Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7146
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7146, 346 aa
1>>>pF1KB7146 346 - 346 aa - 346 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5732+/-0.00102; mu= 15.1974+/- 0.062
mean_var=77.2107+/-15.145, 0's: 0 Z-trim(104.1): 48 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.145961
statistics sampled from 7700 (7748) to 7700 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.615), E-opt: 0.2 (0.238), width: 16
Scan time: 2.060
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14220.1 MAGEB3 gene_id:4114|Hs108|chrX ( 346) 2234 480.1 1.1e-135
CCDS14221.1 MAGEB4 gene_id:4115|Hs108|chrX ( 346) 1148 251.5 7.9e-67
CCDS14222.1 MAGEB1 gene_id:4112|Hs108|chrX ( 347) 1078 236.7 2.2e-62
CCDS35221.1 MAGEB10 gene_id:139422|Hs108|chrX ( 347) 1029 226.4 2.8e-59
CCDS14216.1 MAGEB18 gene_id:286514|Hs108|chrX ( 343) 1022 224.9 7.6e-59
CCDS59524.1 MAGEB17 gene_id:645864|Hs108|chrX ( 336) 1015 223.4 2.1e-58
CCDS14219.1 MAGEB2 gene_id:4113|Hs108|chrX ( 319) 996 219.4 3.2e-57
CCDS43927.1 MAGEB16 gene_id:139604|Hs108|chrX ( 324) 909 201.1 1.1e-51
CCDS65233.1 MAGEB5 gene_id:347541|Hs108|chrX ( 275) 877 194.3 9.8e-50
CCDS14705.1 MAGEA10 gene_id:4109|Hs108|chrX ( 369) 842 187.0 2.1e-47
CCDS48180.1 MAGEA11 gene_id:4110|Hs108|chrX ( 429) 804 179.1 6e-45
CCDS14702.1 MAGEA4 gene_id:4103|Hs108|chrX ( 317) 788 175.6 4.8e-44
CCDS76051.1 MAGEA1 gene_id:4100|Hs108|chrX ( 309) 780 173.9 1.5e-43
CCDS14692.1 MAGEA8 gene_id:4107|Hs108|chrX ( 318) 766 171.0 1.2e-42
CCDS14217.1 MAGEB6 gene_id:158809|Hs108|chrX ( 407) 762 170.2 2.6e-42
CCDS14678.1 MAGEC2 gene_id:51438|Hs108|chrX ( 373) 722 161.8 8.4e-40
CCDS14691.1 MAGEA9 gene_id:4108|Hs108|chrX ( 315) 720 161.3 9.9e-40
CCDS35423.1 MAGEA9B gene_id:728269|Hs108|chrX ( 315) 720 161.3 9.9e-40
CCDS76046.1 MAGEA2B gene_id:266740|Hs108|chrX ( 314) 689 154.8 9.1e-38
CCDS76049.1 MAGEA2 gene_id:4101|Hs108|chrX ( 314) 689 154.8 9.1e-38
CCDS76050.1 MAGEA6 gene_id:4105|Hs108|chrX ( 314) 678 152.5 4.5e-37
CCDS35417.1 MAGEC1 gene_id:9947|Hs108|chrX (1142) 683 153.9 6.2e-37
CCDS76045.1 MAGEA3 gene_id:4102|Hs108|chrX ( 314) 664 149.5 3.5e-36
CCDS76048.1 MAGEA12 gene_id:4111|Hs108|chrX ( 314) 662 149.1 4.7e-36
CCDS10023.1 NSMCE3 gene_id:56160|Hs108|chr15 ( 304) 644 145.3 6.3e-35
CCDS14362.1 MAGED2 gene_id:10916|Hs108|chrX ( 606) 604 137.1 3.8e-32
CCDS43958.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 706) 601 136.5 6.6e-32
CCDS43959.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1431) 601 136.7 1.2e-31
CCDS3269.1 MAGEF1 gene_id:64110|Hs108|chr3 ( 307) 592 134.3 1.3e-31
CCDS59527.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 309) 592 134.3 1.3e-31
CCDS59528.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1034) 592 134.7 3.4e-31
CCDS14677.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 346) 576 131.0 1.4e-30
CCDS73700.1 MAGEL2 gene_id:54551|Hs108|chr15 (1249) 581 132.4 2e-30
CCDS14337.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 778) 567 129.3 1e-29
CCDS35279.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 834) 567 129.3 1.1e-29
CCDS48116.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX ( 739) 562 128.3 2e-29
CCDS35281.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 739) 562 128.3 2e-29
CCDS14338.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 741) 562 128.3 2e-29
CCDS14433.1 MAGEE1 gene_id:57692|Hs108|chrX ( 957) 545 124.7 3e-28
CCDS59529.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 962) 537 123.1 9.7e-28
CCDS14431.1 MAGEE2 gene_id:139599|Hs108|chrX ( 523) 460 106.7 4.5e-23
CCDS10014.1 NDN gene_id:4692|Hs108|chr15 ( 321) 434 101.1 1.3e-21
CCDS14369.1 MAGEH1 gene_id:28986|Hs108|chrX ( 219) 369 87.3 1.3e-17
CCDS14676.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 643) 321 77.5 3.5e-14
>>CCDS14220.1 MAGEB3 gene_id:4114|Hs108|chrX (346 aa)
initn: 2234 init1: 2234 opt: 2234 Z-score: 2549.2 bits: 480.1 E(32554): 1.1e-135
Smith-Waterman score: 2234; 99.4% identity (99.7% similar) in 346 aa overlap (1-346:1-346)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSTLHAREKRQQTRGQTQDHQGAQITATNKKKVSFSSPLILGATIQKKSAGRSRS
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CCDS14 MPRGQKSTLHAREKRQQTRGQTQDHQGAQITATNKKKVSFSSPLILGATIQKKSAGRSRS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 ALKKPQRALSTTTSVDVSYKKSYKGANSKIEKKQSFSQGLSSTVQSHTDPLTMKTNMLVQ
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CCDS14 ALKKPQRALSTTTSVDVSYKKSYKGANSKIEKKQSFSQGLSSTVQSRTDPLIMKTNMLVQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FLMEMYKMKKPIMKADMLKIVQKSHKNCFPEILKKASFNMEVVFGVDLKKVDSTKDSYVL
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CCDS14 FLMEMYKMKKPIMKADMLKIVQKSHKNCFPEILKKASFNMEVVFGVDLKKVDSTKDSYVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VSKMDLPNNGTVTRGRGFPKTGLLLNLLGVIFMKGNCATEEKIWEFLNKMRIYDGKKHFI
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CCDS14 VSKMDLPNNGTVTRGRGFPKTGLLLNLLGVIFMKGNCATEEKIWEFLNKMRIYDGKKHFI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FGEPRKLITQDLVKLKYLEYRQVPNSNPARYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFWAKVNKTVP
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CCDS14 FGEPRKLITQDLVKLKYLEYRQVPNSNPARYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFWAKVNKTVP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB7 SAFQFWYEEALRDEEERVQAAAMLNDGSSAMGRKCSKAKASSSSHA
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CCDS14 SAFQFWYEEALRDEEERVQAAAMLNDGSSAMGRKCSKAKASSSSHA
310 320 330 340
>>CCDS14221.1 MAGEB4 gene_id:4115|Hs108|chrX (346 aa)
initn: 1114 init1: 662 opt: 1148 Z-score: 1313.3 bits: 251.5 E(32554): 7.9e-67
Smith-Waterman score: 1148; 55.7% identity (76.7% similar) in 348 aa overlap (1-345:1-344)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSTLHAREKRQQTRGQTQDHQGAQITATNKKKVSFSSPLILGATIQKKSAGRSRS
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CCDS14 MPRGQKSKLRAREKRQRTRGQTQDLKVGQPTAAEKEESPSSSSSVLRDTA---SSSLAFG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB7 ALKKPQRALSTTTSVD-VSYKKSYKGANSKIEKKQSFSQGLSSTVQSHTDPLTMKTNMLV
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CCDS14 IPQEPQREPPTTSAAAAMSCTGSDKGDESQDEENASSSQASTSTERSLKDSLTRKTKMLV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 QFLMEMYKMKKPIMKADMLKIVQKSHKNCFPEILKKASFNMEVVFGVDLKKVDSTKDSYV
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CCDS14 QFLLYKYKMKEPTTKAEMLKIISKKYKEHFPEIFRKVSQRTELVFGLALKEVNPTTHSYI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LVSKMDLPNNGTVTRGRGFPKTGLLLNLLGVIFMKGNCATEEKIWEFLNKMRIYDGKKHF
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CCDS14 LVSMLG-PNDGNQSSAWTLPRNGLLMPLLSVIFLNGNCAREEEIWEFLNMLGIYDGKRHL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 IFGEPRKLITQDLVKLKYLEYRQVPNSNPARYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFWAKVNKTV
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CCDS14 IFGEPRKLITQDLVQEKYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDTT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB7 PSAFQFWYEEALRDEEERVQAAAMLND--GSSAMGRKCSKAKASSSSHA
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CCDS14 PNNFPLLYEEALRDEEERAGARPRVAARRGTTAMTSAYSRATSSSSSQPM
300 310 320 330 340
>>CCDS14222.1 MAGEB1 gene_id:4112|Hs108|chrX (347 aa)
initn: 1112 init1: 928 opt: 1078 Z-score: 1233.6 bits: 236.7 E(32554): 2.2e-62
Smith-Waterman score: 1078; 51.0% identity (77.4% similar) in 349 aa overlap (1-345:1-345)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSTLHAREKRQQTRGQTQDHQGAQITATNKKKVSFSSPLILGATIQKKSAGRSRS
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CCDS14 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSSP-VLGDTPTSSPAA---G
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB7 ALKKPQRALSTTTSVD-VSYKKSYKGANSKIEKKQSFSQGLSSTVQSHTDPLTMKTNMLV
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CCDS14 IPQKPQGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 QFLMEMYKMKKPIMKADMLKIVQKSHKNCFPEILKKASFNMEVVFGVDLKKVDSTKDSYV
.:... :::..:::::::::.:....:. : :::. :: .:.:::.:::. . . .:.
CCDS14 HFILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYT
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180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LVSKMDLPNNGTVTRGRGFPKTGLLLNLLGVIFMKGNCATEEKIWEFLNKMRIYDGKKHF
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CCDS14 LVSKLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 IFGEPRKLITQDLVKLKYLEYRQVPNSNPARYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFWAKVNKTV
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CCDS14 IYGEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGAT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB7 PSAFQFWYEEALRDEEERVQAAAMLND---GSSAMGRKCSKAKASSSSHA
: : :::::::::::.:. . . ... : :.: : :::
CCDS14 PRDFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
300 310 320 330 340
>>CCDS35221.1 MAGEB10 gene_id:139422|Hs108|chrX (347 aa)
initn: 1049 init1: 1027 opt: 1029 Z-score: 1177.9 bits: 226.4 E(32554): 2.8e-59
Smith-Waterman score: 1029; 47.6% identity (74.6% similar) in 347 aa overlap (1-345:1-345)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSTLHAREKRQQTRGQTQDHQGAQITATNKKKVSFSSPLILGATIQKKSAGRSRS
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CCDS35 MPRGQKSKLRAREKRRQARGGLEDLIDALDILEEEEESPPSASACLKDVFQSSLDGASNN
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 --ALKKPQRALSTTTSVDVSYKKSYKGANSKIEKKQSFSQGLSSTVQSHTDPLTMKTNML
.:.. : ..:... .:. . .:.:...:.. .: : .: . :. :. .:
CCDS35 PHGLREAQS--TSTSATAASHTRHPEGVNDQMEERPICTQDLEATDSFPRGPVDEKVIIL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 VQFLMEMYKMKKPIMKADMLKIVQKSHKNCFPEILKKASFNMEVVFGVDLKKVDSTKDSY
:..:. :.::.:: :::::. : . :. :: ::..:: ..:..::.:::.:. .: :
CCDS35 VHYLLYKYQMKEPITKADMLRNVTQMSKSQFPVILSRASEHLELIFGLDLKEVEPNKHIY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 VLVSKMDLPNNGTVTRGRGFPKTGLLLNLLGVIFMKGNCATEEKIWEFLNKMRIYDGKKH
:::.:.:: .. .. : ::::::...::.:: .:::..::..:. .: : .::: .:
CCDS35 VLVNKLDLGCDAKLSDETGVPKTGLLMTVLGIIFTNGNCVAEEEVWKVFNTMGLYDGIEH
180 190 200 210 220 230
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pF1KB7 FIFGEPRKLITQDLVKLKYLEYRQVPNSNPARYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFWAKVNKT
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CCDS35 FMFGEPRKLLTKDLVKENYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB7 VPSAFQFWYEEALRDEEERVQAAAMLNDGSSAMGRKCSKAKASSSSHA
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CCDS35 APSEFSNWYTEALQDEEERARARVAAKARVSATAGARSKVKSSKSSQLQ
300 310 320 330 340
>>CCDS14216.1 MAGEB18 gene_id:286514|Hs108|chrX (343 aa)
initn: 1014 init1: 875 opt: 1022 Z-score: 1170.0 bits: 224.9 E(32554): 7.6e-59
Smith-Waterman score: 1022; 50.1% identity (74.6% similar) in 347 aa overlap (1-346:1-342)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSTLHAREKRQQTRGQTQDHQGAQITATNKKKVSFSSPLILGATIQKKSAGRSRS
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CCDS14 MPRGQKSKLRAREKRHQARCENQDLGATQATVAEGESPS-PAYLLFGDRPQNLPAAETPS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB7 ALKKPQRALSTTTSVDVSYKKSYKGANSKIEKKQSFSQGLSSTVQS-HTDPLTMKTNMLV
. : : :::... .: .::.:. :: : : : ... . :::. :. ::
CCDS14 IPEALQGAPSTTNAIAPVSCSSNEGASSQDEK----SLGSSREAEGWKEDPLNKKVVSLV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 QFLMEMYKMKKPIMKADMLKIVQKSHKNCFPEILKKASFNMEVVFGVDLKKVDSTKDSYV
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CCDS14 HFLLQKYETKEPITKGDMIKFVIRKDKCHFNEILKRASEHMELALGVDLKEVDPIRHYYA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LVSKMDLPNNGTVTRGRGFPKTGLLLNLLGVIFMKGNCATEEKIWEFLNKMRIYDGKKHF
. ::.:: . :.. . .::::::. :::::..:: : :: .::..: : .: .:::
CCDS14 FFSKLDLTYDETTSDEEKIPKTGLLMIALGVIFLNGNRAPEEAVWEIMNMMGVYADRKHF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 IFGEPRKLITQDLVKLKYLEYRQVPNSNPARYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFWAKVNKTV
..:.:::..:.:::.::::::.:::::.: :::::::::::::::::::::: ::.. ::
CCDS14 LYGDPRKVMTKDLVQLKYLEYQQVPNSDPPRYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFVAKIHDTV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB7 PSAFQFWYEEALRDEEERVQAAAMLNDGSSAMGRKCSKAKASSSSHA
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CCDS14 PSAFPSCYEEALRDEEQRTQARAAARAHTAAMANARSRTTSSSFSHAK
300 310 320 330 340
>>CCDS59524.1 MAGEB17 gene_id:645864|Hs108|chrX (336 aa)
initn: 1010 init1: 883 opt: 1015 Z-score: 1162.1 bits: 223.4 E(32554): 2.1e-58
Smith-Waterman score: 1015; 50.8% identity (77.2% similar) in 333 aa overlap (1-330:1-328)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPRGQKSTLHAREKRQQTRGQTQDHQGAQITATNKKKV-SFSSPLILGATIQKKSAGRSR
::::: : .:::::.:.::. : ::: ::..:.:. : ::: . . .::
CCDS59 MPRGQASKRRAREKRRQARGEDQCLGGAQATAAEKEKLPSSSSPACQSPPQSFPNAG---
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 SALKKPQRA-LSTTTSVDVSYKKSYKGANS-KIEKKQSFSQGLSSTVQSHTDPLTMKTNM
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CCDS59 LVQFLLNKYIRKEPITREAMLKVINRKYKQHFPEILRRSTENVEVVFGLYLKEMDPSRQS
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CCDS59 TVASTYKSRYEEALREEEEQARARAVARDSARARASRSFQP
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CCDS14 IPQEPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSGS
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CCDS14 TTPCAFPTHYEEALKDEEKAGV
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CCDS43 SPLEVPQSFCSSSIAVTTTSSSESDEASSNQEEEDSPSSSEDTSDPRNVPADALDQKVAF
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CCDS43 SYPHSFPSQYAEALKEEEERARARI
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CCDS65 TESSCSNFINIKVGLLEQFLLYKFKMKQRILKEDMLKIVNPRYQNQFAEIHRRASEHIEV
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CCDS65 FSQPY
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CCDS14 SSCYPLIPSTPEEVSADDETPNPPQSAQIACSSPSVVASLPLDQSDEGSSSQKEESPSTL
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: .: :
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]