Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6616
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6616, 433 aa
1>>>pF1KB6616 433 - 433 aa - 433 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3483+/-0.000952; mu= 8.2264+/- 0.056
mean_var=187.8423+/-42.164, 0's: 0 Z-trim(111.3): 663 B-trim: 171 in 1/50
Lambda= 0.093579
statistics sampled from 11472 (12240) to 11472 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.733), E-opt: 0.2 (0.376), width: 16
Scan time: 3.290
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45896.1 STK11 gene_id:6794|Hs108|chr19 ( 433) 2940 409.5 3.2e-114
CCDS3932.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 ( 559) 599 93.6 5.2e-19
CCDS605.1 PRKAA2 gene_id:5563|Hs108|chr1 ( 552) 574 90.2 5.4e-18
CCDS3933.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 ( 574) 559 88.2 2.2e-17
CCDS12921.1 BRSK1 gene_id:84446|Hs108|chr19 ( 778) 527 84.0 5.5e-16
CCDS60696.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 614) 522 83.3 7.5e-16
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CCDS58106.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 674) 522 83.3 8e-16
CCDS58107.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 736) 522 83.3 8.5e-16
CCDS58108.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 766) 522 83.4 8.7e-16
CCDS59123.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 610) 513 82.0 1.7e-15
CCDS6606.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 651) 513 82.1 1.8e-15
CCDS13610.1 HUNK gene_id:30811|Hs108|chr21 ( 714) 511 81.8 2.3e-15
CCDS73034.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 780) 505 81.1 4.3e-15
CCDS31029.2 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 795) 505 81.1 4.4e-15
CCDS73033.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 796) 505 81.1 4.4e-15
CCDS515.1 PLK3 gene_id:1263|Hs108|chr1 ( 646) 490 79.0 1.5e-14
CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 729) 481 77.8 3.9e-14
CCDS10851.1 PSKH1 gene_id:5681|Hs108|chr16 ( 424) 477 77.0 3.9e-14
CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 744) 481 77.8 4e-14
CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 753) 481 77.8 4e-14
CCDS75250.1 PLK2 gene_id:10769|Hs108|chr5 ( 671) 478 77.4 4.9e-14
CCDS3974.1 PLK2 gene_id:10769|Hs108|chr5 ( 685) 478 77.4 5e-14
CCDS59126.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 619) 474 76.8 6.7e-14
CCDS53651.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 709) 472 76.6 8.9e-14
CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 719) 472 76.6 9e-14
CCDS8051.2 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 724) 472 76.6 9e-14
CCDS41665.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 745) 472 76.6 9.2e-14
CCDS53649.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 788) 472 76.6 9.6e-14
CCDS31892.1 NUAK1 gene_id:9891|Hs108|chr12 ( 661) 468 76.0 1.2e-13
CCDS9216.1 CAMKK2 gene_id:10645|Hs108|chr12 ( 588) 466 75.7 1.4e-13
CCDS11038.1 CAMKK1 gene_id:84254|Hs108|chr17 ( 505) 463 75.2 1.6e-13
CCDS44999.1 CAMKK2 gene_id:10645|Hs108|chr12 ( 533) 463 75.2 1.7e-13
CCDS9218.1 CAMKK2 gene_id:10645|Hs108|chr12 ( 541) 463 75.2 1.7e-13
CCDS58283.1 CAMKK2 gene_id:10645|Hs108|chr12 ( 556) 463 75.2 1.7e-13
CCDS55947.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 713) 463 75.4 2.1e-13
CCDS73561.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 422) 458 74.4 2.3e-13
CCDS55895.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 433) 458 74.5 2.3e-13
CCDS9354.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 729) 458 74.7 3.4e-13
CCDS81762.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 740) 458 74.7 3.4e-13
CCDS12658.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 688) 455 74.3 4.3e-13
CCDS56097.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 752) 455 74.3 4.5e-13
CCDS2582.1 CAMK1 gene_id:8536|Hs108|chr3 ( 370) 445 72.6 7.1e-13
CCDS43075.1 SNRK gene_id:54861|Hs108|chr3 ( 765) 447 73.2 9.7e-13
CCDS82645.1 LOC102724428 gene_id:102724428|Hs108|c ( 783) 441 72.4 1.7e-12
CCDS33575.1 SIK1 gene_id:150094|Hs108|chr21 ( 783) 441 72.4 1.7e-12
CCDS7092.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 357) 434 71.1 1.9e-12
CCDS9217.1 CAMKK2 gene_id:10645|Hs108|chr12 ( 545) 437 71.7 2e-12
CCDS53837.1 CAMKK2 gene_id:10645|Hs108|chr12 ( 490) 436 71.5 2e-12
CCDS9219.1 CAMKK2 gene_id:10645|Hs108|chr12 ( 498) 436 71.6 2e-12
>>CCDS45896.1 STK11 gene_id:6794|Hs108|chr19 (433 aa)
initn: 2940 init1: 2940 opt: 2940 Z-score: 2164.2 bits: 409.5 E(32554): 3.2e-114
Smith-Waterman score: 2940; 100.0% identity (100.0% similar) in 433 aa overlap (1-433:1-433)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MEVVDPQQLGMFTEGELMSVGMDTFIHRIDSTEVIYQPRRKRAKLIGKYLMGDLLGEGSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MEVVDPQQLGMFTEGELMSVGMDTFIHRIDSTEVIYQPRRKRAKLIGKYLMGDLLGEGSY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 GKVKEVLDSETLCRRAVKILKKKKLRRIPNGEANVKKEIQLLRRLRHKNVIQLVDVLYNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GKVKEVLDSETLCRRAVKILKKKKLRRIPNGEANVKKEIQLLRRLRHKNVIQLVDVLYNE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 EKQKMYMVMEYCVCGMQEMLDSVPEKRFPVCQAHGYFCQLIDGLEYLHSQGIVHKDIKPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EKQKMYMVMEYCVCGMQEMLDSVPEKRFPVCQAHGYFCQLIDGLEYLHSQGIVHKDIKPG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 NLLLTTGGTLKISDLGVAEALHPFAADDTCRTSQGSPAFQPPEIANGLDTFSGFKVDIWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NLLLTTGGTLKISDLGVAEALHPFAADDTCRTSQGSPAFQPPEIANGLDTFSGFKVDIWS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 AGVTLYNITTGLYPFEGDNIYKLFENIGKGSYAIPGDCGPPLSDLLKGMLEYEPAKRFSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AGVTLYNITTGLYPFEGDNIYKLFENIGKGSYAIPGDCGPPLSDLLKGMLEYEPAKRFSI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 RQIRQHSWFRKKHPPAEAPVPIPPSPDTKDRWRSMTVVPYLEDLHGADEDEDLFDIEDDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RQIRQHSWFRKKHPPAEAPVPIPPSPDTKDRWRSMTVVPYLEDLHGADEDEDLFDIEDDI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 IYTQDFTVPGQVPEEEASHNGQRRGLPKAVCMNGTEAAQLSTKSRAEGRAPNPARKACSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IYTQDFTVPGQVPEEEASHNGQRRGLPKAVCMNGTEAAQLSTKSRAEGRAPNPARKACSA
370 380 390 400 410 420
430
pF1KB6 SSKIRRLSACKQQ
:::::::::::::
CCDS45 SSKIRRLSACKQQ
430
>>CCDS3932.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 (559 aa)
initn: 541 init1: 243 opt: 599 Z-score: 454.8 bits: 93.6 E(32554): 5.2e-19
Smith-Waterman score: 602; 36.3% identity (65.8% similar) in 284 aa overlap (37-319:16-289)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 QQLGMFTEGELMSVGMDTFIHRIDSTEVIYQPRRKRAKLIGKYLMGDLLGEGSYGKVKEV
: . :.: ::.:..:: :: :..::::
CCDS39 MRRLSSWRKMATAEKQKHDGRVK-IGHYILGDTLGVGTFGKVKVG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LDSETLCRRAVKILKKKKLRRIPNGEANVKKEIQLLRRLRHKNVIQLVDVLYNEEKQKMY
: . :::::...:.: . . .....::: :. .:: ..:.: .:. . . ..
CCDS39 KHELTGHKVAVKILNRQKIRSL-DVVGKIRREIQNLKLFRHPHIIKLYQVISTP--SDIF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 MVMEYCVCGMQEMLDSVPEK-RFPVCQAHGYFCQLIDGLEYLHSQGIVHKDIKPGNLLLT
::::: : :..: . .. :. ... : :...:..: : . .::.:.:: :.::
CCDS39 MVMEYVSGG--ELFDYICKNGRLDEKESRRLFQQILSGVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLD
110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 TGGTLKISDLGVAEALHPFAADDTCRTSQGSPAFQPPEIANGLDTFSGFKVDIWSAGVTL
. . ::.:.:... . . . ::: ::: . ::. .: ..: .:::::.:: :
CCDS39 AHMNAKIADFGLSNMM---SDGEFLRTSCGSPNYAAPEVISG-RLYAGPEVDIWSSGVIL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 YNITTGLYPFEGDNIYKLFENIGKGSYAIPGDCGPPLSDLLKGMLEYEPAKRFSIRQIRQ
: . : ::. :.. ::..: : . : .: . .::: ::. .: :: .:..::.
CCDS39 YALLCGTLPFDDDHVPTLFKKICDGIFYTPQYLNPSVISLLKHMLQVDPMKRATIKDIRE
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 HSWFRKKHPPAEAPVPIPPSPDTKDRWRSMTVVPYLEDLHGADEDEDLFDIEDDIIYTQD
: ::.. : :
CCDS39 HEWFKQDLPKYLFPEDPSYSSTMIDDEALKEVCEKFECSEEEVLSCLYNRNHQDPLAVAY
280 290 300 310 320 330
>>CCDS605.1 PRKAA2 gene_id:5563|Hs108|chr1 (552 aa)
initn: 542 init1: 221 opt: 574 Z-score: 436.6 bits: 90.2 E(32554): 5.4e-18
Smith-Waterman score: 577; 36.0% identity (64.0% similar) in 292 aa overlap (37-327:5-284)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 QQLGMFTEGELMSVGMDTFIHRIDSTEVIYQPRRKRAKLIGKYLMGDLLGEGSYGKVKEV
: . :.: ::.:..:: :: :..::::
CCDS60 MAEKQKHDGRVK-IGHYVLGDTLGVGTFGKVKIG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LDSETLCRRAVKILKKKKLRRIPNGEANVKKEIQLLRRLRHKNVIQLVDVLYNEEKQKMY
. : . :::::...:.: . . ...:.::: :. .:: ..:.: .:. . ..
CCDS60 EHQLTGHKVAVKILNRQKIRSL-DVVGKIKREIQNLKLFRHPHIIKLYQVISTPT--DFF
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 MVMEYCVCGMQEMLDSVPEK-RFPVCQAHGYFCQLIDGLEYLHSQGIVHKDIKPGNLLLT
::::: : :..: . .. : .:. : :......: : . .::.:.:: :.::
CCDS60 MVMEYVSGG--ELFDYICKHGRVEEMEARRLFQQILSAVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLD
100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 TGGTLKISDLGVAEALHPFAADDTCRTSQGSPAFQPPEIANGLDTFSGFKVDIWSAGVTL
. . ::.:.:... . . . ::: ::: . ::. .: ..: .::::: :: :
CCDS60 AHMNAKIADFGLSNMM---SDGEFLRTSCGSPNYAAPEVISG-RLYAGPEVDIWSCGVIL
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 YNITTGLYPFEGDNIYKLFENIGKGSYAIPGDCGPPLSDLLKGMLEYEPAKRFSIRQIRQ
: . : ::. ... ::..: : . :: . .. :: ::. .: :: .:..::.
CCDS60 YALLCGTLPFDDEHVPTLFKKIRGGVFYIPEYLNRSVATLLMHMLQVDPLKRATIKDIRE
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 HSWFRKKHPPAEAPVPIPPSPDTKDRWRSMTVVPYLEDLHGADEDEDLFDIEDDIIYTQD
: ::.. : : :: :
CCDS60 HEWFKQDLPSYL--FPEDPSYDANVIDDEAVKEVCEKFECTESEVMNSLYSGDPQDQLAV
270 280 290 300 310 320
>>CCDS3933.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 (574 aa)
initn: 541 init1: 243 opt: 559 Z-score: 425.4 bits: 88.2 E(32554): 2.2e-17
Smith-Waterman score: 576; 35.1% identity (62.9% similar) in 299 aa overlap (37-319:16-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 QQLGMFTEGELMSVGMDTFIHRIDSTEVIYQPRRKRAKLIGKYLMGDLLGEGSYGKVKEV
: . :.: ::.:..:: :: :..::::
CCDS39 MRRLSSWRKMATAEKQKHDGRVK-IGHYILGDTLGVGTFGKVKVG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LDSETLCRRAVKILKKKKLRRIPNGEANVKKEIQLLRRLRHKNVIQLVDVLYNEEKQKMY
: . :::::...:.: . . .....::: :. .:: ..:.: .:. . . ..
CCDS39 KHELTGHKVAVKILNRQKIRSL-DVVGKIRREIQNLKLFRHPHIIKLYQVISTP--SDIF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB6 MVMEYCVCGMQEMLD---------SVP-------EKRFPVCQAHGYFCQLIDGLEYLHSQ
::::: : :..: .:: :.. ... : :...:..: : .
CCDS39 MVMEYVSGG--ELFDYICKNGRKSDVPGVVKTGSTKELDEKESRRLFQQILSGVDYCHRH
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 GIVHKDIKPGNLLLTTGGTLKISDLGVAEALHPFAADDTCRTSQGSPAFQPPEIANGLDT
.::.:.:: :.:: . . ::.:.:... . . . ::: ::: . ::. .:
CCDS39 MVVHRDLKPENVLLDAHMNAKIADFGLSNMM---SDGEFLRTSCGSPNYAAPEVISG-RL
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 FSGFKVDIWSAGVTLYNITTGLYPFEGDNIYKLFENIGKGSYAIPGDCGPPLSDLLKGML
..: .:::::.:: :: . : ::. :.. ::..: : . : .: . .::: ::
CCDS39 YAGPEVDIWSSGVILYALLCGTLPFDDDHVPTLFKKICDGIFYTPQYLNPSVISLLKHML
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 EYEPAKRFSIRQIRQHSWFRKKHPPAEAPVPIPPSPDTKDRWRSMTVVPYLEDLHGADED
. .: :: .:..::.: ::.. : :
CCDS39 QVDPMKRATIKDIREHEWFKQDLPKYLFPEDPSYSSTMIDDEALKEVCEKFECSEEEVLS
280 290 300 310 320 330
>>CCDS12921.1 BRSK1 gene_id:84446|Hs108|chr19 (778 aa)
initn: 463 init1: 252 opt: 527 Z-score: 400.5 bits: 84.0 E(32554): 5.5e-16
Smith-Waterman score: 587; 30.9% identity (59.1% similar) in 421 aa overlap (41-426:26-429)
20 30 40 50 60 70
pF1KB6 MFTEGELMSVGMDTFIHRIDSTEVIYQPRRKRAKLIGKYLMGDLLGEGSYGKVKEVLDSE
..:. .: : . ::.:. : :: .
CCDS12 MSSGAKEGGGGSPAYHLPHPHPHPPQHAQYVGPYRLEKTLGKGQTGLVKLGVHCI
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 TLCRRAVKILKKKKLRRIPNGEANVKKEIQLLRRLRHKNVIQLVDVLYNEEKQKMYMVME
: . :.::....:: . . .:..:: .:. ..: .:..: :: :.:. .:.:.:
CCDS12 TGQKVAIKIVNREKLSE--SVLMKVEREIAILKLIEHPHVLKLHDVY--ENKKYLYLVLE
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180
pF1KB6 YCVCGMQEMLDSVPEK-RFPVCQAHGYFCQLIDGLEYLHSQGIVHKDIKPGNLLLTTGGT
. : :..: . .: :. .:. .: :....:.. :: .: :.:.:: :::: ..
CCDS12 HVSGG--ELFDYLVKKGRLTPKEARKFFRQIVSALDFCHSYSICHRDLKPENLLLDEKNN
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LKISDLGVAEALHPFAADDTCRTSQGSPAFQPPEIANGLDTFSGFKVDIWSAGVTLYNIT
..:.:.:.: .:. ..:. .:: ::: . ::. .: . ..: ..:.:: :: :. .
CCDS12 IRIADFGMA-SLQ--VGDSLLETSCGSPHYACPEVIKG-EKYDGRRADMWSCGVILFALL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 TGLYPFEGDNIYKLFENIGKGSYAIPGDCGPPLSDLLKGMLEYEPAKRFSIRQIRQHSWF
.: ::. ::. .:.:.. .: . .: : ..::.::.: :: ::.:..::..: :.
CCDS12 VGALPFDDDNLRQLLEKVKRGVFHMPHFIPPDCQSLLRGMIEVEPEKRLSLEQIQKHPWY
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KB6 RK-KHPPAEAPVPIP---------PS-----PDTKDRWRSMTVVPYLEDLH----GADED
:: : : : :: ::. . :. : :: . .:.
CCDS12 LGGKHEPDPCLEPAPGRRVAMRSLPSNGELDPDVLESMASLGCFRDRERLHRELRSEEEN
290 300 310 320 330 340
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pF1KB6 ED------LFD-------IED-DIIYTQDFTVPGQ-VPEEEASHNGQRRGLPKAVCMNGT
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