTVVIPMLNPLIYSL
:::::::::.:.: :::.:.::: :.:. : :::: .:.:::::::::.::.::::::::
CCDS31 GRHKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSMEQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIYSL
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KB7 RNKEIKGALKRELRIKIFS
.::..: :::. :
CCDS31 KNKDVKKALKKILWKHIL
300 310
>>CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1053 init1: 1053 opt: 1053 Z-score: 852.5 bits: 165.9 E(32554): 3.7e-41
Smith-Waterman score: 1053; 53.4% identity (75.1% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGTGNDTTVVEFTLLGLSEDTTVCAILFLVFLGIYVVTLMGNISIIVLIRRSHHLHTPMY
::. : .::.:: : ::.:.. . :: .:::::.::..::.:.: .:: ...::::::
CCDS31 MGVKNHSTVTEFLLSGLTEQAELQLPLFCLFLGIYTVTVVGNLSMISIIRLNRQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 IFLCHLAFVDIGYSSSVTPVMLMSFLRKETSLPVAGCVAQLCSVVTFGTAECFLLAAMAY
:: :.:.:. ::: .:: :: .:: .. :. .::. :: . .::..:::::
CCDS31 YFLSSLSFLDFCYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGCMIQLFFFCVCVISECYMLAAMAC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYVAICSPLLYSTCMSPGVCIILVGMSYLGGCVNAWTFIGCLLRLSFCGPNKVNHFFCD
:::::::::::: . ::: :: .::. . : ..: ::.::::::: : ..:.:::
CCDS31 DRYVAICSPLLYRVIMSPRVCSLLVAAVFSVGFTDAVIHGGCILRLSFCGSNIIKHYFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 YSPLLKLACSHDFTFEIIPAISSGSIIVATVCVIAISYIYILITILKMHSTKGRHKAFST
::.::.:: . :.. . .: .::: .: ::: .:: .::..:: ::: :::::
CCDS31 IVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILTSILRIHSKKGRCKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CTSHLTAVTLFYGTITFIYVMPKSSYSTDQNKVVSVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKGA
:.:::::: .:::.. .:. : :: : :.:: :::::.:: :::::::::::.:...:
CCDS31 CSSHLTAVLMFYGSLMSMYLKPASSSSLTQEKVSSVFYTTVILMLNPLIYSLRNNEVRNA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 LKRELRIKIFS
: . :: ::
CCDS31 LMKLLRRKISLSPG
310
>>CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1028 init1: 634 opt: 1035 Z-score: 838.4 bits: 163.3 E(32554): 2.2e-40
Smith-Waterman score: 1035; 52.2% identity (79.1% similar) in 301 aa overlap (5-305:3-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGTGNDTTVVEFTLLGLSEDTTVCAILFLVFLGIYVVTLMGNISIIVLIRRSHHLHTPMY
:.: :.:: ::::..: .. :.:.:: ::..::.:: ...:.:. . :::::::
CCDS31 MENSTEVTEFILLGLTDDPNLQIPLLLAFLFIYLITLLGNGGMMVIIHSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 IFLCHLAFVDIGYSSSVTPVMLMSFLRKETSLPVAGCVAQLCSVVTFGTAECFLLAAMAY
.:: .:..::.::::.:.: . .. . .. ::.::. : :.:.::.:::.:::
CCDS31 FFLSNLSLVDLGYSSAVAPKTVAALRSGDKAISYDGCAAQFFFFVGFATVECYLLASMAY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYVAICSPLLYSTCMSPGVCIILVGMSYLGGCVNAWTFIGCLLRLSFCGPNKVNHFFCD
::..:.: :: :.: :. ::: .:. ::..: .:: . .:::::: :..::::::
CCDS31 DRHAAVCRPLHYTTTMTAGVCALLATGSYVSGFLNASIHAAGTFRLSFCGSNEINHFFCD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 YSPLLKLACSHDFTFEIIPAISSGSIIVATVCVIAISYIYILITILKMHSTKGRHKAFST
::: :.:: : . . .. .: . :. :: :::..: ::: .:::..:..:.:::
CCDS31 IPPLLALSCS-DTRISKLVVFVAGFNVFFTLLVILISYFFICITIQRMHSAEGQKKVFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CTSHLTAVTLFYGTITFIYVMPKSSYSTDQNKVVSVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKGA
:.:::::...::::: :.:..:.:: :.: .:..::::::::::::::::::::::.:.:
CCDS31 CASHLTALSIFYGTIIFMYLQPNSSQSVDTDKIASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKSA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KB7 LKRELRIKIFS
: . :
CCDS31 LWKILNKLYPQY
300
>>CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 (340 aa)
initn: 1026 init1: 981 opt: 1021 Z-score: 827.0 bits: 161.3 E(32554): 9.6e-40
Smith-Waterman score: 1021; 51.2% identity (76.9% similar) in 303 aa overlap (5-307:35-337)
10 20 30
pF1KB7 MGTGNDTTVVEFTLLGLSEDTTVCAILFLVFLGI
: : :. : : :...: . ..:::.:..:
CCDS31 FTGYNLYNLQVKTEMDKLSSGLDIYRNPLKNKTEVTMFILTGFTDDFELQVFLFLLFFAI
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
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130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
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CCDS31 HATIHIVATFSLSFCGSNEIRHVFCDMPPLLAISCSDTHTNQLLLFYFVGSIEIVTILIV
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280 290 300 310
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CCDS31 VILIRTDSHLHTPMYFFIGNLSFLDFWYTSVYTPKILASCVSEDKRISLAGCGAQLFFSC
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CCDS31 NPLIYSLRNKDIKEAFRKATQTIQPQT
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310
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CCDS31 LIRVMQRRQDSR
300 310
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]