Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7134
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7134, 320 aa
1>>>pF1KB7134 320 - 320 aa - 320 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7270+/-0.00134; mu= 13.0739+/- 0.078
mean_var=176.7240+/-63.643, 0's: 0 Z-trim(100.0): 390 B-trim: 646 in 2/47
Lambda= 0.096478
statistics sampled from 5426 (5935) to 5426 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.522), E-opt: 0.2 (0.182), width: 16
Scan time: 2.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 2093 304.8 5.7e-83
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 1277 191.3 8.9e-49
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 1216 182.8 3.2e-46
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 1209 181.8 6.2e-46
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 1111 168.1 7.9e-42
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1101 166.7 2.1e-41
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 1086 164.7 8.9e-41
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 1071 162.6 3.8e-40
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 1068 162.2 5.1e-40
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 1061 161.2 1e-39
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 1058 160.8 1.3e-39
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 1057 160.6 1.5e-39
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 1040 158.3 7.7e-39
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 1039 158.1 8.2e-39
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 1036 157.7 1.1e-38
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 1035 157.6 1.2e-38
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 1022 155.7 4.2e-38
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 1021 155.6 4.7e-38
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 1020 155.5 5.2e-38
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 1009 154.0 1.5e-37
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 1007 153.7 1.8e-37
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 1006 153.5 2e-37
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 998 152.4 4.4e-37
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 993 151.7 7e-37
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 989 151.2 1e-36
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 982 150.2 2e-36
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 973 148.9 4.8e-36
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 973 149.0 4.9e-36
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 970 148.5 6.5e-36
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 967 148.2 9.2e-36
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 966 148.0 9.4e-36
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 962 147.4 1.4e-35
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 949 145.6 5e-35
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 947 145.3 6e-35
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 923 142.0 6e-34
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 900 138.8 5.7e-33
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 896 138.3 8.6e-33
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 887 137.0 2e-32
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 860 133.2 2.6e-31
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 823 128.0 9.2e-30
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 775 121.4 9.7e-28
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 758 119.0 5e-27
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 742 116.8 2.3e-26
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 742 116.9 2.5e-26
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 720 113.7 1.9e-25
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 690 109.5 3.5e-24
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 682 108.4 7.6e-24
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 648 103.7 2e-22
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 602 97.3 1.7e-20
CCDS30903.2 OR6K3 gene_id:391114|Hs108|chr1 ( 315) 602 97.3 1.7e-20
>>CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 (320 aa)
initn: 2093 init1: 2093 opt: 2093 Z-score: 1603.0 bits: 304.8 E(32554): 5.7e-83
Smith-Waterman score: 2093; 100.0% identity (100.0% similar) in 320 aa overlap (1-320:1-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSSCNFTHATFVLIGIPGLEKAHFWVGFPLLSMYVVAMFGNCIVVFIVRTERSLHAPMYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MSSCNFTHATFVLIGIPGLEKAHFWVGFPLLSMYVVAMFGNCIVVFIVRTERSLHAPMYL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FLCMLAAIDLALSTSTMPKILALFWFDSREISFEACLTQMFFIHALSAIESTILLAMAFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FLCMLAAIDLALSTSTMPKILALFWFDSREISFEACLTQMFFIHALSAIESTILLAMAFD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RYVAICHPLRHAAVLNNTVTAQIGIVAVVRGSLFFFPLPLLIKRLAFCHSNVLSHSYCVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RYVAICHPLRHAAVLNNTVTAQIGIVAVVRGSLFFFPLPLLIKRLAFCHSNVLSHSYCVH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QDVMKLAYADTLPNVVYGLTAILLVMGVDVMFISLSYFLIIRTVLQLPSKSERAKAFGTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QDVMKLAYADTLPNVVYGLTAILLVMGVDVMFISLSYFLIIRTVLQLPSKSERAKAFGTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VSHIGVVLAFYVPLIGLSVVHRFGNSLHPIVRVVMGDIYLLLPPVINPIIYGAKTKQIRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VSHIGVVLAFYVPLIGLSVVHRFGNSLHPIVRVVMGDIYLLLPPVINPIIYGAKTKQIRT
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KB7 RVLAMFKISCDKDLQAVGGK
::::::::::::::::::::
CCDS77 RVLAMFKISCDKDLQAVGGK
310 320
>>CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 1258 init1: 954 opt: 1277 Z-score: 989.2 bits: 191.3 E(32554): 8.9e-49
Smith-Waterman score: 1277; 59.8% identity (86.9% similar) in 306 aa overlap (5-309:8-312)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MSSCNFTHAT-FVLIGIPGLEKAHFWVGFPLLSMYVVAMFGNCIVVFIVRTERSLHA
: . :: :.:::.::::.:.::..::: :.:..:..:: ...:::::.:::
CCDS31 MMVDPNGNESSATYFILIGLPGLEEAQFWLAFPLCSLYLIAVLGNLTIIYIVRTEHSLHE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 PMYLFLCMLAAIDLALSTSTMPKILALFWFDSREISFEACLTQMFFIHALSAIESTILLA
:::.:::::..::. .:::.:::.::.:::.: :.:.::: ::: ::.::..:::.:::
CCDS31 PMYIFLCMLSGIDILISTSSMPKMLAIFWFNSTTIQFDACLLQMFAIHSLSGMESTVLLA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 MAFDRYVAICHPLRHAAVLNNTVTAQIGIVAVVRGSLFFFPLPLLIKRLAFCHSNVLSHS
::::::::::::::::.::. ...::..:::::. .. :::..::.: ::.::.::::
CCDS31 MAFDRYVAICHPLRHATVLTLPRVTKIGVAAVVRGAALMAPLPVFIKQLPFCRSNILSHS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 YCVHQDVMKLAYADTLPNVVYGLTAILLVMGVDVMFISLSYFLIIRTVLQLPSKSERAKA
::.:::::::: : :::::: .:. ..:.: ..::.::.::..::: : .. .:::
CCDS31 YCLHQDVMKLACDDIRVNVVYGLIVIISAIGLDSLLISFSYLLILKTVLGL-TREAQAKA
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 FGTCVSHIGVVLAFYVPLIGLSVVHRFGNSLHPIVRVVMGDIYLLLPPVINPIIYGAKTK
:::::::. .:. ::::.::::.::::.. . :....::::.:::.:::.::.:::
CCDS31 FGTCVSHVCAVFIFYVPFIGLSMVHRFSKRRDSPLPVILANIYLLVPPVLNPIVYGVKTK
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KB7 QIRTRVLAMFKISCDKDLQAVGGK
.:: :.: .:...
CCDS31 EIRQRILRLFHVATHASEP
300 310
>>CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 1207 init1: 1008 opt: 1216 Z-score: 943.2 bits: 182.8 E(32554): 3.2e-46
Smith-Waterman score: 1216; 58.6% identity (85.0% similar) in 307 aa overlap (2-306:14-319)
10 20 30 40
pF1KB7 MSSCNFTHAT-FVLIGIPGL-EKAHFWVGFPLLSMYVVAMFGNCIVVF
:. :..::. :.:.::::: :::..::: ::..: .:: .:.
CCDS31 MQKPQLLVPIIATSNGNLVHAAYFLLVGIPGLGPTIHFWLAFPLCFMYALATLGNLTIVL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 IVRTERSLHAPMYLFLCMLAAIDLALSTSTMPKILALFWFDSREISFEACLTQMFFIHAL
:.:.:: :: :::::: ::..:::.::. ::::. .:: . .:: :. ::.:::.::::
CCDS31 IIRVERRLHEPMYLFLAMLSTIDLVLSSITMPKMASLFLMGIQEIEFNICLAQMFLIHAL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 SAIESTILLAMAFDRYVAICHPLRHAAVLNNTVTAQIGIVAVVRGSLFFFPLPLLIKRLA
::.::..::::::::.::::::::::.::.. ..:.::. :..:: .::::::...: :.
CCDS31 SAVESAVLLAMAFDRFVAICHPLRHASVLTGCTVAKIGLSALTRGFVFFFPLPFILKWLS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 FCHSNVLSHSYCVHQDVMKLAYADTLPNVVYGLTAILLVMGVDVMFISLSYFLIIRTVLQ
.:......::.:.:::.:::. .:: :::::: :: ::::: .::..::.::. .::.
CCDS31 YCQTHTVTHSFCLHQDIMKLSCTDTRVNVVYGLFIILSVMGVDSLFIGFSYILILWAVLE
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 LPSKSERAKAFGTCVSHIGVVLAFYVPLIGLSVVHRFGNSLHPIVRVVMGDIYLLLPPVI
: :. :::.::.::. .::.:::::::::::::.:. ...:::.. :::::::.
CCDS31 LSSRRAALKAFNTCISHLCAVLVFYVPLIGLSVVHRLGGPTS-LLHVVMANTYLLLPPVV
250 260 270 280 290
290 300 310 320
pF1KB7 NPIIYGAKTKQIRTRVLAMFKISCDKDLQAVGGK
::..::::::.: .::: ::
CCDS31 NPLVYGAKTKEICSRVLCMFSQGGK
300 310 320
>>CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1229 init1: 1207 opt: 1209 Z-score: 938.1 bits: 181.8 E(32554): 6.2e-46
Smith-Waterman score: 1209; 56.4% identity (83.9% similar) in 305 aa overlap (2-306:8-312)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MSSCNFTHATFVLIGIPGLEKAHFWVGFPLLSMYVVAMFGNCIVVFIVRTERSL
.: . . :::.: ::::::. :.:...:: ::.:.. ::: ..::..:::::
CCDS31 MTLGSLGNSSSSVSATFLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILFIIKTERSL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 HAPMYLFLCMLAAIDLALSTSTMPKILALFWFDSREISFEACLTQMFFIHALSAIESTIL
: :::::: ::: :::.:: :.: .:..:: .:::: .::..:.:::: .: .::..:
CCDS31 HEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDACFAQLFFIHCFSFLESSVL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LAMAFDRYVAICHPLRHAAVLNNTVTAQIGIVAVVRGSLFFFPLPLLIKRLAFCHSNVLS
:.:::::.:::::::.....:.::: ..::.:.. :. ..::::...::. .: : :::
CCDS31 LSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRFPYCGSPVLS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 HSYCVHQDVMKLAYADTLPNVVYGLTAILLVMGVDVMFISLSYFLIIRTVLQLPSKSERA
::::.::.::::: :: : .::. .:. ..:.: ..: .:: ::.::::.. :..::
CCDS31 HSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVLSIASRAERF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 KAFGTCVSHIGVVLAFYVPLIGLSVVHRFGNSLHPIVRVVMGDIYLLLPPVINPIIYGAK
::..:::::: .:: ::.:.:::::.::::.. .:.:::: .:::.:::.:::.:..:
CCDS31 KALNTCVSHICAVLLFYTPMIGLSVIHRFGKQAPHLVQVVMGFMYLLFPPVMNPIVYSVK
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KB7 TKQIRTRVLAMFKISCDKDLQAVGGK
::::: :: :
CCDS31 TKQIRDRVTHAFCY
310
>>CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1100 init1: 1100 opt: 1111 Z-score: 864.4 bits: 168.1 E(32554): 7.9e-42
Smith-Waterman score: 1111; 54.4% identity (80.5% similar) in 307 aa overlap (1-306:1-307)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MSSCNFTH-ATFVLIGIPGLEKAHFWVGFPLLSMYVVAMFGNCIVVFIVRTERSLHAPMY
:. : :: : :.: ::::::..: :.. :: ::.::. :: ... ::.: ::: :::
CCDS31 MGLFNVTHPAFFLLTGIPGLESSHSWLSGPLCVMYAVALGGNTVILQAVRVEPSLHEPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LFLCMLAAIDLALSTSTMPKILALFWFDSREISFEACLTQMFFIHALSAIESTILLAMAF
:: ::. :.:.: .:.: .: : ...:.:.:.::: :::.:: .: .:: :::::.:
CCDS31 YFLSMLSFSDVAISMATLPTVLRTFCLNARNITFDACLIQMFLIHFFSMMESGILLAMSF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 DRYVAICHPLRHAAVLNNTVTAQIGIVAVVRGSLFFFPLPLLIKRLAFCHSNVLSHSYCV
::::::: :::.:.::.. : : .:. :..:. . .::::.::::: .:.:::::::::.
CCDS31 DRYVAICDPLRYATVLTTEVIAAMGLGAAARSFITLFPLPFLIKRLPICRSNVLSHSYCL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 HQDVMKLAYADTLPNVVYGLTAILLVMGVDVMFISLSYFLIIRTVLQLPSKSERAKAFGT
: :.:.:: :: : .::: ... ..:.:..:: ::: ::.:.:. :. :: ::..:
CCDS31 HPDMMRLACADISINSIYGLFVLVSTFGMDLFFIFLSYVLILRSVMATASREERLKALNT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 CVSHIGVVLAFYVPLIGLSVVHRFGNSLHPIVRVVMGDIYLLLPPVINPIIYGAKTKQIR
::::: .:::::::.::.:.:::::. . ..:.:...::..:::.::.::.::::.::
CCDS31 CVSHILAVLAFYVPMIGVSTVHRFGKHVPCYIHVLMSNVYLFVPPVLNPLIYSAKTKEIR
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KB7 TRVLAMFKISCDKDLQAVGGK
.. ::
CCDS31 RAIFRMFHHIKI
310
>>CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1074 init1: 1074 opt: 1101 Z-score: 856.9 bits: 166.7 E(32554): 2.1e-41
Smith-Waterman score: 1101; 49.8% identity (84.4% similar) in 307 aa overlap (2-307:4-310)
10 20 30 40 50
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