Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7142
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7142, 337 aa
1>>>pF1KB7142 337 - 337 aa - 337 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2267+/-0.0012; mu= 15.8762+/- 0.072
mean_var=91.3207+/-25.015, 0's: 0 Z-trim(101.4): 274 B-trim: 914 in 2/47
Lambda= 0.134211
statistics sampled from 6147 (6520) to 6147 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.529), E-opt: 0.2 (0.2), width: 16
Scan time: 2.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 ( 337) 2246 445.9 2.2e-125
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 763 158.8 6.6e-39
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 694 145.4 6.8e-35
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 641 135.1 8.1e-32
CCDS3162.1 SUCNR1 gene_id:56670|Hs108|chr3 ( 334) 638 134.5 1.2e-31
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 637 134.4 1.5e-31
CCDS8220.1 P2RY6 gene_id:5031|Hs108|chr11 ( 328) 555 118.4 8e-27
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 540 115.6 6.5e-26
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 526 112.9 4.2e-25
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 526 112.9 4.3e-25
CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 ( 425) 522 112.2 8.1e-25
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13 ( 361) 496 107.0 2.4e-23
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 493 106.5 3.5e-23
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 493 106.5 3.6e-23
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY ( 359) 487 105.3 7.9e-23
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX ( 359) 487 105.3 7.9e-23
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 ( 397) 486 105.2 9.6e-23
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 479 103.7 2.3e-22
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 479 103.8 2.3e-22
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 478 103.6 2.7e-22
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 477 103.4 2.9e-22
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 475 103.0 3.8e-22
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 474 102.8 4.6e-22
CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 352) 469 101.8 8.7e-22
CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 374) 469 101.8 9.1e-22
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 465 101.0 1.5e-21
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 465 101.1 1.5e-21
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 465 101.1 1.6e-21
CCDS53842.1 HCAR3 gene_id:8843|Hs108|chr12 ( 387) 461 100.3 2.7e-21
CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19 ( 362) 458 99.7 3.9e-21
CCDS9491.1 GPR18 gene_id:2841|Hs108|chr13 ( 331) 452 98.5 8.1e-21
CCDS9235.1 HCAR2 gene_id:338442|Hs108|chr12 ( 363) 452 98.5 8.7e-21
CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX ( 381) 450 98.2 1.2e-20
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 447 97.6 1.7e-20
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 444 97.0 2.5e-20
CCDS9879.1 GPR65 gene_id:8477|Hs108|chr14 ( 337) 439 96.0 4.7e-20
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 435 95.3 8.7e-20
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 433 94.8 1.1e-19
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 432 94.7 1.3e-19
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 432 94.7 1.3e-19
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 432 94.7 1.3e-19
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 432 94.7 1.3e-19
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 431 94.5 1.4e-19
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 424 93.1 3.8e-19
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 421 92.5 5.4e-19
CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12 ( 372) 421 92.5 5.7e-19
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 419 92.1 7.2e-19
CCDS14004.1 MCHR1 gene_id:2847|Hs108|chr22 ( 422) 419 92.2 8.1e-19
CCDS12350.1 F2RL3 gene_id:9002|Hs108|chr19 ( 385) 418 92.0 8.7e-19
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 417 91.8 9.7e-19
>>CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 (337 aa)
initn: 2246 init1: 2246 opt: 2246 Z-score: 2364.4 bits: 445.9 E(32554): 2.2e-125
Smith-Waterman score: 2246; 100.0% identity (100.0% similar) in 337 aa overlap (1-337:1-337)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MNEPLDYLANASDFPDYAAAFGNCTDENIPLKMHYLPVIYGIIFLVGFPGNAVVISTYIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MNEPLDYLANASDFPDYAAAFGNCTDENIPLKMHYLPVIYGIIFLVGFPGNAVVISTYIF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KMRPWKSSTIIMLNLACTDLLYLTSLPFLIHYYASGENWIFGDFMCKFIRFSFHFNLYSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 KMRPWKSSTIIMLNLACTDLLYLTSLPFLIHYYASGENWIFGDFMCKFIRFSFHFNLYSS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 ILFLTCFSIFRYCVIIHPMSCFSIHKTRCAVVACAVVWIISLVAVIPMTFLITSTNRTNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 ILFLTCFSIFRYCVIIHPMSCFSIHKTRCAVVACAVVWIISLVAVIPMTFLITSTNRTNR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SACLDLTSSDELNTIKWYNLILTATTFCLPLVIVTLCYTTIIHTLTHGLQTDSCLKQKAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 SACLDLTSSDELNTIKWYNLILTATTFCLPLVIVTLCYTTIIHTLTHGLQTDSCLKQKAR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RLTILLLLAFYVCFLPFHILRVIRIESRLLSISCSIENQIHEAYIVSRPLAALNTFGNLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 RLTILLLLAFYVCFLPFHILRVIRIESRLLSISCSIENQIHEAYIVSRPLAALNTFGNLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KB7 LYVVVSDNFQQAVCSTVRCKVSGNLEQAKKISYSNNP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 LYVVVSDNFQQAVCSTVRCKVSGNLEQAKKISYSNNP
310 320 330
>>CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 (373 aa)
initn: 545 init1: 505 opt: 763 Z-score: 812.0 bits: 158.8 E(32554): 6.6e-39
Smith-Waterman score: 763; 36.1% identity (71.2% similar) in 299 aa overlap (24-318:42-340)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNEPLDYLANASDFPDYAAAFGNCTDENIPLKMHYLPVIYGIIFLVGFPGNAV
:. . ....:::..: ..:..:: ::.:
CCDS31 GTDAAFLAGPGSSWGNSTVASTAAVSSSFKCALTKTGFQFYYLPAVYILVFIIGFLGNSV
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 VISTYIFKMRPWKSSTIIMLNLACTDLLYLTSLPFLIHYYASGENWIFGDFMCKFIRFSF
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CCDS31 AIWMFVFHMKPWSGISVYMFNLALADFLYVLTLPALIFYYFNKTDWIFGDAMCKLQRFIF
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 HFNLYSSILFLTCFSIFRYCVIIHPMSCFSIHKTRCAVVACAVVWIISLVAVIPMTFLIT
: :::.:::::::.: :: ...:.. .. : . :. ..::.: .::. :. :
CCDS31 HVNLYGSILFLTCISAHRYSGVVYPLKSLGRLKKKNAICISVLVWLIVVVAISPILFYSG
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 STNRTNRS-ACLDLTSSDELNTIKWYNLILTATTFCLPLVIVTLCYTTIIHTLTHGLQTD
. : :.. .: : ::.. : . :.. :.. ::.:::.. :: :...: . .
CCDS31 TGVRKNKTITCYDTTSDEYLRSYFIYSMCTTVAMFCVPLVLILGCYGLIVRALIYKDLDN
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280
pF1KB7 SCLKQKARRLTILLLLAFYVCFLPFHILRVIRIESRL---LSISCSIENQIHEAYIVSRP
: :..:. :.:..: .: : ..:::..... ...:: :....... .: :.:
CCDS31 SPLRRKSIYLVIIVLTVFAVSYIPFHVMKTMNLRARLDFQTPAMCAFNDRVYATYQVTRG
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330
pF1KB7 LAALNTFGNLLLYVVVSDNFQQAVCSTVRCKVSGNLEQAKKISYSNNP
::.::. . .:: ...:.:.. . ..:
CCDS31 LASLNSCVDPILYFLAGDTFRRRLSRATRKASRRSEANLQSKSEDMTLNILPEFKQNGDT
320 330 340 350 360 370
>>CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX (365 aa)
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Smith-Waterman score: 694; 34.9% identity (66.8% similar) in 292 aa overlap (23-311:26-315)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNEPLDYLANASDFPDYAAAFGNC-TDENIPLKMHYLPVIYGIIFLVGFPGNAVVIS
.: ::. .:. ::: :...:..:. :: ..
CCDS14 MASTESSLLRSLGLSPGPGSSEVELDCWFDED--FKFILLPVSYAVVFVLGLGLNAPTLW
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 TYIFKMRPWKSSTIIMLNLACTDLLYLTSLPFLIHYYASGENWIFGDFMCKFIRFSFHFN
.::..::: ... :..:: .: ::. ::: ::.:::. ..: :: .:::.:: :..:
CCDS14 LFIFRLRPWDATATYMFHLALSDTLYVLSLPTLIYYYAAHNHWPFGTEICKFVRFLFYWN
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120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LYSSILFLTCFSIFRYCVIIHPMSCFSIHKTRCAVVACAVVWIISLVAVIPMTFLITSTN
:: :.:::::.:. :: : ::. . . : : . : .::.. ..: :..:..:
CCDS14 LYCSVLFLTCISVHRYLGICHPLRALRWGRPRLAGLLCLAVWLVVAGCLVPNLFFVTTSN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 RTNRSACLDLTSSDELNTIKWYNLILTATTFCLPLVIVTLCYTTIIHTLTHGL--QTDSC
. . : : : .:.. .. . . : .: ... .:: . . : . : ...:
CCDS14 KGTTVLCHDTTRPEEFDHYVHFSSAVMGLLFGVPCLVTLVCYGLMARRLYQPLPGSAQSS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 LKQKARRLTILLLLAFYVCFLPFHILRVIRIESRLLSISCSIENQIHEAYIVSRPLAALN
. .. : ..: .: :::.:::: :.: .::: .: . : .. .: :.::::. :
CCDS14 SRLRSLRTIAVVLTVFAVCFVPFHITRTIYYLARLLEADCRVLNIVNVVYKVTRPLASAN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KB7 TFGNLLLYVVVSDNFQQAVCSTVRCKVSGNLEQAKKISYSNNP
. . .::....:....
CCDS14 SCLDPVLYLLTGDKYRRQLRQLCGGGKPQPRTAASSLALVSLPEDSSCRWAATPQDSSCS
300 310 320 330 340 350
>>CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 (346 aa)
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Smith-Waterman score: 641; 34.6% identity (67.9% similar) in 315 aa overlap (23-329:30-329)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNEPLDYLANASDFPDYAAAFGNCTDENIPLKMHYLPVIYGIIFLVGFPGNAV
::: :: .: ...:..: :::. : ::.
CCDS94 MERKFMSLQPSISVSEMEPNGTFSNNNSRNCTIEN--FKREFFPIVYLIIFFWGVLGNG-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 VISTYIFKMRPWKSST---IIMLNLACTDLLYLTSLPFLIHYYASGENWIFGDFMCKFIR
.: :.: ..:.:.:: ..::::: .:::....::: :: : ::::::. :...
CCDS94 -LSIYVF-LQPYKKSTSVNVFMLNLAISDLLFISTLPFRADYYLRGSNWIFGDLACRIMS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 FSFHFNLYSSILFLTCFSIFRYCVIIHPMSCFSIHKTRCAVVACAVVWIISLVAVIPMTF
.:.. :.:::: ::: .:. :. ...::. . . . : : . :...::. ... : .
CCDS94 YSLYVNMYSSIYFLTVLSVVRFLAMVHPFRLLHVTSIRSAWILCGIIWILIMASSI---M
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB7 LITSTNRTNRS--ACLDLTSSDELNTIKWYNLILTATTFCLPLVIVTLCYTTIIHTLTHG
:. : .. : : .::.:. .. .. .: : .. ::. ...:: ::..: .
CCDS94 LLDSGSEQNGSVTSCLELNLY-KIAKLQTMNYIALVVGCLLPFFTLSICYLLIIRVLLKV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 LQTDSCLK---QKARRLTILLLLAFYVCFLPFHILRVIRIESRLLSISCSIENQIHEAYI
.: :. .:: :. :. :..::::.: ::.... . ... : ....:.: .
CCDS94 EVPESGLRVSHRKALTTIIITLIIFFLCFLPYHTLRTVHLTTWKVGL-C--KDRLHKALV
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KB7 VSRPLAALNTFGNLLLYVVVSDNFQQAVCSTVRCKVSGNLEQAKKISYSNNP
.. ::: :. : ::: ...::.. . :..: .:. ..::
CCDS94 ITLALAAANACFNPLLYYFAGENFKDRLKSALR---KGHPQKAKTKCVFPVSVWLRKETR
290 300 310 320 330 340
CCDS94 V
>>CCDS3162.1 SUCNR1 gene_id:56670|Hs108|chr3 (334 aa)
initn: 541 init1: 276 opt: 638 Z-score: 681.8 bits: 134.5 E(32554): 1.2e-31
Smith-Waterman score: 638; 36.9% identity (66.6% similar) in 293 aa overlap (31-318:21-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MNEPLDYLANASDFPDYAAAFGNCTDENIPLKMHYLPVIYGIIFLVGFPGNAVVISTYIF
:. .:: ..::: :.:: ::..:. :::
CCDS31 MLGIMAWNATCKNWLAAEAALEKYYLSIFYGIEFVVGVLGNTIVVYGYIF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KMRPWKSSTIIMLNLACTDLLYLTSLPFLIHYYASGENWIFGDFMCKFIRFSFHFNLYSS
... :.::.: ..::. .:: .: .::.::. ::.: :::.:: .: :. .: :::.:
CCDS31 SLKNWNSSNIYLFNLSVSDLAFLCTLPMLIRSYANG-NWIYGDVLCISNRYVLHANLYTS
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 ILFLTCFSIFRYCVIIHPMSCFSIHKTRCAVVACAVVWIISLVAVIPMTFLITSTNRTNR
::::: .:: :: .: .:. ..: . :.. ..:.. . ..:. ::. . :
CCDS31 ILFLTFISIDRYLIIKYPFREHLLQKKEFAILISLAIWVLVTLELLPILPLINPVITDNG
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KB7 SACLDLTSSDELNTIKWYNLILTATTFCLPLVIVTLCYTTIIHTLTH-GLQTDSCLK-QK
..: :..:: . : :.. :: : .:: .. . : : : . . :. . : .:
CCDS31 TTCNDFASSGDPNYNLIYSMCLTLLGFLIPLFVMCFFYYKIALFLKQRNRQVATALPLEK
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 ARRLTILLLLAFYVCFLPFHILRVIRIESRLLS---ISCSIENQIHEAYIVSRPLAALNT
:.:. .. : : : :.:..: .:: ::: : .:. . :. :::.:::: ::.
CCDS31 PLNLVIMAVVIFSVLFTPYHVMRNVRIASRLGSWKQYQCT-QVVINSFYIVTRPLAFLNS
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330
pF1KB7 FGNLLLYVVVSDNFQQAVCSTVRCKVSGNLEQAKKISYSNNP
: ..: ...:.:.. . . .:
CCDS31 VINPVFYFLLGDHFRDMLMNQLRHNFKSLTSFSRWAHELLLSFREK
290 300 310 320 330
>>CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 (377 aa)
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Smith-Waterman score: 637; 34.1% identity (67.0% similar) in 279 aa overlap (28-302:28-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MNEPLDYLANASDFPDYAAAFGNCTDENIPLKMHYLPVIYGIIFLVGFPGNAVVISTYIF
: .:. ::: ::.. . :. :::.. ..
CCDS82 MAADLGPWNDTINGTWDGDELGYRCRFNEDFKYVLLPVSYGVVCVPGLCLNAVALYIFLC
10 20 30 40 50 60
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CCDS21 SLNGALDPIMYFFVAEKFRHALCNLL-CGKRLKGPPPSFEGKTNESSLSAKSEL
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CCDS27 NFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYSKMVCFTIWVLAAALCIPEILYSQ
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>>CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 (369 aa)
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CCDS27 LCIPEILYSQIKEESGIAICTMVYPSDESTKLKSAVLTLKVILGFFLPFVVMACCYTIII
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CCDS27 HTL---IQAKKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFISNCAVSTNI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]