FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7178, 426 aa
1>>>pF1KB7178 426 - 426 aa - 426 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7012+/-0.00127; mu= 9.2128+/- 0.075
mean_var=114.9949+/-22.857, 0's: 0 Z-trim(103.9): 166 B-trim: 107 in 1/50
Lambda= 0.119601
statistics sampled from 7447 (7648) to 7447 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.593), E-opt: 0.2 (0.235), width: 16
Scan time: 2.700
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS11478.1 ASB16 gene_id:92591|Hs108|chr17 ( 453) 564 109.1 8.8e-24
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>>CCDS5641.1 ASB4 gene_id:51666|Hs108|chr7 (426 aa)
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Smith-Waterman score: 2925; 100.0% identity (100.0% similar) in 426 aa overlap (1-426:1-426)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KQGYWLPSYKLKSSWATGLHLSVLFGHVECLLVLLDHNATINCRPNGKTPLHVACEMANV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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370 380 390 400 410 420
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::::::
CCDS56 PEGIIY
>>CCDS5642.1 ASB4 gene_id:51666|Hs108|chr7 (349 aa)
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Smith-Waterman score: 2218; 98.2% identity (98.5% similar) in 335 aa overlap (1-335:1-331)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MDGTTAPVTKSGAAKLVKRNFLEALKSNDFGKLKAILIQRQIDVDTVFEVEDENMVLASY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KQGYWLPSYKLKSSWATGLHLSVLFGHVECLLVLLDHNATINCRPNGKTPLHVACEMANV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DCVKILCDRGAKLNCYSLSGHTALHFCTTPSSILCAKQLVWRGANVNMKTNNQDEETPLH
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pF1KB7 TAAHFGLSELVAFYVEHGAIVDSVNAHMETPLAIAAYWALRFKEQEYSTEHHLVCRMLLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TAAHFGLSELVAFYVEHGAIVDSVNAHMETPLAIAAYWALRFKEQEYSTEHHLVCRMLLD
190 200 210 220 230 240
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pF1KB7 YKAEVNARDDDFKSPLHKAAWNCDHVLMHMMLEAGAEANLMDINGCAAIQYVLKVTSVRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 YKAEVNARDDDFKSPLHKAAWNCDHVLMHMMLEAGAEANLMDINGCAAIQYVLKVTSVRP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 AAQPEICYQLLLNHGAARIYPPQFHKVIQACHSCPKAIEVVVNAYEHIRWNTKWRRAIPD
::::::::::::::::::::::::::: . ::
CCDS56 AAQPEICYQLLLNHGAARIYPPQFHKV----RLCPVVSRLRKIQMAALSEISK
310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 DDLEKYWDFYHSLFTVCCNSPRTLMHLSRCAIRRTLHNRCHRAIPLLSLPLSLKKYLLLE
>>CCDS46548.1 ASB18 gene_id:401036|Hs108|chr2 (466 aa)
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Smith-Waterman score: 847; 36.4% identity (66.1% similar) in 404 aa overlap (29-426:70-466)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MDGTTAPVTKSGAAKLVKRNFLEALKSNDFGKLKAILIQRQIDVDTVFEVEDENMVL-
:. .:: .. : :...:::.. ..:
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60 70 80 90 100 110
pF1KB7 ----ASYK-QGYWLPSYKLKSSWATGLHLSVLFGHVECLLVLLDHNATINCRPNGKTPLH
:.. .: : :: . . : : ... ::. :. :: ..: . :.:. ::
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100 110 120 130 140 150
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pF1KB7 VACEMANVDCVKILCDRGAKLNCYSLSGHTALHFCTTPSSILCAKQLVWRGANVNMKTNN
:: ... ::..: .. : . : : . ::.: : .:. ::. :. .::.:. ....
CCDS46 EACLGGHTACVRLLLQHRADPDLLSAEGLAPLHLCRTAASLGCAQALLEHGASVQ-RVGG
160 170 180 190 200 210
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 QDEETPLHTAAHFGLSELVAFYVEHGAIVDSVNAHMETPLAIAAYWALRFKEQEYSTEHH
..::::.::. ::.: . .:. .:: ::. :.. :: :. : : : :. .
CCDS46 TGRDTPLHVAAQRGLDEHARLYLGRGAHVDARNGRGETALSAACGAARRPDEHGRCLR--
220 230 240 250 260 270
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 LVCRMLLDYKAEVNARDDDFKSPLHKAAWNCDHVLMHMMLEAGAEANLMDINGCAAIQYV
.: .:: ::..:::.: .:::::: . .: : ...:. ::.:. .: .: . . :
CCDS46 -LCALLLRRGAEADARDEDERSPLHKACGHASHSLARLLLRHGADAGALDYGGASPLGRV
280 290 300 310 320 330
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 LKVTSVRPAAQPEICYQLLLNHGAARIYPPQFHKVIQACHSCPKAIEVVVNAYEHIRWNT
:...: :.:. : :::::. ..: : ::...: : : .:::. :.: .. .
CCDS46 LQTASCALQASPQRTVQALLNHGSPTVWPDAFPKVLKTCASVPAVIEVLFNSYPQLCLSE
340 350 360 370 380 390
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 KWRRAIPDDDLEKYWDFYHSLFTVCCNSPRTLMHLSRCAIRRTLHNRCHRAIPLLSLPLS
.:...::.. .. . ::.:::.. .:: :.:: :::.:: . .:: :::: ::
CCDS46 SWKEVIPEEVFQMHKPFYQSLFALAL-TPRCLQHLCRCALRRLFGKRCFDLIPLLPLPKP
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420
pF1KB7 LKKYLLLEPEGIIY
:..::::::.:...
CCDS46 LQNYLLLEPQGVLH
460
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10 20 30 40 50
pF1KB7 MDGTTAPVTKSGAAKLVKRNFLEALKSNDFGKLKAILIQRQIDVDTVFEVEDE
:: ..:...:. .. .. .: ..: .
CCDS59 ACRIWRPHSRPAWEPPRPSPLLCQDMALQNALYTGDLARLQELFPPHST-ADLLLESRAA
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60 70 80 90 100 110
pF1KB7 NMVLASYKQGYWLPSYKLKSSWATGLHLSVLFGHVECLLVLLDHNATINCRPNGKTPLHV
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90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 ACEMANVDCVKILCDRGAKLNCYSLSGHTALHFCTTPSSILCAKQLVWRGANVNMKTNNQ
:: ... ::..: :: : . .:. ::.: :... ::. :. :: :. ... .
CCDS59 ACAAGHTACVHVLLVAGADPNIADQDGKRPLHLCRGPGTLECAELLLRFGARVDGRSE-E
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 DEETPLHTAAHFGLSELVAFYVEHGAIVDSVNAHMETPLAIAA-YWALRFKEQEYSTEHH
.::::::.::..: ::. . ...:: :. ::. ::: : . . : .: .
CCDS59 EEETPLHVAARLGHVELADLLLRRGACPDARNAEGWTPLLAACDVRCQSITDAEATTARC
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240 250 260 270 280 290
pF1KB7 L-VCRMLLDYKAEVNARDDDFKSPLHKAAWNCDHVLMHMMLEAGAEANLMDINGCAAIQY
: .: .::. :...: :.: . ::: : ......: :. :: :: .: . ..
CCDS59 LQLCSLLLSAGADADAADQDKQRPLHLACRRGHAAVVELLLSCGVSANTMDYGGHTPLHC
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 VLKVTSVRPAAQPEICYQLLLNHGAARIYPPQFHKVIQACHSCPKAIEVVVNAYEHIRWN
.:. .. : .:: . ::::::.:..: . ::.. .::..:::..:.: ..
CCDS59 ALQGPAAALAQSPEHVVRALLNHGAVRVWPGALPKVLERWSTCPRTIEVLMNTYSVVQLP
320 330 340 350 360 370
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 TKWRRAIPDDDLEKYWDFYHSLFTVCCNSPRTLMHLSRCAIRRTLHNRCHRAIPLLSLPL
. . . :.:. :: :::.. .::.:.::::::.: :.. .:.: : ::
CCDS59 EEAVGLVTPETLQKHQRFYSSLFALV-RQPRSLQHLSRCALRSHLEGSLPQALPRLPLPP
380 390 400 410 420 430
420
pF1KB7 SLKKYLLLEPEGIIY
: .:: :. ::..:
CCDS59 RLLRYLQLDFEGVLY
440 450
>>CCDS47750.2 ASB10 gene_id:136371|Hs108|chr7 (467 aa)
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10 20 30
pF1KB7 MDGTTAPVTKSGAAKLVKRN-------FLEALKSNDFGK
::: . .: :. : .:. ..: :
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pF1KB7 LKAILIQRQIDV--DTVFEVED----ENMVLASYKQGYWLPSYKLKSSWATGLHLSVLFG
.. :: . . . :.::.. : ... . : .:. . . : ::... :
CCDS47 VSRILADSSTGLAPDSVFDTSDPERWRDFRFNIRALRLWSLTYEEELT--TPLHVAASRG
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:.: : .:: . : . :.:.: :: :: ... ::..: :: : . .:. ::.
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pF1KB7 CTTPSSILCAKQLVWRGANVNMKTNNQDEETPLHTAAHFGLSELVAFYVEHGAIVDSVNA
: :... ::. :. :: :. ... ..::::::.::..: ::. . ...:: :. ::
CCDS47 CRGPGTLECAELLLRFGARVDGRSE-EEEETPLHVAARLGHVELADLLLRRGACPDARNA
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pF1KB7 HMETPLAIAA-YWALRFKEQEYSTEHHL-VCRMLLDYKAEVNARDDDFKSPLHKAAWNCD
. ::: : . . : .: . : .: .::. :...: :.: . ::: :
CCDS47 EGWTPLLAACDVRCQSITDAEATTARCLQLCSLLLSAGADADAADQDKQRPLHLACRRGH
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pF1KB7 HVLMHMMLEAGAEANLMDINGCAAIQYVLKVTSVRPAAQPEICYQLLLNHGAARIYPPQF
......: :. :: :: .: . .. .:. .. : .:: . ::::::.:..: .
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pF1KB7 HKVIQACHSCPKAIEVVVNAYEHIRWNTKWRRAIPDDDLEKYWDFYHSLFTVCCNSPRTL
::.. .::..:::..:.: .. . . . :.:. :: :::.. .::.:
CCDS47 PKVLERWSTCPRTIEVLMNTYSVVQLPEEAVGLVTPETLQKHQRFYSSLFALV-RQPRSL
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390 400 410 420
pF1KB7 MHLSRCAIRRTLHNRCHRAIPLLSLPLSLKKYLLLEPEGIIY
.::::::.: :.. .:.: : :: : .:: :. ::..:
CCDS47 QHLSRCALRSHLEGSLPQALPRLPLPPRLLRYLQLDFEGVLY
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>>CCDS11478.1 ASB16 gene_id:92591|Hs108|chr17 (453 aa)
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Smith-Waterman score: 689; 33.8% identity (62.7% similar) in 405 aa overlap (23-425:63-452)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MDGTTAPVTKSGAAKLVKRNFLEALKSNDFGKLKAILIQRQIDVDTVFEVED
.:: :... ...: :.: . .. . :. .
CCDS11 AQQCRSRRCPSSPRARLTRPHRSCRDPAVHQALFSGNLQQVQA-LFQDEEAANMIVETVS
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60 70 80 90 100 110
pF1KB7 ENMVLASYKQGYWLPSYKLKSSWATGLHLSVLFGHVECLLVLLDHNATINCRPNGKTPLH
:.. : .::.:. . : :.. . : ... :...: :. ..: .. : .:.. ::
CCDS11 -NQLAWSAEQGFWVLTPKTKQT--APLAIATARGYTDCARHLIRQGAELDARVGGRAALH
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pF1KB7 VACEMANVDCVKILCDRGAKLNCYSLSGHTALHFCTTPSSILCAKQLVWRGANVNMKTNN
:: :. :::..: ::: : . : : ::.:: : :. ::: :. ::.::. ..
CCDS11 EACARAQFDCVRLLLTFGAKANVLTEEGTTPLHLCTIPESLQCAKLLLEAGATVNLAAG-
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 QDEETPLHTAAHFGLSELVAFYVEHGAIVDSVNAHMETPLAIAAYWALRFKEQEYSTE-H
...:::::.:: :: . ::.:.:::: : ... :: : : : : : . :
CCDS11 ESQETPLHVAAARGLEQHVALYLEHGADVGLRTSQGETALNTACAGA----EGPGSCRRH
210 220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 HLVCRMLLDYKAEVNARDDDFKSPLHKAAWNCDHVLMHMMLEAGAEANLMDINGCAAIQY
. . : ::. :.. : ..:::.: : : ...:. ::.:.. . : . ..
CCDS11 QAAARRLLEAGADARAAGRKRHTPLHNACANGCGGLAELLLRYGARAEVPNGAGHTPMDC
270 280 290 300 310 320
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 VLKVTSVRPAAQPEICYQLLLNHGAARIYPPQFHKVIQACHSCPKAIEVVVNAYEHIRWN
.:.... : .::. . ::..:: . : .... : . :.:.::..::: .
CCDS11 ALQAVQDSPNWEPEVLFAALLDYGAQPVRP----EMLKHCANFPRALEVLLNAYPCVPSC
330 340 350 360 370
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 TKWRRAIPDDDLEKYWDFYHSLFTVC-CNSPRTLMHLSRCAIRRTLHNRCHRAIPLLSLP
: .:. . ... :: : ..: :.:: :.::.: :.: : .::... : ::
CCDS11 ETWVEAVLPELWKEHEAFYSS--ALCMVNQPRQLQHLARLAVRARLGSRCRQGATRLPLP
380 390 400 410 420 430
420
pF1KB7 LSLKKYLLLEPEGIIY
:. ::::. :: :
CCDS11 PLLRDYLLLRVEGCIQ
440 450
>>CCDS47749.2 ASB10 gene_id:136371|Hs108|chr7 (429 aa)
initn: 665 init1: 218 opt: 496 Z-score: 477.4 bits: 97.4 E(32554): 2.9e-20
Smith-Waterman score: 592; 31.2% identity (56.9% similar) in 432 aa overlap (10-426:40-429)
10 20 30
pF1KB7 MDGTTAPVTKSGAAKLVKRN-------FLEALKSNDFGK
::: . .: :. : .:. ..: :
CCDS47 CKGQGEPLDDRHPLCARLVEKPSRGSEEHLKSGPGPIVTRTASGPALAFWQAVLAGDVGC
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80
pF1KB7 LKAILIQRQIDV--DTVFEVED----ENMVLASYKQGYWLPSYKLKSSWATGLHLSVLFG
.. :: . . . :.::.. : ... . : .:. . . : ::... :
CCDS47 VSRILADSSTGLAPDSVFDTSDPERWRDFRFNIRALRLWSLTYEEELT--TPLHVAASRG
70 80 90 100 110 120
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