FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7159, 365 aa
1>>>pF1KB7159 365 - 365 aa - 365 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2144+/-0.000968; mu= 16.8692+/- 0.058
mean_var=128.4858+/-47.968, 0's: 0 Z-trim(105.5): 270 B-trim: 1081 in 2/47
Lambda= 0.113148
statistics sampled from 7937 (8448) to 7937 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.623), E-opt: 0.2 (0.26), width: 16
Scan time: 2.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6 ( 365) 2404 404.5 7.7e-113
CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3 ( 366) 1320 227.5 1.4e-59
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 ( 377) 1074 187.4 1.8e-47
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 ( 390) 1061 185.3 7.9e-47
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 ( 422) 648 117.9 1.6e-26
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 ( 477) 629 114.9 1.5e-25
CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 ( 367) 599 109.8 3.8e-24
CCDS2483.1 HTR2B gene_id:3357|Hs108|chr2 ( 481) 553 102.5 8.2e-22
CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 432) 535 99.5 5.9e-21
CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 445) 535 99.5 6e-21
CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 479) 535 99.5 6.3e-21
CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX ( 458) 519 96.9 3.7e-20
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 514 96.1 6.6e-20
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 342) 508 94.9 1.1e-19
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 429) 508 95.0 1.2e-19
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 455) 508 95.1 1.3e-19
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 466) 508 95.1 1.3e-19
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 475) 508 95.1 1.3e-19
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2 ( 450) 501 93.9 2.8e-19
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 ( 520) 490 92.2 1.1e-18
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 ( 462) 477 90.0 4.3e-18
CCDS5936.1 HTR5A gene_id:3361|Hs108|chr7 ( 357) 474 89.4 5.2e-18
CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 ( 471) 455 86.5 5.3e-17
CCDS1616.1 CHRM3 gene_id:1131|Hs108|chr1 ( 590) 454 86.4 6.8e-17
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 ( 572) 431 82.6 9e-16
CCDS2604.1 HRH1 gene_id:3269|Hs108|chr3 ( 487) 428 82.1 1.1e-15
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 422 80.9 1.9e-15
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 422 81.0 2e-15
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 421 80.8 2.3e-15
CCDS5843.1 CHRM2 gene_id:1129|Hs108|chr7 ( 466) 415 79.9 4.9e-15
CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 414) 410 79.0 8e-15
CCDS10031.1 CHRM5 gene_id:1133|Hs108|chr15 ( 532) 408 78.9 1.2e-14
CCDS8361.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 443) 406 78.4 1.3e-14
CCDS44581.1 CHRM4 gene_id:1132|Hs108|chr11 ( 479) 402 77.8 2.1e-14
CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11 ( 460) 392 76.2 6.5e-14
CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4 ( 477) 389 75.7 9.3e-14
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 ( 446) 383 74.7 1.8e-13
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8 ( 408) 378 73.8 3e-13
CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1 ( 440) 376 73.5 3.9e-13
CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6 ( 339) 344 68.1 1.2e-11
CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 360) 327 65.4 8.8e-11
CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 378) 327 65.4 9.1e-11
CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 387) 327 65.4 9.2e-11
CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 388) 327 65.4 9.2e-11
CCDS75353.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 411) 327 65.5 9.5e-11
CCDS34272.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 428) 327 65.5 9.7e-11
>>CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6 (365 aa)
initn: 2404 init1: 2404 opt: 2404 Z-score: 2139.3 bits: 404.5 E(32554): 7.7e-113
Smith-Waterman score: 2404; 100.0% identity (100.0% similar) in 365 aa overlap (1-365:1-365)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQPANYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQPANYL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 ICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCCTCSILHLCVIALDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 ICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCCTCSILHLCVIALDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHRRLSPPPSQCTIQHDHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 YWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHRRLSPPPSQCTIQHDHV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 IYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQKRGSSRHLSNRSTDSQNSFASCKLTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 IYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQKRGSSRHLSNRSTDSQNSFASCKLTQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 TFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPGERQQISSTRERKAARILGLILGAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 TFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPGERQQISSTRERKAARILGLILGAF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ILSWLPFFIKELIVGLSIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFNEDFKLAFKKLIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 ILSWLPFFIKELIVGLSIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFNEDFKLAFKKLIR
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 CREHT
:::::
CCDS50 CREHT
>>CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3 (366 aa)
initn: 1326 init1: 650 opt: 1320 Z-score: 1183.0 bits: 227.5 E(32554): 1.4e-59
Smith-Waterman score: 1320; 57.0% identity (80.0% similar) in 365 aa overlap (5-362:10-365)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQ
: :.: . :. :.:. .:: .. .:: .: :: :: .:.:::.
CCDS29 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPS----KILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTRKLHH
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 PANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCCTCSILHLCV
:::::::::::::.::::::::.::.::: . : .: .:..:::::.:::::::::: .
CCDS29 PANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSILHLSA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 IALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHRRLSPPPSQCTI
:::::: :::.:.::::::: :.:..:: :: ::.:::::::::: :. : ..: :
CCDS29 IALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWR-HQGTSRD-DECII
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 QHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQKRGSSRHLSNRSTDSQ----N
.:::.. :::::.:::::::.:::::::.::.:::.::.:: .:: .... ...: .
CCDS29 KHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASR-IAKEEVNGQVLLES
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB7 SFASCKLTQTFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPG--ERQQISSTRERKA
. : : ..: : . : :::.:.:.:.:...: . ... : .::.::.::::::
CCDS29 GEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVR--SLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 ARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGL-SIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFN
: ::::::::.. :::::.:::.:.. . .: :...::.::::.:::::::.:: ::
CCDS29 ATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVCDKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIFN
300 310 320 330 340 350
350 360
pF1KB7 EDFKLAFKKLIRCREHT
:::: ::.::.:::
CCDS29 EDFKKAFQKLVRCRC
360
>>CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 (377 aa)
initn: 1056 init1: 591 opt: 1074 Z-score: 965.8 bits: 187.4 E(32554): 1.8e-47
Smith-Waterman score: 1074; 48.6% identity (72.4% similar) in 366 aa overlap (8-363:23-375)
10 20 30 40
pF1KB7 MNITNCTTEASMAIRPKTITE-KMLICMTLVVITTLTTLLNLAVI
::.: : :.:. :. . ..: ::: :.: : :.
CCDS23 MSPLNQSAEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 MAIGTTKKLHQPANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMT
.: :.::: :::::: :::.:::::..::::.:: : . :..: .::..::: :.:
CCDS23 TTILLTRKLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWLSSDIT
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 CCTCSILHLCVIALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHR
::: :::::::::::::::::.:.::...::: .:: :: ::.::: ::.:::::: .
CCDS23 CCTASILHLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLFWR-QA
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KB7 RLSPPPSQCTIQHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAK-------SLYQKRG
. . :.: .. ... :::::: :::::: .:..::: :::.::. ::: ::
CCDS23 KAQEEMSDCLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILNPPSLYGKRF
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 SSRHLSNRSTDSQNSFASCKLTQTFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPGE
.. :: . :. : . :.:.... . .. :. :..:.. : :
CCDS23 TTAHLITGSAGS----SLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFN--HVKIKLA------DSALE
240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 RQQISSTRERKAARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGLSIYT--VSSEVADFLTWLGYV
:..::..:::::..:::.::::::. :::::. :.. . . . . ::.:::::.
CCDS23 RKRISAARERKATKILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGYL
290 300 310 320 330 340
340 350 360
pF1KB7 NSLINPLLYTSFNEDFKLAFKKLIRCREHT
::::::..:: :::.:. ::.:.. :.
CCDS23 NSLINPIIYTVFNEEFRQAFQKIVPFRKAS
350 360 370
>>CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 (390 aa)
initn: 1063 init1: 627 opt: 1061 Z-score: 954.2 bits: 185.3 E(32554): 7.9e-47
Smith-Waterman score: 1061; 47.8% identity (71.2% similar) in 364 aa overlap (5-362:32-387)
10 20 30
pF1KB7 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITT
::... . .. :.:. : :..::
CCDS49 EEPGAQCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVLLVMLLALITL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 LTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQPANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFL
::: : :: .. :.::: :::::: :::::::::..::::.: .: : :: :: .
CCDS49 ATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGRWTLGQVV
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 CEVWLSVDMTCCTCSILHLCVIALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFIS
:. ::: :.:::: :::::::::::::::::.:.::. ::: ::::.:: ::..:: ::
CCDS49 CDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISIS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 MPPLFWRSHRRLSPPPSQCTIQHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQ
.::.::: . . :.:... ::..::.:::.::::.: :.. :: ::: :.:
CCDS49 LPPFFWR-QAKAEEEVSECVVNTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEARSRIL
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 KRGSSRHLSNRSTDSQNSFASCKLTQTFCVSDFSTSDPTTEFEK----FHASIRIPPFDN
:. .: ..: : .: . . . .: :..... : . :. . .... :
CCDS49 KQTPNR-TGKRLTRAQ--LITDSPGSTSSVTSINSRVPDVPSESGSPVYVNQVKVRVSDA
250 260 270 280 290
280 290 300 310 320
pF1KB7 DLDHPGERQQISSTRERKAARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGLSIYTVSSEVA--DF
: :.... ..:::::.. ::.::::::. :::::: :.. . . ..: ::
CCDS49 LL----EKKKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDACWFHLAIFDF
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360
pF1KB7 LTWLGYVNSLINPLLYTSFNEDFKLAFKKLIRCREHT
.:::::.::::::..:: ::::: ::.:::: .
CCDS49 FTWLGYLNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS
360 370 380 390
>>CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 (422 aa)
initn: 878 init1: 487 opt: 648 Z-score: 589.5 bits: 117.9 E(32554): 1.6e-26
Smith-Waterman score: 807; 37.3% identity (66.6% similar) in 389 aa overlap (11-355:25-411)
10 20 30 40
pF1KB7 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMA
. .: :.. ... . : .. ..: : :. :
CCDS34 MDVLSPGQGNNTTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLIFCAVLGNACVVAA
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 IGTTKKLHQPANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCC
:. ..:.. ::::: :::::::.:.:::.:.. .: :...: :: :......:. ::
CCDS34 IALERSLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQVTCDLFIALDVLCC
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 TCSILHLCVIALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLF-WRSHRR
: ::::::.::::::::::. :.:. ::: .::: .: .: :...::.::.. ::. .
CCDS34 TSSILHLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWRTPED
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210
pF1KB7 LSPPPSQCTIQHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAK-------SLYQKRGS
: : . :::..:: ::::::.::::::: :.:.:: ::..::. . .: :.
CCDS34 RSDPDA-CTISKDHG-YTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIRKTVKKVEKTGA
190 200 210 220 230
220 230 240 250
pF1KB7 -SRHLSNRSTDSQNSFAS------------CKLTQTFCVS------DFSTSDPTTEFEKF
.:: .. . . ..: . : ..:.. : ... . : ..
CCDS34 DTRHGASPAPQPKKSVNGESGSRNWRLGVESKAGGALCANGAVRQGDDGAALEVIEVHRV
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300
pF1KB7 HASIRIPPFDND----------LDHPGER-----QQISSTRERKAARILGLILGAFILSW
: . :. .. ... .:: .... .::::... ::.:.:.::: :
CCDS34 GNSKEHLPLPSEAGPTPCAPASFERKNERNAEAKRKMALARERKTVKTLGIIMGTFILCW
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LPFFIKELIVGL--SIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFNEDFKLAFKKLIRCR
::::: :.. . : . . .. ...:::: :::.::..:. ::.::. ::
CCDS34 LPFFIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKDFQNAFKKIIKCK
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 EHT
CCDS34 FCRQ
420
>>CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 (477 aa)
initn: 576 init1: 343 opt: 629 Z-score: 572.2 bits: 114.9 E(32554): 1.5e-25
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10 20 30 40
pF1KB7 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGT
: : . :.:.:. : . :. ::.::.
CCDS75 TAARLLVPASPPASLLPPASESPEPLSQQWTAGMGLLMALIVL--LIVAGNVLVIVAIAK
30 40 50 60 70 80
50 60 70 80 90 100
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: .:. .: .: ::: .::....::.:.. .: ::. : :.::.: :::. : : :
CCDS75 TPRLQTLTNLFIMSLASADLVMGLLVVPFGATIVVWGRWEYGSFFCELWTSVDVLCVTAS
90 100 110 120 130 140
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 ILHLCVIALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLF---WRSH---
: ::::::::: :::. ..: : :: .. :::.:: ..:. :.. ::..
CCDS75 IETLCVIALDRYLAITSPFRYQSLLTRARARGLVCTVWAISALVSFLPILMHWWRAESDE
150 160 170 180 190 200
170 180 190 200 210 220
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:: :. : . ... :.: :.. .::.:: .. ..: :... :.. .: : :
CCDS75 ARRCYNDPKCCDFVTNRA-YAIASSVVSFYVPLCIMAFVYLRVFREAQKQVKKIDSCERR
210 220 230 240 250 260
230 240 250 260 270
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:.. . . : : . : . :. :. : . :.:.
CCDS75 FLGGPARPPSPS-----------PSPVPAPAPPPGPPRPAAAAATAPLAN--GRAGKRRP
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280 290 300 310 320 330
pF1KB7 -QISSTRERKAARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGLSIYTVSSEVADFLTWLGYVNSL
.. . ::.:: . ::.:.:.: : :::::. ... .. : ... :..::::.::
CCDS75 SRLVALREQKALKTLGIIMGVFTLCWLPFFLANVVKAFHRELVPDRLFVFFNWLGYANSA
320 330 340 350 360 370
340 350 360
pF1KB7 INPLLYTSFNEDFKLAFKKLIRCREHT
.::..: . ::. ::. :. :
CCDS75 FNPIIYCR-SPDFRKAFQGLLCCARRAARRRHATHGDRPRASGCLARPGPPPSPGAASDD
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>>CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 (367 aa)
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10 20 30 40
pF1KB7 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAI
.: ::.: ::.. . : ...:. . : : ::.
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10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
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. :. .:::. ::::.:::::.:::: ..: .. :... . :.:....:.
CCDS33 LKERALQTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPW-VVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMM
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110 120 130 140 150 160
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:: :::.::.:..::: :.. ..: . . . .:.:::: .::.... .: : :: .
CCDS33 CTASILNLCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFN
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170 180 190 200 210 220
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. :. :.:.. ..:::.. .::.:. . ...: ::: . :. .:: .:
CCDS33 ---TTGDPTVCSISNPD--FVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKRILTR--
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
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::: .:. .. .. . ::. :...... . :. : ::
CCDS33 -------QNS--QCNSVRPGFPQQTLSPDPAHLELKRYYSICQ----DTALGGPGFQERG
230 240 250 260 270
280 290 300 310 320
pF1KB7 --------ERQQISSTRERKAARILGLILGAFILSWLPFFIKELI-VGLSIYTVSSEVAD
:... ::.::.......:::::. :::::. ... . . :: :. .
CCDS33 GELKREEKTRNSLMPLREKKATQMVAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHVSPELYS
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360
pF1KB7 FLTWLGYVNSLINPLLYTSFNEDFKLAFKKLIRCREHT
:::::::: .::..::.:: .:. :: :.. :
CCDS33 ATTWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAFLKILSC
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>>CCDS2483.1 HTR2B gene_id:3357|Hs108|chr2 (481 aa)
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10 20 30 40 50
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. .:.: :. : ::.:.. :::.
CCDS24 WSGLQTESIPEEMKQIVEEQGNKLHWAALLILMVIIPTIGG--NTLVILAVSLEKKLQYA
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60 70 80 90 100 110
pF1KB7 ANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDR-WKLGYFLCEVWLSVDMTCCTCSILHLCV
.::.. ::::.::::...:::.... :... : : :: .:: .:. : ::.:::.
CCDS24 TNYFLMSLAVADLLVGLFVMPIALLTIMFEAMWPLPLVLCPAWLFLDVLFSTASIMHLCA
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120 130 140 150 160 170
pF1KB7 IALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMP-PLFWRSHRRLSPPPSQCT
:..::: :: . :. . . : . : .:: ::: :..: :. .: :.
CCDS24 ISVDRYIAIKKPIQANQYNSRATAFIKITVVWLISIGIAIPVPIKGIETDVDNPNNITCV
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220
pF1KB7 IQHDHVI-YTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHA--AKSLYQKRGSSRHLS--NRSTDS
. ... . ....:.::. ::..... :. :: :. : ..:. . ::
CCDS24 LTKERFGDFMLFGSLAAFFTPLAIMIVTYFLTIHALQKKAYLVKNKPPQRLTWLTVSTVF
210 220 230 240 250 260
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 QNSFASCKLTQTFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPGERQQISSTRERKA
: . . :. . . : : .: . .. .: . :... . . :..:
CCDS24 QRDETPCSSPEKVAMLDGSRKDKALPNSGDETLMR------RTSTIGKKSVQTISNEQRA
270 280 290 300 310 320
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 ARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGLS---IYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTS
...::... :.: : :::: .. . : :. . . ....:.:::.: .:::.::
CCDS24 SKVLGIVFFLFLLMWCPFFITNITLVLCDSCNQTTLQMLLEIFVWIGYVSSGVNPLVYTL
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350 360
pF1KB7 FNEDFKLAFKKLIRCREHT
::. :. :: . : :
CCDS24 FNKTFRDAFGRYITCNYRATKSVKTLRKRSSKIYFRNPMAENSKFFKKHGIRNGINPAMY
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>>CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 (432 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB7 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGTT
::..: :..:: :: : :.... .
CCDS74 SEVTASPAPTWDAPPDNASGCGEQINYGRVEKVVIGSILTLITLLTIAGNCLVVISVCFV
50 60 70 80 90 100
60 70 80 90 100
pF1KB7 KKLHQPANYLICSLAVTDLLVAVLVMPL-SIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCCTCS
:::.::.:::: :::..:: ::: :::. :. .. .: .:.:.:.:....:. ::: :
CCDS74 KKLRQPSNYLIVSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFFCNVFIAMDVMCCTAS
110 120 130 140 150 160
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 ILHLCVIALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLF-WRSHRRLSP
:. ::::..::: .:: . : ....: : :::.:: .: :..:::: : ..
CCDS74 IMTLCVISIDRYLGITRPLTYPVRQNGKCMAKMILSVWLLSASITLPPLFGWAQN---VN
170 180 190 200 210 220
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 PPSQCTIQHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQKRGSSRHLSNRSTD
. : :..: :::::: :::::....:..::.::.::. .....:
CCDS74 DDKVCLISQDFG-YTIYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIYKAAR-----KSAAKH-------
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230 240 250 260 270 280
pF1KB7 SQNSFASCKLTQTFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPGERQQISS-TRER
. .: . ... .. . . : :. :. : : ::..:: ::.
CCDS74 KFPGFPRVEPDSVIALNGIVKLQK--EVEECANLSRL------LKH--ERKNISIFKREQ
280 290 300 310 320
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 KAARILGLILGAFILSWLPFFI----KELIVGLSIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLL
::: ::.:.::: . :::::. . .: : : . : . ::::.::::::..
CCDS74 KAATTLGIIVGAFTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSCIPLWVERTFLWLGYANSLINPFI
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pF1KB7 YTSFNEDFKLAFKKLIRCREHT
:. ::.:.. ....:..:.
CCDS74 YAFFNRDLRTTYRSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEALKLAERPERPEFVL
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>>CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 (445 aa)
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pF1KB7 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGTT
::..: :..:: :: : :.... .
CCDS74 SEVTASPAPTWDAPPDNASGCGEQINYGRVEKVVIGSILTLITLLTIAGNCLVVISVCFV
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60 70 80 90 100
pF1KB7 KKLHQPANYLICSLAVTDLLVAVLVMPL-SIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCCTCS
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CCDS74 KKLRQPSNYLIVSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFFCNVFIAMDVMCCTAS
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110 120 130 140 150 160
pF1KB7 ILHLCVIALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLF-WRSHRRLSP
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CCDS74 IMTLCVISIDRYLGITRPLTYPVRQNGKCMAKMILSVWLLSASITLPPLFGWAQN---VN
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170 180 190 200 210 220
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CCDS74 DDKVCLISQDFG-YTIYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIYKAAR-----KSAAKH-------
230 240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 SQNSFASCKLTQTFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPGERQQISS-TRER
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CCDS74 KFPGFPRVEPDSVIALNGIVKLQK--EVEECANLSRL------LKH--ERKNISIFKREQ
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pF1KB7 KAARILGLILGAFILSWLPFFI----KELIVGLSIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLL
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CCDS74 KAATTLGIIVGAFTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSCIPLWVERTFLWLGYANSLINPFI
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pF1KB7 YTSFNEDFKLAFKKLIRCREHT
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CCDS74 YAFFNRDLRTTYRSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEALKLAERPERPEFVLQNADYCRKKGH
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]