Result of FASTA (omim) for
pF1KB7220
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7220, 319 aa
1>>>pF1KB7220 319 - 319 aa - 319 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0673+/-0.000508; mu= 17.8044+/- 0.032
mean_var=104.9168+/-27.431, 0's: 0 Z-trim(109.7): 372 B-trim: 2126 in 2/46
Lambda= 0.125214
statistics sampled from 17431 (17973) to 17431 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.545), E-opt: 0.2 (0.211), width: 16
Scan time: 7.470
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 1410 265.9 7.6e-71
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 1061 202.9 7.2e-52
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 1054 201.6 1.7e-51
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 1054 201.6 1.7e-51
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 1054 201.6 1.8e-51
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 934 179.9 5.8e-45
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 894 172.7 8.6e-43
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 882 170.5 3.9e-42
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 882 170.5 3.9e-42
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 882 170.5 3.9e-42
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 879 170.0 5.7e-42
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 877 169.6 7.3e-42
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 875 169.3 9.4e-42
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 874 169.1 1.1e-41
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 865 167.4 3.2e-41
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 847 164.2 3.1e-40
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 817 158.8 1.3e-38
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 814 158.3 2e-38
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 762 148.9 1.3e-35
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 746 146.0 9.7e-35
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 585 116.9 5.6e-26
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 533 107.5 3.8e-23
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 221 51.1 3.5e-06
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 216 50.3 6.8e-06
NP_000015 (OMIM: 109690,600807,601665) beta-2 adre ( 413) 215 50.2 8.7e-06
NP_004113 (OMIM: 601898) growth hormone secretagog ( 289) 211 49.3 1.1e-05
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 211 49.3 1.2e-05
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 211 49.4 1.4e-05
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 211 49.5 1.5e-05
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 211 49.5 1.5e-05
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 211 49.5 1.5e-05
XP_005264366 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 380) 209 49.1 1.8e-05
XP_011531136 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 380) 209 49.1 1.8e-05
XP_006712078 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 389) 209 49.1 1.8e-05
XP_011531133 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 487) 209 49.2 2.1e-05
XP_016859579 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 487) 209 49.2 2.1e-05
XP_016859578 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 614) 209 49.3 2.4e-05
XP_011531130 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 674) 209 49.4 2.5e-05
NP_000224 (OMIM: 152790,176410,238320) lutropin-ch ( 699) 209 49.4 2.6e-05
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 205 48.3 2.7e-05
NP_940799 (OMIM: 601898) growth hormone secretagog ( 366) 204 48.1 3.2e-05
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 203 47.9 3.3e-05
XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317) 203 47.9 3.3e-05
XP_011542713 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 324) 203 47.9 3.4e-05
NP_001309433 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 342) 203 47.9 3.5e-05
NP_001309432 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 370) 203 48.0 3.7e-05
NP_001309431 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 372) 203 48.0 3.7e-05
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 202 47.8 4e-05
NP_150645 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 429) 203 48.0 4e-05
XP_006716356 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 429) 203 48.0 4e-05
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
initn: 1393 init1: 1025 opt: 1410 Z-score: 1392.9 bits: 265.9 E(85289): 7.6e-71
Smith-Waterman score: 1410; 69.0% identity (88.4% similar) in 310 aa overlap (1-309:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MERGNQTEVGNFLLLGFAEDSDMQLLLHGLFLSMYLVTIIGNLLIILTISSDSHLHTPMY
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NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLSNLSFADICFTSTTVPKMLVNIQTQSKMITFAGCLTQIFFFIAFGCLDNLLLTMTAY
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NP_001 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRFVAICYPLHYTVIMNPRLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTILRLSFCTNMEIPHFFCD
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NP_001 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KB7 PSEVLKLACSDTFINNIVMYFVTIVLGVFPLCGILFSYSQIFSSVLRVSA-RGQHKAFST
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NP_001 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 CGSHLSVVSLFYGTGLGVYLSSAVTPPSRTSLAASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNKDMKGS
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NP_001 CGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 LGRLLLRATSLKEGTIAKLS
: ::: :: :
NP_001 LERLLSRADSCP
310
>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo (312 aa)
initn: 925 init1: 925 opt: 1061 Z-score: 1052.2 bits: 202.9 E(85289): 7.2e-52
Smith-Waterman score: 1061; 52.5% identity (82.0% similar) in 305 aa overlap (1-304:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MERGNQTEVGNFLLLGFAEDSDMQLLLHGLFLSMYLVTIIGNLLIILTISSDSHLHTPMY
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NP_002 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISSDSRLHTPVY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLSNLSFADICFTSTTVPKMLVNIQTQSKMITFAGCLTQIFFFIAFGCLDNLLLTMTAY
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NP_002 FFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVALDNLILAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 DRFVAICYPLHYTVIMNPRLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTILRLSFCTNMEIPHFFCD
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NP_002 DRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVTFCGSRKIHYIFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KB7 PSEVLKLACSDTFINNIVMYFVTIVLGVFPLCGILFSYSQIFSSVLRV-SARGQHKAFST
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NP_002 MYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAILRIPSVSKKYKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 CGSHLSVVSLFYGTGLGVYLSSAVTPPSRTSLAASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNKDMKGS
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NP_002 CASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYSVKDSVA-TVMYAVVTPMMNPFIYSLRNKDMHGA
250 260 270 280 290
300 310
pF1KB7 LGRLLLRATSLKEGTIAKLS
:::::
NP_002 LGRLLDKHFKRLT
300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 1076 init1: 790 opt: 1054 Z-score: 1045.4 bits: 201.6 E(85289): 1.7e-51
Smith-Waterman score: 1054; 52.4% identity (78.8% similar) in 307 aa overlap (1-306:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MERGNQTEVGNFLLLGFAEDSDMQLLLHGLFLSMYLVTIIGNLLIILTISSDSHLHTPMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KB7 FFLSNLSFADICFTSTTVPKMLVNIQTQSKMITFAGCLTQIFFFIAFGCLDNLLLTMTAY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 DRFVAICYPLHYTVIMNPRLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTILRLSFCTNMEIPHFFCD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KB7 PSEVLKLACSDTFINNIVMYFVTIVLGVFPLCGILFSYSQIFSSVLRV-SARGQHKAFST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 CGSHLSVVSLFYGTGLGVYLSSAVTPPSRTSLAASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNKDMKGS
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 LGRLLLRATSLKEGTIAKLS
: ... :
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 1076 init1: 790 opt: 1054 Z-score: 1045.4 bits: 201.6 E(85289): 1.7e-51
Smith-Waterman score: 1054; 52.4% identity (78.8% similar) in 307 aa overlap (1-306:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MERGNQTEVGNFLLLGFAEDSDMQLLLHGLFLSMYLVTIIGNLLIILTISSDSHLHTPMY
: ::. :..:::::.... ..: :: .::::::.:..:::::::..: :: ::::::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLSNLSFADICFTSTTVPKMLVNIQTQSKMITFAGCLTQIFFFIAFGCLDNLLLTMTAY
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRFVAICYPLHYTVIMNPRLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTILRLSFCTNMEIPHFFCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KB7 PSEVLKLACSDTFINNIVMYFVTIVLGVFPLCGILFSYSQIFSSVLRV-SARGQHKAFST
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 CGSHLSVVSLFYGTGLGVYLSSAVTPPSRTSLAASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNKDMKGS
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 LGRLLLRATSLKEGTIAKLS
: ... :
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 1076 init1: 790 opt: 1054 Z-score: 1045.2 bits: 201.6 E(85289): 1.8e-51
Smith-Waterman score: 1054; 52.4% identity (78.8% similar) in 307 aa overlap (1-306:11-317)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MERGNQTEVGNFLLLGFAEDSDMQLLLHGLFLSMYLVTIIGNLLIILTIS
: ::. :..:::::.... ..: :: .::::::.:..:::::::..:
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 SDSHLHTPMYFFLSNLSFADICFTSTTVPKMLVNIQTQSKMITFAGCLTQIFFFIAFGCL
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 DNLLLTMTAYDRFVAICYPLHYTVIMNPRLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTILRLSFCT
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KB7 NMEIPHFFCDPSEVLKLACSDTFINNIVMYFVTIVLGVFPLCGILFSYSQIFSSVLRV-S
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XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
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pF1KB7 ARGQHKAFSTCGSHLSVVSLFYGTGLGVYLSSAVTPPSRTSLAASVMYTMVTPMLNPFIY
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XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
250 260 270 280 290 300
290 300 310
pF1KB7 SLRNKDMKGSLGRLLLRATSLKEGTIAKLS
::::. .::.: ... :
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 948 init1: 655 opt: 934 Z-score: 928.2 bits: 179.9 E(85289): 5.8e-45
Smith-Waterman score: 934; 47.4% identity (74.0% similar) in 304 aa overlap (4-306:5-308)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MERGNQTEVGNFLLLGFAEDSDMQLLLHGLFLSMYLVTIIGNLLIILTISSDSHLHTPM
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 YFFLSNLSFADICFTSTTVPKMLVNIQTQSKMITFAGCLTQIFFFIAFGCLDNLLLTMTA
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 YDRFVAICYPLHYTVIMNPRLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTILRLSFCTNMEIPHFFC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 DPSEVLKLACSDTFINNIVMYFVTIVLGVFPLCGILFSYSQIFSSVLRV-SARGQHKAFS
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 TCGSHLSVVSLFYGTGLGVYLSSAVTPPSRTSLAASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNKDMKG
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 SLGRLLLRATSLKEGTIAKLS
.: :: :
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 903 init1: 653 opt: 894 Z-score: 889.2 bits: 172.7 E(85289): 8.6e-43
Smith-Waterman score: 894; 44.6% identity (76.5% similar) in 307 aa overlap (1-306:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MERGNQTEVGNFLLLGFAEDSDMQLLLHGLFLSMYLVTIIGNLLIILTISSDSHLHTPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLSNLSFADICFTSTTVPKMLVNIQTQSKMITFAGCLTQIFFFIAFGCLDNLLLTMTAY
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRFVAICYPLHYTVIMNPRLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTILRLSFCTNMEIPHFFCD
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KB7 PSEVLKLACSDTFINNIVMYFVTIVLGVFPLCGILFSYSQIFSSVLRV-SARGQHKAFST
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 CGSHLSVVSLFYGTGLGVYLSSAVTPPSRTSLAASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNKDMKGS
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQEKSV--SVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
250 260 270 280 290
300 310
pF1KB7 LGRLLLRATSLKEGTIAKLS
: .. :
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 870 init1: 657 opt: 882 Z-score: 877.4 bits: 170.5 E(85289): 3.9e-42
Smith-Waterman score: 882; 43.4% identity (75.6% similar) in 311 aa overlap (1-310:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MERGNQTEVGNFLLLGFAEDSDMQLLLHGLFLSMYLVTIIGNLLIILTISSDSHLHTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLSNLSFADICFTSTTVPKMLVNIQTQSKMITFAGCLTQIFFFIAFGCLDNLLLTMTAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRFVAICYPLHYTVIMNPRLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTILRLSFCTNMEIPHFFCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KB7 PSEVLKLACSDTFINNIVMYFVTIVLGVFPLCGILFSYSQIFSSVLRVSAR-GQHKAFST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 CGSHLSVVSLFYGTGLGVYLSSAVTPPSRTSLAASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNKDMKGS
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 LGRLLLRATSLKEGTIAKLS
.:: . ..:
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 870 init1: 657 opt: 882 Z-score: 877.4 bits: 170.5 E(85289): 3.9e-42
Smith-Waterman score: 882; 43.4% identity (75.6% similar) in 311 aa overlap (1-310:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MERGNQTEVGNFLLLGFAEDSDMQLLLHGLFLSMYLVTIIGNLLIILTISSDSHLHTPMY
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLSNLSFADICFTSTTVPKMLVNIQTQSKMITFAGCLTQIFFFIAFGCLDNLLLTMTAY
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRFVAICYPLHYTVIMNPRLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTILRLSFCTNMEIPHFFCD
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KB7 PSEVLKLACSDTFINNIVMYFVTIVLGVFPLCGILFSYSQIFSSVLRVSAR-GQHKAFST
:..::: :: :..... .::: . :.: .:.:: ::.:..:....: :..::: :
NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 CGSHLSVVSLFYGTGLGVYLSSAVTPPSRTSLAASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNKDMKGS
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 LGRLLLRATSLKEGTIAKLS
.:: . ..:
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 870 init1: 657 opt: 882 Z-score: 877.4 bits: 170.5 E(85289): 3.9e-42
Smith-Waterman score: 882; 43.4% identity (75.6% similar) in 311 aa overlap (1-310:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MERGNQTEVGNFLLLGFAEDSDMQLLLHGLFLSMYLVTIIGNLLIILTISSDSHLHTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLSNLSFADICFTSTTVPKMLVNIQTQSKMITFAGCLTQIFFFIAFGCLDNLLLTMTAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRFVAICYPLHYTVIMNPRLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTILRLSFCTNMEIPHFFCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KB7 PSEVLKLACSDTFINNIVMYFVTIVLGVFPLCGILFSYSQIFSSVLRVSAR-GQHKAFST
:..::: :: :..... .::: . :.: .:.:: ::.:..:....: :..::: :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 CGSHLSVVSLFYGTGLGVYLSSAVTPPSRTSLAASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNKDMKGS
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 LGRLLLRATSLKEGTIAKLS
.:: . ..:
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
319 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 06:05:02 2016 done: Fri Nov 4 06:05:03 2016
Total Scan time: 7.470 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]