FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6250, 682 aa
1>>>pF1KB6250 682 - 682 aa - 682 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7304+/-0.00228; mu= 15.7929+/- 0.137
mean_var=334.3067+/-60.769, 0's: 0 Z-trim(104.2): 962 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.070146
statistics sampled from 6709 (7773) to 6709 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.535), E-opt: 0.2 (0.239), width: 16
Scan time: 2.550
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12632.1 ZNF45 gene_id:7596|Hs108|chr19 ( 682) 4863 507.8 2.1e-143
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 2286 247.0 6.6e-65
CCDS46101.1 ZNF234 gene_id:10780|Hs108|chr19 ( 700) 2219 240.3 7.3e-63
CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 748) 2207 239.1 1.8e-62
CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 799) 2207 239.2 1.8e-62
CCDS46102.1 ZNF226 gene_id:7769|Hs108|chr19 ( 803) 2188 237.2 6.9e-62
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CCDS42574.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 825) 2186 237.0 8e-62
CCDS12637.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 907) 2173 235.8 2.1e-61
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CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 2157 234.0 5.6e-61
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 2143 232.7 1.6e-60
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 2143 232.7 1.6e-60
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 2143 232.7 1.6e-60
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 2141 232.5 1.8e-60
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CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 2142 232.8 2e-60
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 2129 231.3 4.4e-60
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CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 2127 231.0 4.9e-60
CCDS59368.1 ZNF729 gene_id:100287226|Hs108|chr19 (1252) 2129 231.6 5.3e-60
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 2127 231.3 5.9e-60
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 2127 231.4 6e-60
CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 808) 2104 228.7 2.5e-59
CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 924) 2104 228.8 2.7e-59
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 2103 228.7 2.8e-59
CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19 ( 738) 2087 226.9 7.9e-59
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CCDS46991.1 ZNF721 gene_id:170960|Hs108|chr4 ( 923) 2072 225.6 2.5e-58
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 2071 225.5 2.7e-58
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 2067 224.9 3.1e-58
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 2065 224.6 3.5e-58
CCDS59369.1 ZNF99 gene_id:7652|Hs108|chr19 ( 864) 2063 224.6 4.6e-58
CCDS12412.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19 ( 646) 2055 223.6 7e-58
CCDS42536.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19 ( 774) 2055 223.7 7.6e-58
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 2056 224.1 8.2e-58
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 2056 224.1 8.3e-58
CCDS33046.1 ZNF224 gene_id:7767|Hs108|chr19 ( 707) 2041 222.3 1.9e-57
CCDS46166.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 661) 2038 221.9 2.3e-57
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 2038 222.0 2.4e-57
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 2038 222.0 2.5e-57
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 2038 222.0 2.5e-57
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 2037 221.8 2.5e-57
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 2033 221.2 3e-57
CCDS46165.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 674) 2027 220.8 5.1e-57
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 2025 220.9 6.9e-57
CCDS33047.1 ZNF233 gene_id:353355|Hs108|chr19 ( 670) 2022 220.3 7.2e-57
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 2022 220.3 7.2e-57
>>CCDS12632.1 ZNF45 gene_id:7596|Hs108|chr19 (682 aa)
initn: 4863 init1: 4863 opt: 4863 Z-score: 2688.2 bits: 507.8 E(32554): 2.1e-143
Smith-Waterman score: 4863; 99.4% identity (99.9% similar) in 682 aa overlap (1-682:1-682)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTKSKEAVTFKDVAVVFSEEELQLLDLAQRKLYRDVMLENFRNVVSVGHQSTPDGLPQLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MTKSKEAVTFKDVAVVFSEEELQLLDLAQRKLYRDVMLENFRNVVSVGHQSTPDGLPQLE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 REEKLWMMKMATQRDNSSGAKNLKEMETLQEVGLRYLPHEELFCSQIWQQITRELIKYQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 REEKLWMMKMATQRDNSSGAKNLKEMETLQEVGLRYLPHEELFCSQIWQQITRELIKYQD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SVVNIQRTGCQLEKRDDLHYKDEGFSNQSSHLQVHRVHTGEKPYKGEHCVKSFSWSSHLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SVVNIQRTGCQLEKRDDLHYKDEGFSNQSSHLQVHRVHTGEKPYKGEHCVKSFSWSSHLQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 INQRAHAGEKPYKCEKCDNAFRRFSSLQAHQRVHSRAKSYTNDASYRSFSQRSHLPHHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 INQRAHAGEKPYKCEKCDNAFRRFSSLQAHQRVHSRAKSYTNDASYRSFSQRSHLPHHQR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS12 VPTGENPYKYEECGRNVGKSSHCQAPLIVHTGEKPYKCEECGVGFSQRSYLQVHLKVHTG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KKPYKCEECGKSFSWRSRLQAHERIHTGEKPYKCNACGKSFSYSSHLNIHCRIHTGEKPY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 KCEECGKGFSVGSHLQAHQISHTGEKPYKCEECGKGFCRASNLLDHQRGHTGEKPYQCDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KCEECGKGFSVGSHLQAHQISHTGEKPYKCEECGKGFCRASNLLDHQRGHTGEKPYQCDA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 CGKGFSRSSDFNIHFRVHTGEKPYKCEECGKGFSQASNLLAHQRGHTGEKPYKCGTCGKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CGKGFSRSSDFNIHFRVHTGEKPYKCEECGKGFSQASNLLAHQRGHTGEKPYKCGTCGKG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 FSRSSDLNVHCRIHTGEKPYKCEKCGKAFSQFSSLQVHQRVHTGEKPYQCAECGKGFSVG
:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FSRSSDLNVHCRIHTGEKPYKCERCGKAFSQFSSLQVHQRVHTGEKPYQCAECGKGFSVG
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pF1KB6 SQLQAHQRCHTGEKPYQCEECGKGFCRASNFLAHRGVHTGEKPYRCDVCGKRFRQRSYLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SQLQAHQRCHTGEKPYQCEECGKGFCRASNFLAHRGVHTGEKPYRCDVCGKRFRQRSYLQ
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pF1KB6 AHQRVHTGERPYKCEECGKVFSWSSYLQAHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSWSSSLIIHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AHQRVHTGERPYKCEECGKVFSWSSYLQAHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSWSSSLIIHQR
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KB6 VHADDEGDKDFPSSEDSHRKTR
::::::::::::::::::::::
CCDS12 VHADDEGDKDFPSSEDSHRKTR
670 680
>>CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 (688 aa)
initn: 11714 init1: 2132 opt: 2286 Z-score: 1278.7 bits: 247.0 E(32554): 6.6e-65
Smith-Waterman score: 2298; 49.7% identity (72.5% similar) in 680 aa overlap (4-682:2-654)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTKSKEAVTFKDVAVVFSEEELQLLDLAQRKLYRDVMLENFRNVVSVGHQSTPDGLPQLE
... : :.:::. ::.:: . :: ::: :::::::::. :.::. ::.
CCDS12 MARKLVMFRDVAIDFSQEEWECLDSAQRDLYRDVMLENYSNLVSLD-------LPS--
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 REEKLWMMKMATQRDNSSGAKNLKEMETLQEVGLRYLPHEELFCSQIWQQITRELIKYQD
. :.. . : :: : : : . ..: .. .. .:. .. .
CCDS12 --------RCASK--DLSPEKNTYETELSQ-----WEMSDRLENCDLEESNSRDYLEAKG
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130 140 150 160 170
pF1KB6 SVVNIQRTGCQLEKRDDLHYKDEGFSNQSSHLQVH-RVHTGEKPYKGEHCVKSFSWSSHL
.. . :.. . .. . : .. :: ..:. : : :. ::::: ..: :.: .:::
CCDS12 KMEKQQENQKEYFRQGMIIYDKMSIFNQHTYLSQHSRCHSTEKPYKCKECGKAFRRASHL
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 QINQRAHAGEKPYKCEKCDNAFRRFSSLQAHQRVHSRAKSYTNDASYRSFSQRSHLPHHQ
.: :.:::::.:..: .:: : :.:. :::.:. : :. ..:.: :.: :.
CCDS12 TQHQSIHTGEKPYECKQCGKAFSRDSQLSLHQRLHTGEKPYACKECGKAFTQSSQLILHH
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pF1KB6 RVPTGENPYKYEECGKNVGKSSHCQAPLIVHTGEKPYKCEECGVGFSQRSYLQVHLKVHA
:. :::.::: ::::: .::. ::::::::.:.::: .:.: : : .: ..:.
CCDS12 RIHTGEKPYKCEECGKAFIRSSQLTRHQKVHTGEKPYECKECGKAFTQNSQLTLHQRLHT
220 230 240 250 260 270
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pF1KB6 GKKRYKCEECGKSFSWRSRLQAHERIHTGEKPYKCNACGKSFSYSSHLNIHCRIHTGEKP
:.: :.:.:: : :. :.: :.:::::::::.:. :::.: .:.:. : .::.::::
CCDS12 GEKLYECKECRKVFTQLSQLILHKRIHTGEKPYECKECGKAFICGSQLSQHQKIHNGEKP
280 290 300 310 320 330
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pF1KB6 YKCEECGKGFSVGSHLQAHQISHTGEKPYKCEECGKGFCRASNLLDHQRGHTGEKPYQCD
:.:.:::..: :: :. :: ::::::::::::::.: :.:.: .::: ::.::::.:
CCDS12 YECKECGRAFIRGSLLMQHQRIHTGEKPYKCEECGKAFIRGSQLTQHQRIHTNEKPYECK
340 350 360 370 380 390
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pF1KB6 ACGKGFSRSSDFNIHFRVHTGEKPYKCEECGKGFSQASNLLAHQRGHTGEKPYKCGTCGK
::: ::..:... : :.:::::::.:.::::.:...: : ::: :::::::.: :::
CCDS12 ECGKMFSHGSQLTQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFNRGSLLTRHQRIHTGEKPYECKECGK
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 GFSRSSDLNVHCRIHTGEKPYKCEKCGKAFSQFSSLQVHQRVHTGEKPYQCAECGKGFSV
:::.:.:. : :::::::::.:..:::.: . :.: :::.:::::::.: :: .:.
CCDS12 TFSRGSELTQHERIHTGEKPYECKECGKSFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECRMAFTQ
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 GSQLQAHQRCHTGEKPYQCEECGKGFCRASNFLAHRGVHTGEKPYRCDVCGKRFRQRSYL
.:.:. ::: ::::::: :.::::.: :. .. :. .:::::::.: ::: : . : :
CCDS12 SSHLSQHQRLHTGEKPYVCNECGKAFARGLLLIQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFIRGSQL
520 530 540 550 560 570
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pF1KB6 QAHQRVHTGERPYKCEECGKVFSWSSYLQAHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSWSSSLIIHQ
:::.::::.::.:.::::.:: .: : :::.:::::::.:.:: :.:. :: : ::
CCDS12 TQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSHGSQLTLHQRIHTGEKPYECRECRKAFTQSSHLSRHQ
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660 670 680
pF1KB6 RVHADDEGDKDFPSSEDSHRKTR
:.:. :.: . .: .. ::
CCDS12 RIHT---GEKPYQCKECGKAFTRGSQLTQHQRIHISEKSFEYKECGIDFSHGSQVYM
640 650 660 670 680
>>CCDS46101.1 ZNF234 gene_id:10780|Hs108|chr19 (700 aa)
initn: 2210 init1: 2210 opt: 2219 Z-score: 1242.0 bits: 240.3 E(32554): 7.3e-63
Smith-Waterman score: 2602; 54.1% identity (75.1% similar) in 704 aa overlap (1-682:1-700)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTKSKEAVTFKDVAVVFSEEELQLLDLAQRKLYRDVMLENFRNVVSVGHQSTPDGLPQLE
:: ::..:::::::::.:::: ::: .::.::.:::::::::..::::. . ::
CCDS46 MTTFKEGLTFKDVAVVFTEEELGLLDPVQRNLYQDVMLENFRNLLSVGHHPFKHDVFLLE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 REEKLWMMKMATQRDNSSGAKNLKEMETLQEVGLRYLPHEELFCSQIWQQITRELIKYQD
.:.:: .:: :::: ..:. : .:.::. :.: : ::::. .:::.::. .::::.:
CCDS46 KEKKLDIMKTATQRKGKSADKIQSEVETVPEAG-R---HEELYWGQIWKQIASDLIKYED
70 80 90 100 110
130 140 150 160
pF1KB6 SVVNIQR------TGCQLE------KRDDLHYKDEGFSNQSS---HLQVHR-VHTGEKPY
:...:.: .::.. . . :. . .... . ....:. .:.::: .
CCDS46 SMISISRFPRQGDLSCQVRAGLYTTHTGQKFYQCDEYKKSFTDVFNFDLHQQLHSGEKSH
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 KGEHCVKSFSWSSHLQINQRAHAGEKPYKCEKCDNAFRRFSSLQAHQRVHSRAKSYTNDA
..: ::: . : :.:.::.: ::: :::. : . : . : ::.:::::. : .
CCDS46 TCDECGKSFCYISALHIHQRVHMGEKCYKCDVCGKEFSQSSHLQTHQRVHTVEKPFKCVE
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 SYRSFSQRSHLPHHQRVPTGENPYKYEECGKNVGKSSHCQAPLIVHTGEKPYKCEECGVG
..::.:: : : .. .::.::. ::::. ..:: : .::::::.::. :: .
CCDS46 CGKGFSRRSTLTVHCKLHSGEKPYNCEECGRAFIHASHLQEHQRIHTGEKPFKCDTCGKN
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 FSQRSYLQVHLKVHAGKKRYKCEECGKSFSWRSRLQAHERIHTGEKPYKCNACGKSFSYS
: .:: :. : ::.:.: ::::.::: :. : :. :.:.:::::::::. ::: :
CCDS46 FRRRSALNNHCMVHTGEKPYKCEDCGKCFTCSSNLRIHQRVHTGEKPYKCEECGKCFIQP
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 SHLNIHCRIHTGEKPYKCEECGKGFSVGSHLQAHQISHTGEKPYKCEECGKGFCRASNLL
:... : ::::::::: :. ::::: .: .:::: :::::::::.::::.: .
CCDS46 SQFQAHRRIHTGEKPYVCKVCGKGFIYSSSFQAHQGVHTGEKPYKCNECGKSFRMKIHYQ
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 DHQRGHTGEKPYQCDACGKGFSRSSDFNIHFRVHTGEKPYKCEECGKGFSQASNLLAHQR
: :::::::.:..:::.: .:: ..::...:. .::.::::::.::.:.: : ::
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:::..: ::::.:: ...:::::. :::::::.: :::::: . :. :. ::::::::
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CCDS62 YKCAECGKGFSYSSGLLIHQRVHTGEKPYRCQECGKGFRCTSSLHKHQRVHTGKKPYTCD
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pF1KB6 ECGKGFSVGSQLQAHQRCHTGEKPYQCEECGKGFCRASNFLAHRGVHTGEKPYRCDVCGK
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CCDS62 QCGKGFSYGSNLRTHQRLHTGEKPYTCCECGKGFRYGSGLLSHKRVHTGEKPYRCHVCGK
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CCDS62 GYSQSSHLQGHQRVHTGEKPYKCEECGKGFGRNSCLHVHQRVHTGEKPYTCGVCGKGFSY
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CCDS62 TSGLRNHQRVHLGENPYK
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CCDS42 GVRQNTHIRNHPRAPVGDMPYRCDVCGKGFRYKSVLLIHQGVHTGRRPYKCEECGKAFGR
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pF1KB6 RSHLPHHQRVPTGENPYKYEECGKNVGKSSHCQAPLIVHTGEKPYKCEECGVGFSQRSYL
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CCDS42 SSNLLVHQRVHTGEKPYKCSECGKGFSYSSVLQVHQRLHTGEKPYTCSECGKGFCAKSAL
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pF1KB6 QVHLKVHAGKKRYKCEECGKSFSWRSRLQAHERIHTGEKPYKCNACGKSFSYSSHLNIHC
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CCDS42 HKHQHIHPGEKPYSCGECGKGFSCSSHLSSHQKTHTGERPYQCDKCGKGFSHNSYLQAHQ
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CCDS42 RVHMGQHLYKCNVCGKSFSYSSGLLMHQRLHTGEKPYKCE-CGKSFGRSSDLHIHQRVHT
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:::::.:. ::::: :.::.. : ::::::.:: :. ::::: .:.:: ::: ::::::
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:::. :::::: :: : .: :.:::::::.:..:::.: :::. :::::::.::: :
CCDS42 YKCAECGKGFSYSSGLLIHQRVHTGEKPYRCQECGKGFRCTSSLHKHQRVHTGKKPYTCD
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540 550 560 570 580 590
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.:::::: ::.:..::: ::::::: : :::::: .:..:.:. :::::::::: ::::
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CCDS54 EENENVFNQSSCLQVHQKIHTEEKLYTDIEYGKSFICSSNLDIQHRVHMEENSYNSEECG
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260 270 280 290 300 310
pF1KB6 KNVGKSSHCQAPLIVHTGEKPYKCEECGVGFSQRSYLQVHLKVHAGKKRYKCEECGKSFS
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CCDS54 NGFSLASHFQDLQIVHTKEQPYKRYVCSNSFSHNLYLQGHPKIHIGEKPRK--EHGNGFN
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pF1KB6 WRSRLQAHERIHTGEKPYKCNACGKSFSYSSHLNIHCRIHTGEKPYKCEECGKGFSVGSH
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CCDS54 WSSKLKDHQRVHTGQKPYKCNICGKGFNHRSVLNVHQRVHTGEKPYKCEECDKGFSRSSY
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pF1KB6 LQAHQISHTGEKPYKCEECGKGFCRASNLLDHQRGHTGEKPYQCDACGKGFSRSSDFNIH
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CCDS54 LQAHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSRNSYLQGHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSRSSHLQGH
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CCDS54 TGEKPYQCDECGKSFSQRSYLQSHQSVHSGERPYICEVCGKGFSQRAYLQGHQRVHTRVK
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CCDS54 EQCGKGFSGYSSLQAHHRVHTGEKPYKCEVCGKGFSQRSNLQAHQRVHTGEKPYKCDACG
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CCDS54 KGFRWSSGLLIHQRVHSSDKFYKSEDYGKDYPSSENLHRNEDSVLF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]