FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7149, 347 aa
1>>>pF1KB7149 347 - 347 aa - 347 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3674+/-0.000781; mu= 13.5616+/- 0.048
mean_var=114.9347+/-22.558, 0's: 0 Z-trim(111.7): 46 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.119632
statistics sampled from 12510 (12556) to 12510 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.736), E-opt: 0.2 (0.386), width: 16
Scan time: 2.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14222.1 MAGEB1 gene_id:4112|Hs108|chrX ( 347) 2303 407.8 6.8e-114
CCDS14221.1 MAGEB4 gene_id:4115|Hs108|chrX ( 346) 1500 269.2 3.6e-72
CCDS14219.1 MAGEB2 gene_id:4113|Hs108|chrX ( 319) 1368 246.4 2.4e-65
CCDS14216.1 MAGEB18 gene_id:286514|Hs108|chrX ( 343) 1146 208.1 8.8e-54
CCDS59524.1 MAGEB17 gene_id:645864|Hs108|chrX ( 336) 1145 207.9 9.7e-54
CCDS35221.1 MAGEB10 gene_id:139422|Hs108|chrX ( 347) 1109 201.7 7.4e-52
CCDS14220.1 MAGEB3 gene_id:4114|Hs108|chrX ( 346) 1078 196.4 3e-50
CCDS43927.1 MAGEB16 gene_id:139604|Hs108|chrX ( 324) 949 174.1 1.4e-43
CCDS14705.1 MAGEA10 gene_id:4109|Hs108|chrX ( 369) 896 165.0 9e-41
CCDS14217.1 MAGEB6 gene_id:158809|Hs108|chrX ( 407) 871 160.7 1.9e-39
CCDS48180.1 MAGEA11 gene_id:4110|Hs108|chrX ( 429) 861 159.0 6.7e-39
CCDS14702.1 MAGEA4 gene_id:4103|Hs108|chrX ( 317) 855 157.9 1.1e-38
CCDS65233.1 MAGEB5 gene_id:347541|Hs108|chrX ( 275) 847 156.4 2.5e-38
CCDS14692.1 MAGEA8 gene_id:4107|Hs108|chrX ( 318) 830 153.5 2.2e-37
CCDS76051.1 MAGEA1 gene_id:4100|Hs108|chrX ( 309) 800 148.4 7.7e-36
CCDS14691.1 MAGEA9 gene_id:4108|Hs108|chrX ( 315) 790 146.6 2.6e-35
CCDS35423.1 MAGEA9B gene_id:728269|Hs108|chrX ( 315) 790 146.6 2.6e-35
CCDS14678.1 MAGEC2 gene_id:51438|Hs108|chrX ( 373) 773 143.8 2.2e-34
CCDS76049.1 MAGEA2 gene_id:4101|Hs108|chrX ( 314) 729 136.1 3.8e-32
CCDS76046.1 MAGEA2B gene_id:266740|Hs108|chrX ( 314) 729 136.1 3.8e-32
CCDS76048.1 MAGEA12 gene_id:4111|Hs108|chrX ( 314) 726 135.6 5.4e-32
CCDS76050.1 MAGEA6 gene_id:4105|Hs108|chrX ( 314) 714 133.5 2.3e-31
CCDS76045.1 MAGEA3 gene_id:4102|Hs108|chrX ( 314) 711 133.0 3.3e-31
CCDS14677.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 346) 657 123.7 2.2e-28
CCDS10023.1 NSMCE3 gene_id:56160|Hs108|chr15 ( 304) 655 123.3 2.6e-28
CCDS35417.1 MAGEC1 gene_id:9947|Hs108|chrX (1142) 657 124.1 5.6e-28
CCDS3269.1 MAGEF1 gene_id:64110|Hs108|chr3 ( 307) 583 110.9 1.4e-24
CCDS14362.1 MAGED2 gene_id:10916|Hs108|chrX ( 606) 572 109.2 9e-24
CCDS73700.1 MAGEL2 gene_id:54551|Hs108|chr15 (1249) 573 109.7 1.4e-23
CCDS14433.1 MAGEE1 gene_id:57692|Hs108|chrX ( 957) 559 107.1 6e-23
CCDS59527.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 309) 544 104.2 1.5e-22
CCDS43958.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 706) 544 104.5 2.9e-22
CCDS59528.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1034) 544 104.6 3.8e-22
CCDS43959.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1431) 544 104.7 4.9e-22
CCDS48116.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX ( 739) 533 102.6 1.1e-21
CCDS35281.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 739) 533 102.6 1.1e-21
CCDS14338.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 741) 533 102.6 1.1e-21
CCDS14337.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 778) 516 99.7 8.8e-21
CCDS35279.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 834) 516 99.7 9.3e-21
CCDS10014.1 NDN gene_id:4692|Hs108|chr15 ( 321) 505 97.4 1.7e-20
CCDS59529.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 962) 499 96.8 7.9e-20
CCDS14431.1 MAGEE2 gene_id:139599|Hs108|chrX ( 523) 416 82.3 1e-15
CCDS14676.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 643) 415 82.2 1.3e-15
CCDS14369.1 MAGEH1 gene_id:28986|Hs108|chrX ( 219) 370 74.0 1.3e-13
>>CCDS14222.1 MAGEB1 gene_id:4112|Hs108|chrX (347 aa)
initn: 2303 init1: 2303 opt: 2303 Z-score: 2158.2 bits: 407.8 E(32554): 6.8e-114
Smith-Waterman score: 2303; 100.0% identity (100.0% similar) in 347 aa overlap (1-347:1-347)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSSPVLGDTPTSSPAAGIPQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSSPVLGDTPTSSPAAGIPQK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PQGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMHFIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PQGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMHFIL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTLVSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTLVSK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLIYGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLIYGE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 PRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATPRDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATPRDF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB7 PSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
310 320 330 340
>>CCDS14221.1 MAGEB4 gene_id:4115|Hs108|chrX (346 aa)
initn: 1436 init1: 884 opt: 1500 Z-score: 1409.2 bits: 269.2 E(32554): 3.6e-72
Smith-Waterman score: 1500; 68.1% identity (83.6% similar) in 348 aa overlap (1-347:1-346)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSSP-VLGDTPTSSPAAGIPQ
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CCDS14 MPRGQKSKLRAREKRQRTRGQTQDLKVGQPTAAEKEESPSSSSSVLRDTASSSLAFGIPQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 KPQGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMHFI
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CCDS14 EPQREPPTTSAAAAMSCTGSDKGDESQDEENASSSQASTSTERSLKDSLTRKTKMLVQFL
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120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTLVS
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CCDS14 LYKYKMKEPTTKAEMLKIISKKYKEHFPEIFRKVSQRTELVFGLALKEVNPTTHSYILVS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 KLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLIYG
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CCDS14 MLG-PNDGNQSSAWTLPRNGLLMPLLSVIFLNGNCAREEEIWEFLNMLGIYDGKRHLIFG
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 EPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATPRD
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CCDS14 EPRKLITQDLVQEKYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDTTPNN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB7 FPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
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CCDS14 FPLLYEEALRDEEERAGARPRVAARRGTTAMT-SAYSRATSSSSSQPM
300 310 320 330 340
>>CCDS14219.1 MAGEB2 gene_id:4113|Hs108|chrX (319 aa)
initn: 1264 init1: 1043 opt: 1368 Z-score: 1286.6 bits: 246.4 E(32554): 2.4e-65
Smith-Waterman score: 1368; 65.2% identity (88.0% similar) in 316 aa overlap (1-313:1-316)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPS-SSPVLGDTPTSSPAAGIPQ
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CCDS14 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIPQ
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pF1KB7 KPQGAPPTTTAAAA-VSCTESDEGAKC-QGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMH
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CCDS14 EPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSGSLVQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 FILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTL
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CCDS14 FLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGHTYTF
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pF1KB7 VSKLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLI
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CCDS14 IDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGEEHSV
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240 250 260 270 280 290
pF1KB7 YGEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATP
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CCDS14 FGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVNGTTP
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300 310 320 330 340
pF1KB7 RDFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
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CCDS14 CAFPTHYEEALKDEEKAGV
310
>>CCDS14216.1 MAGEB18 gene_id:286514|Hs108|chrX (343 aa)
initn: 1156 init1: 864 opt: 1146 Z-score: 1079.1 bits: 208.1 E(32554): 8.8e-54
Smith-Waterman score: 1146; 54.2% identity (78.2% similar) in 349 aa overlap (1-345:1-341)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSSPVL-GDTPTSSPAAGIPQ
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CCDS14 MPRGQKSKLRAREKRHQARCENQDLGATQATVAEGES-PSPAYLLFGDRPQNLPAAETPS
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pF1KB7 KP---QGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLM
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CCDS14 IPEALQGAPSTTNAIAPVSCS-SNEGASSQDEKSLGSSREA---EGWKEDPLNKKVVSLV
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pF1KB7 HFILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYT
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CCDS14 HFLLQKYETKEPITKGDMIKFVIRKDKCHFNEILKRASEHMELALGVDLKEVDPIRHYYA
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pF1KB7 LVSKLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHL
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CCDS14 FFSKLDLTYDETTSDEEKIPKTGLLMIALGVIFLNGNRAPEEAVWEIMNMMGVYADRKHF
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pF1KB7 IYGEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGAT
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CCDS14 LYGDPRKVMTKDLVQLKYLEYQQVPNSDPPRYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFVAKIHDTV
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pF1KB7 PRDFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
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CCDS14 PSAFPSCYEEALRDEEQRTQARAAARAH---TAAMANARSRTTSSSFSHAK
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>>CCDS59524.1 MAGEB17 gene_id:645864|Hs108|chrX (336 aa)
initn: 1174 init1: 983 opt: 1145 Z-score: 1078.2 bits: 207.9 E(32554): 9.7e-54
Smith-Waterman score: 1145; 55.1% identity (78.9% similar) in 332 aa overlap (1-330:1-331)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSS-PVLGDTPTSSPAAGIPQ
::::: :: :::::::.:: : : : :.:::::::. :::: :. . : : : :::::
CCDS59 MPRGQASKRRAREKRRQARGEDQCLGGAQATAAEKEKLPSSSSPACQSPPQSFPNAGIPQ
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pF1KB7 KPQGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQ-GEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMHF
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CCDS59 ESQRASYPSSPASAVSLTSSDEGAKGQKGESPNSF-HGPSSSESTGRDLLNTKTGELVQF
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120 130 140 150 160 170
pF1KB7 ILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTLV
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CCDS59 LLNKYIRKEPITREAMLKVINRKYKQHFPEILRRSTENVEVVFGLYLKEMDPSRQSYVLV
120 130 140 150 160 170
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pF1KB7 SKLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLIY
.::.. :.:.::. :: .:::: ::..::..:: :::::.:. .:.:: : :..:.::
CCDS59 GKLDFPNQGSLSDGGGFPLSGLLMVLLSTIFMHGNRATEEEMWECLNALGMYKGRKHFIY
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 GEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATPR
:::....:.:::.: ::.:.:::.::::::.::::::: :::.:::::::.::.: ..
CCDS59 GEPQELVTKDLVREGYLEYQQVPSSDPPRYEFLWGPRARAETSKMKVLEFVAKLNDTVAS
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pF1KB7 DFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
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CCDS59 TYKSRYEEALREEEEQARARAVARDSARARASRSFQP
300 310 320 330
>>CCDS35221.1 MAGEB10 gene_id:139422|Hs108|chrX (347 aa)
initn: 1088 init1: 950 opt: 1109 Z-score: 1044.5 bits: 201.7 E(32554): 7.4e-52
Smith-Waterman score: 1109; 52.4% identity (76.2% similar) in 349 aa overlap (1-345:1-345)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECP-SSSPVLGDTPTSSPAAGIPQ
::::::::::::::::.:: . : : :.:: : :.: : :. :: : .
CCDS35 MPRGQKSKLRAREKRRQARGGLEDLIDALDILEEEEESPPSASACLKDVFQSS-LDGASN
10 20 30 40 50
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pF1KB7 KPQG---APPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLM
.:.: : :.:.:.:.: :. ::.. : :: .: .:.: . :: .. .:.
CCDS35 NPHGLREAQSTSTSATAASHTRHPEGVNDQMEERPICTQDLEATDSFPRGPVDEKVIILV
60 70 80 90 100 110
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pF1KB7 HFILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYT
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CCDS35 LVNKLDLGCDAKLSDETGVPKTGLLMTVLGIIFTNGNCVAEEEVWKVFNTMGLYDGIEHF
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CCDS35 MFGEPRKLLTKDLVKENYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDTA
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pF1KB7 PRDFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
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CCDS35 PSEFSNWYTEALQDEEERARARVAAKARVSATAG---ARSKVKSSKSSQLQ
300 310 320 330 340
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CCDS14 MPRGQKSTLHAREKRQQTRGQTQDHQGAQITATNKKKVSFSSPLILGATIQKKSAGRSRS
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CCDS14 ALKKPQRALSTTTSVD-VSYKKSYKGANSKIEKKQSFSQGLSSTVQSRTDPLIMKTNMLV
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CCDS14 QFLMEMYKMKKPIMKADMLKIVQKSHKNCFPEILKKASFNMEVVFGVDLKKVDSTKDSYV
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CCDS14 LVSKMDLPNNGTVTRGRGFPKTGLLLNLLGVIFMKGNCATEEKIWEFLNKMRIYDGKKHF
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pF1KB7 IYGEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGAT
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CCDS14 IFGEPRKLITQDLVKLKYLEYRQVPNSNPARYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFWAKVNKTV
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pF1KB7 PRDFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
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CCDS14 PSAFQFWYEEALRDEEERVQAAAMLND---GSSAMGRKCSKAKASSSSHA
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pF1KB7 PQK-PQGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVK-DPVAWEAGML
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CCDS43 PLEVPQSFCSSSIAVTTTSSSESDEASSNQEEEDSPSSSEDTSDPRNVPADALDQKVAFL
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pF1KB7 MHFILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTY
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CCDS43 VNFMLHKCQMKKPITKADMLKIIIKDDESHFSEILLRASEHLEMIFGLDVVEVDPTTHCY
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CCDS43 GLFIKLGLTYDGMLSGEKGVPKTGLLIIVLGVIFMKGNRATEEEVWEVLNLTGVYSGKKH
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pF1KB7 LIYGEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGA
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CCDS43 FIFGEPRMLITKDFVKEKYLEYQQVANSDPARYEFLWGPRAKAETSKMKVLEFVAKVHGS
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pF1KB7 TPRDFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
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CCDS43 YPHSFPSQYAEALKEEEERARARI
310 320
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CCDS14 MPRAPKRQRCMPEEDLQSQSETQGLEGAQAPLAVEEDASSSTSTSSSFPSSFPSSSSSSS
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pF1KB7 ------IPQKPQ-----GAPPTTTAAAAVSCT-----------ESDEGAKCQGEENASFS
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CCDS14 SSCYPLIPSTPEEVSADDETPNPPQSAQIACSSPSVVASLPLDQSDEGSSSQKEESPSTL
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CCDS14 QVLPDSESLPRSEIDEKVTDLVQFLLFKYQMKEPITKAEILESVIRNYEDHFPLLFSEAS
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pF1KB7 RRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTLVSKLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNS
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CCDS14 ECMLLVFGIDVKEVDPTGHSFVLVTSLGLTYDGMLSDVQSMPKTGILILILSIVFIEGYC
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CCDS14 TPEEVIWEALNMMGLYDGMEHLIYGEPRKLLTQDWVQENYLEYRQVPGSDPARYEFLWGP
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CCDS14 ATGSFSYPE
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CCDS14 ESQGASPTGSPDAGVSGSKYDVAANGQDEKSPSTSHDVSVPQESQGASPTGSPDAGVSGS
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CCDS14 LRA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]