Result of FASTA (omim) for
pF1KB6254
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6254, 683 aa
1>>>pF1KB6254 683 - 683 aa - 683 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7152+/-0.000384; mu= 0.8648+/- 0.024
mean_var=286.4672+/-62.145, 0's: 0 Z-trim(122.6): 139 B-trim: 4223 in 2/54
Lambda= 0.075777
statistics sampled from 40818 (41017) to 40818 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.785), E-opt: 0.2 (0.481), width: 16
Scan time: 14.680
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001157685 (OMIM: 610368) leucine-rich repeat an ( 696) 1040 127.4 1.8e-28
NP_055931 (OMIM: 610368) leucine-rich repeat and c ( 728) 1040 127.4 1.9e-28
NP_001157683 (OMIM: 610368) leucine-rich repeat an ( 763) 1019 125.1 9.5e-28
XP_016875972 (OMIM: 610368) PREDICTED: leucine-ric ( 731) 1008 123.9 2.1e-27
XP_016875973 (OMIM: 610368) PREDICTED: leucine-ric ( 477) 413 58.7 5.9e-08
NP_665894 (OMIM: 605247) p53-induced protein with ( 893) 400 57.5 2.5e-07
XP_011518513 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced ( 893) 400 57.5 2.5e-07
XP_011518512 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced ( 910) 400 57.5 2.5e-07
NP_665893 (OMIM: 605247) p53-induced protein with ( 910) 400 57.5 2.5e-07
XP_011518511 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced ( 920) 400 57.5 2.6e-07
XP_005253062 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced ( 934) 400 57.5 2.6e-07
XP_005253063 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced ( 934) 400 57.5 2.6e-07
XP_005253064 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced ( 934) 400 57.5 2.6e-07
XP_005253065 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced ( 788) 356 52.7 6.4e-06
XP_011518514 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced ( 788) 356 52.7 6.4e-06
NP_001255968 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich re ( 536) 351 52.0 7.1e-06
NP_031399 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich repea ( 582) 351 52.0 7.5e-06
NP_001311266 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich re ( 582) 351 52.0 7.5e-06
XP_016872191 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582) 351 52.0 7.5e-06
XP_016872192 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582) 351 52.0 7.5e-06
NP_001311265 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich re ( 582) 351 52.0 7.5e-06
XP_016872193 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582) 351 52.0 7.5e-06
XP_006717379 (OMIM: 610933,614436) PREDICTED: E3 u ( 690) 341 51.0 1.8e-05
XP_011542154 (OMIM: 605352) PREDICTED: malignant f (1003) 336 50.6 3.5e-05
NP_004216 (OMIM: 605352) malignant fibrous histioc (1052) 336 50.6 3.6e-05
NP_001177652 (OMIM: 610933,614436) E3 ubiquitin-pr ( 696) 326 49.3 5.7e-05
NP_001005373 (OMIM: 610933,614436) E3 ubiquitin-pr ( 723) 326 49.4 5.8e-05
NP_612370 (OMIM: 610933,614436) E3 ubiquitin-prote ( 723) 326 49.4 5.8e-05
XP_016870772 (OMIM: 610933,614436) PREDICTED: E3 u ( 723) 326 49.4 5.8e-05
NP_001005374 (OMIM: 610933,614436) E3 ubiquitin-pr ( 723) 326 49.4 5.8e-05
XP_016866486 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 331) 311 47.4 0.0001
XP_011513029 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 465) 311 47.5 0.00013
NP_060684 (OMIM: 608195) leucine-rich repeat-conta ( 524) 311 47.6 0.00014
XP_011513028 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 524) 311 47.6 0.00014
XP_006714723 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1246) 315 48.4 0.0002
XP_016865126 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1298) 315 48.4 0.00021
NP_001006600 (OMIM: 606944) erbin isoform 7 [Homo (1302) 315 48.4 0.00021
NP_001240627 (OMIM: 606944) erbin isoform 4 [Homo (1346) 315 48.4 0.00021
NP_001240630 (OMIM: 606944) erbin isoform 9 [Homo (1367) 315 48.4 0.00022
NP_061165 (OMIM: 606944) erbin isoform 2 [Homo sap (1371) 315 48.4 0.00022
NP_001240626 (OMIM: 606944) erbin isoform 1 [Homo (1412) 315 48.4 0.00022
XP_016865125 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1415) 315 48.4 0.00022
NP_001240628 (OMIM: 606944) erbin isoform 8 [Homo (1419) 315 48.4 0.00022
XP_005248612 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1456) 315 48.4 0.00023
XP_016865124 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1460) 315 48.4 0.00023
XP_005248611 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1460) 315 48.4 0.00023
NP_036557 (OMIM: 179555) ras suppressor protein 1 ( 277) 290 45.1 0.00044
XP_011539991 (OMIM: 612890) PREDICTED: volume-regu ( 858) 300 46.6 0.00048
XP_016857090 (OMIM: 612890) PREDICTED: volume-regu ( 858) 300 46.6 0.00048
NP_060573 (OMIM: 612890) volume-regulated anion ch ( 858) 300 46.6 0.00048
>>NP_001157685 (OMIM: 610368) leucine-rich repeat and ca (696 aa)
initn: 1351 init1: 976 opt: 1040 Z-score: 632.1 bits: 127.4 E(85289): 1.8e-28
Smith-Waterman score: 1409; 43.4% identity (65.4% similar) in 662 aa overlap (7-635:41-675)
10 20 30
pF1KB6 MAAAVAAPLAAGGEEAAATTSVPGSPGLPGRRSAER
:: .::: ... :. .:: :. ::
NP_001 FVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGS-----GGFNLPLNRGLER
20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 ALEEAVATGTLNLSNRRLKHFPRGAARSYDLSDITQADLSRNRFPEVPEAACQLVSLEGL
:::::. .: :::: :.::.::: :: ..:::: .:::::.::. ::: :..:::: :
NP_001 ALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEIL
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 SLYHNCLRCLNPALGNLTALTYLNLSRNQLSLLPPYICQLPLRVLIVSNNKLGALPPDIG
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NP_001 NLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 TLGSLRQLDVSSNELQSLPSELCGLSSLRDLNVRRNQLSTLPEELGDLPLVRLDFSCNRV
: .: .:::: ::. .::... :.:::.:::::: :..::.:: :::::..:::::.:
NP_001 QLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLPLVKFDFSCNKV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 SRIPVSFCRLRHLQVILLDSNPLQSPPAQVCLKGKLHIFKYLSTEAGQRGSALG-DLAPS
::. : ....:::.::..:::::::::.: :::.::::::: .: : .: . :
NP_001 LVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSLYLHTM
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 RPPSFSPCPAEDLFPGHRYDGGLDSGFHSVDSGSKRWSGNESTDEFS-ELSFRISELARE
. : . .:: :.. :. ::: : :.:.:: :..: .:: . :. .:.. .:
NP_001 ERPHLHQ-HVED---GKK-DS--DSGVGS-DNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEE
310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KB6 PRGPRERKEDGSADGDPVQIDFIDSHVP-----GEDEERGTVEEQRPPELSPGAGDRERA
. :::. .::. .: . : :.. . : ..: . . : ..
NP_001 EQII---KEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGEERDQFTDR-ADGLHSEFMN
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430
pF1KB6 PSSRREEPAGEERRRPDTLQLWQER----ERRQQQQSGAWGAPRK---DSLLKP-GL---
..: :. :: : . :: . ..:... : . : : : ::
NP_001 YKARAED--CEELLRIEEDVHWQTEGIISSSKDQDMDIAMIEQLREAVDLLQDPNGLSTD
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480
pF1KB6 ---RAVV-----GGAAAVSTQ-AMHNG------SPKSSASQAGAAAGQGAPAPAPASQEP
:.:. :.: :. : . :: :: ... . ..:. .:
NP_001 ITERSVLNLYPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQSDLTLQSNGSQYSPNEIREN
480 490 500 510 520 530
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 LPIAGPATAPAPRPLGSIQRPNSFLFRSSSQSGSGPSSPDSVLRPRRYPQVPDEKDLMTQ
: ..:.: . :.: .: : ..: : . .:. ..: :.. :. .::.:. :
NP_001 SPAVSPTTN-STAPFG--LKPRSVFLRP--QRNLESIDPQFTIR-RKMEQMREEKELVEQ
540 550 560 570 580
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 LRQVLESRLQRPLPEDLAEALASGVILCQLANQLRPRSVPFIHVPSPAVPKLSALKARKN
::. .: ::. : :::. :: .::.::.:.:..::::: :::::::::::: : :.:
NP_001 LRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRN
590 600 610 620 630 640
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 VESFLEACRKMGVPEADLCSPSDLLQGTARGLRTALEAVKRVGGKALPPLWPPSGLGGFV
::.:::::::.:::: :: : .:. .::
NP_001 VENFLEACRKLGVPEEKLCLPHHILE--EKGLVKVGITIQALLDITVTKALFT
650 660 670 680 690
670 680
pF1KB6 VFYVVLMLLLYVTYTRLLGS
>>NP_055931 (OMIM: 610368) leucine-rich repeat and calpo (728 aa)
initn: 1441 init1: 976 opt: 1040 Z-score: 631.8 bits: 127.4 E(85289): 1.9e-28
Smith-Waterman score: 1517; 43.1% identity (65.9% similar) in 706 aa overlap (7-677:41-721)
10 20 30
pF1KB6 MAAAVAAPLAAGGEEAAATTSVPGSPGLPGRRSAER
:: .::: ... :. .:: :. ::
NP_055 FVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGS-----GGFNLPLNRGLER
20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 ALEEAVATGTLNLSNRRLKHFPRGAARSYDLSDITQADLSRNRFPEVPEAACQLVSLEGL
:::::. .: :::: :.::.::: :: ..:::: .:::::.::. ::: :..:::: :
NP_055 ALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEIL
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100 110 120 130 140 150
pF1KB6 SLYHNCLRCLNPALGNLTALTYLNLSRNQLSLLPPYICQLPLRVLIVSNNKLGALPPDIG
.:::::.: . :. :: :::::::::::: :: .: :::.:::.::::::.:: .::
NP_055 NLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 TLGSLRQLDVSSNELQSLPSELCGLSSLRDLNVRRNQLSTLPEELGDLPLVRLDFSCNRV
: .: .:::: ::. .::... :.:::.:::::: :..::.:: :::::..:::::.:
NP_055 QLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLPLVKFDFSCNKV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 SRIPVSFCRLRHLQVILLDSNPLQSPPAQVCLKGKLHIFKYLSTEAGQRGSALG-DLAPS
::. : ....:::.::..:::::::::.: :::.::::::: .: : .: . :
NP_055 LVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSLYLHTM
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 RPPSFSPCPAEDLFPGHRYDGGLDSGFHSVDSGSKRWSGNESTDEFS-ELSFRISELARE
. : . .:: :.. :. ::: : :.:.:: :..: .:: . :. .:.. .:
NP_055 ERPHLHQ-HVED---GKK-DS--DSGVGS-DNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEE
310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KB6 PRGPRERKEDGSADGDPVQIDFIDSHVP-----GEDEERGTVEEQRPPELSPGAGDRERA
. :::. .::. .: . : :.. . : :... . . : ..
NP_055 EQII---KEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGE-ERDQFTDRADGLHSEFMN
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430
pF1KB6 PSSRREEPAGEERRRPDTLQLWQER----ERRQQQQSGAWGAPRK---DSLLKP-GL---
..: :. :: : . :: . ..:... : . : : : ::
NP_055 YKARAED--CEELLRIEEDVHWQTEGIISSSKDQDMDIAMIEQLREAVDLLQDPNGLSTD
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480
pF1KB6 ---RAVV-----GGAAAVSTQ-AMHNG------SPKSSASQAGAAAGQGAPAPAPASQEP
:.:. :.: :. : . :: :: ... . ..:. .:
NP_055 ITERSVLNLYPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQSDLTLQSNGSQYSPNEIREN
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490 500 510 520 530 540
pF1KB6 LPIAGPATAPAPRPLGSIQRPNSFLFRSSSQSGSGPSSPDSVLRPRRYPQVPDEKDLMTQ
: ..:.: . :.: .: : ..: : . .:. ..: :.. :. .::.:. :
NP_055 SPAVSPTTN-STAPFG--LKPRSVFLRP--QRNLESIDPQFTIR-RKMEQMREEKELVEQ
540 550 560 570 580
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 LRQVLESRLQRPLPEDLAEALASGVILCQLANQLRPRSVPFIHVPSPAVPKLSALKARKN
::. .: ::. : :::. :: .::.::.:.:..::::: :::::::::::: : :.:
NP_055 LRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRN
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610 620 630 640 650 660
pF1KB6 VESFLEACRKMGVPEADLCSPSDLLQGTARGLRTALEAVKRVGGKALPPLWP--PSGLGG
::.:::::::.:::::::::: :.:: : .: ..... .: :: :: : :
NP_055 VENFLEACRKLGVPEADLCSPCDILQLDFRHIRKTVDTLLALGEKAPPPTSALRSRDLIG
650 660 670 680 690 700
670 680
pF1KB6 FVVFYVVLMLLLYVTYTRLLGS
: . ......:.:.::
NP_055 FCLVHILFIVLVYITYHWNALSA
710 720
>>NP_001157683 (OMIM: 610368) leucine-rich repeat and ca (763 aa)
initn: 1441 init1: 976 opt: 1019 Z-score: 619.2 bits: 125.1 E(85289): 9.5e-28
Smith-Waterman score: 1464; 43.0% identity (64.7% similar) in 709 aa overlap (7-652:41-729)
10 20 30
pF1KB6 MAAAVAAPLAAGGEEAAATTSVPGSPGLPGRRSAER
:: .::: ... :. .:: :. ::
NP_001 FVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGS-----GGFNLPLNRGLER
20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 ALEEAVATGTLNLSNRRLKHFPRGAARSYDLSDITQADLSRNRFPEVPEAACQLVSLEGL
:::::. .: :::: :.::.::: :: ..:::: .:::::.::. ::: :..:::: :
NP_001 ALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEIL
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 SLYHNCLRCLNPALGNLTALTYLNLSRNQLSLLPPYICQLPLRVLIVSNNKLGALPPDIG
.:::::.: . :. :: :::::::::::: :: .: :::.:::.::::::.:: .::
NP_001 NLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 TLGSLRQLDVSSNELQSLPSELCGLSSLRDLNVRRNQLSTLPEELGDLPLVRLDFSCNRV
: .: .:::: ::. .::... :.:::.:::::: :..::.:: :::::..:::::.:
NP_001 QLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLPLVKFDFSCNKV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 SRIPVSFCRLRHLQVILLDSNPLQSPPAQVCLKGKLHIFKYLSTEAGQRGSALG-DLAPS
::. : ....:::.::..:::::::::.: :::.::::::: .: : .: . :
NP_001 LVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSLYLHTM
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 RPPSFSPCPAEDLFPGHRYDGGLDSGFHSVDSGSKRWSGNESTDEFS-ELSFRISELARE
. : . .:: :.. :. ::: : :.:.:: :..: .:: . :. .:.. .:
NP_001 ERPHLHQ-HVED---GKK-DS--DSGVGS-DNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEE
310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KB6 PRGPRERKEDGSADGDPVQIDFIDSHVP-----GEDEERGTVEEQRPPELSPGAGDRERA
. :::. .::. .: . : :.. . : :... . . : ..
NP_001 EQII---KEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGE-ERDQFTDRADGLHSEFMN
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430
pF1KB6 PSSRREEPAGEERRRPDTLQLWQER----ERRQQQQSGAWGAPRK---DSLLKP-GL---
..: :. :: : . :: . ..:... : . : : : ::
NP_001 YKARAED--CEELLRIEEDVHWQTEGIISSSKDQDMDIAMIEQLREAVDLLQDPNGLSTD
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470
pF1KB6 ---RAVV-----GGAAAVSTQ-AMHNG------SP----------KSSASQ-AGAAAGQG
:.:. :.: :. : . :: :: .:..:: . ..
NP_001 ITERSVLNLYPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQSDLTLQSNGSQYSPNEIREN
480 490 500 510 520 530
480 490 500 510 520
pF1KB6 APAPAPASQEPLPIA-GPATAPA---PRPLGSIQRPNSFLFRSSSQSGSGPSSPDSV-LR
.:: .:... :.. : . :: : :.. .. . ::: : . .. :.: ::
NP_001 SPAVSPTTNSTAPFGLKPRSDPALILP-PISFNTLTQAQTWDSSSYSVPSEGDSDNVFLR
540 550 560 570 580 590
530 540 550 560 570
pF1KB6 P--------------RRYPQVPDEKDLMTQLRQVLESRLQRPLPEDLAEALASGVILCQL
: :.. :. .::.:. :::. .: ::. : :::. :: .::.::.:
NP_001 PQRNLESIDPQFTIRRKMEQMREEKELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHL
600 610 620 630 640 650
580 590 600 610 620 630
pF1KB6 ANQLRPRSVPFIHVPSPAVPKLSALKARKNVESFLEACRKMGVPEADLCSPSDLLQGTAR
.:..::::: :::::::::::: : :.:::.:::::::.:::::::::: :.:: :
NP_001 VNHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEADLCSPCDILQLDFR
660 670 680 690 700 710
640 650 660 670 680
pF1KB6 GLRTALEAVKRVGGKALPPLWPPSGLGGFVVFYVVLMLLLYVTYTRLLGS
.: ..... .: :: ::
NP_001 HIRKTVDTLLALGEKAPPPTSALRSRDLIGFCLVHILFIVLVYITYHWNALSA
720 730 740 750 760
>>XP_016875972 (OMIM: 610368) PREDICTED: leucine-rich re (731 aa)
initn: 1340 init1: 965 opt: 1008 Z-score: 612.9 bits: 123.9 E(85289): 2.1e-27
Smith-Waterman score: 1380; 42.3% identity (63.7% similar) in 695 aa overlap (7-635:41-710)
10 20 30
pF1KB6 MAAAVAAPLAAGGEEAAATTSVPGSPGLPGRRSAER
:: .::: ... :. .:: :. ::
XP_016 FVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGS-----GGFNLPLNRGLER
20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 ALEEAVATGTLNLSNRRLKHFPRGAARSYDLSDITQADLSRNRFPEVPEAACQLVSLEGL
:::::. .: :::: :.::.::: :: ..:::: .:::::.::. ::: :..:::: :
XP_016 ALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEIL
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100 110 120 130 140 150
pF1KB6 SLYHNCLRCLNPALGNLTALTYLNLSRNQLSLLPPYICQLPLRVLIVSNNKLGALPPDIG
.:::::.: . :. :: :::::::::::: :: .: :::.:::.::::::.:: .::
XP_016 NLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 TLGSLRQLDVSSNELQSLPSELCGLSSLRDLNVRRNQLSTLPEELGDLPLVRLDFSCNRV
: .: .:::: ::. .::... :.:::.:::::: :..::.:: :: ::..:::::.:
XP_016 QLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLSLVKFDFSCNKV
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220 230 240 250 260 270
pF1KB6 SRIPVSFCRLRHLQVILLDSNPLQSPPAQVCLKGKLHIFKYLSTEAGQRGSALG-DLAPS
::. : ....:::.::..:::::::::.: :::.::::::: .: : .: . :
XP_016 LVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSLYLHTM
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 RPPSFSPCPAEDLFPGHRYDGGLDSGFHSVDSGSKRWSGNESTDEFS-ELSFRISELARE
. : . .:: :.. :. ::: : :.:.:: :..: .:: . :. .:.. .:
XP_016 ERPHLHQ-HVED---GKK-DS--DSGVGS-DNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEE
310 320 330 340 350
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pF1KB6 PRGPRERKEDGSADGDPVQIDFIDSHVP-----GEDEERGTVEEQRPPELSPGAGDRERA
. :::. .::. .: . : :.. . : ..: . . : ..
XP_016 EQII---KEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGEERDQFTDR-ADGLHSEFMN
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430
pF1KB6 PSSRREEPAGEERRRPDTLQLWQER----ERRQQQQSGAWGAPRK---DSLLKP-GL---
..: :. :: : . :: . ..:... : . : : : ::
XP_016 YKARAED--CEELLRIEEDVHWQTEGIISSSKDQDMDIAMIEQLREAVDLLQDPNGLSTD
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470
pF1KB6 ---RAVV-----GGAAAVSTQ-AMHNG------SP----------KSSASQ-AGAAAGQG
:.:. :.: :. : . :: :: .:..:: . ..
XP_016 ITERSVLNLYPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQSDLTLQSNGSQYSPNEIREN
480 490 500 510 520 530
480 490 500 510 520
pF1KB6 APAPAPASQEPLPIA-GPATAPA----PRPLGSIQRPNSFLFRSSSQSGSGPSSPDS---
.:: .:... :.. : . :: : .... . ... .:.: : :: ::
XP_016 SPAVSPTTNSTAPFGLKPRSDPALILPPISFNTLTQAQTW----DSSSYSVPSEGDSDNV
540 550 560 570 580
530 540 550 560 570
pF1KB6 VLRP--------------RRYPQVPDEKDLMTQLRQVLESRLQRPLPEDLAEALASGVIL
::: :.. :. .::.:. :::. .: ::. : :::. :: .::.:
XP_016 FLRPQRNLESIDPQFTIRRKMEQMREEKELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVL
590 600 610 620 630 640
580 590 600 610 620 630
pF1KB6 CQLANQLRPRSVPFIHVPSPAVPKLSALKARKNVESFLEACRKMGVPEADLCSPSDLLQG
:.:.:..::::: :::::::::::: : :.:::.:::::::.:::: :: : .:.
XP_016 CHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEEKLCLPHHILE-
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640 650 660 670 680
pF1KB6 TARGLRTALEAVKRVGGKALPPLWPPSGLGGFVVFYVVLMLLLYVTYTRLLGS
.::
XP_016 -EKGLVKVGITIQALLDITVTKALFT
710 720 730
>>XP_016875973 (OMIM: 610368) PREDICTED: leucine-rich re (477 aa)
initn: 610 init1: 389 opt: 413 Z-score: 263.8 bits: 58.7 E(85289): 5.9e-08
Smith-Waterman score: 608; 35.1% identity (57.1% similar) in 476 aa overlap (226-635:1-456)
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pF1KB6 TLPEELGDLPLVRLDFSCNRVSRIPVSFCRLRHLQVILLDSNPLQSPPAQVCLKGKLHIF
...:::.::..:::::::::.: :::.:::
XP_016 MKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIF
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260 270 280 290 300 310
pF1KB6 KYLSTEAGQRGSALG-DLAPSRPPSFSPCPAEDLFPGHRYDGGLDSGFHSVDSGSKRWSG
:::: .: : .: . : . : . .:: :.. :. ::: : :.:.:: :.
XP_016 KYLSIQACQIKTADSLYLHTMERPHLHQ-HVED---GKK-DS--DSGVGS-DNGDKRLSA
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pF1KB6 NESTDEFS-ELSFRISELAREPRGPRERKEDGSADGDPVQIDFIDSHVP-----GEDEER
.: .:: . :. .:.. .: . :::. .::. .: . : :.. .
XP_016 TEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQII---KEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNS
90 100 110 120 130
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pF1KB6 GTVEEQRPPELSPGAGDRERAPSSRREEPAGEERRRPDTLQLWQER----ERRQQQQSGA
: ..: . . : .. ..: :. :: : . :: . ..:... :
XP_016 GEERDQFTDR-ADGLHSEFMNYKARAED--CEELLRIEEDVHWQTEGIISSSKDQDMDIA
140 150 160 170 180 190
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pF1KB6 WGAPRK---DSLLKP-GL------RAVV-----GGAAAVSTQ-AMHNG------SP----
. : : : :: :.:. :.: :. : . :: ::
XP_016 MIEQLREAVDLLQDPNGLSTDITERSVLNLYPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEV
200 210 220 230 240 250
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pF1KB6 ------KSSASQ-AGAAAGQGAPAPAPASQEPLPIA-GPATAPA----PRPLGSIQRPNS
.:..:: . ...:: .:... :.. : . :: : .... . ..
XP_016 QSDLTLQSNGSQYSPNEIRENSPAVSPTTNSTAPFGLKPRSDPALILPPISFNTLTQAQT
260 270 280 290 300 310
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pF1KB6 FLFRSSSQSGSGPSSPDS---VLRP--------------RRYPQVPDEKDLMTQLRQVLE
. .:.: : :: :: ::: :.. :. .::.:. :::. .:
XP_016 W----DSSSYSVPSEGDSDNVFLRPQRNLESIDPQFTIRRKMEQMREEKELVEQLRESIE
320 330 340 350 360 370
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pF1KB6 SRLQRPLPEDLAEALASGVILCQLANQLRPRSVPFIHVPSPAVPKLSALKARKNVESFLE
::. : :::. :: .::.::.:.:..::::: :::::::::::: : :.:::.:::
XP_016 MRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLE
380 390 400 410 420 430
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pF1KB6 ACRKMGVPEADLCSPSDLLQGTARGLRTALEAVKRVGGKALPPLWPPSGLGGFVVFYVVL
::::.:::: :: : .:. .::
XP_016 ACRKLGVPEEKLCLPHHILE--EKGLVKVGITIQALLDITVTKALFT
440 450 460 470
>>NP_665894 (OMIM: 605247) p53-induced protein with a de (893 aa)
initn: 524 init1: 211 opt: 400 Z-score: 252.5 bits: 57.5 E(85289): 2.5e-07
Smith-Waterman score: 400; 41.5% identity (66.2% similar) in 195 aa overlap (54-244:114-302)
30 40 50 60 70 80
pF1KB6 GSPGLPGRRSAERALEEAVATGTLNLSNRRLKHFPRGAARSYDLSDITQADLSRNRFPEV
: ..: : . :. ... ::: : . .
NP_665 QLPQSLSCLRSLVLKGGQRRDTLGACLRGALTNLPAGLS---GLAHLAHLDLSFNSLETL
90 100 110 120 130 140
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 PEAACQLVSLEGLSLYHNCLRCLNPALGNLTALTYLNLSRNQLSLLPPYICQLP-LRVLI
: . :. .: .: : :::: : ::: : :::.:....:.:. ::: . : :. :
NP_665 PACVLQMRGLGALLLSHNCLSELPEALGALPALTFLTVTHNRLQTLPPALGALSTLQRLD
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 VSNNKLGALPPDIGTLGSLRQLDVSSNELQSLPSELCGLSSLRDLNVRRNQLSTLPEELG
.:.: : .:::.:: :::: .:...::.:::::. : :: ::: : .. : :...: .:.
NP_665 LSQNLLDTLPPEIGGLGSLLELNLASNRLQSLPASLAGLRSLRLLVLHSNLLASVPADLA
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250
pF1KB6 DLPLV-RLDFSCNRVSRIPVSFCRLRHLQVILLDSNPL--QSPPAQVCLKGKLHIFKYLS
:::. :::. :.. .: .: . :..::: :: :
NP_665 RLPLLTRLDLRDNQLRDLPP---ELLDAPFVRLQGNPLGEASPDAPSSPVAALIPEMPRL
270 280 290 300 310
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 TEAGQRGSALGDLAPSRPPSFSPCPAEDLFPGHRYDGGLDSGFHSVDSGSKRWSGNESTD
NP_665 FLTSDLDSFPVTPQGCSVTLACGVRLQFPAGATATPITIRYRLLLPEPGLVPLGPHDALL
320 330 340 350 360 370
>>XP_011518513 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced dea (893 aa)
initn: 524 init1: 211 opt: 400 Z-score: 252.5 bits: 57.5 E(85289): 2.5e-07
Smith-Waterman score: 400; 41.5% identity (66.2% similar) in 195 aa overlap (54-244:114-302)
30 40 50 60 70 80
pF1KB6 GSPGLPGRRSAERALEEAVATGTLNLSNRRLKHFPRGAARSYDLSDITQADLSRNRFPEV
: ..: : . :. ... ::: : . .
XP_011 QLPQSLSCLRSLVLKGGQRRDTLGACLRGALTNLPAGLS---GLAHLAHLDLSFNSLETL
90 100 110 120 130 140
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 PEAACQLVSLEGLSLYHNCLRCLNPALGNLTALTYLNLSRNQLSLLPPYICQLP-LRVLI
: . :. .: .: : :::: : ::: : :::.:....:.:. ::: . : :. :
XP_011 PACVLQMRGLGALLLSHNCLSELPEALGALPALTFLTVTHNRLQTLPPALGALSTLQRLD
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 VSNNKLGALPPDIGTLGSLRQLDVSSNELQSLPSELCGLSSLRDLNVRRNQLSTLPEELG
.:.: : .:::.:: :::: .:...::.:::::. : :: ::: : .. : :...: .:.
XP_011 LSQNLLDTLPPEIGGLGSLLELNLASNRLQSLPASLAGLRSLRLLVLHSNLLASVPADLA
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250
pF1KB6 DLPLV-RLDFSCNRVSRIPVSFCRLRHLQVILLDSNPL--QSPPAQVCLKGKLHIFKYLS
:::. :::. :.. .: .: . :..::: :: :
XP_011 RLPLLTRLDLRDNQLRDLPP---ELLDAPFVRLQGNPLGEASPDAPSSPVAALIPEMPRL
270 280 290 300 310
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 TEAGQRGSALGDLAPSRPPSFSPCPAEDLFPGHRYDGGLDSGFHSVDSGSKRWSGNESTD
XP_011 FLTSDLDSFPVTPQGCSVTLACGVRLQFPAGATATPITIRYRLLLPEPGLVPLGPHDALL
320 330 340 350 360 370
>>XP_011518512 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced dea (910 aa)
initn: 524 init1: 211 opt: 400 Z-score: 252.4 bits: 57.5 E(85289): 2.5e-07
Smith-Waterman score: 400; 41.5% identity (66.2% similar) in 195 aa overlap (54-244:114-302)
30 40 50 60 70 80
pF1KB6 GSPGLPGRRSAERALEEAVATGTLNLSNRRLKHFPRGAARSYDLSDITQADLSRNRFPEV
: ..: : . :. ... ::: : . .
XP_011 QLPQSLSCLRSLVLKGGQRRDTLGACLRGALTNLPAGLS---GLAHLAHLDLSFNSLETL
90 100 110 120 130 140
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 PEAACQLVSLEGLSLYHNCLRCLNPALGNLTALTYLNLSRNQLSLLPPYICQLP-LRVLI
: . :. .: .: : :::: : ::: : :::.:....:.:. ::: . : :. :
XP_011 PACVLQMRGLGALLLSHNCLSELPEALGALPALTFLTVTHNRLQTLPPALGALSTLQRLD
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 VSNNKLGALPPDIGTLGSLRQLDVSSNELQSLPSELCGLSSLRDLNVRRNQLSTLPEELG
.:.: : .:::.:: :::: .:...::.:::::. : :: ::: : .. : :...: .:.
XP_011 LSQNLLDTLPPEIGGLGSLLELNLASNRLQSLPASLAGLRSLRLLVLHSNLLASVPADLA
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250
pF1KB6 DLPLV-RLDFSCNRVSRIPVSFCRLRHLQVILLDSNPL--QSPPAQVCLKGKLHIFKYLS
:::. :::. :.. .: .: . :..::: :: :
XP_011 RLPLLTRLDLRDNQLRDLPP---ELLDAPFVRLQGNPLGEASPDAPSSPVAALIPEMPRL
270 280 290 300 310
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 TEAGQRGSALGDLAPSRPPSFSPCPAEDLFPGHRYDGGLDSGFHSVDSGSKRWSGNESTD
XP_011 FLTSDLDSFPVTPQGCSVTLACGVRLQFPAGATATPITIRYRLLLPEPGLVPLGPHDALL
320 330 340 350 360 370
>>NP_665893 (OMIM: 605247) p53-induced protein with a de (910 aa)
initn: 524 init1: 211 opt: 400 Z-score: 252.4 bits: 57.5 E(85289): 2.5e-07
Smith-Waterman score: 400; 41.5% identity (66.2% similar) in 195 aa overlap (54-244:114-302)
30 40 50 60 70 80
pF1KB6 GSPGLPGRRSAERALEEAVATGTLNLSNRRLKHFPRGAARSYDLSDITQADLSRNRFPEV
: ..: : . :. ... ::: : . .
NP_665 QLPQSLSCLRSLVLKGGQRRDTLGACLRGALTNLPAGLS---GLAHLAHLDLSFNSLETL
90 100 110 120 130 140
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 PEAACQLVSLEGLSLYHNCLRCLNPALGNLTALTYLNLSRNQLSLLPPYICQLP-LRVLI
: . :. .: .: : :::: : ::: : :::.:....:.:. ::: . : :. :
NP_665 PACVLQMRGLGALLLSHNCLSELPEALGALPALTFLTVTHNRLQTLPPALGALSTLQRLD
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 VSNNKLGALPPDIGTLGSLRQLDVSSNELQSLPSELCGLSSLRDLNVRRNQLSTLPEELG
.:.: : .:::.:: :::: .:...::.:::::. : :: ::: : .. : :...: .:.
NP_665 LSQNLLDTLPPEIGGLGSLLELNLASNRLQSLPASLAGLRSLRLLVLHSNLLASVPADLA
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250
pF1KB6 DLPLV-RLDFSCNRVSRIPVSFCRLRHLQVILLDSNPL--QSPPAQVCLKGKLHIFKYLS
:::. :::. :.. .: .: . :..::: :: :
NP_665 RLPLLTRLDLRDNQLRDLPP---ELLDAPFVRLQGNPLGEASPDAPSSPVAALIPEMPRL
270 280 290 300 310
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 TEAGQRGSALGDLAPSRPPSFSPCPAEDLFPGHRYDGGLDSGFHSVDSGSKRWSGNESTD
NP_665 FLTSDLDSFPVTPQGCSVTLACGVRLQFPAGATATPITIRYRLLLPEPGLVPLGPHDALL
320 330 340 350 360 370
>>XP_011518511 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced dea (920 aa)
initn: 461 init1: 211 opt: 400 Z-score: 252.4 bits: 57.5 E(85289): 2.6e-07
Smith-Waterman score: 400; 41.5% identity (66.2% similar) in 195 aa overlap (54-244:141-329)
30 40 50 60 70 80
pF1KB6 GSPGLPGRRSAERALEEAVATGTLNLSNRRLKHFPRGAARSYDLSDITQADLSRNRFPEV
: ..: : . :. ... ::: : . .
XP_011 QLPQSLSCLRSLVLKGGQRRDTLGACLRGALTNLPAGLS---GLAHLAHLDLSFNSLETL
120 130 140 150 160
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 PEAACQLVSLEGLSLYHNCLRCLNPALGNLTALTYLNLSRNQLSLLPPYICQLP-LRVLI
: . :. .: .: : :::: : ::: : :::.:....:.:. ::: . : :. :
XP_011 PACVLQMRGLGALLLSHNCLSELPEALGALPALTFLTVTHNRLQTLPPALGALSTLQRLD
170 180 190 200 210 220
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 VSNNKLGALPPDIGTLGSLRQLDVSSNELQSLPSELCGLSSLRDLNVRRNQLSTLPEELG
.:.: : .:::.:: :::: .:...::.:::::. : :: ::: : .. : :...: .:.
XP_011 LSQNLLDTLPPEIGGLGSLLELNLASNRLQSLPASLAGLRSLRLLVLHSNLLASVPADLA
230 240 250 260 270 280
210 220 230 240 250
pF1KB6 DLPLV-RLDFSCNRVSRIPVSFCRLRHLQVILLDSNPL--QSPPAQVCLKGKLHIFKYLS
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