Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6346
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6346, 291 aa
1>>>pF1KB6346 291 - 291 aa - 291 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2438+/-0.000583; mu= 17.3265+/- 0.035
mean_var=84.3174+/-16.624, 0's: 0 Z-trim(114.6): 124 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.139674
statistics sampled from 15054 (15184) to 15054 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.807), E-opt: 0.2 (0.466), width: 16
Scan time: 2.690
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11089.1 ASGR1 gene_id:432|Hs108|chr17 ( 291) 2082 428.4 3.1e-120
CCDS56017.1 ASGR1 gene_id:432|Hs108|chr17 ( 252) 1657 342.7 1.7e-94
CCDS11088.1 ASGR2 gene_id:433|Hs108|chr17 ( 287) 1293 269.4 2.2e-72
CCDS45598.1 ASGR2 gene_id:433|Hs108|chr17 ( 292) 1273 265.3 3.7e-71
CCDS82049.1 CLEC10A gene_id:10462|Hs108|chr17 ( 289) 1251 260.9 7.9e-70
CCDS45597.1 CLEC10A gene_id:10462|Hs108|chr17 ( 292) 1250 260.7 9.2e-70
CCDS32544.1 ASGR2 gene_id:433|Hs108|chr17 ( 311) 1208 252.3 3.4e-67
CCDS11087.1 CLEC10A gene_id:10462|Hs108|chr17 ( 316) 918 193.8 1.3e-49
CCDS45952.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19 ( 312) 391 87.6 1.2e-17
CCDS56087.1 CLEC17A gene_id:388512|Hs108|chr19 ( 378) 379 85.3 7.6e-17
CCDS32782.1 COLEC12 gene_id:81035|Hs108|chr18 ( 742) 379 85.5 1.2e-16
CCDS59344.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19 ( 268) 364 82.1 4.8e-16
CCDS45949.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19 ( 360) 363 82.0 6.8e-16
CCDS45950.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19 ( 380) 363 82.1 7.1e-16
CCDS12184.1 FCER2 gene_id:2208|Hs108|chr19 ( 321) 362 81.8 7.2e-16
CCDS12186.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19 ( 404) 363 82.1 7.4e-16
CCDS59345.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19 ( 243) 360 81.3 7.8e-16
CCDS59347.1 CLEC4M gene_id:10332|Hs108|chr19 ( 263) 358 80.9 1.1e-15
CCDS12187.1 CLEC4M gene_id:10332|Hs108|chr19 ( 399) 357 80.9 1.7e-15
CCDS45951.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19 ( 398) 341 77.7 1.6e-14
CCDS8594.1 CLEC4E gene_id:26253|Hs108|chr12 ( 219) 333 75.8 3.1e-14
CCDS12185.1 CLEC4G gene_id:339390|Hs108|chr19 ( 293) 313 71.9 6.3e-13
CCDS47242.1 VCAN gene_id:1462|Hs108|chr5 ( 655) 317 73.0 6.5e-13
CCDS54875.1 VCAN gene_id:1462|Hs108|chr5 (1642) 317 73.4 1.3e-12
CCDS54876.1 VCAN gene_id:1462|Hs108|chr5 (2409) 317 73.5 1.7e-12
CCDS4060.1 VCAN gene_id:1462|Hs108|chr5 (3396) 317 73.6 2.2e-12
CCDS12397.1 NCAN gene_id:1463|Hs108|chr19 (1321) 311 72.1 2.5e-12
CCDS41745.1 CLEC4A gene_id:50856|Hs108|chr12 ( 198) 297 68.5 4.4e-12
CCDS8590.1 CLEC4A gene_id:50856|Hs108|chr12 ( 237) 297 68.6 5.1e-12
CCDS8591.1 CLEC4A gene_id:50856|Hs108|chr12 ( 165) 292 67.4 7.8e-12
CCDS8592.1 CLEC4A gene_id:50856|Hs108|chr12 ( 204) 292 67.5 9.1e-12
CCDS53970.1 ACAN gene_id:176|Hs108|chr15 (2530) 304 70.9 1.1e-11
CCDS53971.1 ACAN gene_id:176|Hs108|chr15 (2431) 296 69.3 3.2e-11
CCDS8593.1 CLEC4D gene_id:338339|Hs108|chr12 ( 215) 278 64.7 6.7e-11
CCDS8584.1 CLEC4C gene_id:170482|Hs108|chr12 ( 182) 277 64.5 6.8e-11
CCDS8583.1 CLEC4C gene_id:170482|Hs108|chr12 ( 213) 277 64.5 7.7e-11
>>CCDS11089.1 ASGR1 gene_id:432|Hs108|chr17 (291 aa)
initn: 2082 init1: 2082 opt: 2082 Z-score: 2272.0 bits: 428.4 E(32554): 3.1e-120
Smith-Waterman score: 2082; 100.0% identity (100.0% similar) in 291 aa overlap (1-291:1-291)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTKEYQDLQHLDNEESDHHQLRKGPPPPQPLLQRLCSGPRLLLLSLGLSLLLLVVVCVIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MTKEYQDLQHLDNEESDHHQLRKGPPPPQPLLQRLCSGPRLLLLSLGLSLLLLVVVCVIG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 SQNSQLQEELRGLRETFSNFTASTEAQVKGLSTQGGNVGRKMKSLESQLEKQQKDLSEDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SQNSQLQEELRGLRETFSNFTASTEAQVKGLSTQGGNVGRKMKSLESQLEKQQKDLSEDH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SSLLLHVKQFVSDLRSLSCQMAALQGNGSERTCCPVNWVEHERSCYWFSRSGKAWADADN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SSLLLHVKQFVSDLRSLSCQMAALQGNGSERTCCPVNWVEHERSCYWFSRSGKAWADADN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 YCRLEDAHLVVVTSWEEQKFVQHHIGPVNTWMGLHDQNGPWKWVDGTDYETGFKNWRPEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YCRLEDAHLVVVTSWEEQKFVQHHIGPVNTWMGLHDQNGPWKWVDGTDYETGFKNWRPEQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB6 PDDWYGHGLGGGEDCAHFTDDGRWNDDVCQRPYRWVCETELDKASQEPPLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PDDWYGHGLGGGEDCAHFTDDGRWNDDVCQRPYRWVCETELDKASQEPPLL
250 260 270 280 290
>>CCDS56017.1 ASGR1 gene_id:432|Hs108|chr17 (252 aa)
initn: 1657 init1: 1657 opt: 1657 Z-score: 1810.0 bits: 342.7 E(32554): 1.7e-94
Smith-Waterman score: 1726; 86.3% identity (86.6% similar) in 291 aa overlap (1-291:1-252)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTKEYQDLQHLDNEESDHHQLRKGPPPPQPLLQRLCSGPRLLLLSLGLSLLLLVVVCVIG
:::::::::::::::::::::::
CCDS56 MTKEYQDLQHLDNEESDHHQLRK-------------------------------------
10 20
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 SQNSQLQEELRGLRETFSNFTASTEAQVKGLSTQGGNVGRKMKSLESQLEKQQKDLSEDH
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 --DSQLQEELRGLRETFSNFTASTEAQVKGLSTQGGNVGRKMKSLESQLEKQQKDLSEDH
30 40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SSLLLHVKQFVSDLRSLSCQMAALQGNGSERTCCPVNWVEHERSCYWFSRSGKAWADADN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SSLLLHVKQFVSDLRSLSCQMAALQGNGSERTCCPVNWVEHERSCYWFSRSGKAWADADN
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 YCRLEDAHLVVVTSWEEQKFVQHHIGPVNTWMGLHDQNGPWKWVDGTDYETGFKNWRPEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 YCRLEDAHLVVVTSWEEQKFVQHHIGPVNTWMGLHDQNGPWKWVDGTDYETGFKNWRPEQ
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290
pF1KB6 PDDWYGHGLGGGEDCAHFTDDGRWNDDVCQRPYRWVCETELDKASQEPPLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PDDWYGHGLGGGEDCAHFTDDGRWNDDVCQRPYRWVCETELDKASQEPPLL
210 220 230 240 250
>>CCDS11088.1 ASGR2 gene_id:433|Hs108|chr17 (287 aa)
initn: 1240 init1: 1240 opt: 1293 Z-score: 1412.9 bits: 269.4 E(32554): 2.2e-72
Smith-Waterman score: 1293; 61.2% identity (86.7% similar) in 278 aa overlap (1-278:1-277)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTKEYQDLQHLDNEESDHHQLRKGPPPPQPLLQRLCSGPRLLLLSLGLSLLLLVVVCVIG
:.:..::.:.:..::.:: ...:::: ::: ::::: . ::.:....:::::.:: :
CCDS11 MAKDFQDIQQLSSEENDH-PFHQGPPPAQPLAQRLCSMVCFSLLALSFNILLLVVICVTG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 SQNSQLQEELRGLRETFSNFTASTEAQVKGLSTQGGNVGRKMKSLESQLEKQQKDLSEDH
::..::: :::.:.:.::::..:: ..:...::.::.:: :. :: ..:::::.::. ::
CCDS11 SQSAQLQAELRSLKEAFSNFSSSTLTEVQAISTHGGSVGDKITSLGAKLEKQQQDLKADH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SSLLLHVKQFVSDLRSLSCQMAALQGNGSERTCCPVNWVEHERSCYWFSRSGKAWADADN
..::.:.:.: ::: ..::: :..:::.:::::::::::. ::::::.::::::.:..
CCDS11 DALLFHLKHFPVDLRFVACQMELLHSNGSQRTCCPVNWVEHQGSCYWFSHSGKAWAEAEK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 YCRLEDAHLVVVTSWEEQKFVQHHIGPVNTWMGLHDQNGPWKWVDGTDYETGFKNWRPEQ
::.::.:::::..:::::::. .: .: :::.:: :..: :::::::::. ..::: :
CCDS11 YCQLENAHLVVINSWEEQKFIVQHTNPFNTWIGLTDSDGSWKWVDGTDYRHNYKNWAVTQ
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KB6 PDDWYGHGLGGGEDCAHFTDDGRWNDDVCQRPYRWVCETELDKASQEPPLL
::.:.:: :::.:::.. ::::::: : . ::::::
CCDS11 PDNWHGHELGGSEDCVEVQPDGRWNDDFCLQVYRWVCEKRRNATGEVA
240 250 260 270 280
>>CCDS45598.1 ASGR2 gene_id:433|Hs108|chr17 (292 aa)
initn: 1157 init1: 1058 opt: 1273 Z-score: 1391.0 bits: 265.3 E(32554): 3.7e-71
Smith-Waterman score: 1273; 60.1% identity (85.2% similar) in 283 aa overlap (1-278:1-282)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTKEYQDLQHLDNEESDHHQLRKGPPPPQPLLQRLCSGPRLLLLSLGLSLLLLVVVCVIG
:.:..::.:.:..::.:: ...:::: ::: ::::: . ::.:....:::::.:: :
CCDS45 MAKDFQDIQQLSSEENDH-PFHQGPPPAQPLAQRLCSMVCFSLLALSFNILLLVVICVTG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 SQN-----SQLQEELRGLRETFSNFTASTEAQVKGLSTQGGNVGRKMKSLESQLEKQQKD
::. .::: :::.:.:.::::..:: ..:...::.::.:: :. :: ..:::::.:
CCDS45 SQSEGHGGAQLQAELRSLKEAFSNFSSSTLTEVQAISTHGGSVGDKITSLGAKLEKQQQD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 LSEDHSSLLLHVKQFVSDLRSLSCQMAALQGNGSERTCCPVNWVEHERSCYWFSRSGKAW
:. ::..::.:.:.: ::: ..::: :..:::.:::::::::::. ::::::.:::::
CCDS45 LKADHDALLFHLKHFPVDLRFVACQMELLHSNGSQRTCCPVNWVEHQGSCYWFSHSGKAW
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 ADADNYCRLEDAHLVVVTSWEEQKFVQHHIGPVNTWMGLHDQNGPWKWVDGTDYETGFKN
:.:..::.::.:::::..:::::::. .: .: :::.:: :..: :::::::::. ..::
CCDS45 AEAEKYCQLENAHLVVINSWEEQKFIVQHTNPFNTWIGLTDSDGSWKWVDGTDYRHNYKN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 WRPEQPDDWYGHGLGGGEDCAHFTDDGRWNDDVCQRPYRWVCETELDKASQEPPLL
: :::.:.:: :::.:::.. ::::::: : . ::::::
CCDS45 WAVTQPDNWHGHELGGSEDCVEVQPDGRWNDDFCLQVYRWVCEKRRNATGEVA
240 250 260 270 280 290
>>CCDS82049.1 CLEC10A gene_id:10462|Hs108|chr17 (289 aa)
initn: 808 init1: 808 opt: 1251 Z-score: 1367.1 bits: 260.9 E(32554): 7.9e-70
Smith-Waterman score: 1251; 58.7% identity (85.4% similar) in 288 aa overlap (1-287:1-287)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTKEYQDLQHLDNEESDHHQLRKGPPPPQPLLQRLCSGPRLLLLSLGLSLLLLVVVCVIG
::. :...:.:.:. . . ...:: : : ::::::::: :::::::.:::::..::.:
CCDS82 MTRTYENFQYLENKVKVQG-FKNGPLPLQSLLQRLCSGPCHLLLSLGLGLLLLVIICVVG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 SQNSQLQEELRGLRETFSNFTASTEAQVKGLSTQGGNVGRKMKSLESQLEKQQKDLSEDH
:::..:..: :: :::::..: :....:..::... . . ::....: ... . :
CCDS82 FQNSKFQRDLVTLRTDFSNFTSNTVAEIQALTSQGSSLEETIASLKAEVEGFKQERQAVH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB6 SSLLLHVKQFVSDLRSLSCQMAALQGNGS-ERTCCPVNWVEHERSCYWFSRSGKAWADAD
: .::.:.:.:.::..:.::.:.:..:.: : ::::::::::. ::::::.:: .::.:.
CCDS82 SEMLLRVQQLVQDLKKLTCQVATLNNNASTEGTCCPVNWVEHQDSCYWFSHSGMSWAEAE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 NYCRLEDAHLVVVTSWEEQKFVQHHIGPVNTWMGLHDQNGPWKWVDGTDYETGFKNWRPE
.::.:..:::::..: :::.:::...: . ::::: : .: ::::::::: :::.::.:
CCDS82 KYCQLKNAHLVVINSREEQNFVQKYLGSAYTWMGLSDPEGAWKWVDGTDYATGFQNWKPG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 QPDDWYGHGLGGGEDCAHFTDDGRWNDDVCQRPYRWVCETELDKASQEPPLL
::::: ::::::::::::: :::::::::::::.::::. : ..:::
CCDS82 QPDDWQGHGLGGGEDCAHFHPDGRWNDDVCQRPYHWVCEAGLGQTSQESH
240 250 260 270 280
>>CCDS45597.1 CLEC10A gene_id:10462|Hs108|chr17 (292 aa)
initn: 1258 init1: 808 opt: 1250 Z-score: 1366.0 bits: 260.7 E(32554): 9.2e-70
Smith-Waterman score: 1250; 58.1% identity (84.5% similar) in 291 aa overlap (1-287:1-290)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTKEYQDLQHLDNEESDHHQLRKGPPPPQPLLQRLCSGPRLLLLSLGLSLLLLVVVCVIG
::. :...:.:.:. . . ...:: : : ::::::::: :::::::.:::::..::.:
CCDS45 MTRTYENFQYLENKVKVQG-FKNGPLPLQSLLQRLCSGPCHLLLSLGLGLLLLVIICVVG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 SQNSQLQEELRGLRETFSNFTASTEAQVKGLSTQGGNVGRKMKSLESQLEKQQKDLSEDH
:::..:..: :: :::::..: :....:..::... . . ::....: ... . :
CCDS45 FQNSKFQRDLVTLRTDFSNFTSNTVAEIQALTSQGSSLEETIASLKAEVEGFKQERQAVH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB6 SSLLLHVKQFVSDLRSLSCQMAALQGNG----SERTCCPVNWVEHERSCYWFSRSGKAWA
: .::.:.:.:.::..:.::.:.:..:: .: ::::::::::. ::::::.:: .::
CCDS45 SEMLLRVQQLVQDLKKLTCQVATLNNNGEEASTEGTCCPVNWVEHQDSCYWFSHSGMSWA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 DADNYCRLEDAHLVVVTSWEEQKFVQHHIGPVNTWMGLHDQNGPWKWVDGTDYETGFKNW
.:..::.:..:::::..: :::.:::...: . ::::: : .: ::::::::: :::.::
CCDS45 EAEKYCQLKNAHLVVINSREEQNFVQKYLGSAYTWMGLSDPEGAWKWVDGTDYATGFQNW
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 RPEQPDDWYGHGLGGGEDCAHFTDDGRWNDDVCQRPYRWVCETELDKASQEPPLL
.: ::::: ::::::::::::: :::::::::::::.::::. : ..:::
CCDS45 KPGQPDDWQGHGLGGGEDCAHFHPDGRWNDDVCQRPYHWVCEAGLGQTSQESH
240 250 260 270 280 290
>>CCDS32544.1 ASGR2 gene_id:433|Hs108|chr17 (311 aa)
initn: 1149 init1: 1058 opt: 1208 Z-score: 1319.9 bits: 252.3 E(32554): 3.4e-67
Smith-Waterman score: 1248; 57.5% identity (80.4% similar) in 301 aa overlap (1-278:1-301)
10 20 30 40
pF1KB6 MTKEYQDLQHLDNEESDH--HQ----------------LRKGPPPPQPLLQRLCSGPRLL
:.:..::.:.:..::.:: :: . ::::: ::: ::::: .
CCDS32 MAKDFQDIQQLSSEENDHPFHQGEGPGTRRLNPRRGNPFLKGPPPAQPLAQRLCSMVCFS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KB6 LLSLGLSLLLLVVVCVIGSQN-----SQLQEELRGLRETFSNFTASTEAQVKGLSTQGGN
::.:....:::::.:: :::. .::: :::.:.:.::::..:: ..:...::.::.
CCDS32 LLALSFNILLLVVICVTGSQSEGHGGAQLQAELRSLKEAFSNFSSSTLTEVQAISTHGGS
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 VGRKMKSLESQLEKQQKDLSEDHSSLLLHVKQFVSDLRSLSCQMAALQGNGSERTCCPVN
:: :. :: ..:::::.::. ::..::.:.:.: ::: ..::: :..:::.:::::::
CCDS32 VGDKITSLGAKLEKQQQDLKADHDALLFHLKHFPVDLRFVACQMELLHSNGSQRTCCPVN
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 WVEHERSCYWFSRSGKAWADADNYCRLEDAHLVVVTSWEEQKFVQHHIGPVNTWMGLHDQ
::::. ::::::.::::::.:..::.::.:::::..:::::::. .: .: :::.:: :.
CCDS32 WVEHQGSCYWFSHSGKAWAEAEKYCQLENAHLVVINSWEEQKFIVQHTNPFNTWIGLTDS
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 NGPWKWVDGTDYETGFKNWRPEQPDDWYGHGLGGGEDCAHFTDDGRWNDDVCQRPYRWVC
.: :::::::::. ..::: :::.:.:: :::.:::.. ::::::: : . :::::
CCDS32 DGSWKWVDGTDYRHNYKNWAVTQPDNWHGHELGGSEDCVEVQPDGRWNDDFCLQVYRWVC
250 260 270 280 290 300
280 290
pF1KB6 ETELDKASQEPPLL
:
CCDS32 EKRRNATGEVA
310
>>CCDS11087.1 CLEC10A gene_id:10462|Hs108|chr17 (316 aa)
initn: 1145 init1: 808 opt: 918 Z-score: 1003.9 bits: 193.8 E(32554): 1.3e-49
Smith-Waterman score: 1205; 54.9% identity (79.4% similar) in 315 aa overlap (1-287:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTKEYQDLQHLDNEESDHHQLRKGPPPPQPLLQRLCSGPRLLLLSLGLSLLLLVVVCVIG
::. :...:.:.:. . . ...:: : : ::::::::: :::::::.:::::..::.:
CCDS11 MTRTYENFQYLENKVKVQG-FKNGPLPLQSLLQRLCSGPCHLLLSLGLGLLLLVIICVVG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 SQNSQLQEELRGLRETFSNFTASTEAQVKGLSTQGGNVGRKMKSLESQLE--KQQK----
:::..:..: :: :::::..: :....:..::... . . ::....: ::..
CCDS11 FQNSKFQRDLVTLRTDFSNFTSNTVAEIQALTSQGSSLEETIASLKAEVEGFKQERQAGV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150
pF1KB6 -DLSED--------------------HSSLLLHVKQFVSDLRSLSCQMAALQGNGS-ERT
.:.: :: .::.:.:.:.::..:.::.:.:..:.: : :
CCDS11 SELQEHTTQKAHLGHCPHCPSVCVPVHSEMLLRVQQLVQDLKKLTCQVATLNNNASTEGT
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 CCPVNWVEHERSCYWFSRSGKAWADADNYCRLEDAHLVVVTSWEEQKFVQHHIGPVNTWM
:::::::::. ::::::.:: .::.:..::.:..:::::..: :::.:::...: . :::
CCDS11 CCPVNWVEHQDSCYWFSHSGMSWAEAEKYCQLKNAHLVVINSREEQNFVQKYLGSAYTWM
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 GLHDQNGPWKWVDGTDYETGFKNWRPEQPDDWYGHGLGGGEDCAHFTDDGRWNDDVCQRP
:: : .: ::::::::: :::.::.: ::::: ::::::::::::: ::::::::::::
CCDS11 GLSDPEGAWKWVDGTDYATGFQNWKPGQPDDWQGHGLGGGEDCAHFHPDGRWNDDVCQRP
240 250 260 270 280 290
280 290
pF1KB6 YRWVCETELDKASQEPPLL
:.::::. : ..:::
CCDS11 YHWVCEAGLGQTSQESH
300 310
>>CCDS45952.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19 (312 aa)
initn: 315 init1: 148 opt: 391 Z-score: 430.1 bits: 87.6 E(32554): 1.2e-17
Smith-Waterman score: 391; 31.2% identity (59.4% similar) in 266 aa overlap (35-287:38-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 YQDLQHLDNEESDHHQLRKGPPPPQPLLQRLCSGPRLL-LLSLGLSLLLLVVVCVIGSQN
: :: .: :::. : ::: : . :.
CCDS45 RLQQLGLLEEEQLRGLGFRQTRGYKSLAGCLGHGPLVLQLLSFTLLAGLLVQVSKVPSSI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 SQLQEELRGLRETFSNFTAST-EAQVKGLSTQGGNVGRKMKSLESQLEKQQK--DLSEDH
:: : . .. ...... :.. : . :. . . ..:. ..: ...: .. ..
CCDS45 SQEQSRQDAIYQNLTQLKAAVGELSEKSKLQEIYQELTQLKAAVGELPEKSKLQEIYQEL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB6 SSLLLHVKQFV--SDLRSLSCQMAALQGNGSERTC--CPVNWVEHERSCYWFSRSGKAWA
. : : .. : :. . ... :.. . :: : :: .:. . .::..: : . :
CCDS45 TRLKAAVGELPEKSKLQEIYQELTWLKA-AVERLCHPCPWEWTFFQGNCYFMSNSQRNWH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 DADNYCRLEDAHLVVVTSWEEQKFVQHHIGPVN--TWMGLHD--QNGPWKWVDGTDYETG
:. . :. :.:::. : :::.:.: . . : ::::: : :.: :.::::. .
CCDS45 DSITACKEVGAQLVVIKSAEEQNFLQLQSSRSNRFTWMGLSDLNQEGTWQWVDGSPLLPS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 FKN-WRPEQPDDWYGHGLGGGEDCAHFTDDGRWNDDVCQRPYRWVCETELDKASQEPPLL
::. : .:.. : ::::.:. .: :::: :. :.:. . :..
CCDS45 FKQYWNRGEPNNV------GEEDCAEFSGNG-WNDDKCNLAKFWICKKSAASCSRDEEQF
250 260 270 280 290
CCDS45 LSPAPATPNPPPA
300 310
>>CCDS56087.1 CLEC17A gene_id:388512|Hs108|chr19 (378 aa)
initn: 284 init1: 167 opt: 379 Z-score: 415.9 bits: 85.3 E(32554): 7.6e-17
Smith-Waterman score: 379; 35.0% identity (62.5% similar) in 160 aa overlap (124-278:222-373)
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 QGGNVGRKMKSLESQLEKQQKDLSEDHSSLLLHVKQFVSDLRSLSCQ-MAALQGN-GSER
: .:. .. .:. . : .. : : .:
CCDS56 LIKYQELMEELRMLSFQQMTWRTNMTGMAGLAGLKHDIARVRADTNQSLVELWGLLDCRR
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 TCCPVNWVEHERSCYWFSRSGKAWADADNYCRLEDAHLVVVTSWEEQKFV-QHHIGPVNT
:: .:. : .::.:: : :.: .: .:. . .:::...:. :..:: . : .:
CCDS56 ITCPEGWLPFEGKCYYFSPSTKSWDEARMFCQENYSHLVIINSFAEHNFVAKAHGSPRVY
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260
pF1KB6 WMGLHD--QNGPWKWVDGTDYETGFKNWRPEQPDDWYGHGLGGGEDCAHFTDDGRWNDDV
:.::.: :.: :.:.::. .: :.::.:.. . :::: .. : :::
CCDS56 WLGLNDRAQEGDWRWLDGSPVTLSF--WEPEEPNNIHD------EDCATMNKGGTWNDLS
320 330 340 350 360
270 280 290
pF1KB6 CQRPYRWVCETELDKASQEPPLL
: . :.::
CCDS56 CYKTTYWICERKCSC
370
291 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 11:01:55 2016 done: Sat Nov 5 11:01:56 2016
Total Scan time: 2.690 Total Display time: 0.000
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]