Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7162
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7162, 375 aa
1>>>pF1KB7162 375 - 375 aa - 375 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0835+/-0.000933; mu= 12.8715+/- 0.056
mean_var=123.6860+/-35.133, 0's: 0 Z-trim(107.2): 239 B-trim: 1139 in 2/48
Lambda= 0.115322
statistics sampled from 9118 (9459) to 9118 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.671), E-opt: 0.2 (0.291), width: 16
Scan time: 2.820
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9894.2 GPR68 gene_id:8111|Hs108|chr14 ( 365) 2493 426.3 2e-119
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CCDS9879.1 GPR65 gene_id:8477|Hs108|chr14 ( 337) 648 119.3 4.9e-27
CCDS61567.1 GPR132 gene_id:29933|Hs108|chr14 ( 371) 581 108.2 1.2e-23
CCDS9997.1 GPR132 gene_id:29933|Hs108|chr14 ( 380) 581 108.2 1.2e-23
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 574 107.1 2.7e-23
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 499 94.6 1.4e-19
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 481 91.6 1.1e-18
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 478 91.1 1.8e-18
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 474 90.4 2.7e-18
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 471 89.9 3.7e-18
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 471 89.9 3.7e-18
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 ( 397) 468 89.5 5.7e-18
CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 352) 465 88.9 7.4e-18
CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 374) 465 88.9 7.7e-18
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 464 88.8 8.3e-18
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 458 87.8 1.7e-17
CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12 ( 372) 452 86.8 3.4e-17
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 451 86.6 3.8e-17
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 451 86.6 4e-17
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 451 86.6 4e-17
CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX ( 381) 449 86.3 4.9e-17
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 448 86.1 5.1e-17
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 445 85.6 7.7e-17
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 443 85.3 9.5e-17
CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 355) 436 84.1 2.1e-16
CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 387) 436 84.1 2.2e-16
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 434 83.8 2.7e-16
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 433 83.6 3e-16
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 433 83.6 3e-16
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 433 83.6 3e-16
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 428 82.8 5.6e-16
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 428 82.8 5.7e-16
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 428 82.8 5.7e-16
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 428 82.8 5.7e-16
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 428 82.8 5.8e-16
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 428 82.8 5.8e-16
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 428 82.8 5.9e-16
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 428 82.8 5.9e-16
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 428 82.9 6.2e-16
CCDS14442.1 P2RY10 gene_id:27334|Hs108|chrX ( 339) 426 82.4 6.4e-16
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 428 82.9 6.7e-16
CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 ( 425) 427 82.7 6.7e-16
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 425 82.3 7.4e-16
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 426 82.5 7.5e-16
CCDS9236.1 HCAR1 gene_id:27198|Hs108|chr12 ( 346) 421 81.6 1.2e-15
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 421 81.6 1.2e-15
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 420 81.4 1.3e-15
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 417 81.0 2e-15
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 ( 337) 414 80.4 2.6e-15
>>CCDS9894.2 GPR68 gene_id:8111|Hs108|chr14 (365 aa)
initn: 2493 init1: 2493 opt: 2493 Z-score: 2257.4 bits: 426.3 E(32554): 2e-119
Smith-Waterman score: 2493; 100.0% identity (100.0% similar) in 365 aa overlap (11-375:1-365)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRSVAPSGPKMGNITADNSSMSCTIDHTIHQTLAPVVYVTVLVVGFPANCLSLYFGYLQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 MGNITADNSSMSCTIDHTIHQTLAPVVYVTVLVVGFPANCLSLYFGYLQI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KARNELGVYLCNLTVADLFYICSLPFWLQYVLQHDNWSHGDLSCQVCGILLYENIYISVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 KARNELGVYLCNLTVADLFYICSLPFWLQYVLQHDNWSHGDLSCQVCGILLYENIYISVG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FLCCISVDRYLAVAHPFRFHQFRTLKAAVGVSVVIWAKELLTSIYFLMHEEVIEDENQHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 FLCCISVDRYLAVAHPFRFHQFRTLKAAVGVSVVIWAKELLTSIYFLMHEEVIEDENQHR
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VCFEHYPIQAWQRAINYYRFLVGFLFPICLLLASYQGILRAVRRSHGTQKSRKDQIQRLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 VCFEHYPIQAWQRAINYYRFLVGFLFPICLLLASYQGILRAVRRSHGTQKSRKDQIQRLV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LSTVVIFLACFLPYHVLLLVRSVWEASCDFAKGVFNAYHFSLLLTSFNCVADPVLYCFVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 LSTVVIFLACFLPYHVLLLVRSVWEASCDFAKGVFNAYHFSLLLTSFNCVADPVLYCFVS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ETTHRDLARLRGACLAFLTCSRTGRAREAYPLGAPEASGKSGAQGEEPELLTKLHPAFQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 ETTHRDLARLRGACLAFLTCSRTGRAREAYPLGAPEASGKSGAQGEEPELLTKLHPAFQT
300 310 320 330 340 350
370
pF1KB7 PNSPGSGGFPTGRLA
:::::::::::::::
CCDS98 PNSPGSGGFPTGRLA
360
>>CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19 (362 aa)
initn: 1093 init1: 940 opt: 1112 Z-score: 1015.7 bits: 196.6 E(32554): 3e-50
Smith-Waterman score: 1112; 49.1% identity (75.4% similar) in 338 aa overlap (11-341:1-332)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRSVAPSGPKMGNITADNSSMSCTIDHTIHQTLAPVVYVTVLVVGFPANCLSLYFGYLQI
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CCDS12 MGNHTWEG----CHVDSRVDHLFPPSLYIFVIGVGLPTNCLALWAAYRQV
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KARNELGVYLCNLTVADLFYICSLPFWLQYVLQHDNWSHGDLSCQVCGILLYENIYISVG
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CCDS12 QQRNELGVYLMNLSIADLLYICTLPLWVDYFLHHDNWIHGPGSCKLFGFIFYTNIYISIA
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FLCCISVDRYLAVAHPFRFHQFRTLKAAVGVSVVIWAKELLTSIYFLMHEEVIEDENQHR
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CCDS12 FLCCISVDRYLAVAHPLRFARLRRVKTAVAVSSVVWATELGANSAPLFHDELFRDRYNHT
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VCFEHYPIQAWQRAINYYRFLVGFLFPICLLLASYQGILRAVRRSHGTQKSRKDQIQRLV
:::..:...: .: :: .:::::: :.: ::.::::::: : .:....: .:.::.
CCDS12 FCFEKFPMEGWVAWMNLYRVFVGFLFPWALMLLSYRGILRAVRGSVSTERQEKAKIKRLA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KB7 LSTVVIFLACFLPYHVLLLVRSV------WEASCDFAKGVFNAYHFSLLLTSFNCVADPV
:: ..: :.:: ::::::: ::. :. : : . ::.::: :: .::.::::::.
CCDS12 LSLIAIVLVCFAPYHVLLLSRSAIYLGRPWD--CGFEERVFSAYHSSLAFTSLNCVADPI
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 LYCFVSETTHRDLARLRGACLAFLTCSRTGR-AREAYPLGAPEASGKSGAQGEEPELLTK
:::.:.: .. :.:. : ::. .. . : . : .: .: ..
CCDS12 LYCLVNEGARSDVAKALHNLLRFLASDKPQEMANASLTLETPLTSKRNSTAKAMTGSWAA
290 300 310 320 330 340
360 370
pF1KB7 LHPAFQTPNSPGSGGFPTGRLA
CCDS12 TPPSQGDQVQLKMLPPAQ
350 360
>>CCDS9879.1 GPR65 gene_id:8477|Hs108|chr14 (337 aa)
initn: 745 init1: 420 opt: 648 Z-score: 598.9 bits: 119.3 E(32554): 4.9e-27
Smith-Waterman score: 783; 36.7% identity (70.9% similar) in 313 aa overlap (27-328:10-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRSVAPSGPKMGNITADNSSMSCTIDHTIHQTLAPVVYVTVLVVGFPANCLSLYFGYLQI
: . . : :.::. :..:..::: :: ..::
CCDS98 MNSTCIEEQHDLDHYLFPIVYIFVIIVSIPANIGSLCVSFLQA
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KARNELGVYLCNLTVADLFYICSLPFWLQYVLQHDNWSHGDLSCQVCGILLYENIYISVG
: ..:::.:: .:...::.: .::.:..:. ..:::. . :. ..:.: :.: :..
CCDS98 KKESELGIYLFSLSLSDLLYALTLPLWIDYTWNKDNWTFSPALCKGSAFLMYMNFYSSTA
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130 140 150 160 170
pF1KB7 FLCCISVDRYLAVAHPFRFHQFRTLKAAVGVSVVIWAKELLTSIYFLMHEE-VIE----D
:: ::.:::::::..:..: .:: . :. ::. :: : . . .: ..: :.: .
CCDS98 FLTCIAVDRYLAVVYPLKFFFLRTRRFALMVSLSIWILETIFNAVMLWEDETVVEYCDAE
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 ENQHRVCFEHYPIQAWQRAINYYRFLVGFLFPICLLLASYQGILRAVRRSHGTQKSRKDQ
... .:...::.. :: .: .: .:. .:. .: . . .:::....:....: .
CCDS98 KSNFTLCYDKYPLEKWQINLNLFRTCTGYAIPLVTILICNRKVYQAVRHNKATENKEKKR
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KB7 IQRLVLSTVVIFLACFLPYHVLLLVRSVWEASCDF------AKGVFNAYHFSLLLTSFNC
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CCDS98 IIKLLVSITVTFVLCFTPFHVMLLIRCILEHAVNFEDHSNSGKRTYTMYRITVALTSLNC
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 VADPVLYCFVSETTHRDLARLRGACLAFLTCSRTGRAREAYPLGAPEASGKSGAQGEEPE
::::.:::::.:: . :. . : . :. . : :.
CCDS98 VADPILYCFVTETGRYDMWNILKFCTG--RCNTSQRQRKRILSVSTKDTMELEVLE
290 300 310 320 330
350 360 370
pF1KB7 LLTKLHPAFQTPNSPGSGGFPTGRLA
>>CCDS61567.1 GPR132 gene_id:29933|Hs108|chr14 (371 aa)
initn: 576 init1: 312 opt: 581 Z-score: 538.1 bits: 108.2 E(32554): 1.2e-23
Smith-Waterman score: 583; 30.4% identity (63.9% similar) in 352 aa overlap (36-374:38-366)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 PSGPKMGNITADNSSMSCTIDHTIHQTLAPVVYVTVLVVGFPANCLSLYFGYLQIKARNE
::: .: ..: :::::. ... ::. :
CCDS61 VTTTAPWASLGLSAKTCNNVSFEESRIVLVVVYSAVCTLGVPANCLTAWLALLQVLQGNV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LGVYLCNLTVADLFYICSLPFWLQYVLQHDNWSHGDLSCQVCGILLYENIYISVGFLCCI
:.::: :.. .:.: .::.:. :. .. :. : :.:.: . ... :::.:. :::::
CCDS61 LAVYLLCLALCELLYTGTLPLWVIYIRNQHRWTLGLLACKVTAYIFFCNIYVSILFLCCI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 SVDRYLAVAHPFRFHQFRTLKAAVGVSVVIWAKELLTSIYFLMHEEVIEDENQHRVCFEH
: ::..::.. .. . : ..:. .:. :. .:..: .: :.. :... .::.
CCDS61 SCDRFVAVVYALESRGRRRRRTAILISACIF---ILVGI---VHYPVFQTEDKE-TCFDM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 YPIQAWQRAINYY--RFLVGFLFPICLLLASYQGILRAVRRSHGTQKSRKDQIQRLVLST
.: .: .:: :: ::: .:. .. . . :.:....: : . ..: .... ....
CCDS61 --LQMDSRIAGYYYARFTVGFAIPLSIIAFTNHRIFRSIKQSMGLSAAQKAKVKHSAIAV
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KB7 VVIFLACFLPYHVLLLVRSVW--------EASCDFAKGVFNAYHFSLLLTSFNCVADPVL
:::::.:: :::..:::... .: : . . ...: : :.. : ::::..
CCDS61 VVIFLVCFAPYHLVLLVKAAAFSYYRGDRNAMCGLEERLYTASVVFLCLSTVNGVADPII
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 YCFVSETTHRDLARL-RGACLAFLTC--SRTGRAREAYPLGAPEASGKSGAQGEEPELLT
: .... ......:. .: . .: ..:.. : .: : .
CCDS61 YVLATDHSRQEVSRIHKGWKEWSMKTDVTRLTHSRDTEELQSPVALAD------------
300 310 320 330 340
360 370
pF1KB7 KLHPAFQTPNSPGSGGFPTGRLA
: .:. : : .. :. ::
CCDS61 --HYTFSRPVHPPGSPCPAKRLIEESC
350 360 370
>>CCDS9997.1 GPR132 gene_id:29933|Hs108|chr14 (380 aa)
initn: 530 init1: 312 opt: 581 Z-score: 538.0 bits: 108.2 E(32554): 1.2e-23
Smith-Waterman score: 583; 30.4% identity (63.9% similar) in 352 aa overlap (36-374:47-375)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 PSGPKMGNITADNSSMSCTIDHTIHQTLAPVVYVTVLVVGFPANCLSLYFGYLQIKARNE
::: .: ..: :::::. ... ::. :
CCDS99 VTTTAPWASLGLSAKTCNNVSFEESRIVLVVVYSAVCTLGVPANCLTAWLALLQVLQGNV
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LGVYLCNLTVADLFYICSLPFWLQYVLQHDNWSHGDLSCQVCGILLYENIYISVGFLCCI
:.::: :.. .:.: .::.:. :. .. :. : :.:.: . ... :::.:. :::::
CCDS99 LAVYLLCLALCELLYTGTLPLWVIYIRNQHRWTLGLLACKVTAYIFFCNIYVSILFLCCI
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 SVDRYLAVAHPFRFHQFRTLKAAVGVSVVIWAKELLTSIYFLMHEEVIEDENQHRVCFEH
: ::..::.. .. . : ..:. .:. :. .:..: .: :.. :... .::.
CCDS99 SCDRFVAVVYALESRGRRRRRTAILISACIF---ILVGI---VHYPVFQTEDKE-TCFDM
140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 YPIQAWQRAINYY--RFLVGFLFPICLLLASYQGILRAVRRSHGTQKSRKDQIQRLVLST
.: .: .:: :: ::: .:. .. . . :.:....: : . ..: .... ....
CCDS99 --LQMDSRIAGYYYARFTVGFAIPLSIIAFTNHRIFRSIKQSMGLSAAQKAKVKHSAIAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB7 VVIFLACFLPYHVLLLVRSVW--------EASCDFAKGVFNAYHFSLLLTSFNCVADPVL
:::::.:: :::..:::... .: : . . ...: : :.. : ::::..
CCDS99 VVIFLVCFAPYHLVLLVKAAAFSYYRGDRNAMCGLEERLYTASVVFLCLSTVNGVADPII
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 YCFVSETTHRDLARL-RGACLAFLTC--SRTGRAREAYPLGAPEASGKSGAQGEEPELLT
: .... ......:. .: . .: ..:.. : .: : .
CCDS99 YVLATDHSRQEVSRIHKGWKEWSMKTDVTRLTHSRDTEELQSPVALAD------------
310 320 330 340 350
360 370
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.. . : .. ... ...:..::.::. .: :::: ..: . . . : .
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CCDS14 SDQTTNNGGELMLESTF
360 370
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: . :.. . ... :..::. ::::::.: :. ..:... : . .: ..:
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CCDS94 KVRNETTTYMINLAMSDLLFVFTLPFRIFYFTTR-NWPFGDLLCKISVMLFYTNMYGSIL
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CCDS94 EACFENFPEATWKTYLSRIVIFIEIVGFFIPLILNVTCSSMVLKTLTKPVTLSRSKINKT
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CCDS42 RLVLMVVVVFVLCWMPFYVVQLL-NLFVTSLD---ATVN--HVSLILSYANSCANPILYG
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CCDS42 EALQ-PE-PGRKRIPLTRTTTF
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CCDS25 PCNSSDCIVVDTVMCPNMPNKSVLLYTLSFIYIFIFVIGMIANSVVVWVN-IQAKTTGYD
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CCDS25 THCYILNLAIADLWVVLTIPVWVVSLVQHNQWPMGELTCKVTHLIFSINLFGSIFFLTCM
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CCDS25 RSFYPEHSIKEWLIGMELVSVVLGFAVPFSIIAVFYFLLARAISASSDQEKHSS---RKI
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CCDS25 IFSYVVVFLVCWLPYHVAVLLDIFSILHYIPFTCRLEHALFTALHVTQCLSLVHCCVNPV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]