Result of FASTA (omim) for
pF1KB7240
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7240, 311 aa
1>>>pF1KB7240 311 - 311 aa - 311 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4536+/-0.000484; mu= 20.8263+/- 0.030
mean_var=87.7663+/-22.368, 0's: 0 Z-trim(106.8): 275 B-trim: 887 in 1/48
Lambda= 0.136902
statistics sampled from 14486 (14875) to 14486 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.5), E-opt: 0.2 (0.174), width: 16
Scan time: 6.900
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 1026 213.4 4.8e-55
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NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 953 199.0 1e-50
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 953 199.0 1.1e-50
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 922 192.9 7.3e-49
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 914 191.3 2.2e-48
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 907 189.9 5.6e-48
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 879 184.4 2.6e-46
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NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 863 181.2 2.4e-45
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 863 181.2 2.4e-45
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 857 180.0 5.4e-45
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 855 179.6 7e-45
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 845 177.6 2.7e-44
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 826 173.9 3.8e-43
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 819 172.5 9.7e-43
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 806 169.9 5.8e-42
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 802 169.1 9.7e-42
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 773 163.4 5.2e-40
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 518 113.1 7.7e-25
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 457 101.0 3.3e-21
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 218 53.9 5.6e-07
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 216 53.4 6.8e-07
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 200 50.4 7e-06
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 200 50.4 7.4e-06
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 200 50.4 7.4e-06
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 200 50.4 7.4e-06
NP_003599 (OMIM: 604620) psychosine receptor [Homo ( 337) 192 48.7 1.9e-05
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 188 47.9 3.2e-05
XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 188 47.9 3.3e-05
XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 188 48.0 3.5e-05
XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 188 48.0 3.6e-05
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 188 48.0 3.6e-05
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 188 48.0 3.6e-05
XP_011508789 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 403) 188 48.0 3.7e-05
NP_006047 (OMIM: 604153) neuromedin-U receptor 1 [ ( 426) 188 48.1 3.9e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 184 47.1 5.6e-05
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 182 46.7 7.3e-05
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 183 47.1 7.8e-05
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 183 47.1 8e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 181 46.5 8.7e-05
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 175 45.5 0.00023
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 173 45.1 0.0003
NP_001050 (OMIM: 162332,614840) neuromedin-K recep ( 465) 173 45.1 0.00032
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 170 44.4 0.00039
NP_001048 (OMIM: 162321) substance-K receptor [Hom ( 398) 168 44.1 0.00057
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 165 43.6 0.00095
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 164 43.3 0.001
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 162 42.8 0.0012
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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300 310
pF1KB7 VSLKKMLQRRTLL
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310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
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310
pF1KB7 LKKMLQRRTLL
: ....:.
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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pF1KB7 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHTPMY
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pF1KB7 LKKMLQRRTLL
:::.. :
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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pF1KB7 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHTPMY
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pF1KB7 YFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAY
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pF1KB7 DRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCMFRVQFCKFDLINHYFCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KB7 LLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILHIRSTEGRSKAFST
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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pF1KB7 LKKMLQRRTLL
:::.. :
NP_036 LKKVVGRVVFSV
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>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
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pF1KB7 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIW
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pF1KB7 FDLINHYFCDLLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILHIRS
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XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
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pF1KB7 SLRNKDVHVSLKKMLQRRTLL
::::. .. .:::.. :
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
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pF1KB7 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHTPM
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
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120 130 140 150 160 170
pF1KB7 YDRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCMFRVQFCKFDLINHYFC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
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180 190 200 210 220 230
pF1KB7 DLLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILHIRSTEGRSKAFS
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
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240 250 260 270 280 290
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 SLKKMLQRRTLL
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NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 996 init1: 908 opt: 914 Z-score: 989.7 bits: 191.3 E(85289): 2.2e-48
Smith-Waterman score: 914; 43.5% identity (76.1% similar) in 301 aa overlap (5-305:8-308)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHT
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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pF1KB7 PMYYFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAA
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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pF1KB7 MAYDRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCMFRVQFCKFDLINHY
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
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pF1KB7 FCDLLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILHIRSTEGRSKA
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
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300 310
pF1KB7 HVSLKKMLQRRTLL
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NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 992 init1: 749 opt: 907 Z-score: 982.3 bits: 189.9 E(85289): 5.6e-48
Smith-Waterman score: 907; 44.2% identity (77.2% similar) in 303 aa overlap (5-307:5-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHTPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
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pF1KB7 YFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAY
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
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pF1KB7 DRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCMFRVQFCKFDLINHYFCD
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
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pF1KB7 LLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILHIRSTEGRSKAFST
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
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pF1KB7 CSSHMLAVVIFFGSAAFMYLQPSSISSMDQGKVSSVFYTIIVPMLNPLIYSLRNKDVHVS
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKS--SKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
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310
pF1KB7 LKKMLQRRTLL
:.:. :
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo (312 aa)
initn: 847 init1: 727 opt: 879 Z-score: 952.3 bits: 184.4 E(85289): 2.6e-46
Smith-Waterman score: 879; 43.3% identity (74.6% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHTPMY
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NP_002 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISSDSRLHTPVY
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 YFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAY
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NP_002 FFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVALDNLILAVMAY
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pF1KB7 DRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCMFRVQFCKFDLINHYFCD
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NP_002 DRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVTFCGSRKIHYIFCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KB7 LLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILHIRSTEGRSKAFST
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NP_002 MYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAILRIPSVSKKYKAFST
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pF1KB7 CSSHMLAVVIFFGSAAFMYLQPSSISSMDQGKVSSVFYTIIVPMLNPLIYSLRNKDVHVS
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NP_002 CASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYSV-KDSVATVMYAVVTPMMNPFIYSLRNKDMHGA
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310
pF1KB7 LKKMLQRRTLL
: ..:..
NP_002 LGRLLDKHFKRLT
300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 875 init1: 831 opt: 863 Z-score: 935.2 bits: 181.2 E(85289): 2.4e-45
Smith-Waterman score: 863; 42.7% identity (74.9% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
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pF1KB7 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 YFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KB7 DRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCMFRVQFCKFDLINHYFCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KB7 LLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILHIRSTEGRSKAFST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
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pF1KB7 CSSHMLAVVIFFGSAAFMYLQPSSISSMDQGKVSSVFYTIIVPMLNPLIYSLRNKDVHVS
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
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310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]