Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7211
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7211, 313 aa
1>>>pF1KB7211 313 - 313 aa - 313 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1403+/-0.00147; mu= 11.1281+/- 0.086
mean_var=182.2293+/-65.192, 0's: 0 Z-trim(101.0): 437 B-trim: 372 in 1/46
Lambda= 0.095009
statistics sampled from 5793 (6322) to 5793 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.537), E-opt: 0.2 (0.194), width: 16
Scan time: 2.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 2035 292.4 3.1e-79
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 1609 234.0 1.2e-61
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 1557 226.8 1.7e-59
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 1316 193.8 1.5e-49
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 1184 175.7 4.1e-44
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 1175 174.5 9.6e-44
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 1149 170.9 1.1e-42
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 1135 169.0 4.4e-42
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 1122 167.2 1.5e-41
CCDS31545.1 OR1S2 gene_id:219958|Hs108|chr11 ( 325) 1118 166.7 2.2e-41
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 1110 165.6 4.6e-41
CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 1100 164.2 1.2e-40
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 1098 163.9 1.5e-40
CCDS32937.1 OR1I1 gene_id:126370|Hs108|chr19 ( 355) 1096 163.7 1.9e-40
CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 1085 162.1 4.9e-40
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 1082 161.7 6.7e-40
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 1078 161.2 9.6e-40
CCDS45955.1 OR7E24 gene_id:26648|Hs108|chr19 ( 339) 1075 160.8 1.3e-39
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 1072 160.4 1.7e-39
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 1062 159.0 4.4e-39
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 1055 158.0 8.5e-39
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 1052 157.6 1.1e-38
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 1052 157.6 1.1e-38
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 1049 157.2 1.5e-38
CCDS32897.1 OR7G2 gene_id:390882|Hs108|chr19 ( 345) 1047 157.0 1.9e-38
CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 ( 312) 1039 155.8 3.9e-38
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 1029 154.5 1e-37
CCDS11021.1 OR1A2 gene_id:26189|Hs108|chr17 ( 309) 1023 153.6 1.8e-37
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 1018 152.9 2.9e-37
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 1012 152.1 5.1e-37
CCDS35125.1 OR1Q1 gene_id:158131|Hs108|chr9 ( 314) 1003 150.9 1.2e-36
CCDS32898.2 OR7G1 gene_id:125962|Hs108|chr19 ( 311) 976 147.2 1.6e-35
CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 ( 312) 965 145.7 4.4e-35
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 955 144.3 1.1e-34
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 954 144.2 1.3e-34
CCDS35132.1 OR1K1 gene_id:392392|Hs108|chr9 ( 316) 951 143.8 1.7e-34
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 943 142.7 3.7e-34
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 938 142.0 5.7e-34
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 938 142.0 5.7e-34
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 936 141.7 7e-34
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 936 141.7 7e-34
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 933 141.3 9.3e-34
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 932 141.2 1e-33
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 932 141.2 1.1e-33
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 931 141.0 1.1e-33
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 922 139.8 2.6e-33
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 915 138.9 5.3e-33
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 914 138.7 5.6e-33
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 908 137.9 1e-32
CCDS4658.1 OR12D3 gene_id:81797|Hs108|chr6 ( 316) 907 137.7 1.1e-32
>>CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 (313 aa)
initn: 2035 init1: 2035 opt: 2035 Z-score: 1535.9 bits: 292.4 E(32554): 3.1e-79
Smith-Waterman score: 2035; 100.0% identity (100.0% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFTLFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFTLFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMDMRTKYKSILYEECISQMYFFIFFTDLDSFLITSMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMDMRTKYKSILYEECISQMYFFIFFTDLDSFLITSMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYVAICHPLHYTVIMREELCVFLVAVSWILSCASSLSHTLLLTRLSFCAANTIPHVFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DRYVAICHPLHYTVIMREELCVFLVAVSWILSCASSLSHTLLLTRLSFCAANTIPHVFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LAALLKLSCSDIFLNELVMFTVGVVVITLPFMCILVSYGYIGATILRVPSTKGIHKALST
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CCDS35 LAALLKLSCSDIFLNELVMFTVGVVVITLPFMCILVSYGYIGATILRVPSTKGIHKALST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CGSHLSVVSLYYGSIFGQYLFPTVSSSIDKDVIVALMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 CGSHLSVVSLYYGSIFGQYLFPTVSSSIDKDVIVALMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKEA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 LGKLFSRATFFSW
:::::::::::::
CCDS35 LGKLFSRATFFSW
310
>>CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 (313 aa)
initn: 1635 init1: 1605 opt: 1609 Z-score: 1220.3 bits: 234.0 E(32554): 1.2e-61
Smith-Waterman score: 1609; 77.9% identity (93.6% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFTLFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
:. :::::::::::: ::: :::::::::::::::: ::::::::.:::.:::::::::.
CCDS35 MKRENQSSVSEFLLLDLPIWPEQQAVFFTLFLGMYLITVLGNLLIILLIRLDSHLHTPMF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMDMRTKYKSILYEECISQMYFFIFFTDLDSFLITSMAY
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CCDS35 FFLSHLALTDISLSSVTVPKMLLSMQTQDQSILYAGCVTQMYFFIFFTDLDNFLLTSMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYVAICHPLHYTVIMREELCVFLVAVSWILSCASSLSHTLLLTRLSFCAANTIPHVFCD
::::::::::.::.::.: :: .::.:::::::...:::::::..::::: ::::: :::
CCDS35 DRYVAICHPLRYTTIMKEGLCNLLVTVSWILSCTNALSHTLLLAQLSFCADNTIPHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LAALLKLSCSDIFLNELVMFTVGVVVITLPFMCILVSYGYIGATILRVPSTKGIHKALST
:.:::::::::: :::::.:::: .:::::..:::.:::.::.:::..:::::: :::::
CCDS35 LVALLKLSCSDISLNELVIFTVGQAVITLPLICILISYGHIGVTILKAPSTKGIFKALST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CGSHLSVVSLYYGSIFGQYLFPTVSSSIDKDVIVALMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKEA
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CCDS35 CGSHLSVVSLYYGTIIGLYFLPSSSASSDKDVIASVMYTVITPLLNPFIYSLRNRDIKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 LGKLFSRATFFSW
: .::.::: .:
CCDS35 LERLFNRATVLSQ
310
>>CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 (322 aa)
initn: 1596 init1: 1557 opt: 1557 Z-score: 1181.7 bits: 226.8 E(32554): 1.7e-59
Smith-Waterman score: 1557; 75.0% identity (92.5% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFTLFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFALFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMDMRTKYKSILYEECISQMYFFIFFTDLDSFLITSMAY
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CCDS35 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMNMQTQHLAVFYKGCISQTYFFIFFADLDSFLITSMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYVAICHPLHYTVIMREELCVFLVAVSWILSCASSLSHTLLLTRLSFCAANTIPHVFCD
::::::::::::..:: . ::.::: ::...:: .: :::::..::::: . ::: :::
CCDS35 DRYVAICHPLHYATIMTQSQCVMLVAGSWVIACACALLHTLLLAQLSFCADHIIPHYFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LAALLKLSCSDIFLNELVMFTVGVVVITLPFMCILVSYGYIGATILRVPSTKGIHKALST
:.::::::::: ::.:..::.....: :::.:::::::.::.:::..:::::: :::::
CCDS35 LGALLKLSCSDTSLNQLAIFTAALTAIMLPFLCILVSYGHIGVTILQIPSTKGICKALST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CGSHLSVVSLYYGSIFGQYLFPTVSSSIDKDVIVALMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKEA
::::::::..:: .:.: :..: :.. ::..:....::.::::::::::::::.:.: :
CCDS35 CGSHLSVVTIYYRTIIGLYFLPPSSNTNDKNIIASVIYTAVTPMLNPFIYSLRNKDIKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 LGKLFSRATFFSW
: ::.::.
CCDS35 LRKLLSRSGAVAHACNLNTLGG
310 320
>>CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 (314 aa)
initn: 1350 init1: 1299 opt: 1316 Z-score: 1003.3 bits: 193.8 E(32554): 1.5e-49
Smith-Waterman score: 1316; 61.3% identity (86.9% similar) in 313 aa overlap (1-312:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFTLFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
: .::.:.:.::::::::.:::: . ..:::.:::::.::::::..::.::::::::::
CCDS11 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMDMRTKYKSILYEECISQMYFFIFFTDLDSFLITSMAY
.:::.:...:. :::::.::.:..:... :: : .:..:::::..: ::.:::...:::
CCDS11 LFLSNLSFSDLCFSSVTIPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLLFGDLESFLLVAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYVAICHPLHYTVIMREELCVFLVAVSWILSCASSLSHTLLLTRLSFCAANTIPHVFCD
::::::: :::::.:: ::. :::.::.:. .. ::::..:: ::: :.::: :::
CCDS11 DRYVAICFPLHYTAIMSPMLCLALVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLCFCADNVIPHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LAALLKLSCSDIFLNELVMFTVGVVVITLPFMCILVSYGYIGATILRVPSTKGIHKALST
..:::::. :: .:: :.: .: .....::. :: ::. : ..::.:::.::: ::.::
CCDS11 MSALLKLAFSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSILKVPSSKGICKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CGSHLSVVSLYYGSIFGQYLFPTVSSSIDKDVIVALMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKEA
::::::::::.::...: :: ...:: ::...:.:::::::::::::::::::::: :
CCDS11 CGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCSSANSSTLKDTVMAMMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 LGKLF-SRATFFSW
:.... .. ::::
CCDS11 LSRVIHQKKTFFSL
310
>>CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 (312 aa)
initn: 1203 init1: 1184 opt: 1184 Z-score: 905.5 bits: 175.7 E(32554): 4.1e-44
Smith-Waterman score: 1184; 56.8% identity (82.9% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFTLFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
:: ::::::::::::: .:.:: ..:..::.:::.::::::::.: ...:: ::::::
CCDS10 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMDMRTKYKSILYEECISQMYFFIFFTDLDSFLITSMAY
::::.:...:: :: .:::::: . . ..: . :..:::: ..:.:.:.::.. :::
CCDS10 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYVAICHPLHYTVIMREELCVFLVAVSWILSCASSLSHTLLLTRLSFCAANTIPHVFCD
:..::.:::::::. : ..::..::: :... . : ::::.. ::::: :.: : :::
CCDS10 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LAALLKLSCSDIFLNELVMFTVGVVVITLPFMCILVSYGYIGATILRVPSTKGIHKALST
.. :::::::: :::..... :..:. ::.:::.:: .: :.:.:::::: ::.::
CCDS10 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CGSHLSVVSLYYGSIFGQYLFPTVSSSIDKDVIVALMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKEA
:::::.:: :.:..:.. :. : : : .::......:::::::::::::::::: .: :
CCDS10 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 LGKLFSRATFFSW
: :. .:..:
CCDS10 LKKVVGRVVFSV
310
>>CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 (311 aa)
initn: 1201 init1: 1175 opt: 1175 Z-score: 898.8 bits: 174.5 E(32554): 9.6e-44
Smith-Waterman score: 1175; 53.7% identity (82.5% similar) in 309 aa overlap (4-312:2-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFTLFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
:::::.:::.: :. :::: .: .:: :::.:. :::::.: : : :::::::
CCDS68 MENQSSISEFFLRGISAPPEQQQSLFGIFLCMYLVTLTGNLLIILAIGSDLHLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMDMRTKYKSILYEECISQMYFFIFFTDLDSFLITSMAY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]