Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7137
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7137, 328 aa
1>>>pF1KB7137 328 - 328 aa - 328 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5154+/-0.00121; mu= 14.3814+/- 0.071
mean_var=137.7266+/-46.888, 0's: 0 Z-trim(102.7): 411 B-trim: 835 in 2/46
Lambda= 0.109286
statistics sampled from 6527 (7071) to 6527 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.574), E-opt: 0.2 (0.217), width: 16
Scan time: 1.870
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31188.1 OR13A1 gene_id:79290|Hs108|chr10 ( 328) 2162 353.3 1.5e-97
CCDS31094.1 OR13G1 gene_id:441933|Hs108|chr1 ( 307) 1122 189.3 3.4e-48
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 973 165.8 4.1e-41
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 938 160.3 1.8e-39
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 914 156.5 2.5e-38
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 914 156.5 2.6e-38
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 910 155.9 3.9e-38
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 906 155.3 6.2e-38
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 902 154.7 9.6e-38
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 900 154.3 1.2e-37
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 899 154.2 1.3e-37
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 897 153.8 1.6e-37
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 895 153.5 2e-37
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 895 153.6 2.1e-37
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 892 153.1 2.9e-37
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 885 152.0 6.1e-37
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 884 151.8 6.7e-37
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 884 151.8 6.7e-37
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 884 151.8 6.9e-37
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 883 151.6 7.5e-37
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 879 151.0 1.2e-36
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 876 150.5 1.6e-36
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 875 150.4 1.8e-36
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 874 150.2 2e-36
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 873 150.1 2.3e-36
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 870 149.6 3.1e-36
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 869 149.4 3.5e-36
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 868 149.3 3.9e-36
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 867 149.1 4.3e-36
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 866 149.0 5.1e-36
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 866 149.1 5.3e-36
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 865 148.8 5.4e-36
CCDS11025.1 OR3A3 gene_id:8392|Hs108|chr17 ( 321) 864 148.7 6.1e-36
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 863 148.5 6.6e-36
CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 863 148.5 6.7e-36
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 862 148.3 7.4e-36
CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 ( 316) 861 148.2 8.4e-36
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 859 147.9 1e-35
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 856 147.4 1.5e-35
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 855 147.2 1.6e-35
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 853 146.9 2e-35
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 852 146.8 2.3e-35
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 851 146.6 2.5e-35
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 851 146.6 2.5e-35
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 850 146.4 2.8e-35
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 850 146.4 2.8e-35
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 850 146.5 2.9e-35
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 848 146.1 3.4e-35
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 847 146.0 3.8e-35
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 845 145.6 4.8e-35
>>CCDS31188.1 OR13A1 gene_id:79290|Hs108|chr10 (328 aa)
initn: 2162 init1: 2162 opt: 2162 Z-score: 1864.7 bits: 353.3 E(32554): 1.5e-97
Smith-Waterman score: 2162; 100.0% identity (100.0% similar) in 328 aa overlap (1-328:1-328)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKLWMESHLIVPETRPSPRMMSNQTLVTEFILQGFSEHPEYRVFLFSCFLFLYSGALTGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MKLWMESHLIVPETRPSPRMMSNQTLVTEFILQGFSEHPEYRVFLFSCFLFLYSGALTGN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 VLITLAITFNPGLHAPMYFFLLNLATMDIICTSSIMPKALASLVSEESSISYGGCMAQLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VLITLAITFNPGLHAPMYFFLLNLATMDIICTSSIMPKALASLVSEESSISYGGCMAQLY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FLTWAASSELLLLTVMAYDRYAAICHPLHYSSMMSKVFCSGLATAVWLLCAVNTAIHTGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FLTWAASSELLLLTVMAYDRYAAICHPLHYSSMMSKVFCSGLATAVWLLCAVNTAIHTGL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 MLRLDFCGPNVIIHFFCEVPPLLLLSCSSTYVNGVMIVLADAFYGIVNFLMTIASYGFIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MLRLDFCGPNVIIHFFCEVPPLLLLSCSSTYVNGVMIVLADAFYGIVNFLMTIASYGFIV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SSILKVKTAWGRQKAFSTCSSHLTVVCMYYTAVFYAYISPVSGYSAGKSKLAGLLYTVLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SSILKVKTAWGRQKAFSTCSSHLTVVCMYYTAVFYAYISPVSGYSAGKSKLAGLLYTVLS
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KB7 PTLNPLIYTLRNKEVKAALRKLFPFFRN
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PTLNPLIYTLRNKEVKAALRKLFPFFRN
310 320
>>CCDS31094.1 OR13G1 gene_id:441933|Hs108|chr1 (307 aa)
initn: 1173 init1: 1111 opt: 1122 Z-score: 978.8 bits: 189.3 E(32554): 3.4e-48
Smith-Waterman score: 1122; 50.0% identity (84.3% similar) in 306 aa overlap (23-328:2-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKLWMESHLIVPETRPSPRMMSNQTLVTEFILQGFSEHPEYRVFLFSCFLFLYSGALTGN
:...:::::. :....:: . ..: ::..: :. ::
CCDS31 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGN
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 VLITLAITFNPGLHAPMYFFLLNLATMDIICTSSIMPKALASLVSEESSISYGGCMAQLY
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CCDS31 MLIIIAKIYNNTLHTPMYVFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLF
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FLTWAASSELLLLTVMAYDRYAAICHPLHYSSMMSKVFCSGLATAVWLLCAVNTAIHTGL
..::. ..:..:.:.::::::.::: :::::..:.. .: .: . : . ..:. .::.:
CCDS31 LFTWSLGAEMVLFTTMAYDRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTAL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 MLRLDFCGPNVIIHFFCEVPPLLLLSCSSTYVNGVMIVLADAFYGIVNFLMTIASYGFIV
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CCDS31 IMRLTFCGPNTIDHFFCEIPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFII
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SSILKVKTAWGRQKAFSTCSSHLTVVCMYYTAVFYAYISPVSGYSAGKSKLAGLLYTVLS
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CCDS31 VAILRIRTVEGKRKAFSTCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVT
220 230 240 250 260 270
310 320
pF1KB7 PTLNPLIYTLRNKEVKAALRKLFPFFRN
:::::..:...:.:..:..::.: :...
CCDS31 PTLNPMVYSFQNREMQAGIRKVFAFLKH
280 290 300
>>CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 (321 aa)
initn: 995 init1: 973 opt: 973 Z-score: 851.6 bits: 165.8 E(32554): 4.1e-41
Smith-Waterman score: 973; 47.0% identity (78.7% similar) in 300 aa overlap (23-322:5-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKLWMESHLIVPETRPSPRMMSNQTLVTEFILQGFSEHPEYRVFLFSCFLFLYSGALTGN
::: .::::. :::. : . .::. :.. : .: ::
CCDS46 MERKNQTAITEFIILGFSNLNELQFLLFTIFFLTYFCTLGGN
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70 80 90 100 110 120
pF1KB7 VLITLAITFNPGLHAPMYFFLLNLATMDIICTSSIMPKALASLVSEESSISYGGCMAQLY
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CCDS46 ILIILTTVTDPHLHTPMYYFLGNLAFIDICYTTSNVPQMMVHLLSKKKSISYVGCVVQLF
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130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FLTWAASSELLLLTVMAYDRYAAICHPLHYSSMMSKVFCSGLATAVWLLCAVNTAIHTGL
... ..:: :::..:::::: :::.::.:: ..:::.:. ::.. : .:...:: :
CCDS46 AFVFFVGSECLLLAAMAYDRYIAICNPLRYSVILSKVLCNQLAASCWAAGFLNSVVHTVL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 MLRLDFCGPNVIIHFFCEVPPLLLLSCSSTYVNGVMIVLADAFYGIVNFLMTIASYGFIV
. : ::: : : .:::..::::.:::..: :: . .. . .: : . :: . :: :.
CCDS46 TFCLPFCGNNQINYFFCDIPPLLILSCGNTSVNELALLSTGVFIGWTPFLCIVLSYICII
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SSILKVKTAWGRQKAFSTCSSHLTVVCMYYTAVFYAYISPVSGYSAGKSKLAGLLYTVLS
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CCDS46 STILRIQSSEGRRKAFSTCASHLAIVFLFYGSAIFTYVRPISTYSLKKDRLVSVLYSVVT
230 240 250 260 270 280
310 320
pF1KB7 PTLNPLIYTLRNKEVKAALRKLFPFFRN
: :::.:::::::..: :.. .
CCDS46 PMLNPIIYTLRNKDIKEAVKTIGSKWQPPISSLDSKLTY
290 300 310 320
>>CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 (312 aa)
initn: 961 init1: 936 opt: 938 Z-score: 821.9 bits: 160.3 E(32554): 1.8e-39
Smith-Waterman score: 938; 45.2% identity (79.1% similar) in 301 aa overlap (22-322:4-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKLWMESHLIVPETRPSPRMMSNQTLVTEFILQGFSEHPEYRVFLFSCFLFLYSGALTGN
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CCDS10 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 VLITLAITFNPGLHAPMYFFLLNLATMDIICTSSIMPKALASLVSEESSISYGGCMAQLY
.:: :..... ::.:::::: ::. .:: . . .:: ::. . : ..::. ::..:.:
CCDS10 LLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMY
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FLTWAASSELLLLTVMAYDRYAAICHPLHYSSMMSKVFCSGLATAVWLLCAVNTAIHTGL
:. .. . .::.:::::...:.::::::.. :.. .:. :....:.. .:. .:: :
CCDS10 FVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 MLRLDFCGPNVIIHFFCEVPPLLLLSCSSTYVNGVMIVLADAFYGIVNFLMTIASYGFIV
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CCDS10 MAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHIT
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SSILKVKTAWGRQKAFSTCSSHLTVVCMYYTAVFYAYISPVSGYSAGKSKLAGLLYTVLS
..::: .. :: ::::::.:::.:: ..:.... .:..:.:..:: :. .: .::::..
CCDS10 CTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVT
230 240 250 260 270 280
310 320
pF1KB7 PTLNPLIYTLRNKEVKAALRKLFPFFRN
: :::.::.:::. .:.::.:.
CCDS10 PMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
290 300 310
>>CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 (309 aa)
initn: 901 init1: 901 opt: 914 Z-score: 801.5 bits: 156.5 E(32554): 2.5e-38
Smith-Waterman score: 914; 43.9% identity (76.6% similar) in 303 aa overlap (21-323:3-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKLWMESHLIVPETRPSPRMMSNQTLVTEFILQGFSEHPEYRVFLFSCFLFLYSGALTGN
..:.. . .::: :::.::. .. :: ::.: .:.::
CCDS31 MGLGNESSLMDFILLGFSDHPRLEAVLFVFVLFFYLLTLVGN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 VLITLAITFNPGLHAPMYFFLLNLATMDIICTSSIMPKALASLVSEESSISYGGCMAQLY
: . ..: ::.:::::: ::. .:: :.:. :..:..: ...:.::::.::::
CCDS31 FTIIIISYLDPPLHTPMYFFLSNLSLLDICFTTSLAPQTLVNLQRPKKTITYGGCVAQLY
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FLTWAASSELLLLTVMAYDRYAAICHPLHYSSMMSKVFCSGLATAVWLLCAVNTAIHTGL
. .:.: .::. :: ::: :.:.:::: .:. .:. ::. :: ... ::. .
CCDS31 ISLALGSTECILLADMALDRYIAVCKPLHYVVIMNPRLCQQLASISWLSGLASSLIHATF
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 MLRLDFCGPNVIIHFFCEVPPLLLLSCSSTYVNGVMIVLADAFYGIVNFLMTIASYGFIV
:.: .:: . . ::.:::: :: :.: .: :: ... ...... .. . :::::.
CCDS31 TLQLPLCGNHRLDHFICEVPALLKLACVDTTVNELVLFVVSVLFVVIPPALISISYGFIT
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SSILKVKTAWGRQKAFSTCSSHLTVVCMYYTAVFYAYISPVSGYSAGKSKLAGLLYTVLS
...:..:.. .:.::::::::::::: ..: ...:.:..: ..:. ..:. .:.::...
CCDS31 QAVLRIKSVEARHKAFSTCSSHLTVVIIFYGTIIYVYLQPSDSYAQDQGKFISLFYTMVT
230 240 250 260 270 280
310 320
pF1KB7 PTLNPLIYTLRNKEVKAALRKLFPFFRN
:::::.:::::::..: :::::.
CCDS31 PTLNPIIYTLRNKDMKEALRKLLSGKL
290 300
>>CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 (316 aa)
initn: 950 init1: 900 opt: 914 Z-score: 801.4 bits: 156.5 E(32554): 2.6e-38
Smith-Waterman score: 914; 44.2% identity (77.7% similar) in 301 aa overlap (22-322:4-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKLWMESHLIVPETRPSPRMMSNQTLVTEFILQGFSEHPEYRVFLFSCFLFLYSGALTGN
.:.. :.: :::..:. . :::. .:..: .: ::
CCDS31 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGN
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