Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7157
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7157, 360 aa
1>>>pF1KB7157 360 - 360 aa - 360 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3004+/-0.000952; mu= 16.9360+/- 0.056
mean_var=149.6373+/-55.748, 0's: 0 Z-trim(106.5): 164 B-trim: 1128 in 2/48
Lambda= 0.104847
statistics sampled from 8681 (9007) to 8681 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.646), E-opt: 0.2 (0.277), width: 16
Scan time: 2.670
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS245.1 CNR2 gene_id:1269|Hs108|chr1 ( 360) 2411 377.1 1.3e-104
CCDS5016.2 CNR1 gene_id:1268|Hs108|chr6 ( 439) 666 113.3 4.1e-25
CCDS5015.1 CNR1 gene_id:1268|Hs108|chr6 ( 472) 666 113.3 4.3e-25
CCDS9319.1 GPR12 gene_id:2835|Hs108|chr13 ( 334) 412 74.7 1.3e-13
CCDS12240.1 S1PR5 gene_id:53637|Hs108|chr19 ( 398) 385 70.7 2.5e-12
CCDS5079.1 GPR6 gene_id:2830|Hs108|chr6 ( 362) 382 70.2 3.2e-12
CCDS69172.1 GPR6 gene_id:2830|Hs108|chr6 ( 377) 382 70.2 3.3e-12
CCDS303.1 GPR3 gene_id:2827|Hs108|chr1 ( 330) 381 70.0 3.4e-12
CCDS12105.1 S1PR4 gene_id:8698|Hs108|chr19 ( 384) 374 69.0 7.6e-12
CCDS6777.1 LPAR1 gene_id:1902|Hs108|chr9 ( 364) 373 68.8 8.2e-12
CCDS700.1 LPAR3 gene_id:23566|Hs108|chr1 ( 353) 371 68.5 9.9e-12
CCDS777.1 S1PR1 gene_id:1901|Hs108|chr1 ( 382) 365 67.6 1.9e-11
CCDS12407.1 LPAR2 gene_id:9170|Hs108|chr19 ( 351) 357 66.4 4.3e-11
CCDS6680.1 S1PR3 gene_id:1903|Hs108|chr9 ( 378) 355 66.1 5.5e-11
>>CCDS245.1 CNR2 gene_id:1269|Hs108|chr1 (360 aa)
initn: 2411 init1: 2411 opt: 2411 Z-score: 1991.6 bits: 377.1 E(32554): 1.3e-104
Smith-Waterman score: 2411; 100.0% identity (100.0% similar) in 360 aa overlap (1-360:1-360)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MEECWVTEIANGSKDGLDSNPMKDYMILSGPQKTAVAVLCTLLGLLSALENVAVLYLILS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 MEECWVTEIANGSKDGLDSNPMKDYMILSGPQKTAVAVLCTLLGLLSALENVAVLYLILS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 SHQLRRKPSYLFIGSLAGADFLASVVFACSFVNFHVFHGVDSKAVFLLKIGSVTMTFTAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 SHQLRRKPSYLFIGSLAGADFLASVVFACSFVNFHVFHGVDSKAVFLLKIGSVTMTFTAS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 VGSLLLTAIDRYLCLRYPPSYKALLTRGRALVTLGIMWVLSALVSYLPLMGWTCCPRPCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 VGSLLLTAIDRYLCLRYPPSYKALLTRGRALVTLGIMWVLSALVSYLPLMGWTCCPRPCS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ELFPLIPNDYLLSWLLFIAFLFSGIIYTYGHVLWKAHQHVASLSGHQDRQVPGMARMRLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 ELFPLIPNDYLLSWLLFIAFLFSGIIYTYGHVLWKAHQHVASLSGHQDRQVPGMARMRLD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VRLAKTLGLVLAVLLICWFPVLALMAHSLATTLSDQVKKAFAFCSMLCLINSMVNPVIYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 VRLAKTLGLVLAVLLICWFPVLALMAHSLATTLSDQVKKAFAFCSMLCLINSMVNPVIYA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LRSGEIRSSAHHCLAHWKKCVRGLGSEAKEEAPRSSVTETEADGKITPWPDSRDLDLSDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 LRSGEIRSSAHHCLAHWKKCVRGLGSEAKEEAPRSSVTETEADGKITPWPDSRDLDLSDC
310 320 330 340 350 360
>>CCDS5016.2 CNR1 gene_id:1268|Hs108|chr6 (439 aa)
initn: 951 init1: 508 opt: 666 Z-score: 564.3 bits: 113.3 E(32554): 4.1e-25
Smith-Waterman score: 929; 48.7% identity (75.0% similar) in 300 aa overlap (25-307:75-372)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MEECWVTEIANGSKDGLDSNPMKDYMILSGPQKTAVAVLCTLLGLLSALENVAV
.:.:. :. :.::: :: ...:::. :
CCDS50 ITEFYNKSLSSFKENEENIQCGENFMDIECFMVLNPSQQLAIAVLSLTLGTFTVLENLLV
50 60 70 80 90 100
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LYLILSSHQLRRKPSYLFIGSLAGADFLASVVFACSFVNFHVFHGVDSKAVFLLKIGSVT
: .:: :..:: .::: :::::: ::.:.::.:. ::..::::: ::. :::.:.:.::
CCDS50 LCVILHSRSLRCRPSYHFIGSLAVADLLGSVIFVYSFIDFHVFHRKDSRNVFLFKLGGVT
110 120 130 140 150 160
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 MTFTASVGSLLLTAIDRYLCLRYPPSYKALLTRGRALVTLGIMWVLSALVSYLPLMGWTC
.::::::::.:::::::. .. : .:: ..:: .:.:.. .::... ... :::.::.:
CCDS50 ASFTASVGSLFLTAIDRYISIHRPLAYKRIVTRPKAVVAFCLMWTIAIVIAVLPLLGWNC
170 180 190 200 210 220
180 190 200 210 220
pF1KB7 --CPRPCSELFPLIPNDYLLSWLLFIAFLFSGIIYTYGHVLWKAHQHVASL--SGHQ---
::..:: : . ::. :. . :. :.:.: ..:::::.:.. . : :
CCDS50 EKLQSVCSDIFPHIDETYLMFWIGVTSVLLLFIVYAYMYILWKAHSHAVRMIQRGTQKSI
230 240 250 260 270 280
230 240 250 260 270
pF1KB7 ------DRQV----PGMARMRLDVRLAKTLGLVLAVLLICWFPVLALMAHSLATTLSDQV
: .: : .::: :.:::::: :.:.::.::: :.::.:.... .. .
CCDS50 IIHTSEDGKVQVTRPDQARM--DIRLAKTLVLILVVLIICWGPLLAIMVYDVFGKMNKLI
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 KKAFAFCSMLCLINSMVNPVIYALRSGEIRSSAHHCLAHWKKCVRGLGSEAKEEAPRSSV
: .:::::::::.:: :::.:::::: ..:
CCDS50 KTVFAFCSMLCLLNSTVNPIIYALRSKDLRHAFRSMFPSCEGTAQPLDNSMGDSDCLHKH
350 360 370 380 390 400
>>CCDS5015.1 CNR1 gene_id:1268|Hs108|chr6 (472 aa)
initn: 951 init1: 508 opt: 666 Z-score: 563.9 bits: 113.3 E(32554): 4.3e-25
Smith-Waterman score: 929; 48.7% identity (75.0% similar) in 300 aa overlap (25-307:108-405)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MEECWVTEIANGSKDGLDSNPMKDYMILSGPQKTAVAVLCTLLGLLSALENVAV
.:.:. :. :.::: :: ...:::. :
CCDS50 ITEFYNKSLSSFKENEENIQCGENFMDIECFMVLNPSQQLAIAVLSLTLGTFTVLENLLV
80 90 100 110 120 130
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LYLILSSHQLRRKPSYLFIGSLAGADFLASVVFACSFVNFHVFHGVDSKAVFLLKIGSVT
: .:: :..:: .::: :::::: ::.:.::.:. ::..::::: ::. :::.:.:.::
CCDS50 LCVILHSRSLRCRPSYHFIGSLAVADLLGSVIFVYSFIDFHVFHRKDSRNVFLFKLGGVT
140 150 160 170 180 190
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 MTFTASVGSLLLTAIDRYLCLRYPPSYKALLTRGRALVTLGIMWVLSALVSYLPLMGWTC
.::::::::.:::::::. .. : .:: ..:: .:.:.. .::... ... :::.::.:
CCDS50 ASFTASVGSLFLTAIDRYISIHRPLAYKRIVTRPKAVVAFCLMWTIAIVIAVLPLLGWNC
200 210 220 230 240 250
180 190 200 210 220
pF1KB7 --CPRPCSELFPLIPNDYLLSWLLFIAFLFSGIIYTYGHVLWKAHQHVASL--SGHQ---
::..:: : . ::. :. . :. :.:.: ..:::::.:.. . : :
CCDS50 EKLQSVCSDIFPHIDETYLMFWIGVTSVLLLFIVYAYMYILWKAHSHAVRMIQRGTQKSI
260 270 280 290 300 310
230 240 250 260 270
pF1KB7 ------DRQV----PGMARMRLDVRLAKTLGLVLAVLLICWFPVLALMAHSLATTLSDQV
: .: : .::: :.:::::: :.:.::.::: :.::.:.... .. .
CCDS50 IIHTSEDGKVQVTRPDQARM--DIRLAKTLVLILVVLIICWGPLLAIMVYDVFGKMNKLI
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 KKAFAFCSMLCLINSMVNPVIYALRSGEIRSSAHHCLAHWKKCVRGLGSEAKEEAPRSSV
: .:::::::::.:: :::.:::::: ..:
CCDS50 KTVFAFCSMLCLLNSTVNPIIYALRSKDLRHAFRSMFPSCEGTAQPLDNSMGDSDCLHKH
380 390 400 410 420 430
>>CCDS9319.1 GPR12 gene_id:2835|Hs108|chr13 (334 aa)
initn: 401 init1: 187 opt: 412 Z-score: 357.8 bits: 74.7 E(32554): 1.3e-13
Smith-Waterman score: 412; 32.5% identity (61.1% similar) in 283 aa overlap (38-314:50-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 EIANGSKDGLDSNPMKDYMILSGPQKTAVAVLCTLLGLLSALENVAVLYLILSSHQLRRK
:::: : : . ::. :. .:. . .::
CCDS93 AAAENISAAVSSRVPAVEPEPELVVNPWDIVLCTS-GTLISCENAIVVLIIFHNPSLR-A
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PSYLFIGSLAGADFLASVVFACSFVNFHVFHGVDSKAVFLLKIGSVTMTFTASVGSLLLT
: .:.::::: ::.::.. . .:: .... :.:. :. :: .. .:.::: :::
CCDS93 PMFLLIGSLALADLLAGIGLITNFVFAYLLQ---SEATKLVTIGLIVASFSASVCSLLAI
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AIDRYLCLRYPPSYKALLTRGRALVTLGIMWVLSALVSYLPLMGWTCC--PRPCSELFPL
..:::: : : .:.. : . : : ..: : .. ::.:::.: :: . ::
CCDS93 TVDRYLSLYYALTYHSERTVTFTYVMLVMLWGTSICLGLLPVMGWNCLRDESTCSVVRPL
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 IPNDYLLSWLLFIAFLFSGIIYTYGHV--LWKAHQHVASLSGHQDRQVPGMARMRLDVRL
:. . . :. :.:. .. : .. . : : .:. :. . .. : :
CCDS93 TKNNAAILSVSFL-FMFALMLQLYIQICKIVMRHAHQIALQ-HHFLATSHYVTTRKGV--
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 AKTLGLVLAVLLICWFPVLALMAHSLATTLSDQVKKA-FAFCSML-CLINSMVNPVIYAL
.::...:... ::.: .: . ..: . . ... ..: ::..::::::.
CCDS93 -STLAIILGTFAACWMPF------TLYSLIADYTYPSIYTYATLLPATYNSIINPVIYAF
260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 RSGEIRSSAHHCLAHWKKCVRGLGSEAKEEAPRSSVTETEADGKITPWPDSRDLDLSDC
:. ::... ::
CCDS93 RNQEIQKAL--CLICCGCIPSSLAQRARSPSDV
310 320 330
>>CCDS12240.1 S1PR5 gene_id:53637|Hs108|chr19 (398 aa)
initn: 340 init1: 99 opt: 385 Z-score: 335.0 bits: 70.7 E(32554): 2.5e-12
Smith-Waterman score: 385; 29.3% identity (60.2% similar) in 324 aa overlap (30-344:33-346)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MEECWVTEIANGSKDGLDSNPMKDYMILSGPQKTAVAVLCTLLGLLSALENVAVLYLIL
: : ::.: . . .:::.::: :.:
CCDS12 SGLLRPAPVSEVIVLHYNYTGKLRGARYQPGAGLRADAVVCLAVCAFIVLENLAVL-LVL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 SSHQLRRKPSYLFIGSLAGADFLASVVFACSFVNFHVFHGVDSKAVFLLKIGSVTMTFTA
. : . : .:..:::. .:.::....: ... . : :... . :.: ...::
CCDS12 GRHPRFHAPMFLLLGSLTLSDLLAGAAYAANILLSGPLTLKLSPALWFAREGGVFVALTA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 SVGSLLLTAIDRYLCL-RYPPSYKALLTRGRALVTLGIMWVLSALVSYLPLMGWTCCPR-
:: ::: :..: : . : :. . .:::.:. . : .: :.. :: .::.: :
CCDS12 SVLSLLAIALERSLTMARRGPA--PVSSRGRTLAMAAAAWGVSLLLGLLPALGWNCLGRL
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 -PCSELFPLIPNDYLLSWLLFIAFLFSGIIYTYGHVLWKAHQHVASLSGHQDRQVPGMAR
:: ..:: . :.: .: .. ....: :... ... .. : .. .:
CCDS12 DACSTVLPLYAKAYVLFCVLAFVGILAAICALYARIYCQVRANARRLPARPGTAGTTSTR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 MRLDVR---LAKTLGLVLAVLLICWFPVLALMAHSLA--TTLSDQVKKAFAFCSMLCLIN
: : : .::..:: ... :: :.. :. ..: . . .: : . : . :
CCDS12 ARRKPRSLALLRTLSVVLLAFVACWGPLFLLLLLDVACPARTCPVLLQADPFLG-LAMAN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 SMVNPVIYALRSGEIRSSAHHCLAHWKKCVRGLGSEAKEEA-PRSSVTETEADGKITPWP
:..::.::.: . ..: : : . : : : ... . ..:.. .::.:
CCDS12 SLLNPIIYTLTNRDLR----HALLRLVCC--GRHSCGRDPSGSQQSASAAEASGGLRRCL
300 310 320 330 340 350
360
pF1KB7 DSRDLDLSDC
CCDS12 PPGLDGSFSGSERSSPQRDGLDTSGSTGSPGAPTAARTLVSEPAAD
360 370 380 390
>>CCDS5079.1 GPR6 gene_id:2830|Hs108|chr6 (362 aa)
initn: 290 init1: 163 opt: 382 Z-score: 332.9 bits: 70.2 E(32554): 3.2e-12
Smith-Waterman score: 382; 32.6% identity (58.6% similar) in 304 aa overlap (10-307:50-337)
10 20 30
pF1KB7 MEECWVTEIANGSKDGLDSNPMKDYMILSGPQKTAVAVL
:::: . :.:. : : . ::
CCDS50 GAAAAATAAGGPDTGEWGPPAAAALGAGGGANGSLE-LSSQLSAGPPGLLLPAVNPWDVL
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 CTLLGLLSALENVAVLYLILSSHQLRRKPSYLFIGSLAGADFLASVVFACSFVNFHVFHG
. : . : ::. :. :: :. :: : ....:::: ::.:: .:... ::.
CCDS50 LCVSGTVIAGENALVVALIASTPALRT-PMFVLVGSLATADLLA----GCGLILHFVFQY
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 -VDSKAVFLLKIGSVTMTFTASVGSLLLTAIDRYLCLRYPPSYKALLTRGRALVTLGIMW
: :..: :: .: .. .:.:::.::: ..:::: : .: . : . . :. :
CCDS50 LVPSETVSLLTVGFLVASFAASVSSLLAITVDRYLSLYNALTYYSRRTLLGVHLLLAATW
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 VLSALVSYLPLMGWTCCPR--PCSELFPLIPNDY-LLSWLLFIAFLFSGIIYTY-GHVLW
..: .. ::..::.: . :: . :: . ::: .:..: . .:. .:.:
CCDS50 TVSLGLGLLPVLGWNCLAERAACSVVRPLARSHVALLSAAFFMVFGIMLHLYVRICQVVW
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 KAHQHVASLSGHQDRQVPGMARMRLDVRLAKTLGLVLAVLLICWFPVLALMAHSLATTLS
. : : .:. : : .: : : ::..::... :.: . . .. .
CCDS50 R-HAHQIALQQHC-LAPPHLAATRKGV---GTLAVVLGTFGASWLP---FAIYCVVGSHE
260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 DQVKKAFAFCSML-CLINSMVNPVIYALRSGEIRSSAHHCLAHWKKCVRGLGSEAKEEAP
: . .... ..: :::.::.:::.:. ::.
CCDS50 DPA--VYTYATLLPATYNSMINPIIYAFRNQEIQRALWLLLCGCFQSKVPFRSRSPSEV
310 320 330 340 350 360
340 350 360
pF1KB7 RSSVTETEADGKITPWPDSRDLDLSDC
>>CCDS69172.1 GPR6 gene_id:2830|Hs108|chr6 (377 aa)
initn: 290 init1: 163 opt: 382 Z-score: 332.7 bits: 70.2 E(32554): 3.3e-12
Smith-Waterman score: 382; 32.6% identity (58.6% similar) in 304 aa overlap (10-307:65-352)
10 20 30
pF1KB7 MEECWVTEIANGSKDGLDSNPMKDYMILSGPQKTAVAVL
:::: . :.:. : : . ::
CCDS69 GAAAAATAAGGPDTGEWGPPAAAALGAGGGANGSLE-LSSQLSAGPPGLLLPAVNPWDVL
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 CTLLGLLSALENVAVLYLILSSHQLRRKPSYLFIGSLAGADFLASVVFACSFVNFHVFHG
. : . : ::. :. :: :. :: : ....:::: ::.:: .:... ::.
CCDS69 LCVSGTVIAGENALVVALIASTPALRT-PMFVLVGSLATADLLA----GCGLILHFVFQY
100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 -VDSKAVFLLKIGSVTMTFTASVGSLLLTAIDRYLCLRYPPSYKALLTRGRALVTLGIMW
: :..: :: .: .. .:.:::.::: ..:::: : .: . : . . :. :
CCDS69 LVPSETVSLLTVGFLVASFAASVSSLLAITVDRYLSLYNALTYYSRRTLLGVHLLLAATW
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 VLSALVSYLPLMGWTCCPR--PCSELFPLIPNDY-LLSWLLFIAFLFSGIIYTY-GHVLW
..: .. ::..::.: . :: . :: . ::: .:..: . .:. .:.:
CCDS69 TVSLGLGLLPVLGWNCLAERAACSVVRPLARSHVALLSAAFFMVFGIMLHLYVRICQVVW
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 KAHQHVASLSGHQDRQVPGMARMRLDVRLAKTLGLVLAVLLICWFPVLALMAHSLATTLS
. : : .:. : : .: : : ::..::... :.: . . .. .
CCDS69 R-HAHQIALQQHC-LAPPHLAATRKGV---GTLAVVLGTFGASWLP---FAIYCVVGSHE
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 DQVKKAFAFCSML-CLINSMVNPVIYALRSGEIRSSAHHCLAHWKKCVRGLGSEAKEEAP
: . .... ..: :::.::.:::.:. ::.
CCDS69 DPA--VYTYATLLPATYNSMINPIIYAFRNQEIQRALWLLLCGCFQSKVPFRSRSPSEV
330 340 350 360 370
340 350 360
pF1KB7 RSSVTETEADGKITPWPDSRDLDLSDC
>>CCDS303.1 GPR3 gene_id:2827|Hs108|chr1 (330 aa)
initn: 308 init1: 172 opt: 381 Z-score: 332.5 bits: 70.0 E(32554): 3.4e-12
Smith-Waterman score: 381; 29.9% identity (59.5% similar) in 304 aa overlap (11-307:20-305)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MEECWVTEIANGSKDGLDSNPMKDYMILSGPQKTAVAVLCTLLGLLSALEN
: :. : .: : .:. : ::: . : : . ::
CCDS30 MMWGAGSPLAWLSAGSGNVNVSSVGPAEGPTGPAAPLPSPKAWDV-VLC-ISGTLVSCEN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 VAVLYLILSSHQLRRKPSYLFIGSLAGADFLASVVFACSFVNFHVFHGVDSKAVFLLKIG
. :. .:... .: : .:..:::: ::.::.. .. :. :: . : . :. .:
CCDS30 ALVVAIIVGTPAFR-APMFLLVGSLAVADLLAGLGLVLHFAA--VFC-IGSAEMSLVLVG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 SVTMTFTASVGSLLLTAIDRYLCLRYPPSYKALLTRGRALVTLGIMWVLSALVSYLPLMG
..:.::::.:::: ..:::: : .: . : :. : :...: . .. ::...
CCDS30 VLAMAFTASIGSLLAITVDRYLSLYNALTYYSETTVTRTYVMLALVWGGALGLGLLPVLA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB7 WTCCP--RPCSELFPLIPNDYLLSWLLFIAFL--FSGIIYTYGHVLWKAHQHVASLSGHQ
:.: :. ..:: : .. : :::. :. .. :... . .:. ... :
CCDS30 WNCLDGLTTCGVVYPLSKNHLVV---LAIAFFMVFGIMLQLYAQICRIVCRHAQQIA-LQ
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 DRQVPGMARMRLDVRLAKTLGLVLAVLLICWFP--VLALMAHSLATTLSDQVKKAFAFCS
. .:. . .: ::..::... ::.: : :.. . . : ... .
CCDS30 RHLLPASHYVATRKGIA-TLAVVLGAFAACWLPFTVYCLLGDAHSPPL-------YTYLT
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 ML-CLINSMVNPVIYALRSGEIRSSAHHCLAHWKKCVRGLGSEAKEEAPRSSVTETEADG
.: :::.::.:::.:. ...
CCDS30 LLPATYNSMINPIIYAFRNQDVQKVLWAVCCCCSSSKIPFRSRSPSDV
290 300 310 320 330
>>CCDS12105.1 S1PR4 gene_id:8698|Hs108|chr19 (384 aa)
initn: 364 init1: 141 opt: 374 Z-score: 326.1 bits: 69.0 E(32554): 7.6e-12
Smith-Waterman score: 374; 28.7% identity (61.4% similar) in 334 aa overlap (30-348:40-357)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MEECWVTEIANGSKDGLDSNPMKDYMILSGPQKTAVAVLCTL---LGLLSALENVAVLY
::. ....: : . : .:::. ::
CCDS12 PESCQQLAAGGHSRLIVLHYNHSGRLAGRGGPEDGGLGALRGLSVAASCLVVLENLLVLA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LILSSHQLRRKPSYLFIGS-----LAGADFLASVVFACSFVNFHVFHGVDSKAVFLLKIG
: : . :: : ... :.:: .::.:... . . :.. . : ..:. :
CCDS12 AITSHMRSRRWVYYCLVNITLSDLLTGAAYLANVLLSGART-FRL-----APAQWFLREG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 SVTMTFTASVGSLLLTAIDRYLCLRYPPSYKALLTRGRALVTLGIMWVLSALVSYLPLMG
. ...::. :::.:: .:. . : . .. .:. .:. :.:.::...:::.:
CCDS12 LLFTALAASTFSLLFTAGERFATMVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLAALLGMLPLLG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KB7 WTC-CPRP-CSELFPLIPNDYLLSWLLFIAFLFSGIIYTYGHVLWKAHQHVASLSGHQDR
:.: : :: :.:: . :.: :...: ... :. :: .. .... :: .
CCDS12 WNCLCAFDRCSSLLPLYSKRYILFCLVIFAGVLATIMGLYGAIF-----RLVQASG---Q
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 QVPGMARMRLDVRLAKTLGLVLAVLLICWFPVLALM-AHSLATTL-SDQVKKAFAFCSML
..: : : :: ::. ..: ..:.:: :...:. : ....: ... ... . :
CCDS12 KAPRPAARRKARRLLKTVLMILLAFLVCWGPLFGLLLADVFGSNLWAQEYLRGMDWILAL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 CLINSMVNPVIYALRSGEIRSS--AHHCLAHWKKCVRGLGSE-AKEEAPRSSVTETEADG
..:: :::.::..:: :. . . : . . .:: :. :. .:... : :.
CCDS12 AVLNSAVNPIIYSFRSREVCRAVLSFLCCGCLRLGMRGPGDCLARAVEAHSGASTT--DS
300 310 320 330 340 350
350 360
pF1KB7 KITPWPDSRDLDLSDC
.. :
CCDS12 SLRPRDSFRGSRSLSFRMREPLSSISSVRSI
360 370 380
>>CCDS6777.1 LPAR1 gene_id:1902|Hs108|chr9 (364 aa)
initn: 248 init1: 88 opt: 373 Z-score: 325.5 bits: 68.8 E(32554): 8.2e-12
Smith-Waterman score: 373; 27.6% identity (63.2% similar) in 272 aa overlap (49-314:65-326)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 SNPMKDYMILSGPQKTAVAVLCTLLGLLSALENVAVLYLILSSHQLRRKPSYLFIGSLAG
: :. :. : ..... : : ....::.
CCDS67 NRSGKHLATEWNTVSKLVMGLGITVCIFIMLANLLVMVAIYVNRRFHF-PIYYLMANLAA
40 50 60 70 80 90
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 ADFLASVVFACSFVNFHVFHGVDSK----AVFLLKIGSVTMTFTASVGSLLLTAIDRYLC
:::.:.... .. :.. : ... ...::. : . ..::::..:: ::.:..
CCDS67 ADFFAGLAYF--YLMFNT--GPNTRRLTVSTWLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHIT
100 110 120 130 140
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 LRYPPSYKALLTRGRALVTLGIMWVLSALVSYLPLMGWTC-CP-RPCSELFPLIPNDYLL
. . . .: :..:.. ..:... ... .: .::.: : . ::.. :: ..::.
CCDS67 VFRMQLHTRMSNR-RVVVVIVVIWTMAIVMGAIPSVGWNCICDIENCSNMAPLYSDSYLV
150 160 170 180 190 200
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 SWLLFIAFLFSGIIYTYGHVLWKAHQHVASLSGHQDRQVPGMARMRLDVRLAKTLGLVLA
: .: : .. :.:.. ..:.. .: :.. : : . . : ::. .::.
CCDS67 FWAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQRTMRMSRHSSG--PRRNRDTM-MSLLKTVVIVLG
210 220 230 240 250 260
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 VLLICWFPVLALMAHSLATTLSDQVKKAFAFCSMLCLINSMVNPVIYALRSGEIRSSAHH
...::: : :.:. .. : : : .: .:: .::.::. :. :. .. ..
CCDS67 AFIICWTPGLVLLLLDVCCPQCD-VLAYEKFFLLLAEFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQ
270 280 290 300 310 320
320 330 340 350 360
pF1KB7 CLAHWKKCVRGLGSEAKEEAPRSSVTETEADGKITPWPDSRDLDLSDC
:
CCDS67 ILCCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHTILAGVHSNDHSVV
330 340 350 360
360 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 05:21:34 2016 done: Fri Nov 4 05:21:34 2016
Total Scan time: 2.670 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]