Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7169
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7169, 433 aa
1>>>pF1KB7169 433 - 433 aa - 433 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7335+/-0.000933; mu= 6.5081+/- 0.056
mean_var=135.2131+/-26.764, 0's: 0 Z-trim(110.7): 25 B-trim: 209 in 2/51
Lambda= 0.110297
statistics sampled from 11789 (11813) to 11789 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.72), E-opt: 0.2 (0.363), width: 16
Scan time: 3.390
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30834.1 GJA8 gene_id:2703|Hs108|chr1 ( 433) 2876 468.9 4.1e-132
CCDS9289.1 GJA3 gene_id:2700|Hs108|chr13 ( 435) 1175 198.3 1.3e-50
CCDS929.1 GJA5 gene_id:2702|Hs108|chr1 ( 358) 1032 175.5 7.5e-44
CCDS5025.1 GJA10 gene_id:84694|Hs108|chr6 ( 543) 955 163.3 5.3e-40
CCDS432.1 GJA9 gene_id:81025|Hs108|chr1 ( 515) 945 161.7 1.5e-39
CCDS5123.1 GJA1 gene_id:2697|Hs108|chr6 ( 382) 900 154.5 1.7e-37
CCDS30669.1 GJA4 gene_id:2701|Hs108|chr1 ( 333) 881 151.4 1.2e-36
CCDS9290.1 GJB2 gene_id:2706|Hs108|chr13 ( 226) 501 90.9 1.4e-18
CCDS7191.1 GJD4 gene_id:219770|Hs108|chr10 ( 370) 495 90.0 4.1e-18
CCDS9291.1 GJB6 gene_id:10804|Hs108|chr13 ( 261) 488 88.9 6.6e-18
CCDS14408.1 GJB1 gene_id:2705|Hs108|chrX ( 283) 464 85.0 1e-16
CCDS384.1 GJB3 gene_id:2707|Hs108|chr1 ( 270) 463 84.9 1.1e-16
CCDS383.1 GJB4 gene_id:127534|Hs108|chr1 ( 266) 462 84.7 1.2e-16
CCDS11487.1 GJC1 gene_id:10052|Hs108|chr17 ( 396) 464 85.1 1.3e-16
CCDS1569.1 GJC2 gene_id:57165|Hs108|chr1 ( 439) 452 83.2 5.4e-16
CCDS382.1 GJB5 gene_id:2709|Hs108|chr1 ( 273) 442 81.5 1.1e-15
CCDS10040.1 GJD2 gene_id:57369|Hs108|chr15 ( 321) 433 80.1 3.4e-15
CCDS5008.1 GJB7 gene_id:375519|Hs108|chr6 ( 223) 425 78.8 6e-15
CCDS58547.1 GJD3 gene_id:125111|Hs108|chr17 ( 294) 399 74.7 1.3e-13
CCDS34697.1 GJC3 gene_id:349149|Hs108|chr7 ( 279) 355 67.7 1.6e-11
>>CCDS30834.1 GJA8 gene_id:2703|Hs108|chr1 (433 aa)
initn: 2876 init1: 2876 opt: 2876 Z-score: 2485.2 bits: 468.9 E(32554): 4.1e-132
Smith-Waterman score: 2876; 100.0% identity (100.0% similar) in 433 aa overlap (1-433:1-433)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGDWSFLGNILEEVNEHSTVIGRVWLTVLFIFRILILGTAAEFVWGDEQSDFVCNTQQPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MGDWSFLGNILEEVNEHSTVIGRVWLTVLFIFRILILGTAAEFVWGDEQSDFVCNTQQPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 CENVCYDEAFPISHIRLWVLQIIFVSTPSLMYVGHAVHYVRMEEKRKSREAEELGQQAGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 CENVCYDEAFPISHIRLWVLQIIFVSTPSLMYVGHAVHYVRMEEKRKSREAEELGQQAGT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 NGGPDQGSVKKSSGSKGTKKFRLEGTLLRTYICHIIFKTLFEVGFIVGHYFLYGFRILPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NGGPDQGSVKKSSGSKGTKKFRLEGTLLRTYICHIIFKTLFEVGFIVGHYFLYGFRILPL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 YRCSRWPCPNVVDCFVSRPTEKTIFILFMLSVASVSLFLNVMELGHLGLKGIRSALKRPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YRCSRWPCPNVVDCFVSRPTEKTIFILFMLSVASVSLFLNVMELGHLGLKGIRSALKRPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 EQPLGEIPEKSLHSIAVSSIQKAKGYQLLEEEKIVSHYFPLTEVGMVETSPLPAKPFNQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EQPLGEIPEKSLHSIAVSSIQKAKGYQLLEEEKIVSHYFPLTEVGMVETSPLPAKPFNQF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 EEKISTGPLGDLSRGYQETLPSYAQVGAQEVEGEGPPAEEGAEPEVGEKKEEAERLTTEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EEKISTGPLGDLSRGYQETLPSYAQVGAQEVEGEGPPAEEGAEPEVGEKKEEAERLTTEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 QEKVAVPEGEKVETPGVDKEGEKEEPQSEKVSKQGLPAEKTPSLCPELTTDDARPLSRLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QEKVAVPEGEKVETPGVDKEGEKEEPQSEKVSKQGLPAEKTPSLCPELTTDDARPLSRLS
370 380 390 400 410 420
430
pF1KB7 KASSRARSDDLTV
:::::::::::::
CCDS30 KASSRARSDDLTV
430
>>CCDS9289.1 GJA3 gene_id:2700|Hs108|chr13 (435 aa)
initn: 1171 init1: 657 opt: 1175 Z-score: 1022.4 bits: 198.3 E(32554): 1.3e-50
Smith-Waterman score: 1175; 45.6% identity (66.2% similar) in 447 aa overlap (1-433:1-435)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGDWSFLGNILEEVNEHSTVIGRVWLTVLFIFRILILGTAAEFVWGDEQSDFVCNTQQPG
:::::::: .::...:::::::.::::::::::::.::.::: :::::::::.:::::::
CCDS92 MGDWSFLGRLLENAQEHSTVIGKVWLTVLFIFRILVLGAAAEDVWGDEQSDFTCNTQQPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB7 CENVCYDEAFPISHIRLWVLQIIFVSTPSLMYVGHAVHYVRMEEKRKSREAEE-LGQQAG
:::::::.::::::::.:.:::::::::.:.:.::..: ::::::.: :: :: : ...
CCDS92 CENVCYDRAFPISHIRFWALQIIFVSTPTLIYLGHVLHIVRMEEKKKEREEEEQLKRESP
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 TNGGPDQGSVKKSSGSKGTKKFRLEGTLLRTYICHIIFKTLFEVGFIVGHYFLYGFRILP
. : : . .: ..: . :. :.:::::. .::::::::::::.:.::::::.. :
CCDS92 SPKEPPQDN-PSSRDDRG--RVRMAGALLRTYVFNIIFKTLFEVGFIAGQYFLYGFELKP
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LYRCSRWPCPNVVDCFVSRPTEKTIFILFMLSVASVSLFLNVMELGHLGLKGIRSALKRP
::::.::::::.::::.::::::::::.:::.:: .::.::..:. ::: : .....
CCDS92 LYRCDRWPCPNTVDCFISRPTEKTIFIIFMLAVACASLLLNMLEIYHLGWKKLKQGVTSR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 VEQPLGEIPEKSLHSIAVSSIQKAKGYQLLEEEKIVSHYFPLTEVGMV--ETSPLPAKPF
. .: : . . .. . . . :: .. : .: :: :
CCDS92 LGPDASEAPLGTADPPPLPPSSRPPAVAIGFPPYYAHTAAPLGQARAVGYPGAPPPAADF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 N--QFEEKISTGPLGDLSRGYQETLPSYAQVGAQEVEGEGPPAEEGAEPEVGEKKEEAER
. . : . : . : :... : . . . : .: . ::: . : : .. .
CCDS92 KLLALTEARGKGQSAKLYNGHHHLLMTEQNWANQAAERQ-PPALK-AYPAASTPAAPSPV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KB7 LTT-----EEQEKVAVP---EGEKVETPGVDKEGEKEEPQSEKVSKQGLPAEKTPSLCPE
.. .: : :.: .: : : :: .. .. . :
CCDS92 GSSSPPLAHEAEAGAAPLLLDGSGSSLEGSALAGTPEEEEQAVTTAAQMHQ-------PP
360 370 380 390 400
410 420 430
pF1KB7 LTTDDARPLSRLSKASS-RARSDDLTV
: : :. :.::: ::: .::..
CCDS92 LPLGDPGRASKASRASSGRARPEDLAI
410 420 430
>>CCDS929.1 GJA5 gene_id:2702|Hs108|chr1 (358 aa)
initn: 1104 init1: 649 opt: 1032 Z-score: 900.7 bits: 175.5 E(32554): 7.5e-44
Smith-Waterman score: 1032; 61.8% identity (83.8% similar) in 241 aa overlap (1-239:1-241)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGDWSFLGNILEEVNEHSTVIGRVWLTVLFIFRILILGTAAEFVWGDEQSDFVCNTQQPG
:::::::::.::::..::::.:.::::::::::.:.:::::: :::::.:: :.: :::
CCDS92 MGDWSFLGNFLEEVHKHSTVVGKVWLTVLFIFRMLVLGTAAESSWGDEQADFRCDTIQPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 CENVCYDEAFPISHIRLWVLQIIFVSTPSLMYVGHAVHYVRMEEKRKSREAEELGQQAGT
:.:::::.:::::::: :::::::::::::.:.:::.: :::.:::: ::::. . :.
CCDS92 CQNVCYDQAFPISHIRYWVLQIIFVSTPSLVYMGHAMHTVRMQEKRKLREAERAKEVRGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB7 NGG--PDQGSVKKSSGSKGTKKFRLEGTLLRTYICHIIFKTLFEVGFIVGHYFLYGFRIL
.. : ... : .:. .. :.:::: ::.: :...: .:::::::.::.::. .
CCDS92 GSYEYPVAEKAELSCWEEGNGRIALQGTLLNTYVCSILIRTTMEVGFIVGQYFIYGIFLT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 PLYRCSRWPCPNVVDCFVSRPTEKTIFILFMLSVASVSLFLNVMELGHLGLKGIRSALKR
:. : : :::. :.:.:::::::..::.:::.::..::.:.. :: ::: : ::. . .
CCDS92 TLHVCRRSPCPHPVNCYVSRPTEKNVFIVFMLAVAALSLLLSLAELYHLGWKKIRQRFVK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 PVEQPLGEIPEKSLHSIAVSSIQKAKGYQLLEEEKIVSHYFPLTEVGMVETSPLPAKPFN
:
CCDS92 PRQHMAKCQLSGPSVGIVQSCTPPPDFNQCLENGPGGKFFNPFSNNMASQQNTDNLVTEQ
250 260 270 280 290 300
>>CCDS5025.1 GJA10 gene_id:84694|Hs108|chr6 (543 aa)
initn: 973 init1: 557 opt: 955 Z-score: 831.7 bits: 163.3 E(32554): 5.3e-40
Smith-Waterman score: 963; 38.2% identity (66.2% similar) in 456 aa overlap (1-429:1-439)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGDWSFLGNILEEVNEHSTVIGRVWLTVLFIFRILILGTAAEFVWGDEQSDFVCNTQQPG
::::..::.:::::. :::..:..:::.:::::.:.: .::: :: :::: :.:::.:::
CCDS50 MGDWNLLGGILEEVHSHSTIVGKIWLTILFIFRMLVLRVAAEDVWDDEQSAFACNTRQPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 CENVCYDEAFPISHIRLWVLQIIFVSTPSLMYVGHAVHYVRMEEKRKSREAEELGQQAGT
:.:.:::.::::: ::.:::::::::.:::.:.:::.. .: :: ..:. .: : .
CCDS50 CNNICYDDAFPISLIRFWVLQIIFVSSPSLVYMGHALYRLRAFEKDRQRKKSHLRAQMEN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB7 NGGPD-----QGSV----KKSSGSKGTKKFRLEGTLLRTYICHIIFKTLFEVGFIVGHYF
:: : . .. .: .: :.: :::::. ::. ....::::..:.:.
CCDS50 ---PDLDLEEQQRIDRELRRLEEQKRIHKVPLKGCLLRTYVLHILTRSVLEVGFMIGQYI
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LYGFRILPLYRCSRWPCPNVVDCFVSRPTEKTIFILFMLSVASVSLFLNVMELGHLGLKG
::::.. :::.:.. ::::.::::::::::::::.::: :.:..::.::..:. :::..
CCDS50 LYGFQMHPLYKCTQPPCPNAVDCFVSRPTEKTIFMLFMHSIAAISLLLNILEIFHLGIRK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB7 I-RSALKRP----VEQPLGEIPEKSLHSIA-----VSSI-QKAKGYQLLEEEKIVSHYFP
: :. :. .:. : . . .:.: ::. .. . : ...... :
CCDS50 IMRTLYKKSSSEGIEDETGPPFHLKKYSVAQQCMICSSLPERISPLQANNQQQVIRVNVP
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 LTEVGMVETSPLPAKPFNQFEEKISTGPLGDLSRGYQETLPSYAQVGAQEVEGEGPPAEE
... : . : : :.: :.: : :. :.. : .:.. : :
CCDS50 KSKT-MWQI-PQP----RQLEVDPSNGK-KDWSEKDQHS-------GQLHVHSPCPWAGS
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390
pF1KB7 GAEPEVGEKKEEA-----ERLTTEEQEKVAVPEGEKVETPGVDKEGEKEEPQSEKVSKQG
... ..:...... . .. ...:.. . :. .... ::..: ..
CCDS50 AGNQHLGQQSDHSSFGLQNTMSQSWLGTTTAPRNCPSFAVGTWEQSQDPEPSGEPLTDLH
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430
pF1KB7 LPAEKTPSLCPE--LTTDDARPLSRLSKASSRARSDDLTV
. . . : . : .:: :: .. :: :.
CCDS50 SHCRDSEGSMRESGVWIDRSRPGSRKASFLSRLLSEKRHLHSDSGSSGSRNSSCLDFPHW
410 420 430 440 450 460
CCDS50 ENSPSPLPSVTGHRTSMVRQAALPIMELSQELFHSGCFLFPFFLPGVCMYVCVDREADGG
470 480 490 500 510 520
>>CCDS432.1 GJA9 gene_id:81025|Hs108|chr1 (515 aa)
initn: 997 init1: 559 opt: 945 Z-score: 823.5 bits: 161.7 E(32554): 1.5e-39
Smith-Waterman score: 956; 39.8% identity (69.2% similar) in 425 aa overlap (1-398:1-413)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGDWSFLGNILEEVNEHSTVIGRVWLTVLFIFRILILGTAAEFVWGDEQSDFVCNTQQPG
::::..::. ::::. :::.::..:::.:::::.:.::.::: ::.:::: :.:::.:::
CCDS43 MGDWNLLGDTLEEVHIHSTMIGKIWLTILFIFRMLVLGVAAEDVWNDEQSGFICNTEQPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB7 CENVCYDEAFPISHIRLWVLQIIFVSTPSLMYVGHAVHYVR-MEEKRKSREAE---ELGQ
:.:::::.::::: :: ::::.::::.:::.:.:::.. .: .::.:. .:. :: .
CCDS43 CRNVCYDQAFPISLIRYWVLQVIFVSSPSLVYMGHALYRLRVLEEERQRMKAQLRVEL-E
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 QAGTNGGPDQGSVKKSSGSKGTKKFR---LEGTLLRTYICHIIFKTLFEVGFIVGHYFLY
.. . :. ... . .:. :.:::: ::. ::. ... ::::..:.:.::
CCDS43 EVEFEMPRDRRRLEQELCQLEKRKLNKAPLRGTLLCTYVIHIFTRSVVEVGFMIGQYLLY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 GFRILPLYRCSRWPCPNVVDCFVSRPTEKTIFILFMLSVASVSLFLNVMELGHLGLKGIR
::.. ::..: ::::..:::::::::::::.::: :.:..:::::..:. :::.: :.
CCDS43 GFHLEPLFKCHGHPCPNIIDCFVSRPTEKTIFLLFMQSIATISLFLNILEIFHLGFKKIK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB7 SAL--KRPVEQPLGEI-PEKSLHSIA------VSSIQK---AKGYQLLEEEKIVSHYFP-
.: : ... .:. .:. ...: ..:... : :.:: :.. . .:
CCDS43 RGLWGKYKLKKEHNEFHANKAKQNVAKYQSTSANSLKRLPSAPDYNLLVEKQTHTAVYPS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KB7 LTEVGMVETSPL-----PAKPFNQFEEKISTGPLGDLSRG--YQETLPSYAQVGAQEVEG
:. .. . .: : . . .: . .. .. :: . . . . : . .... :
CCDS43 LNSSSVFQPNPDNHSVNDEKCILDEQETVLSNEISTLSTSCSHFQHISSNNNKDTHKIFG
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 EGPPAEEGAEPEVGEKKEEAERLTTEEQEKVAVPEGEKVETPGVDKEGEKEEPQSEKVSK
. : .. ::.: . .... .:.. ::: .::.. :: . .
CCDS43 K-----ELNGNQLMEKRETEGK----DSKRNYYSRGHR-SIPGVAIDGENNMRQSPQ-TV
360 370 380 390 400
400 410 420 430
pF1KB7 QGLPAEKTPSLCPELTTDDARPLSRLSKASSRARSDDLTV
.:::
CCDS43 FSLPANCDWKPRWLRATWGSSTEHENRGSPPKGNLKGQFRKGTVRTLPPSQGDSQSLDIP
410 420 430 440 450 460
>>CCDS5123.1 GJA1 gene_id:2697|Hs108|chr6 (382 aa)
initn: 959 init1: 544 opt: 900 Z-score: 786.8 bits: 154.5 E(32554): 1.7e-37
Smith-Waterman score: 900; 55.2% identity (81.3% similar) in 241 aa overlap (1-237:1-241)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGDWSFLGNILEEVNEHSTVIGRVWLTVLFIFRILILGTAAEFVWGDEQSDFVCNTQQPG
::::: ::..:..:. .::. :.:::.::::::::.::::.: .:::::: : :::::::
CCDS51 MGDWSALGKLLDKVQAYSTAGGKVWLSVLFIFRILLLGTAVESAWGDEQSAFRCNTQQPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB7 CENVCYDEAFPISHIRLWVLQIIFVSTPSLMYVGHAVHYVRMEEKRKSREAE-ELGQQAG
:::::::..:::::.:.:::::::::.:.:.:..:. . .: ::: ...: : ...: :
CCDS51 CENVCYDKSFPISHVRFWVLQIIFVSVPTLLYLAHVFYVMRKEEKLNKKEEELKVAQTDG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 TNGGPD--QGSVKK-SSGSKGTKKFRLEGTLLRTYICHIIFKTLFEVGFIVGHYFLYGFR
.: : .:: . : . : ...: :::::: :.::..:::.:.. ....:::
CCDS51 VNVDMHLKQIEIKKFKYGIEEHGKVKMRGGLLRTYIISILFKSIFEVAFLLIQWYIYGFS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 ILPLYRCSRWPCPNVVDCFVSRPTEKTIFILFMLSVASVSLFLNVMELGHLGLKGIRSAL
. .: :.: :::. ::::.::::::::::.::: :. ::: ::..:: .. .::... .
CCDS51 LSAVYTCKRDPCPHQVDCFLSRPTEKTIFIIFMLVVSLVSLALNIIELFYVFFKGVKDRV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 KRPVEQPLGEIPEKSLHSIAVSSIQKAKGYQLLEEEKIVSHYFPLTEVGMVETSPLPAKP
:
CCDS51 KGKSDPYHATSGALSPAKDCGSQKYAYFNGCSSPTAPLSPMSPPGYKLVTGDRNNSSCRN
250 260 270 280 290 300
>>CCDS30669.1 GJA4 gene_id:2701|Hs108|chr1 (333 aa)
initn: 904 init1: 577 opt: 881 Z-score: 771.3 bits: 151.4 E(32554): 1.2e-36
Smith-Waterman score: 881; 54.5% identity (79.4% similar) in 233 aa overlap (1-227:1-231)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGDWSFLGNILEEVNEHSTVIGRVWLTVLFIFRILILGTAAEFVWGDEQSDFVCNTQQPG
::::.:: ..:..:.:::::.:..:::::::::::::: :.: ::::::::: ::: :::
CCDS30 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 CENVCYDEAFPISHIRLWVLQIIFVSTPSLMYVGHAVHYVRMEEKRKSREAEELGQQAGT
: :::::.:::::::: ::::..:::::.:.:.::... : ::. ...:.: . :
CCDS30 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIYLSRREERLRQKEGELRALPAKD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB7 N------GGPDQGSVKKSSGSKGTKKFRLEGTLLRTYICHIIFKTLFEVGFIVGHYFLYG
.. .. .: : . : ..:..:.:. ::. .. :...:.::. :.. :::
CCDS30 PQVERALAAVERQMAKISVAEDG--RLRIRGALMGTYVASVLCKSVLEAGFLYGQWRLYG
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 FRILPLYRCSRWPCPNVVDCFVSRPTEKTIFILFMLSVASVSLFLNVMELGHLGLKGIRS
. . :.. :.: ::: .:::::::::::::::.::: :. .:: ::..:: ::
CCDS30 WTMEPVFVCQRAPCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVGLISLVLNLLELVHLLCRCLSR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 ALKRPVEQPLGEIPEKSLHSIAVSSIQKAKGYQLLEEEKIVSHYFPLTEVGMVETSPLPA
CCDS30 GMRARQGQDAPPTQGTSSDPYTDQVFFYLPVGQGPSSPPCPTYNGLSSSEQNWANLTTEE
240 250 260 270 280 290
>>CCDS9290.1 GJB2 gene_id:2706|Hs108|chr13 (226 aa)
initn: 774 init1: 477 opt: 501 Z-score: 447.1 bits: 90.9 E(32554): 1.4e-18
Smith-Waterman score: 802; 52.3% identity (73.6% similar) in 239 aa overlap (3-240:2-226)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGDWSFLGNILEEVNEHSTVIGRVWLTVLFIFRILILGTAAEFVWGDEQSDFVCNTQQPG
::. : .:: ::.::: ::..::::::::::.:: .::. ::::::.:::::: :::
CCDS92 MDWGTLQTILGGVNKHSTSIGKIWLTVLFIFRIMILVVAAKEVWGDEQADFVCNTLQPG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 CENVCYDEAFPISHIRLWVLQIIFVSTPSLMYVGHAVHYVRMEEKRKSREAEELGQQAGT
:.:::::. :::::::::.::.::::::.:. . : : : : :.::: ..: ..
CCDS92 CKNVCYDHYFPISHIRLWALQLIFVSTPALLVAMH-VAYRRHEKKRKFIKGEIKSEFK--
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB7 NGGPDQGSVKKSSGSKGTKKFRLEGTLLRTYICHIIFKTLFEVGFIVGHYFLY-GFRILP
: .: :.: :.::.: :: :.:...::..:. : .: :: .
CCDS92 ----DIEEIK-------TQKVRIEGSLWWTYTSSIFFRVIFEAAFMYVFYVMYDGFSMQR
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LYRCSRWPCPNVVDCFVSRPTEKTIFILFMLSVASVSLFLNVMELGHLGLKGIRSALKRP
: .:. :::::.::::::::::::.: .::..:... ..::: :: .: .. . :.:
CCDS92 LVKCNAWPCPNTVDCFVSRPTEKTVFTVFMIAVSGICILLNVTELCYLLIRYCSGKSKKP
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 VEQPLGEIPEKSLHSIAVSSIQKAKGYQLLEEEKIVSHYFPLTEVGMVETSPLPAKPFNQ
:
CCDS92 V
>>CCDS7191.1 GJD4 gene_id:219770|Hs108|chr10 (370 aa)
initn: 487 init1: 254 opt: 495 Z-score: 438.7 bits: 90.0 E(32554): 4.1e-18
Smith-Waterman score: 495; 35.2% identity (65.8% similar) in 219 aa overlap (6-224:6-216)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGDWSFLGNILEEVNEHSTVIGRVWLTVLFIFRILILGTAAEFVWGDEQSDFVCNTQQPG
.:: .. .: . :..:..:... ...:.:.. :.. :. ::: ::::: :::
CCDS71 MEGVDLLGFLIITLNCNVTMVGKLWFVLTMLLRMLVIVLAGRPVYQDEQERFVCNTLQPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 CENVCYDEAFPISHIRLWVLQIIFVSTPSLMYVGHAVHYVRMEEKRKSREAEELGQQAGT
: ::::: :.::.:.:..: . : :: .. ...: :. . . :
CCDS71 CANVCYDVFSPVSHLRFWLIQGVCVLLPSAVFSVYVLHRGATLAALGPRRCPDPREPA--
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 NGGPDQGSVKKSSGSKGTKKFRLEGTLLRTYICHIIFKTLFEVGFIVGHYFLYGFRILPL
.: : . : .: . . :: :....::.:..: . ::::.::
CCDS71 SG---QRRCPRPFGERGGLQV---PDFSAGYIIHLLLRTLLEAAFGALHYFLFGFLAPKK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 YRCSRWPCPNVVDCFVSRPTEKTIFILFMLSVASVSLFLNVMELGHLGLKGIRSALKRPV
. :.: :: .::::.:::::::....::. .:...:..:.. .:
CCDS71 FPCTRPPCTGVVDCYVSRPTEKSLLMLFLWAVSALSFLLGLADLVCSLRRRMRRRPGPPT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 EQPLGEIPEKSLHSIAVSSIQKAKGYQLLEEEKIVSHYFPLTEVGMVETSPLPAKPFNQF
CCDS71 SPSIRKQSGASGHAEGRRTDEEGGREEEGAPAPPGARAGGEGAGSPRRTSRVSGHTKIPD
240 250 260 270 280 290
>>CCDS9291.1 GJB6 gene_id:10804|Hs108|chr13 (261 aa)
initn: 753 init1: 467 opt: 488 Z-score: 435.0 bits: 88.9 E(32554): 6.6e-18
Smith-Waterman score: 769; 52.0% identity (73.4% similar) in 229 aa overlap (3-230:2-216)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGDWSFLGNILEEVNEHSTVIGRVWLTVLFIFRILILGTAAEFVWGDEQSDFVCNTQQPG
::. : ... ::.::: ::.::.::.::::..:: .::. :::::: :::::: :::
CCDS92 MDWGTLHTFIGGVNKHSTSIGKVWITVIFIFRVMILVVAAQEVWGDEQEDFVCNTLQPG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 CENVCYDEAFPISHIRLWVLQIIFVSTPSLMYVGHAVHYVRMEEKRKSREAEELGQQAGT
:.:::::. ::.::::::.::.::::::.:. . : : : : : :: :..:.
CCDS92 CKNVCYDHFFPVSHIRLWALQLIFVSTPALLVAMH-VAYYRHETTRKFRRGEK------R
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB7 NGGPDQGSVKKSSGSKGTKKFRLEGTLLRTYICHIIFKTLFEVGFIVGHYFLYGFRILP-
: : ..:: .: :.::.: :: :.:. .::..:. ::::. ::
CCDS92 NDFKDIEDIKK-------QKVRIEGSLWWTYTSSIFFRIIFEAAFMYVFYFLYNGYHLPW
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LYRCSRWPCPNVVDCFVSRPTEKTIFILFMLSVASVSLFLNVMELGHLGLKGIRSALKRP
. .:. ::::.::::.:::::::.: .::.:.. . ..::: :: .: ::
CCDS92 VLKCGIDPCPNLVDCFISRPTEKTVFTIFMISASVICMLLNVAELCYLLLKVCFRRSKRA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 VEQPLGEIPEKSLHSIAVSSIQKAKGYQLLEEEKIVSHYFPLTEVGMVETSPLPAKPFNQ
CCDS92 QTQKNHPNHALKESKQNEMNELISDSGQNAITGFPS
230 240 250 260
433 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 05:34:53 2016 done: Fri Nov 4 05:34:54 2016
Total Scan time: 3.390 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]