Result of FASTA (omim) for
pF1KB7001
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7001, 1307 aa
1>>>pF1KB7001 1307 - 1307 aa - 1307 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3141+/-0.000525; mu= 23.5387+/- 0.033
mean_var=110.8955+/-21.092, 0's: 0 Z-trim(110.5): 294 B-trim: 41 in 2/48
Lambda= 0.121792
statistics sampled from 18478 (18833) to 18478 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.563), E-opt: 0.2 (0.221), width: 16
Scan time: 10.170
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_006712321 (OMIM: 610519) PREDICTED: contactin-a (1307) 8890 1574.9 0
NP_570129 (OMIM: 610519) contactin-associated prot (1306) 8873 1571.9 0
XP_016858805 (OMIM: 610519) PREDICTED: contactin-a (1227) 6309 1121.4 0
NP_207837 (OMIM: 610518) contactin-associated prot (1308) 5386 959.2 0
XP_011521705 (OMIM: 610518) PREDICTED: contactin-a (1283) 5379 958.0 0
NP_001309110 (OMIM: 610518) contactin-associated p (1307) 5369 956.3 0
NP_001309118 (OMIM: 610518) contactin-associated p (1220) 5127 913.7 0
NP_001309117 (OMIM: 610518) contactin-associated p (1273) 4937 880.3 0
NP_001309109 (OMIM: 610518) contactin-associated p (1179) 4886 871.3 0
NP_387504 (OMIM: 610517) contactin-associated prot (1288) 4805 857.2 0
NP_054860 (OMIM: 604569,610042,612100) contactin-a (1331) 4438 792.7 0
NP_001309108 (OMIM: 610518) contactin-associated p (1228) 4097 732.7 3.7e-210
XP_016879294 (OMIM: 610518) PREDICTED: contactin-a ( 999) 4067 727.3 1.2e-208
NP_001309120 (OMIM: 610518) contactin-associated p ( 999) 4067 727.3 1.2e-208
NP_620481 (OMIM: 610518) contactin-associated prot (1235) 3836 686.9 2.4e-196
NP_001309119 (OMIM: 610518) contactin-associated p (1260) 3836 686.9 2.4e-196
NP_001309116 (OMIM: 610518) contactin-associated p ( 836) 3491 626.0 3.2e-178
NP_001309107 (OMIM: 610518) contactin-associated p (1258) 3422 614.1 1.9e-174
NP_003623 (OMIM: 602346,616286) contactin-associat (1384) 3011 542.0 1.1e-152
XP_016880727 (OMIM: 602346,616286) PREDICTED: cont (1384) 3011 542.0 1.1e-152
XP_005257805 (OMIM: 602346,616286) PREDICTED: cont (1308) 2901 522.6 7e-147
XP_016867439 (OMIM: 604569,610042,612100) PREDICTE ( 714) 2502 452.2 6e-126
XP_016860816 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1466) 479 97.1 9.6e-19
XP_011531477 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1495) 473 96.1 2e-18
NP_001317011 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1496) 473 96.1 2e-18
NP_001317006 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1499) 473 96.1 2e-18
NP_001317025 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1437) 463 94.3 6.7e-18
NP_001317016 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1440) 463 94.3 6.7e-18
NP_001317017 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1447) 460 93.8 9.6e-18
NP_001317024 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1460) 460 93.8 9.7e-18
XP_011531485 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1225) 454 92.6 1.8e-17
XP_011531480 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1484) 454 92.7 2e-17
XP_016860805 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1502) 452 92.4 2.6e-17
XP_016860800 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1508) 452 92.4 2.6e-17
XP_005274459 (OMIM: 600566) PREDICTED: neurexin-2- (1503) 440 90.3 1.1e-16
XP_016877294 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1464) 438 89.9 1.4e-16
XP_016877292 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1468) 438 89.9 1.4e-16
XP_016877291 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1541) 438 89.9 1.5e-16
NP_001317124 (OMIM: 600567) neurexin 3 isoform 5 [ (1571) 438 89.9 1.5e-16
XP_011535672 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1575) 438 89.9 1.5e-16
XP_016877284 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1675) 438 90.0 1.5e-16
XP_016877283 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1675) 438 90.0 1.5e-16
XP_011535668 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1679) 438 90.0 1.5e-16
XP_016860807 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1499) 433 89.0 2.6e-16
XP_016860809 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1495) 428 88.2 4.8e-16
NP_001317014 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1498) 428 88.2 4.9e-16
NP_620060 (OMIM: 600566) neurexin-2-beta isoform a (1642) 415 85.9 2.5e-15
XP_011543677 (OMIM: 600566) PREDICTED: neurexin-2- (1700) 415 85.9 2.6e-15
XP_016877295 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1462) 364 76.9 1.2e-12
XP_016877287 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1666) 364 77.0 1.3e-12
>>XP_006712321 (OMIM: 610519) PREDICTED: contactin-assoc (1307 aa)
initn: 8890 init1: 8890 opt: 8890 Z-score: 8445.2 bits: 1574.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8890; 100.0% identity (100.0% similar) in 1307 aa overlap (1-1307:1-1307)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDSLPRLTSVLTLLFSGLWHLGLTATNYNCDDPLASLLSPMAFSSSSDLTGTHSPAQLNW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MDSLPRLTSVLTLLFSGLWHLGLTATNYNCDDPLASLLSPMAFSSSSDLTGTHSPAQLNW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 RVGTGGWSPADSNAQQWLQMDLGNRVEITAVATQGRYGSSDWVTSYSLMFSDTGRNWKQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RVGTGGWSPADSNAQQWLQMDLGNRVEITAVATQGRYGSSDWVTSYSLMFSDTGRNWKQY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KQEDSIWTFAGNMNADSVVHHKLLHSVRARFVRFVPLEWNPSGKIGMRVEVYGCSYKSDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KQEDSIWTFAGNMNADSVVHHKLLHSVRARFVRFVPLEWNPSGKIGMRVEVYGCSYKSDV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ADFDGRSSLLYRFNQKLMSTLKDVISLKFKSMQGDGVLFHGEGQRGDHITLELQKGRLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ADFDGRSSLLYRFNQKLMSTLKDVISLKFKSMQGDGVLFHGEGQRGDHITLELQKGRLAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 HLNLGDSKARLSSSLPSATLGSLLDDQHWHSVLIERVGKQVNFTVDKHTQHFRTKGETDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 HLNLGDSKARLSSSLPSATLGSLLDDQHWHSVLIERVGKQVNFTVDKHTQHFRTKGETDA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LDIDYELSFGGIPVPGKPGTFLKKNFHGCIENLYYNGVNIIDLAKRRKHQIYTVGNVTFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LDIDYELSFGGIPVPGKPGTFLKKNFHGCIENLYYNGVNIIDLAKRRKHQIYTVGNVTFS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 CSEPQIVPITFVNSSGSYLLLPGTPQIDGLSVSFQFRTWNKDGLLLSTELSEGSGTLLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 CSEPQIVPITFVNSSGSYLLLPGTPQIDGLSVSFQFRTWNKDGLLLSTELSEGSGTLLLS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 LEGGILRLVIQKMTERVAEILTGSNLNDGLWHSVSINARRNRITLTLDDEAAPPAPDSTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LEGGILRLVIQKMTERVAEILTGSNLNDGLWHSVSINARRNRITLTLDDEAAPPAPDSTW
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 VQIYSGNSYYFGGCPDNLTDSQCLNPIKAFQGCMRLIFIDNQPKDLISVQQGSLGNFSDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VQIYSGNSYYFGGCPDNLTDSQCLNPIKAFQGCMRLIFIDNQPKDLISVQQGSLGNFSDL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 HIDLCSIKDRCLPNYCEHGGSCSQSWTTFYCNCSDTSYTGATCHNSIYEQSCEVYRHQGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 HIDLCSIKDRCLPNYCEHGGSCSQSWTTFYCNCSDTSYTGATCHNSIYEQSCEVYRHQGN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 TAGFFYIDSDGSGPLGPLQVYCNITEDKIWTSVQHNNTELTRVRGANPEKPYAMALDYGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TAGFFYIDSDGSGPLGPLQVYCNITEDKIWTSVQHNNTELTRVRGANPEKPYAMALDYGG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 SMEQLEAVIDGSEHCEQEVAYHCRRSRLLNTPDGTPFTWWIGRSNERHPYWGGSPPGVQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SMEQLEAVIDGSEHCEQEVAYHCRRSRLLNTPDGTPFTWWIGRSNERHPYWGGSPPGVQQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 CECGLDESCLDIQHFCNCDADKDEWTNDTGFLSFKDHLPVTQIVITDTDRSNSEAAWRIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 CECGLDESCLDIQHFCNCDADKDEWTNDTGFLSFKDHLPVTQIVITDTDRSNSEAAWRIG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 PLRCYGDRRFWNAVSFYTEASYLHFPTFHAEFSADISFFFKTTALSGVFLENLGIKDFIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PLRCYGDRRFWNAVSFYTEASYLHFPTFHAEFSADISFFFKTTALSGVFLENLGIKDFIR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 LEISSPSEITFAIDVGNGPVELVVQSPSLLNDNQWHYVRAERNLKETSLQVDNLPRSTRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LEISSPSEITFAIDVGNGPVELVVQSPSLLNDNQWHYVRAERNLKETSLQVDNLPRSTRE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 TSEEGHFRLQLNSQLFVGGTSSRQKGFLGCIRSLHLNGQKMDLEERAKVTSGVRPGCPGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TSEEGHFRLQLNSQLFVGGTSSRQKGFLGCIRSLHLNGQKMDLEERAKVTSGVRPGCPGH
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB7 CSSYGSICHNGGKCVEKHNGYLCDCTNSPYEGPFCKKEVSAVFEAGTSVTYMFQEPYPVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 CSSYGSICHNGGKCVEKHNGYLCDCTNSPYEGPFCKKEVSAVFEAGTSVTYMFQEPYPVT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB7 KNISLSSSAIYTDSAPSKENIALSFVTTQAPSLLLFINSSSQDFVVVLLCKNGSLQVRYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KNISLSSSAIYTDSAPSKENIALSFVTTQAPSLLLFINSSSQDFVVVLLCKNGSLQVRYH
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB7 LNKEETHVFTIDADNFANRRMHHLKINREGRELTIQMDQQLRLSYNFSPEVEFRVIRSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LNKEETHVFTIDADNFANRRMHHLKINREGRELTIQMDQQLRLSYNFSPEVEFRVIRSLT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB7 LGKVTENLGLDSEVAKANAMGFAGCMSSVQYNHIAPLKAALRHATVAPVTVHGTLTESSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LGKVTENLGLDSEVAKANAMGFAGCMSSVQYNHIAPLKAALRHATVAPVTVHGTLTESSC
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB7 GFMVDSDVNAVTTVHSSSDPFGKTDEREPLTNAVRSDSAVIGGVIAVVIFIIFCIIGIMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GFMVDSDVNAVTTVHSSSDPFGKTDEREPLTNAVRSDSAVIGGVIAVVIFIIFCIIGIMT
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300
pF1KB7 RFLYQHKQSHRTSQMKEKEYPENLDSSFRNEIDLQNTVSECKREYFI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RFLYQHKQSHRTSQMKEKEYPENLDSSFRNEIDLQNTVSECKREYFI
1270 1280 1290 1300
>>NP_570129 (OMIM: 610519) contactin-associated protein- (1306 aa)
initn: 8871 init1: 6495 opt: 8873 Z-score: 8429.1 bits: 1571.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8873; 99.9% identity (99.9% similar) in 1307 aa overlap (1-1307:1-1306)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDSLPRLTSVLTLLFSGLWHLGLTATNYNCDDPLASLLSPMAFSSSSDLTGTHSPAQLNW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 MDSLPRLTSVLTLLFSGLWHLGLTATNYNCDDPLASLLSPMAFSSSSDLTGTHSPAQLNW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 RVGTGGWSPADSNAQQWLQMDLGNRVEITAVATQGRYGSSDWVTSYSLMFSDTGRNWKQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 RVGTGGWSPADSNAQQWLQMDLGNRVEITAVATQGRYGSSDWVTSYSLMFSDTGRNWKQY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KQEDSIWTFAGNMNADSVVHHKLLHSVRARFVRFVPLEWNPSGKIGMRVEVYGCSYKSDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 KQEDSIWTFAGNMNADSVVHHKLLHSVRARFVRFVPLEWNPSGKIGMRVEVYGCSYKSDV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ADFDGRSSLLYRFNQKLMSTLKDVISLKFKSMQGDGVLFHGEGQRGDHITLELQKGRLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 ADFDGRSSLLYRFNQKLMSTLKDVISLKFKSMQGDGVLFHGEGQRGDHITLELQKGRLAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 HLNLGDSKARLSSSLPSATLGSLLDDQHWHSVLIERVGKQVNFTVDKHTQHFRTKGETDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 HLNLGDSKARLSSSLPSATLGSLLDDQHWHSVLIERVGKQVNFTVDKHTQHFRTKGETDA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LDIDYELSFGGIPVPGKPGTFLKKNFHGCIENLYYNGVNIIDLAKRRKHQIYTVGNVTFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
NP_570 LDIDYELSFGGIPVPGKPGTFLKKNFHGCIENLYYNGVNIIDLAKRRKHQIYT-GNVTFS
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 CSEPQIVPITFVNSSGSYLLLPGTPQIDGLSVSFQFRTWNKDGLLLSTELSEGSGTLLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 CSEPQIVPITFVNSSGSYLLLPGTPQIDGLSVSFQFRTWNKDGLLLSTELSEGSGTLLLS
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 LEGGILRLVIQKMTERVAEILTGSNLNDGLWHSVSINARRNRITLTLDDEAAPPAPDSTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 LEGGILRLVIQKMTERVAEILTGSNLNDGLWHSVSINARRNRITLTLDDEAAPPAPDSTW
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 VQIYSGNSYYFGGCPDNLTDSQCLNPIKAFQGCMRLIFIDNQPKDLISVQQGSLGNFSDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 VQIYSGNSYYFGGCPDNLTDSQCLNPIKAFQGCMRLIFIDNQPKDLISVQQGSLGNFSDL
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 HIDLCSIKDRCLPNYCEHGGSCSQSWTTFYCNCSDTSYTGATCHNSIYEQSCEVYRHQGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 HIDLCSIKDRCLPNYCEHGGSCSQSWTTFYCNCSDTSYTGATCHNSIYEQSCEVYRHQGN
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 TAGFFYIDSDGSGPLGPLQVYCNITEDKIWTSVQHNNTELTRVRGANPEKPYAMALDYGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 TAGFFYIDSDGSGPLGPLQVYCNITEDKIWTSVQHNNTELTRVRGANPEKPYAMALDYGG
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 SMEQLEAVIDGSEHCEQEVAYHCRRSRLLNTPDGTPFTWWIGRSNERHPYWGGSPPGVQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 SMEQLEAVIDGSEHCEQEVAYHCRRSRLLNTPDGTPFTWWIGRSNERHPYWGGSPPGVQQ
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 CECGLDESCLDIQHFCNCDADKDEWTNDTGFLSFKDHLPVTQIVITDTDRSNSEAAWRIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 CECGLDESCLDIQHFCNCDADKDEWTNDTGFLSFKDHLPVTQIVITDTDRSNSEAAWRIG
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 PLRCYGDRRFWNAVSFYTEASYLHFPTFHAEFSADISFFFKTTALSGVFLENLGIKDFIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 PLRCYGDRRFWNAVSFYTEASYLHFPTFHAEFSADISFFFKTTALSGVFLENLGIKDFIR
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 LEISSPSEITFAIDVGNGPVELVVQSPSLLNDNQWHYVRAERNLKETSLQVDNLPRSTRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 LEISSPSEITFAIDVGNGPVELVVQSPSLLNDNQWHYVRAERNLKETSLQVDNLPRSTRE
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 TSEEGHFRLQLNSQLFVGGTSSRQKGFLGCIRSLHLNGQKMDLEERAKVTSGVRPGCPGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 TSEEGHFRLQLNSQLFVGGTSSRQKGFLGCIRSLHLNGQKMDLEERAKVTSGVRPGCPGH
900 910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB7 CSSYGSICHNGGKCVEKHNGYLCDCTNSPYEGPFCKKEVSAVFEAGTSVTYMFQEPYPVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 CSSYGSICHNGGKCVEKHNGYLCDCTNSPYEGPFCKKEVSAVFEAGTSVTYMFQEPYPVT
960 970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB7 KNISLSSSAIYTDSAPSKENIALSFVTTQAPSLLLFINSSSQDFVVVLLCKNGSLQVRYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 KNISLSSSAIYTDSAPSKENIALSFVTTQAPSLLLFINSSSQDFVVVLLCKNGSLQVRYH
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB7 LNKEETHVFTIDADNFANRRMHHLKINREGRELTIQMDQQLRLSYNFSPEVEFRVIRSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 LNKEETHVFTIDADNFANRRMHHLKINREGRELTIQMDQQLRLSYNFSPEVEFRVIRSLT
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB7 LGKVTENLGLDSEVAKANAMGFAGCMSSVQYNHIAPLKAALRHATVAPVTVHGTLTESSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 LGKVTENLGLDSEVAKANAMGFAGCMSSVQYNHIAPLKAALRHATVAPVTVHGTLTESSC
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB7 GFMVDSDVNAVTTVHSSSDPFGKTDEREPLTNAVRSDSAVIGGVIAVVIFIIFCIIGIMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 GFMVDSDVNAVTTVHSSSDPFGKTDEREPLTNAVRSDSAVIGGVIAVVIFIIFCIIGIMT
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1270 1280 1290 1300
pF1KB7 RFLYQHKQSHRTSQMKEKEYPENLDSSFRNEIDLQNTVSECKREYFI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 RFLYQHKQSHRTSQMKEKEYPENLDSSFRNEIDLQNTVSECKREYFI
1260 1270 1280 1290 1300
>>XP_016858805 (OMIM: 610519) PREDICTED: contactin-assoc (1227 aa)
initn: 8279 init1: 6309 opt: 6309 Z-score: 5994.6 bits: 1121.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8123; 93.9% identity (93.9% similar) in 1307 aa overlap (1-1307:1-1227)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDSLPRLTSVLTLLFSGLWHLGLTATNYNCDDPLASLLSPMAFSSSSDLTGTHSPAQLNW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MDSLPRLTSVLTLLFSGLWHLGLTATNYNCDDPLASLLSPMAFSSSSDLTGTHSPAQLNW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 RVGTGGWSPADSNAQQWLQMDLGNRVEITAVATQGRYGSSDWVTSYSLMFSDTGRNWKQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RVGTGGWSPADSNAQQWLQMDLGNRVEITAVATQGRYGSSDWVTSYSLMFSDTGRNWKQY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KQEDSIWTFAGNMNADSVVHHKLLHSVRARFVRFVPLEWNPSGKIGMRVEVYGCSYKSDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KQEDSIWTFAGNMNADSVVHHKLLHSVRARFVRFVPLEWNPSGKIGMRVEVYGCSYKSDV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ADFDGRSSLLYRFNQKLMSTLKDVISLKFKSMQGDGVLFHGEGQRGDHITLELQKGRLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ADFDGRSSLLYRFNQKLMSTLKDVISLKFKSMQGDGVLFHGEGQRGDHITLELQKGRLAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 HLNLGDSKARLSSSLPSATLGSLLDDQHWHSVLIERVGKQVNFTVDKHTQHFRTKGETDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HLNLGDSKARLSSSLPSATLGSLLDDQHWHSVLIERVGKQVNFTVDKHTQHFRTKGETDA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LDIDYELSFGGIPVPGKPGTFLKKNFHGCIENLYYNGVNIIDLAKRRKHQIYTVGNVTFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LDIDYELSFGGIPVPGKPGTFLKKNFHGCIENLYYNGVNIIDLAKRRKHQIYTVGNVTFS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 CSEPQIVPITFVNSSGSYLLLPGTPQIDGLSVSFQFRTWNKDGLLLSTELSEGSGTLLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CSEPQIVPITFVNSSGSYLLLPGTPQIDGLSVSFQFRTWNKDGLLLSTELSEGSGTLLLS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 LEGGILRLVIQKMTERVAEILTGSNLNDGLWHSVSINARRNRITLTLDDEAAPPAPDSTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LEGGILRLVIQKMTERVAEILTGSNLNDGLWHSVSINARRNRITLTLDDEAAPPAPDSTW
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 VQIYSGNSYYFGGCPDNLTDSQCLNPIKAFQGCMRLIFIDNQPKDLISVQQGSLGNFSDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VQIYSGNSYYFGGCPDNLTDSQCLNPIKAFQGCMRLIFIDNQPKDLISVQQGSLGNFSDL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 HIDLCSIKDRCLPNYCEHGGSCSQSWTTFYCNCSDTSYTGATCHNSIYEQSCEVYRHQGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HIDLCSIKDRCLPNYCEHGGSCSQSWTTFYCNCSDTSYTGATCHNSIYEQSCEVYRHQGN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 TAGFFYIDSDGSGPLGPLQVYCNITEDKIWTSVQHNNTELTRVRGANPEKPYAMALDYGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TAGFFYIDSDGSGPLGPLQVYCNITEDKIWTSVQHNNTELTRVRGANPEKPYAMALDYGG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 SMEQLEAVIDGSEHCEQEVAYHCRRSRLLNTPDGTPFTWWIGRSNERHPYWGGSPPGVQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SMEQLEAVIDGSEHCEQEVAYHCRRSRLLNTPDGTPFTWWIGRSNERHPYWGGSPPGVQQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 CECGLDESCLDIQHFCNCDADKDEWTNDTGFLSFKDHLPVTQIVITDTDRSNSEAAWRIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CECGLDESCLDIQHFCNCDADKDEWTNDTGFLSFKDHLPVTQIVITDTDRSNSEAAWRIG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 PLRCYGDRRFWNAVSFYTEASYLHFPTFHAEFSADISFFFKTTALSGVFLENLGIKDFIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PLRCYGDRRFWNAVSFYTEASYLHFPTFHAEFSADISFFFKTTALSGVFLENLGIKDFIR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 LEISSPSEITFAIDVGNGPVELVVQSPSLLNDNQWHYVRAERNLKETSLQVDNLPRSTRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LEISSPSEITFAIDVGNGPVELVVQSPSLLNDNQWHYVRAERNLKETSLQVDNLPRSTRE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 TSEEGHFRLQLNSQLFVGGTSSRQKGFLGCIRSLHLNGQKMDLEERAKVTSGVRPGCPGH
:::::::::::::::::
XP_016 TSEEGHFRLQLNSQLFV-------------------------------------------
910
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB7 CSSYGSICHNGGKCVEKHNGYLCDCTNSPYEGPFCKKEVSAVFEAGTSVTYMFQEPYPVT
:::::::::::::::::::::::
XP_016 -------------------------------------EVSAVFEAGTSVTYMFQEPYPVT
920 930 940
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB7 KNISLSSSAIYTDSAPSKENIALSFVTTQAPSLLLFINSSSQDFVVVLLCKNGSLQVRYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KNISLSSSAIYTDSAPSKENIALSFVTTQAPSLLLFINSSSQDFVVVLLCKNGSLQVRYH
950 960 970 980 990 1000
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB7 LNKEETHVFTIDADNFANRRMHHLKINREGRELTIQMDQQLRLSYNFSPEVEFRVIRSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LNKEETHVFTIDADNFANRRMHHLKINREGRELTIQMDQQLRLSYNFSPEVEFRVIRSLT
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB7 LGKVTENLGLDSEVAKANAMGFAGCMSSVQYNHIAPLKAALRHATVAPVTVHGTLTESSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGKVTENLGLDSEVAKANAMGFAGCMSSVQYNHIAPLKAALRHATVAPVTVHGTLTESSC
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB7 GFMVDSDVNAVTTVHSSSDPFGKTDEREPLTNAVRSDSAVIGGVIAVVIFIIFCIIGIMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GFMVDSDVNAVTTVHSSSDPFGKTDEREPLTNAVRSDSAVIGGVIAVVIFIIFCIIGIMT
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1270 1280 1290 1300
pF1KB7 RFLYQHKQSHRTSQMKEKEYPENLDSSFRNEIDLQNTVSECKREYFI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RFLYQHKQSHRTSQMKEKEYPENLDSSFRNEIDLQNTVSECKREYFI
1190 1200 1210 1220
>>NP_207837 (OMIM: 610518) contactin-associated protein- (1308 aa)
initn: 4811 init1: 2083 opt: 5386 Z-score: 5117.8 bits: 959.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5386; 58.7% identity (83.2% similar) in 1299 aa overlap (11-1306:12-1307)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MDSLPRLTSVLTLLFSGLWHLGLTATNYNCDDPLASLLSPMAFSSSSDLTGTHSP--AQ
: :: . :. ....:.:::::.: : .:::::.:...:.: :.
NP_207 MGSVTGAVLKTLLLLSTQNWNRVEAGNSYDCDDPLVSALPQASFSSSSELSSSHGPGFAR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LNWRVGTGGWSPADSNAQQWLQMDLGNRVEITAVATQGRYGSSDWVTSYSLMFSDTGRNW
:: : :.::::: :: ::::.:::.:.:.::::::: ::::.::::: :::::.: ::
NP_207 LNRRDGAGGWSPLVSNKYQWLQIDLGERMEVTAVATQGGYGSSNWVTSYLLMFSDSGWNW
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 KQYKQEDSIWTFAGNMNADSVVHHKLLHSVRARFVRFVPLEWNPSGKIGMRVEVYGCSYK
:::.:::::: :.:: ::::::...: :..:::.::.::::::.:.::::.::.::.:.
NP_207 KQYRQEDSIWGFSGNANADSVVYYRLQPSIKARFLRFIPLEWNPKGRIGMRIEVFGCAYR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 SDVADFDGRSSLLYRFNQKLMSTLKDVISLKFKSMQGDGVLFHGEGQRGDHITLELQKGR
:.:.:.::.:::::::.:: .: .::.::::::.::.::.:.: :: ::::::.:...:
NP_207 SEVVDLDGKSSLLYRFDQKSLSPIKDIISLKFKTMQSDGILLHREGPNGDHITLQLRRAR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 LALHLNLGDSKARLSSSLPSATLGSLLDDQHWHSVLIERVGKQVNFTVDKHTQHFRTKGE
: : .: :..: .:.: . ::::::::::::::::.:.:::::::::.: .::...::
NP_207 LFLLINSGEAKLPSTSTLVNLTLGSLLDDQHWHSVLIQRLGKQVNFTVDEHRHHFHARGE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 TDALDIDYELSFGGIPVPGKPGTFLKKNFHGCIENLYYNGVNIIDLAKRRKHQIYTVGNV
. ...:::.::::::.::: .: ..:::::.::::::::.::::::..: :: ..:::
NP_207 FNLMNLDYEISFGGIPAPGKSVSFPHRNFHGCLENLYYNGVDIIDLAKQQKPQIIAMGNV
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 TFSCSEPQIVPITFVNSSGSYLLLPGTPQIDGLSVSFQFRTWNKDGLLLSTELSEGSGTL
.::::.:: .:.::. :: ::: :: . .:..:::::::: :::: .::. :: .
NP_207 SFSCSQPQSMPVTFL-SSRSYLALPDFSGEEEVSATFQFRTWNKAGLLLFSELQLISGGI
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 LLSLEGGILRLVIQKMTERVAEILTGSNLNDGLWHSVSINARRNRITLTLDDEAAPPAPD
:: : : :. . . . ..: .: .:::: :::::..:..:......: . : ::
NP_207 LLFLSDGKLKSNLYQPGKLPSDITAGVELNDGQWHSVSLSAKKNHLSVAVDGQMASAAPL
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 STWVQIYSGNSYYFGGCPDNLTDSQCLNPIKAFQGCMRLIFIDNQPKDLISVQQGSLGNF
:::::..::::::::. :.: .:. .:::::::: :... :::::::::::::
NP_207 LGPEQIYSGGTYYFGGCPDKSFGSKCKSPLGGFQGCMRLISISGKVVDLISVQQGSLGNF
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 SDLHIDLCSIKDRCLPNYCEHGGSCSQSWTTFYCNCSDTSYTGATCHNSIYEQSCEVYRH
:::.:: :.:.:::::::::::: :::::.::.:::..:.: ::::::::::::::.:.:
NP_207 SDLQIDSCGISDRCLPNYCEHGGECSQSWSTFHCNCTNTGYRGATCHNSIYEQSCEAYKH
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB7 QGNTAGFFYIDSDGSGPLGPLQVYCNITEDKIWTSVQHNNTELTRVRGANPEKPYAMALD
.:::.::.:::::::::: :. .:::.:: :: .:::...:::::..:::.::: ..
NP_207 RGNTSGFYYIDSDGSGPLEPFLLYCNMTETA-WTIIQHNGSDLTRVRNTNPENPYAGFFE
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB7 YGGSMEQLEAVIDGSEHCEQEVAYHCRRSRLLNTPDGTPFTWWIGRSNERHPYWGGSPPG
: .:::::.:.:. .:::::: .:.:..:::.: ::::..::.::.:: . ::::: :
NP_207 YVASMEQLQATINRAEHCEQEFTYYCKKSRLVNKQDGTPLSWWVGRTNETQTYWGGSSPD
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB7 VQQCECGLDESCLDIQHFCNCDADKDEWTNDTGFLSFKDHLPVTQIVITDTDRSNSEAAW
.:.: :::. .:.: :..::::::..:::::::.:..:.:::::.:::::: : .::::.
NP_207 LQKCTCGLEGNCIDSQYYCNCDADRNEWTNDTGLLAYKEHLPVTKIVITDTGRLHSEAAY
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KB7 RIGPLRCYGDRRFWNAVSFYTEASYLHFPTFHAEFSADISFFFKTTALSGVFLENLGIKD
..::: : ::: :::..:: ::::::::::::.:.:::.:::::::: :::::::::: :
NP_207 KLGPLLCQGDRSFWNSASFDTEASYLHFPTFHGELSADVSFFFKTTASSGVFLENLGIAD
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KB7 FIRLEISSPSEITFAIDVGNGPVELVVQSPSLLNDNQWHYVRAERNLKETSLQVDNLPRS
:::.:. ::. .::..:::::: :. ::::. .::::::.::.:::.::.:::::.: .
NP_207 FIRIELRSPTVVTFSFDVGNGPFEISVQSPTHFNDNQWHHVRVERNMKEASLQVDQLTPK
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KB7 TRETSEEGHFRLQLNSQLFVGGTSSRQKGFLGCIRSLHLNGQKMDLEERAKVTSGVRPGC
:. . .:: ::::::::::::..::.:::::::::.:::. .::::::.:: :.:::
NP_207 TQPAPADGHVLLQLNSQLFVGGTATRQRGFLGCIRSLQLNGMTLDLEERAQVTPEVQPGC
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB7 PGHCSSYGSICHNGGKCVEKHNGYLCDCTNSPYEGPFCKKEVSAVFEAGTSVTYMFQEPY
:::::::..:.::::: :. :..:::: : : ::::..:.:: : .:.:: : ::: :
NP_207 RGHCSSYGKLCRNGGKCRERPIGFFCDCTFSAYTGPFCSNEISAYFGSGSSVIYNFQENY
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB7 PVTKNISLSSSAIYTDSAPSKENIALSFVTTQAPSLLLFINSSSQDFVVVLLCKNGSLQV
..:: : ..... : :.: : .:: ::..::::::..: .... :.. ::::::.
NP_207 LLSKNSSSHAASFHGDMKLSREMIKFSFRTTRTPSLLLFVSSFYKEYLSVIIAKNGSLQI
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB7 RYHLNK-EETHVFTIDADNFANRRMHHLKINREGRELTIQMDQQLRLSYNFSPEVEFRVI
::.::: .: : ..: :.:. ..::. :::: . :..:.. : . ..: .:: ..
NP_207 RYKLNKYQEPDVVNFDFKNMADGQLHHIMINREEGVVFIEIDDNRRRQVHLSSGTEFSAV
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KB7 RSLTLGKVTENLGLDSEVAKANAMGFAGCMSSVQYNHIAPLKAALRHATVAPVTVHGTLT
.::.::.. :. .:...: :.:.::.::.:.:: .:.:::::::. . :::: : .:
NP_207 KSLVLGRILEHSDVDQDTALAGAQGFTGCLSAVQLSHVAPLKAALHPSHPDPVTVTGHVT
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KB7 ESSCGFMVDSDVNAVTTVHSSSDPFGKTDEREPLTNAVRSDSAVIGGVIAVVIFIIFCII
:::: . .:... .:: .: : :.::::.::..::::::::.:::::::..::
NP_207 ESSCMAQPGTDATSRERTHSFADHSGTIDDREPLANAIKSDSAVIGGLIAVVIFILLCIT
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1260 1270 1280 1290 1300
pF1KB7 GIMTRFLYQHKQSHRTSQMKEKEYPENLDSSFRNEIDLQNTVSECKREYFI
.: .: .::.:. .. :. :..: .. .. ...:...::.:.: ..:::
NP_207 AIAVR-IYQQKRLYKRSEAKRSENVDSAEAVLKSELNIQNAVNENQKEYFF
1260 1270 1280 1290 1300
>>XP_011521705 (OMIM: 610518) PREDICTED: contactin-assoc (1283 aa)
initn: 4804 init1: 2083 opt: 5379 Z-score: 5111.2 bits: 958.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5379; 59.2% identity (83.6% similar) in 1283 aa overlap (27-1306:3-1282)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MDSLPRLTSVLTLLFSGLWHLGLTATNYNCDDPLASLLSPMAFSSSSDLTGTHSP--AQL
::.:::::.: : .:::::.:...:.: :.:
XP_011 MWNYDCDDPLVSALPQASFSSSSELSSSHGPGFARL
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 NWRVGTGGWSPADSNAQQWLQMDLGNRVEITAVATQGRYGSSDWVTSYSLMFSDTGRNWK
: : :.::::: :: ::::.:::.:.:.::::::: ::::.::::: :::::.: :::
XP_011 NRRDGAGGWSPLVSNKYQWLQIDLGERMEVTAVATQGGYGSSNWVTSYLLMFSDSGWNWK
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 QYKQEDSIWTFAGNMNADSVVHHKLLHSVRARFVRFVPLEWNPSGKIGMRVEVYGCSYKS
::.:::::: :.:: ::::::...: :..:::.::.::::::.:.::::.::.::.:.:
XP_011 QYRQEDSIWGFSGNANADSVVYYRLQPSIKARFLRFIPLEWNPKGRIGMRIEVFGCAYRS
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 DVADFDGRSSLLYRFNQKLMSTLKDVISLKFKSMQGDGVLFHGEGQRGDHITLELQKGRL
.:.:.::.:::::::.:: .: .::.::::::.::.::.:.: :: ::::::.:...::
XP_011 EVVDLDGKSSLLYRFDQKSLSPIKDIISLKFKTMQSDGILLHREGPNGDHITLQLRRARL
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 ALHLNLGDSKARLSSSLPSATLGSLLDDQHWHSVLIERVGKQVNFTVDKHTQHFRTKGET
: .: :..: .:.: . ::::::::::::::::.:.:::::::::.: .::...::
XP_011 FLLINSGEAKLPSTSTLVNLTLGSLLDDQHWHSVLIQRLGKQVNFTVDEHRHHFHARGEF
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 DALDIDYELSFGGIPVPGKPGTFLKKNFHGCIENLYYNGVNIIDLAKRRKHQIYTVGNVT
. ...:::.::::::.::: .: ..:::::.::::::::.::::::..: :: ..:::.
XP_011 NLMNLDYEISFGGIPAPGKSVSFPHRNFHGCLENLYYNGVDIIDLAKQQKPQIIAMGNVS
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 FSCSEPQIVPITFVNSSGSYLLLPGTPQIDGLSVSFQFRTWNKDGLLLSTELSEGSGTLL
::::.:: .:.::. :: ::: :: . .:..:::::::: :::: .::. :: .:
XP_011 FSCSQPQSMPVTFL-SSRSYLALPDFSGEEEVSATFQFRTWNKAGLLLFSELQLISGGIL
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 LSLEGGILRLVIQKMTERVAEILTGSNLNDGLWHSVSINARRNRITLTLDDEAAPPAPDS
: : : :. . . . ..: .: .:::: :::::..:..:......: . : ::
XP_011 LFLSDGKLKSNLYQPGKLPSDITAGVELNDGQWHSVSLSAKKNHLSVAVDGQMASAAPLL
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 TWVQIYSGNSYYFGGCPDNLTDSQCLNPIKAFQGCMRLIFIDNQPKDLISVQQGSLGNFS
:::::..::::::::. :.: .:. .:::::::: :... ::::::::::::::
XP_011 GPEQIYSGGTYYFGGCPDKSFGSKCKSPLGGFQGCMRLISISGKVVDLISVQQGSLGNFS
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 DLHIDLCSIKDRCLPNYCEHGGSCSQSWTTFYCNCSDTSYTGATCHNSIYEQSCEVYRHQ
::.:: :.:.:::::::::::: :::::.::.:::..:.: ::::::::::::::.:.:.
XP_011 DLQIDSCGISDRCLPNYCEHGGECSQSWSTFHCNCTNTGYRGATCHNSIYEQSCEAYKHR
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KB7 GNTAGFFYIDSDGSGPLGPLQVYCNITEDKIWTSVQHNNTELTRVRGANPEKPYAMALDY
:::.::.:::::::::: :. .:::.:: :: .:::...:::::..:::.::: ..:
XP_011 GNTSGFYYIDSDGSGPLEPFLLYCNMTETA-WTIIQHNGSDLTRVRNTNPENPYAGFFEY
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KB7 GGSMEQLEAVIDGSEHCEQEVAYHCRRSRLLNTPDGTPFTWWIGRSNERHPYWGGSPPGV
.:::::.:.:. .:::::: .:.:..:::.: ::::..::.::.:: . ::::: : .
XP_011 VASMEQLQATINRAEHCEQEFTYYCKKSRLVNKQDGTPLSWWVGRTNETQTYWGGSSPDL
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KB7 QQCECGLDESCLDIQHFCNCDADKDEWTNDTGFLSFKDHLPVTQIVITDTDRSNSEAAWR
:.: :::. .:.: :..::::::..:::::::.:..:.:::::.:::::: : .::::..
XP_011 QKCTCGLEGNCIDSQYYCNCDADRNEWTNDTGLLAYKEHLPVTKIVITDTGRLHSEAAYK
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KB7 IGPLRCYGDRRFWNAVSFYTEASYLHFPTFHAEFSADISFFFKTTALSGVFLENLGIKDF
.::: : ::: :::..:: ::::::::::::.:.:::.:::::::: :::::::::: ::
XP_011 LGPLLCQGDRSFWNSASFDTEASYLHFPTFHGELSADVSFFFKTTASSGVFLENLGIADF
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KB7 IRLEISSPSEITFAIDVGNGPVELVVQSPSLLNDNQWHYVRAERNLKETSLQVDNLPRST
::.:. ::. .::..:::::: :. ::::. .::::::.::.:::.::.:::::.: .:
XP_011 IRIELRSPTVVTFSFDVGNGPFEISVQSPTHFNDNQWHHVRVERNMKEASLQVDQLTPKT
820 830 840 850 860 870
900 910 920 930 940 950
pF1KB7 RETSEEGHFRLQLNSQLFVGGTSSRQKGFLGCIRSLHLNGQKMDLEERAKVTSGVRPGCP
. . .:: ::::::::::::..::.:::::::::.:::. .::::::.:: :.:::
XP_011 QPAPADGHVLLQLNSQLFVGGTATRQRGFLGCIRSLQLNGMTLDLEERAQVTPEVQPGCR
880 890 900 910 920 930
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB7 GHCSSYGSICHNGGKCVEKHNGYLCDCTNSPYEGPFCKKEVSAVFEAGTSVTYMFQEPYP
:::::::..:.::::: :. :..:::: : : ::::..:.:: : .:.:: : ::: :
XP_011 GHCSSYGKLCRNGGKCRERPIGFFCDCTFSAYTGPFCSNEISAYFGSGSSVIYNFQENYL
940 950 960 970 980 990
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB7 VTKNISLSSSAIYTDSAPSKENIALSFVTTQAPSLLLFINSSSQDFVVVLLCKNGSLQVR
..:: : ..... : :.: : .:: ::..::::::..: .... :.. ::::::.:
XP_011 LSKNSSSHAASFHGDMKLSREMIKFSFRTTRTPSLLLFVSSFYKEYLSVIIAKNGSLQIR
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB7 YHLNK-EETHVFTIDADNFANRRMHHLKINREGRELTIQMDQQLRLSYNFSPEVEFRVIR
:.::: .: : ..: :.:. ..::. :::: . :..:.. : . ..: .:: ...
XP_011 YKLNKYQEPDVVNFDFKNMADGQLHHIMINREEGVVFIEIDDNRRRQVHLSSGTEFSAVK
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KB7 SLTLGKVTENLGLDSEVAKANAMGFAGCMSSVQYNHIAPLKAALRHATVAPVTVHGTLTE
::.::.. :. .:...: :.:.::.::.:.:: .:.:::::::. . :::: : .::
XP_011 SLVLGRILEHSDVDQDTALAGAQGFTGCLSAVQLSHVAPLKAALHPSHPDPVTVTGHVTE
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KB7 SSCGFMVDSDVNAVTTVHSSSDPFGKTDEREPLTNAVRSDSAVIGGVIAVVIFIIFCIIG
::: . .:... .:: .: : :.::::.::..::::::::.:::::::..:: .
XP_011 SSCMAQPGTDATSRERTHSFADHSGTIDDREPLANAIKSDSAVIGGLIAVVIFILLCITA
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1260 1270 1280 1290 1300
pF1KB7 IMTRFLYQHKQSHRTSQMKEKEYPENLDSSFRNEIDLQNTVSECKREYFI
: .: .::.:. .. :. :..: .. .. ...:...::.:.: ..:::
XP_011 IAVR-IYQQKRLYKRSEAKRSENVDSAEAVLKSELNIQNAVNENQKEYFF
1240 1250 1260 1270 1280
>>NP_001309110 (OMIM: 610518) contactin-associated prote (1307 aa)
initn: 4784 init1: 2083 opt: 5369 Z-score: 5101.6 bits: 956.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5369; 58.6% identity (83.1% similar) in 1299 aa overlap (11-1306:12-1306)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MDSLPRLTSVLTLLFSGLWHLGLTATNYNCDDPLASLLSPMAFSSSSDLTGTHSP--AQ
: :: . :. ....:.:::::.: : .:::::.:...:.: :.
NP_001 MGSVTGAVLKTLLLLSTQNWNRVEAGNSYDCDDPLVSALPQASFSSSSELSSSHGPGFAR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LNWRVGTGGWSPADSNAQQWLQMDLGNRVEITAVATQGRYGSSDWVTSYSLMFSDTGRNW
:: : .::::: :: ::::.:::.:.:.::::::: ::::.::::: :::::.: ::
NP_001 LN-RRDAGGWSPLVSNKYQWLQIDLGERMEVTAVATQGGYGSSNWVTSYLLMFSDSGWNW
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 KQYKQEDSIWTFAGNMNADSVVHHKLLHSVRARFVRFVPLEWNPSGKIGMRVEVYGCSYK
:::.:::::: :.:: ::::::...: :..:::.::.::::::.:.::::.::.::.:.
NP_001 KQYRQEDSIWGFSGNANADSVVYYRLQPSIKARFLRFIPLEWNPKGRIGMRIEVFGCAYR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 SDVADFDGRSSLLYRFNQKLMSTLKDVISLKFKSMQGDGVLFHGEGQRGDHITLELQKGR
:.:.:.::.:::::::.:: .: .::.::::::.::.::.:.: :: ::::::.:...:
NP_001 SEVVDLDGKSSLLYRFDQKSLSPIKDIISLKFKTMQSDGILLHREGPNGDHITLQLRRAR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 LALHLNLGDSKARLSSSLPSATLGSLLDDQHWHSVLIERVGKQVNFTVDKHTQHFRTKGE
: : .: :..: .:.: . ::::::::::::::::.:.:::::::::.: .::...::
NP_001 LFLLINSGEAKLPSTSTLVNLTLGSLLDDQHWHSVLIQRLGKQVNFTVDEHRHHFHARGE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 TDALDIDYELSFGGIPVPGKPGTFLKKNFHGCIENLYYNGVNIIDLAKRRKHQIYTVGNV
. ...:::.::::::.::: .: ..:::::.::::::::.::::::..: :: ..:::
NP_001 FNLMNLDYEISFGGIPAPGKSVSFPHRNFHGCLENLYYNGVDIIDLAKQQKPQIIAMGNV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 TFSCSEPQIVPITFVNSSGSYLLLPGTPQIDGLSVSFQFRTWNKDGLLLSTELSEGSGTL
.::::.:: .:.::. :: ::: :: . .:..:::::::: :::: .::. :: .
NP_001 SFSCSQPQSMPVTFL-SSRSYLALPDFSGEEEVSATFQFRTWNKAGLLLFSELQLISGGI
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 LLSLEGGILRLVIQKMTERVAEILTGSNLNDGLWHSVSINARRNRITLTLDDEAAPPAPD
:: : : :. . . . ..: .: .:::: :::::..:..:......: . : ::
NP_001 LLFLSDGKLKSNLYQPGKLPSDITAGVELNDGQWHSVSLSAKKNHLSVAVDGQMASAAPL
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 STWVQIYSGNSYYFGGCPDNLTDSQCLNPIKAFQGCMRLIFIDNQPKDLISVQQGSLGNF
:::::..::::::::. :.: .:. .:::::::: :... :::::::::::::
NP_001 LGPEQIYSGGTYYFGGCPDKSFGSKCKSPLGGFQGCMRLISISGKVVDLISVQQGSLGNF
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 SDLHIDLCSIKDRCLPNYCEHGGSCSQSWTTFYCNCSDTSYTGATCHNSIYEQSCEVYRH
:::.:: :.:.:::::::::::: :::::.::.:::..:.: ::::::::::::::.:.:
NP_001 SDLQIDSCGISDRCLPNYCEHGGECSQSWSTFHCNCTNTGYRGATCHNSIYEQSCEAYKH
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB7 QGNTAGFFYIDSDGSGPLGPLQVYCNITEDKIWTSVQHNNTELTRVRGANPEKPYAMALD
.:::.::.:::::::::: :. .:::.:: :: .:::...:::::..:::.::: ..
NP_001 RGNTSGFYYIDSDGSGPLEPFLLYCNMTETA-WTIIQHNGSDLTRVRNTNPENPYAGFFE
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB7 YGGSMEQLEAVIDGSEHCEQEVAYHCRRSRLLNTPDGTPFTWWIGRSNERHPYWGGSPPG
: .:::::.:.:. .:::::: .:.:..:::.: ::::..::.::.:: . ::::: :
NP_001 YVASMEQLQATINRAEHCEQEFTYYCKKSRLVNKQDGTPLSWWVGRTNETQTYWGGSSPD
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB7 VQQCECGLDESCLDIQHFCNCDADKDEWTNDTGFLSFKDHLPVTQIVITDTDRSNSEAAW
.:.: :::. .:.: :..::::::..:::::::.:..:.:::::.:::::: : .::::.
NP_001 LQKCTCGLEGNCIDSQYYCNCDADRNEWTNDTGLLAYKEHLPVTKIVITDTGRLHSEAAY
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KB7 RIGPLRCYGDRRFWNAVSFYTEASYLHFPTFHAEFSADISFFFKTTALSGVFLENLGIKD
..::: : ::: :::..:: ::::::::::::.:.:::.:::::::: :::::::::: :
NP_001 KLGPLLCQGDRSFWNSASFDTEASYLHFPTFHGELSADVSFFFKTTASSGVFLENLGIAD
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KB7 FIRLEISSPSEITFAIDVGNGPVELVVQSPSLLNDNQWHYVRAERNLKETSLQVDNLPRS
:::.:. ::. .::..:::::: :. ::::. .::::::.::.:::.::.:::::.: .
NP_001 FIRIELRSPTVVTFSFDVGNGPFEISVQSPTHFNDNQWHHVRVERNMKEASLQVDQLTPK
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KB7 TRETSEEGHFRLQLNSQLFVGGTSSRQKGFLGCIRSLHLNGQKMDLEERAKVTSGVRPGC
:. . .:: ::::::::::::..::.:::::::::.:::. .::::::.:: :.:::
NP_001 TQPAPADGHVLLQLNSQLFVGGTATRQRGFLGCIRSLQLNGMTLDLEERAQVTPEVQPGC
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB7 PGHCSSYGSICHNGGKCVEKHNGYLCDCTNSPYEGPFCKKEVSAVFEAGTSVTYMFQEPY
:::::::..:.::::: :. :..:::: : : ::::..:.:: : .:.:: : ::: :
NP_001 RGHCSSYGKLCRNGGKCRERPIGFFCDCTFSAYTGPFCSNEISAYFGSGSSVIYNFQENY
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB7 PVTKNISLSSSAIYTDSAPSKENIALSFVTTQAPSLLLFINSSSQDFVVVLLCKNGSLQV
..:: : ..... : :.: : .:: ::..::::::..: .... :.. ::::::.
NP_001 LLSKNSSSHAASFHGDMKLSREMIKFSFRTTRTPSLLLFVSSFYKEYLSVIIAKNGSLQI
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB7 RYHLNK-EETHVFTIDADNFANRRMHHLKINREGRELTIQMDQQLRLSYNFSPEVEFRVI
::.::: .: : ..: :.:. ..::. :::: . :..:.. : . ..: .:: ..
NP_001 RYKLNKYQEPDVVNFDFKNMADGQLHHIMINREEGVVFIEIDDNRRRQVHLSSGTEFSAV
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KB7 RSLTLGKVTENLGLDSEVAKANAMGFAGCMSSVQYNHIAPLKAALRHATVAPVTVHGTLT
.::.::.. :. .:...: :.:.::.::.:.:: .:.:::::::. . :::: : .:
NP_001 KSLVLGRILEHSDVDQDTALAGAQGFTGCLSAVQLSHVAPLKAALHPSHPDPVTVTGHVT
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KB7 ESSCGFMVDSDVNAVTTVHSSSDPFGKTDEREPLTNAVRSDSAVIGGVIAVVIFIIFCII
:::: . .:... .:: .: : :.::::.::..::::::::.:::::::..::
NP_001 ESSCMAQPGTDATSRERTHSFADHSGTIDDREPLANAIKSDSAVIGGLIAVVIFILLCIT
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1260 1270 1280 1290 1300
pF1KB7 GIMTRFLYQHKQSHRTSQMKEKEYPENLDSSFRNEIDLQNTVSECKREYFI
.: .: .::.:. .. :. :..: .. .. ...:...::.:.: ..:::
NP_001 AIAVR-IYQQKRLYKRSEAKRSENVDSAEAVLKSELNIQNAVNENQKEYFF
1260 1270 1280 1290 1300
>>NP_001309118 (OMIM: 610518) contactin-associated prote (1220 aa)
initn: 4552 init1: 2083 opt: 5127 Z-score: 4872.2 bits: 913.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5127; 59.1% identity (83.7% similar) in 1222 aa overlap (86-1306:1-1219)
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 AQLNWRVGTGGWSPADSNAQQWLQMDLGNRVEITAVATQGRYGSSDWVTSYSLMFSDTGR
.:.::::::: ::::.::::: :::::.:
NP_001 MEVTAVATQGGYGSSNWVTSYLLMFSDSGW
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 NWKQYKQEDSIWTFAGNMNADSVVHHKLLHSVRARFVRFVPLEWNPSGKIGMRVEVYGCS
:::::.:::::: :.:: ::::::...: :..:::.::.::::::.:.::::.::.::.
NP_001 NWKQYRQEDSIWGFSGNANADSVVYYRLQPSIKARFLRFIPLEWNPKGRIGMRIEVFGCA
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 YKSDVADFDGRSSLLYRFNQKLMSTLKDVISLKFKSMQGDGVLFHGEGQRGDHITLELQK
:.:.:.:.::.:::::::.:: .: .::.::::::.::.::.:.: :: ::::::.:..
NP_001 YRSEVVDLDGKSSLLYRFDQKSLSPIKDIISLKFKTMQSDGILLHREGPNGDHITLQLRR
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 GRLALHLNLGDSKARLSSSLPSATLGSLLDDQHWHSVLIERVGKQVNFTVDKHTQHFRTK
.:: : .: :..: .:.: . ::::::::::::::::.:.:::::::::.: .::...
NP_001 ARLFLLINSGEAKLPSTSTLVNLTLGSLLDDQHWHSVLIQRLGKQVNFTVDEHRHHFHAR
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 GETDALDIDYELSFGGIPVPGKPGTFLKKNFHGCIENLYYNGVNIIDLAKRRKHQIYTVG
:: . ...:::.::::::.::: .: ..:::::.::::::::.::::::..: :: ..:
NP_001 GEFNLMNLDYEISFGGIPAPGKSVSFPHRNFHGCLENLYYNGVDIIDLAKQQKPQIIAMG
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 NVTFSCSEPQIVPITFVNSSGSYLLLPGTPQIDGLSVSFQFRTWNKDGLLLSTELSEGSG
::.::::.:: .:.::. :: ::: :: . .:..:::::::: :::: .::. ::
NP_001 NVSFSCSQPQSMPVTFL-SSRSYLALPDFSGEEEVSATFQFRTWNKAGLLLFSELQLISG
280 290 300 310 320
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 TLLLSLEGGILRLVIQKMTERVAEILTGSNLNDGLWHSVSINARRNRITLTLDDEAAPPA
.:: : : :. . . . ..: .: .:::: :::::..:..:......: . : :
NP_001 GILLFLSDGKLKSNLYQPGKLPSDITAGVELNDGQWHSVSLSAKKNHLSVAVDGQMASAA
330 340 350 360 370 380
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 PDSTWVQIYSGNSYYFGGCPDNLTDSQCLNPIKAFQGCMRLIFIDNQPKDLISVQQGSLG
: :::::..::::::::. :.: .:. .:::::::: :... :::::::::::
NP_001 PLLGPEQIYSGGTYYFGGCPDKSFGSKCKSPLGGFQGCMRLISISGKVVDLISVQQGSLG
390 400 410 420 430 440
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 NFSDLHIDLCSIKDRCLPNYCEHGGSCSQSWTTFYCNCSDTSYTGATCHNSIYEQSCEVY
:::::.:: :.:.:::::::::::: :::::.::.:::..:.: ::::::::::::::.:
NP_001 NFSDLQIDSCGISDRCLPNYCEHGGECSQSWSTFHCNCTNTGYRGATCHNSIYEQSCEAY
450 460 470 480 490 500
600 610 620 630 640 650
pF1KB7 RHQGNTAGFFYIDSDGSGPLGPLQVYCNITEDKIWTSVQHNNTELTRVRGANPEKPYAMA
.:.:::.::.:::::::::: :. .:::.:: :: .:::...:::::..:::.:::
NP_001 KHRGNTSGFYYIDSDGSGPLEPFLLYCNMTETA-WTIIQHNGSDLTRVRNTNPENPYAGF
510 520 530 540 550 560
660 670 680 690 700 710
pF1KB7 LDYGGSMEQLEAVIDGSEHCEQEVAYHCRRSRLLNTPDGTPFTWWIGRSNERHPYWGGSP
..: .:::::.:.:. .:::::: .:.:..:::.: ::::..::.::.:: . :::::
NP_001 FEYVASMEQLQATINRAEHCEQEFTYYCKKSRLVNKQDGTPLSWWVGRTNETQTYWGGSS
570 580 590 600 610 620
720 730 740 750 760 770
pF1KB7 PGVQQCECGLDESCLDIQHFCNCDADKDEWTNDTGFLSFKDHLPVTQIVITDTDRSNSEA
: .:.: :::. .:.: :..::::::..:::::::.:..:.:::::.:::::: : .:::
NP_001 PDLQKCTCGLEGNCIDSQYYCNCDADRNEWTNDTGLLAYKEHLPVTKIVITDTGRLHSEA
630 640 650 660 670 680
780 790 800 810 820 830
pF1KB7 AWRIGPLRCYGDRRFWNAVSFYTEASYLHFPTFHAEFSADISFFFKTTALSGVFLENLGI
:...::: : ::: :::..:: ::::::::::::.:.:::.:::::::: ::::::::::
NP_001 AYKLGPLLCQGDRSFWNSASFDTEASYLHFPTFHGELSADVSFFFKTTASSGVFLENLGI
690 700 710 720 730 740
840 850 860 870 880 890
pF1KB7 KDFIRLEISSPSEITFAIDVGNGPVELVVQSPSLLNDNQWHYVRAERNLKETSLQVDNLP
::::.:. ::. .::..:::::: :. ::::. .::::::.::.:::.::.:::::.:
NP_001 ADFIRIELRSPTVVTFSFDVGNGPFEISVQSPTHFNDNQWHHVRVERNMKEASLQVDQLT
750 760 770 780 790 800
900 910 920 930 940 950
pF1KB7 RSTRETSEEGHFRLQLNSQLFVGGTSSRQKGFLGCIRSLHLNGQKMDLEERAKVTSGVRP
.:. . .:: ::::::::::::..::.:::::::::.:::. .::::::.:: :.:
NP_001 PKTQPAPADGHVLLQLNSQLFVGGTATRQRGFLGCIRSLQLNGMTLDLEERAQVTPEVQP
810 820 830 840 850 860
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB7 GCPGHCSSYGSICHNGGKCVEKHNGYLCDCTNSPYEGPFCKKEVSAVFEAGTSVTYMFQE
:: :::::::..:.::::: :. :..:::: : : ::::..:.:: : .:.:: : :::
NP_001 GCRGHCSSYGKLCRNGGKCRERPIGFFCDCTFSAYTGPFCSNEISAYFGSGSSVIYNFQE
870 880 890 900 910 920
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB7 PYPVTKNISLSSSAIYTDSAPSKENIALSFVTTQAPSLLLFINSSSQDFVVVLLCKNGSL
: ..:: : ..... : :.: : .:: ::..::::::..: .... :.. :::::
NP_001 NYLLSKNSSSHAASFHGDMKLSREMIKFSFRTTRTPSLLLFVSSFYKEYLSVIIAKNGSL
930 940 950 960 970 980
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB7 QVRYHLNK-EETHVFTIDADNFANRRMHHLKINREGRELTIQMDQQLRLSYNFSPEVEFR
:.::.::: .: : ..: :.:. ..::. :::: . :..:.. : . ..: .::
NP_001 QIRYKLNKYQEPDVVNFDFKNMADGQLHHIMINREEGVVFIEIDDNRRRQVHLSSGTEFS
990 1000 1010 1020 1030 1040
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KB7 VIRSLTLGKVTENLGLDSEVAKANAMGFAGCMSSVQYNHIAPLKAALRHATVAPVTVHGT
...::.::.. :. .:...: :.:.::.::.:.:: .:.:::::::. . :::: :
NP_001 AVKSLVLGRILEHSDVDQDTALAGAQGFTGCLSAVQLSHVAPLKAALHPSHPDPVTVTGH
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KB7 LTESSCGFMVDSDVNAVTTVHSSSDPFGKTDEREPLTNAVRSDSAVIGGVIAVVIFIIFC
.::::: . .:... .:: .: : :.::::.::..::::::::.:::::::..:
NP_001 VTESSCMAQPGTDATSRERTHSFADHSGTIDDREPLANAIKSDSAVIGGLIAVVIFILLC
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1260 1270 1280 1290 1300
pF1KB7 IIGIMTRFLYQHKQSHRTSQMKEKEYPENLDSSFRNEIDLQNTVSECKREYFI
: .: .: .::.:. .. :. :..: .. .. ...:...::.:.: ..:::
NP_001 ITAIAVR-IYQQKRLYKRSEAKRSENVDSAEAVLKSELNIQNAVNENQKEYFF
1170 1180 1190 1200 1210 1220
>>NP_001309117 (OMIM: 610518) contactin-associated prote (1273 aa)
initn: 3950 init1: 2083 opt: 4937 Z-score: 4691.5 bits: 880.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5173; 57.1% identity (81.0% similar) in 1299 aa overlap (11-1306:12-1272)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MDSLPRLTSVLTLLFSGLWHLGLTATNYNCDDPLASLLSPMAFSSSSDLTGTHSP--AQ
: :: . :. ....:.:::::.: : .:::::.:...:.: :.
NP_001 MGSVTGAVLKTLLLLSTQNWNRVEAGNSYDCDDPLVSALPQASFSSSSELSSSHGPGFAR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LNWRVGTGGWSPADSNAQQWLQMDLGNRVEITAVATQGRYGSSDWVTSYSLMFSDTGRNW
:: : :.::::: :: ::::.:::.:.:.::::::: ::::.::::: :::::.: ::
NP_001 LNRRDGAGGWSPLVSNKYQWLQIDLGERMEVTAVATQGGYGSSNWVTSYLLMFSDSGWNW
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 KQYKQEDSIWTFAGNMNADSVVHHKLLHSVRARFVRFVPLEWNPSGKIGMRVEVYGCSYK
:::.:::::: :.:: ::::::...: :..:::.::.::::::.:.::::.::.::.:.
NP_001 KQYRQEDSIWGFSGNANADSVVYYRLQPSIKARFLRFIPLEWNPKGRIGMRIEVFGCAYR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 SDVADFDGRSSLLYRFNQKLMSTLKDVISLKFKSMQGDGVLFHGEGQRGDHITLELQKGR
:.:.:.::.:::::::.:: .: .::.::::::.::.::.:.: :: ::::::.:...:
NP_001 SEVVDLDGKSSLLYRFDQKSLSPIKDIISLKFKTMQSDGILLHREGPNGDHITLQLRRAR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 LALHLNLGDSKARLSSSLPSATLGSLLDDQHWHSVLIERVGKQVNFTVDKHTQHFRTKGE
: : .: :..: .:.: . ::::::::::::::::.:.:::::::::.: .::...::
NP_001 LFLLINSGEAKLPSTSTLVNLTLGSLLDDQHWHSVLIQRLGKQVNFTVDEHRHHFHARGE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 TDALDIDYELSFGGIPVPGKPGTFLKKNFHGCIENLYYNGVNIIDLAKRRKHQIYTVGNV
. ...:::.::::::.::: .: ..:::::.::::::::.::::::..: :: ..:::
NP_001 FNLMNLDYEISFGGIPAPGKSVSFPHRNFHGCLENLYYNGVDIIDLAKQQKPQIIAMGNV
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 TFSCSEPQIVPITFVNSSGSYLLLPGTPQIDGLSVSFQFRTWNKDGLLLSTELSEGSGTL
.::::.:: .:.::. :: ::: :: . .:..:::::::: :::: .::. :: .
NP_001 SFSCSQPQSMPVTFL-SSRSYLALPDFSGEEEVSATFQFRTWNKAGLLLFSELQLISGGI
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 LLSLEGGILRLVIQKMTERVAEILTGSNLNDGLWHSVSINARRNRITLTLDDEAAPPAPD
:: : : :. . . . ..: .: .:::: :::::..:..:......: . : ::
NP_001 LLFLSDGKLKSNLYQPGKLPSDITAGVELNDGQWHSVSLSAKKNHLSVAVDGQMASAAPL
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 STWVQIYSGNSYYFGGCPDNLTDSQCLNPIKAFQGCMRLIFIDNQPKDLISVQQGSLGNF
:::::..::::::::. :.: .:. .:::::::: :... :::::::::::::
NP_001 LGPEQIYSGGTYYFGGCPDKSFGSKCKSPLGGFQGCMRLISISGKVVDLISVQQGSLGNF
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 SDLHIDLCSIKDRCLPNYCEHGGSCSQSWTTFYCNCSDTSYTGATCHNSIYEQSCEVYRH
:::.:: :.:.:::::::::::: :::::.::.:::..:.: ::::::::::::::.:.:
NP_001 SDLQIDSCGISDRCLPNYCEHGGECSQSWSTFHCNCTNTGYRGATCHNSIYEQSCEAYKH
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB7 QGNTAGFFYIDSDGSGPLGPLQVYCNITEDKIWTSVQHNNTELTRVRGANPEKPYAMALD
.:::.::.:::::::::: :. .:::.:: :: .:::...:::::..:::.::: ..
NP_001 RGNTSGFYYIDSDGSGPLEPFLLYCNMTETA-WTIIQHNGSDLTRVRNTNPENPYAGFFE
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB7 YGGSMEQLEAVIDGSEHCEQEVAYHCRRSRLLNTPDGTPFTWWIGRSNERHPYWGGSPPG
: .:::::.:.:. .:::::: .:.:..:::.: ::::..::.::.:: . ::::: :
NP_001 YVASMEQLQATINRAEHCEQEFTYYCKKSRLVNKQDGTPLSWWVGRTNETQTYWGGSSPD
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB7 VQQCECGLDESCLDIQHFCNCDADKDEWTNDTGFLSFKDHLPVTQIVITDTDRSNSEAAW
.:.: :::. .:.: :..::::::..:::::::.:..:.:::::.:::::: : .::::.
NP_001 LQKCTCGLEGNCIDSQYYCNCDADRNEWTNDTGLLAYKEHLPVTKIVITDTGRLHSEAAY
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KB7 RIGPLRCYGDRRFWNAVSFYTEASYLHFPTFHAEFSADISFFFKTTALSGVFLENLGIKD
..::: : ::: :::..:: ::::::::::::.:.:::.:::::::: :::::::::: :
NP_001 KLGPLLCQGDRSFWNSASFDTEASYLHFPTFHGELSADVSFFFKTTASSGVFLENLGIAD
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KB7 FIRLEISSPSEITFAIDVGNGPVELVVQSPSLLNDNQWHYVRAERNLKETSLQVDNLPRS
:::.:. ::. .::..:::::: :. ::::. .::::::.::.:::.::.:::::.: .
NP_001 FIRIELRSPTVVTFSFDVGNGPFEISVQSPTHFNDNQWHHVRVERNMKEASLQVDQLTPK
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KB7 TRETSEEGHFRLQLNSQLFVGGTSSRQKGFLGCIRSLHLNGQKMDLEERAKVTSGVRPGC
:. . .:: ::::::::::::..::.:::::::::.:::. .::::::.:: :.:::
NP_001 TQPAPADGHVLLQLNSQLFVGGTATRQRGFLGCIRSLQLNGMTLDLEERAQVTPEVQPGC
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB7 PGHCSSYGSICHNGGKCVEKHNGYLCDCTNSPYEGPFCKKEVSAVFEAGTSVTYMFQEPY
:::::::..:.::::: :. :..:::: : : ::::..:.:: : .:.:: : ::: :
NP_001 RGHCSSYGKLCRNGGKCRERPIGFFCDCTFSAYTGPFCSNEISAYFGSGSSVIYNFQENY
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB7 PVTKNISLSSSAIYTDSAPSKENIALSFVTTQAPSLLLFINSSSQDFVVVLLCKNGSLQV
..:: : ..... : :.: : .:: ::..::::::..: .... :.. ::::::.
NP_001 LLSKNSSSHAASFHGDMKLSREMIKFSFRTTRTPSLLLFVSSFYKEYLSVIIAKNGSLQI
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB7 RYHLNK-EETHVFTIDADNFANRRMHHLKINREGRELTIQMDQQLRLSYNFSPEVEFRVI
::.::: .: : ..: :.:. ..::. :::: . :..:.. : . ..: .:: ..
NP_001 RYKLNKYQEPDVVNFDFKNMADGQLHHIMINREEGVVFIEIDDNRRRQVHLSSGTEFSAV
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KB7 RSLTLGKVTENLGLDSEVAKANAMGFAGCMSSVQYNHIAPLKAALRHATVAPVTVHGTLT
.::.::.. :. .:...: : : .:
NP_001 KSLVLGRILEHSDVDQDTALA-----------------------------------GHVT
1140 1150 1160
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KB7 ESSCGFMVDSDVNAVTTVHSSSDPFGKTDEREPLTNAVRSDSAVIGGVIAVVIFIIFCII
:::: . .:... .:: .: : :.::::.::..::::::::.:::::::..::
NP_001 ESSCMAQPGTDATSRERTHSFADHSGTIDDREPLANAIKSDSAVIGGLIAVVIFILLCIT
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1260 1270 1280 1290 1300
pF1KB7 GIMTRFLYQHKQSHRTSQMKEKEYPENLDSSFRNEIDLQNTVSECKREYFI
.: .: .::.:. .. :. :..: .. .. ...:...::.:.: ..:::
NP_001 AIAVR-IYQQKRLYKRSEAKRSENVDSAEAVLKSELNIQNAVNENQKEYFF
1230 1240 1250 1260 1270
>>NP_001309109 (OMIM: 610518) contactin-associated prote (1179 aa)
initn: 4311 init1: 2083 opt: 4886 Z-score: 4643.5 bits: 871.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4886; 58.4% identity (83.5% similar) in 1179 aa overlap (129-1306:3-1178)
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 SSDWVTSYSLMFSDTGRNWKQYKQEDSIWTFAGNMNADSVVHHKLLHSVRARFVRFVPLE
:.:: ::::::...: :..:::.::.:::
NP_001 MGFSGNANADSVVYYRLQPSIKARFLRFIPLE
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 WNPSGKIGMRVEVYGCSYKSDVADFDGRSSLLYRFNQKLMSTLKDVISLKFKSMQGDGVL
:::.:.::::.::.::.:.:.:.:.::.:::::::.:: .: .::.::::::.::.::.:
NP_001 WNPKGRIGMRIEVFGCAYRSEVVDLDGKSSLLYRFDQKSLSPIKDIISLKFKTMQSDGIL
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 FHGEGQRGDHITLELQKGRLALHLNLGDSKARLSSSLPSATLGSLLDDQHWHSVLIERVG
.: :: ::::::.:...:: : .: :..: .:.: . ::::::::::::::::.:.:
NP_001 LHREGPNGDHITLQLRRARLFLLINSGEAKLPSTSTLVNLTLGSLLDDQHWHSVLIQRLG
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 KQVNFTVDKHTQHFRTKGETDALDIDYELSFGGIPVPGKPGTFLKKNFHGCIENLYYNGV
::::::::.: .::...:: . ...:::.::::::.::: .: ..:::::.::::::::
NP_001 KQVNFTVDEHRHHFHARGEFNLMNLDYEISFGGIPAPGKSVSFPHRNFHGCLENLYYNGV
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 NIIDLAKRRKHQIYTVGNVTFSCSEPQIVPITFVNSSGSYLLLPGTPQIDGLSVSFQFRT
.::::::..: :: ..:::.::::.:: .:.::. :: ::: :: . .:..:::::
NP_001 DIIDLAKQQKPQIIAMGNVSFSCSQPQSMPVTFL-SSRSYLALPDFSGEEEVSATFQFRT
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 WNKDGLLLSTELSEGSGTLLLSLEGGILRLVIQKMTERVAEILTGSNLNDGLWHSVSINA
::: :::: .::. :: .:: : : :. . . . ..: .: .:::: :::::..:
NP_001 WNKAGLLLFSELQLISGGILLFLSDGKLKSNLYQPGKLPSDITAGVELNDGQWHSVSLSA
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 RRNRITLTLDDEAAPPAPDSTWVQIYSGNSYYFGGCPDNLTDSQCLNPIKAFQGCMRLIF
..:......: . : :: :::::..::::::::. :.: .:. .::::::::
NP_001 KKNHLSVAVDGQMASAAPLLGPEQIYSGGTYYFGGCPDKSFGSKCKSPLGGFQGCMRLIS
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KB7 IDNQPKDLISVQQGSLGNFSDLHIDLCSIKDRCLPNYCEHGGSCSQSWTTFYCNCSDTSY
:... ::::::::::::::::.:: :.:.:::::::::::: :::::.::.:::..:.:
NP_001 ISGKVVDLISVQQGSLGNFSDLQIDSCGISDRCLPNYCEHGGECSQSWSTFHCNCTNTGY
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KB7 TGATCHNSIYEQSCEVYRHQGNTAGFFYIDSDGSGPLGPLQVYCNITEDKIWTSVQHNNT
::::::::::::::.:.:.:::.::.:::::::::: :. .:::.:: :: .:::..
NP_001 RGATCHNSIYEQSCEAYKHRGNTSGFYYIDSDGSGPLEPFLLYCNMTETA-WTIIQHNGS
460 470 480 490 500 510
640 650 660 670 680 690
pF1KB7 ELTRVRGANPEKPYAMALDYGGSMEQLEAVIDGSEHCEQEVAYHCRRSRLLNTPDGTPFT
.:::::..:::.::: ..: .:::::.:.:. .:::::: .:.:..:::.: ::::..
NP_001 DLTRVRNTNPENPYAGFFEYVASMEQLQATINRAEHCEQEFTYYCKKSRLVNKQDGTPLS
520 530 540 550 560 570
700 710 720 730 740 750
pF1KB7 WWIGRSNERHPYWGGSPPGVQQCECGLDESCLDIQHFCNCDADKDEWTNDTGFLSFKDHL
::.::.:: . ::::: : .:.: :::. .:.: :..::::::..:::::::.:..:.::
NP_001 WWVGRTNETQTYWGGSSPDLQKCTCGLEGNCIDSQYYCNCDADRNEWTNDTGLLAYKEHL
580 590 600 610 620 630
760 770 780 790 800 810
pF1KB7 PVTQIVITDTDRSNSEAAWRIGPLRCYGDRRFWNAVSFYTEASYLHFPTFHAEFSADISF
:::.:::::: : .::::...::: : ::: :::..:: ::::::::::::.:.:::.::
NP_001 PVTKIVITDTGRLHSEAAYKLGPLLCQGDRSFWNSASFDTEASYLHFPTFHGELSADVSF
640 650 660 670 680 690
820 830 840 850 860 870
pF1KB7 FFKTTALSGVFLENLGIKDFIRLEISSPSEITFAIDVGNGPVELVVQSPSLLNDNQWHYV
:::::: :::::::::: ::::.:. ::. .::..:::::: :. ::::. .::::::.:
NP_001 FFKTTASSGVFLENLGIADFIRIELRSPTVVTFSFDVGNGPFEISVQSPTHFNDNQWHHV
700 710 720 730 740 750
880 890 900 910 920 930
pF1KB7 RAERNLKETSLQVDNLPRSTRETSEEGHFRLQLNSQLFVGGTSSRQKGFLGCIRSLHLNG
:.:::.::.:::::.: .:. . .:: ::::::::::::..::.:::::::::.:::
NP_001 RVERNMKEASLQVDQLTPKTQPAPADGHVLLQLNSQLFVGGTATRQRGFLGCIRSLQLNG
760 770 780 790 800 810
940 950 960 970 980 990
pF1KB7 QKMDLEERAKVTSGVRPGCPGHCSSYGSICHNGGKCVEKHNGYLCDCTNSPYEGPFCKKE
. .::::::.:: :.::: :::::::..:.::::: :. :..:::: : : ::::..:
NP_001 MTLDLEERAQVTPEVQPGCRGHCSSYGKLCRNGGKCRERPIGFFCDCTFSAYTGPFCSNE
820 830 840 850 860 870
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB7 VSAVFEAGTSVTYMFQEPYPVTKNISLSSSAIYTDSAPSKENIALSFVTTQAPSLLLFIN
.:: : .:.:: : ::: : ..:: : ..... : :.: : .:: ::..::::::..
NP_001 ISAYFGSGSSVIYNFQENYLLSKNSSSHAASFHGDMKLSREMIKFSFRTTRTPSLLLFVS
880 890 900 910 920 930
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KB7 SSSQDFVVVLLCKNGSLQVRYHLNK-EETHVFTIDADNFANRRMHHLKINREGRELTIQM
: .... :.. ::::::.::.::: .: : ..: :.:. ..::. :::: . :..
NP_001 SFYKEYLSVIIAKNGSLQIRYKLNKYQEPDVVNFDFKNMADGQLHHIMINREEGVVFIEI
940 950 960 970 980 990
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KB7 DQQLRLSYNFSPEVEFRVIRSLTLGKVTENLGLDSEVAKANAMGFAGCMSSVQYNHIAPL
:.. : . ..: .:: ...::.::.. :. .:...: :.:.::.::.:.:: .:.:::
NP_001 DDNRRRQVHLSSGTEFSAVKSLVLGRILEHSDVDQDTALAGAQGFTGCLSAVQLSHVAPL
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KB7 KAALRHATVAPVTVHGTLTESSCGFMVDSDVNAVTTVHSSSDPFGKTDEREPLTNAVRSD
::::. . :::: : .::::: . .:... .:: .: : :.::::.::..::
NP_001 KAALHPSHPDPVTVTGHVTESSCMAQPGTDATSRERTHSFADHSGTIDDREPLANAIKSD
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KB7 SAVIGGVIAVVIFIIFCIIGIMTRFLYQHKQSHRTSQMKEKEYPENLDSSFRNEIDLQNT
::::::.:::::::..:: .: .: .::.:. .. :. :..: .. .. ...:...::.
NP_001 SAVIGGLIAVVIFILLCITAIAVR-IYQQKRLYKRSEAKRSENVDSAEAVLKSELNIQNA
1120 1130 1140 1150 1160
1300
pF1KB7 VSECKREYFI
:.: ..:::
NP_001 VNENQKEYFF
1170
>>NP_387504 (OMIM: 610517) contactin-associated protein- (1288 aa)
initn: 4274 init1: 1815 opt: 4805 Z-score: 4566.1 bits: 857.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4805; 54.2% identity (79.6% similar) in 1281 aa overlap (10-1279:11-1286)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MDSLPRLTSVLTLLFSGLWHLGLTATNYNCDDPLASLLSPMAFSSSSDLTGTHSP--AQ
:: :: . : ... .:: :::: : .:::::.:...:.: ..
NP_387 MASVAWAVLKVLLLLPTQTWSPVGAGNPPDCDAPLASALPRSSFSSSSELSSSHGPGFSR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LNWRVGTGGWSPADSNAQQWLQMDLGNRVEITAVATQGRYGSSDWVTSYSLMFSDTGRNW
:: : :.:::.: :: ::::.:::.:.:.::::::: :::::::::: ::::: ::::
NP_387 LNRRDGAGGWTPLVSNKYQWLQIDLGERMEVTAVATQGGYGSSDWVTSYLLMFSDGGRNW
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 KQYKQEDSIWTFAGNMNADSVVHHKLLHSVRARFVRFVPLEWNPSGKIGMRVEVYGCSYK
:::..:.::: : :: :::::::..: .:::.::.:: ::: :.::::.:::::.::
NP_387 KQYRREESIWGFPGNTNADSVVHYRLQPPFEARFLRFLPLAWNPRGRIGMRIEVYGCAYK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 SDVADFDGRSSLLYRFNQKLMSTLKDVISLKFKSMQGDGVLFHGEGQRGDHITLELQKGR
:.:. :::.:.::::...: .. ..::::::::.::..:.:.: :::.:.:::::: ::.
NP_387 SEVVYFDGQSALLYRLDKKPLKPIRDVISLKFKAMQSNGILLHREGQHGNHITLELIKGK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 LALHLNLGDSKARLSSSL-P-SATLGSLLDDQHWHSVLIERVGKQVNFTVDKHTQHFRTK
:.. :: :. :.: :.. : . ::::::::::::::::: . ::::::::::.::..:
NP_387 LVFFLNSGN--AKLPSTIAPVTLTLGSLLDDQHWHSVLIELLDTQVNFTVDKHTHHFQAK
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 GETDALDIDYELSFGGIPVPGKPGTFLKKNFHGCIENLYYNGVNIIDLAKRRKHQIYTVG
:... ::...:.::::::.::. .: .:.::::.::::::::.. .:::..: :: .:
NP_387 GDSSYLDLNFEISFGGIPTPGRSRAFRRKSFHGCLENLYYNGVDVTELAKKHKPQILMMG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 NVTFSCSEPQIVPITFVNSSGSYLLLPGTPQIDGLSVSFQFRTWNKDGLLLSTELSEGSG
::.::: .:: ::.::. :: ::: :::. : .::.:::::::. : :: :: .:::
NP_387 NVSFSCPQPQTVPVTFL-SSRSYLALPGNSGEDKVSVTFQFRTWNRAGHLLFGELRRGSG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 TLLLSLEGGILRLVIQKMTERVAEILTGSNLNDGLWHSVSINARRNRITLTLDDEAAPPA
...: :. : :.: . . . .. .:..:::: :::::..:. .......::..: .
NP_387 SFVLFLKDGKLKLSLFQPGQSPRNVTAGAGLNDGQWHSVSFSAKWSHMNVVVDDDTA--V
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 PDSTWVQIYSGNSYYFGGCPDNLTDSQCLNPIKAFQGCMRLIFIDNQPKDLISVQQGSLG
. : : ::..:::::: :: . : : .:. .::::.::: : .. : : ::::.::
NP_387 QPLVAVLIDSGDTYYFGGCLDNSSGSGCKSPLGGFQGCLRLITIGDKAVDPILVQQGALG
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 NFSDLHIDLCSIKDRCLPNYCEHGGSCSQSWTTFYCNCSDTSYTGATCHNSIYEQSCEVY
.: ::.:: :.: :::::.:::::: ::::: :: :.: :.::: :::.:.::::::..
NP_387 SFRDLQIDSCGITDRCLPSYCEHGGECSQSWDTFSCDCLGTGYTGETCHSSLYEQSCEAH
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB7 RHQGNTAGFFYIDSDGSGPLGPLQVYCNITEDKIWTSVQHNNTELTRVRGANPEKPY-AM
.:.:: .:..:::.::::::::. ::::.: : :: :::.. . . .::: .: :.
NP_387 KHRGNPSGLYYIDADGSGPLGPFLVYCNMTADAAWTVVQHGGPDAVTLRGAPSGHPRSAV
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB7 ALDYGGSMEQLEAVIDGSEHCEQEVAYHCRRSRLLNTPDGTPFTWWIGRSNERHPYWGGS
.. :... ::..... .:.:::..: .: .: .. ::::..::.::.:: : ::::
NP_387 SFAYAAGAGQLRSAVNLAERCEQRLALRCGTARRPDSRDGTPLSWWVGRTNETHTSWGGS
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB7 PPGVQQCECGLDESCLDIQHFCNCDADKDEWTNDTGFLSFKDHLPVTQIVITDTDRSNSE
: .:.: :::. .:.: :..::::: ..:::.:: :: :.::::::::.::. : .::
NP_387 LPDAQKCTCGLEGNCIDSQYYCNCDAGRNEWTSDTIVLSQKEHLPVTQIVMTDAGRPHSE
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KB7 AAWRIGPLRCYGDRRFWNAVSFYTEASYLHFPTFHAEFSADISFFFKTTALSGVFLENLG
::. .::: : ::. :::..:: ::.::::::.::.:..::. ::::::. ::::.::::
NP_387 AAYTLGPLLCRGDQSFWNSASFNTETSYLHFPAFHGELTADVCFFFKTTVSSGVFMENLG
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KB7 IKDFIRLEISSPSEITFAIDVGNGPVELVVQSPSLLNDNQWHYVRAERNLKETSLQVDNL
: ::::.:. .:.:.::..:::::: :..::::. .::::::.::::::.: .:::::.:
NP_387 ITDFIRIELRAPTEVTFSFDVGNGPCEVTVQSPTPFNDNQWHHVRAERNVKGASLQVDQL
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KB7 PRSTRETSEEGHFRLQLNSQLFVGGTSSRQKGFLGCIRSLHLNGQKMDLEERAKVTSGVR
:.. . . .:: :::::::::.:::..::.:::::::::.::: .:::::: :: ::.
NP_387 PQKMQPAPADGHVRLQLNSQLFIGGTATRQRGFLGCIRSLQLNGVALDLEERATVTPGVE
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB7 PGCPGHCSSYGSICHNGGKCVEKHNGYLCDCTNSPYEGPFCKKEVSAVFEAGTSVTYMFQ
::: ::::.:: .:.:::.: ::. : :::. : :.::::..:.:: : .:.:.:: ::
NP_387 PGCAGHCSTYGHLCRNGGRCREKRRGVTCDCAFSAYDGPFCSNEISAYFATGSSMTYHFQ
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB7 EPYPVTKNISLSSSAIYTDSAPSKENIALSFVTTQAPSLLLFINSSSQDFVVVLLCKNGS
: : ...: : :... : . ..: :.::: ::..:::::...: .... :.: .:::
NP_387 EHYTLSENSSSLVSSLHRDVTLTREMITLSFRTTRTPSLLLYVSSFYEEYLSVILANNGS
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB7 LQVRYHLNKEET-HVFTIDADNFANRRMHHLKINREGRELTIQMDQQLRLSYNFSPEVEF
::.::.:..... .::.: :.:. ..:..::::: . ....:. . . .: .::
NP_387 LQIRYKLDRHQNPDAFTFDFKNMADGQLHQVKINREEAVVMVEVNQSTKKQVILSSGTEF
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KB7 RVIRSLTLGKVTENLGLDSEVAKANAMGFAGCMSSVQYNHIAPLKAALRHATVAPVTVHG
...:: :::: : : : .. .: . ::.::.:.:.... :::::::: . . :::.:
NP_387 NAVKSLILGKVLEAAGADPDTRRAATSGFTGCLSAVRFGRAAPLKAALRPSGPSRVTVRG
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1200 1210 1220 1230 1240
pF1KB7 TLTE-SSCGFMVDSDVNA---VTTVHSSSDPFGKTDEREPLTNAVRSDSAVIGGVIAVVI
.. . :. . : : . . ... : .:: :::.:: : :::::::::::::
NP_387 HVAPMARCAAGAASGSPARELAPRLAGGAGRSGPADEGEPLVNADRRDSAVIGGVIAVVI
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KB7 FIIFCIIGIMTRFLYQHK-QSHRTSQMKEKEYPENLDSSFRNEIDLQNTVSECKREYFI
::..:: .: :. :.: ... :....::
NP_387 FILLCITAIAIRIYQQRKLRKENESKVSKKEEC
1260 1270 1280
1307 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 18:05:18 2016 done: Thu Nov 3 18:05:20 2016
Total Scan time: 10.170 Total Display time: 0.640
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]