Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7218
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7218, 250 aa
1>>>pF1KB7218 250 - 250 aa - 250 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1624+/-0.000698; mu= 16.0199+/- 0.042
mean_var=77.8863+/-15.187, 0's: 0 Z-trim(111.6): 173 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.145326
statistics sampled from 12316 (12497) to 12316 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.756), E-opt: 0.2 (0.384), width: 16
Scan time: 2.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12816.1 KLK9 gene_id:284366|Hs108|chr19 ( 250) 1816 389.6 1.1e-108
CCDS12819.1 KLK11 gene_id:11012|Hs108|chr19 ( 250) 1009 220.4 9.4e-58
CCDS12818.1 KLK11 gene_id:11012|Hs108|chr19 ( 282) 1009 220.4 1e-57
CCDS12813.1 KLK8 gene_id:11202|Hs108|chr19 ( 260) 897 196.9 1.1e-50
CCDS42600.1 KLK8 gene_id:11202|Hs108|chr19 ( 305) 897 196.9 1.3e-50
CCDS12823.2 KLK14 gene_id:43847|Hs108|chr19 ( 267) 826 182.0 3.5e-46
CCDS12810.1 KLK5 gene_id:25818|Hs108|chr19 ( 293) 815 179.7 1.9e-45
CCDS12822.1 KLK13 gene_id:26085|Hs108|chr19 ( 277) 781 172.6 2.5e-43
CCDS12821.1 KLK12 gene_id:43849|Hs108|chr19 ( 248) 767 169.6 1.8e-42
CCDS54297.1 KLK11 gene_id:11012|Hs108|chr19 ( 275) 755 167.1 1.1e-41
CCDS12820.1 KLK12 gene_id:43849|Hs108|chr19 ( 254) 713 158.3 4.6e-39
CCDS12811.1 KLK6 gene_id:5653|Hs108|chr19 ( 244) 708 157.2 9.2e-39
CCDS12808.1 KLK2 gene_id:3817|Hs108|chr19 ( 261) 707 157.1 1.1e-38
CCDS12807.1 KLK3 gene_id:354|Hs108|chr19 ( 261) 707 157.1 1.1e-38
CCDS62766.1 KLK15 gene_id:55554|Hs108|chr19 ( 255) 695 154.5 6.3e-38
CCDS12805.1 KLK15 gene_id:55554|Hs108|chr19 ( 256) 691 153.7 1.1e-37
CCDS12804.1 KLK1 gene_id:3816|Hs108|chr19 ( 262) 682 151.8 4.2e-37
CCDS47958.1 PRSS3 gene_id:5646|Hs108|chr9 ( 304) 677 150.8 9.8e-37
CCDS12812.1 KLK7 gene_id:5650|Hs108|chr19 ( 253) 676 150.5 9.9e-37
CCDS56570.1 PRSS3 gene_id:5646|Hs108|chr9 ( 240) 674 150.1 1.3e-36
CCDS6545.1 PRSS3 gene_id:5646|Hs108|chr9 ( 247) 674 150.1 1.3e-36
CCDS56571.1 PRSS3 gene_id:5646|Hs108|chr9 ( 261) 674 150.1 1.4e-36
CCDS12817.1 KLK10 gene_id:5655|Hs108|chr19 ( 276) 671 149.5 2.2e-36
CCDS5872.1 PRSS1 gene_id:5644|Hs108|chr7 ( 247) 660 147.2 9.9e-36
CCDS83236.1 PRSS2 gene_id:5645|Hs108|chr7 ( 247) 631 141.1 6.7e-34
CCDS12809.1 KLK4 gene_id:9622|Hs108|chr19 ( 254) 622 139.2 2.5e-33
CCDS74433.1 KLK8 gene_id:11202|Hs108|chr19 ( 139) 548 123.5 7.6e-29
CCDS59414.1 KLK7 gene_id:5650|Hs108|chr19 ( 181) 521 117.9 4.7e-27
CCDS3964.1 GZMK gene_id:3003|Hs108|chr5 ( 264) 509 115.5 3.5e-26
CCDS83235.1 PRSS2 gene_id:5645|Hs108|chr7 ( 261) 507 115.1 4.7e-26
CCDS13571.1 TMPRSS15 gene_id:5651|Hs108|chr21 (1019) 510 116.2 8.4e-26
CCDS58675.1 KLK2 gene_id:3817|Hs108|chr19 ( 159) 497 112.8 1.4e-25
CCDS12088.1 TMPRSS9 gene_id:360200|Hs108|chr19 (1059) 505 115.2 1.8e-25
CCDS74856.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 ( 802) 503 114.7 1.9e-25
CCDS13941.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 ( 811) 503 114.7 2e-25
CCDS46155.1 KLK3 gene_id:354|Hs108|chr19 ( 218) 492 111.9 3.6e-25
CCDS82261.1 CFD gene_id:1675|Hs108|chr19 ( 260) 489 111.3 6.4e-25
CCDS12046.1 CFD gene_id:1675|Hs108|chr19 ( 253) 488 111.1 7.2e-25
CCDS42597.1 KLK2 gene_id:3817|Hs108|chr19 ( 223) 483 110.0 1.4e-24
CCDS33083.1 KLK3 gene_id:354|Hs108|chr19 ( 238) 483 110.1 1.4e-24
CCDS10852.1 CTRL gene_id:1506|Hs108|chr16 ( 264) 481 109.7 2.1e-24
CCDS9632.1 GZMH gene_id:2999|Hs108|chr14 ( 246) 480 109.4 2.3e-24
CCDS42599.1 KLK6 gene_id:5653|Hs108|chr19 ( 137) 468 106.7 8.4e-24
CCDS12806.2 KLK15 gene_id:55554|Hs108|chr19 ( 160) 467 106.6 1.1e-23
CCDS3965.1 GZMA gene_id:3001|Hs108|chr5 ( 262) 468 106.9 1.4e-23
CCDS32489.1 CTRB2 gene_id:440387|Hs108|chr16 ( 263) 466 106.5 1.8e-23
CCDS32490.1 CTRB1 gene_id:1504|Hs108|chr16 ( 263) 463 105.9 2.8e-23
CCDS9633.1 GZMB gene_id:3002|Hs108|chr14 ( 247) 461 105.5 3.6e-23
CCDS83495.1 F9 gene_id:2158|Hs108|chrX ( 423) 461 105.7 5.4e-23
CCDS14666.1 F9 gene_id:2158|Hs108|chrX ( 461) 461 105.7 5.8e-23
>>CCDS12816.1 KLK9 gene_id:284366|Hs108|chr19 (250 aa)
initn: 1816 init1: 1816 opt: 1816 Z-score: 2064.7 bits: 389.6 E(32554): 1.1e-108
Smith-Waterman score: 1816; 100.0% identity (100.0% similar) in 250 aa overlap (1-250:1-250)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKLGLLCALLSLLAGHGWADTRAIGAEECRPNSQPWQAGLFHLTRLFCGATLISDRWLLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MKLGLLCALLSLLAGHGWADTRAIGAEECRPNSQPWQAGLFHLTRLFCGATLISDRWLLT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 AAHCRKPYLWVRLGEHHLWKWEGPEQLFRVTDFFPHPGFNKDLSANDHNDDIMLIRLPRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AAHCRKPYLWVRLGEHHLWKWEGPEQLFRVTDFFPHPGFNKDLSANDHNDDIMLIRLPRQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 ARLSPAVQPLNLSQTCVSPGMQCLISGWGAVSSPKALFPVTLQCANISILENKLCHWAYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ARLSPAVQPLNLSQTCVSPGMQCLISGWGAVSSPKALFPVTLQCANISILENKLCHWAYP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 GHISDSMLCAGLWEGGRGSCQGDSGGPLVCNGTLAGVVSGGAEPCSRPRRPAVYTSVCHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GHISDSMLCAGLWEGGRGSCQGDSGGPLVCNGTLAGVVSGGAEPCSRPRRPAVYTSVCHY
190 200 210 220 230 240
250
pF1KB7 LDWIQEIMEN
::::::::::
CCDS12 LDWIQEIMEN
250
>>CCDS12819.1 KLK11 gene_id:11012|Hs108|chr19 (250 aa)
initn: 1009 init1: 1009 opt: 1009 Z-score: 1150.3 bits: 220.4 E(32554): 9.4e-58
Smith-Waterman score: 1009; 57.0% identity (81.4% similar) in 242 aa overlap (9-250:8-249)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKLGLLCALLSLLAGHGWADTRAIGAEECRPNSQPWQAGLFHLTRLFCGATLISDRWLLT
::.: .: ..:: : . ::.:.::::::.::. :::.::::::. :::::
CCDS12 MRILQLILLALATGLVGGETRIIKGFECKPHSQPWQAALFEKTRLLCGATLIAPRWLLT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 AAHCRKPYLWVRLGEHHLWKWEGPEQLFRVTDFFPHPGFNKDLSANDHNDDIMLIRLPRQ
:::: :: :.::.:.: : :: :: .:. :::::::..: .:: .::::...
CCDS12 AAHCLKPRYIVHLGQHNLQKEEGCEQTRTATESFPHPGFNNSLPNKDHRNDIMLVKMASP
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 ARLSPAVQPLNLSQTCVSPGMQCLISGWGAVSSPKALFPVTLQCANISILENKLCHWAYP
. .. ::.::.::. ::. : .:::::::..:::. .: ::.::::.:.:.. :. :::
CCDS12 VSITWAVRPLTLSSRCVTAGTSCLISGWGSTSSPQLRLPHTLRCANITIIEHQKCENAYP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 GHISDSMLCAGLWEGGRGSCQGDSGGPLVCNGTLAGVVSGGAEPCSRPRRPAVYTSVCHY
:.:.:.:.::.. :::. ::::::::::::: .: :..: : .::. :.:.:::.::.:
CCDS12 GNITDTMVCASVQEGGKDSCQGDSGGPLVCNQSLQGIISWGQDPCAITRKPGVYTKVCKY
180 190 200 210 220 230
250
pF1KB7 LDWIQEIMEN
.::::: :.:
CCDS12 VDWIQETMKNN
240 250
>>CCDS12818.1 KLK11 gene_id:11012|Hs108|chr19 (282 aa)
initn: 1009 init1: 1009 opt: 1009 Z-score: 1149.6 bits: 220.4 E(32554): 1e-57
Smith-Waterman score: 1009; 57.0% identity (81.4% similar) in 242 aa overlap (9-250:40-281)
10 20 30
pF1KB7 MKLGLLCALLSLLAGHGWADTRAIGAEECRPNSQPWQA
::.: .: ..:: : . ::.:.::::::
CCDS12 WKSSGRGLTAAKEPGARSSPLQAMRILQLILLALATGLVGGETRIIKGFECKPHSQPWQA
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 GLFHLTRLFCGATLISDRWLLTAAHCRKPYLWVRLGEHHLWKWEGPEQLFRVTDFFPHPG
.::. :::.::::::. ::::::::: :: :.::.:.: : :: :: .:. :::::
CCDS12 ALFEKTRLLCGATLIAPRWLLTAAHCLKPRYIVHLGQHNLQKEEGCEQTRTATESFPHPG
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 FNKDLSANDHNDDIMLIRLPRQARLSPAVQPLNLSQTCVSPGMQCLISGWGAVSSPKALF
::..: .:: .::::... . .. ::.::.::. ::. : .:::::::..:::. .
CCDS12 FNNSLPNKDHRNDIMLVKMASPVSITWAVRPLTLSSRCVTAGTSCLISGWGSTSSPQLRL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 PVTLQCANISILENKLCHWAYPGHISDSMLCAGLWEGGRGSCQGDSGGPLVCNGTLAGVV
: ::.::::.:.:.. :. ::::.:.:.:.::.. :::. ::::::::::::: .: :..
CCDS12 PHTLRCANITIIEHQKCENAYPGNITDTMVCASVQEGGKDSCQGDSGGPLVCNQSLQGII
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250
pF1KB7 SGGAEPCSRPRRPAVYTSVCHYLDWIQEIMEN
: : .::. :.:.:::.::.:.::::: :.:
CCDS12 SWGQDPCAITRKPGVYTKVCKYVDWIQETMKNN
250 260 270 280
>>CCDS12813.1 KLK8 gene_id:11202|Hs108|chr19 (260 aa)
initn: 884 init1: 335 opt: 897 Z-score: 1023.2 bits: 196.9 E(32554): 1.1e-50
Smith-Waterman score: 897; 50.0% identity (83.1% similar) in 236 aa overlap (14-248:23-256)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MKLGLLCALLSLLAGHGWA-DTRAIGAEECRPNSQPWQAGLFHLTRLFCGA
:::. : . ...:..::.:.::::::.::. .:.::.
CCDS12 MGRPRPRAAKTWMFLLLLGGAWAGHSRAQEDKVLGGHECQPHSQPWQAALFQGQQLLCGG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 TLISDRWLLTAAHCRKPYLWVRLGEHHLWKWEGPEQLFRVTDFFPHPGFNKDLSANDHND
.:.. :.::::::.:: ::::.: : . .:::: . :.. .::: .:.. ...:::
CCDS12 VLVGGNWVLTAAHCKKPKYTVRLGDHSLQNKDGPEQEIPVVQSIPHPCYNSS-DVEDHNH
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 DIMLIRLPRQARLSPAVQPLNLSQTCVSPGMQCLISGWGAVSSPKALFPVTLQCANISIL
:.::..: :: :. :.:..:.. :..::..: .::::.:.::. :: ::.::...:.
CCDS12 DLMLLQLRDQASLGSKVKPISLADHCTQPGQKCTVSGWGTVTSPRENFPDTLNCAEVKIF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 ENKLCHWAYPGHISDSMLCAGLWEGGRGSCQGDSGGPLVCNGTLAGVVSGGAEPCSRPRR
.: :. ::::.:.:.:.::: .:. .:::::::::::.:.: :..: :..::.: .
CCDS12 PQKKCEDAYPGQITDGMVCAGSSKGA-DTCQGDSGGPLVCDGALQGITSWGSDPCGRSDK
180 190 200 210 220 230
240 250
pF1KB7 PAVYTSVCHYLDWIQEIMEN
:.:::..:.:::::..:.
CCDS12 PGVYTNICRYLDWIKKIIGSKG
240 250 260
>>CCDS42600.1 KLK8 gene_id:11202|Hs108|chr19 (305 aa)
initn: 884 init1: 335 opt: 897 Z-score: 1022.2 bits: 196.9 E(32554): 1.3e-50
Smith-Waterman score: 897; 50.0% identity (83.1% similar) in 236 aa overlap (14-248:68-301)
10 20 30 40
pF1KB7 MKLGLLCALLSLLAGHGWA-DTRAIGAEECRPNSQPWQAGLFH
:::. : . ...:..::.:.::::::.::.
CCDS42 NLPCVHLNPQWPSQPSHCPRGWRSNPLPPAAGHSRAQEDKVLGGHECQPHSQPWQAALFQ
40 50 60 70 80 90
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 LTRLFCGATLISDRWLLTAAHCRKPYLWVRLGEHHLWKWEGPEQLFRVTDFFPHPGFNKD
.:.::..:.. :.::::::.:: ::::.: : . .:::: . :.. .::: .:..
CCDS42 GQQLLCGGVLVGGNWVLTAAHCKKPKYTVRLGDHSLQNKDGPEQEIPVVQSIPHPCYNSS
100 110 120 130 140 150
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 LSANDHNDDIMLIRLPRQARLSPAVQPLNLSQTCVSPGMQCLISGWGAVSSPKALFPVTL
...::: :.::..: :: :. :.:..:.. :..::..: .::::.:.::. :: ::
CCDS42 -DVEDHNHDLMLLQLRDQASLGSKVKPISLADHCTQPGQKCTVSGWGTVTSPRENFPDTL
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 QCANISILENKLCHWAYPGHISDSMLCAGLWEGGRGSCQGDSGGPLVCNGTLAGVVSGGA
.::...:. .: :. ::::.:.:.:.::: .:. .:::::::::::.:.: :..: :.
CCDS42 NCAEVKIFPQKKCEDAYPGQITDGMVCAGSSKGA-DTCQGDSGGPLVCDGALQGITSWGS
220 230 240 250 260 270
230 240 250
pF1KB7 EPCSRPRRPAVYTSVCHYLDWIQEIMEN
.::.: .:.:::..:.:::::..:.
CCDS42 DPCGRSDKPGVYTNICRYLDWIKKIIGSKG
280 290 300
>>CCDS12823.2 KLK14 gene_id:43847|Hs108|chr19 (267 aa)
initn: 874 init1: 548 opt: 826 Z-score: 942.6 bits: 182.0 E(32554): 3.5e-46
Smith-Waterman score: 826; 45.5% identity (75.7% similar) in 255 aa overlap (2-250:16-266)
10 20 30 40
pF1KB7 MKLGLLCALLSLLA---GHGWAD-TRAIGAEECRPNSQPWQAGLFH
:. :: . :..:: .. : .. ::.. : .::::::.:.
CCDS12 MSLRVLGSGTWPSAPKMFLLLTALQVLAIAMTQSQEDENKIIGGHTCTRSSQPWQAALLA
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 --LTRLFCGATLISDRWLLTAAHCRKPYLWVRLGEHHLWKWEGPEQLFRVTDFFPHPGFN
:..::..:.: .:..::::: .: : : ::.:.: .::. .:..::. ::..:
CCDS12 GPRRRFLCGGALLSGQWVITAAHCGRPILQVALGKHNLRRWEATQQVLRVVRQVTHPNYN
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 KDLSANDHNDDIMLIRLPRQARLSPAVQPLNLSQTCVSPGMQCLISGWGAVSSPKALFPV
. :..:.::..: . ::.. ::.:....:.:.::: .: .::::..::: : .:.
CCDS12 ----SRTHDNDLMLLQLQQPARIGRAVRPIEVTQACASPGTSCRVSGWGTISSPIARYPA
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 TLQCANISILENKLCHWAYPGHISDSMLCAGLWEGGRGSCQGDSGGPLVCNGTLAGVVSG
.:::.::.: ...:. ::: :. .:.:::. .::. :::::::::::: : : :.::
CCDS12 SLQCVNINISPDEVCQKAYPRTITPGMVCAGVPQGGKDSCQGDSGGPLVCRGQLQGLVSW
180 190 200 210 220 230
230 240 250
pF1KB7 GAEPCSRPRRPAVYTSVCHYLDWIQEIMEN
: : :. : :.:::..:.: .::.: :..
CCDS12 GMERCALPGYPGVYTNLCKYRSWIEETMRDK
240 250 260
>>CCDS12810.1 KLK5 gene_id:25818|Hs108|chr19 (293 aa)
initn: 740 init1: 323 opt: 815 Z-score: 929.6 bits: 179.7 E(32554): 1.9e-45
Smith-Waterman score: 815; 48.9% identity (77.3% similar) in 233 aa overlap (19-249:63-290)
10 20 30 40
pF1KB7 MKLGLLCALLSLLAGHGWADTRAIGAEECRPNSQPWQAGLF-HLTRLF
...: :.. .: ..:::::.:. . ..:.
CCDS12 VSCDHPSNTVPSGSNQDLGAGAGEDARSDDSSSRIINGSDCDMHTQPWQAALLLRPNQLY
40 50 60 70 80 90
50 60 70 80 90 100
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230 240 250
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..: ..:. .: : ::.. ..:: : .::::...::.. .: :::::::.. ..
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CCDS12 YTRVSRYVLWIRETIRKYETQQQKWLKGPQ
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CCDS12 TAAHCSGSRYWVRLGEHSLSQLDWTEQI-RHSGFSVTHPGYLGASTSHEHDLRLLRLRLP
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CCDS12 --VRVTSSVQPLPLPNDCATAGTECHVSGWGITNHPRNPFPDLLQCLNLSIVSHATCHGV
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240
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]