Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7205
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7205, 426 aa
1>>>pF1KB7205 426 - 426 aa - 426 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3660+/-0.000757; mu= 13.7792+/- 0.046
mean_var=110.5671+/-21.966, 0's: 0 Z-trim(112.8): 18 B-trim: 58 in 2/49
Lambda= 0.121972
statistics sampled from 13491 (13505) to 13491 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.759), E-opt: 0.2 (0.415), width: 16
Scan time: 3.510
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12802.1 ACPT gene_id:93650|Hs108|chr19 ( 426) 2922 524.5 7.4e-149
CCDS7928.1 ACP2 gene_id:53|Hs108|chr11 ( 423) 1112 206.0 5.5e-53
CCDS76402.1 ACP2 gene_id:53|Hs108|chr11 ( 395) 1072 199.0 6.9e-51
CCDS3073.1 ACPP gene_id:55|Hs108|chr3 ( 386) 1034 192.3 7e-49
CCDS46916.1 ACPP gene_id:55|Hs108|chr3 ( 418) 1034 192.3 7.4e-49
CCDS76403.1 ACP2 gene_id:53|Hs108|chr11 ( 391) 942 176.1 5.3e-44
CCDS76404.1 ACP2 gene_id:53|Hs108|chr11 ( 360) 513 100.6 2.6e-21
CCDS77818.1 ACPP gene_id:55|Hs108|chr3 ( 353) 479 94.6 1.6e-19
>>CCDS12802.1 ACPT gene_id:93650|Hs108|chr19 (426 aa)
initn: 2922 init1: 2922 opt: 2922 Z-score: 2786.0 bits: 524.5 E(32554): 7.4e-149
Smith-Waterman score: 2922; 100.0% identity (100.0% similar) in 426 aa overlap (1-426:1-426)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAGLGFWGHPAGPLLLLLLLVLPPRALPEGPLVFVALVFRHGDRAPLASYPMDPHKEVAS
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CCDS12 MAGLGFWGHPAGPLLLLLLLVLPPRALPEGPLVFVALVFRHGDRAPLASYPMDPHKEVAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 TLWPRGLGQLTTEGVRQQLELGRFLRSRYEAFLSPEYRREEVYIRSTDFDRTLESAQANL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TLWPRGLGQLTTEGVRQQLELGRFLRSRYEAFLSPEYRREEVYIRSTDFDRTLESAQANL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AGLFPEAAPGSPEARWRPIPVHTVPVAEDKLLRFPMRSCPRYHELLREATEAAEYQEALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AGLFPEAAPGSPEARWRPIPVHTVPVAEDKLLRFPMRSCPRYHELLREATEAAEYQEALE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 GWTGFLSRLENFTGLSLVGEPLRRAWKVLDTLMCQQAHGLPLPAWASPDVLRTLAQISAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GWTGFLSRLENFTGLSLVGEPLRRAWKVLDTLMCQQAHGLPLPAWASPDVLRTLAQISAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 DIGAHVGPPRAAEKAQLTGGILLNAILANFSRVQRLGLPLKMVMYSAHDSTLLALQGALG
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CCDS12 DIGAHVGPPRAAEKAQLTGGILLNAILANFSRVQRLGLPLKMVMYSAHDSTLLALQGALG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LYDGHTPPYAACLGFEFRKHLGNPAKDGGNVTVSLFYRNDSAHLPLPLSLPGCPAPCPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LYDGHTPPYAACLGFEFRKHLGNPAKDGGNVTVSLFYRNDSAHLPLPLSLPGCPAPCPLG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 RFYQLTAPARPPAHGVSCHGPYEAAIPPAPVVPLLAGAVAVLVALSLGLGLLAWRPGCLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RFYQLTAPARPPAHGVSCHGPYEAAIPPAPVVPLLAGAVAVLVALSLGLGLLAWRPGCLR
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 ALGGPV
::::::
CCDS12 ALGGPV
>>CCDS7928.1 ACP2 gene_id:53|Hs108|chr11 (423 aa)
initn: 705 init1: 544 opt: 1112 Z-score: 1064.7 bits: 206.0 E(32554): 5.5e-53
Smith-Waterman score: 1112; 44.4% identity (68.9% similar) in 428 aa overlap (1-417:1-412)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAGL-GFWGHPAGPLLLLL---LLVLPP-RALPEGPLVFVALVFRHGDRAPLASYPMDPH
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CCDS79 MAGKRSGWSR-AALLQLLLGVNLVVMPPTRA---RSLRFVTLLYRHGDRSPVKTYPKDPY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 KEVASTLWPRGLGQLTTEGVRQQLELGRFLRSRYEAFLSPEYRREEVYIRSTDFDRTLES
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CCDS79 QEEE---WPQGFGQLTKEGMLQHWELGQALRQRYHGFLNTSYHRQEVYVRSTDFDRTLMS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 AQANLAGLFPEAAPG--SPEARWRPIPVHTVPVAEDKLLRFPMRSCPRYHELLREATEAA
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CCDS79 AEANLAGLFPPNGMQRFNPNISWQPIPVHTVPITEDRLLKFPLGPCPRYEQLQNETRQTP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 EYQEALEGWTGFLSRLENFTGLSLVGEPLRRAWKVLDTLMCQQAHGLPLPAWASPDVLRT
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CCDS79 EYQNESSRNAQFLDMVANETGLTDL--TLETVWNVYDTLFCEQTHGLRLPPWASPQTMQR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 LAQISALDIGAHVGPPRAAEKAQLTGGILLNAILANFSRVQRLG-LPLKMVMYSAHDSTL
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CCDS79 LSRLKDFSFRFLFGIYQQAEKARLQGGVLLAQIRKNLTLMATTSQLP-KLLVYSAHDTTL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 LALQGALGLYDGHTPPYAACLGFEFRKHLGNPAKDGGNVTVSLFYRNDSAHLPLPLSLPG
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CCDS79 VALQMALDVYNGEQAPYASCHIFELYQ------EDSGNFSVEMYFRNESDKAPWPLSLPG
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KB7 CPAPCPLGRFYQLTAPARPPAHGVSCH---GPYEAAIPPAPVVPLLAGAVAVLVALSLGL
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CCDS79 CPHRCPLQDFLRLTEPVVPKDWQQECQLASGPADTEVIVALAVCGSILFLLIVLLLTVLF
350 360 370 380 390 400
410 420
pF1KB7 GLLAWRPGCLRALGGPV
. : ::
CCDS79 RMQAQPPGYRHVADGEDHA
410 420
>>CCDS76402.1 ACP2 gene_id:53|Hs108|chr11 (395 aa)
initn: 787 init1: 543 opt: 1072 Z-score: 1027.0 bits: 199.0 E(32554): 6.9e-51
Smith-Waterman score: 1072; 44.4% identity (69.7% similar) in 390 aa overlap (34-417:8-384)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 LGFWGHPAGPLLLLLLLVLPPRALPEGPLVFVALVFRHGDRAPLASYPMDPHKEVASTLW
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CCDS76 MGVRMTEYVGL-YRHGDRSPVKTYPKDPYQE---EEW
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PRGLGQLTTEGVRQQLELGRFLRSRYEAFLSPEYRREEVYIRSTDFDRTLESAQANLAGL
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CCDS76 PQGFGQLTKEGMLQHWELGQALRQRYHGFLNTSYHRQEVYVRSTDFDRTLMSAEANLAGL
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FPEAAPG--SPEARWRPIPVHTVPVAEDKLLRFPMRSCPRYHELLREATEAAEYQEALEG
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CCDS76 FPPNGMQRFNPNISWQPIPVHTVPITEDRLLKFPLGPCPRYEQLQNETRQTPEYQNESSR
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 WTGFLSRLENFTGLSLVGEPLRRAWKVLDTLMCQQAHGLPLPAWASPDVLRTLAQISALD
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CCDS76 NAQFLDMVANETGLTDL--TLETVWNVYDTLFCEQTHGLRLPPWASPQTMQRLSRLKDFS
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 IGAHVGPPRAAEKAQLTGGILLNAILANFSRVQRLG-LPLKMVMYSAHDSTLLALQGALG
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CCDS76 FRFLFGIYQQAEKARLQGGVLLAQIRKNLTLMATTSQLP-KLLVYSAHDTTLVALQMALD
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LYDGHTPPYAACLGFEFRKHLGNPAKDGGNVTVSLFYRNDSAHLPLPLSLPGCPAPCPLG
.:.:. :::.: ::. . .:.:: .: ...::.: . : :::::::: :::
CCDS76 VYNGEQAPYASCHIFELYQ------EDSGNFSVEMYFRNESDKAPWPLSLPGCPHRCPLQ
280 290 300 310 320
370 380 390 400 410
pF1KB7 RFYQLTAPARPPAHGVSCH---GPYEAAIPPAPVVPLLAGAVAVLVALSLGLGLLAWRPG
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CCDS76 DFLRLTEPVVPKDWQQECQLASGPADTEVIVALAVCGSILFLLIVLLLTVLFRMQAQPPG
330 340 350 360 370 380
420
pF1KB7 CLRALGGPV
CCDS76 YRHVADGEDHA
390
>>CCDS3073.1 ACPP gene_id:55|Hs108|chr3 (386 aa)
initn: 972 init1: 307 opt: 1034 Z-score: 991.0 bits: 192.3 E(32554): 7e-49
Smith-Waterman score: 1034; 43.3% identity (70.6% similar) in 367 aa overlap (15-378:18-372)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAGLGFWGHPAGPLLLLLLLVLPPRALPEGPLVFVALVFRHGDRAPLASYPMDPHKE
.:.::. :.. : ::.::::::::.:. ..: :: ::
CCDS30 MRAAPLLLARAASLSLGFLFLLFFWLDRSVLAKELKFVTLVFRHGDRSPIDTFPTDPIKE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 VASTLWPRGLGQLTTEGVRQQLELGRFLRSRYEAFLSPEYRREEVYIRSTDFDRTLESAQ
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CCDS30 SS---WPQGFGQLTQLGMEQHYELGEYIRKRYRKFLNESYKHEQVYIRSTDVDRTLMSAM
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 ANLAGLFPEAAPG--SPEARWRPIPVHTVPVAEDKLLRFPMRSCPRYHELLREATEAAEY
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CCDS30 TNLAALFPPEGVSIWNPILLWQPIPVHTVPLSEDQLLYLPFRNCPRFQELESETLKSEEF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 QEALEGWTGFLSRLENFTGLSLVGEPLRRAW-KVLDTLMCQQAHGLPLPAWASPDVLRTL
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CCDS30 QKRLHPYKDFIATLGKLSGLH--GQDLFGIWSKVYDPLYCESVHNFTLPSWATEDTMTKL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 AQISALDIGAHVGPPRAAEKAQLTGGILLNAILANFSRVQRLGLPLKMVMYSAHDSTLLA
..: :.. . : . ::..: ::.:.: :: ...:. .. :..::::::.:. .
CCDS30 RELSELSLLSLYGIHKQKEKSRLQGGVLVNEILNHMKRATQIPSYKKLIMYSAHDTTVSG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 LQGALGLYDGHTPPYAACLGFEFRKHLGNPAKDGGNVTVSLFYRNDSAHLPLPLSLPGCP
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CCDS30 LQMALDVYNGLLPPYASC-------HLTELYFEKGEYFVEMYYRNETQHEPYPLMLPGCS
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 APCPLGRFYQLTAPARPPAHGVSCHGPYEAAIPPAPVVPLLAGAVAVLVALSLGLGLLAW
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CCDS30 PSCPLERFAELVGPVIPQDWSTECMTTNSHQGTEDSTD
350 360 370 380
>>CCDS46916.1 ACPP gene_id:55|Hs108|chr3 (418 aa)
initn: 950 init1: 307 opt: 1034 Z-score: 990.6 bits: 192.3 E(32554): 7.4e-49
Smith-Waterman score: 1034; 43.3% identity (70.6% similar) in 367 aa overlap (15-378:18-372)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAGLGFWGHPAGPLLLLLLLVLPPRALPEGPLVFVALVFRHGDRAPLASYPMDPHKE
.:.::. :.. : ::.::::::::.:. ..: :: ::
CCDS46 MRAAPLLLARAASLSLGFLFLLFFWLDRSVLAKELKFVTLVFRHGDRSPIDTFPTDPIKE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 VASTLWPRGLGQLTTEGVRQQLELGRFLRSRYEAFLSPEYRREEVYIRSTDFDRTLESAQ
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CCDS46 SS---WPQGFGQLTQLGMEQHYELGEYIRKRYRKFLNESYKHEQVYIRSTDVDRTLMSAM
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 ANLAGLFPEAAPG--SPEARWRPIPVHTVPVAEDKLLRFPMRSCPRYHELLREATEAAEY
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CCDS46 TNLAALFPPEGVSIWNPILLWQPIPVHTVPLSEDQLLYLPFRNCPRFQELESETLKSEEF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 QEALEGWTGFLSRLENFTGLSLVGEPLRRAW-KVLDTLMCQQAHGLPLPAWASPDVLRTL
:. :. . :.. : ...:: :. : : :: : :.:...:.. ::.::. :.. :
CCDS46 QKRLHPYKDFIATLGKLSGLH--GQDLFGIWSKVYDPLYCESVHNFTLPSWATEDTMTKL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 AQISALDIGAHVGPPRAAEKAQLTGGILLNAILANFSRVQRLGLPLKMVMYSAHDSTLLA
..: :.. . : . ::..: ::.:.: :: ...:. .. :..::::::.:. .
CCDS46 RELSELSLLSLYGIHKQKEKSRLQGGVLVNEILNHMKRATQIPSYKKLIMYSAHDTTVSG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 LQGALGLYDGHTPPYAACLGFEFRKHLGNPAKDGGNVTVSLFYRNDSAHLPLPLSLPGCP
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CCDS46 LQMALDVYNGLLPPYASC-------HLTELYFEKGEYFVEMYYRNETQHEPYPLMLPGCS
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 APCPLGRFYQLTAPARPPAHGVSCHGPYEAAIPPAPVVPLLAGAVAVLVALSLGLGLLAW
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CCDS46 PSCPLERFAELVGPVIPQDWSTECMTTNSHQVLKVIFAVAFCLISAVLMVLLFIHIRRGL
350 360 370 380 390 400
>>CCDS76403.1 ACP2 gene_id:53|Hs108|chr11 (391 aa)
initn: 650 init1: 489 opt: 942 Z-score: 903.5 bits: 176.1 E(32554): 5.3e-44
Smith-Waterman score: 942; 42.1% identity (66.8% similar) in 385 aa overlap (40-417:5-380)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 PAGPLLLLLLLVLPPRALPEGPLVFVALVFRHG-DRAPLASYPMDPHKEVASTLWPRGLG
: : .:: : . . . : :.:
CCDS76 MAGKRSGWSRAALLQLLLGVNLVVMPPTRARSLR
10 20 30
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pF1KB7 QLTTEGVRQQLELGRFLRSRYEAFLSPEYRREEVYIRSTDFDRTLESAQANLAGLFPEAA
.: ::. :. :::. ::.::..::. :.:.:::.::::::::: ::.:::::::: .
CCDS76 FVTLEGMLQHWELGQALRQRYHGFLNTSYHRQEVYVRSTDFDRTLMSAEANLAGLFPPNG
40 50 60 70 80 90
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pF1KB7 PG--SPEARWRPIPVHTVPVAEDKLLRFPMRSCPRYHELLREATEAAEYQEALEGWTGFL
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CCDS76 MQRFNPNISWQPIPVHTVPITEDRLLKFPLGPCPRYEQLQNETRQTPEYQNESSRNAQFL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SRLENFTGLSLVGEPLRRAWKVLDTLMCQQAHGLPLPAWASPDVLRTLAQISALDIGAHV
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CCDS76 DMVANETGLTDL--TLETVWNVYDTLFCEQTHGLRLPPWASPQTMQRLSRLKDFSFRFLF
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 GPPRAAEKAQLTGGILLNAILANFSRVQRLG-LPLKMVMYSAHDSTLLALQGALGLYDGH
: . ::::.: ::.:: : :.. . . :: :...:::::.::.::: :: .:.:.
CCDS76 GIYQQAEKARLQGGVLLAQIRKNLTLMATTSQLP-KLLVYSAHDTTLVALQMALDVYNGE
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 TPPYAACLGFEFRKHLGNPAKDGGNVTVSLFYRNDSAHLPLPLSLPGCPAPCPLGRFYQL
:::.: ::. . .:.:: .: ...::.: . : :::::::: ::: : .:
CCDS76 QAPYASCHIFELYQ------EDSGNFSVEMYFRNESDKAPWPLSLPGCPHRCPLQDFLRL
280 290 300 310 320
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pF1KB7 TAPARPPAHGVSCH---GPYEAAIPPAPVVPLLAGAVAVLVALSLGLGLLAWRPGCLRAL
: :. : :. :: .. . : .: . ... :.. . . : ::
CCDS76 TEPVVPKDWQQECQLASGPADTEVIVALAVCGSILFLLIVLLLTVLFRMQAQPPGYRHVA
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 GGPV
CCDS76 DGEDHA
390
>>CCDS76404.1 ACP2 gene_id:53|Hs108|chr11 (360 aa)
initn: 719 init1: 295 opt: 513 Z-score: 496.0 bits: 100.6 E(32554): 2.6e-21
Smith-Waterman score: 814; 38.3% identity (58.6% similar) in 428 aa overlap (1-417:1-349)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAGL-GFWGHPAGPLLLLL---LLVLPP-RALPEGPLVFVALVFRHGDRAPLASYPMDPH
::: . :.. :. : ::: :.:.:: :: : ::.:..:::::.:. .:: ::.
CCDS76 MAGKRSGWSR-AALLQLLLGVNLVVMPPTRARS---LRFVTLLYRHGDRSPVKTYPKDPY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 KEVASTLWPRGLGQLTTEGVRQQLELGRFLRSRYEAFLSPEYRREEVYIRSTDFDRTLES
.: ::.:.:::: ::. :. :::. ::.::..::. :.:.:::.::::::::: :
CCDS76 QE---EEWPQGFGQLTKEGMLQHWELGQALRQRYHGFLNTSYHRQEVYVRSTDFDRTLMS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
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