Result of FASTA (omim) for
pF1KB7222
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7222, 455 aa
1>>>pF1KB7222 455 - 455 aa - 455 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4282+/-0.000398; mu= 3.6672+/- 0.024
mean_var=242.8579+/-49.633, 0's: 0 Z-trim(119.8): 182 B-trim: 99 in 2/59
Lambda= 0.082300
statistics sampled from 34016 (34212) to 34016 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.745), E-opt: 0.2 (0.401), width: 16
Scan time: 10.260
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002271 (OMIM: 602764) keratin, type I cuticular ( 455) 3025 372.4 1.4e-102
XP_011523096 (OMIM: 602764) PREDICTED: keratin, ty ( 455) 3025 372.4 1.4e-102
NP_003762 (OMIM: 604540) keratin, type I cuticular ( 467) 2004 251.2 4.4e-66
NP_002269 (OMIM: 602760) keratin, type I cuticular ( 448) 1899 238.7 2.4e-62
NP_002268 (OMIM: 601077) keratin, type I cuticular ( 416) 1872 235.5 2.1e-61
NP_004129 (OMIM: 602761) keratin, type I cuticular ( 404) 1783 224.9 3.1e-58
XP_011523095 (OMIM: 602763) PREDICTED: keratin, ty ( 412) 1772 223.6 7.8e-58
NP_066293 (OMIM: 602763) keratin, type I cuticular ( 436) 1770 223.4 9.6e-58
NP_002270 (OMIM: 602762) keratin, type I cuticular ( 404) 1765 222.8 1.4e-57
XP_016879678 (OMIM: 616679) PREDICTED: keratin, ty ( 484) 1650 209.2 2e-53
NP_872303 (OMIM: 616679) keratin, type I cytoskele ( 431) 1648 208.9 2.2e-53
NP_998821 (OMIM: 616678) keratin, type I cytoskele ( 491) 1551 197.4 7e-50
NP_006762 (OMIM: 604542) keratin, type I cuticular ( 456) 1534 195.4 2.7e-49
NP_003761 (OMIM: 604541) keratin, type I cuticular ( 449) 1484 189.4 1.6e-47
NP_000517 (OMIM: 125595,131760,131800,131900,14806 ( 472) 1308 168.6 3.3e-41
NP_000413 (OMIM: 148069,167210,184500) keratin, ty ( 432) 1290 166.4 1.4e-40
NP_005548 (OMIM: 148067,167200,613000) keratin, ty ( 473) 1279 165.1 3.6e-40
NP_002266 (OMIM: 148030) keratin, type I cytoskele ( 456) 1270 164.0 7.3e-40
NP_705694 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cy ( 458) 1261 163.0 1.5e-39
XP_016880103 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, ty ( 437) 1257 162.5 2.1e-39
XP_011523086 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, ty ( 463) 1257 162.5 2.2e-39
NP_002267 (OMIM: 148020) keratin, type I cytoskele ( 400) 1242 160.7 6.7e-39
NP_002265 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cy ( 420) 1242 160.7 7e-39
NP_000412 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) kera ( 584) 1186 154.2 8.8e-37
XP_005257400 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) P ( 624) 1180 153.5 1.5e-36
NP_000214 (OMIM: 122100,601687) keratin, type I cy ( 494) 1148 149.6 1.8e-35
XP_016879788 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 494) 1096 143.4 1.3e-33
NP_061889 (OMIM: 607742) keratin, type I cytoskele ( 525) 1095 143.3 1.5e-33
NP_061883 (OMIM: 608218) keratin, type I cytoskele ( 424) 1093 143.0 1.5e-33
NP_853515 (OMIM: 616676) keratin, type I cytoskele ( 459) 1063 139.5 1.8e-32
NP_853513 (OMIM: 616677) keratin, type I cytoskele ( 464) 1044 137.2 8.9e-32
XP_011522716 (OMIM: 616646,616760) PREDICTED: kera ( 448) 993 131.1 5.8e-30
NP_853512 (OMIM: 616646,616760) keratin, type I cy ( 450) 993 131.1 5.8e-30
NP_000215 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskele ( 430) 990 130.8 7.2e-30
NP_954657 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskele ( 430) 990 130.8 7.2e-30
XP_011523088 (OMIM: 602761) PREDICTED: keratin, ty ( 245) 985 129.9 7.3e-30
NP_000217 (OMIM: 144200,607606) keratin, type I cy ( 623) 985 130.3 1.4e-29
NP_853517 (OMIM: 616675) keratin, type I cytoskele ( 468) 969 128.3 4.3e-29
NP_056330 (OMIM: 606194) keratin, type I cytoskele ( 422) 946 125.5 2.7e-28
XP_011522762 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 422) 930 123.6 9.9e-28
XP_006721802 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 427) 925 123.1 1.5e-27
XP_011522641 (OMIM: 616679) PREDICTED: keratin, ty ( 289) 761 103.4 8.3e-22
XP_005257257 (OMIM: 606194) PREDICTED: keratin, ty ( 285) 709 97.2 6e-20
NP_001269362 (OMIM: 606194) keratin, type I cytosk ( 285) 709 97.2 6e-20
XP_011522897 (OMIM: 606194) PREDICTED: keratin, ty ( 285) 709 97.2 6e-20
NP_001918 (OMIM: 125660,181400,601419,602067,60476 ( 470) 617 86.5 1.6e-16
NP_001307127 (OMIM: 158000,601928) keratin, type I ( 486) 604 85.0 4.9e-16
XP_016874785 (OMIM: 158000,601928) PREDICTED: kera ( 486) 604 85.0 4.9e-16
XP_005268923 (OMIM: 158000,601928) PREDICTED: kera ( 563) 604 85.1 5.4e-16
NP_002272 (OMIM: 158000,602153) keratin, type II c ( 505) 601 84.7 6.4e-16
>>NP_002271 (OMIM: 602764) keratin, type I cuticular Ha5 (455 aa)
initn: 3025 init1: 3025 opt: 3025 Z-score: 1962.8 bits: 372.4 E(85289): 1.4e-102
Smith-Waterman score: 3025; 100.0% identity (100.0% similar) in 455 aa overlap (1-455:1-455)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MASKCLKAGFSSGSLKSPGGASGGSTRVSAMYSSSSCKLPSLSPVARSFSACSVGLGRSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MASKCLKAGFSSGSLKSPGGASGGSTRVSAMYSSSSCKLPSLSPVARSFSACSVGLGRSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YRATSCLPALCLPAGGFATSYSGGGGWFGEGILTGNEKETMQSLNDRLAGYLEKVRQLEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 YRATSCLPALCLPAGGFATSYSGGGGWFGEGILTGNEKETMQSLNDRLAGYLEKVRQLEQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 ENASLESRIREWCEQQVPYMCPDYQSYFRTIEELQKKTLCSKAENARLVVEIDNAKLAAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 ENASLESRIREWCEQQVPYMCPDYQSYFRTIEELQKKTLCSKAENARLVVEIDNAKLAAD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 DFRTKYETEVSLRQLVESDINGLRRILDDLTLCKSDLEAQVESLKEELLCLKKNHEEEVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 DFRTKYETEVSLRQLVESDINGLRRILDDLTLCKSDLEAQVESLKEELLCLKKNHEEEVN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SLRCQLGDRLNVEVDAAPPVDLNRVLEEMRCQYETLVENNRRDAEDWLDTQSEELNQQVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SLRCQLGDRLNVEVDAAPPVDLNRVLEEMRCQYETLVENNRRDAEDWLDTQSEELNQQVV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SSSEQLQSCQAEIIELRRTVNALEIELQAQHSMRDALESTLAETEARYSSQLAQMQCMIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SSSEQLQSCQAEIIELRRTVNALEIELQAQHSMRDALESTLAETEARYSSQLAQMQCMIT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 NVEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRGLLESEDSKLPCNPCAPDYSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 NVEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRGLLESEDSKLPCNPCAPDYSPS
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KB7 KSCLPCLPAASCGPSAARTNCSPRPICVPCPGGRF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KSCLPCLPAASCGPSAARTNCSPRPICVPCPGGRF
430 440 450
>>XP_011523096 (OMIM: 602764) PREDICTED: keratin, type I (455 aa)
initn: 3025 init1: 3025 opt: 3025 Z-score: 1962.8 bits: 372.4 E(85289): 1.4e-102
Smith-Waterman score: 3025; 100.0% identity (100.0% similar) in 455 aa overlap (1-455:1-455)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MASKCLKAGFSSGSLKSPGGASGGSTRVSAMYSSSSCKLPSLSPVARSFSACSVGLGRSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MASKCLKAGFSSGSLKSPGGASGGSTRVSAMYSSSSCKLPSLSPVARSFSACSVGLGRSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YRATSCLPALCLPAGGFATSYSGGGGWFGEGILTGNEKETMQSLNDRLAGYLEKVRQLEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YRATSCLPALCLPAGGFATSYSGGGGWFGEGILTGNEKETMQSLNDRLAGYLEKVRQLEQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 ENASLESRIREWCEQQVPYMCPDYQSYFRTIEELQKKTLCSKAENARLVVEIDNAKLAAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ENASLESRIREWCEQQVPYMCPDYQSYFRTIEELQKKTLCSKAENARLVVEIDNAKLAAD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 DFRTKYETEVSLRQLVESDINGLRRILDDLTLCKSDLEAQVESLKEELLCLKKNHEEEVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DFRTKYETEVSLRQLVESDINGLRRILDDLTLCKSDLEAQVESLKEELLCLKKNHEEEVN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SLRCQLGDRLNVEVDAAPPVDLNRVLEEMRCQYETLVENNRRDAEDWLDTQSEELNQQVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLRCQLGDRLNVEVDAAPPVDLNRVLEEMRCQYETLVENNRRDAEDWLDTQSEELNQQVV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SSSEQLQSCQAEIIELRRTVNALEIELQAQHSMRDALESTLAETEARYSSQLAQMQCMIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSSEQLQSCQAEIIELRRTVNALEIELQAQHSMRDALESTLAETEARYSSQLAQMQCMIT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 NVEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRGLLESEDSKLPCNPCAPDYSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NVEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRGLLESEDSKLPCNPCAPDYSPS
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KB7 KSCLPCLPAASCGPSAARTNCSPRPICVPCPGGRF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KSCLPCLPAASCGPSAARTNCSPRPICVPCPGGRF
430 440 450
>>NP_003762 (OMIM: 604540) keratin, type I cuticular Ha6 (467 aa)
initn: 2048 init1: 1843 opt: 2004 Z-score: 1307.5 bits: 251.2 E(85289): 4.4e-66
Smith-Waterman score: 2004; 70.1% identity (86.1% similar) in 445 aa overlap (1-445:1-437)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MASKCLKAGFSSGSLKSPGGASGGSTRVSAMYSSSSCKLPSLSPVARSFSACSVGLGRSS
::.. ::.::.:. :..:: .:::.. : .::..:::. .: .:. ::. .
NP_003 MATQTCTPTFSTGSIKGLCGTAGGISRVSSIRSVGSCRVPSLAGAAGYISSARSGLSGLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YRATSCLPALCLPAGGFATSYSGGGGWFGEGILTGNEKETMQSLNDRLAGYLEKVRQLEQ
::::. : . .... :.:::: :: ..:.:::::: ::::::.:::::::::.
NP_003 ----SCLPGSYLSSECHTSGFVGSGGWFCEGSFNGSEKETMQFLNDRLANYLEKVRQLER
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 ENASLESRIREWCEQQVPYMCPDYQSYFRTIEELQKKTLCSKAENARLVVEIDNAKLAAD
::: :::::.:: : :.::.::::::::.:::..:.: : .:.::::::..:::::::::
NP_003 ENAELESRIQEWYEFQIPYICPDYQSYFKTIEDFQQKILLTKSENARLVLQIDNAKLAAD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 DFRTKYETEVSLRQLVESDINGLRRILDDLTLCKSDLEAQVESLKEELLCLKKNHEEEVN
:::::::::.:::::::.::::::::::.:::::.:::::::::::::.::::::::::.
NP_003 DFRTKYETELSLRQLVEADINGLRRILDELTLCKADLEAQVESLKEELMCLKKNHEEEVS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SLRCQLGDRLNVEVDAAPPVDLNRVLEEMRCQYETLVENNRRDAEDWLDTQSEELNQQVV
::::::::::::::::::::::..::.::::::.::::::::.: :..::.::::::::
NP_003 VLRCQLGDRLNVEVDAAPPVDLNKILEDMRCQYEALVENNRRDVEAWFNTQTEELNQQVV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SSSEQLQSCQAEIIELRRTVNALEIELQAQHSMRDALESTLAETEARYSSQLAQMQCMIT
::::::: ::.:::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::.:.
NP_003 SSSEQLQCCQTEIIELRRTVNALEIELQAQHSMRNSLESTLAETEARYSSQLAQMQCLIS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 NVEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRGLLESEDSKLPCNPCAPDYSPS
::::::.::: :::::::::::::::.:::: :: ::: :::.:: ::: .::: .:
NP_003 NVEAQLSEIRCDLERQNQEYQVLLDVKARLEGEIATYRHLLEGEDCKLPPQPCATACKPV
360 370 380 390 400 410
430 440 450
pF1KB7 KSCLPCLPAASCGPSAARTNCSPRPICVPCPGGRF
.: .: . : ::. :.: :
NP_003 IR-VPSVPPVPCVPSVP---CTPAPQVGTQIRTITEEIRDGKVISSREHVQSRPL
420 430 440 450 460
>>NP_002269 (OMIM: 602760) keratin, type I cuticular Ha2 (448 aa)
initn: 1943 init1: 1798 opt: 1899 Z-score: 1240.3 bits: 238.7 E(85289): 2.4e-62
Smith-Waterman score: 1915; 66.8% identity (82.3% similar) in 464 aa overlap (1-455:1-448)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MASKCLKAGFSSGSLKS-PGGASGGSTRVSAMYSSSSCKLPSLSPVARSFSACSVGLGRS
:.:.: .. ..:::: : :: :. :. : .:.: :.: .
NP_002 MTSSCCVTNNLQASLKSCPRPASVCSSGVNC--RPELCLGYVCQPMACLPSVCLP----T
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 SYRATSCLPAL-----CLPAGGFATSYSGGGGWFGEGILTGNEKETMQSLNDRLAGYLEK
..: .::: : :.:.. :. : :.:..:: ..:::::::: ::::::.:: .
NP_002 TFRPASCLSKTYLSSSCQAASGISGSM-GPGSWYSEGAFNGNEKETMQFLNDRLASYLTR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 VRQLEQENASLESRIREWCEQQVPYMCPDYQSYFRTIEELQKKTLCSKAENARLVVEIDN
::::::::: :::::.: ..:: : :::::.::::::::.: ::.::::::.::.:::
NP_002 VRQLEQENAELESRIQEASHSQVLTMTPDYQSHFRTIEELQQKILCTKAENARMVVNIDN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 AKLAADDFRTKYETEVSLRQLVESDINGLRRILDDLTLCKSDLEAQVESLKEELLCLKKN
:::::::::.:::.:...:::::.::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::
NP_002 AKLAADDFRAKYEAELAMRQLVEADINGLRRILDDLTLCKADLEAQVESLKEELMCLKKN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 HEEEVNSLRCQLGDRLNVEVDAAPPVDLNRVLEEMRCQYETLVENNRRDAEDWLDTQSEE
:::::.:::::::::::.::::::::::.:::::::::::..:: ::::.:.:.. : ::
NP_002 HEEEVGSLRCQLGDRLNIEVDAAPPVDLTRVLEEMRCQYEAMVEANRRDVEEWFNMQMEE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 LNQQVVSSSEQLQSCQAEIIELRRTVNALEIELQAQHSMRDALESTLAETEARYSSQLAQ
:::::..::::::. :..::.::::::.::::::::::.::.::.::.:.::::::::::
NP_002 LNQQVATSSEQLQNYQSDIIDLRRTVNTLEIELQAQHSLRDSLENTLTESEARYSSQLAQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 MQCMITNVEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRGLLESEDSKLPCNPCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.:::.:: :::::::.
NP_002 MQCMITNVEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLEGEINTYRSLLENEDCKLPCNPCS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450
pF1KB7 PDYSPSKSCLPCLPAASCGPSAARTNCSPRPI---CVPCPGGRF
.:: : :.:. : . :: : :: . : ::: ::.
NP_002 ---TPS--CTTCVPS----PCVPRTVCVPRTVGMPCSPCPQGRY
420 430 440
>>NP_002268 (OMIM: 601077) keratin, type I cuticular Ha1 (416 aa)
initn: 1846 init1: 1756 opt: 1872 Z-score: 1223.4 bits: 235.5 E(85289): 2.1e-61
Smith-Waterman score: 1872; 71.9% identity (86.3% similar) in 409 aa overlap (49-450:3-411)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 GGASGGSTRVSAMYSSSSCKLPSLSPVARSFSACSVGLG-RSSYRATSCLPALC----LP
.. : .:. :.: . :.: : ::
NP_002 MPYNFCLPSLSCRTSCSSRPCVPPSCHSCTLP
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 AGGFATSYSGGGGWFGEGILTGNEKETMQSLNDRLAGYLEKVRQLEQENASLESRIREWC
.. . .. .:: :: ..:.:::::: ::::::.:::::::::..:: ::. :::
NP_002 GACNIPANVSNCNWFCEGSFNGSEKETMQFLNDRLASYLEKVRQLERDNAELENLIRERS
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 EQQVPYMCPDYQSYFRTIEELQKKTLCSKAENARLVVEIDNAKLAADDFRTKYETEVSLR
.:: : .::.:::::.::::::.: ::.:.:::::::.:::::::::::::::.::.:::
NP_002 QQQEPLLCPSYQSYFKTIEELQQKILCTKSENARLVVQIDNAKLAADDFRTKYQTELSLR
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 QLVESDINGLRRILDDLTLCKSDLEAQVESLKEELLCLKKNHEEEVNSLRCQLGDRLNVE
:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.:::.:::.::::::::::::
NP_002 QLVESDINGLRRILDELTLCKSDLEAQVESLKEELLCLKSNHEQEVNTLRCQLGDRLNVE
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 VDAAPPVDLNRVLEEMRCQYETLVENNRRDAEDWLDTQSEELNQQVVSSSEQLQSCQAEI
::::: :::::::.: : :::.:::.:::..:.:. ::.::::.::::::::::: ::::
NP_002 VDAAPTVDLNRVLNETRSQYEALVETNRREVEQWFTTQTEELNKQVVSSSEQLQSYQAEI
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 IELRRTVNALEIELQAQHSMRDALESTLAETEARYSSQLAQMQCMITNVEAQLAEIRADL
::::::::::::::::::..::.::.::.:.::::::::.:.: .:::::.::::::.::
NP_002 IELRRTVNALEIELQAQHNLRDSLENTLTESEARYSSQLSQVQSLITNVESQLAEIRSDL
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 ERQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRGLLESEDSKLPCNPCAPDYSPSKSCLPCL--PAAS
:::::::::::::::::::::::::.:::::: .:: :::: . :: ::: : .:
NP_002 ERQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRSLLESEDCNLPSNPCATTNACSKPIGPCLSNPCTS
340 350 360 370 380 390
440 450
pF1KB7 CGPSAARTNCSPRPICVPCPGGRF
: : : : :.::: : ::
NP_002 CVPPAPCTPCAPRPRCGPCNSFVR
400 410
>>NP_004129 (OMIM: 602761) keratin, type I cuticular Ha3 (404 aa)
initn: 1775 init1: 1740 opt: 1783 Z-score: 1166.4 bits: 224.9 E(85289): 3.1e-58
Smith-Waterman score: 1799; 70.3% identity (84.3% similar) in 414 aa overlap (34-443:2-398)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 KCLKAGFSSGSLKSPGGASGGSTRVSAMYSSSSCKLPSLSPVARSFSACSVGLGRSSYRA
: :: ::::: : :.: .
NP_004 MSYSCGLPSLS--------C-----RTSCSS
10
70 80 90 100 110
pF1KB7 TSCLPALC----LPAGGFATSYSGGGGWFGEGILTGNEKETMQSLNDRLAGYLEKVRQLE
:.: : ::.. . .. .:: :: ..:.:::::: ::::::.:::::::::
NP_004 RPCVPPSCHGCTLPGACNIPANVSNCNWFCEGSFNGSEKETMQFLNDRLASYLEKVRQLE
20 30 40 50 60 70
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 QENASLESRIREWCEQQVPYMCPDYQSYFRTIEELQKKTLCSKAENARLVVEIDNAKLAA
..:: ::. ::: .:: : .: .:::::.::::::.: ::::.:::::::.:::::::.
NP_004 RDNAELENLIRERSQQQEPLVCASYQSYFKTIEELQQKILCSKSENARLVVQIDNAKLAS
80 90 100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 DDFRTKYETEVSLRQLVESDINGLRRILDDLTLCKSDLEAQVESLKEELLCLKKNHEEEV
::::::::::.::::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::.:::.::
NP_004 DDFRTKYETELSLRQLVESDINGLRRILDELTLCRSDLEAQVESLKEELLCLKQNHEQEV
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 NSLRCQLGDRLNVEVDAAPPVDLNRVLEEMRCQYETLVENNRRDAEDWLDTQSEELNQQV
:.::::::::::::::::: ::::.::.: : :::.:::.:::..:.:. ::.::::.::
NP_004 NTLRCQLGDRLNVEVDAAPTVDLNQVLNETRSQYEALVETNRREVEQWFATQTEELNKQV
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 VSSSEQLQSCQAEIIELRRTVNALEIELQAQHSMRDALESTLAETEARYSSQLAQMQCMI
::::::::: ::::::::::::::::::::::..::.::.::.:.::::::::.:.: .:
NP_004 VSSSEQLQSYQAEIIELRRTVNALEIELQAQHNLRDSLENTLTESEARYSSQLSQVQRLI
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 TNVEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRGLLESEDSKLPCNPCAPDYSP
::::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::: ::: :::: .
NP_004 TNVESQLAEIRSDLERQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRSLLESEDCKLPSNPCATTNAC
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450
pF1KB7 SKSCLPCLPAASCGPSAARTNCSPRPICVPCPGGRF
.:: ::. . :: :. :.:
NP_004 DKSTGPCI-SNPCG---LRARCGPCNTFGY
380 390 400
>>XP_011523095 (OMIM: 602763) PREDICTED: keratin, type I (412 aa)
initn: 1754 init1: 1725 opt: 1772 Z-score: 1159.3 bits: 223.6 E(85289): 7.8e-58
Smith-Waterman score: 1776; 70.3% identity (86.6% similar) in 397 aa overlap (39-426:7-403)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 GFSSGSLKSPGGASGGSTRVSAMYSSSSCKLPSLSPV----ARSFSACSVGLG-RSSYRA
: .:.:. . :.: : .:: :.: .
XP_011 MDTKIPLSTLAPIFVSCTMSYSCCLPSLGCRTSCSS
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KB7 TSCLPALC----LPAGGFATSYSGGGGWFGEGILTGNEKETMQSLNDRLAGYLEKVRQLE
:.: : ::.. . .. .:: :: ..:.:::::: ::::::.:::::::::
XP_011 RPCVPPSCHGYTLPGACNIPANVSNCNWFCEGSFNGSEKETMQFLNDRLASYLEKVRQLE
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 QENASLESRIREWCEQQVPYMCPDYQSYFRTIEELQKKTLCSKAENARLVVEIDNAKLAA
..:: ::. :.: .:: : .::.:::::.::::::.: ::.:::::::::.:::::::.
XP_011 RDNAELEKLIQERSQQQEPLLCPSYQSYFKTIEELQQKILCAKAENARLVVNIDNAKLAS
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 DDFRTKYETEVSLRQLVESDINGLRRILDDLTLCKSDLEAQVESLKEELLCLKKNHEEEV
::::.::.:: ::: :::::::..:::::.:::::::::.:::::.:::.::::::::::
XP_011 DDFRSKYQTEQSLRLLVESDINSIRRILDELTLCKSDLESQVESLREELICLKKNHEEEV
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 NSLRCQLGDRLNVEVDAAPPVDLNRVLEEMRCQYETLVENNRRDAEDWLDTQSEELNQQV
:.:: :::::::::::.:: ::::.::.: : :::.::: :::..:.:. ::.::::.::
XP_011 NTLRSQLGDRLNVEVDTAPTVDLNQVLNETRSQYEALVEINRREVEQWFATQTEELNKQV
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 VSSSEQLQSCQAEIIELRRTVNALEIELQAQHSMRDALESTLAETEARYSSQLAQMQCMI
::::::::::::::::::::::::::::::::..::.::.::.:.::.:::::.:.: .:
XP_011 VSSSEQLQSCQAEIIELRRTVNALEIELQAQHNLRDSLENTLTESEAHYSSQLSQVQSLI
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 TNVEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRGLLESEDSKLPCNPCAPDYSP
::::.:::::: :::::::::::::::::::::::::::.:::::: :::::::: .
XP_011 TNVESQLAEIRCDLERQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRSLLESEDCKLPCNPCATTNAS
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450
pF1KB7 SKSCLPCLPAASCGPSAARTNCSPRPICVPCPGGRF
..:: ::
XP_011 GNSCGPCGTSQKGCCN
400 410
>>NP_066293 (OMIM: 602763) keratin, type I cuticular Ha4 (436 aa)
initn: 1725 init1: 1725 opt: 1770 Z-score: 1157.7 bits: 223.4 E(85289): 9.6e-58
Smith-Waterman score: 1770; 71.9% identity (87.8% similar) in 384 aa overlap (48-426:44-427)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 PGGASGGSTRVSAMYSSSSCKLPSLSPVARSFSACSVGLG-RSSYRATSCLPALC----L
:.: : .:: :.: . :.: : :
NP_066 KGLQRKERLKPAHIHLQQLTCFSITCSSTMSYSCCLPSLGCRTSCSSRPCVPPSCHGYTL
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 PAGGFATSYSGGGGWFGEGILTGNEKETMQSLNDRLAGYLEKVRQLEQENASLESRIREW
:.. . .. .:: :: ..:.:::::: ::::::.:::::::::..:: ::. :.:
NP_066 PGACNIPANVSNCNWFCEGSFNGSEKETMQFLNDRLASYLEKVRQLERDNAELEKLIQER
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 CEQQVPYMCPDYQSYFRTIEELQKKTLCSKAENARLVVEIDNAKLAADDFRTKYETEVSL
.:: : .::.:::::.::::::.: ::.:::::::::.:::::::.::::.::.:: ::
NP_066 SQQQEPLLCPSYQSYFKTIEELQQKILCAKAENARLVVNIDNAKLASDDFRSKYQTEQSL
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 RQLVESDINGLRRILDDLTLCKSDLEAQVESLKEELLCLKKNHEEEVNSLRCQLGDRLNV
: :::::::..:::::.:::::::::.:::::.:::.:::::::::::.:: ::::::::
NP_066 RLLVESDINSIRRILDELTLCKSDLESQVESLREELICLKKNHEEEVNTLRSQLGDRLNV
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 EVDAAPPVDLNRVLEEMRCQYETLVENNRRDAEDWLDTQSEELNQQVVSSSEQLQSCQAE
:::.:: ::::.::.: : :::.::: :::..:.:. ::.::::.:::::::::::::::
NP_066 EVDTAPTVDLNQVLNETRSQYEALVEINRREVEQWFATQTEELNKQVVSSSEQLQSCQAE
260 270 280 290 300 310
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 IIELRRTVNALEIELQAQHSMRDALESTLAETEARYSSQLAQMQCMITNVEAQLAEIRAD
:::::::::::::::::::..::.::.::.:.::.:::::.:.: .:::::.:::::: :
NP_066 IIELRRTVNALEIELQAQHNLRDSLENTLTESEAHYSSQLSQVQSLITNVESQLAEIRCD
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 LERQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRGLLESEDSKLPCNPCAPDYSPSKSCLPCLPAASC
::::::::::::::::::::::::::.:::::: :::::::: . ..:: ::
NP_066 LERQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRSLLESEDCKLPCNPCATTNASGNSCGPCGTSQKG
380 390 400 410 420 430
440 450
pF1KB7 GPSAARTNCSPRPICVPCPGGRF
NP_066 CCN
>>NP_002270 (OMIM: 602762) keratin, type I cuticular Ha3 (404 aa)
initn: 1734 init1: 1690 opt: 1765 Z-score: 1154.9 bits: 222.8 E(85289): 1.4e-57
Smith-Waterman score: 1765; 71.0% identity (86.1% similar) in 396 aa overlap (49-434:3-398)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 GGASGGSTRVSAMYSSSSCKLPSLSPVARSFSACSVGLG-RSSYRATSCLPALC----LP
.. : .:. :.: . :.: : ::
NP_002 MPYNFCLPSLSCRTSCSSRPCVPPSCHGYTLP
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 AGGFATSYSGGGGWFGEGILTGNEKETMQSLNDRLAGYLEKVRQLEQENASLESRIREWC
.. . .. .:: :: ..:.:::::: ::::::.:::::::::..:: ::. :::
NP_002 GACNIPANVSNCNWFCEGSFNGSEKETMQFLNDRLASYLEKVRQLERDNAELENLIRERS
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 EQQVPYMCPDYQSYFRTIEELQKKTLCSKAENARLVVEIDNAKLAADDFRTKYETEVSLR
.:: : .::.:::::.::::::.: ::::.:::::::.:::::::::::::::.:: :::
NP_002 QQQEPLLCPSYQSYFKTIEELQQKILCSKSENARLVVQIDNAKLAADDFRTKYQTEQSLR
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 QLVESDINGLRRILDDLTLCKSDLEAQVESLKEELLCLKKNHEEEVNSLRCQLGDRLNVE
::::::::.::::::.::::.::::::.:::::::: ::.:::.:::.::::::::::::
NP_002 QLVESDINSLRRILDELTLCRSDLEAQMESLKEELLSLKQNHEQEVNTLRCQLGDRLNVE
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 VDAAPPVDLNRVLEEMRCQYETLVENNRRDAEDWLDTQSEELNQQVVSSSEQLQSCQAEI
::::: ::::.::.: : :::.:::.:::..:.:. ::.::::.::::::::::: ::::
NP_002 VDAAPAVDLNQVLNETRNQYEALVETNRREVEQWFATQTEELNKQVVSSSEQLQSYQAEI
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 IELRRTVNALEIELQAQHSMRDALESTLAETEARYSSQLAQMQCMITNVEAQLAEIRADL
::::::::::::::::::..: .::.::.:.::::::::.:.: .:::::.::::::.::
NP_002 IELRRTVNALEIELQAQHNLRYSLENTLTESEARYSSQLSQVQSLITNVESQLAEIRSDL
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420
pF1KB7 ERQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRGLLESEDSKLPCNPCAPDYS---PSKSCL--PCLP
:::::::::::::::::::::::::.:::::: ::: :::: . : ::. :: :
NP_002 ERQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRSLLESEDCKLPSNPCATTNACEKPIGSCVTNPCGP
340 350 360 370 380 390
430 440 450
pF1KB7 AASCGPSAARTNCSPRPICVPCPGGRF
. :::
NP_002 RSRCGPCNTFGY
400
>>XP_016879678 (OMIM: 616679) PREDICTED: keratin, type I (484 aa)
initn: 1645 init1: 1619 opt: 1650 Z-score: 1080.1 bits: 209.2 E(85289): 2e-53
Smith-Waterman score: 1655; 59.8% identity (81.3% similar) in 438 aa overlap (1-432:54-477)
10 20
pF1KB7 MASKCLKAGFSSGSLKSPGG---ASGGSTR
:.: : .. : : . .: ::. :..
XP_016 WGVIKLSGEESFGVKATEVLQPVSVFASGRMTSDCSSTHCSPESCGTASGCAPASSCSVE
30 40 50 60 70 80
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 VSAMY---SSSSCKLPSLSPVARSFSACSVGLGRSSYRATSCLPALCLPAGGFATSYSGG
.. . ..: :. ::. .:....: . : . :: . :: :.
XP_016 TACLPGTCATSRCQTPSFLSRSRGLTGCLL----PCYFTGSC-NSPCL---------VGN
90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 GGWFGEGILTGNEKETMQSLNDRLAGYLEKVRQLEQENASLESRIREWCEQQVPYMCPDY
.: .:..:.::::::: ::::::.::::::.::. :: :::::.: :::..:..::::
XP_016 CAWCEDGVFTSNEKETMQFLNDRLASYLEKVRSLEETNAELESRIQEQCEQDIPMVCPDY
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 QSYFRTIEELQKKTLCSKAENARLVVEIDNAKLAADDFRTKYETEVSLRQLVESDINGLR
: :: :::.::.: ::.::::.::.:..:: :::.:::..:::.:.:::::.:.::..:.
XP_016 QRYFNTIEDLQQKILCTKAENSRLAVQLDNCKLATDDFKSKYESELSLRQLLEADISSLH
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 RILDDLTLCKSDLEAQVESLKEELLCLKKNHEEEVNSLRCQLGDRLNVEVDAAPPVDLNR
::..::::::::::.::::::.::::::::::::: :: ::::::.::.:.:: .::::
XP_016 GILEELTLCKSDLEAHVESLKEDLLCLKKNHEEEVNLLREQLGDRLSVELDTAPTLDLNR
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 VLEEMRCQYETLVENNRRDAEDWLDTQSEELNQQVVSSSEQLQSCQAEIIELRRTVNALE
::.::::: ::.. ::::.::.:: .:.:::::: .::.::::.:: ::.::.::..:::
XP_016 VLDEMRCQCETVLANNRREAEEWLAVQTEELNQQQLSSAEQLQGCQMEILELKRTASALE
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 IELQAQHSMRDALESTLAETEARYSSQLAQMQCMITNVEAQLAEIRADLERQNQEYQVLL
::::::.:. ..:: :.:::::.:::::::.::.: :.: :::::: :::::::::::::
XP_016 IELQAQQSLTESLECTVAETEAQYSSQLAQIQCLIDNLENQLAEIRCDLERQNQEYQVLL
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 DVRARLECEINTYRGLLESEDSKLPCNPCAPDYSPSKSCLPCLPAASCGPSAARTNCSPR
::.:::: ::::: :::.::::.: :.::. . :..: :: . :
XP_016 DVKARLEGEINTYWGLLDSEDSRLSCSPCSTTCTSSNTCEPCSAYVICTVENCCL
430 440 450 460 470 480
450
pF1KB7 PICVPCPGGRF
455 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 20:28:15 2016 done: Fri Nov 4 20:28:16 2016
Total Scan time: 10.260 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]