FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7133, 319 aa
1>>>pF1KB7133 319 - 319 aa - 319 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4686+/-0.000319; mu= 6.8197+/- 0.020
mean_var=139.3365+/-27.752, 0's: 0 Z-trim(120.3): 128 B-trim: 0 in 0/60
Lambda= 0.108653
statistics sampled from 35320 (35448) to 35320 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.766), E-opt: 0.2 (0.416), width: 16
Scan time: 8.170
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002355 (OMIM: 300098) melanoma-associated antig ( 319) 2080 337.0 3.2e-92
XP_011543814 (OMIM: 300098) PREDICTED: melanoma-as ( 319) 2080 337.0 3.2e-92
NP_002354 (OMIM: 300097) melanoma-associated antig ( 347) 1373 226.2 7.8e-59
NP_796379 (OMIM: 300097) melanoma-associated antig ( 347) 1373 226.2 7.8e-59
NP_803134 (OMIM: 300097) melanoma-associated antig ( 347) 1373 226.2 7.8e-59
NP_002358 (OMIM: 300153) melanoma-associated antig ( 346) 1311 216.4 6.6e-56
XP_011543869 (OMIM: 300763) PREDICTED: melanoma-as ( 336) 1060 177.1 4.5e-44
NP_001264236 (OMIM: 300763) melanoma-associated an ( 336) 1060 177.1 4.5e-44
XP_011543815 (OMIM: 300152) PREDICTED: melanoma-as ( 346) 995 166.9 5.4e-41
XP_011543816 (OMIM: 300152) PREDICTED: melanoma-as ( 346) 995 166.9 5.4e-41
NP_002356 (OMIM: 300152) melanoma-associated antig ( 346) 995 166.9 5.4e-41
NP_872312 (OMIM: 300761) melanoma-associated antig ( 347) 963 161.9 1.7e-39
XP_011543755 (OMIM: 300762) PREDICTED: melanoma-as ( 324) 867 146.8 5.6e-35
NP_001093391 (OMIM: 300762) melanoma-associated an ( 324) 867 146.8 5.6e-35
XP_011543756 (OMIM: 300762) PREDICTED: melanoma-as ( 324) 867 146.8 5.6e-35
XP_016885011 (OMIM: 300344) PREDICTED: melanoma-as ( 394) 809 137.8 3.6e-32
NP_001011544 (OMIM: 300344) melanoma-associated an ( 400) 809 137.8 3.6e-32
XP_011529466 (OMIM: 300344) PREDICTED: melanoma-as ( 421) 809 137.8 3.8e-32
NP_005357 (OMIM: 300344) melanoma-associated antig ( 429) 809 137.8 3.8e-32
XP_016885010 (OMIM: 300344) PREDICTED: melanoma-as ( 429) 809 137.8 3.8e-32
XP_016885009 (OMIM: 300341) PREDICTED: melanoma-as ( 318) 783 133.7 5.1e-31
NP_001159872 (OMIM: 300341) melanoma-associated an ( 318) 783 133.7 5.1e-31
NP_005355 (OMIM: 300341) melanoma-associated antig ( 318) 783 133.7 5.1e-31
NP_001159873 (OMIM: 300341) melanoma-associated an ( 318) 783 133.7 5.1e-31
NP_001238757 (OMIM: 300343) melanoma-associated an ( 369) 784 133.8 5.1e-31
NP_066386 (OMIM: 300343) melanoma-associated antig ( 369) 784 133.8 5.1e-31
NP_001011543 (OMIM: 300343) melanoma-associated an ( 369) 784 133.8 5.1e-31
NP_775794 (OMIM: 300467) melanoma-associated antig ( 407) 780 133.2 8.6e-31
NP_002353 (OMIM: 300175) melanoma-associated antig ( 317) 777 132.7 9.7e-31
NP_001011550 (OMIM: 300175) melanoma-associated an ( 317) 777 132.7 9.7e-31
NP_001011549 (OMIM: 300175) melanoma-associated an ( 317) 777 132.7 9.7e-31
NP_001011548 (OMIM: 300175) melanoma-associated an ( 317) 777 132.7 9.7e-31
XP_005274735 (OMIM: 300175) PREDICTED: melanoma-as ( 317) 777 132.7 9.7e-31
XP_005274736 (OMIM: 300175) PREDICTED: melanoma-as ( 317) 777 132.7 9.7e-31
XP_005274734 (OMIM: 300175) PREDICTED: melanoma-as ( 397) 777 132.8 1.2e-30
NP_001258681 (OMIM: 300466) melanoma-associated an ( 275) 765 130.8 3.2e-30
NP_057333 (OMIM: 300468) melanoma-associated antig ( 373) 739 126.8 6.9e-29
NP_005356 (OMIM: 300342) melanoma-associated antig ( 315) 724 124.4 3.1e-28
NP_001074259 (OMIM: 300764) melanoma-associated an ( 315) 724 124.4 3.1e-28
XP_005278249 (OMIM: 300764) PREDICTED: melanoma-as ( 315) 724 124.4 3.1e-28
XP_005262391 (OMIM: 300342) PREDICTED: melanoma-as ( 315) 724 124.4 3.1e-28
XP_005278250 (OMIM: 300764) PREDICTED: melanoma-as ( 315) 724 124.4 3.1e-28
XP_005262392 (OMIM: 300342) PREDICTED: melanoma-as ( 315) 724 124.4 3.1e-28
NP_004979 (OMIM: 300016) melanoma-associated antig ( 309) 723 124.2 3.3e-28
NP_005354 (OMIM: 300176) melanoma-associated antig ( 314) 684 118.1 2.3e-26
NP_787064 (OMIM: 300176) melanoma-associated antig ( 314) 684 118.1 2.3e-26
XP_011529463 (OMIM: 300174) PREDICTED: melanoma-as ( 314) 673 116.4 7.8e-26
NP_005353 (OMIM: 300174) melanoma-associated antig ( 314) 673 116.4 7.8e-26
XP_006724881 (OMIM: 300174) PREDICTED: melanoma-as ( 314) 673 116.4 7.8e-26
XP_011529462 (OMIM: 300174) PREDICTED: melanoma-as ( 314) 673 116.4 7.8e-26
>>NP_002355 (OMIM: 300098) melanoma-associated antigen B (319 aa)
initn: 2080 init1: 2080 opt: 2080 Z-score: 1776.7 bits: 337.0 E(85289): 3.2e-92
Smith-Waterman score: 2080; 99.7% identity (100.0% similar) in 319 aa overlap (1-319:1-319)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIPQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSGSLVQ
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSGSLVQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGHTYTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGHTYTF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 IDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGEEHSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 IDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGEEHSV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVNGTTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVNGTTP
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 CAFPTHYEEALKDEEKAGV
:::::::::::::::::::
NP_002 CAFPTHYEEALKDEEKAGV
310
>>XP_011543814 (OMIM: 300098) PREDICTED: melanoma-associ (319 aa)
initn: 2080 init1: 2080 opt: 2080 Z-score: 1776.7 bits: 337.0 E(85289): 3.2e-92
Smith-Waterman score: 2080; 99.7% identity (100.0% similar) in 319 aa overlap (1-319:1-319)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIPQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSGSLVQ
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSGSLVQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGHTYTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGHTYTF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 IDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGEEHSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGEEHSV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVNGTTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVNGTTP
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 CAFPTHYEEALKDEEKAGV
:::::::::::::::::::
XP_011 CAFPTHYEEALKDEEKAGV
310
>>NP_002354 (OMIM: 300097) melanoma-associated antigen B (347 aa)
initn: 1264 init1: 1043 opt: 1373 Z-score: 1177.2 bits: 226.2 E(85289): 7.8e-59
Smith-Waterman score: 1373; 65.5% identity (88.0% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIPQ
:::::::::::::::::::.::.::.: ..: ::.:: : :: : : . .:::::::::
NP_002 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPS-SSPVLGDTPTSSPAAGIPQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSGSLVQ
::: :: :..:::: :: :.: .::: :::.::: :::.:::.: .::.. ..: :..
NP_002 KPQGAPPTTTAAAA-VSCTESDEGAKC-QGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMH
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130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGHTYTF
:.: :::... . :..:::.: .....:: :::. ::. : .::::.:.. ::.:::::.
NP_002 FILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTL
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pF1KB7 IDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGEEHSV
..:..::.. .: ..::::: :::::::::::.::::::::::.:.:.::.:::::: .
NP_002 VSKLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLI
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pF1KB7 FGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVNGTTP
.::: :.::.::::::::.:.:::.:::::.::::::::::::.::::::::::.::.::
NP_002 YGEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATP
240 250 260 270 280 290
310
pF1KB7 CAFPTHYEEALKDEEKAGV
::.::::::.:::.
NP_002 RDFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
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>>NP_796379 (OMIM: 300097) melanoma-associated antigen B (347 aa)
initn: 1264 init1: 1043 opt: 1373 Z-score: 1177.2 bits: 226.2 E(85289): 7.8e-59
Smith-Waterman score: 1373; 65.5% identity (88.0% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIPQ
:::::::::::::::::::.::.::.: ..: ::.:: : :: : : . .:::::::::
NP_796 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPS-SSPVLGDTPTSSPAAGIPQ
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pF1KB7 KPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSGSLVQ
::: :: :..:::: :: :.: .::: :::.::: :::.:::.: .::.. ..: :..
NP_796 KPQGAPPTTTAAAA-VSCTESDEGAKC-QGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMH
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pF1KB7 FLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGHTYTF
:.: :::... . :..:::.: .....:: :::. ::. : .::::.:.. ::.:::::.
NP_796 FILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 IDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGEEHSV
..:..::.. .: ..::::: :::::::::::.::::::::::.:.:.::.:::::: .
NP_796 VSKLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLI
180 190 200 210 220 230
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pF1KB7 FGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVNGTTP
.::: :.::.::::::::.:.:::.:::::.::::::::::::.::::::::::.::.::
NP_796 YGEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATP
240 250 260 270 280 290
310
pF1KB7 CAFPTHYEEALKDEEKAGV
::.::::::.:::.
NP_796 RDFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
300 310 320 330 340
>>NP_803134 (OMIM: 300097) melanoma-associated antigen B (347 aa)
initn: 1264 init1: 1043 opt: 1373 Z-score: 1177.2 bits: 226.2 E(85289): 7.8e-59
Smith-Waterman score: 1373; 65.5% identity (88.0% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIPQ
:::::::::::::::::::.::.::.: ..: ::.:: : :: : : . .:::::::::
NP_803 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPS-SSPVLGDTPTSSPAAGIPQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSGSLVQ
::: :: :..:::: :: :.: .::: :::.::: :::.:::.: .::.. ..: :..
NP_803 KPQGAPPTTTAAAA-VSCTESDEGAKC-QGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGHTYTF
:.: :::... . :..:::.: .....:: :::. ::. : .::::.:.. ::.:::::.
NP_803 FILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 IDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGEEHSV
..:..::.. .: ..::::: :::::::::::.::::::::::.:.:.::.:::::: .
NP_803 VSKLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVNGTTP
.::: :.::.::::::::.:.:::.:::::.::::::::::::.::::::::::.::.::
NP_803 YGEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATP
240 250 260 270 280 290
310
pF1KB7 CAFPTHYEEALKDEEKAGV
::.::::::.:::.
NP_803 RDFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
300 310 320 330 340
>>NP_002358 (OMIM: 300153) melanoma-associated antigen B (346 aa)
initn: 1030 init1: 651 opt: 1311 Z-score: 1124.7 bits: 216.4 E(85289): 6.6e-56
Smith-Waterman score: 1311; 65.5% identity (83.4% similar) in 319 aa overlap (1-318:1-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIPQ
:::::::::::::::...: .:. :.: : : ::.::.: :::: .:::: : ::::
NP_002 MPRGQKSKLRAREKRQRTRGQTQDLKVGQPTAAEKEESPSSSSSVLRDTASSSLAFGIPQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSGSLVQ
.::: : :..:::: .: : : :: .: : :.:::::::::::. .: ::::. :::
NP_002 EPQREPPTTSAAAA-MSCTGSDKGDES-QDEENASSSQASTSTERSLKDSLTRKTKMLVQ
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGHTYTF
:::::::.:. .::.:::::..:...::::::..:.:. .:::: :..:::. :.: .
NP_002 FLLYKYKMKEPTTKAEMLKIISKKYKEHFPEIFRKVSQRTELVFGLALKEVNPTTHSYIL
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pF1KB7 IDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGEEHSV
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NP_002 VSMLGPNDGNQS-SAWTLPRNGLLMPLLSVIFLNGNCAREEEIWEFLNMLGIYDGKRHLI
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:::: ::::.::::::::::.:::.:::::.::::::::.:::::::::::::::: :::
NP_002 FGEPRKLITQDLVQEKYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDTTP
240 250 260 270 280 290
310
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NP_002 NNFPLLYEEALRDEEERAGARPRVAARRGTTAMTSAYSRATSSSSSQPM
300 310 320 330 340
>>XP_011543869 (OMIM: 300763) PREDICTED: melanoma-associ (336 aa)
initn: 1018 init1: 771 opt: 1060 Z-score: 912.3 bits: 177.1 E(85289): 4.5e-44
Smith-Waterman score: 1060; 51.6% identity (79.4% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-314)
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pF1KB7 FLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGHTYTF
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XP_011 FLLNKYIRKEPITREAMLKVINRKYKQHFPEILRRSTENVEVVFGLYLKEMDPSRQSYVL
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310
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.. ..:::::..::.
XP_011 STYKSRYEEALREEEEQARARAVARDSARARASRSFQP
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>>NP_001264236 (OMIM: 300763) melanoma-associated antige (336 aa)
initn: 1018 init1: 771 opt: 1060 Z-score: 912.3 bits: 177.1 E(85289): 4.5e-44
Smith-Waterman score: 1060; 51.6% identity (79.4% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIPQ
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NP_001 MPRGQASKRRAREKRRQARGEDQCLGGAQATAAEKEKLPSSSSPACQSPPQSFPNAGIPQ
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pF1KB7 KPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSGSLVQ
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NP_001 ESQRASYPSSPASA-VSLTSSDEGAKGQKGE-SPNSFHGPSSSESTGRDLLNTKTGELVQ
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGHTYTF
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NP_001 FLLNKYIRKEPITREAMLKVINRKYKQHFPEILRRSTENVEVVFGLYLKEMDPSRQSYVL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 IDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGEEHSV
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NP_001 VGKLDFPNQGSLSDGGGFPLSGLLMVLLSTIFMHGNRATEEEMWECLNALGMYKGRKHFI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVNGTTP
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NP_001 YGEPQELVTKDLVREGYLEYQQVPSSDPPRYEFLWGPRARAETSKMKVLEFVAKLNDTVA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KB7 CAFPTHYEEALKDEEKAGV
.. ..:::::..::.
NP_001 STYKSRYEEALREEEEQARARAVARDSARARASRSFQP
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>>XP_011543815 (OMIM: 300152) PREDICTED: melanoma-associ (346 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIP-
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pF1KB7 ---QKPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSG
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XP_011 SALKKPQRALSTTTSV--DVSYKKSYKGANS-KIEKKQSFSQGLSSTVQSRTDPLIMKTN
60 70 80 90 100 110
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pF1KB7 SLVQFLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGH
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XP_011 MLVQFLMEMYKMKKPIMKADMLKIVQKSHKNCFPEILKKASFNMEVVFGVDLKKVDSTKD
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pF1KB7 TYTFIDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGE
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XP_011 SYVLVSKMDLPNNGTVTRGRGFPKTGLLLNLLGVIFMKGNCATEEKIWEFLNKMRIYDGK
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pF1KB7 EHSVFGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVN
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XP_011 KHFIFGEPRKLITQDLVKLKYLEYRQVPNSNPARYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFWAKVN
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pF1KB7 GTTPCAFPTHYEEALKDEEKAGV
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XP_011 KTVPSAFQFWYEEALRDEEERVQAAAMLNDGSSAMGRKCSKAKASSSSHA
300 310 320 330 340
>>XP_011543816 (OMIM: 300152) PREDICTED: melanoma-associ (346 aa)
initn: 1001 init1: 944 opt: 995 Z-score: 857.0 bits: 166.9 E(85289): 5.4e-41
Smith-Waterman score: 995; 51.9% identity (76.6% similar) in 320 aa overlap (1-316:1-316)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIP-
::::::: :.:::::...: .:. . :.: ...... :: . ::. .. .::
XP_011 MPRGQKSTLHAREKRQQTRGQTQDHQGAQITATNKKKVSF-SSPLILGATIQKKSAGRSR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 ---QKPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSG
.::::: .:.... :: :: :::.: . ::. : ::. .:: . ::: :..
XP_011 SALKKPQRALSTTTSV--DVSYKKSYKGANS-KIEKKQSFSQGLSSTVQSRTDPLIMKTN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 SLVQFLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGH
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XP_011 MLVQFLMEMYKMKKPIMKADMLKIVQKSHKNCFPEILKKASFNMEVVFGVDLKKVDSTKD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 TYTFIDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGE
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XP_011 SYVLVSKMDLPNNGTVTRGRGFPKTGLLLNLLGVIFMKGNCATEEKIWEFLNKMRIYDGK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 EHSVFGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVN
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XP_011 KHFIFGEPRKLITQDLVKLKYLEYRQVPNSNPARYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFWAKVN
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KB7 GTTPCAFPTHYEEALKDEEKAGV
:.: :: :::::.:::.
XP_011 KTVPSAFQFWYEEALRDEEERVQAAAMLNDGSSAMGRKCSKAKASSSSHA
300 310 320 330 340
319 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 05:09:41 2016 done: Fri Nov 4 05:09:43 2016
Total Scan time: 8.170 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]