Result of FASTA (omim) for
pF1KB6577
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6577, 377 aa
1>>>pF1KB6577 377 - 377 aa - 377 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8833+/-0.000542; mu= -6.8579+/- 0.033
mean_var=383.1169+/-89.303, 0's: 0 Z-trim(114.8): 181 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.065525
statistics sampled from 24673 (24847) to 24673 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.672), E-opt: 0.2 (0.291), width: 16
Scan time: 8.600
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006144 (OMIM: 600508) cytoplasmic protein NCK1 ( 377) 2556 256.5 7.6e-68
NP_001278928 (OMIM: 600508) cytoplasmic protein NC ( 377) 2556 256.5 7.6e-68
NP_001177725 (OMIM: 600508) cytoplasmic protein NC ( 313) 2075 210.9 3.3e-54
XP_016860594 (OMIM: 604930) PREDICTED: cytoplasmic ( 380) 1794 184.4 3.7e-46
XP_016860592 (OMIM: 604930) PREDICTED: cytoplasmic ( 380) 1794 184.4 3.7e-46
NP_003572 (OMIM: 604930) cytoplasmic protein NCK2 ( 380) 1794 184.4 3.7e-46
XP_011510293 (OMIM: 604930) PREDICTED: cytoplasmic ( 380) 1794 184.4 3.7e-46
XP_006712860 (OMIM: 604930) PREDICTED: cytoplasmic ( 380) 1794 184.4 3.7e-46
XP_016860593 (OMIM: 604930) PREDICTED: cytoplasmic ( 380) 1794 184.4 3.7e-46
NP_001004720 (OMIM: 604930) cytoplasmic protein NC ( 380) 1794 184.4 3.7e-46
XP_011510294 (OMIM: 604930) PREDICTED: cytoplasmic ( 83) 424 54.1 1.3e-07
NP_001004722 (OMIM: 604930) cytoplasmic protein NC ( 83) 424 54.1 1.3e-07
>>NP_006144 (OMIM: 600508) cytoplasmic protein NCK1 isof (377 aa)
initn: 2556 init1: 2556 opt: 2556 Z-score: 1339.0 bits: 256.5 E(85289): 7.6e-68
Smith-Waterman score: 2556; 100.0% identity (100.0% similar) in 377 aa overlap (1-377:1-377)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAEEVVVVAKFDYVAQQEQELDIKKNERLWLLDDSKSWWRVRNSMNKTGFVPSNYVERKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MAEEVVVVAKFDYVAQQEQELDIKKNERLWLLDDSKSWWRVRNSMNKTGFVPSNYVERKN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 SARKASIVKNLKDTLGIGKVKRKPSVPDSASPADDSFVDPGERLYDLNMPAYVKFNYMAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SARKASIVKNLKDTLGIGKVKRKPSVPDSASPADDSFVDPGERLYDLNMPAYVKFNYMAE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 REDELSLIKGTKVIVMEKCSDGWWRGSYNGQVGWFPSNYVTEEGDSPLGDHVGSLSEKLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 REDELSLIKGTKVIVMEKCSDGWWRGSYNGQVGWFPSNYVTEEGDSPLGDHVGSLSEKLA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 AVVNNLNTGQVLHVVQALYPFSSSNDEELNFEKGDVMDVIEKPENDPEWWKCRKINGMVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AVVNNLNTGQVLHVVQALYPFSSSNDEELNFEKGDVMDVIEKPENDPEWWKCRKINGMVG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LVPKNYVTVMQNNPLTSGLEPSPPQCDYIRPSLTGKFAGNPWYYGKVTRHQAEMALNERG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LVPKNYVTVMQNNPLTSGLEPSPPQCDYIRPSLTGKFAGNPWYYGKVTRHQAEMALNERG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 HEGDFLIRDSESSPNDFSVSLKAQGKNKHFKVQLKETVYCIGQRKFSTMEELVEHYKKAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 HEGDFLIRDSESSPNDFSVSLKAQGKNKHFKVQLKETVYCIGQRKFSTMEELVEHYKKAP
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB6 IFTSEQGEKLYLVKHLS
:::::::::::::::::
NP_006 IFTSEQGEKLYLVKHLS
370
>>NP_001278928 (OMIM: 600508) cytoplasmic protein NCK1 i (377 aa)
initn: 2556 init1: 2556 opt: 2556 Z-score: 1339.0 bits: 256.5 E(85289): 7.6e-68
Smith-Waterman score: 2556; 100.0% identity (100.0% similar) in 377 aa overlap (1-377:1-377)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAEEVVVVAKFDYVAQQEQELDIKKNERLWLLDDSKSWWRVRNSMNKTGFVPSNYVERKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAEEVVVVAKFDYVAQQEQELDIKKNERLWLLDDSKSWWRVRNSMNKTGFVPSNYVERKN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 SARKASIVKNLKDTLGIGKVKRKPSVPDSASPADDSFVDPGERLYDLNMPAYVKFNYMAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SARKASIVKNLKDTLGIGKVKRKPSVPDSASPADDSFVDPGERLYDLNMPAYVKFNYMAE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 REDELSLIKGTKVIVMEKCSDGWWRGSYNGQVGWFPSNYVTEEGDSPLGDHVGSLSEKLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REDELSLIKGTKVIVMEKCSDGWWRGSYNGQVGWFPSNYVTEEGDSPLGDHVGSLSEKLA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 AVVNNLNTGQVLHVVQALYPFSSSNDEELNFEKGDVMDVIEKPENDPEWWKCRKINGMVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVVNNLNTGQVLHVVQALYPFSSSNDEELNFEKGDVMDVIEKPENDPEWWKCRKINGMVG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LVPKNYVTVMQNNPLTSGLEPSPPQCDYIRPSLTGKFAGNPWYYGKVTRHQAEMALNERG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVPKNYVTVMQNNPLTSGLEPSPPQCDYIRPSLTGKFAGNPWYYGKVTRHQAEMALNERG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 HEGDFLIRDSESSPNDFSVSLKAQGKNKHFKVQLKETVYCIGQRKFSTMEELVEHYKKAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HEGDFLIRDSESSPNDFSVSLKAQGKNKHFKVQLKETVYCIGQRKFSTMEELVEHYKKAP
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB6 IFTSEQGEKLYLVKHLS
:::::::::::::::::
NP_001 IFTSEQGEKLYLVKHLS
370
>>NP_001177725 (OMIM: 600508) cytoplasmic protein NCK1 i (313 aa)
initn: 2075 init1: 2075 opt: 2075 Z-score: 1094.2 bits: 210.9 E(85289): 3.3e-54
Smith-Waterman score: 2075; 98.7% identity (99.7% similar) in 307 aa overlap (71-377:7-313)
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 VRNSMNKTGFVPSNYVERKNSARKASIVKNLKDTLGIGKVKRKPSVPDSASPADDSFVDP
.:: ..::::::::::::::::::::::::
NP_001 MDWLNVFKDFFSIGKVKRKPSVPDSASPADDSFVDP
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 GERLYDLNMPAYVKFNYMAEREDELSLIKGTKVIVMEKCSDGWWRGSYNGQVGWFPSNYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GERLYDLNMPAYVKFNYMAEREDELSLIKGTKVIVMEKCSDGWWRGSYNGQVGWFPSNYV
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 TEEGDSPLGDHVGSLSEKLAAVVNNLNTGQVLHVVQALYPFSSSNDEELNFEKGDVMDVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TEEGDSPLGDHVGSLSEKLAAVVNNLNTGQVLHVVQALYPFSSSNDEELNFEKGDVMDVI
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 EKPENDPEWWKCRKINGMVGLVPKNYVTVMQNNPLTSGLEPSPPQCDYIRPSLTGKFAGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKPENDPEWWKCRKINGMVGLVPKNYVTVMQNNPLTSGLEPSPPQCDYIRPSLTGKFAGN
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 PWYYGKVTRHQAEMALNERGHEGDFLIRDSESSPNDFSVSLKAQGKNKHFKVQLKETVYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PWYYGKVTRHQAEMALNERGHEGDFLIRDSESSPNDFSVSLKAQGKNKHFKVQLKETVYC
220 230 240 250 260 270
350 360 370
pF1KB6 IGQRKFSTMEELVEHYKKAPIFTSEQGEKLYLVKHLS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IGQRKFSTMEELVEHYKKAPIFTSEQGEKLYLVKHLS
280 290 300 310
>>XP_016860594 (OMIM: 604930) PREDICTED: cytoplasmic pro (380 aa)
initn: 1814 init1: 731 opt: 1794 Z-score: 949.7 bits: 184.4 E(85289): 3.7e-46
Smith-Waterman score: 1794; 69.4% identity (87.4% similar) in 382 aa overlap (1-376:1-379)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAEEVVVVAKFDYVAQQEQELDIKKNERLWLLDDSKSWWRVRNSMNKTGFVPSNYVERKN
:.:::.:.::.::.:::.::::::::::::::::::.::::::. :.::.::::::::::
XP_016 MTEEVIVIAKWDYTAQQDQELDIKKNERLWLLDDSKTWWRVRNAANRTGYVPSNYVERKN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB6 SARKASIVKNLKDTLGIGKVKRKPSVPD-SASPADDS-FVDPG---ERLYDLNMPAYVKF
: .:.:.:::::::::.::..:: :. : : .:. :. . : .:.::::.::.:::
XP_016 SLKKGSLVKNLKDTLGLGKTRRKTSARDASPTPSTDAEYPANGSGADRIYDLNIPAFVKF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 NYMAEREDELSLIKGTKVIVMEKCSDGWWRGSYNGQVGWFPSNYVTEEGDSPLGDHVGSL
:.:::::::::.::..: :::::::::::::::::.:::::::: :: : .. . :
XP_016 AYVAEREDELSLVKGSRVTVMEKCSDGWWRGSYNGQIGWFPSNYVLEEVDEAAAESPSFL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 SEKLAAVVNNLNTGQVLHVVQALYPFSSSNDEELNFEKGDVMDVIEKPENDPEWWKCRKI
: . .: ..: . ..::::::.:::::: ..::::::::..:.::::::::::::::..
XP_016 SLRKGASLSNGQGSRVLHVVQTLYPFSSVTEEELNFEKGETMEVIEKPENDPEWWKCKNA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 NGMVGLVPKNYVTVMQNNPLTSGLEPS-PPQCDYIRPSLTGKFAGNPWYYGKVTRHQAEM
:.:::::::::.:....: .:.:. :: .: :: .:.::: ::::.:::::::
XP_016 RGQVGLVPKNYVVVLSDGP---ALHPAHAPQISYTGPSSSGRFAGREWYYGNVTRHQAEC
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 ALNERGHEGDFLIRDSESSPNDFSVSLKAQGKNKHFKVQLKETVYCIGQRKFSTMEELVE
:::::: :::::::::::::.::::::::.:::::::::: ..:::::::.: ::.::::
XP_016 ALNERGVEGDFLIRDSESSPSDFSVSLKASGKNKHFKVQLVDNVYCIGQRRFHTMDELVE
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB6 HYKKAPIFTSEQGEKLYLVKHLS
:::::::::::.:::::::. :
XP_016 HYKKAPIFTSEHGEKLYLVRALQ
360 370 380
>>XP_016860592 (OMIM: 604930) PREDICTED: cytoplasmic pro (380 aa)
initn: 1814 init1: 731 opt: 1794 Z-score: 949.7 bits: 184.4 E(85289): 3.7e-46
Smith-Waterman score: 1794; 69.4% identity (87.4% similar) in 382 aa overlap (1-376:1-379)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAEEVVVVAKFDYVAQQEQELDIKKNERLWLLDDSKSWWRVRNSMNKTGFVPSNYVERKN
:.:::.:.::.::.:::.::::::::::::::::::.::::::. :.::.::::::::::
XP_016 MTEEVIVIAKWDYTAQQDQELDIKKNERLWLLDDSKTWWRVRNAANRTGYVPSNYVERKN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB6 SARKASIVKNLKDTLGIGKVKRKPSVPD-SASPADDS-FVDPG---ERLYDLNMPAYVKF
: .:.:.:::::::::.::..:: :. : : .:. :. . : .:.::::.::.:::
XP_016 SLKKGSLVKNLKDTLGLGKTRRKTSARDASPTPSTDAEYPANGSGADRIYDLNIPAFVKF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 NYMAEREDELSLIKGTKVIVMEKCSDGWWRGSYNGQVGWFPSNYVTEEGDSPLGDHVGSL
:.:::::::::.::..: :::::::::::::::::.:::::::: :: : .. . :
XP_016 AYVAEREDELSLVKGSRVTVMEKCSDGWWRGSYNGQIGWFPSNYVLEEVDEAAAESPSFL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 SEKLAAVVNNLNTGQVLHVVQALYPFSSSNDEELNFEKGDVMDVIEKPENDPEWWKCRKI
: . .: ..: . ..::::::.:::::: ..::::::::..:.::::::::::::::..
XP_016 SLRKGASLSNGQGSRVLHVVQTLYPFSSVTEEELNFEKGETMEVIEKPENDPEWWKCKNA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 NGMVGLVPKNYVTVMQNNPLTSGLEPS-PPQCDYIRPSLTGKFAGNPWYYGKVTRHQAEM
:.:::::::::.:....: .:.:. :: .: :: .:.::: ::::.:::::::
XP_016 RGQVGLVPKNYVVVLSDGP---ALHPAHAPQISYTGPSSSGRFAGREWYYGNVTRHQAEC
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 ALNERGHEGDFLIRDSESSPNDFSVSLKAQGKNKHFKVQLKETVYCIGQRKFSTMEELVE
:::::: :::::::::::::.::::::::.:::::::::: ..:::::::.: ::.::::
XP_016 ALNERGVEGDFLIRDSESSPSDFSVSLKASGKNKHFKVQLVDNVYCIGQRRFHTMDELVE
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB6 HYKKAPIFTSEQGEKLYLVKHLS
:::::::::::.:::::::. :
XP_016 HYKKAPIFTSEHGEKLYLVRALQ
360 370 380
>>NP_003572 (OMIM: 604930) cytoplasmic protein NCK2 isof (380 aa)
initn: 1814 init1: 731 opt: 1794 Z-score: 949.7 bits: 184.4 E(85289): 3.7e-46
Smith-Waterman score: 1794; 69.4% identity (87.4% similar) in 382 aa overlap (1-376:1-379)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAEEVVVVAKFDYVAQQEQELDIKKNERLWLLDDSKSWWRVRNSMNKTGFVPSNYVERKN
:.:::.:.::.::.:::.::::::::::::::::::.::::::. :.::.::::::::::
NP_003 MTEEVIVIAKWDYTAQQDQELDIKKNERLWLLDDSKTWWRVRNAANRTGYVPSNYVERKN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB6 SARKASIVKNLKDTLGIGKVKRKPSVPD-SASPADDS-FVDPG---ERLYDLNMPAYVKF
: .:.:.:::::::::.::..:: :. : : .:. :. . : .:.::::.::.:::
NP_003 SLKKGSLVKNLKDTLGLGKTRRKTSARDASPTPSTDAEYPANGSGADRIYDLNIPAFVKF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 NYMAEREDELSLIKGTKVIVMEKCSDGWWRGSYNGQVGWFPSNYVTEEGDSPLGDHVGSL
:.:::::::::.::..: :::::::::::::::::.:::::::: :: : .. . :
NP_003 AYVAEREDELSLVKGSRVTVMEKCSDGWWRGSYNGQIGWFPSNYVLEEVDEAAAESPSFL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 SEKLAAVVNNLNTGQVLHVVQALYPFSSSNDEELNFEKGDVMDVIEKPENDPEWWKCRKI
: . .: ..: . ..::::::.:::::: ..::::::::..:.::::::::::::::..
NP_003 SLRKGASLSNGQGSRVLHVVQTLYPFSSVTEEELNFEKGETMEVIEKPENDPEWWKCKNA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 NGMVGLVPKNYVTVMQNNPLTSGLEPS-PPQCDYIRPSLTGKFAGNPWYYGKVTRHQAEM
:.:::::::::.:....: .:.:. :: .: :: .:.::: ::::.:::::::
NP_003 RGQVGLVPKNYVVVLSDGP---ALHPAHAPQISYTGPSSSGRFAGREWYYGNVTRHQAEC
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 ALNERGHEGDFLIRDSESSPNDFSVSLKAQGKNKHFKVQLKETVYCIGQRKFSTMEELVE
:::::: :::::::::::::.::::::::.:::::::::: ..:::::::.: ::.::::
NP_003 ALNERGVEGDFLIRDSESSPSDFSVSLKASGKNKHFKVQLVDNVYCIGQRRFHTMDELVE
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB6 HYKKAPIFTSEQGEKLYLVKHLS
:::::::::::.:::::::. :
NP_003 HYKKAPIFTSEHGEKLYLVRALQ
360 370 380
>>XP_011510293 (OMIM: 604930) PREDICTED: cytoplasmic pro (380 aa)
initn: 1814 init1: 731 opt: 1794 Z-score: 949.7 bits: 184.4 E(85289): 3.7e-46
Smith-Waterman score: 1794; 69.4% identity (87.4% similar) in 382 aa overlap (1-376:1-379)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAEEVVVVAKFDYVAQQEQELDIKKNERLWLLDDSKSWWRVRNSMNKTGFVPSNYVERKN
:.:::.:.::.::.:::.::::::::::::::::::.::::::. :.::.::::::::::
XP_011 MTEEVIVIAKWDYTAQQDQELDIKKNERLWLLDDSKTWWRVRNAANRTGYVPSNYVERKN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB6 SARKASIVKNLKDTLGIGKVKRKPSVPD-SASPADDS-FVDPG---ERLYDLNMPAYVKF
: .:.:.:::::::::.::..:: :. : : .:. :. . : .:.::::.::.:::
XP_011 SLKKGSLVKNLKDTLGLGKTRRKTSARDASPTPSTDAEYPANGSGADRIYDLNIPAFVKF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 NYMAEREDELSLIKGTKVIVMEKCSDGWWRGSYNGQVGWFPSNYVTEEGDSPLGDHVGSL
:.:::::::::.::..: :::::::::::::::::.:::::::: :: : .. . :
XP_011 AYVAEREDELSLVKGSRVTVMEKCSDGWWRGSYNGQIGWFPSNYVLEEVDEAAAESPSFL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 SEKLAAVVNNLNTGQVLHVVQALYPFSSSNDEELNFEKGDVMDVIEKPENDPEWWKCRKI
: . .: ..: . ..::::::.:::::: ..::::::::..:.::::::::::::::..
XP_011 SLRKGASLSNGQGSRVLHVVQTLYPFSSVTEEELNFEKGETMEVIEKPENDPEWWKCKNA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 NGMVGLVPKNYVTVMQNNPLTSGLEPS-PPQCDYIRPSLTGKFAGNPWYYGKVTRHQAEM
:.:::::::::.:....: .:.:. :: .: :: .:.::: ::::.:::::::
XP_011 RGQVGLVPKNYVVVLSDGP---ALHPAHAPQISYTGPSSSGRFAGREWYYGNVTRHQAEC
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 ALNERGHEGDFLIRDSESSPNDFSVSLKAQGKNKHFKVQLKETVYCIGQRKFSTMEELVE
:::::: :::::::::::::.::::::::.:::::::::: ..:::::::.: ::.::::
XP_011 ALNERGVEGDFLIRDSESSPSDFSVSLKASGKNKHFKVQLVDNVYCIGQRRFHTMDELVE
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB6 HYKKAPIFTSEQGEKLYLVKHLS
:::::::::::.:::::::. :
XP_011 HYKKAPIFTSEHGEKLYLVRALQ
360 370 380
>>XP_006712860 (OMIM: 604930) PREDICTED: cytoplasmic pro (380 aa)
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Smith-Waterman score: 1794; 69.4% identity (87.4% similar) in 382 aa overlap (1-376:1-379)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAEEVVVVAKFDYVAQQEQELDIKKNERLWLLDDSKSWWRVRNSMNKTGFVPSNYVERKN
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: .:.:.:::::::::.::..:: :. : : .:. :. . : .:.::::.::.:::
XP_006 SLKKGSLVKNLKDTLGLGKTRRKTSARDASPTPSTDAEYPANGSGADRIYDLNIPAFVKF
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pF1KB6 HYKKAPIFTSEQGEKLYLVKHLS
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XP_006 HYKKAPIFTSEHGEKLYLVRALQ
360 370 380
>>XP_016860593 (OMIM: 604930) PREDICTED: cytoplasmic pro (380 aa)
initn: 1814 init1: 731 opt: 1794 Z-score: 949.7 bits: 184.4 E(85289): 3.7e-46
Smith-Waterman score: 1794; 69.4% identity (87.4% similar) in 382 aa overlap (1-376:1-379)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAEEVVVVAKFDYVAQQEQELDIKKNERLWLLDDSKSWWRVRNSMNKTGFVPSNYVERKN
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pF1KB6 SARKASIVKNLKDTLGIGKVKRKPSVPD-SASPADDS-FVDPG---ERLYDLNMPAYVKF
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XP_016 AYVAEREDELSLVKGSRVTVMEKCSDGWWRGSYNGQIGWFPSNYVLEEVDEAAAESPSFL
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pF1KB6 SEKLAAVVNNLNTGQVLHVVQALYPFSSSNDEELNFEKGDVMDVIEKPENDPEWWKCRKI
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XP_016 SLRKGASLSNGQGSRVLHVVQTLYPFSSVTEEELNFEKGETMEVIEKPENDPEWWKCKNA
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pF1KB6 NGMVGLVPKNYVTVMQNNPLTSGLEPS-PPQCDYIRPSLTGKFAGNPWYYGKVTRHQAEM
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XP_016 RGQVGLVPKNYVVVLSDGP---ALHPAHAPQISYTGPSSSGRFAGREWYYGNVTRHQAEC
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pF1KB6 ALNERGHEGDFLIRDSESSPNDFSVSLKAQGKNKHFKVQLKETVYCIGQRKFSTMEELVE
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XP_016 ALNERGVEGDFLIRDSESSPSDFSVSLKASGKNKHFKVQLVDNVYCIGQRRFHTMDELVE
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB6 HYKKAPIFTSEQGEKLYLVKHLS
:::::::::::.:::::::. :
XP_016 HYKKAPIFTSEHGEKLYLVRALQ
360 370 380
>>NP_001004720 (OMIM: 604930) cytoplasmic protein NCK2 i (380 aa)
initn: 1814 init1: 731 opt: 1794 Z-score: 949.7 bits: 184.4 E(85289): 3.7e-46
Smith-Waterman score: 1794; 69.4% identity (87.4% similar) in 382 aa overlap (1-376:1-379)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAEEVVVVAKFDYVAQQEQELDIKKNERLWLLDDSKSWWRVRNSMNKTGFVPSNYVERKN
:.:::.:.::.::.:::.::::::::::::::::::.::::::. :.::.::::::::::
NP_001 MTEEVIVIAKWDYTAQQDQELDIKKNERLWLLDDSKTWWRVRNAANRTGYVPSNYVERKN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB6 SARKASIVKNLKDTLGIGKVKRKPSVPD-SASPADDS-FVDPG---ERLYDLNMPAYVKF
: .:.:.:::::::::.::..:: :. : : .:. :. . : .:.::::.::.:::
NP_001 SLKKGSLVKNLKDTLGLGKTRRKTSARDASPTPSTDAEYPANGSGADRIYDLNIPAFVKF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 NYMAEREDELSLIKGTKVIVMEKCSDGWWRGSYNGQVGWFPSNYVTEEGDSPLGDHVGSL
:.:::::::::.::..: :::::::::::::::::.:::::::: :: : .. . :
NP_001 AYVAEREDELSLVKGSRVTVMEKCSDGWWRGSYNGQIGWFPSNYVLEEVDEAAAESPSFL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 SEKLAAVVNNLNTGQVLHVVQALYPFSSSNDEELNFEKGDVMDVIEKPENDPEWWKCRKI
: . .: ..: . ..::::::.:::::: ..::::::::..:.::::::::::::::..
NP_001 SLRKGASLSNGQGSRVLHVVQTLYPFSSVTEEELNFEKGETMEVIEKPENDPEWWKCKNA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 NGMVGLVPKNYVTVMQNNPLTSGLEPS-PPQCDYIRPSLTGKFAGNPWYYGKVTRHQAEM
:.:::::::::.:....: .:.:. :: .: :: .:.::: ::::.:::::::
NP_001 RGQVGLVPKNYVVVLSDGP---ALHPAHAPQISYTGPSSSGRFAGREWYYGNVTRHQAEC
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 ALNERGHEGDFLIRDSESSPNDFSVSLKAQGKNKHFKVQLKETVYCIGQRKFSTMEELVE
:::::: :::::::::::::.::::::::.:::::::::: ..:::::::.: ::.::::
NP_001 ALNERGVEGDFLIRDSESSPSDFSVSLKASGKNKHFKVQLVDNVYCIGQRRFHTMDELVE
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB6 HYKKAPIFTSEQGEKLYLVKHLS
:::::::::::.:::::::. :
NP_001 HYKKAPIFTSEHGEKLYLVRALQ
360 370 380
377 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 01:18:39 2016 done: Sat Nov 5 01:18:41 2016
Total Scan time: 8.600 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]