Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7220
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7220, 319 aa
1>>>pF1KB7220 319 - 319 aa - 319 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3844+/-0.00123; mu= 9.9787+/- 0.074
mean_var=139.8544+/-44.155, 0's: 0 Z-trim(103.8): 412 B-trim: 940 in 2/46
Lambda= 0.108452
statistics sampled from 7041 (7580) to 7041 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.575), E-opt: 0.2 (0.233), width: 16
Scan time: 2.510
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 2078 337.4 9.1e-93
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 1636 268.2 6e-72
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 1410 232.9 2.6e-61
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 1375 227.4 1.1e-59
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 1374 227.2 1.3e-59
CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 1360 225.0 5.9e-59
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 1349 223.3 1.9e-58
CCDS45955.1 OR7E24 gene_id:26648|Hs108|chr19 ( 339) 1312 217.6 1.1e-56
CCDS32897.1 OR7G2 gene_id:390882|Hs108|chr19 ( 345) 1307 216.8 2e-56
CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 ( 312) 1289 213.9 1.3e-55
CCDS32898.2 OR7G1 gene_id:125962|Hs108|chr19 ( 311) 1229 204.5 8.7e-53
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 1137 190.2 2e-48
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 1125 188.3 6.9e-48
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 1110 185.9 3.5e-47
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 1108 185.6 4.4e-47
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 1098 184.0 1.3e-46
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 1092 183.1 2.5e-46
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 1091 182.9 2.8e-46
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 1061 178.2 7.1e-45
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 1057 177.6 1.1e-44
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 1054 177.2 1.5e-44
CCDS31545.1 OR1S2 gene_id:219958|Hs108|chr11 ( 325) 1053 177.0 1.7e-44
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 1048 176.2 3e-44
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 1043 175.4 5e-44
CCDS32937.1 OR1I1 gene_id:126370|Hs108|chr19 ( 355) 1033 173.9 1.6e-43
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 1032 173.7 1.7e-43
CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 ( 312) 1022 172.1 4.9e-43
CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 976 164.9 7.1e-41
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 975 164.8 8e-41
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 953 161.4 8.9e-40
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 952 161.2 9.8e-40
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 943 159.8 2.6e-39
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 934 158.4 6.8e-39
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 928 157.4 1.3e-38
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 924 156.8 2.1e-38
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 924 156.8 2.1e-38
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 920 156.2 3.1e-38
CCDS11021.1 OR1A2 gene_id:26189|Hs108|chr17 ( 309) 919 156.0 3.5e-38
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 919 156.0 3.5e-38
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 919 156.0 3.5e-38
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 917 155.8 4.7e-38
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 911 154.8 8.3e-38
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 904 153.7 1.8e-37
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 904 153.7 1.8e-37
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 902 153.4 2.2e-37
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 901 153.2 2.5e-37
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 899 152.9 3e-37
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 899 152.9 3.1e-37
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 898 152.7 3.4e-37
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 898 152.8 3.4e-37
>>CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 (319 aa)
initn: 2078 init1: 2078 opt: 2078 Z-score: 1778.9 bits: 337.4 E(32554): 9.1e-93
Smith-Waterman score: 2078; 100.0% identity (100.0% similar) in 319 aa overlap (1-319:1-319)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MERGNQTEVGNFLLLGFAEDSDMQLLLHGLFLSMYLVTIIGNLLIILTISSDSHLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MERGNQTEVGNFLLLGFAEDSDMQLLLHGLFLSMYLVTIIGNLLIILTISSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLSNLSFADICFTSTTVPKMLVNIQTQSKMITFAGCLTQIFFFIAFGCLDNLLLTMTAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FFLSNLSFADICFTSTTVPKMLVNIQTQSKMITFAGCLTQIFFFIAFGCLDNLLLTMTAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRFVAICYPLHYTVIMNPRLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTILRLSFCTNMEIPHFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DRFVAICYPLHYTVIMNPRLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTILRLSFCTNMEIPHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PSEVLKLACSDTFINNIVMYFVTIVLGVFPLCGILFSYSQIFSSVLRVSARGQHKAFSTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PSEVLKLACSDTFINNIVMYFVTIVLGVFPLCGILFSYSQIFSSVLRVSARGQHKAFSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 GSHLSVVSLFYGTGLGVYLSSAVTPPSRTSLAASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNKDMKGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GSHLSVVSLFYGTGLGVYLSSAVTPPSRTSLAASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNKDMKGSL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 GRLLLRATSLKEGTIAKLS
:::::::::::::::::::
CCDS12 GRLLLRATSLKEGTIAKLS
310
>>CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 (320 aa)
initn: 1222 init1: 1222 opt: 1636 Z-score: 1405.2 bits: 268.2 E(32554): 6e-72
Smith-Waterman score: 1636; 77.8% identity (90.6% similar) in 320 aa overlap (1-319:1-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MERGNQTEVGNFLLLGFAEDSDMQLLLHGLFLSMYLVTIIGNLLIILTISSDSHLHTPMY
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CCDS12 METGNQTHAQEFLLLGFSATSEIQFILFGLFLSMYLVTFTGNLLIILAICSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLSNLSFADICFTSTTVPKMLVNIQTQSKMITFAGCLTQIFFFIAFGCLDNLLLTMTAY
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CCDS12 FFLSNLSFADLCFTSTTVPKMLLNILTQNKFITYAGCLSQIFFFTSFGCLDNLLLTVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 DRFVAICYPLHYTVIMNPRLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTILRLSFCTNMEIPHFFCD
:::::.:.::::::::::.:::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::
CCDS12 DRFVAVCHPLHYTVIMNPQLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTVLRLSFCTEMEIPHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KB7 PSEVLKLACSDTFINNIVMYFVTIVLGVFPLCGILFSYSQIFSSVLRVSARG-QHKAFST
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CCDS12 LLEVLKLACSDTFINNVVIYFATGVLGVISFTGIFFSYYKIVFSILRISSAGRKHKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 CGSHLSVVSLFYGTGLGVYLSSAVTPPSRTSLAASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNKDMKGS
::::::::.::::::.:::::::.:: :::::.::::::::::::::::::::: ::: .
CCDS12 CGSHLSVVTLFYGTGFGVYLSSAATPSSRTSLVASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNTDMKRA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 LGRLLLRATSLKEGTIAKLS
::::: ::: .. : ::
CCDS12 LGRLLSRATFFNGDITAGLS
310 320
>>CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 (312 aa)
initn: 1393 init1: 1025 opt: 1410 Z-score: 1214.2 bits: 232.9 E(32554): 2.6e-61
Smith-Waterman score: 1410; 69.0% identity (88.4% similar) in 310 aa overlap (1-309:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MERGNQTEVGNFLLLGFAEDSDMQLLLHGLFLSMYLVTIIGNLLIILTISSDSHLHTPMY
:: : ::...:::::...: ..: .: ::::::::::..:::::::..:::::::::::
CCDS32 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
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pF1KB7 FFLSNLSFADICFTSTTVPKMLVNIQTQSKMITFAGCLTQIFFFIAFGCLDNLLLTMTAY
::::::::.:::: :::::::::.::..:: :.. :::::..:.. :. .:..::.. ::
CCDS32 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
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pF1KB7 DRFVAICYPLHYTVIMNPRLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTILRLSFCTNMEIPHFFCD
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CCDS32 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE
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pF1KB7 PSEVLKLACSDTFINNIVMYFVTIVLGVFPLCGILFSYSQIFSSVLRVSA-RGQHKAFST
:..:::.:::.:..::::.: .: .:::::. ::::::::: ::.. .:. .:..:::::
CCDS32 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST
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240 250 260 270 280 290
pF1KB7 CGSHLSVVSLFYGTGLGVYLSSAVTPPSRTSLAASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNKDMKGS
::::: ::::::::::::::::::: :..: .:::::.:::::::::::::::::.::.
CCDS32 CGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 LGRLLLRATSLKEGTIAKLS
: ::: :: :
CCDS32 LERLLSRADSCP
310
>>CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 (309 aa)
initn: 1379 init1: 1042 opt: 1375 Z-score: 1184.7 bits: 227.4 E(32554): 1.1e-59
Smith-Waterman score: 1375; 69.1% identity (89.0% similar) in 301 aa overlap (1-300:1-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MERGNQTEVGNFLLLGFAEDSDMQLLLHGLFLSMYLVTIIGNLLIILTISSDSHLHTPMY
:. :.: . .:::::..:. ..: .: ::::::::::..:::::::. ::::::::::
CCDS32 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
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pF1KB7 FFLSNLSFADICFTSTTVPKMLVNIQTQSKMITFAGCLTQIFFFIAFGCLDNLLLTMTAY
::::::::.::::.:::::::::::::..:.::.:::.::. ::. : :::.:::. ::
CCDS32 FFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNKVITYAGCITQMCFFLLFVGLDNFLLTVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 DRFVAICYPLHYTVIMNPRLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTILRLSFCTNMEIPHFFCD
:::::::.:::: :::::.:::::::.:: .::..:.:..: .: : :::.::::::::.
CCDS32 DRFVAICHPLHYMVIMNPQLCGLLVLASWIMSVLNSMLQSLMVLPLPFCTHMEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KB7 PSEVLKLACSDTFINNIVMYFVTIVLGVFPLCGILFSYSQIFSSVLRVS-ARGQHKAFST
..:..:::::::.:.:::::.. .:: :: :::.:::.: ::. .: :.:..:::::
CCDS32 INQVVHLACSDTFLNDIVMYFAVALLGGGPLTGILYSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
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240 250 260 270 280 290
pF1KB7 CGSHLSVVSLFYGTGLGVYLSSAVTPPSRTSLAASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNKDMKGS
:.:::::::::::: ::::::::.: :.:. :::::::.::::::::::::::: .::.
CCDS32 CASHLSVVSLFYGTCLGVYLSSAATHNSHTGAAASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKHIKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 LGRLLLRATSLKEGTIAKLS
.
CCDS32 MKTFFRGKQ
>>CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 (319 aa)
initn: 1411 init1: 1033 opt: 1374 Z-score: 1183.6 bits: 227.2 E(32554): 1.3e-59
Smith-Waterman score: 1374; 66.7% identity (88.7% similar) in 309 aa overlap (1-308:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MERGNQTEVGNFLLLGFAEDSDMQLLLHGLFLSMYLVTIIGNLLIILTISSDSHLHTPMY
:: ::.:....::::::... .: .: ::::::::::..:::::::. ::::::::::
CCDS12 MEPGNDTQISEFLLLGFSQEPGLQPFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLSNLSFADICFTSTTVPKMLVNIQTQSKMITFAGCLTQIFFFIAFGCLDNLLLTMTAY
:::::::::::: ::::.::::.:::::.:.::. .:: :..::: :. ..:.::.. ::
CCDS12 FFLSNLSFADICVTSTTIPKMLMNIQTQNKVITYIACLMQMYFFILFAGFENFLLSVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 DRFVAICYPLHYTVIMNPRLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTILRLSFCTNMEIPHFFCD
:::::::.:::: :::::.:::::::.:: .:.. :::. : ..:::::: .:::::::.
CCDS12 DRFVAICHPLHYMVIMNPHLCGLLVLASWTMSALYSLLQILMVVRLSFCTALEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KB7 PSEVLKLACSDTFINNIVMYFVTIVLGVFPLCGILFSYSQIFSSVLRVS-ARGQHKAFST
..:..:::::.:.:..:.::.. .:: :: :::.:::.:.::. .: :.:..:::::
CCDS12 LNQVIQLACSDSFLNHMVIYFTVALLGGGPLTGILYSYSKIISSIHAISSAQGKYKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 CGSHLSVVSLFYGTGLGVYLSSAVTPPSRTSLAASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNKDMKGS
:.:::::::::::. ::::::::.: :..: .::::::.::::::::::::::::.: .
CCDS12 CASHLSVVSLFYGAILGVYLSSAATRNSHSSATASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDIKRA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 LGRLLLRATSLKEGTIAKLS
:: :: .:
CCDS12 LGIHLLWGTMKGQFFKKCP
310
>>CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 (312 aa)
initn: 1355 init1: 1012 opt: 1360 Z-score: 1171.9 bits: 225.0 E(32554): 5.9e-59
Smith-Waterman score: 1360; 65.5% identity (86.5% similar) in 310 aa overlap (1-309:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MERGNQTEVGNFLLLGFAEDSDMQLLLHGLFLSMYLVTIIGNLLIILTISSDSHLHTPMY
:: :::: .:.:::..:: ..: .. ::::::::::..:::::::.::::::::::::
CCDS32 MEAGNQTGFLEFILLGLSEDPELQPFIFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAISSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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CCDS32 FFLSNLSWVDICFSTCIVPKMLVNIQTENKAISYMDCLTQVYFSMFFPILDTLLLTVMAY
70 80 90 100 110 120
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CCDS32 DRFVAVCHPLHYMIIMNPHLCGLLVFVTWLIGVMTSLLHISLMMHLIFCKDFEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KB7 PSEVLKLACSDTFINNIVMYFVTIVLGVFPLCGILFSYSQIFSSVLRVSARG-QHKAFST
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CCDS32 LTYILQLACSDTFLNSTLIYFMTGVLGVFPLLGIIFSYSRIASSIRKMSSSGGKQKALST
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240 250 260 270 280 290
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CCDS32 CGSHLSVVSLFYGTGIGVHFTSAVTHSSQKISVASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
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300 310
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:: :: ::.:
CCDS32 LGSLLSRAASCL
310
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CCDS12 FFLSNLSFADICFISTTIPKMLINIQTQSRVITYAGCITQMCFFVLFGGLDSLLLAVMAY
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CCDS12 LNQVIHLACSDTFLNDMGMYFAAGLLAGGPLVGILCSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
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CCDS12 CASHLSVVSLFCCTGLGVYLTSAATHNSHTSATASVMYTVATPMLNPFIYSLRNKDIKRA
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300 310
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:
CCDS12 LKMSFRGKQ
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10 20 30 40
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CCDS45 LLIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSLADIGFTSTTVPKMIVDMQTHSRVISYEGCLTQMS
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CCDS45 PMLNPFIYSLRNKDIQSALCRLHGRIIKSHHLHPFCYMG
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10 20 30
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CCDS32 MPMQLLLTDFIIFSIRFIINSMEARNQTAISKFLLLGLIEDPELQPVLFSLFLSMYLVTI
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pF1KB7 IGNLLIILTISSDSHLHTPMYFFLSNLSFADICFTSTTVPKMLVNIQTQSKMITFAGCLT
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CCDS32 QITSCVLRMPSASGKHKAVSTCGSHLSIVLLFYGAGLGVYISSVVTDSPRKTAVASVMYS
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CCDS32 VFPQMVNPFIYSLRNKDMKGTLRKFIGRIPSLLWCAICFGFRFLE
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CCDS32 FLLSILSLVDICFTSTTMPKMLVNIQAQAQSINYTGCLTQICFVLVFVGLENGILVMMAY
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CCDS32 DRFVAICHPLRYNVIMNPKLCGLLLLLSFIVSVLDALLHTLMVLQLTFCIDLEIPHFFCE
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pF1KB7 PSEVLKLACSDTFINNIVMYFVTIVLGVFPLCGILFSYSQIFSSVLRV-SARGQHKAFST
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CCDS32 LAHILKLACSDVLINNILVYLVTSLLGVVPLSGIIFSYTRIVSSVMKIPSAGGKYKAFSI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]