FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6502, 381 aa
1>>>pF1KB6502 381 - 381 aa - 381 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4450+/-0.000836; mu= 10.5790+/- 0.050
mean_var=81.1026+/-16.094, 0's: 0 Z-trim(107.8): 47 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.142415
statistics sampled from 9754 (9800) to 9754 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.678), E-opt: 0.2 (0.301), width: 16
Scan time: 3.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9033.1 DUSP6 gene_id:1848|Hs108|chr12 ( 381) 2531 529.7 1.7e-150
CCDS33766.2 DUSP7 gene_id:1849|Hs108|chr3 ( 419) 1783 376.0 3.3e-104
CCDS14724.1 DUSP9 gene_id:1852|Hs108|chrX ( 384) 1048 225.0 8.9e-59
CCDS9034.1 DUSP6 gene_id:1848|Hs108|chr12 ( 235) 882 190.8 1e-48
CCDS1528.1 DUSP10 gene_id:11221|Hs108|chr1 ( 482) 479 108.1 1.7e-23
CCDS6073.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8 ( 303) 472 106.6 3e-23
CCDS6072.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8 ( 394) 472 106.7 3.8e-23
CCDS4380.1 DUSP1 gene_id:1843|Hs108|chr5 ( 367) 470 106.2 4.8e-23
CCDS7724.1 DUSP8 gene_id:1850|Hs108|chr11 ( 625) 468 105.9 1e-22
CCDS2016.1 DUSP2 gene_id:1844|Hs108|chr2 ( 314) 460 104.2 1.7e-22
CCDS8650.1 DUSP16 gene_id:80824|Hs108|chr12 ( 665) 446 101.4 2.5e-21
CCDS7566.1 DUSP5 gene_id:1847|Hs108|chr10 ( 384) 414 94.7 1.4e-19
CCDS55882.1 SSH1 gene_id:54434|Hs108|chr12 ( 692) 334 78.4 2.2e-14
CCDS53825.1 SSH1 gene_id:54434|Hs108|chr12 ( 703) 334 78.4 2.2e-14
CCDS9121.1 SSH1 gene_id:54434|Hs108|chr12 (1049) 334 78.4 3.2e-14
CCDS4468.1 DUSP22 gene_id:56940|Hs108|chr6 ( 184) 320 75.3 4.8e-14
CCDS69035.1 DUSP22 gene_id:56940|Hs108|chr6 ( 205) 320 75.3 5.3e-14
CCDS2289.1 DUSP19 gene_id:142679|Hs108|chr2 ( 217) 310 73.3 2.3e-13
CCDS11253.1 SSH2 gene_id:85464|Hs108|chr17 (1423) 319 75.4 3.6e-13
CCDS74024.1 SSH2 gene_id:85464|Hs108|chr17 (1450) 319 75.4 3.7e-13
CCDS11320.1 DUSP14 gene_id:11072|Hs108|chr17 ( 198) 293 69.8 2.4e-12
CCDS11469.1 DUSP3 gene_id:1845|Hs108|chr17 ( 185) 268 64.6 7.9e-11
>>CCDS9033.1 DUSP6 gene_id:1848|Hs108|chr12 (381 aa)
initn: 2531 init1: 2531 opt: 2531 Z-score: 2815.5 bits: 529.7 E(32554): 1.7e-150
Smith-Waterman score: 2531; 99.7% identity (100.0% similar) in 381 aa overlap (1-381:1-381)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MIDTLRPVPFASEMAISKTVAWLNEQLELGNERLLLMDCRPQELYESSHIESAINVAIPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 MIDTLRPVPFASEMAISKTVAWLNEQLELGNERLLLMDCRPQELYESSHIESAINVAIPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 IMLRRLQKGNLPVRALFTRGEDRDRFTRRCGTDTVVLYDESSSDWNENTGGESLLGLLLK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS90 IMLRRLQKGNLPVRALFTRGEDRDRFTRRCGTDTVVLYDESSSDWNENTGGESVLGLLLK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 KLKDEGCRAFYLEGGFSKFQAEFSLHCETNLDGSCSSSSPPLPVLGLGGLRISSDSSSDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 KLKDEGCRAFYLEGGFSKFQAEFSLHCETNLDGSCSSSSPPLPVLGLGGLRISSDSSSDI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 ESDLDRDPNSATDSDGSPLSNSQPSFPVEILPFLYLGCAKDSTNLDVLEEFGIKYILNVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 ESDLDRDPNSATDSDGSPLSNSQPSFPVEILPFLYLGCAKDSTNLDVLEEFGIKYILNVT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 PNLPNLFENAGEFKYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARGKNCGVLVHCLAGISRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 PNLPNLFENAGEFKYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARGKNCGVLVHCLAGISRS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 VTVTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNFMGQLLDFERTLGLSSPCDNRVPAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 VTVTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNFMGQLLDFERTLGLSSPCDNRVPAQ
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KB6 QLYFTTPSNQNVYQVDSLQST
:::::::::::::::::::::
CCDS90 QLYFTTPSNQNVYQVDSLQST
370 380
>>CCDS33766.2 DUSP7 gene_id:1849|Hs108|chr3 (419 aa)
initn: 1430 init1: 1398 opt: 1783 Z-score: 1984.3 bits: 376.0 E(32554): 3.3e-104
Smith-Waterman score: 1783; 71.7% identity (90.7% similar) in 367 aa overlap (18-381:55-419)
10 20 30 40
pF1KB6 MIDTLRPVPFASEMAISKTVAWLNEQLEL-GNERLLLMDCRPQELYE
:.. ::.:.:: :. :::.::::.::.:
CCDS33 TRAGSEPGAGSGSGAGTGAGAATGAGAMPCKSAEWLQEELEARGGASLLLLDCRPHELFE
30 40 50 60 70 80
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 SSHIESAINVAIPGIMLRRLQKGNLPVRALFTRGEDRDRFTRRCGTDTVVLYDESSSDWN
:::::.:::.::::.:::::.:::::.:... :..::. :: . ::.::::....:.
CCDS33 SSHIETAINLAIPGLMLRRLRKGNLPIRSIIPNHADKERFATRCKAATVLLYDEATAEWQ
90 100 110 120 130 140
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 ENTGGE-SLLGLLLKKLKDEGCRAFYLEGGFSKFQAEFSLHCETNLDGSCS-SSSPPLPV
. :. :.:::::.::.:.::.:.::.:::.:::.:.: :::::.:.: : ::::: :
CCDS33 PEPGAPASVLGLLLQKLRDDGCQAYYLQGGFNKFQTEYSEHCETNVDSSSSPSSSPPTSV
150 160 170 180 190 200
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 LGLGGLRISSDSSSDIESDLDRDPNSATDSDGSPLSNSQPSFPVEILPFLYLGCAKDSTN
::::::::::: : : ::: . :.:::.:::::. .:::.:::.:::.:::::::::::
CCDS33 LGLGGLRISSDCS-DGESDREL-PSSATESDGSPVPSSQPAFPVQILPYLYLGCAKDSTN
210 220 230 240 250 260
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 LDVLEEFGIKYILNVTPNLPNLFENAGEFKYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARG
:::: ..:::::::::::::: ::..::: :::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS33 LDVLGKYGIKYILNVTPNLPNAFEHGGEFTYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARS
270 280 290 300 310 320
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 KNCGVLVHCLAGISRSVTVTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNFMGQLLDFE
:.:::::::::::::::::::::::::.:::.:::::.:: :::::::::::::::::::
CCDS33 KKCGVLVHCLAGISRSVTVTVAYLMQKMNLSLNDAYDFVKRKKSNISPNFNFMGQLLDFE
330 340 350 360 370 380
350 360 370 380
pF1KB6 RTLGLSSPCDNRVPAQQLYFTTPSNQNVYQVDSLQST
:::::::::::.. ..::::.::.:.:.. ...:.::
CCDS33 RTLGLSSPCDNHASSEQLYFSTPTNHNLFPLNTLEST
390 400 410
>>CCDS14724.1 DUSP9 gene_id:1852|Hs108|chrX (384 aa)
initn: 1198 init1: 791 opt: 1048 Z-score: 1168.7 bits: 225.0 E(32554): 8.9e-59
Smith-Waterman score: 1217; 54.2% identity (75.3% similar) in 384 aa overlap (16-375:4-381)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MIDTLRPVPFASEMAISKTVAWLNEQLELGNERLLLMDCRPQELYESSHIESAINVAIPG
.... :: ..: ::::.::: .:::::..: .:..::.:.
CCDS14 MEGLGRSCLWLRRELSPPRPRLLLLDCRSRELYESARIGGALSVALPA
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB6 IMLRRLQKGNLPVRALFTRGEDRDRFTRRCGTDTVVLYDESSSDWN--------ENTGGE
..::::..:.: ::::. : . :.:::.... :. .:
CCDS14 LLLRRLRRGSLSVRALLP-GPP----LQPPPPAPVLLYDQGGGRRRRGEAEAEAEEWEAE
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KB6 SLLGLLLKKLKDEGCRAFYLEGGFSKFQAEFSLHCETNLDGSCSSS-SP---PLPVLGLG
:.:: ::.::..:: :.::.::::.:::: :::.: : .:: .: :.::.:::
CCDS14 SVLGTLLQKLREEGYLAYYLQGGFSRFQAECPHLCETSLAGRAGSSMAPVPGPVPVVGLG
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 GLRISSDSSSDIESDLDRDPNS-ATDSDGS--PLSNSQPSFPVEILPFLYLGCAKDSTNL
.: ..:: : : ::. ::: : . ::.:. : . . ::::.::: :::: :.::.::
CCDS14 SLCLGSDCS-DAESEADRDSMSCGLDSEGATPPPVGLRASFPVQILPNLYLGSARDSANL
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 DVLEEFGIKYILNVTPNLPNLFENAGEFKYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARGK
. : ..::.:::::::::::.::. :.:.:::::::::::::::.:::::: ::::: ..
CCDS14 ESLAKLGIRYILNVTPNLPNFFEKNGDFHYKQIPISDHWSQNLSRFFPEAIEFIDEALSQ
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 NCGVLVHCLAGISRSVTVTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNFMGQLLDFER
:::::::::::.:::::::::::::::.::.:::::.:: ::::::::::::::::::::
CCDS14 NCGVLVHCLAGVSRSVTVTVAYLMQKLHLSLNDAYDLVKRKKSNISPNFNFMGQLLDFER
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380
pF1KB6 TLGL---------SSPCDNRVPAQQLYFTTPSNQNVYQVDSLQST
.: : :. . . .::::........
CCDS14 SLRLEERHSQEQGSGGQASAASNPPSFFTTPTSDGAFELAPT
350 360 370 380
>>CCDS9034.1 DUSP6 gene_id:1848|Hs108|chr12 (235 aa)
initn: 879 init1: 879 opt: 882 Z-score: 987.9 bits: 190.8 E(32554): 1e-48
Smith-Waterman score: 1244; 61.4% identity (61.7% similar) in 381 aa overlap (1-381:1-235)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MIDTLRPVPFASEMAISKTVAWLNEQLELGNERLLLMDCRPQELYESSHIESAINVAIPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 MIDTLRPVPFASEMAISKTVAWLNEQLELGNERLLLMDCRPQELYESSHIESAINVAIPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 IMLRRLQKGNLPVRALFTRGEDRDRFTRRCGTDTVVLYDESSSDWNENTGGESLLGLLLK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS90 IMLRRLQKGNLPVRALFTRGEDRDRFTRRCGTDTVVLYDESSSDWNENTGGESVLGLLLK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 KLKDEGCRAFYLEGGFSKFQAEFSLHCETNLDGSCSSSSPPLPVLGLGGLRISSDSSSDI
:::::::::::::
CCDS90 KLKDEGCRAFYLE-----------------------------------------------
130
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 ESDLDRDPNSATDSDGSPLSNSQPSFPVEILPFLYLGCAKDSTNLDVLEEFGIKYILNVT
CCDS90 ------------------------------------------------------------
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 PNLPNLFENAGEFKYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARGKNCGVLVHCLAGISRS
:::::::::::::::::::::
CCDS90 ---------------------------------------DEARGKNCGVLVHCLAGISRS
140 150
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 VTVTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNFMGQLLDFERTLGLSSPCDNRVPAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 VTVTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNFMGQLLDFERTLGLSSPCDNRVPAQ
160 170 180 190 200 210
370 380
pF1KB6 QLYFTTPSNQNVYQVDSLQST
:::::::::::::::::::::
CCDS90 QLYFTTPSNQNVYQVDSLQST
220 230
>>CCDS1528.1 DUSP10 gene_id:11221|Hs108|chr1 (482 aa)
initn: 638 init1: 477 opt: 479 Z-score: 535.3 bits: 108.1 E(32554): 1.7e-23
Smith-Waterman score: 646; 37.1% identity (67.3% similar) in 315 aa overlap (35-347:173-462)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 LRPVPFASEMAISKTVAWLNEQLELGNERLLLMDCRPQELYESSHIESAINVAIPG-IML
...:::: :..:::..:... :
CCDS15 QLASIKIIYPNDLAKKMTKCSKSHLPSQGPVIIDCRPFMEYNKSHIQGAVHINCADKISR
150 160 170 180 190 200
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 RRLQKGNLPVRALFTRGEDRDRFTRRCGTDTVVLYDESSSDWNENTGGESLLGLLLKKLK
::::.:.. : :.. : .: : .: . ...:::.... .. .. : ..:..::
CCDS15 RRLQQGKITVLDLISCREGKDSF-KRIFSKEIIVYDENTNEPSRVMPSQPL-HIVLESLK
210 220 230 240 250 260
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 DEGCRAFYLEGGFSKFQAEFSLHCETNLD-GSCSSSSPPLPVLGLGGLRISSDSSSDIES
:: . . :.::.:.:. . :...:. : .: :: .: .:: . .
CCDS15 REGKEPLVLKGGLSSFKQNHENLCDNSLQLQECRE-------VG-GG---ASAASSLLPQ
270 280 290 300
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 DLDRDPNSATDSDGSPLSNSQPSFPVEILPFLYLGCAKDSTNLDVLEEFGIKYILNVTPN
. : : ... :. : :::::.:: .:. .::......: :..::: .
CCDS15 PIPTTP----DIENAELT---P-----ILPFLFLGNEQDAQDLDTMQRLNIGYVINVTTH
310 320 330 340 350
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LPNLFENAGEFKYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARGKNCGVLVHCLAGISRSVT
:: . : :.::..: .: .::: :.: ::. ::.::. . :.:.:: ::.:::.:
CCDS15 LPLYHYEKGLFNYKRLPATDSNKQNLRQYFEEAFEFIEEAHQCGKGLLIHCQAGVSRSAT
360 370 380 390 400 410
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 VTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNFMGQLLDFERTLGLSSPCDNRVPAQQL
...::::.. ..:.::: .:: :. ::::.:::::::.::. :
CCDS15 IVIAYLMKHTRMTMTDAYKFVKGKRPIISPNLNFMGQLLEFEEDLNNGVTPRILTPKLMG
420 430 440 450 460 470
370 380
pF1KB6 YFTTPSNQNVYQVDSLQST
CCDS15 VETVV
480
>>CCDS6073.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8 (303 aa)
initn: 503 init1: 318 opt: 472 Z-score: 530.8 bits: 106.6 E(32554): 3e-23
Smith-Waterman score: 485; 37.2% identity (62.1% similar) in 253 aa overlap (127-373:47-275)
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 LYDESSSDWNENTGGESLLGLLLKKLKDEGCRAFYLEGGFSKFQAEFSLHCETNLDGSCS
: .::. .:..:. : . . .
CCDS60 RSPRRTGRDCKPVRAPSMALGVSQLAGRSRCLCSESQGGYERFSSEYPEFCSKT--KALA
20 30 40 50 60 70
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 SSSPPLPVLGLGGLRISSDSSSDIESDLDRDPNSATDSDGSPLSNSQPSFPVEILPFLYL
. ::.: :. :: . .: :.:: .. ::::::::::
CCDS60 AIPPPVP------------PSATEPLDL------GCSSCGTPLHDQGG--PVEILPFLYL
80 90 100 110
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 GCAKDSTNLDVLEEFGIKYILNVTPNLPNLFENAGEFKYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAI
: : .. :.:. .:: .:::. . :: :: :...:: ::. :. . ..:..: :::
CCDS60 GSAYHAARRDMLDALGITALLNVSSDCPNHFE--GHYQYKCIPVEDNHKADISSWFMEAI
120 130 140 150 160 170
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 SFIDEARGKNCGVLVHCLAGISRSVTVTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNF
.:: .. ::::: ::::::.:. .::::.: . ...:...::...: :::::.:
CCDS60 EYIDAVKDCRGRVLVHCQAGISRSATICLAYLMMKKRVRLEEAFEFVKQRRSIISPNFSF
180 190 200 210 220 230
340 350 360 370 380
pF1KB6 MGQLLDFE-RTLGLSSPCDNRVPAQQLYF-----TTPSNQNVYQVDSLQST
:::::.:: ..:. : . :. : .::..: :.
CCDS60 MGQLLQFESQVLATSCAAEAASPSGPLRERGKTPATPTSQFVFSFPVSVGVHSAPSSLPY
240 250 260 270 280 290
CCDS60 LHSPITTSPSC
300
>>CCDS6072.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8 (394 aa)
initn: 569 init1: 318 opt: 472 Z-score: 529.0 bits: 106.7 E(32554): 3.8e-23
Smith-Waterman score: 588; 34.6% identity (62.9% similar) in 350 aa overlap (33-373:44-366)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 DTLRPVPFASEMAISKTVAWLNEQLELGNERLLLMDCRPQELYESSHIESAINVAIPGIM
. ::.:::: . ...: ...:: . .
CCDS60 VLKRLMNRDENGGGAGGSGSHGTLGLPSGGKCLLLDCRPFLAHSAGYILGSVNVRC-NTI
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LRRLQKGNLPVRALFTRGEDRDRFTRRCGT-DTVVLYDESSSDWNENTGGESLLGLLLKK
.:: ::.. .. .. .:.. : : : ..:..::: : :. .: ..:...
CCDS60 VRRRAKGSVSLEQILP-AEEEVRARLRSGLYSAVIVYDERSPR-AESLREDSTVSLVVQA
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170
pF1KB6 LKDEGCRA--FYLEGGFSKFQAEFSLHCETNLDGSCSSSSPPLPVLGLGGLRISSDSSSD
:. .. :. :.::. .:..:. : . . .. ::.: :.
CCDS60 LRRNAERTDICLLKGGYERFSSEYPEFCSKT--KALAAIPPPVP------------PSAT
140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 IESDLDRDPNSATDSDGSPLSNSQPSFPVEILPFLYLGCAKDSTNLDVLEEFGIKYILNV
:: . .: :.:: .. ::::::::::: : .. :.:. .:: .:::
CCDS60 EPLDL------GCSSCGTPLHDQGG--PVEILPFLYLGSAYHAARRDMLDALGITALLNV
180 190 200 210 220
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CCDS60 SGPLRERGKTPATPTSQFVFSFPVSVGVHSAPSSLPYLHSPITTSPSC
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CCDS43 AMAVLDRGTSTTTVFNFPVSIPVHSTNSALSYLQSPITTSPSC
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CCDS77 RLQQGKVTIAELI-QPAARSQVEATEPQD-VVVYDQSTRDASV-LAADSFLSILLSKL--
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CCDS77 ---------------PMSLSQPCLPVPSVGLTRILPHLYLGSQKDVLNKDLMTQNGISYV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]