Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6394
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6394, 303 aa
1>>>pF1KB6394 303 - 303 aa - 303 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1529+/-0.000883; mu= 16.1468+/- 0.053
mean_var=61.4997+/-12.520, 0's: 0 Z-trim(105.8): 79 B-trim: 222 in 1/50
Lambda= 0.163545
statistics sampled from 8521 (8605) to 8521 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.642), E-opt: 0.2 (0.264), width: 16
Scan time: 1.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33375.1 PECR gene_id:55825|Hs108|chr2 ( 303) 1994 479.0 2e-135
CCDS6250.1 DECR1 gene_id:1666|Hs108|chr8 ( 335) 536 135.0 7.7e-32
CCDS10409.1 DECR2 gene_id:26063|Hs108|chr16 ( 292) 523 131.9 5.8e-31
CCDS9605.1 DHRS4 gene_id:10901|Hs108|chr14 ( 278) 394 101.4 8.1e-22
CCDS12736.1 HSD17B14 gene_id:51171|Hs108|chr19 ( 270) 389 100.2 1.8e-21
CCDS9604.1 DHRS2 gene_id:10202|Hs108|chr14 ( 280) 378 97.7 1.1e-20
CCDS3812.1 CBR4 gene_id:84869|Hs108|chr4 ( 237) 372 96.2 2.6e-20
CCDS41927.1 DHRS2 gene_id:10202|Hs108|chr14 ( 300) 317 83.3 2.5e-16
CCDS4769.1 HSD17B8 gene_id:7923|Hs108|chr6 ( 261) 303 79.9 2.2e-15
CCDS3821.1 HPGD gene_id:3248|Hs108|chr4 ( 266) 288 76.4 2.6e-14
CCDS11315.2 DHRS11 gene_id:79154|Hs108|chr17 ( 260) 276 73.6 1.8e-13
CCDS56020.1 DHRS7C gene_id:201140|Hs108|chr17 ( 312) 265 71.0 1.3e-12
CCDS58517.1 DHRS7C gene_id:201140|Hs108|chr17 ( 311) 261 70.1 2.5e-12
CCDS9606.2 DHRS4L2 gene_id:317749|Hs108|chr14 ( 232) 248 66.9 1.6e-11
CCDS4126.1 HSD17B4 gene_id:3295|Hs108|chr5 ( 736) 247 67.0 5.1e-11
CCDS54821.1 HPGD gene_id:3248|Hs108|chr4 ( 178) 237 64.3 7.8e-11
CCDS9743.1 DHRS7 gene_id:51635|Hs108|chr14 ( 339) 240 65.1 8.3e-11
>>CCDS33375.1 PECR gene_id:55825|Hs108|chr2 (303 aa)
initn: 1994 init1: 1994 opt: 1994 Z-score: 2544.9 bits: 479.0 E(32554): 2e-135
Smith-Waterman score: 1994; 100.0% identity (100.0% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MASWAKGRSYLAPGLLQGQVAIVTGGATGIGKAIVKELLELGSNVVIASRKLERLKSAAD
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CCDS33 MASWAKGRSYLAPGLLQGQVAIVTGGATGIGKAIVKELLELGSNVVIASRKLERLKSAAD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 ELQANLPPTKQARVIPIQCNIRNEEEVNNLVKSTLDTFGKINFLVNNGGGQFLSPAEHIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ELQANLPPTKQARVIPIQCNIRNEEEVNNLVKSTLDTFGKINFLVNNGGGQFLSPAEHIS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SKGWHAVLETNLTGTFYMCKAVYSSWMKEHGGSIVNIIVPTKAGFPLAVHSGAARAGVYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SKGWHAVLETNLTGTFYMCKAVYSSWMKEHGGSIVNIIVPTKAGFPLAVHSGAARAGVYN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LTKSLALEWACSGIRINCVAPGVIYSQTAVENYGSWGQSFFEGSFQKIPAKRIGVPEEVS
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CCDS33 LTKSLALEWACSGIRINCVAPGVIYSQTAVENYGSWGQSFFEGSFQKIPAKRIGVPEEVS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SVVCFLLSPAASFITGQSVDVDGGRSLYTHSYEVPDHDNWPKGAGDLSVVKKMKETFKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SVVCFLLSPAASFITGQSVDVDGGRSLYTHSYEVPDHDNWPKGAGDLSVVKKMKETFKEK
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 AKL
:::
CCDS33 AKL
>>CCDS6250.1 DECR1 gene_id:1666|Hs108|chr8 (335 aa)
initn: 499 init1: 168 opt: 536 Z-score: 685.1 bits: 135.0 E(32554): 7.7e-32
Smith-Waterman score: 536; 35.2% identity (69.3% similar) in 261 aa overlap (8-264:49-302)
10 20 30
pF1KB6 MASWAKGRSYLAPGLLQGQVAIVTGGATGIGKAIVKE
...: :. .::.::..:::.::.::...
CCDS62 LAPRRFFSYGTKILYQNTEALQSKFFSPLQKAMLPPNSFQGKVAFITGGGTGLGKGMTTL
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 LLELGSNVVIASRKLERLKSAADELQANLPPTKQARVIPIQCNIRNEEEVNNLVKSTLDT
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CCDS62 LSSLGAQCVIASRKMDVLKATAEQISSQTG----NKVHAIQCDVRDPDMVQNTVSELIKV
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 FGKINFLVNNGGGQFLSPAEHISSKGWHAVLETNLTGTFYMCKAVYSSWMKEHGG----S
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CCDS62 AGHPNIVINNAAGNFISPTERLSPNAWKTITDIVLNGTAFVTLEIGKQLIKAQKGAAFLS
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 IVNIIVPTKAGFPLAVHSGAARAGVYNLTKSLALEWACSGIRINCVAPGVIYSQTAVENY
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CCDS62 ITTIYAETGSGF--VVPSASAKAGVEAMSKSLAAEWGKYGMRFNVIQPGPIKTKGAFSRL
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 GSWGQSFFEGSFQKIPAKRIGVPEEVSSVVCFLLSPAASFITGQSVDVDGGRSLYTHSYE
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CCDS62 DPTG-TFEKEMIGRIPCGRLGTVEELANLAAFLCSDYASWINGAVIKFDGGEEVLISGEF
260 270 280 290 300 310
280 290 300
pF1KB6 VPDHDNWPKGAGDLSVVKKMKETFKEKAKL
CCDS62 NDLRKVTKEQWDTIEELIRKTKGS
320 330
>>CCDS10409.1 DECR2 gene_id:26063|Hs108|chr16 (292 aa)
initn: 306 init1: 179 opt: 523 Z-score: 669.4 bits: 131.9 E(32554): 5.8e-31
Smith-Waterman score: 523; 34.9% identity (67.4% similar) in 258 aa overlap (8-264:18-270)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MASWAKGRSYLAPGLLQGQVAIVTGGATGIGKAIVKELLELGSNVVIASR
: . : ::. .::..:::..::: :.. ... : ..:::::
CCDS10 MAQPPPDVEGDDCLPAYRHLFCPDLLRDKVAFITGGGSGIGFRIAEIFMRHGCHTVIASR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 KLERLKSAADELQANLPPTKQARVIPIQCNIRNEEEVNNLVKSTLDTFGKINFLVNNGGG
.: :. .:: .: . . : .:.. ..: : : ..: ::.:..:.: ..:
CCDS10 SLPRVLTAARKLAG----ATGRRCLPLSMDVRAPPAVMAAVDQALKEFGRIDILINCAAG
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KB6 QFLSPAEHISSKGWHAVLETNLTGTFYMCKAVYSSWMKEHGGSIVNIIVPT-KAGFPLAV
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CCDS10 NFLCPAGALSFNAFKTVMDIDTSGTFNVSRVLYEKFFRDHGGVIVNITATLGNRGQALQV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 HSGAARAGVYNLTKSLALEWACSGIRINCVAPGVIYSQTAVENYGSWGQSFFEGSFQKIP
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CCDS10 HAGSAKAAVDAMTRHLAVEWGPQNIRVNSLAPGPISGTEGLRRLGG-PQASLSTKVTASP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 AKRIGVPEEVSSVVCFLLSPAASFITGQSVDVDGGRSLYTHSYEVPDHDNWPKGAGDLSV
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CCDS10 LQRLGNKTEIAHSVLYLASPLASYVTGAVLVADGGAWLTFPNGVKGLPDFASFSAKL
240 250 260 270 280 290
290 300
pF1KB6 VKKMKETFKEKAKL
>>CCDS9605.1 DHRS4 gene_id:10901|Hs108|chr14 (278 aa)
initn: 330 init1: 114 opt: 394 Z-score: 505.2 bits: 101.4 E(32554): 8.1e-22
Smith-Waterman score: 394; 33.1% identity (63.2% similar) in 269 aa overlap (1-264:19-273)
10 20 30 40
pF1KB6 MASWAKGRSYLAPGLLQGQVAIVTGGATGIGKAIVKELLELG
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CCDS96 MHKAGLLGLCARAWNSVRMAS--SGMTRRDP--LANKVALVTASTDGIGFAIARRLAQDG
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 SNVVIASRKLERLKSAADELQANLPPTKQARVIPIQCNIRNEEEVNNLVKSTLDTFGKIN
..::..::: . . .:. ::. . : :.. . :. . :: ... : :.
CCDS96 AHVVVSSRKQQNVDQAVATLQG-----EGLSVTGTVCHVGKAEDRERLVATAVKLHGGID
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 FLVNNGG-GQFLSPAEHISSKGWHAVLETNLTGTFYMCKAVYSSWMKEHGGSIVNIIVPT
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CCDS96 ILVSNAAVNPFFGSIMDVTEEVWDKTLDINVKAPALMTKAVVPEMEKRGGGSVV--IVSS
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210
pF1KB6 KAGF---PLAVHSGAARAGVYNLTKSLALEWACSGIRINCVAPGVIYSQTAVENYGSWGQ
:.: : ....... .:::.::.: : .::.::.:::.: .:. . : .
CCDS96 IAAFSPSPGFSPYNVSKTALLGLTKTLAIELAPRNIRVNCLAPGLI--KTSFSRM-LWMD
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 SFFEGSFQK-IPAKRIGVPEEVSSVVCFLLSPAASFITGQSVDVDGGRSLYTHSYEVPDH
. : :... . .:.: ::. ...: :: : ::.:::..: : ::
CCDS96 KEKEESMKETLRIRRLGEPEDCAGIVSFLCSEDASYITGETVVVGGGTPSRL
230 240 250 260 270
280 290 300
pF1KB6 DNWPKGAGDLSVVKKMKETFKEKAKL
>>CCDS12736.1 HSD17B14 gene_id:51171|Hs108|chr19 (270 aa)
initn: 312 init1: 142 opt: 389 Z-score: 499.0 bits: 100.2 E(32554): 1.8e-21
Smith-Waterman score: 389; 32.8% identity (63.3% similar) in 256 aa overlap (18-267:9-251)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MASWAKGRSYLAPGLLQGQVAIVTGGATGIGKAIVKELLELGSNVVIASRKLERLKSAAD
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CCDS12 MATGTRYAGKVVVVTGGGRGIGAGIVRAFVNSGARVVICDKD----ESGGR
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB6 ELQANLPPTKQARVIPIQCNIRNEEEVNNLVKSTLDTFGKINFLVNNGGGQFLSPA--EH
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CCDS12 ALEQELPGA-----VFILCDVTQEDDVKTLVSETIRRFGRLDCVVNNAG-HHPPPQRPEE
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 ISSKGWHAVLETNLTGTFYMCKAVYSSWMKEHGGSIVNIIVPTKA-GFPLAVHSGAARAG
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CCDS12 TSAQGFRQLLELNLLGTYTLTKLALP-YLRKSQGNVINISSLVGAIGQAQAVPYVATKGA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 VYNLTKSLALEWACSGIRINCVAPGVIYSQTAVENYGSWGQ---SFFEGSFQKIPAKRIG
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CCDS12 VTAMTKALALDESPYGVRVNCISPGNIWTPLWEELAALMPDPRATIREGMLAQ-PLGRMG
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 VPEEVSSVVCFLLSPAASFITGQSVDVDGGRSLYTHSYEVPDHDNWPKGAGDLSVVKKMK
: ::.... :: : : .: :: . : :: :
CCDS12 QPAEVGAAAVFLASEA-NFCTGIELLVTGGAELGYGCKASRSTPVDAPDIPS
220 230 240 250 260 270
300
pF1KB6 ETFKEKAKL
>>CCDS9604.1 DHRS2 gene_id:10202|Hs108|chr14 (280 aa)
initn: 355 init1: 134 opt: 378 Z-score: 484.8 bits: 97.7 E(32554): 1.1e-20
Smith-Waterman score: 378; 31.0% identity (65.9% similar) in 258 aa overlap (14-263:32-275)
10 20 30 40
pF1KB6 MASWAKGRSYLAPGLLQGQVAIVTGGATGIGKAIVKELLELGS
:.: ..::.:::...::: ::...: . :.
CCDS96 LSAVARGYQGWFHPCARLSVRMSSTGIDRKGVLANRVAVVTGSTSGIGFAIARRLARDGA
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 NVVIASRKLERLKSAADELQANLPPTKQARVIPIQCNIRNEEEVNNLVKSTLDTFGKINF
.:::.::: . . : .::. . : : :.. . :. ..:: ..:. : ..:
CCDS96 HVVISSRKQQNVDRAMAKLQG-----EGLSVAGIVCHVGKAEDREQLVAKALEHCGGVDF
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KB6 LVNNGG-----GQFLSPAEHISSKGWHAVLETNLTGTFYMCKAVYSSWMKEHGGSIVNII
:: ..: :. :. .:.: : .: .:. . . . . .:... :.. :.
CCDS96 LVCSAGVNPLVGSTLGTSEQI----WDKILSVNVKSPALLLSQLLP-YMENRRGAV--IL
120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 VPTKAGFPLAVHSGA---ARAGVYNLTKSLALEWACSGIRINCVAPGVIYSQTAVENYGS
: . :.. .: :. ..... .::..:::: : . ::.:::.::.: .. . .:.
CCDS96 VSSIAAYNPVVALGVYNVSKTALLGLTRTLALELAPKDIRVNCVVPGIIKTDFSKVFHGN
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 WGQSFFEGSFQKIPAKRIGVPEEVSSVVCFLLSPAASFITGQSVDVDGGRSLYTHSYEVP
.:.... .. .::: :. ...: :: :: ::...:... : :
CCDS96 --ESLWKNFKEHHQLQRIGESEDCAGIVSFLCSPDASYVNGENIAVAGYSTRL
230 240 250 260 270 280
280 290 300
pF1KB6 DHDNWPKGAGDLSVVKKMKETFKEKAKL
>>CCDS3812.1 CBR4 gene_id:84869|Hs108|chr4 (237 aa)
initn: 323 init1: 115 opt: 372 Z-score: 478.2 bits: 96.2 E(32554): 2.6e-20
Smith-Waterman score: 372; 32.0% identity (64.0% similar) in 253 aa overlap (19-267:3-235)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MASWAKGRSYLAPGLLQGQVAIVTGGATGIGKAIVKELLELGSNVVIASRKLERLKSAAD
.: : ::. :::.:... . . : ... .:.:: :.::
CCDS38 MDKVCAVFGGSRGIGRAVAQLMARKGYRLAVIARNLEGAKAAAG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 ELQANLPPTKQARVIPIQCNIRNEEEVNNLVKSTLDTFGKINFLVNNGGGQFLSPAEHIS
.: .. . ..:.. .:..:.: . .:..::::: .: . . . .
CCDS38 DLGGDH--------LAFSCDVAKEHDVQNTFEELEKHLGRVNFLVNAAGINRDGLLVRTK
50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KB6 SKGWHAVLETNLTGTFYMCKAVYSSWMKEHGGSIVNI--IVPTKAGFPLAVHSGAARAGV
.. . :.::: :.. :::.. . ....::::::. :: :.. .:.: :...:.
CCDS38 TEDMVSQLHTNLLGSMLTCKAAMRTMIQQQGGSIVNVGSIVGLKGNSGQSVYS-ASKGGL
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 YNLTKSLALEWACSGIRINCVAPGVIYSQTAVENYGSWGQSFFEGSFQK-IPAKRIGVPE
.....:: : : . ::.: :::: .... . ... : ..: :: :.:
CCDS38 VGFSRALAKEVARKKIRVNVVAPGFVHTDMT--------KDLKEEHLKKNIPLGRFGETI
160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 EVSSVVCFLL-SPAASFITGQSVDVDGGRSLYTHSYEVPDHDNWPKGAGDLSVVKKMKET
::. .: ::: :: .:::. . :::: .:
CCDS38 EVAHAVVFLLESP---YITGHVLVVDGGLQLIL
210 220 230
300
pF1KB6 FKEKAKL
>>CCDS41927.1 DHRS2 gene_id:10202|Hs108|chr14 (300 aa)
initn: 271 init1: 134 opt: 317 Z-score: 406.5 bits: 83.3 E(32554): 2.5e-16
Smith-Waterman score: 317; 31.0% identity (62.8% similar) in 258 aa overlap (14-259:32-275)
10 20 30 40
pF1KB6 MASWAKGRSYLAPGLLQGQVAIVTGGATGIGKAIVKELLELGS
:.: ..::.:::...::: ::...: . :.
CCDS41 LSAVARGYQGWFHPCARLSVRMSSTGIDRKGVLANRVAVVTGSTSGIGFAIARRLARDGA
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 NVVIASRKLERLKSAADELQANLPPTKQARVIPIQCNIRNEEEVNNLVKSTLDTFGKINF
.:::.::: . . : .::. . : : :.. . :. ..:: ..:. : ..:
CCDS41 HVVISSRKQQNVDRAMAKLQG-----EGLSVAGIVCHVGKAEDREQLVAKALEHCGGVDF
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KB6 LVNNGG-----GQFLSPAEHISSKGWHAVLETNLTGTFYMCKAVYSSWMKEHGGSIVNII
:: ..: :. :. .:.: : .: .:. . . . . .:... :.. :.
CCDS41 LVCSAGVNPLVGSTLGTSEQI----WDKILSVNVKSPALLLSQLLP-YMENRRGAV--IL
120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 VPTKAGFPLAVHSGA---ARAGVYNLTKSLALEWACSGIRINCVAPGVIYSQ-TAVENYG
: . :.. .: :. ..... .::..:::: : . ::.:::.::.: .. . : :
CCDS41 VSSIAAYNPVVALGVYNVSKTALLGLTRTLALELAPKDIRVNCVVPGIIKTDFSKVVRIG
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 SWGQSFFEGSFQKIPAKR-IGVPEEV--SSVVCFLLSPAASFITGQSVDVDGGRSLYTHS
:.:. . ..: . : .: . : : : : ::.: ::...
CCDS41 FMGMSLSGRTSRNIISCRGLGSQRTVQESCPSCALQMPATS--TGRTLRWQATPLGSERS
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280 290 300
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