Result of FASTA (omim) for
pF1KB7203
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7203, 623 aa
1>>>pF1KB7203 623 - 623 aa - 623 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0958+/-0.000424; mu= 4.8103+/- 0.026
mean_var=213.5705+/-44.824, 0's: 0 Z-trim(117.4): 241 B-trim: 33 in 1/56
Lambda= 0.087761
statistics sampled from 29015 (29359) to 29015 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.344), width: 16
Scan time: 11.480
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_056428 (OMIM: 616103) leucine-rich repeat, immu ( 623) 4190 544.2 4.9e-154
XP_011537925 (OMIM: 616103) PREDICTED: leucine-ric ( 574) 3825 498.0 3.7e-140
XP_011537928 (OMIM: 616103) PREDICTED: leucine-ric ( 428) 2849 374.3 4.8e-103
NP_940908 (OMIM: 615004,615058) leucine-rich repea ( 679) 1051 146.8 2.3e-34
XP_016863657 (OMIM: 615004,615058) PREDICTED: leuc ( 197) 585 87.3 5.4e-17
XP_016863656 (OMIM: 615004,615058) PREDICTED: leuc ( 496) 488 75.4 5.2e-13
NP_958934 (OMIM: 602059) immunoglobulin superfamil ( 428) 291 50.4 1.5e-05
NP_005536 (OMIM: 602059) immunoglobulin superfamil ( 428) 291 50.4 1.5e-05
NP_001317035 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat an ( 466) 279 48.9 4.6e-05
NP_001333104 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat an ( 466) 279 48.9 4.6e-05
NP_001333102 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat an ( 719) 279 49.1 6.3e-05
NP_689660 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat and f ( 719) 279 49.1 6.3e-05
XP_016876537 (OMIM: 612811) PREDICTED: leucine-ric ( 719) 279 49.1 6.3e-05
XP_016877935 (OMIM: 614179) PREDICTED: immunoglobu ( 468) 271 47.9 9.3e-05
NP_443204 (OMIM: 611289) leucine-rich alpha-2-glyc ( 347) 268 47.4 9.8e-05
XP_011520143 (OMIM: 614179) PREDICTED: immunoglobu ( 745) 271 48.1 0.00013
NP_065902 (OMIM: 614179) immunoglobulin superfamil ( 745) 271 48.1 0.00013
NP_001123609 (OMIM: 614179) immunoglobulin superfa ( 745) 271 48.1 0.00013
NP_001123608 (OMIM: 614179) immunoglobulin superfa ( 745) 271 48.1 0.00013
XP_011520142 (OMIM: 614179) PREDICTED: immunoglobu ( 745) 271 48.1 0.00013
NP_001123610 (OMIM: 614179) immunoglobulin superfa ( 745) 271 48.1 0.00013
NP_612490 (OMIM: 616236) chondroadherin-like prote ( 762) 264 47.2 0.00024
XP_005261427 (OMIM: 616236) PREDICTED: chondroadhe ( 771) 264 47.2 0.00025
XP_011528236 (OMIM: 616236) PREDICTED: chondroadhe ( 825) 264 47.3 0.00026
XP_011528235 (OMIM: 616236) PREDICTED: chondroadhe ( 830) 264 47.3 0.00026
XP_011528234 (OMIM: 616236) PREDICTED: chondroadhe ( 839) 264 47.3 0.00026
NP_001094861 (OMIM: 609792) leucine-rich repeat an ( 592) 248 45.1 0.00083
XP_016864334 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1495) 246 45.2 0.0019
XP_011512211 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1499) 246 45.2 0.0019
XP_006714049 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1509) 246 45.2 0.0019
NP_001276065 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein (1521) 246 45.3 0.0019
NP_001276064 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein (1525) 246 45.3 0.0019
NP_004778 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein is (1529) 246 45.3 0.0019
XP_005248268 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1533) 246 45.3 0.0019
NP_003052 (OMIM: 603742) slit homolog 1 protein pr (1534) 238 44.2 0.0039
NP_076941 (OMIM: 612810) leucine-rich repeat and f ( 635) 227 42.5 0.0055
XP_005274296 (OMIM: 612810) PREDICTED: leucine-ric ( 635) 227 42.5 0.0055
XP_011514763 (OMIM: 610486) PREDICTED: leucine-ric ( 653) 225 42.2 0.0067
NP_071426 (OMIM: 610486) leucine-rich repeat-conta ( 653) 225 42.2 0.0067
XP_016867994 (OMIM: 610486) PREDICTED: leucine-ric ( 653) 225 42.2 0.0067
>>NP_056428 (OMIM: 616103) leucine-rich repeat, immunogl (623 aa)
initn: 4190 init1: 4190 opt: 4190 Z-score: 2886.5 bits: 544.2 E(85289): 4.9e-154
Smith-Waterman score: 4190; 100.0% identity (100.0% similar) in 623 aa overlap (1-623:1-623)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRVALGMLWLLALAWPPQARGFCPSQCSCSLHIMGDGSKARTVVCNDPDMTLPPASIPPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 MRVALGMLWLLALAWPPQARGFCPSQCSCSLHIMGDGSKARTVVCNDPDMTLPPASIPPD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 TSRLRLERTAIRRVPGEAFRPLGRLEQLWLPYNALSELNALMLRGLRRLRELRLPGNRLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 TSRLRLERTAIRRVPGEAFRPLGRLEQLWLPYNALSELNALMLRGLRRLRELRLPGNRLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AFPWAALRDAPKLRLLDLQANRLSAVPAEAARFLENLTFLDLSSNQLMRLPQELIVSWAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 AFPWAALRDAPKLRLLDLQANRLSAVPAEAARFLENLTFLDLSSNQLMRLPQELIVSWAH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LETGIFPPGHHPRRVLGLQDNPWACDCRLYDLVHLLDGWAPNLAFIETELRCASPRSLAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LETGIFPPGHHPRRVLGLQDNPWACDCRLYDLVHLLDGWAPNLAFIETELRCASPRSLAG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VAFSQLELRKCQGPELHPGVASIRSLLGGTALLRCGATGVPGPEMSWRRANGRPLNGTVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 VAFSQLELRKCQGPELHPGVASIRSLLGGTALLRCGATGVPGPEMSWRRANGRPLNGTVH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 QEVSSDGTSWTLLGLPAVSHLDSGDYICQAKNFLGASETVISLIVTEPPTSTEHSGSPGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 QEVSSDGTSWTLLGLPAVSHLDSGDYICQAKNFLGASETVISLIVTEPPTSTEHSGSPGA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 LWARTGGGGEAAAYNNKLVARHVPQIPKPAVLATGPSVPSTKEELTLEHFQMDALGELSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LWARTGGGGEAAAYNNKLVARHVPQIPKPAVLATGPSVPSTKEELTLEHFQMDALGELSD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 GRAGPSEARMVRSVKVVGDTYHSVSLVWKAPQAKNTTAFSVLYAVFGQHSMRRVIVQPGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 GRAGPSEARMVRSVKVVGDTYHSVSLVWKAPQAKNTTAFSVLYAVFGQHSMRRVIVQPGK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 TRVTITGLLPKTKYVACVCVQGLVPRKEQCVIFSTNEVVDAENTQQLINVVVISVAIVIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 TRVTITGLLPKTKYVACVCVQGLVPRKEQCVIFSTNEVVDAENTQQLINVVVISVAIVIA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 LPLTLLVCCSALQKRCRKCFNKDSTEATVTYVNLERLGYSEDGLEELSRHSVSEADRLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LPLTLLVCCSALQKRCRKCFNKDSTEATVTYVNLERLGYSEDGLEELSRHSVSEADRLLS
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KB7 ARSSVDFQAFGVKGGRRINEYFC
:::::::::::::::::::::::
NP_056 ARSSVDFQAFGVKGGRRINEYFC
610 620
>>XP_011537925 (OMIM: 616103) PREDICTED: leucine-rich re (574 aa)
initn: 3825 init1: 3825 opt: 3825 Z-score: 2637.2 bits: 498.0 E(85289): 3.7e-140
Smith-Waterman score: 3825; 100.0% identity (100.0% similar) in 574 aa overlap (50-623:1-574)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 RGFCPSQCSCSLHIMGDGSKARTVVCNDPDMTLPPASIPPDTSRLRLERTAIRRVPGEAF
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MTLPPASIPPDTSRLRLERTAIRRVPGEAF
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 RPLGRLEQLWLPYNALSELNALMLRGLRRLRELRLPGNRLAAFPWAALRDAPKLRLLDLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RPLGRLEQLWLPYNALSELNALMLRGLRRLRELRLPGNRLAAFPWAALRDAPKLRLLDLQ
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 ANRLSAVPAEAARFLENLTFLDLSSNQLMRLPQELIVSWAHLETGIFPPGHHPRRVLGLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ANRLSAVPAEAARFLENLTFLDLSSNQLMRLPQELIVSWAHLETGIFPPGHHPRRVLGLQ
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 DNPWACDCRLYDLVHLLDGWAPNLAFIETELRCASPRSLAGVAFSQLELRKCQGPELHPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DNPWACDCRLYDLVHLLDGWAPNLAFIETELRCASPRSLAGVAFSQLELRKCQGPELHPG
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 VASIRSLLGGTALLRCGATGVPGPEMSWRRANGRPLNGTVHQEVSSDGTSWTLLGLPAVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VASIRSLLGGTALLRCGATGVPGPEMSWRRANGRPLNGTVHQEVSSDGTSWTLLGLPAVS
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 HLDSGDYICQAKNFLGASETVISLIVTEPPTSTEHSGSPGALWARTGGGGEAAAYNNKLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HLDSGDYICQAKNFLGASETVISLIVTEPPTSTEHSGSPGALWARTGGGGEAAAYNNKLV
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 ARHVPQIPKPAVLATGPSVPSTKEELTLEHFQMDALGELSDGRAGPSEARMVRSVKVVGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ARHVPQIPKPAVLATGPSVPSTKEELTLEHFQMDALGELSDGRAGPSEARMVRSVKVVGD
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 TYHSVSLVWKAPQAKNTTAFSVLYAVFGQHSMRRVIVQPGKTRVTITGLLPKTKYVACVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TYHSVSLVWKAPQAKNTTAFSVLYAVFGQHSMRRVIVQPGKTRVTITGLLPKTKYVACVC
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 VQGLVPRKEQCVIFSTNEVVDAENTQQLINVVVISVAIVIALPLTLLVCCSALQKRCRKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VQGLVPRKEQCVIFSTNEVVDAENTQQLINVVVISVAIVIALPLTLLVCCSALQKRCRKC
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KB7 FNKDSTEATVTYVNLERLGYSEDGLEELSRHSVSEADRLLSARSSVDFQAFGVKGGRRIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FNKDSTEATVTYVNLERLGYSEDGLEELSRHSVSEADRLLSARSSVDFQAFGVKGGRRIN
520 530 540 550 560 570
620
pF1KB7 EYFC
::::
XP_011 EYFC
>>XP_011537928 (OMIM: 616103) PREDICTED: leucine-rich re (428 aa)
initn: 2849 init1: 2849 opt: 2849 Z-score: 1971.0 bits: 374.3 E(85289): 4.8e-103
Smith-Waterman score: 2849; 99.8% identity (100.0% similar) in 428 aa overlap (196-623:1-428)
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 QLMRLPQELIVSWAHLETGIFPPGHHPRRVLGLQDNPWACDCRLYDLVHLLDGWAPNLAF
.:::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MGLQDNPWACDCRLYDLVHLLDGWAPNLAF
10 20 30
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 IETELRCASPRSLAGVAFSQLELRKCQGPELHPGVASIRSLLGGTALLRCGATGVPGPEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IETELRCASPRSLAGVAFSQLELRKCQGPELHPGVASIRSLLGGTALLRCGATGVPGPEM
40 50 60 70 80 90
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 SWRRANGRPLNGTVHQEVSSDGTSWTLLGLPAVSHLDSGDYICQAKNFLGASETVISLIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SWRRANGRPLNGTVHQEVSSDGTSWTLLGLPAVSHLDSGDYICQAKNFLGASETVISLIV
100 110 120 130 140 150
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 TEPPTSTEHSGSPGALWARTGGGGEAAAYNNKLVARHVPQIPKPAVLATGPSVPSTKEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TEPPTSTEHSGSPGALWARTGGGGEAAAYNNKLVARHVPQIPKPAVLATGPSVPSTKEEL
160 170 180 190 200 210
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 TLEHFQMDALGELSDGRAGPSEARMVRSVKVVGDTYHSVSLVWKAPQAKNTTAFSVLYAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TLEHFQMDALGELSDGRAGPSEARMVRSVKVVGDTYHSVSLVWKAPQAKNTTAFSVLYAV
220 230 240 250 260 270
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 FGQHSMRRVIVQPGKTRVTITGLLPKTKYVACVCVQGLVPRKEQCVIFSTNEVVDAENTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FGQHSMRRVIVQPGKTRVTITGLLPKTKYVACVCVQGLVPRKEQCVIFSTNEVVDAENTQ
280 290 300 310 320 330
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 QLINVVVISVAIVIALPLTLLVCCSALQKRCRKCFNKDSTEATVTYVNLERLGYSEDGLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QLINVVVISVAIVIALPLTLLVCCSALQKRCRKCFNKDSTEATVTYVNLERLGYSEDGLE
340 350 360 370 380 390
590 600 610 620
pF1KB7 ELSRHSVSEADRLLSARSSVDFQAFGVKGGRRINEYFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ELSRHSVSEADRLLSARSSVDFQAFGVKGGRRINEYFC
400 410 420
>>NP_940908 (OMIM: 615004,615058) leucine-rich repeat, i (679 aa)
initn: 1274 init1: 583 opt: 1051 Z-score: 738.1 bits: 146.8 E(85289): 2.3e-34
Smith-Waterman score: 1258; 35.8% identity (63.4% similar) in 623 aa overlap (22-577:20-632)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRVALGMLWLLALAWPPQARGFCPSQCSCSLHIMGDGSKARTVVCNDPDMTLPPASIPPD
.:::::.:. : .::: .: :.::: ::. :...: :
NP_940 MHLFACLCIVLSFLEGVGCLCPSQCTCDYHGRNDGSGSRLVLCNDMDMNELPTNLPVD
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 TSRLRLERTAIRRVPGEAFRPLGRLEQLWLPYNALSELNALMLRGLRRLRELRLPGNRLA
: .::.:.:.:::. .::: : .:. ::. ::... .. . .:..:.:::: :: ::
NP_940 TVKLRIEKTVIRRISAEAFYYLVELQYLWVTYNSVASIDPSSFYNLKQLHELRLDGNSLA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AFPWAALRDAPKLRLLDLQANRLSAVPAEAARFLENLTFLDLSSNQLMRLPQELIVSWAH
:::::.: : : :: :::. :....:: :: :.:.::..::::::.: :: ... ::.:
NP_940 AFPWASLLDMPLLRTLDLHNNKITSVPNEALRYLKNLAYLDLSSNRLTTLPPDFLESWTH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB7 LETGIFPPG---HHPRRV-LGLQDNPWACDCRLYDLVHLLDGWAPNLAFIETELRCASPR
: . : : : :. :::::::: :::.. ...: : ..... . :. :.
NP_940 LVS--TPSGVLDLSPSRIILGLQDNPWFCDCHISKMIELSKVVDPAIVLLDPLMTCSEPE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 SLAGVAFSQLELRKCQGPELHPGVASIRSLLGGTALLRCGATGVPGPEMSWRRANGRPLN
:.:. :.. ::..: : . ....: : ::...:::: ::: : :...: :... :.:
NP_940 RLTGILFQRAELEHCLKPSVMTSATKIMSALGSNVLLRCDATGFPTPQITWTRSDSSPVN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 GTVHQEVSSDGTSWTLLGLPAVSHLDSGDYICQAKNFLGASETVISLIVTE------PPT
:: :: .:. :....: ..: :.::: :.:::. : ::.:... : ::
NP_940 YTVIQESPEEGVRWSIMSLTGISSKDAGDYKCKAKNLAGMSEAVVTVTVLGITTTPIPPD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB7 STEHSGSPGALWARTGGGGE------AAAY--------NNKLVARHVPQIPKPAVLATGP
..:..:. : :.:. :..: .... : . :. : .. .:
NP_940 TSERTGDHPE-WDVQPGSGRSTSVSSASSYLWSSSFSPTSSFSASTLSP-PSTASFSLSP
360 370 380 390 400 410
400 410 420
pF1KB7 SVPSTKEELTL--------------EHFQMDALGE--LSDGRAG----PSEAR-------
:: : . ::. :. :. .. : :. .
NP_940 FSSSTVSSTTTLSTSISASTTMANKRSFQLHQGGKRNLKVAKNGSKLPPASTSKKEELAL
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470
pF1KB7 -----------MVRSVKVVGDTYHSVSLVWKAPQAKNTTAFSVLYAVFGQHSMRRVIVQP
.....::..: .::.:.:. .. ...: .:::. .: ... . ..
NP_940 LDQTMLTETNAAIENLRVVSETKESVTLTWNMINTTHNSAVTVLYSKYGGKDLLLLNADS
480 490 500 510 520 530
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 GKTRVTITGLLPKTKYVACVCVQGLVPRKEQCVIFSTNEVVDAENTQQLINVVVISVAIV
.:..::: :: : .:.:::: .:. :.:.::. ::: : :.....: . .:: :.: :
NP_940 SKNQVTIDGLEPGGQYMACVCPKGVPPQKDQCITFST-ERVEGDDSQWSLLLVVTSTACV
540 550 560 570 580 590
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 IALPLTLLVCCSALQKRCR-KC----FNKDSTEATVTYVNLERLGYSEDGLEELSRHSVS
. ::: : : : :. .: : .:. : ::...: :
NP_940 VILPLI----CFLLYKVCKLQCKSEPFWEDDL-AKETYIQFETLFPRSQSVGELWTRSHR
600 610 620 630 640
600 610 620
pF1KB7 EADRLLSARSSVDFQAFGVKGGRRINEYFC
NP_940 DDSEKLLLCSRSSVESQVTFKSEGSRPEYYC
650 660 670
>>XP_016863657 (OMIM: 615004,615058) PREDICTED: leucine- (197 aa)
initn: 583 init1: 583 opt: 585 Z-score: 426.1 bits: 87.3 E(85289): 5.4e-17
Smith-Waterman score: 585; 48.3% identity (74.7% similar) in 178 aa overlap (22-196:20-195)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRVALGMLWLLALAWPPQARGFCPSQCSCSLHIMGDGSKARTVVCNDPDMTLPPASIPPD
.:::::.:. : .::: .: :.::: ::. :...: :
XP_016 MHLFACLCIVLSFLEGVGCLCPSQCTCDYHGRNDGSGSRLVLCNDMDMNELPTNLPVD
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 TSRLRLERTAIRRVPGEAFRPLGRLEQLWLPYNALSELNALMLRGLRRLRELRLPGNRLA
: .::.:.:.:::. .::: : .:. ::. ::... .. . .:..:.:::: :: ::
XP_016 TVKLRIEKTVIRRISAEAFYYLVELQYLWVTYNSVASIDPSSFYNLKQLHELRLDGNSLA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AFPWAALRDAPKLRLLDLQANRLSAVPAEAARFLENLTFLDLSSNQLMRLPQELIVSWAH
:::::.: : : :: :::. :....:: :: :.:.::..::::::.: :: ... ::.:
XP_016 AFPWASLLDMPLLRTLDLHNNKITSVPNEALRYLKNLAYLDLSSNRLTTLPPDFLESWTH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB7 LETGIFPPG---HHPRRVLGLQDNPWACDCRLYDLVHLLDGWAPNLAFIETELRCASPRS
: . : : : :..
XP_016 LVS--TPSGVLDLSPSRIILG
180 190
>>XP_016863656 (OMIM: 615004,615058) PREDICTED: leucine- (496 aa)
initn: 742 init1: 454 opt: 488 Z-score: 354.6 bits: 75.4 E(85289): 5.2e-13
Smith-Waterman score: 705; 29.6% identity (58.4% similar) in 476 aa overlap (188-599:4-472)
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 TFLDLSSNQLMRLPQELIVSWAHLETGIFPPGHHPRRV-LGLQDNPWACDCRLYDLVHLL
: ..::. .::::::: :::.. ...:
XP_016 MVEPHQEPRHSKVGLQDNPWFCDCHISKMIELS
10 20 30
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 DGWAPNLAFIETELRCASPRSLAGVAFSQLELRKCQGPELHPGVASIRSLLGGTALLRCG
: ..... . :. :. :.:. :.. ::..: : . ....: : ::...::::
XP_016 KVVDPAIVLLDPLMTCSEPERLTGILFQRAELEHCLKPSVMTSATKIMSALGSNVLLRCD
40 50 60 70 80 90
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 ATGVPGPEMSWRRANGRPLNGTVHQEVSSDGTSWTLLGLPAVSHLDSGDYICQAKNFLGA
::: : :...: :... :.: :: :: .:. :....: ..: :.::: :.:::. :
XP_016 ATGFPTPQITWTRSDSSPVNYTVIQESPEEGVRWSIMSLTGISSKDAGDYKCKAKNLAGM
100 110 120 130 140 150
340 350 360 370 380
pF1KB7 SETVISLIVTE------PPTSTEHSGSPGALWARTGGGGEAAAYNNK----LVARHVP--
::.:... : :: ..:..:. : :.:.... .. . :
XP_016 SEAVVTVTVLGITTTPIPPDTSERTGDHPE-WDVQPGSGRSTSVSSASSYLWSSSFSPTS
160 170 180 190 200 210
390 400 410
pF1KB7 -------QIPKPAVLATGPSVPSTKEELTL--------------EHFQMDALGELS----
. :. : .. .: :: : . ::. :. .
XP_016 SFSASTLSPPSTASFSLSPFSSSTVSSTTTLSTSISASTTMANKRSFQLHQGGKRNLKVA
220 230 240 250 260 270
420 430 440 450
pF1KB7 -DGRAGPSEAR-------------------MVRSVKVVGDTYHSVSLVWKAPQAKNTTAF
.: : . .....::..: .::.:.:. .. ...:
XP_016 KNGSKLPPASTSKKEELALLDQTMLTETNAAIENLRVVSETKESVTLTWNMINTTHNSAV
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 SVLYAVFGQHSMRRVIVQPGKTRVTITGLLPKTKYVACVCVQGLVPRKEQCVIFSTNEVV
.:::. .: ... . .. .:..::: :: : .:.:::: .:. :.:.::. ::: : :
XP_016 TVLYSKYGGKDLLLLNADSSKNQVTIDGLEPGGQYMACVCPKGVPPQKDQCITFST-ERV
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KB7 DAENTQQLINVVVISVAIVIALPLTLLVCCSALQKRCR-KC----FNKDSTEATVTYVNL
.....: . .:: :.: :. ::: : : : :. .: : .:. : ::...
XP_016 EGDDSQWSLLLVVTSTACVVILPLI----CFLLYKVCKLQCKSEPFWEDDL-AKETYIQF
400 410 420 430 440
580 590 600 610 620
pF1KB7 ERLGYSEDGLEEL-SRHSVSEADRLLSARSSVDFQAFGVKGGRRINEYFC
: : ... :: .: .....::
XP_016 ETLFPRSQSVGELWTRSHRDDSEKLLLCSRSSVESQVTFKSEGSRPEYYC
450 460 470 480 490
>>NP_958934 (OMIM: 602059) immunoglobulin superfamily co (428 aa)
initn: 184 init1: 184 opt: 291 Z-score: 220.6 bits: 50.4 E(85289): 1.5e-05
Smith-Waterman score: 396; 26.9% identity (50.3% similar) in 376 aa overlap (5-355:4-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRVALGMLWLLALAWPPQARGFCPSQCSCSLHIMGDGSKARTVVCNDPDMTLPPASIPPD
: .:: : :: :: :.: :. . . : :. : ..: .
NP_958 MQELHLLWWALLLGLAQA---CPEPCDC-----GEKYGFQIADCAYRDLESVPPGFPAN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 TSRLRLERTAIRRVPGEAFRPLGRLEQLWLPYNALSELNALMLRGLRRLRELRLPGNRLA
.. : : . . .: ::: . :..::: .: . . : : .: .:. : : : ..
NP_958 VTTLSLSANRLPGLPEGAFREVPLLQSLWLAHNEIRTVAAGALASLSHLKSLDLSHNLIS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AFPWAALRDAPKLRLLDLQANRLSAVPAEAARFLENLTFLDLSSNQLMRLPQELIVSWAH
: :. :.. :.:: ...:.:. .: .: : :. : :.:. :.: : .
NP_958 DFAWSDLHNLSALQLLKMDSNELTFIPRDAFRSLRALRSLQLNHNRLHTLAE--------
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KB7 LETGIFPPGHHPRRVLGLQDNPWACDCRLYDLVHLLDGWAPNLAFIETE---LRCASPRS
: : : . : ...::. : : . : :: . : : . :.::.
NP_958 ---GTFTPLTALSH-LQINENPFDCTCGIV----WLKTWALTTAVSIPEQDNIACTSPHV
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280
pF1KB7 LAGVAFSQLELRKCQGPELH----PGVASIRSLLGGTALLRCGATGVPGPEMSWR-----
: :. .:.: :..: .. :. . . : . :.: . : :.:.. :.
NP_958 LKGTPLSRLPPLPCSAPSVQLSYQPSQDGAELRPGFVLALHCDVDGQPAPQLHWHIQIPS
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330
pF1KB7 ----------RANGRPLNGT---VHQEVSSDGTSWTLLGLPAVSHLDSGDYICQAKNFLG
..:: : :: : . .. .:: .: ..:. : : : : : ::
NP_958 GIVEITSPNVGTDGRALPGTPVASSQPRFQAFANGSLL-IPDFGKLEEGTYSCLATNELG
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 ASETVISLIVTEPPTSTEHSGSPGALWARTGGGGEAAAYNNKLVARHVPQIPKPAVLATG
..:. ... .. : . : .
NP_958 SAESSVDVALATPGEGGEDTLGRRFHGKAVEGKGCYTVDNEVQPSGPEDNVVIIYLSRAG
340 350 360 370 380 390
>>NP_005536 (OMIM: 602059) immunoglobulin superfamily co (428 aa)
initn: 184 init1: 184 opt: 291 Z-score: 220.6 bits: 50.4 E(85289): 1.5e-05
Smith-Waterman score: 396; 26.9% identity (50.3% similar) in 376 aa overlap (5-355:4-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRVALGMLWLLALAWPPQARGFCPSQCSCSLHIMGDGSKARTVVCNDPDMTLPPASIPPD
: .:: : :: :: :.: :. . . : :. : ..: .
NP_005 MQELHLLWWALLLGLAQA---CPEPCDC-----GEKYGFQIADCAYRDLESVPPGFPAN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 TSRLRLERTAIRRVPGEAFRPLGRLEQLWLPYNALSELNALMLRGLRRLRELRLPGNRLA
.. : : . . .: ::: . :..::: .: . . : : .: .:. : : : ..
NP_005 VTTLSLSANRLPGLPEGAFREVPLLQSLWLAHNEIRTVAAGALASLSHLKSLDLSHNLIS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AFPWAALRDAPKLRLLDLQANRLSAVPAEAARFLENLTFLDLSSNQLMRLPQELIVSWAH
: :. :.. :.:: ...:.:. .: .: : :. : :.:. :.: : .
NP_005 DFAWSDLHNLSALQLLKMDSNELTFIPRDAFRSLRALRSLQLNHNRLHTLAE--------
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KB7 LETGIFPPGHHPRRVLGLQDNPWACDCRLYDLVHLLDGWAPNLAFIETE---LRCASPRS
: : : . : ...::. : : . : :: . : : . :.::.
NP_005 ---GTFTPLTALSH-LQINENPFDCTCGIV----WLKTWALTTAVSIPEQDNIACTSPHV
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280
pF1KB7 LAGVAFSQLELRKCQGPELH----PGVASIRSLLGGTALLRCGATGVPGPEMSWR-----
: :. .:.: :..: .. :. . . : . :.: . : :.:.. :.
NP_005 LKGTPLSRLPPLPCSAPSVQLSYQPSQDGAELRPGFVLALHCDVDGQPAPQLHWHIQIPS
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330
pF1KB7 ----------RANGRPLNGT---VHQEVSSDGTSWTLLGLPAVSHLDSGDYICQAKNFLG
..:: : :: : . .. .:: .: ..:. : : : : : ::
NP_005 GIVEITSPNVGTDGRALPGTPVASSQPRFQAFANGSLL-IPDFGKLEEGTYSCLATNELG
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 ASETVISLIVTEPPTSTEHSGSPGALWARTGGGGEAAAYNNKLVARHVPQIPKPAVLATG
..:. ... .. : . : .
NP_005 SAESSVDVALATPGEGGEDTLGRRFHGKAVEGKGCYTVDNEVQPSGPEDNVVIIYLSRAG
340 350 360 370 380 390
>>NP_001317035 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat and fi (466 aa)
initn: 291 init1: 131 opt: 279 Z-score: 211.9 bits: 48.9 E(85289): 4.6e-05
Smith-Waterman score: 372; 27.2% identity (56.3% similar) in 302 aa overlap (64-358:104-390)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 MGDGSKARTVVCNDPDMTLPPASIPPDTSRLRLERTAIRRVPGEAFRPLGRLEQLWLPYN
:.:. . . .. .. : :. :..: : :
NP_001 MTSLVDLTLSRNTISFITPHAFADLRNLRALHLNSNRLTKITNDMFSGLSNLHHLILNNN
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 ALSELNALMLRGLRRLRELRLPGNRLAAFPWAALRDAPKLRLLDLQANRLSAVPAEAARF
:. ... . . :.:: : : : ..:: :.. .:. :.:. : .. .: .
NP_001 QLTLISSTAFDDVFALEELDLSYNNLETIPWDAVEKMVSLHTLSLDHNMIDNIPKGTFSH
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 LENLTFLDLSSNQLMRLPQELIVSWAHL--ETGIFPPGHHPRRVLGLQDNPWACDCRLYD
:...: ::..::.:..:: . . . :.. .::. :. .:.. :: :.:.:
NP_001 LHKMTRLDVTSNKLQKLPPDPLFQRAQVLATSGIISPSTF---ALSFGGNPLHCNCELL-
200 210 220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KB7 LVHLLDGWAPNLAFIETELRCASPRSLAGVAFSQLELRK--CQGPELHPGVASIRSLLGG
: :. . :::: :.: : .. .. :. : . . .: : :
NP_001 -------WLRRLSREDDLETCASPPLLTGRYFWSIPEEEFLCEPPLITRHTHEMRVLEGQ
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 TALLRCGATGVPGPEMSWRRANGRPLNGTVHQEVSSDGTSWTLLGLPAVSHLDSGDYICQ
: ::: : : : : . : .:. ....... : ..:: : . .. :.: . :
NP_001 RATLRCKARGDPEPAIHWISPEGKLISNATRSLVYDNGT----LDILITTVKDTGAFTCI
310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 AKNFLGASETVISLIVTEPP---TSTEHSGSPGALWARTGGGGEAAAYNNKLVARHVPQI
:.: : . ...: . . : .::.: :
NP_001 ASNPAGEATQIVDLHIIKLPHLLNSTNHIHEPDPGSSDISTSTKSGSNTSSSNGDTKLSQ
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 PKPAVLATGPSVPSTKEELTLEHFQMDALGELSDGRAGPSEARMVRSVKVVGDTYHSVSL
NP_001 DKIVVAEATSSTALLKFNFQRNIPGIRMFQIQYNGTYDDTLVYRCFAD
420 430 440 450 460
>>NP_001333104 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat and fi (466 aa)
initn: 291 init1: 131 opt: 279 Z-score: 211.9 bits: 48.9 E(85289): 4.6e-05
Smith-Waterman score: 372; 27.2% identity (56.3% similar) in 302 aa overlap (64-358:104-390)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 MGDGSKARTVVCNDPDMTLPPASIPPDTSRLRLERTAIRRVPGEAFRPLGRLEQLWLPYN
:.:. . . .. .. : :. :..: : :
NP_001 MTSLVDLTLSRNTISFITPHAFADLRNLRALHLNSNRLTKITNDMFSGLSNLHHLILNNN
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 ALSELNALMLRGLRRLRELRLPGNRLAAFPWAALRDAPKLRLLDLQANRLSAVPAEAARF
:. ... . . :.:: : : : ..:: :.. .:. :.:. : .. .: .
NP_001 QLTLISSTAFDDVFALEELDLSYNNLETIPWDAVEKMVSLHTLSLDHNMIDNIPKGTFSH
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 LENLTFLDLSSNQLMRLPQELIVSWAHL--ETGIFPPGHHPRRVLGLQDNPWACDCRLYD
:...: ::..::.:..:: . . . :.. .::. :. .:.. :: :.:.:
NP_001 LHKMTRLDVTSNKLQKLPPDPLFQRAQVLATSGIISPSTF---ALSFGGNPLHCNCELL-
200 210 220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KB7 LVHLLDGWAPNLAFIETELRCASPRSLAGVAFSQLELRK--CQGPELHPGVASIRSLLGG
: :. . :::: :.: : .. .. :. : . . .: : :
NP_001 -------WLRRLSREDDLETCASPPLLTGRYFWSIPEEEFLCEPPLITRHTHEMRVLEGQ
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 TALLRCGATGVPGPEMSWRRANGRPLNGTVHQEVSSDGTSWTLLGLPAVSHLDSGDYICQ
: ::: : : : : . : .:. ....... : ..:: : . .. :.: . :
NP_001 RATLRCKARGDPEPAIHWISPEGKLISNATRSLVYDNGT----LDILITTVKDTGAFTCI
310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 AKNFLGASETVISLIVTEPP---TSTEHSGSPGALWARTGGGGEAAAYNNKLVARHVPQI
:.: : . ...: . . : .::.: :
NP_001 ASNPAGEATQIVDLHIIKLPHLLNSTNHIHEPDPGSSDISTSTKSGSNTSSSNGDTKLSQ
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 PKPAVLATGPSVPSTKEELTLEHFQMDALGELSDGRAGPSEARMVRSVKVVGDTYHSVSL
NP_001 DKIVVAEATSSTALLKFNFQRNIPGIRMFQIQYNGTYDDTLVYRCFAD
420 430 440 450 460
623 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 05:55:17 2016 done: Fri Nov 4 05:55:19 2016
Total Scan time: 11.480 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]