Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6602
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6602, 430 aa
1>>>pF1KB6602 430 - 430 aa - 430 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6166+/-0.00134; mu= 3.5575+/- 0.080
mean_var=206.7844+/-40.933, 0's: 0 Z-trim(106.9): 98 B-trim: 83 in 2/50
Lambda= 0.089190
statistics sampled from 9168 (9264) to 9168 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.616), E-opt: 0.2 (0.285), width: 16
Scan time: 2.740
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31809.1 KRT18 gene_id:3875|Hs108|chr12 ( 430) 2668 356.3 3.4e-98
CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 ( 472) 1159 162.1 1e-39
CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 ( 473) 1110 155.8 8.2e-38
CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17 ( 400) 1108 155.5 8.6e-38
CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 ( 456) 1096 154.0 2.8e-37
CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17 ( 432) 1091 153.3 4.2e-37
CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 458) 1075 151.3 1.8e-36
CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 420) 1070 150.6 2.7e-36
CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 ( 584) 1063 149.8 6.4e-36
CCDS11395.1 KRT36 gene_id:8689|Hs108|chr17 ( 467) 1024 144.8 1.7e-34
CCDS11372.1 KRT24 gene_id:192666|Hs108|chr17 ( 525) 1012 143.2 5.6e-34
CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17 ( 494) 995 141.0 2.4e-33
CCDS11394.2 KRT35 gene_id:3886|Hs108|chr17 ( 455) 990 140.4 3.5e-33
CCDS11379.1 KRT20 gene_id:54474|Hs108|chr17 ( 424) 981 139.2 7.5e-33
CCDS11393.1 KRT32 gene_id:3882|Hs108|chr17 ( 448) 961 136.6 4.7e-32
CCDS11388.1 KRT33A gene_id:3883|Hs108|chr17 ( 404) 953 135.6 8.8e-32
CCDS11391.1 KRT31 gene_id:3881|Hs108|chr17 ( 416) 953 135.6 9e-32
CCDS11389.1 KRT33B gene_id:3884|Hs108|chr17 ( 404) 930 132.6 6.8e-31
CCDS11376.1 KRT28 gene_id:162605|Hs108|chr17 ( 464) 916 130.9 2.6e-30
CCDS11375.1 KRT27 gene_id:342574|Hs108|chr17 ( 459) 905 129.4 7e-30
CCDS32654.1 KRT9 gene_id:3857|Hs108|chr17 ( 623) 900 128.9 1.4e-29
CCDS11373.1 KRT25 gene_id:147183|Hs108|chr17 ( 450) 897 128.4 1.4e-29
CCDS11390.1 KRT34 gene_id:3885|Hs108|chr17 ( 436) 891 127.6 2.3e-29
CCDS11380.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17 ( 422) 855 123.0 5.7e-28
CCDS11374.1 KRT26 gene_id:353288|Hs108|chr17 ( 468) 851 122.5 8.8e-28
CCDS11382.1 KRT39 gene_id:390792|Hs108|chr17 ( 491) 843 121.5 1.9e-27
CCDS42320.1 KRT40 gene_id:125115|Hs108|chr17 ( 431) 819 118.3 1.4e-26
CCDS11392.1 KRT38 gene_id:8687|Hs108|chr17 ( 456) 819 118.4 1.5e-26
CCDS32653.1 KRT37 gene_id:8688|Hs108|chr17 ( 449) 814 117.7 2.3e-26
CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10 ( 466) 677 100.1 4.8e-21
CCDS33859.1 BFSP2 gene_id:8419|Hs108|chr3 ( 415) 644 95.8 8.3e-20
CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12 ( 469) 637 95.0 1.7e-19
CCDS62182.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17 ( 285) 632 94.1 1.8e-19
CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2 ( 470) 632 94.3 2.7e-19
CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 483) 623 93.2 6.1e-19
CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 511) 623 93.2 6.4e-19
CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 432) 620 92.7 7.3e-19
CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 431) 611 91.6 1.6e-18
CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 438) 609 91.3 2e-18
CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8 ( 916) 614 92.2 2.2e-18
CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8 ( 543) 593 89.3 9.7e-18
CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12 ( 551) 587 88.6 1.7e-17
CCDS8783.1 PRPH gene_id:5630|Hs108|chr12 ( 470) 575 87.0 4.3e-17
CCDS8824.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12 ( 507) 570 86.4 7.1e-17
CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10 ( 499) 569 86.2 7.7e-17
CCDS44895.1 KRT3 gene_id:3850|Hs108|chr12 ( 628) 567 86.0 1.1e-16
CCDS8830.1 KRT5 gene_id:3852|Hs108|chr12 ( 590) 565 85.8 1.3e-16
CCDS8823.1 KRT83 gene_id:3889|Hs108|chr12 ( 493) 562 85.3 1.4e-16
CCDS8825.1 KRT84 gene_id:3890|Hs108|chr12 ( 600) 557 84.7 2.6e-16
CCDS41785.1 KRT86 gene_id:3892|Hs108|chr12 ( 486) 555 84.4 2.6e-16
>>CCDS31809.1 KRT18 gene_id:3875|Hs108|chr12 (430 aa)
initn: 2668 init1: 2668 opt: 2668 Z-score: 1876.3 bits: 356.3 E(32554): 3.4e-98
Smith-Waterman score: 2668; 100.0% identity (100.0% similar) in 430 aa overlap (1-430:1-430)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSFTTRSTFSTNYRSLGSVQAPSYGARPVSSAASVYAGAGGSGSRISVSRSTSFRGGMGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MSFTTRSTFSTNYRSLGSVQAPSYGARPVSSAASVYAGAGGSGSRISVSRSTSFRGGMGS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 GGLATGIAGGLAGMGGIQNEKETMQSLNDRLASYLDRVRSLETENRRLESKIREHLEKKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GGLATGIAGGLAGMGGIQNEKETMQSLNDRLASYLDRVRSLETENRRLESKIREHLEKKG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 PQVRDWSHYFKIIEDLRAQIFANTVDNARIVLQIDNARLAADDFRVKYETELAMRQSVEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PQVRDWSHYFKIIEDLRAQIFANTVDNARIVLQIDNARLAADDFRVKYETELAMRQSVEN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 DIHGLRKVIDDTNITRLQLETEIEALKEELLFMKKNHEEEVKGLQAQIASSGLTVEVDAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DIHGLRKVIDDTNITRLQLETEIEALKEELLFMKKNHEEEVKGLQAQIASSGLTVEVDAP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 KSQDLAKIMADIRAQYDELARKNREELDKYWSQQIEESTTVVTTQSAEVGAAETTLTELR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KSQDLAKIMADIRAQYDELARKNREELDKYWSQQIEESTTVVTTQSAEVGAAETTLTELR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 RTVQSLEIDLDSMRNLKASLENSLREVEARYALQMEQLNGILLHLESELAQTRAEGQRQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RTVQSLEIDLDSMRNLKASLENSLREVEARYALQMEQLNGILLHLESELAQTRAEGQRQA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 QEYEALLNIKVKLEAEIATYRRLLEDGEDFNLGDALDSSNSMQTIQKTTTRRIVDGKVVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QEYEALLNIKVKLEAEIATYRRLLEDGEDFNLGDALDSSNSMQTIQKTTTRRIVDGKVVS
370 380 390 400 410 420
430
pF1KB6 ETNDTKVLRH
::::::::::
CCDS31 ETNDTKVLRH
430
>>CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 (472 aa)
initn: 618 init1: 482 opt: 1159 Z-score: 826.4 bits: 162.1 E(32554): 1e-39
Smith-Waterman score: 1171; 48.2% identity (78.2% similar) in 427 aa overlap (17-428:38-461)
10 20 30 40
pF1KB6 MSFTTRSTFSTNYRSLGSVQAPS-YGAR-PVSSAASVYAGA----G
:: .::: ::. :::. .:: :
CCDS11 FTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSSRFSSGGACGLGG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KB6 GSGSRISVSRST---SFRGGMGSG---GLATGIAGGLAGMGG--IQNEKETMQSLNDRLA
: :. .: : :. .: ::.:.: ::. :..::.:: : . .:: :::.::::::
CCDS11 GYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQNLNDRLA
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 SYLDRVRSLETENRRLESKIREHLEKKGP-QVRDWSHYFKIIEDLRAQIFANTVDNARIV
::::.::.:: : :: :::. ... : ...:.: ::: ::::: .:.. ::::: ..
CCDS11 SYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIKDYSPYFKTIEDLRNKILTATVDNANVL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 LQIDNARLAADDFRVKYETELAMRQSVENDIHGLRKVIDDTNITRLQLETEIEALKEELL
::::::::::::::.:::::: .:.::: ::.:::.:.:. ...: .:: .::.:::::
CCDS11 LQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIESLKEELA
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 FMKKNHEEEVKGLQAQIASSGLTVEVDAPKSQDLAKIMADIRAQYDELARKNREELDKYW
..:::::::...:..:.... ..::.:: . ::..:. ..: ::...:.:::.. ....
CCDS11 YLKKNHEEEMNALRGQVGGD-VNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEEWF
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 SQQIEESTTVVTTQSAEVGAAETTLTELRRTVQSLEIDLDSMRNLKASLENSLREVEARY
. :: . :.:.: : .... ..:::::.:.:::.:.:. ..::::::::.:...::
CCDS11 FTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASLENSLEETKGRY
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 ALQMEQLNGILLHLESELAQTRAEGQRQAQEYEALLNIKVKLEAEIATYRRLLEDGEDFN
.:. :.. .. .: .::: : : ..: :::. ::..:..:: :::::::::: ::: .
CCDS11 CMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLE-GEDAH
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430
pF1KB6 LGDALDSSNSMQTIQKTTTRRIVDGKVVSETNDTKVLRH
:... ::.:... . :.. : . ::. ...: ::.
CCDS11 LSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQIRTKVM-DVHDGKVVSTHEQVLRTKN
430 440 450 460 470
>>CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 (473 aa)
initn: 571 init1: 474 opt: 1110 Z-score: 792.3 bits: 155.8 E(32554): 8.2e-38
Smith-Waterman score: 1132; 46.0% identity (76.6% similar) in 428 aa overlap (17-426:38-456)
10 20 30
pF1KB6 MSFTTRSTFSTNYRSLGSVQAPS-YG------ARPVSSAASVYAGA
:: .::: :: .: :..: .:.
CCDS11 FTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSRFSSGGACGLGGG
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80
pF1KB6 GGSGSRISVSRSTSFRGGMGSGGLATGIAGGL-AGMGG---------IQNEKETMQSLND
:.: : : ...: ::.: :::..:..::: ::.:: . .:: :::.:::
CCDS11 YGGGFSSSSSFGSGFGGGYG-GGLGAGFGGGLGAGFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQNLND
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 RLASYLDRVRSLETENRRLESKIREHLEKKGP-QVRDWSHYFKIIEDLRAQIFANTVDNA
:::::::.::.:: : :: :::. ... : ...:.: ::: ::::: .:.: :..::
CCDS11 RLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPSEIKDYSPYFKTIEDLRNKIIAATIENA
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 RIVLQIDNARLAADDFRVKYETELAMRQSVENDIHGLRKVIDDTNITRLQLETEIEALKE
. .::::::::::::::.::: :::.::.:: :..:::.:.:. ...: .:: .::.:::
CCDS11 QPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKE
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 ELLFMKKNHEEEVKGLQAQIASSGLTVEVDAPKSQDLAKIMADIRAQYDELARKNREELD
:: ...::::::. .:..: ... ..::.:: . ::..:. ..: ::...:.:::.. .
CCDS11 ELAYLRKNHEEEMLALRGQ-TGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEQMAEKNRRDAE
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 KYWSQQIEESTTVVTTQSAEVGAAETTLTELRRTVQSLEIDLDSMRNLKASLENSLREVE
.. .. :: . :...: : .... .:::::..:.:::.:.:. ..::::::::.:..
CCDS11 TWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQLSMKASLENSLEETK
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 ARYALQMEQLNGILLHLESELAQTRAEGQRQAQEYEALLNIKVKLEAEIATYRRLLEDGE
.:: .:. :..:.. .: .::: : : ..:.:::. ::..:..:: :::::::::: ::
CCDS11 GRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQEIATYRRLLE-GE
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430
pF1KB6 DFNLGDALDSSNSMQTIQKTTTRRIVDGKVVSETNDTKVLRH
: .: :... . :. ..:.. .. : . .:.
CCDS11 DAHL------SSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFSQGQSS
430 440 450 460 470
>>CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17 (400 aa)
initn: 571 init1: 494 opt: 1108 Z-score: 791.9 bits: 155.5 E(32554): 8.6e-38
Smith-Waterman score: 1108; 46.7% identity (78.7% similar) in 394 aa overlap (2-389:3-389)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSFTTR-STFSTNYRSLGSVQAPSYGARPVSSAASVYAGAGGSGSRISVSR--STSFRG
:.. : :. .... .::. . .: . : :...:.:: : .: .: :.: :
CCDS11 MTSYSYRQSSATSSFGGLGG-GSVRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFVSSSSSG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 --GMGSGGLATGIAGGLAGMGGIQNEKETMQSLNDRLASYLDRVRSLETENRRLESKIRE
: : ::. :. : ::: ::: :::.::::::::::.::.::. : .:: :::.
CCDS11 AYGGGYGGVLTASDGLLAG-----NEKLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 HLEKKGP-QVRDWSHYFKIIEDLRAQIFANTVDNARIVLQIDNARLAADDFRVKYETELA
.:.:: ::.:::. :.::: .:.. :..:.:::::::::::::::::.:.::: :
CCDS11 WYQKQGPGPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 MRQSVENDIHGLRKVIDDTNITRLQLETEIEALKEELLFMKKNHEEEVKGLQAQIASSGL
.:.::: ::.:::.:.:. ...: .:: .::.::::: ..:::::::.. :..:.... .
CCDS11 LRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQ-V
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 TVEVDAPKSQDLAKIMADIRAQYDELARKNREELDKYWSQQIEESTTVVTTQSAEVGAAE
.::::. . :::::..:.:.::. .:..::.. . ..... :: . :. .. .. ..
CCDS11 SVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 TTLTELRRTVQSLEIDLDSMRNLKASLENSLREVEARYALQMEQLNGILLHLESELAQTR
. .:.::::.:.:::.:.:. ..::.::..: :.:::.. :. ...... .:..:...:
CCDS11 SEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 AEGQRQAQEYEALLNIKVKLEAEIATYRRLLEDGEDFNLGDALDSSNSMQTIQKTTTRRI
:...:: :::. :..:: .:: :::::: ::: ::
CCDS11 ADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL
360 370 380 390 400
420 430
pF1KB6 VDGKVVSETNDTKVLRH
>>CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 (456 aa)
initn: 1143 init1: 439 opt: 1096 Z-score: 782.8 bits: 154.0 E(32554): 2.8e-37
Smith-Waterman score: 1108; 45.8% identity (78.0% similar) in 413 aa overlap (25-420:40-450)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSFTTRSTFSTNYRSLGSVQAPSYGARPVSSAASVYAGAGGSGSRISVSRSTSF
:.: .:.... ....:..:. . : .:
CCDS11 SSTFGGGSTRGGSLLAGGGGFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSGGGYGGGMRVCGF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KB6 RGGMGS---GGLATGIAGGLAGM-----GGIQ--NEKETMQSLNDRLASYLDRVRSLETE
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CCDS11 GGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLASYLDKVRALEEA
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 NRRLESKIREHLEKKGPQVR--DWSHYFKIIEDLRAQIFANTVDNARIVLQIDNARLAAD
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CCDS11 NADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRVILEIDNARLAAD
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 DFRVKYETELAMRQSVENDIHGLRKVIDDTNITRLQLETEIEALKEELLFMKKNHEEEVK
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CCDS11 DFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEELAYLKKNHEEEMK
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230 240 250 260 270 280
pF1KB6 GLQAQIASSGLTVEVDAPKSQDLAKIMADIRAQYDELARKNREELDKYWSQQIEESTTVV
...:.:.. ..::.:: . ::....:..: ::. .:.:::.... .. .. :: . :
CCDS11 EFSSQLAGQ-VNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDVEAWFFSKTEELNKEV
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 TTQSAEVGAAETTLTELRRTVQSLEIDLDSMRNLKASLENSLREVEARYALQMEQLNGIL
.... . ...: .:.::::.: :::.:.:. ..::.::::: :.: ::: :..:..:..
CCDS11 ASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSLAETECRYATQLQQIQGLI
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 LHLESELAQTRAEGQRQAQEYEALLNIKVKLEAEIATYRRLLEDGEDFNL-GDALDSSNS
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CCDS11 GGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLE-GQDAKMAGIAIREASS
370 380 390 400 410 420
410 420 430
pF1KB6 ----MQTIQKTTTRRIVDGKVVSETNDTKVLRH
.. . .... :::.:::
CCDS11 GGGGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI
430 440 450
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CCDS11 QFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRLGSAGGLGSTLGGSSYSSCYSFGSG
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CCDS11 GGYGSSFGGVDGLLAG-----GEKATMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQ
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pF1KB6 KKGP-QVRDWSHYFKIIEDLRAQIFANTVDNARIVLQIDNARLAADDFRVKYETELAMRQ
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CCDS11 RQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRL
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CCDS11 SVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGE-INVE
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pF1KB6 VDAPKSQDLAKIMADIRAQYDELARKNREELDKYWSQQIEESTTVVTTQSAEVGAAETTL
.:: . ::..:. ..: ::...:.:::.. . .. .. :: . :.:.: : .... .
CCDS11 MDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEI
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pF1KB6 TELRRTVQSLEIDLDSMRNLKASLENSLREVEARYALQMEQLNGILLHLESELAQTRAEG
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CCDS11 SELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEM
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360 370 380 390 400 410
pF1KB6 QRQAQEYEALLNIKVKLEAEIATYRRLLEDGEDFNLGDALDSSNSMQTIQKTTTRRIVDG
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CCDS11 EQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLE-GEDAHLTQYKKEPVTTRQV-RTIVEEVQDG
370 380 390 400 410
420 430
pF1KB6 KVVSETNDTKVLRH
::.:
CCDS11 KVISSREQVHQTTR
420 430
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10 20 30
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CCDS11 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQLGGGRGVSTCSTRFVSGGS--AGGYG-------GGVSC
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40 50 60 70 80
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CCDS11 TIENNRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQI
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pF1KB6 EALKEELLFMKKNHEEEVKGLQAQIASSGLTVEVDAPKSQDLAKIMADIRAQYDELARKN
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CCDS11 ESLNEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQ-VNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERN
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pF1KB6 REELDKYWSQQIEESTTVVTTQSAEVGAAETTLTELRRTVQSLEIDLDSMRNLKASLENS
:.. .... . : . :.:..: . ...: .::::::.:.:::.:.:. ..::.:::.
CCDS11 RRDAEEWFHTKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENT
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330 340 350 360 370 380
pF1KB6 LREVEARYALQMEQLNGILLHLESELAQTRAEGQRQAQEYEALLNIKVKLEAEIATYRRL
. :.: :::::..:..:.. .:..:.. :.: . : :::. ::.::..:: :::::: :
CCDS11 VAETECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSL
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pF1KB6 LEDGEDFNLGDALDSSNSMQTIQKTTTRRIVDGKVVSETNDTKVLRH
:: :.: .. .. :: . . ..:.. ...:.. .:
CCDS11 LE-GQDAKMI-GFPSSAGSVSPRSTSVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP
410 420 430 440 450
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10 20 30
pF1KB6 MSFTTRSTFSTNYRSLGSVQAPSYGARPVSSAASVYA
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CCDS11 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQLGGGRGVSTCSTRFVSGGS--AGGYGG-------GVSC
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40 50 60 70 80
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pF1KB6 TVDNARIVLQIDNARLAADDFRVKYETELAMRQSVENDIHGLRKVIDDTNITRLQLETEI
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CCDS11 TIENNRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQI
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pF1KB6 EALKEELLFMKKNHEEEVKGLQAQIASSGLTVEVDAPKSQDLAKIMADIRAQYDELARKN
:.:.::: .::::::::.: .. :.... ..::.:: . ::....:..: ::. .:..:
CCDS11 ESLNEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQ-VNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERN
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pF1KB6 REELDKYWSQQIEESTTVVTTQSAEVGAAETTLTELRRTVQSLEIDLDSMRNLKASLENS
:.. .... . : . :.:..: . ...: .::::::.:.:::.:.:. ..::.:::.
CCDS11 RRDAEEWFHTKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENT
290 300 310 320 330 340
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pF1KB6 LREVEARYALQMEQLNGILLHLESELAQTRAEGQRQAQEYEALLNIKVKLEAEIATYRRL
. :.: :::::..:..:.. .:..:.. :.: . : :::. ::.::..:: :::::: :
CCDS11 VAETECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSL
350 360 370 380 390 400
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pF1KB6 LEDGEDFNLGDALDSSNSMQTIQKTTTRRIVDGKVVSETNDTKVLRH
:: :.:
CCDS11 LE-GQDAKKRQPP
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10 20 30
pF1KB6 MSFTTRSTFSTNYRSLGSVQAPSY-GARPVSSAASVYAG
: .: .::. . :. :. :: .. :.:
CCDS11 GSLGGGFSSGGFSGGSFSRGSSGGGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSSFGGSYGG
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pF1KB6 AGGSGSRISVSRST-SFRGG-MGSGGLATGIAGGLAGMGGIQ--NEKETMQSLNDRLASY
:.:: . : . :: :: .:.::.. :..::..: ::. ::: :::.::::::::
CCDS11 IFGGGSFGGGSFGGGSFGGGGFGGGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASY
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pF1KB6 LDRVRSLETENRRLESKIREHLEKKGP----QVRDWSHYFKIIEDLRAQIFANTVDNARI
::.::.:: : .::.::.: ::.: . ::.:.:.: :.::. ::. :.::: :
CCDS11 LDKVRALEESNYELEGKIKEWYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANI
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pF1KB6 VLQIDNARLAADDFRVKYETELAMRQSVENDIHGLRKVIDDTNITRLQLETEIEALKEEL
.::::::::::::::.:::.:.:.::::: ::.:::.:.:. ..:. .:: .::.: :::
CCDS11 LLQIDNARLAADDFRLKYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEEL
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pF1KB6 LFMKKNHEEEVKGLQAQIASSGLTVEVDAPKSQDLAKIMADIRAQYDELARKNREELDKY
..:::::::.: :. ..... ..::..: . ::.... ..:.::..::..::.. . .
CCDS11 AYLKKNHEEEMKDLR-NVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAW
290 300 310 320 330
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pF1KB6 WSQQIEESTTVVTTQSAEVGAAETTLTELRRTVQSLEIDLDSMRNLKASLENSLREVEAR
.... .: :: . .. .... .. .:::::.::.:::.:.:. :: ::: :: :.:.:
CCDS11 FNEKSKELTTEIDNNIEQISSYKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGR
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 YALQMEQLNGILLHLESELAQTRAEGQRQAQEYEALLNIKVKLEAEIATYRRLLEDGEDF
: .:. :... . :: .: : ::: . : ::. ::.::..:: :: ::: ::: ::
CCDS11 YCVQLSQIQAQISALEEQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLE-GEGS
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430
pF1KB6 NLGDALDSSNSMQTIQKTTTRRIVDGKVVSETNDTKVLRH
. :
CCDS11 SGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGGGSSGGGHGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSS
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>>CCDS11395.1 KRT36 gene_id:8689|Hs108|chr17 (467 aa)
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10 20 30 40
pF1KB6 MSFTTRSTFSTNYRSLGSVQAPSY-GARP-VSSAASVYAGAG
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CCDS11 MATQTCTPTFSTGSIKGLCGTAGGISRVSSIRSVGSCRVPSLAGAAGYISSARSGLSGLG
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. :: .: :: : .:::: :.. : .:::::: ::::::.::..:
CCDS11 SCLPGSYLSSECHTS--GFVGSGGWFC--EGSFNG-----SEKETMQFLNDRLANYLEKV
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CCDS11 RQLERENAELESRIQEWYEFQIPYICPDYQSYFKTIEDFQQKILLTKSENARLVLQIDNA
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CCDS11 KLAADDFRTKYETELSLRQLVEADINGLRRILDELTLCKADLEAQVESLKEELMCLKKNH
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::::. :. :... :.::::: :: ::. :.: ::. :...::.... ... : ::
CCDS11 EEEVSVLRCQLGDR-LNVEVDAAPPVDLNKILEDMRCQYEALVENNRRDVEAWFNTQTEE
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. :...: .. .: . ::::::..:::.:....... :::..: :.::::. :. :
CCDS11 LNQQVVSSSEQLQCCQTEIIELRRTVNALEIELQAQHSMRNSLESTLAETEARYSSQLAQ
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.. .. ..:..:.. : . .:: :::..::..:..::.::::::.::: ::: .:
CCDS11 MQCLISNVEAQLSEIRCDLERQNQEYQVLLDVKARLEGEIATYRHLLE-GEDCKLPPQPC
360 370 380 390 400
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pF1KB6 SSNSMQTIQKTTTRRIVDGKVVSETNDTKVLRH
CCDS11 ATACKPVIRVPSVPPVPCVPSVPCTPAPQVGTQIRTITEEIRDGKVISSREHVQSRPL
410 420 430 440 450 460
430 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]