Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7230
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7230, 351 aa
1>>>pF1KB7230 351 - 351 aa - 351 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7030+/-0.00112; mu= 14.2557+/- 0.066
mean_var=168.0666+/-69.089, 0's: 0 Z-trim(103.9): 392 B-trim: 905 in 2/47
Lambda= 0.098931
statistics sampled from 7005 (7631) to 7005 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.579), E-opt: 0.2 (0.234), width: 16
Scan time: 2.360
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34541.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 ( 351) 2393 354.6 7.3e-98
CCDS5157.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 ( 306) 2092 311.5 5.8e-85
CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6 ( 337) 973 151.9 7.3e-37
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 ( 345) 894 140.6 1.8e-33
CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 ( 348) 886 139.5 4.1e-33
CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6 ( 342) 851 134.5 1.3e-31
CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6 ( 339) 755 120.8 1.7e-27
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 519 87.1 2.4e-17
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 519 87.2 2.6e-17
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 420 73.0 4.6e-13
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 420 73.0 4.6e-13
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 420 73.1 4.6e-13
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 420 73.1 4.6e-13
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 420 73.1 4.7e-13
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 420 73.1 4.7e-13
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 420 73.1 4.8e-13
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 420 73.1 4.8e-13
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 420 73.1 4.9e-13
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 420 73.2 5.2e-13
CCDS55068.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 319) 375 66.5 3.5e-11
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 374 66.5 4.3e-11
CCDS8652.1 GPR19 gene_id:2842|Hs108|chr12 ( 415) 373 66.4 5e-11
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 368 65.6 7.9e-11
CCDS55071.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 300) 366 65.2 8.3e-11
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 367 65.6 9.6e-11
>>CCDS34541.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 (351 aa)
initn: 2393 init1: 2393 opt: 2393 Z-score: 1870.4 bits: 354.6 E(32554): 7.3e-98
Smith-Waterman score: 2393; 100.0% identity (100.0% similar) in 351 aa overlap (1-351:1-351)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAVSSEQHELSHFKRTQTKKEKFNCSEYGNRSCPENERSLGVRVAMYSFMAGSIFITIFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MAVSSEQHELSHFKRTQTKKEKFNCSEYGNRSCPENERSLGVRVAMYSFMAGSIFITIFG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 NLAMIISISYFKQLHTPTNFLILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NLAMIISISYFKQLHTPTNFLILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIYY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 SFDLMLSITSIFHLCSVAIDRFYAICYPLLYSTKITIPVIKRLLLLCWSVPGAFAFGVVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SFDLMLSITSIFHLCSVAIDRFYAICYPLLYSTKITIPVIKRLLLLCWSVPGAFAFGVVF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SEAYADGIEGYDILVACSSSCPVMFNKLWGTTLFMAGFFTPGSMMVGIYGKIFAVSRKHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SEAYADGIEGYDILVACSSSCPVMFNKLWGTTLFMAGFFTPGSMMVGIYGKIFAVSRKHA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 HAINNLRENQNNQVKKDKKAAKTLGIVIGVFLLCWFPCFFTILLDPFLNFSTPVVLFDAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HAINNLRENQNNQVKKDKKAAKTLGIVIGVFLLCWFPCFFTILLDPFLNFSTPVVLFDAL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB7 TWFGYFNSTCNPLIYGFFYPWFRRALKYILLGKIFSSCFHNTILCMQKESE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TWFGYFNSTCNPLIYGFFYPWFRRALKYILLGKIFSSCFHNTILCMQKESE
310 320 330 340 350
>>CCDS5157.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 (306 aa)
initn: 2092 init1: 2092 opt: 2092 Z-score: 1638.8 bits: 311.5 E(32554): 5.8e-85
Smith-Waterman score: 2092; 100.0% identity (100.0% similar) in 306 aa overlap (46-351:1-306)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 TQTKKEKFNCSEYGNRSCPENERSLGVRVAMYSFMAGSIFITIFGNLAMIISISYFKQLH
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 MYSFMAGSIFITIFGNLAMIISISYFKQLH
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 TPTNFLILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIYYSFDLMLSITSIFHLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 TPTNFLILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIYYSFDLMLSITSIFHLC
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 SVAIDRFYAICYPLLYSTKITIPVIKRLLLLCWSVPGAFAFGVVFSEAYADGIEGYDILV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 SVAIDRFYAICYPLLYSTKITIPVIKRLLLLCWSVPGAFAFGVVFSEAYADGIEGYDILV
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 ACSSSCPVMFNKLWGTTLFMAGFFTPGSMMVGIYGKIFAVSRKHAHAINNLRENQNNQVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 ACSSSCPVMFNKLWGTTLFMAGFFTPGSMMVGIYGKIFAVSRKHAHAINNLRENQNNQVK
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 KDKKAAKTLGIVIGVFLLCWFPCFFTILLDPFLNFSTPVVLFDALTWFGYFNSTCNPLIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 KDKKAAKTLGIVIGVFLLCWFPCFFTILLDPFLNFSTPVVLFDALTWFGYFNSTCNPLIY
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350
pF1KB7 GFFYPWFRRALKYILLGKIFSSCFHNTILCMQKESE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 GFFYPWFRRALKYILLGKIFSSCFHNTILCMQKESE
280 290 300
>>CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6 (337 aa)
initn: 976 init1: 566 opt: 973 Z-score: 775.2 bits: 151.9 E(32554): 7.3e-37
Smith-Waterman score: 973; 43.3% identity (75.6% similar) in 307 aa overlap (30-336:21-326)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAVSSEQHELSHFKRTQTKKEKFNCSEYGNRSCPENERSLGVRVAMYSFMAGSIFITIFG
: :::.. ..::.....: :....: ..:
CCDS51 MRAVFIQGAEEHPAAFCYQVNGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 NLAMIISISYFKQLHTPTNFLILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIYY
:. . ...:::: ::::::::.::.:..:..::. ..: : :::::.::.:: .:...
CCDS51 NVFVAFAVSYFKALHTPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 SFDLMLSITSIFHLCSVAIDRFYAICYPLLYSTKITIPVIKRLLLLCWSVPGAFAFGVVF
.: .. .::::::: ..::: ::: :::: .:.:. : : .: :.::.:.. ..
CCDS51 YLDTLFCLTSIFHLCFISIDRHCAICDPLLYPSKFTVRVALRYILAGWGVPAAYTSLFLY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SEAYADGIEGYDILVACSSSCPVMFNKLWGTTLFMAGFFTPGSMMVGIYGKIFAVSRKHA
... . . . : .:: ...::.:: : ::.: .:...: :::.:. ..:
CCDS51 TDVVETRLSQWLEEMPCVGSCQLLLNKFWGWLNF-PLFFVPCLIMISLYVKIFVVATRQA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 HAINNLRENQNNQVKKDKKAAKTLGIVIGVFLLCWFPCFFTILLDPFLNFSTPVVLFDAL
. :..: .. . .:...::::::::..:..::::.: . ..: .:.: :: ..:: .
CCDS51 QQITTLSKSLAGAAKHERKAAKTLGIAVGIYLLCWLPFTIDTMVDSLLHFITPPLVFDIF
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB7 TWFGYFNSTCNPLIYGFFYPWFRRALKYILLGKIFSSCFHNTILCMQKESE
::.::::.:::.:: : : :::.::: : :.::
CCDS51 IWFAYFNSACNPIIYVFSYQWFRKALKLTLSQKVFSPQTRTVDLYQE
300 310 320 330
>>CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 (345 aa)
initn: 867 init1: 500 opt: 894 Z-score: 714.2 bits: 140.6 E(32554): 1.8e-33
Smith-Waterman score: 894; 39.6% identity (70.1% similar) in 321 aa overlap (25-337:14-333)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAVSSEQHELSHFKRTQTKKEKFNCSEYGNRSCPENERSLGVRVAMYSFMAGSIFITIFG
: : :: . : : :: .: .. . ...::
CCDS51 MSSNSSLLVAVQLCYANVNGSCVKIPFSPGSRVILYIVFGFGAVLAVFG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 NLAMIISISYFKQLHTPTNFLILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIYY
:: ..::: .:::::.:::::. :.: .:::.: :.::.::.:.::.::::: .:: ..
CCDS51 NLLVMISILHFKQLHSPTNFLVASLACADFLVGVTVMPFSMVRTVESCWYFGRSFCTFHT
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 SFDLMLSITSIFHLCSVAIDRFYAICYPLLYSTKITIPVIKRLLLLCWSVPGAFAFGVVF
:. . .:.:::: ..:::. :. ::.: ::.:. : . . : .: .. .: .
CCDS51 CCDVAFCYSSLFHLCFISIDRYIAVTDPLVYPTKFTVSVSGICISVSWILPLMYSGAVFY
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SEAYADGIEGYDILVACSSSCPVMFNKLWGTTLFMAGFFTPGSMMVGIYGKIFAVSRKHA
. .: ::.: . . : ..: .. :. : : :.. :: : .:. .::.:: :.:..:
CCDS51 TGVYDDGLEELSDALNCIGGCQTVVNQNWVLTDFLS-FFIPTFIMIILYGNIFLVARRQA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KB7 HAINNL-------RENQNNQV-KKDKKAAKTLGIVIGVFLLCWFPCFFTILLDPFLNFST
. :.: :. . .: ....:::::::... .:.. :.: . :.: :..: :
CCDS51 KKIENTGSKTESSSESYKARVARRERKAAKTLGVTVVAFMISWLPYSIDSLIDAFMGFIT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 PVVLFDALTWFGYFNSTCNPLIYGFFYPWFRRALKYILLGKIFSSCFHNTILCMQKESE
:. ... : .:.::. :::::..::::::.:.: :. :.....
CCDS51 PACIYEICCWCAYYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKVIVTGQVLKNSSATMNLFSEHI
290 300 310 320 330 340
>>CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 (348 aa)
initn: 882 init1: 551 opt: 886 Z-score: 708.0 bits: 139.5 E(32554): 4.1e-33
Smith-Waterman score: 886; 40.2% identity (70.1% similar) in 321 aa overlap (25-337:14-333)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAVSSEQHELSHFKRTQTKKEKFNCSEYGNRSCPENERSLGVRVAMYSFMAGSIFITIFG
: . :.:: .. : : : .:. .. . .. ::
CCDS75 MVNNFSQAEAVELCYKNVNESCIKTPYSPGPRSILYAVLGFGAVLAAFG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 NLAMIISISYFKQLHTPTNFLILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIYY
:: ..:.: .:::::::::::: :.: .:::.: :.::.: .::::.::::: ..::..
CCDS75 NLLVMIAILHFKQLHTPTNFLIASLACADFLVGVTVMPFSTVRSVESCWYFGDSYCKFHT
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 SFDLMLSITSIFHLCSVAIDRFYAICYPLLYSTKITIPVIKRLLLLCWSVPGAFAFGVVF
:: . ..:.:::: ...::. :. :: : ::.:. : ..: : ...:.. .
CCDS75 CFDTSFCFASLFHLCCISVDRYIAVTDPLTYPTKFTVSVSGICIVLSWFFSVTYSFSIFY
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SEAYADGIEGYDILVACSSSCPVMFNKLWGTTLFMAGFFTPGSMMVGIYGKIFAVSRKHA
. : .::: . ..: ..: . .:. : :. :: :. :: ::.::: :....:
CCDS75 TGANEEGIEELVVALTCVGGCQAPLNQNWVLLCFLL-FFIPNVAMVFIYSKIFLVAKHQA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KB7 HAINNL-------RENQNNQV-KKDKKAAKTLGIVIGVFLLCWFPCFFTILLDPFLNFST
. :.. :. ...: :...::::::::....::. :.: . ..: ..:: :
CCDS75 RKIESTASQAQSSSESYKERVAKRERKAAKTLGIAMAAFLVSWLPYLVDAVIDAYMNFIT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 PVVLFDALTWFGYFNSTCNPLIYGFFYPWFRRALKYILLGKIFSSCFHNTILCMQKESE
: ... :.: :.::. :::::.::: :: .:.: :. ::.. .
CCDS75 PPYVYEILVWCVYYNSAMNPLIYAFFYQWFGKAIKLIVSGKVLRTDSSTTNLFSEEVETD
290 300 310 320 330 340
>>CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6 (342 aa)
initn: 846 init1: 516 opt: 851 Z-score: 681.1 bits: 134.5 E(32554): 1.3e-31
Smith-Waterman score: 851; 38.5% identity (68.6% similar) in 322 aa overlap (25-337:13-332)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAVSSEQHELSHFKRTQTKKEKFNCSEYGNRSCPENERSLGVRVAMYS-FMAGSIFITIF
: : : :: :. : : :: .:. : ::. ...:
CCDS51 MTSNFSQPVVQLCYEDVNGSCIETPYSPGSRVILYTAFSFGSL-LAVF
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 GNLAMIISISYFKQLHTPTNFLILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIY
::: .. :. .:::::.:::::: :.: .:::.: :.: .::.:.::.::::: :: ..
CCDS51 GNLLVMTSVLHFKQLHSPTNFLIASLACADFLVGVTVMLFSMVRTVESCWYFGAKFCTLH
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 YSFDLMLSITSIFHLCSVAIDRFYAICYPLLYSTKITIPVIKRLLLLCWSVPGAFAFGVV
:. . .:..::: . :::. .. ::.:.::.:. : . . : .: ... .:
CCDS51 SCCDVAFCYSSVLHLCFICIDRYIVVTDPLVYATKFTVSVSGICISVSWILPLTYSGAVF
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 FSEAYADGIEGYDILVACSSSCPVMFNKLWGTTLFMAGFFTPGSMMVGIYGKIFAVSRKH
.. . ::.: . : ..: .. .. : :. :: : .:. .:.::: .....
CCDS51 YTGVNDDGLEELVSALNCVGGCQIIVSQGWVLIDFLL-FFIPTLVMIILYSKIFLIAKQQ
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 A-------HAINNLRENQNNQV-KKDKKAAKTLGIVIGVFLLCWFPCFFTILLDPFLNFS
: ... :. . .: :...:::::::... .:.. :.: ::.: :..:
CCDS51 AIKIETTSSKVESSSESYKIRVAKRERKAAKTLGVTVLAFVISWLPYTVDILIDAFMGFL
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 TPVVLFDALTWFGYFNSTCNPLIYGFFYPWFRRALKYILLGKIFSSCFHNTILCMQKESE
::. ... : .:.::. :::::..::::::.:.: :: : ....
CCDS51 TPAYIYEICCWSAYYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKLILSGDVLKASSSTISLFLE
290 300 310 320 330 340
>>CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6 (339 aa)
initn: 1065 init1: 610 opt: 755 Z-score: 607.1 bits: 120.8 E(32554): 1.7e-27
Smith-Waterman score: 1111; 50.6% identity (76.7% similar) in 322 aa overlap (25-335:5-324)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAVSSEQHELSHFKRTQTKKEKFNCSEYGNRSCPENERSLGVRVAMYSFMAGSIFITIFG
: . : :: .:. : ::...::.:. :. :. :
CCDS51 MMPFCHNIINISCVKNNWSNDVRASLYSLMVLIILTTLVG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 NLAMIISISYFKQLHTPTNFLILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIYY
:: .:.:::.:::::::::.:: ::: .::::: .:::::.::.:.::::: .::::.
CCDS51 NLIVIVSISHFKQLHTPTNWLIHSMATVDFLLGCLVMPYSMVRSAEHCWYFGEVFCKIHT
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 SFDLMLSITSIFHLCSVAIDRFYAICYPLLYSTKITIPVIKRLLLLCWSVPGAFAFGVVF
: :.::: .::::: ..:::.::.: :: :..:..: :: .... ::::..::::..:
CCDS51 STDIMLSSASIFHLSFISIDRYYAVCDPLRYKAKMNILVICVMIFISWSVPAVFAFGMIF
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KB7 SEAYADGIEG-YDILVACSSSCPVMFNKLWGTTLFMAGFFTPGSMMVGIYGKIFAVSRKH
: : : : : : ..: :.:.:. :. ::..:. :::.:. .: .:. .....
CCDS51 LELNFKGAEEIYYKHVHCRGGCSVFFSKISGVLTFMTSFYIPGSIMLCVYYRIYLIAKEQ
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KB7 AHAINNLRENQNNQV----------KKDKKAAKTLGIVIGVFLLCWFPCFFTILLDPFLN
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280 290 300 310 320 330
350
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CCDS51 S
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]