Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6334
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6334, 289 aa
1>>>pF1KB6334 289 - 289 aa - 289 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8933+/-0.00123; mu= 3.6794+/- 0.072
mean_var=134.5182+/-27.033, 0's: 0 Z-trim(105.0): 44 B-trim: 68 in 1/49
Lambda= 0.110582
statistics sampled from 8143 (8184) to 8143 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.603), E-opt: 0.2 (0.251), width: 16
Scan time: 2.030
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7975.1 STX3 gene_id:6809|Hs108|chr11 ( 289) 1782 295.7 2.5e-80
CCDS53637.1 STX3 gene_id:6809|Hs108|chr11 ( 277) 1654 275.3 3.4e-74
CCDS9270.1 STX2 gene_id:2054|Hs108|chr12 ( 288) 1164 197.2 1.2e-50
CCDS9269.1 STX2 gene_id:2054|Hs108|chr12 ( 287) 1142 193.6 1.4e-49
CCDS34655.1 STX1A gene_id:6804|Hs108|chr7 ( 288) 1141 193.5 1.5e-49
CCDS10699.1 STX1B gene_id:112755|Hs108|chr16 ( 288) 1078 183.4 1.6e-46
CCDS55120.1 STX1A gene_id:6804|Hs108|chr7 ( 251) 932 160.1 1.5e-39
CCDS10700.1 STX4 gene_id:6810|Hs108|chr16 ( 297) 697 122.7 3.3e-28
CCDS61916.1 STX4 gene_id:6810|Hs108|chr16 ( 295) 673 118.8 4.7e-27
CCDS5205.1 STX11 gene_id:8676|Hs108|chr6 ( 287) 462 85.2 6.3e-17
CCDS33793.1 STX19 gene_id:415117|Hs108|chr3 ( 294) 429 79.9 2.5e-15
>>CCDS7975.1 STX3 gene_id:6809|Hs108|chr11 (289 aa)
initn: 1782 init1: 1782 opt: 1782 Z-score: 1555.5 bits: 295.7 E(32554): 2.5e-80
Smith-Waterman score: 1782; 100.0% identity (100.0% similar) in 289 aa overlap (1-289:1-289)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MKDRLEQLKAKQLTQDDDTDAVEIAIDNTAFMDEFFSEIEETRLNIDKISEHVEEAKKLY
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CCDS79 MKDRLEQLKAKQLTQDDDTDAVEIAIDNTAFMDEFFSEIEETRLNIDKISEHVEEAKKLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 SIILSAPIPEPKTKDDLEQLTTEIKKRANNVRNKLKSMEKHIEEDEVRSSADLRIRKSQH
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CCDS79 SIILSAPIPEPKTKDDLEQLTTEIKKRANNVRNKLKSMEKHIEEDEVRSSADLRIRKSQH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SVLSRKFVEVMTKYNEAQVDFRERSKGRIQRQLEITGKKTTDEELEEMLESGNPAIFTSG
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CCDS79 SVLSRKFVEVMTKYNEAQVDFRERSKGRIQRQLEITGKKTTDEELEEMLESGNPAIFTSG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 IIDSQISKQALSEIEGRHKDIVRLESSIKELHDMFMDIAMLVENQGEMLDNIELNVMHTV
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CCDS79 IIDSQISKQALSEIEGRHKDIVRLESSIKELHDMFMDIAMLVENQGEMLDNIELNVMHTV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280
pF1KB6 DHVEKARDETKKAVKYQSQARKKLIIIIVLVVVLLGILALIIGLSVGLN
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CCDS79 DHVEKARDETKKAVKYQSQARKKLIIIIVLVVVLLGILALIIGLSVGLN
250 260 270 280
>>CCDS53637.1 STX3 gene_id:6809|Hs108|chr11 (277 aa)
initn: 1651 init1: 1651 opt: 1654 Z-score: 1445.4 bits: 275.3 E(32554): 3.4e-74
Smith-Waterman score: 1654; 97.1% identity (98.9% similar) in 275 aa overlap (1-275:1-275)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MKDRLEQLKAKQLTQDDDTDAVEIAIDNTAFMDEFFSEIEETRLNIDKISEHVEEAKKLY
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CCDS53 MKDRLEQLKAKQLTQDDDTDAVEIAIDNTAFMDEFFSEIEETRLNIDKISEHVEEAKKLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 SIILSAPIPEPKTKDDLEQLTTEIKKRANNVRNKLKSMEKHIEEDEVRSSADLRIRKSQH
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CCDS53 SIILSAPIPEPKTKDDLEQLTTEIKKRANNVRNKLKSMEKHIEEDEVRSSADLRIRKSQH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SVLSRKFVEVMTKYNEAQVDFRERSKGRIQRQLEITGKKTTDEELEEMLESGNPAIFTSG
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CCDS53 SVLSRKFVEVMTKYNEAQVDFRERSKGRIQRQLEITGKKTTDEELEEMLESGNPAIFTSG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 IIDSQISKQALSEIEGRHKDIVRLESSIKELHDMFMDIAMLVENQGEMLDNIELNVMHTV
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CCDS53 IIDSQISKQALSEIEGRHKDIVRLESSIKELHDMFMDIAMLVENQGEMLDNIELNVMHTV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280
pF1KB6 DHVEKARDETKKAVKYQSQARKKLIIIIVLVVVLLGILALIIGLSVGLN
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CCDS53 DHVEKARDETKKAVKYQSQARKKLISLQTGVATLVFR
250 260 270
>>CCDS9270.1 STX2 gene_id:2054|Hs108|chr12 (288 aa)
initn: 759 init1: 478 opt: 1164 Z-score: 1022.7 bits: 197.2 E(32554): 1.2e-50
Smith-Waterman score: 1164; 64.1% identity (89.3% similar) in 290 aa overlap (1-287:1-287)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MKDRLEQLKAKQLTQDDDTDAVEIAIDNTAFMDEFFSEIEETRLNIDKISEHVEEAKKLY
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CCDS92 MRDRLPDLTACR--KNDDGDTV-VVVEKDHFMDDFFHQVEEIRNSIDKITQYVEEVKKNH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 SIILSAPIPEPKTKDDLEQLTTEIKKRANNVRNKLKSMEKHIEEDEV--RSSADLRIRKS
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CCDS92 SIILSAPNPEGKIKEELEDLNKEIKKTANKIRAKLKAIEQSFDQDESGNRTSVDLRIRRT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 QHSVLSRKFVEVMTKYNEAQVDFRERSKGRIQRQLEITGKKTTDEELEEMLESGNPAIFT
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CCDS92 QHSVLSRKFVEAMAEYNEAQTLFRERSKGRIQRQLEITGRTTTDDELEEMLESGKPSIFT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 SGII-DSQISKQALSEIEGRHKDIVRLESSIKELHDMFMDIAMLVENQGEMLDNIELNVM
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CCDS92 SDIISDSQITRQALNEIESRHKDIMKLETSIRELHEMFMDMAMFVETQGEMINNIERNVM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB6 HTVDHVEKARDETKKAVKYQSQARKKLIIIIVLVVVLLGILALIIGLSVGLN
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CCDS92 NATDYVEHAKEETKKAIKYQSKARRKKWIIIAVSVVLVAIIALIIGLSVGK
240 250 260 270 280
>>CCDS9269.1 STX2 gene_id:2054|Hs108|chr12 (287 aa)
initn: 1136 init1: 452 opt: 1142 Z-score: 1003.7 bits: 193.6 E(32554): 1.4e-49
Smith-Waterman score: 1142; 62.3% identity (89.3% similar) in 289 aa overlap (1-286:1-286)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MKDRLEQLKAKQLTQDDDTDAVEIAIDNTAFMDEFFSEIEETRLNIDKISEHVEEAKKLY
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CCDS92 MRDRLPDLTACR--KNDDGDTV-VVVEKDHFMDDFFHQVEEIRNSIDKITQYVEEVKKNH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 SIILSAPIPEPKTKDDLEQLTTEIKKRANNVRNKLKSMEKHIEEDEV--RSSADLRIRKS
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CCDS92 SIILSAPNPEGKIKEELEDLNKEIKKTANKIRAKLKAIEQSFDQDESGNRTSVDLRIRRT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 QHSVLSRKFVEVMTKYNEAQVDFRERSKGRIQRQLEITGKKTTDEELEEMLESGNPAIFT
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CCDS92 QHSVLSRKFVEAMAEYNEAQTLFRERSKGRIQRQLEITGRTTTDDELEEMLESGKPSIFT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 SGII-DSQISKQALSEIEGRHKDIVRLESSIKELHDMFMDIAMLVENQGEMLDNIELNVM
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CCDS92 SDIISDSQITRQALNEIESRHKDIMKLETSIRELHEMFMDMAMFVETQGEMINNIERNVM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB6 HTVDHVEKARDETKKAVKYQSQARKKLIIIIVLVVVLLGILALIIGLSVGLN
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CCDS92 NATDYVEHAKEETKKAIKYQSKARRKLMFIIICVIVLLVILGIILATTLS
240 250 260 270 280
>>CCDS34655.1 STX1A gene_id:6804|Hs108|chr7 (288 aa)
initn: 832 init1: 417 opt: 1141 Z-score: 1002.8 bits: 193.5 E(32554): 1.5e-49
Smith-Waterman score: 1141; 63.3% identity (85.7% similar) in 286 aa overlap (1-283:1-284)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MKDRLEQLKAKQLTQDDDTDAVEIAIDNTAFMDEFFSEIEETRLNIDKISEHVEEAKKLY
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CCDS34 MKDRTQELRTAK--DSDDDDDVAVTVDRDRFMDEFFEQVEEIRGFIDKIAENVEEVKRKH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 SIILSAPIPEPKTKDDLEQLTTEIKKRANNVRNKLKSMEKHIEEDE--VRSSADLRIRKS
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CCDS34 SAILASPNPDEKTKEELEELMSDIKKTANKVRSKLKSIEQSIEQEEGLNRSSADLRIRKT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 QHSVLSRKFVEVMTKYNEAQVDFRERSKGRIQRQLEITGKKTTDEELEEMLESGNPAIFT
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CCDS34 QHSTLSRKFVEVMSEYNATQSDYRERCKGRIQRQLEITGRTTTSEELEDMLESGNPAIFA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 SGII-DSQISKQALSEIEGRHKDIVRLESSIKELHDMFMDIAMLVENQGEMLDNIELNVM
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CCDS34 SGIIMDSSISKQALSEIETRHSEIIKLENSIRELHDMFMDMAMLVESQGEMIDRIEYNVE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB6 HTVDHVEKARDETKKAVKYQSQARKKLIIIIVLVVVLLGILALIIGLSVGLN
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CCDS34 HAVDYVERAVSDTKKAVKYQSKARRKKIMIIICCVILGIVIASTVGGIFA
240 250 260 270 280
>>CCDS10699.1 STX1B gene_id:112755|Hs108|chr16 (288 aa)
initn: 808 init1: 439 opt: 1078 Z-score: 948.5 bits: 183.4 E(32554): 1.6e-46
Smith-Waterman score: 1078; 60.1% identity (83.5% similar) in 291 aa overlap (1-288:1-288)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MKDRLEQLKAKQLTQDDDTDAVEIAIDNTAFMDEFFSEIEETRLNIDKISEHVEEAKKLY
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CCDS10 MKDRTQELRS---AKDSDDEEEVVHVDRDHFMDEFFEQVEEIRGCIEKLSEDVEQVKKQH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 SIILSAPIPEPKTKDDLEQLTTEIKKRANNVRNKLKSMEKHIEEDE--VRSSADLRIRKS
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CCDS10 SAILAAPNPDEKTKQELEDLTADIKKTANKVRSKLKAIEQSIEQEEGLNRSSADLRIRKT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 QHSVLSRKFVEVMTKYNEAQVDFRERSKGRIQRQLEITGKKTTDEELEEMLESGNPAIFT
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CCDS10 QHSTLSRKFVEVMTEYNATQSKYRDRCKDRIQRQLEITGRTTTNEELEDMLESGKLAIFT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 SGI-IDSQISKQALSEIEGRHKDIVRLESSIKELHDMFMDIAMLVENQGEMLDNIELNVM
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CCDS10 DDIKMDSQMTKQALNEIETRHNEIIKLETSIRELHDMFVDMAMLVESQGEMIDRIEYNVE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB6 HTVDHVEKARDETKKAVKYQSQARKKLIIIIVLVVVLLGILALIIGLSVGLN
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CCDS10 HSVDYVERAVSDTKKAVKYQSKARRKKIMIIICCVVLGVVLASSIGGTLGL
240 250 260 270 280
>>CCDS55120.1 STX1A gene_id:6804|Hs108|chr7 (251 aa)
initn: 603 init1: 398 opt: 932 Z-score: 823.6 bits: 160.1 E(32554): 1.5e-39
Smith-Waterman score: 932; 64.9% identity (86.8% similar) in 228 aa overlap (1-225:1-226)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MKDRLEQLKAKQLTQDDDTDAVEIAIDNTAFMDEFFSEIEETRLNIDKISEHVEEAKKLY
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CCDS55 MKDRTQELRTAK--DSDDDDDVAVTVDRDRFMDEFFEQVEEIRGFIDKIAENVEEVKRKH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 SIILSAPIPEPKTKDDLEQLTTEIKKRANNVRNKLKSMEKHIEEDE--VRSSADLRIRKS
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CCDS55 SAILASPNPDEKTKEELEELMSDIKKTANKVRSKLKSIEQSIEQEEGLNRSSADLRIRKT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 QHSVLSRKFVEVMTKYNEAQVDFRERSKGRIQRQLEITGKKTTDEELEEMLESGNPAIFT
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CCDS55 QHSTLSRKFVEVMSEYNATQSDYRERCKGRIQRQLEITGRTTTSEELEDMLESGNPAIFA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 SGII-DSQISKQALSEIEGRHKDIVRLESSIKELHDMFMDIAMLVENQGEMLDNIELNVM
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CCDS55 SGIIMDSSISKQALSEIETRHSEIIKLENSIRELHDMFMDMAMLVESQTMWRGPCLTPRR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB6 HTVDHVEKARDETKKAVKYQSQARKKLIIIIVLVVVLLGILALIIGLSVGLN
CCDS55 PSSTRARRAGRKS
240 250
>>CCDS10700.1 STX4 gene_id:6810|Hs108|chr16 (297 aa)
initn: 737 init1: 293 opt: 697 Z-score: 619.8 bits: 122.7 E(32554): 3.3e-28
Smith-Waterman score: 718; 40.7% identity (76.6% similar) in 295 aa overlap (1-286:1-295)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MKDRLEQLKAKQLTQDD-DTDAVEIAID-NTAFM----DEFFSEIEETRLNIDKISEHVE
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CCDS10 MRDRTHELRQGDDSSDEEDKERVALVVHPGTARLGSPDEEFFHKVRTIRQTIVKLGNKVQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 EAKKLYSIILSAPIPEPKTKDDLEQLTTEIKKRANNVRNKLKSMEKHIEE-DEVRSSADL
: .: ::..:.:: . :..:..: :::. . ..: .::..: . :: :: .:..
CCDS10 ELEKQQVTILATPLPEESMKQELQNLRDEIKQLGREIRLQLKAIEPQKEEADENYNSVNT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 RIRKSQHSVLSRKFVEVMTKYNEAQVDFRERSKGRIQRQLEITGKK-TTDEELEEMLESG
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CCDS10 RMRKTQHGVLSQQFVELINKCNSMQSEYREKNVERIRRQLKITNAGMVSDEELEQMLDSG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 NPAIFTSGII-DSQISKQALSEIEGRHKDIVRLESSIKELHDMFMDIAMLVENQGEMLDN
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CCDS10 QSEVFVSNILKDTQVTRQALNEISARHSEIQQLERSIRELHDIFTFLATEVEMQGEMINR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KB6 IELNVMHTVDHVEKARDETKKAVKYQSQARKKLIIIIVLVVVLLGILALIIGLSVGLN
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CCDS10 IEKNILSSADYVERGQEHVKTALENQKKARKKKVLIAICVSITVVLLAVIIGVTVVG
250 260 270 280 290
>>CCDS61916.1 STX4 gene_id:6810|Hs108|chr16 (295 aa)
initn: 685 init1: 293 opt: 673 Z-score: 599.2 bits: 118.8 E(32554): 4.7e-27
Smith-Waterman score: 673; 42.9% identity (79.0% similar) in 252 aa overlap (38-286:42-293)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 LKAKQLTQDDDTDAVEIAIDNTAFMDEFFSEIEETRLNIDKISEHVEEAKKLYSIILSAP
... : .: :....:.: .: ::..:
CCDS61 SGSRWWCTRARHGWGARTRSSSTSPLGHPPQVRTIRQTIVKLGNKVQELEKQQVTILATP
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 IPEPKTKDDLEQLTTEIKKRANNVRNKLKSMEKHIEE-DEVRSSADLRIRKSQHSVLSRK
.:: . :..:..: :::. . ..: .::..: . :: :: .:.. :.::.::.:::..
CCDS61 LPEESMKQELQNLRDEIKQLGREIRLQLKAIEPQKEEADENYNSVNTRMRKTQHGVLSQQ
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 FVEVMTKYNEAQVDFRERSKGRIQRQLEITGKK-TTDEELEEMLESGNPAIFTSGII-DS
:::...: : : ..::.. ::.:::.::. ..:::::.::.::. .:.:.:. :.
CCDS61 FVELINKCNSMQSEYREKNVERIRRQLKITNAGMVSDEELEQMLDSGQSEVFVSNILKDT
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