FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6562, 399 aa
1>>>pF1KB6562 399 - 399 aa - 399 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6499+/-0.00104; mu= -2.0969+/- 0.061
mean_var=319.7904+/-68.768, 0's: 0 Z-trim(113.7): 613 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.071720
statistics sampled from 13711 (14458) to 13711 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.761), E-opt: 0.2 (0.433), width: 16
Scan time: 1.440
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS11162.1 MAP2K4 gene_id:6416|Hs109|chr17 ( 399) 2710 294.0 1.7e-79
CCDS62095.1 MAP2K4 gene_id:6416|Hs109|chr17 ( 410) 2479 270.1 2.7e-72
CCDS11686.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs109|chr17 ( 334) 1200 137.6 1.6e-32
CCDS82194.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs109|chr17 ( 278) 1166 134.0 1.6e-31
CCDS11218.1 MAP2K3 gene_id:5606|Hs109|chr17 ( 318) 1147 132.1 7.1e-31
CCDS11217.1 MAP2K3 gene_id:5606|Hs109|chr17 ( 347) 1147 132.2 7.5e-31
CCDS74277.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs109|chr19 ( 435) 1000 117.1 3.3e-26
CCDS42491.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs109|chr19 ( 419) 995 116.5 4.6e-26
CCDS74278.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs109|chr19 ( 426) 971 114.1 2.6e-25
CCDS10216.1 MAP2K1 gene_id:5604|Hs109|chr15 ( 393) 612 76.9 3.8e-14
CCDS12120.1 MAP2K2 gene_id:5605|Hs109|chr19 ( 400) 612 76.9 3.8e-14
CCDS55970.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs109|chr15 ( 412) 553 70.8 2.7e-12
CCDS10224.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs109|chr15 ( 448) 553 70.8 2.8e-12
CCDS59108.1 STK3 gene_id:6788|Hs109|chr8 ( 519) 553 70.9 3.2e-12
CCDS47900.1 STK3 gene_id:6788|Hs109|chr8 ( 491) 552 70.8 3.3e-12
CCDS86957.1 STK4 gene_id:6789|Hs109|chr20 ( 462) 545 70.0 5.2e-12
CCDS13341.1 STK4 gene_id:6789|Hs109|chr20 ( 487) 545 70.0 5.4e-12
CCDS2549.1 STK25 gene_id:10494|Hs109|chr2 ( 426) 509 66.3 6.5e-11
>>CCDS11162.1 MAP2K4 gene_id:6416|Hs109|chr17 (399 aa)
initn: 2710 init1: 2710 opt: 2710 Z-score: 1540.8 bits: 294.0 E(33420): 1.7e-79
Smith-Waterman score: 2710; 100.0% identity (100.0% similar) in 399 aa overlap (1-399:1-399)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAAPSPSGGGGSGGGSGSGTPGPVGSPAPGHPAVSSMQGKRKALKLNFANPPFKSTARFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MAAPSPSGGGGSGGGSGSGTPGPVGSPAPGHPAVSSMQGKRKALKLNFANPPFKSTARFT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LNPNPTGVQNPHIERLRTHSIESSGKLKISPEQHWDFTAEDLKDLGEIGRGAYGSVNKMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LNPNPTGVQNPHIERLRTHSIESSGKLKISPEQHWDFTAEDLKDLGEIGRGAYGSVNKMV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 HKPSGQIMAVKRIRSTVDEKEQKQLLMDLDVVMRSSDCPYIVQFYGALFREGDCWICMEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HKPSGQIMAVKRIRSTVDEKEQKQLLMDLDVVMRSSDCPYIVQFYGALFREGDCWICMEL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 MSTSFDKFYKYVYSVLDDVIPEEILGKITLATVKALNHLKENLKIIHRDIKPSNILLDRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSTSFDKFYKYVYSVLDDVIPEEILGKITLATVKALNHLKENLKIIHRDIKPSNILLDRS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 GNIKLCDFGISGQLVDSIAKTRDAGCRPYMAPERIDPSASRQGYDVRSDVWSLGITLYEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GNIKLCDFGISGQLVDSIAKTRDAGCRPYMAPERIDPSASRQGYDVRSDVWSLGITLYEL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 ATGRFPYPKWNSVFDQLTQVVKGDPPQLSNSEEREFSPSFINFVNLCLTKDESKRPKYKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ATGRFPYPKWNSVFDQLTQVVKGDPPQLSNSEEREFSPSFINFVNLCLTKDESKRPKYKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KB6 LLKHPFILMYEERAVEVACYVCKILDQMPATPSSPMYVD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LLKHPFILMYEERAVEVACYVCKILDQMPATPSSPMYVD
370 380 390
>>CCDS62095.1 MAP2K4 gene_id:6416|Hs109|chr17 (410 aa)
initn: 2437 init1: 2437 opt: 2479 Z-score: 1411.5 bits: 270.1 E(33420): 2.7e-72
Smith-Waterman score: 2678; 97.3% identity (97.3% similar) in 410 aa overlap (1-399:1-410)
10 20 30 40
pF1KB6 MAAPSPSGGGGSGGGSGSGTPGPVGSPAPGHPAVSSMQG-----------KRKALKLNFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS62 MAAPSPSGGGGSGGGSGSGTPGPVGSPAPGHPAVSSMQGFQINFCEKAQSKRKALKLNFA
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 NPPFKSTARFTLNPNPTGVQNPHIERLRTHSIESSGKLKISPEQHWDFTAEDLKDLGEIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 NPPFKSTARFTLNPNPTGVQNPHIERLRTHSIESSGKLKISPEQHWDFTAEDLKDLGEIG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 RGAYGSVNKMVHKPSGQIMAVKRIRSTVDEKEQKQLLMDLDVVMRSSDCPYIVQFYGALF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 RGAYGSVNKMVHKPSGQIMAVKRIRSTVDEKEQKQLLMDLDVVMRSSDCPYIVQFYGALF
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 REGDCWICMELMSTSFDKFYKYVYSVLDDVIPEEILGKITLATVKALNHLKENLKIIHRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 REGDCWICMELMSTSFDKFYKYVYSVLDDVIPEEILGKITLATVKALNHLKENLKIIHRD
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 IKPSNILLDRSGNIKLCDFGISGQLVDSIAKTRDAGCRPYMAPERIDPSASRQGYDVRSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 IKPSNILLDRSGNIKLCDFGISGQLVDSIAKTRDAGCRPYMAPERIDPSASRQGYDVRSD
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 VWSLGITLYELATGRFPYPKWNSVFDQLTQVVKGDPPQLSNSEEREFSPSFINFVNLCLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 VWSLGITLYELATGRFPYPKWNSVFDQLTQVVKGDPPQLSNSEEREFSPSFINFVNLCLT
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390
pF1KB6 KDESKRPKYKELLKHPFILMYEERAVEVACYVCKILDQMPATPSSPMYVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 KDESKRPKYKELLKHPFILMYEERAVEVACYVCKILDQMPATPSSPMYVD
370 380 390 400 410
>>CCDS11686.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs109|chr17 (334 aa)
initn: 1201 init1: 586 opt: 1200 Z-score: 697.4 bits: 137.6 E(33420): 1.6e-32
Smith-Waterman score: 1200; 54.9% identity (81.1% similar) in 317 aa overlap (69-385:21-332)
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 GKRKALKLNFANPPFKSTARFTLNPNPTGVQNPHIERLRTHSIESSGKLKISPEQHWDFT
..:. ....:.. ..:. .:...
CCDS11 MSQSKGKKRNPGLKIPKEAFEQPQTSSTPPRDLDSKACISIG-NQNFEVK
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 AEDLKDLGEIGRGAYGSVNKMVHKPSGQIMAVKRIRSTVDEKEQKQLLMDLDVVMRSSDC
:.::. . :.:::::: :.:: : ::::::::::::.::. .:::.::::::. ::. ::
CCDS11 ADDLEPIMELGRGAYGVVEKMRHVPSGQIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDISMRTVDC
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 PYIVQFYGALFREGDCWICMELMSTSFDKFYKYVYSVLDDVIPEEILGKITLATVKALNH
:. : :::::::::: :::::::.::.::::: : . ..:::.:::::... ::::.:
CCDS11 PFTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYKQVIDK-GQTIPEDILGKIAVSIVKALEH
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 LKENLKIIHRDIKPSNILLDRSGNIKLCDFGISGQLVDSIAKTRDAGCRPYMAPERIDPS
:. .:..::::.::::.:.. :..:.::::::: ::::.::: ::::.::::::::.:
CCDS11 LHSKLSVIHRDVKPSNVLINALGQVKMCDFGISGYLVDSVAKTIDAGCKPYMAPERINPE
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 ASRQGYDVRSDVWSLGITLYELATGRFPYPKWNSVFDQLTQVVKGDPPQLSNSEEREFSP
...::.:.::.::::::. ::: :::: .:.. :.:: :::. ::: .. ::
CCDS11 LNQKGYSVKSDIWSLGITMIELAILRFPYDSWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADK---FSA
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 SFINFVNLCLTKDESKRPKYKELLKHPFILMYEERAVEVACYVCKILDQMPATPSSPMYV
:..:.. :: :. ..:: : ::..:::. ..: ....:: .: ::
CCDS11 EFVDFTSQCLKKNSKERPTYPELMQHPFFTLHESKGTDVASFVKLILGD
290 300 310 320 330
pF1KB6 D
>>CCDS82194.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs109|chr17 (278 aa)
initn: 1173 init1: 586 opt: 1166 Z-score: 679.4 bits: 134.0 E(33420): 1.6e-31
Smith-Waterman score: 1166; 59.9% identity (82.8% similar) in 279 aa overlap (107-385:2-276)
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 RTHSIESSGKLKISPEQHWDFTAEDLKDLGEIGRGAYGSVNKMVHKPSGQIMAVKRIRST
:.:::::: :.:: : ::::::::::::.:
CCDS82 MELGRGAYGVVEKMRHVPSGQIMAVKRIRAT
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 VDEKEQKQLLMDLDVVMRSSDCPYIVQFYGALFREGDCWICMELMSTSFDKFYKYVYSVL
:. .:::.::::::. ::. :::. : :::::::::: :::::::.::.::::: : .
CCDS82 VNSQEQKRLLMDLDISMRTVDCPFTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYKQVIDK-
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 DDVIPEEILGKITLATVKALNHLKENLKIIHRDIKPSNILLDRSGNIKLCDFGISGQLVD
..:::.:::::... ::::.::. .:..::::.::::.:.. :..:.::::::: :::
CCDS82 GQTIPEDILGKIAVSIVKALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINALGQVKMCDFGISGYLVD
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 SIAKTRDAGCRPYMAPERIDPSASRQGYDVRSDVWSLGITLYELATGRFPYPKWNSVFDQ
:.::: ::::.::::::::.: ...::.:.::.::::::. ::: :::: .:.. :.:
CCDS82 SVAKTIDAGCKPYMAPERINPELNQKGYSVKSDIWSLGITMIELAILRFPYDSWGTPFQQ
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 LTQVVKGDPPQLSNSEEREFSPSFINFVNLCLTKDESKRPKYKELLKHPFILMYEERAVE
: :::. ::: .. :: :..:.. :: :. ..:: : ::..:::. ..: ....
CCDS82 LKQVVEEPSPQLPADK---FSAEFVDFTSQCLKKNSKERPTYPELMQHPFFTLHESKGTD
220 230 240 250 260
380 390
pF1KB6 VACYVCKILDQMPATPSSPMYVD
:: .: ::
CCDS82 VASFVKLILGD
270
>>CCDS11218.1 MAP2K3 gene_id:5606|Hs109|chr17 (318 aa)
initn: 1153 init1: 589 opt: 1147 Z-score: 668.0 bits: 132.1 E(33420): 7.1e-31
Smith-Waterman score: 1150; 52.3% identity (78.0% similar) in 327 aa overlap (63-387:7-316)
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 AVSSMQGKRKALKLNFANPPFKSTARFTLNPNPTGVQNPHIERLRTHSIESSGKLKISPE
:::: .: : .... . : .
CCDS11 MSKPPAPNPTPPRN-----LDSRTFITIG------D
10 20
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 QHWDFTAEDLKDLGEIGRGAYGSVNKMVHKPSGQIMAVKRIRSTVDEKEQKQLLMDLDVV
.... :.:: ..:.:::::: :.:. : :: ::::::::.::. .:::.::::::.
CCDS11 RNFEVEADDLVTISELGRGAYGVVEKVRHAQSGTIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDIN
30 40 50 60 70 80
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 MRSSDCPYIVQFYGALFREGDCWICMELMSTSFDKFYKYVYSVLDD--VIPEEILGKITL
::. :: : : :::::::::: :::::::.::.::::. .::: .:::.:::.:..
CCDS11 MRTVDCFYTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYR---KVLDKNMTIPEDILGEIAV
90 100 110 120 130 140
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 ATVKALNHLKENLKIIHRDIKPSNILLDRSGNIKLCDFGISGQLVDSIAKTRDAGCRPYM
. :.::.::. .:..::::.::::.:... :..:.::::::: ::::.::: ::::.:::
CCDS11 SIVRALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYM
150 160 170 180 190 200
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 APERIDPSASRQGYDVRSDVWSLGITLYELATGRFPYPKWNSVFDQLTQVVKGDPPQLSN
:::::.: ...::.:.:::::::::. :.: :::: .:.. :.:: :::. :::
CCDS11 APERINPELNQKGYNVKSDVWSLGITMIEMAILRFPYESWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPA
210 220 230 240 250 260
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 SEEREFSPSFINFVNLCLTKDESKRPKYKELLKHPFILMYEERAVEVACYVCKILDQMPA
.. ::: :..:. :: :. ..: .: ::..:::. ... . ...: .: .:: .
CCDS11 DR---FSPEFVDFTAQCLRKNPAERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS
270 280 290 300 310
pF1KB6 TPSSPMYVD
>>CCDS11217.1 MAP2K3 gene_id:5606|Hs109|chr17 (347 aa)
initn: 1174 init1: 589 opt: 1147 Z-score: 667.5 bits: 132.2 E(33420): 7.5e-31
Smith-Waterman score: 1169; 49.3% identity (75.3% similar) in 369 aa overlap (26-387:3-345)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MAAPSPSGGGGSGGGSGSGTPGPVGSPAPGHPA-VSSMQGK---RKALKLN-FANPPFKS
::: ..:: . . .:: .: :... ...::
CCDS11 MESPASSQPASMPQSKGKSKRKKDLRISCMSKPP---
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 TARFTLNPNPTGVQNPHIERLRTHSIESSGKLKISPEQHWDFTAEDLKDLGEIGRGAYGS
:::: .: : .... . : ..... :.:: ..:.::::::
CCDS11 ------APNPTPPRN-----LDSRTFITIG------DRNFEVEADDLVTISELGRGAYGV
40 50 60 70
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 VNKMVHKPSGQIMAVKRIRSTVDEKEQKQLLMDLDVVMRSSDCPYIVQFYGALFREGDCW
:.:. : :: ::::::::.::. .:::.::::::. ::. :: : : :::::::::: :
CCDS11 VEKVRHAQSGTIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVDCFYTVTFYGALFREGDVW
80 90 100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 ICMELMSTSFDKFYKYVYSVLDD--VIPEEILGKITLATVKALNHLKENLKIIHRDIKPS
::::::.::.::::. .::: .:::.:::.:... :.::.::. .:..::::.:::
CCDS11 ICMELMDTSLDKFYR---KVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEHLHSKLSVIHRDVKPS
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 NILLDRSGNIKLCDFGISGQLVDSIAKTRDAGCRPYMAPERIDPSASRQGYDVRSDVWSL
:.:... :..:.::::::: ::::.::: ::::.::::::::.: ...::.:.::::::
CCDS11 NVLINKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINPELNQKGYNVKSDVWSL
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 GITLYELATGRFPYPKWNSVFDQLTQVVKGDPPQLSNSEEREFSPSFINFVNLCLTKDES
:::. :.: :::: .:.. :.:: :::. ::: .. ::: :..:. :: :. .
CCDS11 GITMIEMAILRFPYESWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADR---FSPEFVDFTAQCLRKNPA
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390
pF1KB6 KRPKYKELLKHPFILMYEERAVEVACYVCKILDQMPATPSSPMYVD
.: .: ::..:::. ... . ...: .: .:: .
CCDS11 ERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS
320 330 340
>>CCDS74277.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs109|chr19 (435 aa)
initn: 722 init1: 390 opt: 1000 Z-score: 584.1 bits: 117.1 E(33420): 3.3e-26
Smith-Waterman score: 1002; 44.3% identity (71.0% similar) in 393 aa overlap (3-394:52-423)
10 20 30
pF1KB6 MAAPSPSGGGGSGGGSGSGTPGPVGSPAPGHP
::: .. .. .:. .: . .: ::
CCDS74 REARRRIDLNLDISPQRPRPIIVITLSPAPAPSQRAALQLPLANDGGSRSPSSESSPQHP
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 AVSSMQGKRKALKLNFANPPFKSTARFTLNPNPTGVQNPHIERLRTHSIESSGKLKISPE
. . :. : : : .. :: : .... .:.. . ....: : :.
CCDS74 TPPARP--RHMLGL----P----STLFT----PRSMESIEIDQKLQEIMKQTGYLTIGG-
90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 QHWDFTAEDLKDLGEIGRGAYGSVNKMVHKPSGQIMAVKRIRSTVDEKEQKQLLMDLDVV
:... .::..:::.: :. :.: :: . .:...:::..: . ...:.:..:::::::
CCDS74 QRYQAEINDLENLGEMGSGTCGQVWKMRFRKTGHVIAVKQMRRSGNKEENKRILMDLDVV
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 MRSSDCPYIVQFYGALFREGDCWICMELMSTSFDKFYKYVYSVLDDVIPEEILGKITLAT
..: ::::::: .:... . : .: ::::.: .:. : .. :::.::::.:.:
CCDS74 LKSHDCPYIVQCFGTFITNTDVFIAMELMGTCAEKLKKR----MQGPIPERILGKMTVAI
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 VKALNHLKENLKIIHRDIKPSNILLDRSGNIKLCDFGISGQLVDSIAKTRDAGCRPYMAP
:::: .:::. .::::.::::::::. :.::::::::::.:::: ::::.::: ::::
CCDS74 VKALYYLKEKHGVIHRDVKPSNILLDERGQIKLCDFGISGRLVDSKAKTRSAGCAAYMAP
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280 290 300 310 320 330
pF1KB6 ERIDP-SASRQGYDVRSDVWSLGITLYELATGRFPYPKWNSVFDQLTQVVKGDPPQLSNS
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CCDS74 ERIDPPDPTKPDYDIRADVWSLGISLVELATGQFPYKNCKTDFEVLTKVLQEEPPLLPG-
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 EEREFSPSFINFVNLCLTKDESKRPKYKELLKHPFILMYEERAVEVACYVCKILDQMPAT
. :: .: .::. :::::. :::::..::.: :: :: :.:: . .. . .
CCDS74 -HMGFSGDFQSFVKDCLTKDHRKRPKYNKLLEHSFIKRYETLEVDVASWFKDVMAKTESP
370 380 390 400 410 420
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.:
CCDS74 RTSGVLSQPHLPFFR
430
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. :. : : : .. :: : .... .:.. . ....: : :. :
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::: .:::. .::::.::::::::. :.::::::::::.:::: ::::.::: :::::
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CCDS42 HMGFSGDFQSFVKDCLTKDHRKRPKYNKLLEHSFIKRYETLEVDVASWFKDVMAKTESPR
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pF1KB6 SSPMYVD
.:
CCDS42 TSGVLSQPHLPFFR
410
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CCDS74 KSHDCPYIVQCFGTFITNTDVFIAMELMGTCAEKLKKR----MQGPIPERILGKMTVAIV
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pF1KB6 KALNHLKENLKIIHRDIKPSNILLDRSGNIKLCDFGISGQLVDSIAKTRDAGCRPYMAPE
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CCDS74 KALYYLKEKHGVIHRDVKPSNILLDERGQIKLCDFGISGRLVDSKAKTRSAGCAAYMAPE
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pF1KB6 RIDP-SASRQGYDVRSDVWSLGITL-------YELATGRFPYPKWNSVFDQLTQVVKGDP
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CCDS74 RIDPPDPTKPDYDIRADVWSLGISLPCPSPSQVELATGQFPYKNCKTDFEVLTKVLQEEP
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pF1KB6 PQLSNSEEREFSPSFINFVNLCLTKDESKRPKYKELLKHPFILMYEERAVEVACYVCKIL
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CCDS74 PLLPG--HMGFSGDFQSFVKDCLTKDHRKRPKYNKLLEHSFIKRYETLEVDVASWFKDVM
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390
pF1KB6 DQMPATPSSPMYVD
. . .:
CCDS74 AKTESPRTSGVLSQPHLPFFR
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pF1KB6 VKRIRSTVDEKEQKQLLMDLDVVMRSSDCPYIVQFYGALFREGDCWICMELMST-SFDKF
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CCDS10 RKLIHLEIKPAIRNQIIRELQV-LHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQV
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CCDS10 LKKAGR-----IPEQILGKVSIAVIKGLTYLREKHKIMHRDVKPSNILVNSRGEIKLCDF
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CCDS10 GVSGQLIDSMANSF-VGTRSYMSPERLQGT----HYSVQSDIWSMGLSLVEMAVGRYPIP
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CCDS10 NQPSTPTHAAGV
390
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18921897 residues in 33420 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]