Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7219
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7219, 320 aa
1>>>pF1KB7219 320 - 320 aa - 320 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8502+/-0.00151; mu= 12.8077+/- 0.088
mean_var=203.3420+/-72.065, 0's: 0 Z-trim(99.5): 416 B-trim: 332 in 1/44
Lambda= 0.089942
statistics sampled from 5279 (5762) to 5279 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.494), E-opt: 0.2 (0.177), width: 16
Scan time: 2.100
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 2062 281.5 6.1e-76
CCDS6596.2 OR2S2 gene_id:56656|Hs108|chr9 ( 319) 1406 196.4 2.6e-50
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 1396 195.1 6.6e-50
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 1381 193.1 2.4e-49
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 1381 193.1 2.4e-49
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 1378 192.7 3.2e-49
CCDS35091.1 OR13C5 gene_id:138799|Hs108|chr9 ( 318) 1342 188.1 8.1e-48
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 1222 172.6 4.1e-43
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 1107 157.6 1.2e-38
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 1086 154.8 8.1e-38
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 1055 150.8 1.3e-36
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 1020 146.3 3e-35
CCDS35011.1 OR13J1 gene_id:392309|Hs108|chr9 ( 312) 998 143.4 2.2e-34
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 991 142.5 4.2e-34
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 981 141.2 1e-33
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 974 140.4 2e-33
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 963 138.9 5.1e-33
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 954 137.7 1.1e-32
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 946 136.7 2.3e-32
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 945 136.5 2.6e-32
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 942 136.1 3.3e-32
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 941 136.0 3.7e-32
CCDS35396.1 OR13H1 gene_id:347468|Hs108|chrX ( 308) 935 135.2 6.3e-32
CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs108|chr1 ( 317) 935 135.3 6.4e-32
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 934 135.1 7.1e-32
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 933 135.0 7.6e-32
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 931 134.7 9e-32
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 929 134.5 1.1e-31
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 928 134.3 1.2e-31
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 924 133.8 1.7e-31
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 924 133.8 1.7e-31
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 924 133.8 1.7e-31
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 921 133.4 2.2e-31
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 919 133.2 2.7e-31
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 909 131.9 6.6e-31
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 908 131.7 7.1e-31
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 907 131.6 7.8e-31
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 907 131.6 7.9e-31
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 906 131.5 8.5e-31
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 906 131.5 8.6e-31
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 904 131.2 1e-30
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 904 131.2 1e-30
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 904 131.2 1e-30
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 900 130.7 1.5e-30
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 900 130.7 1.5e-30
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 900 130.7 1.5e-30
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 899 130.6 1.6e-30
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 899 130.6 1.6e-30
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 899 130.6 1.6e-30
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 898 130.4 1.8e-30
>>CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 (320 aa)
initn: 2062 init1: 2062 opt: 2062 Z-score: 1476.9 bits: 281.5 E(32554): 6.1e-76
Smith-Waterman score: 2062; 100.0% identity (100.0% similar) in 320 aa overlap (1-320:1-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MERTNDSTSTEFFLVGLSAHPKLQTVFFVLILWMYLMILLGNGVLISVIIFDSHLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MERTNDSTSTEFFLVGLSAHPKLQTVFFVLILWMYLMILLGNGVLISVIIFDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLCNLSFLDVCYTSSSVPLILASFLAVKKKVSFSGCMVQMFISFAMGATECMILGTMAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FFLCNLSFLDVCYTSSSVPLILASFLAVKKKVSFSGCMVQMFISFAMGATECMILGTMAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYVAICYPLRYPVIMSKGAYVAMAAGSWVTGLVDSVVQTAFAMQLPFCANNVIKHFVCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DRYVAICYPLRYPVIMSKGAYVAMAAGSWVTGLVDSVVQTAFAMQLPFCANNVIKHFVCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ILAILKLACADISINVISMTGSNLIVLVIPLLVISISYIFIVATILRIPSTEGKHKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ILAILKLACADISINVISMTGSNLIVLVIPLLVISISYIFIVATILRIPSTEGKHKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPESKASVDSGNEDIIEALISLFYGVMTPMLNPLIYSLRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 CSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPESKASVDSGNEDIIEALISLFYGVMTPMLNPLIYSLRN
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KB7 KDVKAAVKNILCRKNFSDGK
::::::::::::::::::::
CCDS35 KDVKAAVKNILCRKNFSDGK
310 320
>>CCDS6596.2 OR2S2 gene_id:56656|Hs108|chr9 (319 aa)
initn: 1402 init1: 1373 opt: 1406 Z-score: 1016.9 bits: 196.4 E(32554): 2.6e-50
Smith-Waterman score: 1406; 66.7% identity (88.7% similar) in 318 aa overlap (1-317:1-318)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MERTNDSTSTE-FFLVGLSAHPKLQTVFFVLILWMYLMILLGNGVLISVIIFDSHLHTPM
::..:... . : :. :::::.:. .:::::: :::.::::::::: : :.::.:::::
CCDS65 MEKANETSPVMGFVLLRLSAHPELEKTFFVLILLMYLVILLGNGVLILVTILDSRLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 YFFLCNLSFLDVCYTSSSVPLILASFLAVKKKVSFSGCMVQMFISFAMGATECMILGTMA
:::: ::::::.:.:.:::::.: :::. .. .:::.: ::: .::::..:::..:. ::
CCDS65 YFFLGNLSFLDICFTTSSVPLVLDSFLTPQETISFSACAVQMALSFAMAGTECLLLSMMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LDRYVAICYPLRYPVIMSKGAYVAMAAGSWVTGLVDSVVQTAFAMQLPFCANNVIKHFVC
.::::::: :::: :::::.::. :::.::. : . :::.:..:.:::::..:::.::.:
CCDS65 FDRYVAICNPLRYSVIMSKAAYMPMAASSWAIGGAASVVHTSLAIQLPFCGDNVINHFTC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 EILAILKLACADISINVISMTGSNLIVLVIPLLVISISYIFIVATILRIPSTEGKHKAFS
::::.::::::::::::::: .:.: : .:.: ::.::.::..:::::::.::..:.::
CCDS65 EILAVLKLACADISINVISMEVTNVIFLGVPVLFISFSYVFIITTILRIPSAEGRKKVFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 TCSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPESKASVDSGNEDIIEALISLFYGVMTPMLNPLIYSLR
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CCDS65 TCSAHLTVVIVFYGTLFFMYGKPKSKDSMGADKEDLSDKLIPLFYGVVTPMLNPIIYSLR
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KB7 NKDVKAAVKNILCRKNFSDGK
::::::::. .: :.:.
CCDS65 NKDVKAAVRRLLRPKGFTQ
310
>>CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 (347 aa)
initn: 1416 init1: 1385 opt: 1396 Z-score: 1009.5 bits: 195.1 E(32554): 6.6e-50
Smith-Waterman score: 1396; 65.3% identity (88.2% similar) in 314 aa overlap (1-314:31-344)
10 20 30
pF1KB7 MERTNDSTSTEFFLVGLSAHPKLQTVFFVL
: . :.. .::.:.:::..::.. :.:.:
CCDS35 MIVQLICTVCFLAVNTFHVRSSFDFLKADDMGEINQTLVSEFLLLGLSGYPKIEIVYFAL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 ILWMYLMILLGNGVLISVIIFDSHLHTPMYFFLCNLSFLDVCYTSSSVPLILASFLAVKK
:: :::.::.:::::: . :::::.:::::::: ::::::.:::::::: :.:... :.
CCDS35 ILVMYLVILIGNGVLIIASIFDSHFHTPMYFFLGNLSFLDICYTSSSVPSTLVSLISKKR
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 KVSFSGCMVQMFISFAMGATECMILGTMALDRYVAICYPLRYPVIMSKGAYVAMAAGSWV
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CCDS35 NISFSGCAVQMFFGFAMGSTECLLLGMMAFDRYVAICNPLRYPIILSKVAYVLMASVSWL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 TGLVDSVVQTAFAMQLPFCANNVIKHFVCEILAILKLACADISINVISMTGSNLIVLVIP
.: ..:.::: .::.::::.::.:.::.:::::.:::::::::.:.:.:. ::. ::.:
CCDS35 SGGINSAVQTLLAMRLPFCGNNIINHFACEILAVLKLACADISLNIITMVISNMAFLVLP
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 LLVISISYIFIVATILRIPSTEGKHKAFSTCSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPESKASVDS
:.:: .::.::. :::.. :. :..:::::::::::::::::::::::::::.:. .
CCDS35 LMVIFFSYMFILYTILQMNSATGRRKAFSTCSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLIGE
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320
pF1KB7 GNEDIIEALISLFYGVMTPMLNPLIYSLRNKDVKAAVKNILCRKNFSDGK
. . .. ::::::::.::::::..::::::::::::: .: .:
CCDS35 EKLQALDKLISLFYGVVTPMLNPILYSLRNKDVKAAVKYLLNKKPIH
310 320 330 340
>>CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 (318 aa)
initn: 1381 init1: 1381 opt: 1381 Z-score: 999.3 bits: 193.1 E(32554): 2.4e-49
Smith-Waterman score: 1381; 63.7% identity (85.8% similar) in 317 aa overlap (1-317:1-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MERTNDSTSTEFFLVGLSAHPKLQTVFFVLILWMYLMILLGNGVLISVIIFDSHLHTPMY
:: :.. .:::: : :.::.:. .:::::. ::..::::::.:: . :.: :::::::
CCDS35 MEWENQTILVEFFLKGHSVHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLCNLSFLDVCYTSSSVPLILASFLAVKKKVSFSGCMVQMFISFAMGATECMILGTMAL
::: ::::::.:::..:.: :.:::. .: .::::: ::::...:::.:::..:: ::.
CCDS35 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISFSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYVAICYPLRYPVIMSKGAYVAMAAGSWVTGLVDSVVQTAFAMQLPFCANNVIKHFVCE
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CCDS35 DRYVAICNPLRYPIIMSKNAYVPMAVGSWFAGIVNSAVQTTFVVQLPFCRKNVINHFSCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ILAILKLACADISINVISMTGSNLIVLVIPLLVISISYIFIVATILRIPSTEGKHKAFST
:::..:::::::: : . : .... ..:::.: ::: .:...::.: :.::. :::::
CCDS35 ILAVMKLACADISGNEFLMLVATILFTLMPLLLIVISYSLIISSILKIHSSEGRSKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPESKASVDSGNEDIIEALISLFYGVMTPMLNPLIYSLRN
:::::::::::::::.::: ::.:: ...: . : . .::.::::::::.:::::::::
CCDS35 CSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRN
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KB7 KDVKAAVKNILCRKNFSDGK
:::: :::.. :. ::
CCDS35 KDVKEAVKHLPNRRFFSK
310
>>CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 (318 aa)
initn: 1381 init1: 1381 opt: 1381 Z-score: 999.3 bits: 193.1 E(32554): 2.4e-49
Smith-Waterman score: 1381; 63.1% identity (85.2% similar) in 317 aa overlap (1-317:1-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MERTNDSTSTEFFLVGLSAHPKLQTVFFVLILWMYLMILLGNGVLISVIIFDSHLHTPMY
:: : . .:::: :::.::.:. .:::::. ::..::::::.:: . :.: :::::::
CCDS35 MEWENHTILVEFFLKGLSGHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLCNLSFLDVCYTSSSVPLILASFLAVKKKVSFSGCMVQMFISFAMGATECMILGTMAL
::: ::::::.:::..:.: :.:::. .: .:.::: ::::...:::.:::..:: ::.
CCDS35 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISLSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYVAICYPLRYPVIMSKGAYVAMAAGSWVTGLVDSVVQTAFAMQLPFCANNVIKHFVCE
::::::: :::::.:::: ::: ::::::. : :.:.::..:..::::: ::.:.::.::
CCDS35 DRYVAICNPLRYPIIMSKDAYVPMAAGSWIIGAVNSAVQSVFVVQLPFCRNNIINHFTCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ILAILKLACADISINVISMTGSNLIVLVIPLLVISISYIFIVATILRIPSTEGKHKAFST
:::..:::::::: : . : .. . .. :::.: .:: .:...:..: :.::. :: ::
CCDS35 ILAVMKLACADISDNEFIMLVATTLFILTPLLLIIVSYTLIIVSIFKISSSEGRSKASST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPESKASVDSGNEDIIEALISLFYGVMTPMLNPLIYSLRN
:::::::::::::::.::: ::.:: ...: . : . .::.::::::::.:::::::::
CCDS35 CSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRN
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KB7 KDVKAAVKNILCRKNFSDGK
:::: :::..: :. ::
CCDS35 KDVKEAVKHLLNRRFFSK
310
>>CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 (318 aa)
initn: 1363 init1: 1363 opt: 1378 Z-score: 997.2 bits: 192.7 E(32554): 3.2e-49
Smith-Waterman score: 1378; 63.1% identity (87.9% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MERTNDSTSTEFFLVGLSAHPKLQTVFFVLILWMYLMILLGNGVLISVIIFDSHLHTPMY
:.. :.. ::.:.:::..:::. .::.::: ::..::.:::::: . :.::.:: :::
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CCDS35 ILAVMKLACADISGNEFILLVTTTLFLLTPLLLIIVSYTLIILSIFKISSSEGRSKPSST
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CCDS35 KDVKEAVKHLLRRKNFNK
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CCDS35 RFTDFDVSNISIYLNHVLFYTTQQAGDLEHMETRNYSAMTEFFLVGLSQYPELQLFLFLL
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CCDS35 -NTNTSDEIIGLSYGVVSPMLNPIIYSLRNKEVKEAVKKVLSRHLHLLKM
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CCDS67 MQGENFTIWSIFFLEGFSQYPGLEVVLFVFSLVMYLTTLLGNSTLILITILDSRLKTPMY
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CCDS67 NKEVKDAMKKLLGKITLHQTHEHL
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CCDS35 MFPANWTSVKVFFFLGFFHYPKVQVIIFAVCLLMYLITLLGNIFLISITILDSHLHTPMY
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CCDS35 LFLSNLSFLDIWYSSSALSPMLANFVSGRNTISFSGCATQMYLSLAMGSTECVLLPMMAY
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CCDS35 ILAILKLVCVDTSLVQLIMLVISVLLLPMPMLLICISYAFILASILRISSVEGRSKAFST
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