Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7150
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7150, 347 aa
1>>>pF1KB7150 347 - 347 aa - 347 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6115+/-0.000848; mu= 15.0999+/- 0.051
mean_var=75.5371+/-15.408, 0's: 0 Z-trim(107.9): 46 B-trim: 387 in 1/51
Lambda= 0.147569
statistics sampled from 9849 (9895) to 9849 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.681), E-opt: 0.2 (0.304), width: 16
Scan time: 2.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35221.1 MAGEB10 gene_id:139422|Hs108|chrX ( 347) 2270 492.5 2.2e-139
CCDS14221.1 MAGEB4 gene_id:4115|Hs108|chrX ( 346) 1143 252.6 3.6e-67
CCDS14216.1 MAGEB18 gene_id:286514|Hs108|chrX ( 343) 1114 246.4 2.6e-65
CCDS14222.1 MAGEB1 gene_id:4112|Hs108|chrX ( 347) 1109 245.3 5.5e-65
CCDS14220.1 MAGEB3 gene_id:4114|Hs108|chrX ( 346) 1025 227.4 1.3e-59
CCDS59524.1 MAGEB17 gene_id:645864|Hs108|chrX ( 336) 998 221.7 7e-58
CCDS14705.1 MAGEA10 gene_id:4109|Hs108|chrX ( 369) 987 219.4 3.8e-57
CCDS14219.1 MAGEB2 gene_id:4113|Hs108|chrX ( 319) 962 214.0 1.4e-55
CCDS43927.1 MAGEB16 gene_id:139604|Hs108|chrX ( 324) 932 207.6 1.2e-53
CCDS14692.1 MAGEA8 gene_id:4107|Hs108|chrX ( 318) 821 184.0 1.5e-46
CCDS14691.1 MAGEA9 gene_id:4108|Hs108|chrX ( 315) 820 183.8 1.7e-46
CCDS35423.1 MAGEA9B gene_id:728269|Hs108|chrX ( 315) 820 183.8 1.7e-46
CCDS48180.1 MAGEA11 gene_id:4110|Hs108|chrX ( 429) 810 181.7 9.6e-46
CCDS14678.1 MAGEC2 gene_id:51438|Hs108|chrX ( 373) 805 180.6 1.8e-45
CCDS65233.1 MAGEB5 gene_id:347541|Hs108|chrX ( 275) 792 177.8 9.4e-45
CCDS14702.1 MAGEA4 gene_id:4103|Hs108|chrX ( 317) 756 170.2 2.2e-42
CCDS35417.1 MAGEC1 gene_id:9947|Hs108|chrX (1142) 756 170.5 6.2e-42
CCDS76046.1 MAGEA2B gene_id:266740|Hs108|chrX ( 314) 745 167.8 1.1e-41
CCDS76049.1 MAGEA2 gene_id:4101|Hs108|chrX ( 314) 745 167.8 1.1e-41
CCDS76051.1 MAGEA1 gene_id:4100|Hs108|chrX ( 309) 740 166.7 2.2e-41
CCDS14217.1 MAGEB6 gene_id:158809|Hs108|chrX ( 407) 709 160.2 2.7e-39
CCDS76048.1 MAGEA12 gene_id:4111|Hs108|chrX ( 314) 706 159.5 3.4e-39
CCDS76050.1 MAGEA6 gene_id:4105|Hs108|chrX ( 314) 702 158.7 6.2e-39
CCDS10023.1 NSMCE3 gene_id:56160|Hs108|chr15 ( 304) 691 156.3 3e-38
CCDS76045.1 MAGEA3 gene_id:4102|Hs108|chrX ( 314) 690 156.1 3.6e-38
CCDS14677.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 346) 678 153.6 2.3e-37
CCDS3269.1 MAGEF1 gene_id:64110|Hs108|chr3 ( 307) 637 144.8 8.9e-35
CCDS14362.1 MAGED2 gene_id:10916|Hs108|chrX ( 606) 627 142.9 6.8e-34
CCDS59528.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1034) 609 139.2 1.5e-32
CCDS59527.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 309) 601 137.1 1.8e-32
CCDS43959.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1431) 609 139.2 2e-32
CCDS43958.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 706) 601 137.4 3.6e-32
CCDS35281.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 739) 592 135.4 1.4e-31
CCDS48116.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX ( 739) 592 135.4 1.4e-31
CCDS14338.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 741) 592 135.4 1.4e-31
CCDS14433.1 MAGEE1 gene_id:57692|Hs108|chrX ( 957) 584 133.8 5.7e-31
CCDS14337.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 778) 577 132.3 1.3e-30
CCDS35279.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 834) 577 132.3 1.4e-30
CCDS73700.1 MAGEL2 gene_id:54551|Hs108|chr15 (1249) 551 126.8 9.2e-29
CCDS59529.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 962) 541 124.7 3.2e-28
CCDS14431.1 MAGEE2 gene_id:139599|Hs108|chrX ( 523) 473 110.0 4.5e-24
CCDS10014.1 NDN gene_id:4692|Hs108|chr15 ( 321) 455 106.1 4.2e-23
CCDS14676.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 643) 420 98.8 1.3e-20
CCDS14369.1 MAGEH1 gene_id:28986|Hs108|chrX ( 219) 360 85.8 3.8e-17
>>CCDS35221.1 MAGEB10 gene_id:139422|Hs108|chrX (347 aa)
initn: 2270 init1: 2270 opt: 2270 Z-score: 2616.0 bits: 492.5 E(32554): 2.2e-139
Smith-Waterman score: 2270; 100.0% identity (100.0% similar) in 347 aa overlap (1-347:1-347)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRQARGGLEDLIDALDILEEEEESPPSASACLKDVFQSSLDGASNN
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CCDS35 MPRGQKSKLRAREKRRQARGGLEDLIDALDILEEEEESPPSASACLKDVFQSSLDGASNN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PHGLREAQSTSTSATAASHTRHPEGVNDQMEERPICTQDLEATDSFPRGPVDEKVIILVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PHGLREAQSTSTSATAASHTRHPEGVNDQMEERPICTQDLEATDSFPRGPVDEKVIILVH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YLLYKYQMKEPITKADMLRNVTQMSKSQFPVILSRASEHLELIFGLDLKEVEPNKHIYVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 YLLYKYQMKEPITKADMLRNVTQMSKSQFPVILSRASEHLELIFGLDLKEVEPNKHIYVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VNKLDLGCDAKLSDETGVPKTGLLMTVLGIIFTNGNCVAEEEVWKVFNTMGLYDGIEHFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VNKLDLGCDAKLSDETGVPKTGLLMTVLGIIFTNGNCVAEEEVWKVFNTMGLYDGIEHFM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FGEPRKLLTKDLVKENYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDTAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FGEPRKLLTKDLVKENYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDTAP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB7 SEFSNWYTEALQDEEERARARVAAKARVSATAGARSKVKSSKSSQLQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SEFSNWYTEALQDEEERARARVAAKARVSATAGARSKVKSSKSSQLQ
310 320 330 340
>>CCDS14221.1 MAGEB4 gene_id:4115|Hs108|chrX (346 aa)
initn: 1089 init1: 655 opt: 1143 Z-score: 1319.3 bits: 252.6 E(32554): 3.6e-67
Smith-Waterman score: 1143; 53.7% identity (77.3% similar) in 348 aa overlap (1-345:1-344)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRQARGGLEDLIDALDILEEEEESPPSASACLKDVFQSSLD-GASN
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CCDS14 MPRGQKSKLRAREKRQRTRGQTQDLKVGQPTAAEKEESPSSSSSVLRDTASSSLAFGIPQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 NPHGLREAQSTSTSATAASHTRHPEGVNDQMEERPICTQDLEATDSFPRGPVDEKVIILV
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CCDS14 EPQ--REPPTTS-AAAAMSCTGSDKGDESQDEENASSSQASTSTERSLKDSLTRKTKMLV
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 HYLLYKYQMKEPITKADMLRNVTQMSKSQFPVILSRASEHLELIFGLDLKEVEPNKHIYV
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CCDS14 QFLLYKYKMKEPTTKAEMLKIISKKYKEHFPEIFRKVSQRTELVFGLALKEVNPTTHSYI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LVNKLDLGCDAKLSDETGVPKTGLLMTVLGIIFTNGNCVAEEEVWKVFNTMGLYDGIEHF
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CCDS14 LVSMLGPN-DGNQSSAWTLPRNGLLMPLLSVIFLNGNCAREEEIWEFLNMLGIYDGKRHL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 MFGEPRKLLTKDLVKENYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDTA
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CCDS14 IFGEPRKLITQDLVQEKYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDTT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB7 PSEFSNWYTEALQDEEERA--RARVAAKARVSATAGARSKVKSSKSSQLQ
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CCDS14 PNNFPLLYEEALRDEEERAGARPRVAARRGTTAMTSAYSRATSSSSSQPM
300 310 320 330 340
>>CCDS14216.1 MAGEB18 gene_id:286514|Hs108|chrX (343 aa)
initn: 1097 init1: 955 opt: 1114 Z-score: 1286.0 bits: 246.4 E(32554): 2.6e-65
Smith-Waterman score: 1114; 53.0% identity (76.7% similar) in 347 aa overlap (1-345:1-341)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRQARGGLEDLIDALDILEEEEESPPSASACLKDVFQSSLDGASNN
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CCDS14 MPRGQKSKLRAREKRHQARCENQDL-GATQATVAEGESPSPAYLLFGDRPQN-LPAAETP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB7 --PHGLREAQSTSTSATAASHTRHPEGVNDQMEERPICTQDLEATDSFPRGPVDEKVIIL
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CCDS14 SIPEALQGAPST-TNAIAPVSCSSNEGASSQ-DEKSLGSS--REAEGWKEDPLNKKVVSL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 VHYLLYKYQMKEPITKADMLRNVTQMSKSQFPVILSRASEHLELIFGLDLKEVEPNKHIY
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CCDS14 VHFLLQKYETKEPITKGDMIKFVIRKDKCHFNEILKRASEHMELALGVDLKEVDPIRHYY
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180 190 200 210 220 230
pF1KB7 VLVNKLDLGCDAKLSDETGVPKTGLLMTVLGIIFTNGNCVAEEEVWKVFNTMGLYDGIEH
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CCDS14 AFFSKLDLTYDETTSDEEKIPKTGLLMIALGVIFLNGNRAPEEAVWEIMNMMGVYADRKH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 FMFGEPRKLLTKDLVKENYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDT
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CCDS14 FLYGDPRKVMTKDLVQLKYLEYQQVPNSDPPRYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFVAKIHDT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB7 APSEFSNWYTEALQDEEERARARVAAKARVSATAGARSKVKSSKSSQLQ
.:: : . : :::.:::.:..::.::.:...: :.:::.. ::. :.
CCDS14 VPSAFPSCYEEALRDEEQRTQARAAARAHTAAMANARSRTTSSSFSHAK
300 310 320 330 340
>>CCDS14222.1 MAGEB1 gene_id:4112|Hs108|chrX (347 aa)
initn: 1088 init1: 950 opt: 1109 Z-score: 1280.1 bits: 245.3 E(32554): 5.5e-65
Smith-Waterman score: 1109; 52.4% identity (76.2% similar) in 349 aa overlap (1-345:1-345)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRQARGGLEDLIDALDILEEEEESPPSASACLKDVFQSS-LDGASN
::::::::::::::::.:: . : : :.:: : :.: : :. :: : .
CCDS14 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECP-SSSPVLGDTPTSSPAAGIPQ
10 20 30 40 50
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pF1KB7 NPHGLREAQSTSTSATAASHTRHPEGVNDQMEERPICTQDLEATDSFPRGPVDEKVIILV
.:.: : :.:.:.:.: :. ::.. : :: .: .:.: . :: .. .:.
CCDS14 KPQG---APPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 HYLLYKYQMKEPITKADMLRNVTQMSKSQFPVILSRASEHLELIFGLDLKEVEPNKHIYV
:..: ::.:.::: :::::. : . :..: ::. ::..:::.::::::: .:. : :.
CCDS14 HFILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYT
120 130 140 150 160 170
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pF1KB7 LVNKLDLGCDAKLSDETGVPKTGLLMTVLGIIFTNGNCVAEEEVWKVFNTMGLYDGIEHF
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CCDS14 LVSKLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 MFGEPRKLLTKDLVKENYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDTA
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CCDS14 IYGEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGAT
240 250 260 270 280 290
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pF1KB7 PSEFSNWYTEALQDEEERARARVAAKARVSATAG---ARSKVKSSKSSQLQ
: .: . : :::.::::::..: ...:: .:: :::.. :.::.
CCDS14 PRDFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
300 310 320 330 340
>>CCDS14220.1 MAGEB3 gene_id:4114|Hs108|chrX (346 aa)
initn: 1045 init1: 1023 opt: 1025 Z-score: 1183.5 bits: 227.4 E(32554): 1.3e-59
Smith-Waterman score: 1025; 47.6% identity (74.6% similar) in 347 aa overlap (1-345:1-345)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRQARGGLEDLIDALDILEEEEESPPSASACLKDVFQSSLDGASNN
::::::: :.:::::.:.:: .: : .... :. : ..:.. : : .
CCDS14 MPRGQKSTLHAREKRQQTRGQTQDHQGAQITATNKKKVSFSSPLILGATIQKKSAGRSRS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB7 PHGLREAQS--TSTSATAASHTRHPEGVNDQMEERPICTQDLEATDSFPRGPVDEKVIIL
.:.. : ..:... .:. . .:.:...:.. .: : .: . :. :. .:
CCDS14 --ALKKPQRALSTTTSVDVSYKKSYKGANSKIEKKQSFSQGLSSTVQSRTDPLIMKTNML
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 VHYLLYKYQMKEPITKADMLRNVTQMSKSQFPVILSRASEHLELIFGLDLKEVEPNKHIY
:..:. :.::.:: :::::. : . :. :: ::..:: ..:..::.:::.:. .: :
CCDS14 VQFLMEMYKMKKPIMKADMLKIVQKSHKNCFPEILKKASFNMEVVFGVDLKKVDSTKDSY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 VLVNKLDLGCDAKLSDETGVPKTGLLMTVLGIIFTNGNCVAEEEVWKVFNTMGLYDGIEH
:::.:.:: .. .. : ::::::...::.:: .:::..::..:. .: : .::: .:
CCDS14 VLVSKMDLPNNGTVTRGRGFPKTGLLLNLLGVIFMKGNCATEEKIWEFLNKMRIYDGKKH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 FMFGEPRKLLTKDLVKENYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDT
:.:::::::.:.:::: .::::.:::::.: ::.::::::::::::::::::: :::: :
CCDS14 FIFGEPRKLITQDLVKLKYLEYRQVPNSNPARYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFWAKVNKT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB7 APSEFSNWYTEALQDEEERARARVAAKARVSATAGARSKVKSSKSSQLQ
.:: :. :: :::.:::::..: . . :: . ::.:.:.::.
CCDS14 VPSAFQFWYEEALRDEEERVQAAAMLNDGSSAMGRKCSKAKASSSSHA
300 310 320 330 340
>>CCDS59524.1 MAGEB17 gene_id:645864|Hs108|chrX (336 aa)
initn: 1036 init1: 820 opt: 998 Z-score: 1152.6 bits: 221.7 E(32554): 7e-58
Smith-Waterman score: 998; 49.6% identity (75.7% similar) in 337 aa overlap (1-336:1-333)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRQARGGLEDLIDALDILEEEEESPPSAS-ACLKDVFQSSLDGASN
::::: :: ::::::::::: . : : :.:. : :.: :: . .:. .:.
CCDS59 MPRGQASKRRAREKRRQARGEDQCLGGAQATAAEKEKLPSSSSPACQSP--PQSFPNAGI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 NPHGLREAQSTSTSATAASHTRHPEGVNDQMEERPICTQDLEATDSFPRGPVDEKVIILV
:. ..:. :. :.:.: : ::.. : : : . ...: : .. :. ::
CCDS59 -PQESQRASYPSSPASAVSLTSSDEGAKGQKGESPNSFHGPSSSESTGRDLLNTKTGELV
60 70 80 90 100 110
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CCDS14 TPCAFPTHYEEALKDEEKAGV
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CCDS43 CSSSIAVTTTSSSESDEASSNQEEEDSPSSSEDTSDPRNVPADALDQKVAFLVNFMLHKC
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CCDS43 YAEALKEEEERARARI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]